Marcelo Visentini Kitahara

Pós-doutorado

Formação complementar

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Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

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Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Ecophysiological trade-offs for reef corals living in climate refugia, Descrição: O aquecimento acelerado dos oceanos é uma grande ameaça para os ecossistemas recifais em todo o mundo. O calor e a irradiação solar elevados podem levar ao branqueamento em massa e à morte dos corais. Locais e habitats que são menos suscetíveis ao estresse térmico devido a características intrínsecas (e.g., maiores profundidades e alta turbidez) são amplamente reconhecidos como refúgios climáticos para corais. Corais que vivem fora de refúgios climáticos podem enfrentar pressão seletiva mais forte e ter maior potencial de adaptação/aclimatação do que aqueles encontrados em refúgios, incluindo maior tolerância ao calor e limites de branqueamento. Assim, os refúgios climáticos podem impor trade-offs para os corais que podem comprometer sua sobrevivência em longo prazo. Nosso objetivo aqui é avaliar os trade-offs ecofisiológicas sofridos por corais que vivem em refúgios climáticos no Atlântico Sudoeste (i.e., habitats/locais turvos e sujeitos a menor variabilidade/estresse térmico). Faremos isso investigando como corais de locais/habitats de refúgio e não-refúgio respondem ao estresse de calor e luz em três escalas espaciais: entre regiões ao longo do gradiente latitudinal dentro da Província Brasileira, entre sítios dispostos em um gradiente cross-shelf ao longo da plataforma continental e entre habitats (topos versus paredes) dentro de cada sítio. Nossas descobertas ajudarão a esclarecer as vantagens e trade-offs sofridos por corais que vivem dentro e fora de refúgios climáticos, em várias escalas espaciais, e fornecerão informações sobre estratégias eficazes de conservação para ecossistemas de recifes diante das mudanças climáticas. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Carla Zilberberg - Integrante / Miguel Mies - Integrante / Ronaldo B. Francini-Filho - Coordenador / Samuel Coelho de Faria - Integrante / Carolina Freitas Schlosser - Integrante / Letícia Veras Costa-Lotufo - Integrante / Bianca Del Bianco Sahm - Integrante.

• 2023 - Atual

  Respostas metabólicas e moleculares de Oreochromis niloticus influenciadas pela interação entre temperatura e composição da dieta, Descrição: Oreochromis niloticus (tilápia) é a espécie de peixe mais produzida no Brasil. Apesar de ser uma espécie com enorme potencial para se adaptar a diferentes condições de cultivo, melhores performances produtivas são obtidas em temperaturas elevadas (27 - 30 C). No entanto, os principais polos produtores no Brasil foram estabelecidos nas regiões sul (oeste do Paraná) e sudeste (oeste de São Paulo) do país, onde as temperaturas no outono/inverno estão fora da faixa ótima para a espécie, com esta exposição a baixas temperaturas frequentemente resultando em redução de crescimento e em alta taxa de mortalidade. Estudos prévios observaram melhor crescimento e sobrevivência de espécies de peixes mantidas em baixas temperaturas, e alimentadas com dietas contendo níveis mais elevados de ácidos graxos polinsaturados de cadeia longa (LC-PUFAs), em especial o ácido docosahexaenóico (DHA, 22:6n-3), ácido eicosapentaenoico (EPA, 20:5n-3) e ácido araquidônico (ARA, 20:4n-6). Da mesma forma, estudos recentes mostraram um melhor desempenho produtivo de tilápias mantidas em temperaturas subótimas e alimentados com dietas contendo principalmente DHA. No entanto, os mecanismos fisiológicos responsáveis por esta melhora ainda não estão claros. Adicionalmente, apesar de resultados promissores obtidos com outras espécies, nenhum estudo prévio avaliou a influência de ARA na performance de tilápias mantidas em temperaturas subótimas. Sendo assim, o seguinte projeto objetiva (1) testar diferentes níveis de ARA em dietas para tilápias mantidas em temperaturas baixas (outono/inverno), (2) investigar a influência de diferentes razões entre DHA, EPA e ARA na performance e metabolismo de tilápias mantidas em ótima e subótima temperatura. Para isso, serão avaliados a performance produtiva, morfofisiologia e composição de tecidos lipogênicos e lipolíticos, variáveis relacionadas com o sistema imunológico e transcrição gênica (vias do metabolismo energético, sistema imunológico e estresse térmico). Os resultados obtidos no projeto serão essenciais para a compreensão da relação entre temperatura e composição da dieta na performance e metabolismo da espécie, auxiliando a indústria no desenvolvimento de estratégias para mitigar os impactos negativos causados pelas baixas temperaturas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / Renato M. Honji - Integrante / Bruno Cavalheiro Araújo - Integrante / Alexandre Wagner Silva Hilsdorf - Integrante / Fabiano Bezerra Menegidio - Integrante / Giovani Sampaio Gonçalves - Integrante / Renata Guimarães Moreira Whitton - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2023 - Atual

