Rafael Azevedo Baraúna

Pós-doutorado

Formação complementar

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Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• GOMES NETTO, WALTER DE BARROS ; SOUSA, SAED SILVA ; NAKAMARU, SOFIA MAYUMI BRANDAO ; PHILIPPSEN, HELLEN KEMPFER ; DE CASTRO SILVA, DENIS ; COSTA, DERIKS KARLAY DIAS ; DE OLIVEIRA, ANA CAROLINA FAVACHO MIRANDA ; Baraúna, Rafael Azevedo ; DAS GRAÇAS, DIEGO ASSIS ; Silva, Artur ; DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN . PanGeneWhale - A dockerized Kotlin-based GUI platform for reproducible and user-friendly pangenomic analysis. COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY , v. 120, p. 108779, 2026.

• COSTA, SÁVIO DE SOUZA ; DAS GRAÇAS, DIEGO ASSIS ; Silva, Artur ; VERAS, ADONNEY ALLAN DE OLIVEIRA ; Schneider, Maria Paula Cruz ; SAMPAIO, DIONISO DE SOUZA ; Baraúna, Rafael Azevedo . High-Resolution Metabarcoding Reveals the Microbiome Dynamics of Mangrove Oysters ( Crassostrea gasar ) and Their Habitat. Marine Ecology , v. 47, p. e70075, 2026.

• LOBATO, AMÁLIA R. F. ; SOUZA, MIKHAIL J. S. ; PEREIRA, EMANOELE S. ; CAZUZA, THALYTA B. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. ; BRASILIENSE, DANIELLE M. . Emergence of NDM-7-Producing Klebsiella quasipneumoniae subs. simillipneumoniae ST138 in a Hospital from the Northern Region of Brazil. Microorganisms , v. 13, p. 314, 2025.

• OLIVEIRA, ROSYELY DA SILVA ; OLIVEIRA ALVES FILHO, NILSON CÉSAR ; GOMES NETTO, WALTER DE BARROS ; SILVA, DENIS DE CASTRO ; OLIVEIRA, MÔNICA SILVA DE ; OLIVEIRA, ANA CAROLINA FAVACHO MIRANDA DE ; Baraúna, Rafael Azevedo ; GRAÇAS, Diego Assis das ; Silva, Artur ; OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN DE . ContigPolishing: A User-Friendly Java GUI for contig extension and refinement in prokaryotic genomes. GENE , v. 1, p. 149893, 2025.

• OLIVEIRA, A. P. G. ; Graças, Diego A. ; Baraúna, Rafael A. ; SILVA, Artur . High abundance and diversity of antibiotic resistance genes during the Amazonian winter in the reservoir of the Tucuruí Hydroelectric Plant, state of Pará, Brazil. REVISTA PAN-AMAZÔNICA DE SAÚDE (ONLINE) , v. 16, p. e202501779, 2025.

• SANCHES, JOHNES PINTO ; COSTA, SÁVIO SOUZA ; DAS GRAÇAS, DIEGO ASSIS ; Silva, Artur ; BAIÃO, GUILHERME COSTA ; MOREIRA, RENNAN G. ; MAGALHÃES, MARCELO MURAD ; CUNHA, ROBERTO LISBOA ; Baraúna, Rafael Azevedo . Soil Fertilization with Palm Oil Mill Effluent Has a Short-Term Effect on the Bacterial Diversity of an Amazonian Agricultural Land Area. Microorganisms , v. 12, p. 507, 2024.

• DA SILVA, ANDERSON MORAES ; DA CRUZ PAULA NEVES, PATRICK ; COSTA, SÁVIO SOUZA ; Silva, Artur ; Schneider, Maria Paula Cruz ; DAS GRAÇAS, DIEGO ASSIS ; DA SILVA, JOYCE KELLY DO ROSÁRIO ; Baraúna, Rafael Azevedo . Assessment of Plant-Growth Promoting Potential of Bacteria Isolated from Amazonian Black Pepper Roots. Journal of Soil Science and Plant Nutrition , v. 1, p. 1, 2024.

• Cordeiro, CM ; Moia, Gislenne S. ; Oliveira, Mônica S. ; Silva, Lucas S. ; Schneider, Maria P.C. ; Costa, Sávio S. ; Baraúna, Rafael A. ; Graças, Diego A. ; Silva, Artur ; VERAS, A. A. O. . BioPipeline Creator-a user-friendly Java-based GUI for managing and customizing biological data pipelines. Scientific Reports , v. 14, p. 16572, 2024.

• DE OLIVEIRA, ANA CAROLINA FAVACHO MIRANDA ; VIEIRA, BRUNA DOMINGUES ; DE FELÍCIO, RAFAEL ; SILVA, LUCAS DA SILVA E ; VERAS, ADONNEY ALLAN DE OLIVEIRA ; GRAÇAS, Diego Assis das ; Silva, Artur ; AZEVEDO BARAÚNA, RAFAEL ; BARRETTO BARBOSA TRIVELLA, DANIELA ; Schneider, Maria Paula Cruz . A metabologenomics approach reveals the unexplored biosynthetic potential of bacteria isolated from an Amazon Conservation Unit. MICROBIOLOGY SPECTRUM , v. 1, p. e00996-24, 2024.

• Costa, Sávio S. ; Moia, Gislenne S. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. ; VERAS, A. A. O. . BADASS: BActeriocin Diversity ASsessment Software. BMC BIOINFORMATICS , v. 24, p. 24, 2023.

• BONNELLY, ROBERTO ; QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA ; CALDERON, VICTOR V. ; Baraúna, Rafael Azevedo ; JUCÁ RAMOS, ROMMEL THIAGO ; RODRÍGUEZ-RODRÍGUEZ, YASET ; DE FRANCISCO, LUIS ENRIQUE RODRÍGUEZ ; MAROTO MARTÍN, LUIS ORLANDO ; PERDOMO, OMAR PAINO ; FRANCO DE LOS SANTOS, EDIAN FRANKLIN . Beta-Lactam Susceptibility Profiles of Bacteria Isolated from the Ozama River in Santo Domingo, Dominican Republic. Sustainability , v. 15, p. 5109, 2023.

• COSTA, GLEYCIANE MACHADO DA ; COSTA, SÁVIO SOUZA ; Baraúna, Rafael Azevedo ; CASTILHO, BRUNO PUREZA ; PINHEIRO, IZABEL CRUZ ; Silva, Artur ; SCHAAN, ANA PAULA ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; GRAÇAS, Diego Assis das . Effects of Degradation on Microbial Communities of an Amazonian Mangrove. Microorganisms , v. 11, p. 1389, 2023.

• DIAS, DIANA ; COSTA, SÁVIO ; FONSECA, CARLOS ; BARAÚNA, RAFAEL ; CAETANO, TÂNIA ; MENDO, SÓNIA . Pathogenicity of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) from wildlife: Should we care?. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT , v. 812, p. 152324, 2022.

• COSTA, SÁVIO S. ; LAGO, LETICIA, A. B. ; Silva, Artur ; GRAÇAS, Diego Assis das ; LAMEIRA, JERÔNIMO ; BARAÚNA, R. A. . Diversity of bacteriocins in the microbiome of the Tucuruí Hydroelectric Power Plant water reservoir and three-dimensional structure prediction of a zoocin. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION) , v. 45, p. 1, 2022.