  Rede IntegraMAR - Rede de Pesquisa Integrada em Biodiversidade, Impactos, Serviços, Gestão e Conservação Marinha, Descrição: Os temas de pesquisa que serão desenvolvidos pela rede IntegraMAR estão inseridos em um contexto de complementaridade. Eles foram cuidadosamente selecionados considerando as lacunas de conhecimento no que tange à biodiversidade marinha, gestão costeira, manejo de recursos, e políticas públicas no país (Figura 1). Os temas de pesquisa serão desenvolvidos em um contexto de complementaridade, de modo que os resultados de um eixo irão cobrir temas diferentes e fundamentar ações considerando impactos, serviços, e gestão. Os eixos deste projeto de rede são:Eixo 1. Análise da biodiversidade, dinâmica ecológica e mecanismos de funcionamento em ecossistemas de recifesEixo 2. Impactos locais, globais e sinérgicos sobre a biodiversidade marinha brasileira e seus serviços ecossistêmicosEixo 3. Serviços de ecossistemas marinhos brasileiros: ampliando e resgatando conhecimentos para a sustentabilidadeEixo 4. Subsídios às ações de gestão, manejo e restauração adaptativa dos recifes brasileiros.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / Ronaldo Bastos Francini-Filho - Integrante / Gustavo Muniz Dias - Integrante / BANHA, T. N. S. - Integrante / Marcelo de Oliveira Soares - Integrante / Guilherme O. Longo - Integrante / Hudson T. Pinheiro - Integrante / Rafael Magris - Integrante / Samuel Coelho de Faria - Integrante / Bárbara Segal - Integrante / Mariana Bender - Integrante / Cesar M. M. Cordeiro - Integrante / Vinicius J. Giglio - Integrante / Leandra Gonçalves - Integrante / Maria Luiza Gallina - Integrante / Carine O. Fogliarini - Integrante / Adriana C. Fonseca - Integrante / André L. Luza - Integrante / Anne K. S. Justino - Integrante / Bráulio A. Santos - Integrante / Carlos E. L. Ferreira - Integrante / Carolina Schlosser - Integrante / Cristian S. Dambros - Integrante / Cybelle M. Longhini - Integrante / Daniele A. Vila Nova - Integrante / Edson A. Vieira Filho - Integrante / Elisa Abbad - Integrante / Esteban Nogueira - Integrante / Fabian Sá - Integrante / Fabienne Tuno - Integrante / Fabrício Albuquerque - Integrante / Fernanda Ramos - Integrante / Gabriel Araujo - Integrante / Flávia L. Frédou - Integrante / Guilherme Loyola - Integrante / Giovanna R. Santinni - Integrante / Guilherme Ferreira - Integrante / Jaqueline Toledo - Integrante / Isadora P. F. Cord - Integrante / José A. Reis-Filho - Integrante / Jemilli Viaggi - Integrante / Julia Marx - Integrante / juan p quimbayo - Integrante / Leandro N. Eduardo - Integrante / Katia Freire - Integrante / Luiza S. Waechter - Integrante / Lucas T. Nunes - Integrante / Maisha Gragnolati - Integrante / Mariana Clauzet - Integrante / Maria Laura F. Ternes - Integrante / Marina A. Méga de Andrade - Integrante / Marina N. Sissini - Integrante / Melina F. Maxwell - Integrante / Miguel Loiola Miranda - Integrante / Natália Hanazaki - Integrante / Paula R. C. Roriz - Integrante / Priscila Lopes - Integrante / Pedro H. C. Pereira - Integrante / Rosana M. da Rocha - Integrante / Rafaella Nunes Freitas - Integrante / Sergio R. Floeter - Integrante / Thayná Mello - Integrante / Tainá L. Gaspar - Integrante / Thierry Frédou - Integrante / Thiago C. Mendes - Integrante / Tommaso Giarrizzo - Integrante.

• 2022 - Atual

  Integrating tools and disciplines to understand the future of Southwestern Atlantic shallow-water corals in a changing planet, Descrição: Covering less than 0.1% of the ocean flor, warm, shallow-water coral reefs are recognized for supporting over a quarter of the worlds? marine biodiversity and also for the critical ecosystem services they provide to human kind. Nonetheless, due to the ongoing climate change and other anthropogenic challenges, about 75% of the coral reefs are considered threatened, with several already severely degraded or under phase-shift to algal dominated habitats. Even though some hope has been put forward - the extinction risk of most coral species is lower than previously thought and, as a lineage, scleractinian corals have persisted to at least four of the five great mass extinction events -, it is a common sense that coral reefs are not going to be the same for the future generations. In the Southwestern Atlantic (SWA) the panorama is not different, with stronger and more frequent ocean thermal anomalies taking its toll on coral cover. Nevertheless, although displaying low diversity (but high endemicity), corals from this region have been purported to be more resistant and even more resilient to the warming ocean effects. Such ?shielding? being the result of the more nutrient rich, turbid waters that our corals are adapted. However, we know virtually nothing on the genetic structure and genetic diversity of the SWA coral populations. Overall, genetic diversity is an essential source for biodiversity, providing the raw material for evolution. When interconnected, populations tend to preserve greater genetic diversity compared to more isolated populations, which in turn are more susceptible to genetic drift effects. Thus, endeavoring to fill such gaps and, consequently, improve our understanding in how climate change has and is shaping SWA coral evolution as a lineage and as a system, the present proposal consists of consolidating an interdisciplinary research line cored on RNA/DNA deep sequencing and its usefulness at the Center for Marine Biology of the University of São Paulo (CEBIMar-USP). Overall, advances in high-throughput sequencing and SNP genotyping technologies have greatly expanded our ability to identify signatures of positive selection. Such signatures help us to delimit regions of the genome that are, or have been, functionally important, poiting towards the identification of genetic variation that contributes to phenotypic diversity and genotype selection. Examining such diversity in the light of phylogeny / phylogeography / holobiont will open horizons to explore where, when and how traits ? of any nature ? have changed over different time scales. Retrieved biological patterns at population and specific levels will also enable the proposition of evolutionary processes and subsequent transformations of corals in light of environment variables. Therefore, at the onset of the Decade of the Ocean, and understanding that such knowledge is essential to define efficient management and conservation strategies, the present proposal will persue long lasting questions regarding the major architects of shallow-water coral reefs in times not just of major scientific interest, but also intense public and media concern because of the uncertain fate of these ecosystems in the face of ever increasing anthropogenic challenges.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / David J. Miller - Integrante / Jaroslaw Stolarski - Integrante / Carla Zilberberg - Integrante / CAPEL, K. C. C. - Integrante / Miguel Mies - Integrante / Ronaldo B. Francini-Filho - Integrante / Laura F. Robinson - Integrante / Samuel Faria - Integrante / Douglas Gherardi - Integrante / FRANCINI, CARLO LEOPOLDO B - Integrante / J. A. Stewart - Integrante / Amana Garrido - Integrante / Guilherme O. Longo - Integrante / Hudson T. Pinheiro - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2022 - Atual