• CALDERÓN, VÍCTOR V. ; BONNELLY, ROBERTO ; DEL ROSARIO, CAMILA ; DUARTE, ALBERT ; BARAÚNA, RAFAEL ; RAMOS, ROMMEL T. ; PERDOMO, OMAR P. ; RODRIGUEZ DE FRANCISCO, LUIS E. ; FRANCO, EDIAN F. . Distribution of Beta-Lactamase Producing Gram-Negative Bacterial Isolates in Isabela River of Santo Domingo, Dominican Republic. Frontiers in Microbiology , v. 11, p. 519169, 2021.

• Conceição, Marcos V.R. ; Costa, Sávio S. ; Schaan, AP ; Ribeiro-dos-Santos, Ândrea K. C. ; Silva, Artur ; Graças, Diego A. ; Schneider, Maria P.C. ; Baraúna, Rafael A. . Amazonia seasons have an influence in the composition of bacterial gut microbiota of mangrove oysters (Crassostrea gasar). Frontiers in Genetics , v. 11, p. 602608, 2021.

• ARAÚJO, SUSANA ; TACÃO, MARTA ; BARAÚNA, RAFAEL ; RAMOS, ROMMEL ; Silva, Artur ; Henriques, Isabel . Genome analysis of two multidrug-resistant Escherichia coli O8:H9-ST48 strains isolated from lettuce. GENE , v. 785, p. 145603, 2021.

• Araújo, S. ; SOUSA, M. ; TACÃO, M. ; BARAÚNA, R.A. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. ; ALVES, A. ; MANAIA, C.M. ; HENRIQUES, I. . Carbapenem-resistant bacteria over a wastewater treatment process: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in untreated wastewater and intrinsically-resistant bacteria in final effluent. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT , v. 782, p. 146892, 2021.

• LANNES-COSTA, PAMELLA SILVA ; Baraúna, Rafael Azevedo ; RAMOS, JULIANA NUNES ; VERAS, JOÃO FLAVIO CARNEIRO ; CONCEIÇÃO, MARCOS VINÍCIUS REIS ; VIEIRA, VERÔNICA VIANA ; DE MATTOS-GUARALDI, ANA LUIZA ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; DORAN, KELLY S. ; Silva, Artur ; Nagao, Prescilla Emy . Comparative genomic analysis and identification of pathogenicity islands of hypervirulent ST-17 Streptococcus agalactiae Brazilian strain. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 1, p. 104195, 2020.

• TEIXEIRA, PEDRO ; TACÃO, MARTA ; Baraúna, Rafael A. ; Silva, Artur ; Henriques, Isabel . Genomic analysis of Chromobacterium haemolyticum: insights into the species resistome, virulence determinants and genome plasticity. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS , v. 1, p. 1, 2020.

• OLIVEIRA, AMANDA M.S. ; Baraúna, Rafael A. ; MARCON, DAVI J. ; Lago, Letícia A.B. ; Silva, Artur ; LUSIO, JOANA ; TAVARES, RAFAEL D.S. ; TACÃO, MARTA ; Henriques, Isabel ; Schneider, Maria P.C. . Occurrence, antibiotic-resistance and virulence of E. coli strains isolated from mangrove oysters (Crassostrea gasar) farmed in estuaries of Amazonia. MARINE POLLUTION BULLETIN , v. 157, p. 111302, 2020.

• COSTA, SÁVIO SOUZA ; GUIMARÃES, LUÍS CARLOS ; Silva, Artur ; SOARES, SIOMAR CASTRO ; Baraúna, Rafael Azevedo . First Steps in the Analysis of Prokaryotic Pan-Genomes. BIOINFORMATICS AND BIOLOGY INSIGHTS , v. 14, p. 117793222093806, 2020.

• FREITAS, DHARA Y. ; ARAÚJO, SUSANA ; Folador, Adriana R. C. ; Ramos, Rommel T. J. ; Azevedo, Juliana S. N. ; TACÃO, MARTA ; Silva, Artur ; Henriques, Isabel ; Baraúna, Rafael A. . Extended Spectrum Beta-Lactamase-Producing Gram-Negative Bacteria Recovered From an Amazonian Lake Near the City of Belém, Brazil. Frontiers in Microbiology , v. 10, p. 364, 2019.

• DIAS, LARISSA M ; FOLADOR, ADRIANA R C ; OLIVEIRA, AMANDA M ; RAMOS, ROMMEL T J ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . Genomic Architecture of the Two Cold-Adapted Genera Exiguobacterium and Psychrobacter: Evidence of Functional Reduction in the Exiguobacterium antarcticum B7 genome. Genome Biology and Evolution , p. 731-741, 2018.

• Baraúna, Rafael A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; PINHEIRO, KENNY C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; VIANA, MARCUS V. C. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; AZEVEDO, VASCO ; Silva, Artur . Assessing the Genotypic Differences between Strains of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi through Comparative Genomics. Plos One , v. 12, p. e0170676, 2017.

• Baraúna, Rafael A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; DE SÁ, PABLO H. C. G. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A. ; CARNEIRO, ADRIANA R. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; AZEVEDO, VASCO ; Silva, Artur . Genomic analysis of four strains of Corynebacterium pseudotuberculosis bv. Equi isolated from horses showing distinct signs of infection. Standards in Genomic Sciences , v. 12, p. 16, 2017.

• BARAÚNA, RAFAEL A ; FREITAS, D. Y. ; PINHEIRO, J. C. ; CARNEIRO, A. R. ; SILVA, A. . A proteomic perspective on the bacterial adaptation to cold: Integrating OMICs data of the psychrotrophic bacterium Exiguobacterium antarcticum B7. Proteomes , v. 5, p. 9, 2017.

• ARANTES, LARISSA SOUZA ; ALVES, J. T. C. ; VERAS, A. A. O. ; BARAÚNA, R. A. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; SPIER, S. ; Edman, J. ; GUIMARAES, L. C. ; ROCHA, F. ; Ramos, Rommel T. J. ; AZEVEDO, V. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; Carneiro,Adriana R . Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 226, Isolated from the Abscess of a Goat in California. Genome Announcements , v. 1, p. 10101000-1010100, 2016.

• KAWASAKI, REGIANE ; BARAÚNA, R. A. ; SILVA, A. ; CAREPO, MARTA S. P. ; OLIVEIRA, RUI ; MARQUES, RODOLFO ; Ramos, Rommel T. J. ; Schneider, Maria P. C. . Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of Exiguobacterium antarcticum B7 Based on Genomic and Bibliomic Data. BIOMED RES INT , v. 2016, p. 1-9, 2016.

• Baraúna, Rafael A. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A. ; Nunes, Catarina I. P. ; Schneider, Maria P. C. ; Silva, Artur ; CAREPO, MARTA S. P. . De novo synthesis of fatty acids is regulated by FapR protein in Exiguobacterium antarcticum B7, a psychrotrophic bacterium isolated from Antarctica. BMC Research Notes , v. 9, p. 447, 2016.

• BARAÚNA, R. A. ; Santos, Agenor V. ; Graças, Diego A. ; SANTOS, DANIEL M. ; GHILARDI JÚNIOR, RUBENS ; PIMENTA, ADRIANO M. C. ; CAREPO, MARTA S. P. ; Schneider, Maria P.C. ; SILVA, A. . Exposure to an extremely low-frequency electromagnetic field only slightly modifies the proteome of Chromobacterium violaceum ATCC 12472. Genetics and Molecular Biology (online version) , v. 38, p. 227-230, 2015.

• SILVA, A. D. S. D. S. ; BARAUNA, R. A. ; DE SA, P. C. G. ; DAS GRACAS, D. A. ; CARNEIRO, A. R. ; THOUVENIN, M. ; AZEVEDO, V. ; BADELL, E. ; GUISO, N. ; DA SILVA, A. L. D. C. ; Ramos, R. T. J. . Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France. Genome Announcements , v. 2, p. e01132-13-e01132-13, 2014.

• BARAÚNA, R. A. ; GUIMARAES, L. C. ; VERAS, A. A. O. ; DE SA, P. H. C. G. ; GRAÇAS, Diego Assis das ; PINHEIRO, K. C. ; SILVA, A. S. S. ; FOLADOR, E. L. ; BENEVIDES, L. J. ; VIANA, M. V. C. ; CARNEIRO, A. R. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SPIER, S. J. ; EDMAN, J. M. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. . Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California. Genome Announcements , v. 2, p. e00977-14-e00977-14, 2014.

• DALL'AGNOL, HIVANA PMB ; BARAÚNA, R. A. ; DE SÁ, PABLO HCG ; RAMOS, ROMMEL TJ ; NÓBREGA, FELIPE ; NUNES, CATARINA IP ; GRAÇAS, Diego Assis das ; CARNEIRO, ADRIANA R ; SANTOS, DANIEL M ; PIMENTA, ADRIANO MC ; CAREPO, MARTA SP ; AZEVEDO, VASCO ; PELLIZARI, VIVIAN H ; SCHNEIDER, MARIA PC ; Silva, Artur . Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation. BMC Genomics , v. 15, p. 986, 2014.

• DE SA, P. C. G. ; DA SILVA, M. L. ; CARNEIRO, A. R. ; GOMES, J. C. M. ; DIAS, L. M. ; ALVES, J. T. C. ; DE OLIVEIRA VERAS, A. A. ; BARAUNA, R. A. ; DAS GRACAS, D. A. ; MATTE, M. H. ; SATO, M. I. Z. ; HACHICH, E. M. ; MATTE, G. R. ; RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. . Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19. Genome Announcements , v. 2, p. e01094-14-e01094-14, 2014.

• GRAÇAS, Diego Assis das ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCÁ ; SÁ, PABLO GOMES ; Baraúna, Rafael Azevedo ; GHILARDI JR., RUBENS ; Schneider, Maria Paula Cruz ; Silva, Artur . Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir. Aquatic Science and Technology , v. 3, p. 18, 2014.

• VERAS, A. A. O. ; SA, P. H. C. G. ; PINHEIRO, K. C. ; GRACAS, D. A. ; BARAÚNA, R. A. ; SCHNEIDER, M. P. ; AZEVEDO, V. ; RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. . Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform. Journal of Proteomics & Bioinformatics , v. 7, p. 374, 2014.

• ASSIS DAS GRACAS, D. ; THIAGO JUCA RAMOS, R. ; VIEIRA ARAUJO, A. C. ; ZAHLOUTH, R. ; RIBEIRO CARNEIRO, A. ; SOUZA LOPES, T. ; AZEVEDO BARAUNA, R. ; AZEVEDO, V. ; CRUZ SCHNEIDER, M. P. ; Pellizari, V. H. ; SILVA, A. . Complete Genome of a Methanosarcina mazei Strain Isolated from Sediment Samples from an Amazonian Flooded Area. Genome Announcements , v. 1, p. e00271-13-e00271-13, 2013.

• CARNEIRO, A. R. ; JUCA RAMOS, R. T. ; BARAUNA, R. A. ; DE SA, P. H. ; MARINHO ALMEIDA, D. ; BARBOSA, S. ; PEREIRA, A. ; ALVES, A. ; EGAS, C. ; CORREIA, A. ; HENRIQUES, I. ; SILVA, A. . Draft Genome Sequence of Serratia fonticola LMG 7882T Isolated from Freshwater. Genome Announcements , v. 1, p. e00971-13-e00971-13, 2013.

• HENRIQUES, I. ; JUCA RAMOS, R. T. ; BARAUNA, R. A. ; DE SA, P. H. ; MARINHO ALMEIDA, D. ; CARNEIRO, A. R. ; BARBOSA, S. ; PEREIRA, A. ; ALVES, A. ; SAAVEDRA, M. J. ; EGAS, C. ; SILVA, A. ; CORREIA, A. . Draft Genome Sequence of Serratia fonticola UTAD54, a Carbapenem-Resistant Strain Isolated from Drinking Water. Genome Announcements , v. 1, p. e00970-13-e00970-13, 2013.

• Ciprandi, Alessandra ; Baraúna, Rafael Azevedo ; Santos, Agenor Valadares ; Gonçalves, Evonnildo Costa ; Carepo, Marta Sofia Peixe ; Schneider, Maria Paula Cruz ; Silva, Artur . Proteomic Response to Arsenic Stress in Chromobacterium violaceum. Journal of Integrated OMICS , v. 2, p. 69-73, 2012.

• de Sá, Pablo ; Pinto, Anne ; Ramos, Rommel T. J. ; Coimbra, Nilson ; Baraúna, Rafael A. ; Dall'Agnol, Hivana ; Carneiro, Adriana C. ; Ranieri, Alex ; Santos, Agenor V. ; Azevedo, Vasco ; Schneider, Maria P.C. ; Barh, Debmalya ; Silva, Artur . FunSys: Software for functional analysis of prokaryotic transcriptome and proteome. Bioinformation (Online) (Chennai) , v. 8, p. 529-531, 2012.

• CARNEIRO, A. R. ; Ramos, R. T. J. ; DALL'AGNOL, H. ; PINTO, A. C. ; DE CASTRO SOARES, S. ; SANTOS, A. R. ; GUIMARAES, L. C. ; ALMEIDA, S. S. ; BARAUNA, R. A. ; DAS GRACAS, D. A. ; FRANCO, L. C. ; ALI, A. ; HASSAN, S. S. ; NUNES, C. I. P. ; BARBOSA, M. S. ; FIAUX, K. K. ; ABURJAILE, F. F. ; BARBOSA, E. G. V. ; BAKHTIAR, S. M. ; VILELA, D. ; et.al . Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica. Journal of Bacteriology (Print) , v. 194, p. 6689-6690, 2012.

• GRAÇAS, DIEGO A ; JESUS, EDERSON C ; FILHO, LUCIANO C F ; JR, RUBENS GUILHARDI ; BARBOSA, MARIA SR ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCÁ ; LEÃO, TIAGO F ; BARAÚNA, RAFAEL A ; SCHNEIDER, MARIA PC ; Silva, Artur . Changes in Microbial Communities along a Water Column in an Amazonian Flooded Area. Aquatic Science and Technology , v. 1, p. 1-2, 2012.

• Baraúna, Rafael A. ; GRAÇAS, DIEGO A ; Miranda, Paulo R. ; Ghilardi, Rubens ; BARBOSA, Maria Silvanira ; Schneider, Maria P. C. ; Silva, Artur . Prokaryotic Diversity of the Tucuruí Hydropower Plant Reservoir in the Brazilian Amazon. Aquatic Science and Technology , v. 1, p. 181-199, 2012.