  Avaliando adaptação, variação epigenética e dispersão para entender a resposta de mangues em um mundo em mudanças, Descrição: As rápidas mudanças ambientais de origem antrópica impõem novas condições bióticas e abióticas aos organismos que podem responder por migração que os permite alterar distribuições espaciais ou por persistência via adaptação mediada por seleção natural ou pela plasticidade fenotípica. Em caso de ausência ou insuficiência de resposta, pode ocorrer extinção local ou global. Árvores são especialmente afetadas pelas alterações ambientais pois são organismos de longo ciclo de vida e sésseis na fase adulta, e entre elas, um grupo deve ser particularmente ameaçado, os mangues devido à dinâmica ambiental costeira somada aos desafios de se ocupar uma estreita faixa entre o mar e o continente. Estes organismos compõem manguezais, os quais contribuem substancialmente com o sequestro e estoque de carbono. Portanto, árvores de mangue devem ser consideradas organismos prioritários para se compreender os processos biológicos na resposta às rápidas alterações do ambiente, pois são tanto 'vítimas' como potenciais soluções para elas. Neste contexto, o objetivo geral desta proposta é desvendar como os mangues podem responder às mudanças climáticas atuais por dispersão e por persistência. Para isso, serão desenvolvidos dois subprojetos autônomos, mas complementares que pretendem a) avaliar a contribuição das correntes oceânicas superficiais para a dispersão de árvores de mangue em escala global e b) investigar o papel da variação genética adaptativa, epigenética e fenotípica na persistência em novas condições ambientais desafiadoras. Esta abordagem permitirá o treinamento, capacitação e networking de recurso humano além da nucleação de um grupo interdisciplinar de investigação focado em Ecologia Molecular no Campus do Litoral Paulista da UNESP. Adicionalmente, ela possibilitará a obtenção de novas e sólidas evidências que permitam identificar fatores chave de ameaça aos mangues, construir modelos preditivos mais realistas e auxiliar na seleção ou criação de estratégias eficientes de manejo, restauração e conservação desses ecossistemas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / Gustavo Maruyama Mori - Integrante / Christina L Richards - Integrante / Milton Costa Lima Neto - Integrante / Andre Guilherme Madeira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2021 - Atual

  Identificação de berçários de peixes recifais de importância econômica no litoral norte do Estado de São Paulo, Descrição: Peixes recifais apresentam uma fase larval planctônica que termina com o assentamento dos indivíduos em recifes rasos costeiros. O litoral de São Paulo abarca extensos recifes rochosos que suportam importante atividade pesqueira. Este projeto tem como objetivo prever, pela primeira vez, a ocorrência de berçários de peixes recifais importantes na pesca e suas relações com variáveis oceanográficas no litoral de São Paulo. Os resultados subsidiarão estratégias mais eficientes de manejo pesqueiro.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Alvaro Esteves Migotto - Integrante / Augusto A. V. Flores - Integrante / Luciano Abel - Integrante / Aurea M Ciotti - Integrante / Ronaldo B. Francini-Filho - Coordenador / Samuel Faria - Integrante / Cláudio Gonçalves - Integrante / Hudson T. Pinheiro - Integrante / Juan Pablo Quimbayo Agreda - Integrante / Eduardo Siegle - Integrante / Rafael Magris - Integrante / Linda Waters - Integrante.

• 2021 - Atual

  Integrando fisiologia, ecologia e filogenia em recifes brasileiros: aprendendo evolução e conservação com os corais, Descrição: O branqueamento de corais caracteriza-se pela ruptura da simbiose entre o hospedeiro e as microalgas simbiontes, sendo fundamental uma avaliação filogenética de biomarcadores funcionais para a antecipação desse fenômeno diante do câmbio do clima. A presente proposta caracterizará e promoverá os biomarcadores de saúde em ações de sensibilização social para amparar os tomadores de decisão em políticas públicas de monitoramento, considerando os diferentes atores da academia, sociedade e estado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Ralf Tarcisio Cordeiro - Integrante / Alvaro Esteves Migotto - Integrante / Carla Zilberberg - Integrante / Tito Monteiro Lotufo - Integrante / Luciano Abel - Integrante / Miguel Mies - Integrante / Aurea M Ciotti - Integrante / Ronaldo B. Francini-Filho - Integrante / Samuel Faria - Coordenador / Cláudio Gonçalves - Integrante / Guilherme O. Longo - Integrante / Camila Martins - Integrante., Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2021 - Atual

  Biodiversidade, biogeografia e conservação de ecossistemas recifais mesofóticos no Oceano Atlântico, Descrição: O recente uso do mergulho técnico tem contribuído para o avanço nas pesquisas relacionadas a ecossistemas recifais mesofóticos (mesophotic coral ecosystems - MCE), recifes profundos situados entre 30 e 150 m de profundidade. Investigações sobre a biodiversidade de MCEs revelam ricas assembleias e espécies desconhecidas em diversas localidades do mundo, com uma taxa de descoberta de duas espécies novas de peixes por hora de exploração. Estudos ecológicos, por outro lado, apresentam resultados controversos. Os padrões gerais mais aceitos são em relação a mudanças na estrutura das comunidades e diminuição da riqueza de espécies com a profundidade, enquanto estudos contraditórios são relacionados aos níveis de similaridade entre comunidades de diferentes faixas batimétricas. Alguns autores reportam grande sobreposição de espécies entre ambientes recifais rasos e fundos, sugerindo que MCEs podem atuar como refúgio para espécies de ampla distribuição batimétrica, um conceito conhecido como "Hipótese de Refúgio em Recifes Profundos". Por outro lado, estudos baseados em dados empíricos ressaltam grande mudança nas assembleias de peixes e corais com a profundidade. Essa dicotomia, entretanto, pode decorrer do fato de que a hipótese de refúgio é espécie ou contexto dependente, e análises ambientais e biogeográficas mais refinadas e baseadas em dados de abundância estão faltando. Fatores ambientais como temperatura, complexidade bentônica, cobertura de corais e exposição a ondas, conhecidos por influenciar a ecologia de peixes recifais de ambientes rasos, precisam ser explorados em MCEs. Ainda, flutuações de nível do mar durante o Pleistoceno causaram alterações mais extremas na área disponível de habitats rasos do que profundos ("Hipótese de Persistência do Habitat"), possivelmente influenciando de forma distinta os padrões de diversidade, endemismo e história evolutiva dos peixes do MCE. Nesse contexto, com o objetivo de avançar o conhecimento sobre a biodiversidade, biogeografia, ecologia e evolução da fauna de recifes mesofóticos do Oceano Atlântico, este projeto propõe a criação de uma linha de pesquisa para a exploração de recifes mesofóticos no Centro de Biologia Marinha da Universidade de São Paulo (CEBIMar / USP). Questões originais e inovadoras desta proposta incluem: investigar pela primeira vez o efeito de fatores biogeográficos e ambientais sobre os padrões de diversidade taxonômica (alpha e beta) e funcional encontrados ao longo do gradiente de profundidade em diferentes recifes do Oceano Atlântico (África, Brasil, Caribe e Dorsal Meso-Atlântica); testar com uma abordagem moderna (utilizando uma matriz de abundância) se a Hipótese de Refúgio em Recifes Profundos varia de acordo com o contexto ecológico, histórico ou biogeográfico; analisar a relação entre riqueza e endemismo de comunidades rasas e profundas com a história geológica de ilhas oceânicas e variações do nível do mar do Pleistoceno; avaliar de forma inédita a Hipótese de Persistência do Habitat, explorando a relação entre a história evolutiva e características biológicas/ecológicas de espécies do raso e do fundo usando técnicas contemporâneas de sequenciamento de DNA. Outros objetivos específicos incluem: registrar, amostrar e descrever a biodiversidade de peixes recifais, incluindo novos registros, novas espécies e espécies exóticas, em MCEs pouco explorados do Oceano Atlântico; capacitar pesquisadores e estudantes para a realização de mergulho técnico e modernas análises genômicas; e consolidar essa linha de pesquisa no CEBIMar, contribuindo para iniciativas de conservação e comunicação de MCEs para a sociedade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Ronaldo B. Francini-Filho - Integrante / Hudson T. Pinheiro - Coordenador / Luiz Alves da Rocha Filho - Integrante / Juan Pablo Quimbayo Agreda - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2019 - 2021