• Graças, Diego A. ; Miranda, Paulo R. ; BARAÚNA, R. A. ; McCulloch, John A. ; Ghilardi, Rubens ; Schneider, Maria Paula C. ; Silva, Artur . Microbial Diversity of an Anoxic Zone of a Hydroelectric Power Station Reservoir in Brazilian Amazonia. Microbial Ecology , v. 1, p. 1, 2011.

• Baraúna, Rafael A. ; Ciprandi, Alessandra ; Santos, Agenor V. ; Carepo, Marta S.P. ; Gonçalves, Evonnildo C. ; Schneider, Maria P.C. ; Silva, Artur . Proteomics Analysis of the Effects of Cyanate on Chromobacterium violaceum Metabolism. Genes , v. 2, p. 736-747, 2011.

• Baraúna, Rafael Azevedo . Mecanismos de adaptação da Exiguobacterium antarcticum B7 ao frio: Proteoma diferencial e caracterização da proteína reguladora da síntese de ácidos graxos. 1. ed. Alemanha: Novas Edições Acadêmicas, 2015. v. 1. 81p .

• Lobato, Amália, R. F. ; SILVA, B. L. ; SILVA, A. ; Brasiliense, D. M. ; BARAÚNA, R.A. . Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae: a clinical and environmental perspective in the Amazon region. In: Surajit Das; Hirak Ranjan Dash. (Org.). Microbial diversity in the genomic era; functional diversity and community analysis. 2ed.Londres: Elsevier, 2024, v. , p. 467-479.

• BARAÚNA, RAFAEL A ; GRACAS, D. A. ; ALVES, J. T. C. ; CAVALCANTE, A. L. ; SILVA, A. . Gel-Based Approaches in Genomic and Proteomic Sciences. In: Vijay Kumar Thakur; Manju Kumari Thakur. (Org.). Polymer Gels: Synthesis and Characterization. 1ed.Singapura: Springer Nature, 2018, v. 1, p. 1-.

• PINHEIRO, J. C. ; Santos, Lays T. ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Linking the Environmental Microbial Diversity and Antibiotic Resistance. In: Surajit Das; Hirak Ranjan Dash. (Org.). Microbial Diversity in the Genomic Era. 1ed.Londres: Elsevier, 2018, v. 1, p. 451-457.

• BRAGA, M. B. ; VERAS, A. A. O. ; DE SA, P. C. G. ; GRACAS, D. A. ; BARAUNA, R. A. ; ALVES, J. T. C. ; PINHEIRO, K. C. ; AZEVEDO, V. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; Ramos, R. T. J. ; SILVA, A. . Omics Technologies Applied to Prokaryotes. In: Kevin V. Urbano. (Org.). Advances in Genetics Research. 1ed.: Nova Science Publishers, 2016, v. 16, p. 1-.

• Ramos, R. T. J. ; VERAS, A. A. O. ; CARNEIRO, A. R. ; GRACAS, D. A. ; ALMEIDA, D. M. ; Franco Filho, L. C. ; RODRIGUES, M. P. ; SA, P. H. C. G. ; BARAUNA, R. A. ; Leão, T. F. ; SILVA, A. . Anotação de Genoma: Fundamentos e Aplicações das Análises in silico. In: Rodrigo Ribeiro Resende. (Org.). Biotecnologia Aplicada à Saúde: Fundamentos e Aplicações. 1ed.São Paulo: Blucher, 2016, v. 3, p. 717-755.

• Baraúna, Rafael A. ; VERAS, A. A. O. ; SA, P. H. C. G. ; PINHEIRO, K. C. ; Ramos, Rommel T. J. ; SILVA, Artur ; GRAÇAS, DIEGO A . Next-Generation Sequencing. In: Thiago Bruce Rodrigues; Amaro Emiliano Trindade Silva. (Org.). Molecular Diversity of Environmental Prokaryotes. 1ed.: CRC Press, 2016, v. 1, p. 229-241.

• GRACAS, D. A. ; BARAUNA, R. A. ; Franco Filho, L. C. ; LEAO, T. ; DE SÁ, PABLO HCG ; VERAS, A. A. O. ; CARNEIRO, A. R. ; MEIRELES, J. ; PINHEIRO, K. C. ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. . The use of Ion Torrent PGM for bacterial diversity analyses: The study case of five brazilian hydroelectric reservoirs. In: Camilla Benedetti. (Org.). Metagenomics: Methods, Applications and Perspectives. 1ed.: Nova Science Publishers, 2014, v. , p. 67-86.

• CIPRANDI, A ; BARAÚNA, R. A. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Alterações no Perfil de Proteínas de Chromobacterium violaceum em resposta ao arsênio. In: XI Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental, 2008, Fortaleza. Livro de Resumos, 2008.

• BARAÚNA, R. A. ; NEVES, A. N. ; BARBOSA, W. L. R. ; SOUZA, P. J. C. ; ROCHA, J. C. S. . Avaliação Fitoquímica e Farmacológica do Extrato Aquoso de Eleutherine plicata. In: 59ª Reunião Anual da SBPC, 2007. 14ª Jornada Nacional de Iniciação Científica, 2007.

• VIEIRA, J. K. S. ; Ribeiro, N. C. ; SILVA, B. L. ; GRACAS, D. A. ; Schneider, Maria P.C. ; BARROS, A. J. A. ; OLIVEIRA, W. A. ; SILVA, J. A. A. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Aerobic bacterial spores as indicators of treatment efficiency in water sources and plants in the Metropolitan Region of Belém-PA. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• Gonçalves, L. R. ; COSTA, G. B. S. ; Ribeiro, N. C. ; SILVA, B. L. ; ANDRADE, S. S. ; OLIVEIRA, T. A. ; FARIAS, F. S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Graças, Diego A. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . RT-qPCR: a tool for SARS-CoV-2 epidemiological surveillance in urban wastewater. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• Ribeiro, N. C. ; SILVA, B. L. ; VIEIRA, J. K. S. ; SILVA, I. C. ; OLIVEIRA, T. A. ; FARIAS, F. S. ; Schneider, Maria Paula C. ; VERAS, A. A. O. ; Graças, Diego A. ; SILVA, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Phenotypic profile of isolates from sewage treatment plants in the Belém metropolitan region. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• PIMENTA, M. C. ; VASCONCELOS, C. P. ; Costa, Sávio S. ; Sanches, Johnes P. ; GRANDIS, A. ; REZENDE, F. M. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Graças, Diego A. ; VERAS, A. A. O. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . GENOMIC AND PHYSIOLOGICAL POTENTIAL OF Kosakonia pseudosacchari Pn16 FOR PROMOTING PLANT GROWTH UNDER THERMAL STRESS. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• VASCONCELOS, C. P. ; PIMENTA, M. C. ; COSTA, SÁVIO S. ; Graças, Diego A. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Silva, Artur ; Sanches, Johnes P. ; GRANDIS, A. ; REZENDE, F. M. ; BUCKERIDGE, M. S. ; Baraúna, Rafael A. . POTENTIAL BIOCONTROL ACTIVITY OF KOSAKONIA PSEUDOSACCHARI Pn16: AN IN SILICO ANALYSIS. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• CALDAS, A. S. ; Graças, Diego A. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Detection and identification of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in samples of wastewater treatment plants from Belém, PA. In: 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Campos do Jordão. Anais do 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2024.