  Deep sea corals in the South Atlantic: new insights from an interdisciplinary study, Descrição: Ubiquitous to all oceans, scleractinian corals have been the main framework builders in the shallow and deep-sea since the Triassic. In contrast to their shallow-water counterparts, cold-water corals (also known as azooxanthellate or deep-sea corals) do not live in symbiosis with photosynthetic dinoflagellates. This means that they can live deep within the ocean without the need for light. Occurrences of deep-sea corals have been reported from Antarctica to the Arctic and down to depths as great as 6,300 m. Despite their global distribution, and potential importance in forming habitats, little is known about the controls on their distributions. With ongoing changes to the ocean environment it is timely to consider the potential vulnerability of these important ecosystems. This proposal represents a unique opportunity to combine the efforts of deep-sea coral researchers in the UK (Laura Robinson and Michelle Taylor) and Brazil (Marcelo V. Kitahara). The project seeks to initiate a long-term partnership which aims to build a coherent view of the long term controls (both today and in the past) on deep-sea corals in the South Atlantic. The South Atlantic holds numerous records of deep-sea coral species, especially on the Brazilian Margin - extending onto seamounts and ridges. These records encompass more than 60 species of which some are purported to form the largest deep-water coral reefs in the world. Such large reefs are formed under the influence of several water masses originating in both the high northern and southern latitudes. These waters have very different properties such as nutrient concentrations, pH and temperature. With this diversity in habitat and water column properties the South Atlantic is an ideal testing ground to explore the large scale controls on deep-sea corals in space and time. With access to samples to the North and South of Brazil (UK collaborators) and within the South Atlantic (Brazil) and with world leading expertise in taxonomy, genetics, deep sea ecology and coral mineralogy, growth rate, geochemistry and past climates we are proposing to come together in a new collaboration to share our ideas, samples and techniques. Within the two-year program we will organise exchange visits, establish a shared data base, share samples and access to laboratories. During the project we will seek to establish additional support to continue these efforts beyond the scope of this initial pump priming proposal.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / Laura F. Robinson - Integrante / Michelle Taylor - Integrante / Maria Luiza Carvalho Ferreira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2019

  Avaliação de processos que determinam a formação e a biodiversidade associada a bancos de rodolitos em diferentes escalas espaciais, Descrição: Rodolitos são nódulos de vida livre formados por algas calcárias incrustantes. Esses nódulos constituem estruturas consolidadas e tridimensionais que fornecem micro-habitats para invertebrados, algas e outros organismos associados. Além do interesse comercial de exploração do CaCO3, bancos de rodolitos têm sido tratados com atenção pelo IBAMA nos processos de licenciamento de atividades de exploração e produção de petróleo na plataforma continental brasileira. Aplicando a prerrogativa de precaução, o IBAMA tem negado solicitações para atividades de perfuração em sítios de ocorrência de bancos de rodolitos. O conhecimento sobre quais são os principais organismos associados aos rodolitos e os fatores estruturadores dessa biota são questões científicas de extrema relevância para compreender, conservar e promover o uso racional da biodiversidade marinha nacional. Nesta proposta pretende-se identificar as principais variáveis preditoras da biodiversidade associada aos bancos de rodolitos com o propósito de serem utilizadas na classificação desses ambientes. Usaremos como modelo para essa abordagem os bancos de rodolitos do Arquipélago de Fernando de Noronha (PE), Banco dos Abrolhos (BA) e da Ilha da Queimada Grande (SP). Além disso, pretendemos elucidar questões relacionadas à formação de bancos de rodolitos a partir de eventos de mortandade de recifes de corais. Neste sentido, o modelo utilizado será o banco de rodolitos recentemente descoberto pelo grupo desta proposta na Ilha da Queimada Grande, SP. (AU). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Fábio dos Santos Motta - Integrante / Guilherme Henrique Pereira Filho - Coordenador / Fernando Z. Gibran - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2016 - 2019

  Evolução e diversidade em Ceriantharia (Cnidaria), Descrição: A divisão dicotômica entre os grandes grupos (subfilos) em Cnidaria (Anthozoaria x Medusozoa) está muito relacionada com os distintos padrões de ciclo de vida reconhecidos. Vários subgrupos dentro de cada subfilo de Cnidaria têm sido estudados utilizando diferentes abordagens, entretanto, Ceriantharia (um subgrupo de Anthozoaria) permanece ainda uma incógnita em muitos aspectos. A esse subgrupo já foram atribuídas uma série de posições sistemáticas e ainda não existe um consenso. Os Ceriantharia possuem muitas peculiaridades em relação aos demais grupos, incluindo estruturas no seu genoma que são diferentes das conhecidas para Anthozoaria e até a possibilidade de ciclos de vida holoplanctônicos, desconhecido para espécies de Anthozoaria. Análises moleculares realizadas até o momento mostram que a posição de Ceriantharia ainda é controversa, mas apresenta tendência de contrapor as propostas mais utilizadas (Ceriantharia + Hexacorallia). Esse cenário incerto apresenta desdobramentos em várias escalas, principalmente relacionados a origem e tempos de divergência entre os grupos. Baseado no exposto acima, o presente projeto propõe uma avaliação compreensiva sobre Ceriantharia e suas relações com os demais clados em Cnidaria. A proposta incorporará dados morfológicos, biológicos (ciclo de vida e comportamento) e moleculares de espécies de Ceriantharia para avaliar a relação filogenética dentro do grupo e entre os demais clados de Cnidaria. Uma grande quantidade de informações inéditas será gerada e que serão revertidas na produção de publicações mostrando um cenário mais amplo deste grupo. Este projeto permitirá a formação de um novo grupo de pesquisadores, podendo se nivelar aos laboratórios internacionais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / André Carrara Morandini - Integrante / Maximiliano M. Maronna - Integrante / Sérgio N. Stampar - Coordenador / Carlos Camargo Alberts - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2021

  Phylogenomics of the Order Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa): relationships between evolution and climate change (Programa FAPESP de Pesquisa em Mudanças Climáticas Globais), Descrição: Endeavoring to improve our understanding in scleractinian evolution as a lineage and as a system, the present proposal consists of two stages motivated to create and consolidate a research line on RNA/DNA deep sequencing and its usefulness at the Marine Science Department of the São Paulo Federal University (DCMar-UNIFESP). Based on the first azooxanthellate coral transcriptomes (1 species ? Madrepora oculata [scleractinian coral bearing the widest worldwide distribution], 18 transcriptomes of which 6 from shallow water specimens [<50], 6 from deep waters [>200]) and 6 specimens subjected to thermal and pH stress) the first stage aims to improve our understanding on the genetic basis from the main reef framework builders, as well as to identify genes potentially related to physiological adaptations to low temperatures, calcification on extreme environments, etc. Also using NGS platforms, the second stage of the project aims to partially sequence the genome from 100 scleractinian species (symbiotic [50] and aposymbiotic [50]) in order to reconstruct a robust evolutionary history of the order, shedding light into its relationships to Corallimorpharia as well as within scleractinian ?sub-orders? and families. Furthermore, the phylogenomic reconstruction will be submitted to molecular clock techniques calibrated using the earliest fossils that can be unambiguously assigned to extant clades and whose unique skeletal characters can be unequivocally recognized in fossil coralla, enabling the estimation of every node divergence time. These results are going to be correlated with paleo-environmental data (temperature and atmospheric CO2 concentration) with the aspiration to set robust hypothesis uniting shallow and deep-water reefs and climate change. The proposed research line will significantly contribute to the knowledge of the major architects of shallow- and deep-water coral reefs in times not just of major scientific interest, but also intense public and media concern because of the uncertain fate of these ecosystems in the face of ever increasing anthropogenic challenges.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / David J. Miller - Integrante / Forêt, S. - Integrante / Allen Chaolum Chen - Integrante / BALL, E. E. - Integrante / Chuya Shinzato - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2021

  Phylogenomics of Anthozoa (Cnidaria): new approaches to long-standing problems, Descrição: Anthozoan cnidarians (>7500 species) are arguably one of the most ecologically important groups of metazoans on earth. By their ability to produce large colonies by asexual propagation and CaCO3 precipitation, some species create massive biogenic structures, thereby engineering entire reef-based ecosystems in both shallow and deep waters. Countless other species?including humans?are dependent on coral reefs for shelter and sustenance. Predictions that increases in atmospheric CO2 leading to ocean acidification (OA) and warmer ocean temperatures will impact skeletogenesis have generated widespread concern about the future of reef-building anthozoans and the diverse communities they support. Increased understanding of past evolutionary transitions in skeletal composition and of the paleoclimatic variables associated with the loss or gain of CaCO3 skeletons will inform predictions of future change. For example, whether or not soft-bodied anthozoans such as Corallimorpharia (coral-like anemones) were indeed derived by skeletal loss during past environmental crises remains controversial. This question is one of many that cannot currently be answered due to our incomplete understanding of phylogenetic relationships among anthozoan orders. A robust, well-resolved phylogeny of Anthozoa is required in order to test hypotheses of skeletal evolution and other key characters that have lead to the success of the class.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Catherine McFadden - Coordenador / Brant Faircloth - Integrante / Luisa Dueñas - Integrante / Estefania Rodriguez - Integrante / Andrea Quattrini - Integrante / Mercer Brugler - Integrante / Juan Sanchez - Integrante / Eliot Bush - Integrante., Financiador(es): The National Science Foundation - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2017

  Avaliação da efetividade do Parque Estadual Marinho da Laje de Santos e das Estações Ecológicas Tupinambás e Tupiniquins, litoral do Estado de São Paulo, Descrição: A costa do Estado de São Paulo, ao longo dos seus 700 km de extensão, abrange ampla diversidade de ecossistemas, incluindo estuários, manguezais, restingas, rios, recifes rochosos, praias arenosas e centenas de ilhas e formações insulares. Esses ambientes são responsáveis pela provisão de diversos serviços ambientais com grande importância social e econômica (alimento, proteção da linha de costa, turismo, lazer etc...). Em São Paulo, existem 27 unidades de conservação (UCs) costeiras e marinhas estabelecidas para proteger a biodiversidade, assegurar a manutenção de processos ecológicos e ordenar o uso dos espaços e recursos naturais. Entre as UCs marinhas, três se destacam pela diversidade, endemismo e abundância de peixes, algas e outras espécies: as Estações Ecológicas (ESECs) Federais Tupiniquins e Tupinambás e o Parque Estadual Marinho (PEM) da Laje de Santos. Além dos seus atributos naturais, a partir de 2008, com a criação das Áreas de Proteção Ambiental Marinhas, essas UCs, adquiriram relevância adicional por representarem as principais zonas de proteção integral (no-take) do mosaico de áreas marinhas protegidas (AMPs) estabelecido no Estado de São Paulo. Considerando as pressões atuais e principalmente a perspectiva de aumento da industrialização e ocupação humana para a costa paulista nos próximos anos, a presente iniciativa tem como objetivo avaliar o grau de efetividade das ESECs Tupiniquins e Tupinambás e do PEM Laje de Santos, visando gerar subsídios para ajustes no manejo e a realização de avaliações futuras. A análise da efetividade será realizada por métodos quantitativos utilizando indicadores biológicos e uma abordagem qualitativa empregando um sistema de pontuação (MPA Score Card) baseado em indicadores relacionados aos diferentes aspectos do desempenho da gestão. Os indicadores biológicos (i.e. estrutura das assembleias de peixes recifais e dos organismos bentônicos) serão mensurados com a utilização de mergulho autônomo por meio de censos visuais estacionários e foto-quadrats efetuados dentro e fora das AMPs. O questionário do MPA Score Card será aplicado durante reuniões realizadas com os gestores e conselhos de cada UC. A presente iniciativa espera contribuir com a gestão das UCs marinhas de proteção integral do Estado de São Paulo, avaliando a efetividade das mesmas, estimulando a discussão do tema juntos aos conselhos gestores, estabelecendo os protocolos mínimos para esforços futuros de avaliação e gerando as bases para o monitoramento de longo prazo dessas áreas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Fábio dos Santos Motta - Coordenador / Rodrigo Leão de Moura - Integrante / Ronaldo Bastos Francini-Filho - Integrante / Guilherme Henrique Pereira Filho - Integrante / Fernando Zaniolo Gibran - Integrante., Financiador(es): Fundação SOS Pró-Mata Atlântica - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2015