• SILVA, B. L. ; NEVES, C. A. S. ; VIEIRA, BRUNA DOMINGUES ; NIERO, H. ; ANDRADE, S. S. ; BARBOSA, Maria Silvanira ; SCHNEIDER, M. P. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; BITAR, Y. O. C. ; Graças, Diego A. ; BARRETTO BARBOSA TRIVELLA, DANIELA ; SILVA, Artur ; Baraúna, Rafael A. . SHOTGUN METAGENOMICS REVEALS HIGH MICROBIAL DIVERSITY IN TESO SOILS FROM MARAJÓ ISLAND. In: 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2025, Belém. Anais do 70o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2025.

• VIEIRA, J. K. S. ; Ribeiro, N. C. ; SILVA, B. L. ; SILVA, I. C. ; FARIAS, S. D. P. ; Graças, Diego A. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Silva, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Detection of carbapenemases and evaluation of their removal capacity by sewage treatment plants in the metropolitan region of Belém. In: I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Industrial, 2024, Florianópolis. Anais do I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Industrial, 2024.

• Ribeiro, N. C. ; ANDRADE, S. S. ; SILVA, B. L. ; VIEIRA, J. K. S. ; Schneider, Maria P.C. ; VERAS, A. A. O. ; Graças, Diego A. ; SILVA, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Surveillance of Clinically Relevant Beta- Lactamases by qPCR and Evaluation of their Removal by Wastewater Treatment Plants in Belém-PA. In: 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2024, Campos do Jordão. Anais do 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2024.

• SILVA, B. L. ; MARCON, D. J. ; ARAUJO, J. L. ; ALVES, F. A. S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; GRACAS, D. A. ; SILVA, Artur ; SCHNEIDER, M. P. ; Baraúna, Rafael A. . Molecular investigation of antibiotic and heavy metal resistance in gram-negative bacteria from human-impacted areas in Santarém, Pará. In: 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética, 2024, Campos do Jordão. Anais do 69o Congresso Internacional da Sociedade Brasileira de Genética. São Paulo: Sociedade Brasileira de Genética, 2024.

• Lago, Letícia A.B. ; Costa, Sávio S. ; Silva, Artur ; Graças, Diego A. ; Baraúna, Rafael A. . Bioprospecting of bacteriocin-like genes in the metagenome of the Tucuruí-hydropower plant reservoir. In: 30° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019, Maceió. Resumos do 30° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019.

• Conceição, Marcos V.R. ; Costa, Sávio S. ; Araújo, S. ; Folador, Adriana R. C. ; RAMOS, ROMMEL T J ; TACÃO, MARTA ; Azevedo, Juliana S. N. ; SILVA, Artur ; Henriques, Isabel ; Baraúna, Rafael A. . Genome and resistome of two multidrug-resistant Gram-negative strains isolated from an Amazonia lake. In: 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019, Maceió. Resumos do 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019.

• Teixeira, Dielle M. ; Silva, Luciana D. ; Resque, H.R. ; GABBAY, Y. B. ; BARAÚNA, RAFAEL A . Application of phylogenomic tools for Norovirus analysis. In: 65th Brazilian Congress of Genetics, 2019, Águas de Lindóia. Resumos do 65º Congresso Brasileiro de Genética, 2019.

• Costa, Sávio S. ; Baraúna, Rafael A. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; Soares, Siomar C. ; Silva, Artur . Structural divertisy of bacterial pan-genomes. In: 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019, Maceió. Resumos do 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019.

• Reis, José L. ; Costa, Sávio S. ; Marcon, Davi ; LIMA, A. ; Valinoto, Marcelo ; SILVA, Artur ; Baraúna, Rafael A. . Bayesian phylogenetic analysis and molecular clock of the Corynebacterium genus. In: 30° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019, Maceió. Resumos do 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019.

• Marcon, Davi ; Oliveira, Amanda M. ; Lago, Letícia A.B. ; SILVA, Artur ; Henriques, Isabel ; Tacão, Marta ; Schneider, Maria P. C. ; Baraúna, Rafael A. . Occurence, antibiotic-resistance and phylogenetic profile of Escherichia coli strains isolated from mangrove oysters (Crassostrea gasar) farmed in Amazonic estuaries. In: 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019, Maceió. Resumos do 30º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2019.

• ALVES, J. T. C. ; BRABO, G. ; Dias, Larissa M. ; Araújo, Carlos L. ; BARAÚNA, RAFAEL A ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; Folador, Adriana R. C. . Caracterização de bactérias Gram-negativas resistentes à antibióticos beta-lactâmicos no lago Bolonha, manancial de Belém, Pará - Brasil. In: XXIV Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2018, Santiago. Resumos do XXIV Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2018. v. 1.

• LIMA, A. ; Araújo, Carlos L. ; FOLADOR, E. ; Azevedo, Vasco ; BARAÚNA, RAFAEL A ; Artur Luiz da Costa da Silva . Análise comparativa de espécies patogênicas e não patogênicas de Corynebacterium spp.. In: XXIV Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2018, Santiago. Resumos do XXIV Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2018. v. 1.

• Barreto, Diego F. ; ALVES, J. T. C. ; Araújo, Carlos L. ; Dias, Larissa M. ; Costa, Wana L. ; Baraúna, Rafael A. ; SILVA, Artur ; Folador, Adriana R. C. . Assembly and functional annotation of genomes of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi and ovis. In: 29° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017, Foz do Iguaçu. 29° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017.

• Barreto, Diego F. ; ALVES, J. T. C. ; Araújo, Carlos L. ; Dias, Larissa M. ; Costa, Wana L. ; Baraúna, Rafael A. ; Araújo, S. ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; Folador, Adriana R. C. . Genetic Characterization of Klebsiella sp. antibiotic-resistant strain isolated from Água Preta lake, fountain from Belém, Pará. In: 29° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017, Foz do Iguaçu. 29º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017.

• ALVES, J. T. C. ; Araújo, Carlos L. ; Dias, Larissa M. ; Costa, Wana L. ; Barreto, Diego F. ; Castro, Ícaro R. R. ; Baraúna, Rafael A. ; Silva, Artur ; Folador, Adriana R. C. . The bioprospection of Gram-negative bacteria resistant to beta-lactam antibiotic in lake Bolonha, Pará - Brazil. In: 29º Congresso Brasileiro de MIcrobiologia, 2017, Foz do Iguaçu. 29º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017.

• Gantois, Rafael C. ; Castillo, Raquel E. H. ; Santos, Rodrigo P. S. ; Souza, Thiago J. ; Viana, Marcus V. C. ; Gomide, Anne C. P. ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A ; Azevedo, Vasco . Genome assembly completeness and its effect on phylogenetic estimation. In: 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. 13th International Conference of the AB3C, 2017.

• BARAÚNA, RAFAEL A ; FREITAS, D. Y. ; Araújo, S. ; Folador, Adriana R. C. ; Ramos, Rommel T. J. ; Azevedo, Juliana S. N. ; Silva, Artur ; Henriques, Isabel . Multi-drug resistant Gram-negative isolates recovered from an Amazonian mesotrophic lake. In: Congress of Microbiology and Biotechnology 2017, 2017, Porto, Portugal. Resumos do MicroBiotec17, 2017.