  Sistemática e história evolutiva da ordem Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa), Descrição: Resumidamente, o presente projeto visa, através de sequências nucleotídicas completas de genomas mitocondriais, propor uma hipótese filogenética robusta da ordem Scleractinia, dando ênfase às espécies azooxanteladas de águas profundas. Adicionalmente, os resultados filogenéticos oriundos deste estudo irão, potencialmente, auxiliar na compreensão das implicações que mudanças climáticas exerceram/exercerão sobre a ordem Scleractinia. Para isto, será dada ênfase para produção de estimativas de relógios moleculares que auxiliem na identificação dos principais momentos de divergência dos principais clados do grupo, além de suas correlações com paleo-ambientes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Alvaro Esteves Migotto - Coordenador / Kátia Cruz Capél - Integrante / Bruna Louise Luz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2009 - 2011

  Biodiversidade marinha do Estado de Santa Catarina: síntese do conhecimento e inovação para a gestão sustentável dos recursos naturais, Descrição: O Estado de Santa Catarina é o maior produtor nacional de pescado, abarca a maior frota pesqueira e o segundo maior porto de contêineres do Brasil (Porto de Itajai), e tem no seu litoral um dos mais importantes destinos turísticos de toda a América do Sul. Dadas as pesquisas do naturalista Fritz Muller no século XIX, Santa Catarina é também o estado pioneiro no estudo da biodiversidade marinha no Brasil. O conhecimento detalhado da biodiversidade marinha é, portanto, fundamental para a gestão dos recursos naturais do estado e para o bem estar de toda a populacão catarinense. Nesse sentido, o presente projeto visa (1) sintetizar o conhecimento sobre a biodiversidade marinha do estado de Santa Catarina e obter novos dados no curto prazo (24 meses) e (2) consolidar um grupo de pesquisa em biodiversidade marinha no estado através de uma abordagem inovadora no Brasil: a utilização de sequências de DNA para a identificação de espécies marinhas e seus padrões de distribuição no estado. Estes objetivos serão alcançados através da implementação online do Portal da Biodiversidade Marinha do Estado de Santa Catarina, de novas coletas biológicas na costa catarinense, e da implementação de um Laboratório de Biologia Molecular para obtenção de sequências de DNA. A utilização de técnicas clássicas de taxonomia e ecologia com técnicas modernas de biologia molecular é a abordagem central da proposta, que consolidará um emergente grupo multidisciplinar em estudo de biodiversidade marinha, o qual já vem atuando na Universidade Federal de Santa Catarina.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Lindner, Alberto - Coordenador / Andrea S. Freire - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2011

  A biodiversidade de peixes demersais dos bancos de corais de profundidade no talude superior da região sudeste e sul do Brasil, Descrição: O elevado esforço pesqueiro sobre os ambientes coralíneos de profundidade vem demonstrando a grande biodiversidade de peixes associados a estas formações. Por outro lado, tem-se observado também o declínio na captura de inúmeros recursos devido a parcial ou total destruição dos ecossistemas coralíneos. O presente projeto tem por objetivo sistematizar o conhecimento existente acerca da fauna de peixes de importância comercial associados aos ambientes coralíneos no talude superior (entre 200 e 800 m de profundidade) da região sudeste e sul do Brasil.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Michael Maia Mincarone - Integrante / Agnaldo S. Martins - Coordenador / José Angel Alvarez Perez - Integrante / João Batista Teixeira - Integrante / Paulo Costa - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2019

  Microbial symbiosis in deep sea corals, Descrição: Deep sea coral reefs are one of the most vulnerable marine ecosystems to human dependence on fishing, fossil fuels, and deep ocean mining, with reports increasing worldwide of significant environmental impacts to deep ocean ecosystems. The extent and immediacy of environmental threats to this ecologically and socio-economically important biosphere highlights the necessity for studies into deep sea corals, their associated communities, physiology, and the ecosystems they support. There is a significant lack of knowledge about the physiology, resilience, reproduction, biodiversity and microbial diversity of deep sea corals and deep sea coral reef ecosystems. Deep sea coral reefs are arguably the most three-dimensionally complex habitats in the deep-ocean, providing ecological niches for thousands of eukaryotic species and potentially millions of microbial species. Understanding these systems in greater detail is imperative to the future sustainability and improved management of these areas in an era of rapid environmental change. Therefore this project aims to determine the microbial communities associated with deep sea corals and coral reefs.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Tracy Ainsworth - Coordenador.