• Dias, Larissa M. ; Folador, Adriana R. C. ; Oliveira, Amanda M. ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . The genomic architecture of the two cold-adapted genera Exiguobacterium and Psychrobacter: Evidence of functional reduction in Exiguobacterium antarcticum B7 genome. In: Congress of Microbiology and Biotechnology 2017, 2017, Porto, Portugal. Resumos do MicroBiotec17, 2017.

• FREITAS, D. Y. ; Araújo, S. ; Ramos, Rommel T. J. ; FOLADOR, ADRIANA R C ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . O resistoma ambiental de um lago eutrófico amazônico e pesquisa de linhagens resistentes a antibióticos de último recurso. In: III Encontro Nacional de Estudantes de Biotecnologia - Nucleo17, 2017, Salvador. Resumos do Nucleo17, 2017.

• FREITAS, D. Y. ; PINHEIRO, J. C. ; Oliveira, Amanda M. ; Araújo, S. ; Ramos, Rommel T. J. ; Folador, Adriana R. C. ; Azevedo, Juliana S. N. ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . Genoma da linhagem APC43A de Escherichia coli multirresistente isolada do lago Água Preta, Belém, PA. In: II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017, Belém. Resumos do II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017.

• PINHEIRO, J. C. ; Santos, Lays T. ; FREITAS, D. Y. ; Oliveira, Amanda M. ; Araújo, S. ; Ramos, Rommel T. J. ; FOLADOR, ADRIANA R C ; Azevedo, Juliana S. N. ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . Descrição e caracterização de linhagens Gram-negativas isoladas de um lago eutrófico Amazônico. In: II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017, Belém. Resumos do II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017.

• Oliveira, Amanda M. ; FREITAS, D. Y. ; PINHEIRO, J. C. ; Araújo, S. ; Ramos, Rommel T. J. ; FOLADOR, ADRIANA R C ; Azevedo, Juliana S. N. ; Henriques, Isabel ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . Caraceterização do genoma da linhagem APC25 de Acinetobacter baumannii multirresistente isolada de um lago Eutrófico Amazônico. In: II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017, Belém. Resumos do II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017.

• Aburjaile, Flávia F. ; Lobato, Amália, R. F. ; Guimarães, L.C. ; CAVALCANTE, A. L. ; PINHEIRO, K. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; BARAÚNA, RAFAEL A ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. . Characterization of phage sequences on Corynebacterium pseudotuberculosis genomes. In: 12th International Conference of the AB3C - X-Meeting, 2016, Belo Horizonte. Resumos do X-Meeting 2016, 2016.

• Baraúna, Rafael A. ; LOBATO, A. ; COSTA, S. ; BARRETO, D. ; SILVA, Y. ; CAVALCANTE, A. L. ; MAUES, D. ; de Sá, Pablo ; VERAS, A. A. O. ; GRAÇAS, DIEGO A ; Guimarães, L.C. ; CANARIO, V. ; BENEVIDES, L. ; Schneider, Maria P. C. ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCÁ ; SPIER, S. J. ; AZEVEDO, VASCO ; Silva, Artur . Genome sequencing of twelve strains of the animal pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis bv. equi. In: 28º Congresso Brasileiro de MIcrobiologia, 2015, Florianópolis. Resumos do 28º CBM, 2015.

• Ramos, R. T. J. ; DE SÁ, PABLO HCG ; VERAS, A. A. O. ; BARAÚNA, R. A. ; GRACAS, D. A. ; CARNEIRO, A. R. ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, A. . GO4D - Gene Ontology for Dummies. In: 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2014, Boston. 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2014.

• BARAÚNA, R. A. ; CARNEIRO, A.R. ; Dall'Agnol, Hivana ; Nóbrega, Felipe ; Ramos, R. T. J. ; de Sá, Pablo ; Nunes, Catarina I. P. ; Carepo, M. S. P. C. ; AZEVEDO, V. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; Pellizari, V. H. ; SILVA, A. . Como uma bactéria sobrevive ao frio? Elucidando os mecanismos moleculares de adaptação da Exiguobacterium antarcticum. In: 59° Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia - SP. Anais do 59° Congresso Brasileiro de Genética, 2013.

• VERAS, A. A. O. ; DE SÁ, PABLO HCG ; BARAÚNA, R. A. ; CARNEIRO, A. R. ; DAS GRACAS, D. A. ; MARINHO ALMEIDA, D. ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, A. ; Ramos, R. T. J. . B4D - Blast2GO for Dummies. In: X-Meeting, 2013, Recife. Anais do X-Meeting 2013, 2013.

• GRACAS, D. A. ; BARAÚNA, R. A. ; Perez-Chaparro, J. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Molecular analysis of prokaryotic diversity of a hydroelectric power station reservoir in brazilian Amazonia. In: 13th International Symposium on Microbial Ecology, 2013, Seattle. ISME-13, 2013.

• Nóbrega, Felipe ; Baraúna, Rafael A. ; Silva, Artur ; Pellizari, V. H. . Potential for survival and adaptation of extremophile Exiguobacterium antarcticum in simulated extraterrestrial life. In: Astrobiology Science Conference 2012 - AbSciCon 2012, 2012, Atlanta. Resumes of AbSciCon 2012, 2012.

• Baraúna, Rafael A. ; Nóbrega, Felipe ; Melo-Barbosa, Hivana P. ; Carneiro, Adriana C. ; Nunes, Catarina I. P. ; Carepo, Marta S.P. ; Pellizari, V. H. ; Schneider, Maria Paula C. ; Silva, Artur . Proteomics of the psychrotrophic bacterium Exiguobacterium antarcticum B7. In: International Polar Year 2012 Conference, 2012, Montreal. Resumes of IPY 2012, 2012.

• BARAÚNA, R. A. ; CIPRANDI, A ; Santos, Agenor V. ; PIMENTA, A.M.C. ; Carepo, Marta S.P. ; GONCALVES, E. C. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Análise dos efeitos causados pelo cianato no metabolismo da Chromobacterium violaceum ATCC 12472 através de uma abordagem proteômica. In: 26º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu. Resumos do 26º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.

• Franco Filho, L. C. ; Jesus, E. C. ; GRACAS, D. A. ; BARAÚNA, R. A. ; Leão, T. F. ; BARBOSA, M. S. R. ; GHILARDI Jr, R. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Cromatografia Líquida Desnaturante de Alto Desempenho (DHPLC) aplicada na avaliação da diversidade procariótica da coluna d'água do reservatório da UHE-Tucuruí. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu/PR. Resumos do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.

• Carneiro, Adriana C. ; Ramos, Rommel T. J. ; Baraúna, Rafael A. ; MELO-BARBOSA, H ; Carepo, M. S. P. C. ; Pellizari, V. H. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; Silva, Artur . Montagem e análise comparativa do genoma da bactéria psicrotrófica Exiguobacterium antarcticum linhagem B7. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu. Resumos do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.

• MELO-BARBOSA, H ; BARAÚNA, R. A. ; LAMEIRA, J. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Homology modeling of mercury reductase from thermophilic bacterium - Thermus thermophilus HB27. In: 5 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-meeting Abstracts, 2009.