• 2007 - 2010

  Morphological and molecular systematics of scleractinian corals (Cnidaria, Anthozoa), with emphasis on deep-water species, Descrição: Corals are the subject of intense scientific, public and media interest because of their ecological and economic importance, and because of the uncertain fate of coral reefs in the face of ever increasing anthropogenic challenges. Despite this, the scleractinian origins are not well understood. Starting from the premise that taxonomy remains essential to credible biological research, and acknowledging that reliable and accurate molecular based phylogenies, and its interpretation relies on taxonomic knowledge, a large segment of the present thesis is dedicated to classical taxonomy of extant azooxanthellate scleractinians from New Caledonia. The examination of more than 3000 specimens, collected between 80 and 1200 m deep, revealed the occurrence of 170 species (including 3 new families, 1 new genus, and at least 12 undescribed species) to this small southwestern Pacific Archipelago. Species rarefaction analysis suggests that the species diversity for this region still underestimated, implying a much more diverse azooxanthellate scleractinian coral fauna than all previously examined regions in the world. Additionally, to better understand broad patterns of coral evolution, I generated molecular data for a broad and representative range of deep-water scleractinians, and conducted the most comprehensive molecular phylogenetic analyses of the order to date.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador.

• 2004 - 2006

  Sistemática, distribuição geográfica, abundância e importância dos bancos de corais da plataforma e talude continental do sul do Brasil, com ênfase para a identificação de áreas potenciais para a exclusão da pesca demersal, Descrição: O oceano profundo é provavelmente a última grande fronteira do planeta, devido, principalmente a necessidade de campanhas extremamente complexas e dispendiosas necessárias a sua pesquisa, sendo apenas uma pequena fração de seus ecossistemas marinhos encontrados abaixo dos 200 m de profundidade considerados bem estudados. Antes dos anos oitenta, o conhecimento científico dos recursos naturais da região da plataforma e talude continental no Brasil eram escassos. A partir da assinatura do Brasil na Convenção das Nações Unidas sobre o direito do Mar, em 1982, iniciou-se o impulso das pesquisas em oceanografia biológica na região do talude e águas profundas, principalmente pela necessidade de maiores conhecimentos a respeito dos recursos naturais da Zona Econômica Exclusiva (ZEE). A partir de 1996 foi implementado o Programa REVIZEE, significando, sem dúvida, um dos maiores esforços na pesquisa oceanográfica brasileira. Visando a implementação e adequação de políticas públicas, alguns grupos de organismos podem ser considerados com estratégicos do ponto de vista da preservação de habitat e consequentemente de estoques pesqueiros, destacando os corais azooxantelados. O presente trabalho disserta sobre os corais azooxantelados da Ordem Scleractinia (corais verdadeiros), coletados por campanhas oceanográficas e também pela frota pesqueira, ao largo da região sul do Brasil, área que abrange ao norte a divisa dos estados de São Paulo e Paraná, ao sul a fronteira do Brasil com o Uruguai e em direção ao mar tivemos como limite a isóbata dos 1000 m. Dentre os principais resultados apresentados, destacam-se as revisões aos estudos dos corais azooxantelados, aspectos oceanográficos físicos e químicos, sedimentologia, recursos minerais e pesca, além de estudo sistemático gerando a primeira chave de identificação dos corais de profundidade ocorrentes em águas brasileiras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Coordenador / Norberto Holmiro Horn Filho - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4

Projetos de desenvolvimento

• 2019 - Atual

  Maré de Ciência, Descrição: O Maré de Ciência é uma proposta inovadora de difusão científica e engajamento para fortalecer a interface entre ciência, políticas públicas e sociedade. Nós trabalhamos as Ciências do Mar no contexto da Agenda 2030 e dos Objetivos do Desenvolvimento Sustentável, alinhado aos objetivos da Década dos Oceanos da ONU. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Ronaldo Adriano Christofoletti - Coordenador / Fernando Ramos Martins - Integrante / Paula Kasten - Integrante / Barbara Lage Ignacio - Integrante / Tatiana Mazzo - Integrante / Leonardo Querobim Yokoyama - Integrante / Andrezza Justino Gozzo Andeotti - Integrante / William Conti - Integrante.

• 2019 - Atual

  Maré de Ciência, Descrição: O Maré de Ciência é uma proposta inovadora de difusão científica e engajamento para fortalecer a interface entre ciência, políticas públicas e sociedade. Nós trabalhamos as Ciências do Mar no contexto da Agenda 2030 e dos Objetivos do Desenvolvimento Sustentável, alinhado aos objetivos da Década dos Oceanos da ONU. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marcelo Visentini Kitahara - Integrante / Ronaldo Adriano Christofoletti - Coordenador / Fernando Ramos Martins - Integrante / Paula Kasten - Integrante / Barbara Lage Ignacio - Integrante / Tatiana Mazzo - Integrante / Leonardo Querobim Yokoyama - Integrante / Andrezza Justino Gozzo Andeotti - Integrante / William Conti - Integrante.

Prêmios