• GUIMARÃES, L.C. ; BARAÚNA, R. A. ; CARNEIRO, A.R. ; LAMEIRA, J. ; McCULLOCH, J.A. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; MIYOSHI, A. ; SILVA, A. ; AZEVEDO, V. . Molecular modeling of the Chromobacterium violaceum cyn operon regulator protein (cynR). In: 5 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-meeting Abstracts, 2009.

• BARAÚNA, R. A. ; CIPRANDI, A ; LAMEIRA, J. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Caracterização molecular da enzima anidrase carbônica codificada pelo operon cyn de Chromobacterium violaceum. In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Resumos do 25º CBM, 2009.

• BARAÚNA, R. A. ; CIPRANDI, A ; GHILARDI JUNIOR, R. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Determinação da concentração inibitória mínima do cianato para Chromobacterium violaceum. In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Resumos do 25º CBM, 2009.

• BARAÚNA, R. A. ; MIRANDA, P. R. O. ; GHILARDI JUNIOR, R. ; ANDRADE, S. S. ; BARBOSA, M. S. R. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; SILVA, A. . Diversidade Filogenética de Bactérias Presentes em Ecossistema Pristino e Anóxico do Reservatório da UHE Tucuruí, Pará. In: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador. Resumos do 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008.

• BARAÚNA, R. A. ; BARBOSA, M. S. R. ; ANDRADE, S. S. ; GHILARDI JUNIOR, R. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. . Diversidade Bacteriana do Reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí-PA. In: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. Resumos do 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007.

• BARAÚNA, RAFAEL A . Biotecnologia Ambiental. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Baraúna, Rafael A. . Bioprospecção e Biotecnologia Ambiental. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARAÚNA, R. A. ; Reis, S. P. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. . Proteoma do Músculo Esquelético do Búfalo da Raça Murrah. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• BARAÚNA, R. A. ; NEVES, A. N. ; BARBOSA, W. L. R. ; SOUZA, P. J. C. ; ROCHA, J. C. S. . Avaliação Tóxico-Farmacológica de Plantas Medicinais Nativas da Região Amazônica. 2006. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Caracterização da mariscagem nos maretórios Pará-Amapá para o fortalecimento e sustentabilidade da cadeia produtiva na Amazônia, Descrição: O termo maretório foi criado por comunidades tradicionais, também denominadas povos extrativistas costeiro-marinhos, para definir áreas litorâneas pobremente representadas pelo termo território. São nessas regiões que se encontram as Reservas Extrativistas Marinhas (RESEXs) do litoral da Amazônia, principais locais onde se praticam o cultivo e a extração dos mariscos. Os principais avanços deste projeto para o setor incluem a obtenção de informações socioeconômicas para o ordenamento da atividade, auxílio na promoção de práticas sustentáveis, e identificação de parâmetros ambientais, patógenos, ou espécies exóticas invasoras que possam comprometer as cadeias produtivas. Outro avanço será a identificação taxonômica das espécies comercializadas na região utilizando genômica, um aspecto chave para a expansão de qualquer cadeia produtiva. Além disso, esperamos entregar um diagnóstico da saúde e conservação dos ecossistemas onde estes mariscos são extraídos ou cultivados. Finalmente, pretendemos auxiliar na formulação de normas para promoção da higiene e sanidade destes animais, com o intuito de diminuir perdas e custos de produção, inibir a exploração desordenada, promovendo práticas sustentáveis que garantam o bem-estar humano, ambiental e animal. O projeto também busca contribuir com iniciativas de catalogação da biodiversidade brasileira, adicionando dados coletados nas amostragens (vídeos, fotos, figuras e outros) no Sistema de Informação Sobre a Biodiversidade Brasileira SiBBr. A rede de pesquisa é composta por grupos reconhecidamente produtores de conhecimento sobre os mariscos comercializados na região Norte, incluindo: UFPA, UNIFAP, ICMBio, Embrapa Amapá e UFSC.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Coordenador / Soraya Silva Andrade - Integrante / GRAÇAS, DIEGO A - Integrante / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Artur Silva - Integrante / Adonney Allan de Oliveira Veras - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Silvia Maria Mathes Faustino - Integrante / Sávio de Souza Costa - Integrante / Lucas da Silva e Silva - Integrante / Dioniso Souza Sampaio - Integrante / Afonso Celso Dias Bainy - Integrante / Jô de Farias Lima - Integrante / Luciana Sampaio Lima - Integrante / Kelly Kalynka Damasceno Cruz - Integrante / William Ricardo da Silva Fernandes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2024 - Atual

  Avaliação da resistência antimicrobiana em efluentes de estações de tratamento de esgoto da cidade de Belém, Amazônia Brasileira, Descrição: A resistência antimicrobiana (RAM) é considerada uma das principais ameaças para a saúde pública atualmente. Este projeto busca avaliar o uso de Estações de Tratamento de Esgoto para o monitoramento da RAM em grandes centros urbanos, uma abordagem já utilizada em diversos países no mundo. Atenção especial será dada para bactérias Gram-negativas resistentes aos beta-lactâmicos de último recurso. A análise será realizada em estações de Belém, PA, sob os termos do Acordo de Cooperação entre o EngBio, da UFPA, e a Companhia de Saneamento do Pará (COSANPA). O projeto conta com a parceria da Universidade de Durham e Universidade de Newcastle, ambas do Reino Unido.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2023 - Atual

  Monitoramento ambiental e vigilância genômica do Novo Coronavírus (SARS-CoV-2) e bactérias multirresistentes, Descrição: A resistência aos antibióticos foi recentemente considerada pela Organização Mundial da Saúde como uma das três maiores ameaças deste século em termos de saúde pública, aumentando consideravelmente a morbidade e mortalidade associadas a doenças infecciosas. A resistência que encontramos em isolados bacterianos hospitalares é comumente encontrada em isolados bacterianos ambientais. Isto ocorre, pois a resistência aos antibióticos é um mecanismo natural, utilizado por bactérias do ambiente para sobreviver a presença de compostos antimicrobianos naturais produzidos por outros micro-organismos. Este cenário é ainda mais preocupante na atual conjuntura da pandemia de Covid-19. Devido co-infecções bacterianas em pacientes acometidos com a doença, vários antibióticos foram usados em larga escala e com pouco controle. Este projeto visa avaliar a ocorrência, risco e disseminação de bactérias multi droga resistentes do grupo ESKAPE e a presença d e variantes de preocupação do vírus SARS-CoV-2 em amostras de água e esgoto da Região Metropolitana de Belém. O projeto é desenvolvido em parceria com a Companhia de Sanemento do Pará (COSANPA).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Coordenador / Soraya Silva Andrade - Integrante / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Sávio de Souza Costa - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / johnes pinto sanches - Integrante / Aline Madeira Marques Saraiva - Integrante / GIOVANNA BEATRIZ Santos da Costa - Integrante / Suelem Daniella Pinho Farias - Integrante / Dandara Pinheiro Melo - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2022 - Atual

  Contribuições do microbioma ambiental nos cultivos de ostras nativas em Reservas Extrativistas Marinhas no Estado do Pará em busca de um manejo sustentável, Descrição: Esta proposta busca realizar uma pesquisa de caráter inédito para a região Amazônica com o objetivo de definir a composição do microbioma das ostras nativas, em diferentes épocas do ano, em diferentes estuários e em diferentes estágios do desenvolvimento do molusco. Os dados serão de grande importância para tomadas de decisão dentro da cadeia produtiva de ostra no estado do Pará e fortalecerá a produção de ostras nativas dentro do país, especialmente na região norte.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Soraya Silva Andrade - Integrante / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Sávio de Souza Costa - Integrante / Dioniso Sampaio - Coordenador / johnes pinto sanches - Integrante / Daniel Voloski Guasselli - Integrante / Gleyciane Machado da Costa - Integrante / Carlos Alberto Martins Cordeiro - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2021 - 2023

  Produção de selos de autenticação alimentícia e detecção de fraudes pra cadeia agropecuária paraense usando métodos moleculares, Descrição: As complexidades na cadeia de suprimentos de alimentos e bebidas criam oportunidades significativas e, às vezes, relativamente fáceis para atividades fraudulentas com motivação econômica. Essas oportunidades de fraude podem ocorrer em qualquer parte do processo de produção, desde o local de fabricação até o consumidor, e muitas vezes passam despercebidas. Nos últimos anos, garantir a autenticidade de alimentos e bebidas tornou-se um problema global crescente. Este projeto tem como motivação perguntas comuns dos consumidores, como: o produto alimentício é puro? Ele contém algum contaminante? Foi adulterado? De óleos comestíveis, sucos, bebidas alcoólicas, leite, carnes, peixes, mel e especiarias, os alimentos e bebidas possuem uma impressão digital, um produto químico único e / ou assinatura que permite a identificação de seus componentes, e um deles é o DNA. Utilizaremos amostras alimentícias e extrairemos o material genético contido ali, com o objetivo de identificar e determinar a pureza de desses produtos, agregando valor a marca dos produtos e dando confiança para o mercado consumidor.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Diego Assis das Graças - Coordenador., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2021 - 2023

  Implantação do Centro de Bioeconomia e Biotecnologia Médica da Amazônia - CBBMA, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Artur Luiz da Costa da Silva em 09/03/2023., Descrição: O projeto objetiva o desenvolvimento de soluções tecnológicas voltadas pra sustentabilidade das cadeias produtivas do Pará. Dessa forma, busca nuclear tecnologias e instrumentação avançada para o desenvolvimento da bioeconomia e biotecnologia. O genoma e transcriptoma do açaí (Euterpe oleracea Mart.) é o projeto piloto para a implantação destas novas tecnologias.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Artur Silva - Coordenador / Soraya Silva Andrade - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2018 - 2020

  Genômica ambiental aplicada a biofilmes biocorrosivos da Usina HIdrelétrica de Tucuruí, Descrição: Este projeto tem como finalidade uma compreensão estrutural, genética e metabólica de biofilmes causadores de biocorrosão das galerias de concreto da usina hidrelétrica de Tucuruí, utilizando uma abordagem multi-ômica ? genômica, metagenômica e transcriptômica - com sequenciamento de nova geração para obtenção de genomas dos táxons presentes, determinação das vias metabólicas biocorrosivas ativas e atividade microbiana. Para isto, amostras serão coletadas e analisadas nas plataformas de sequenciamento mais eficientes e com as ferramentas de bioinformática mais atuais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Artur Silva - Integrante / Diego Assis das Graças - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2020

  Avaliação do resistoma em ambientes de água doce na Amazônia: Genômica de linhagens bacterianas multirresistentes, Descrição: Como evidenciado por estudos de metagenômica, a diversidade microbiana em ambientes naturais é extremamente alta, constituindo-se como um reservatório de moléculas biologicamente ativas. Nestes ambientes é possível encontrar uma alta diversidade de antibióticos naturais e, consequentemente, uma variedade ainda maior de mecanismos de resistência a estas moléculas. No contexto amazônico, a presente proposta visa avaliar a diversidade microbiana e o perfil fenotípico e genotípico da resistência microbiana nos lagos Bolonha e Água Preta, localizados no Complexo Hídrico Estadual do Utinga, em Belém-PA, além de caracterizar os genomas de linhagens de E. coli isoladas destes ambientes, já que esta espécie apresenta características para funcionar como mediador na transferência de resistência do Homem para o Ambiente, e vice-versa. A pesquisa possui implicações diretas para a saúde pública, pois os mecanismos de resistência microbiana observados na clínica são também disseminados em ambientes naturais. No caso dos lagos Água Preta e Bolonha, a ação antrópica observada ao redor do complexo hídrico torna-se um catalisador para o surgimento de linhagens ambientais resistentes a antibióticos, além de aumentar a possibilidade de eventos genéticos que permitam que bactérias patogênicas ou da microbiota humana, acumulem informações genéticas contidas em microrganismos de vida-livre. Há 15 anos a Organização Mundial da Saúde publicou o ?WHO Global Strategy for Containment of Antimicrobial Resistance?, enfatizando estratégias necessárias para o combate à resistência aos antimicrobianos e apresentando índices alarmantes sobre o número de infecções causadas por linhagens multirresistentes e o elevado custo monetário a nível global que estes quadros infecciosos podem causar. Nesta pesquisa serão utilizadas abordagens de microbiologia para isolamento de bactérias resistentes aos antibióticos de último recurso, bem como será realizada uma pesquisa de genes de resistência por técnicas de biologia molecular. A diversidade microbiana dos lagos será avaliada por metagenômica e os genomas das linhagens de E. coli isoladas serão seqüenciados na plataforma de nova geração Ion Proton?. Frente às características ambientais anteriormente descritas, os lagos Bolonha e Água Preta tornam-se um ótimo local de estudo para avaliar o perfil do resistoma de um lago amazônico e sua contribuição para o surgimento de linhagens bacterianas multirresistentes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Coordenador / Diego Assis das Graças - Integrante / Adriana - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Joana Montezano Marques - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2017

  ARTEMan:Transferência de resistência a antibióticos entre o Ambiente e o Homem, Descrição: Projeto de cooperação internacional FCT CAPES Edital CAPES-FCT 039/2014. Universidade de Aveiro Profa. Dra. Isabel da Silva Henriques.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Isabel Henriques - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Diego Assis das Graças - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.

• 2015 - 2017

  Estudo do interatoma e exossoma em Corynebacterium pseudotuberculosis para pesquisa de novos alvos terapêuticos, Descrição: Existe uma dificuldade na eliminação da C. pseudotuberculosis por macrófagos, e desvendar como ocorre a interação entre patógeno e hospedeiro, conhecer a cascata de resposta em nível transcricional, nos dois organismos simultaneamente, bem como elucidar o efeito do exossoma secretado na resposta imune do hospedeiro, abriria um leque de tentativas para busca de soluções eficazes contra este problema enfrentado. Tanto o patógeno quanto o hospedeiro buscam uma resposta rápida, adaptativa, eficaz para a própria sobrevivência. Assim, perceber a alteração no ambiente e transmitir a informação montando uma rede de resposta ideal é o ponto chave para entender todo o processo para manutenção dos organismos no ambiente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (2) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Vasco - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Coordenador / Joana Montezano Marques - Integrante / Bruno Walter Santos Sobral - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2014 - 2016

  O genoma do búfalo do Marajó, Descrição: Recentes avanços na biologia molecular tem levado a uma rápida obtenção de genomas completos de animais domésticos. Em relação a genômica aplicada a pecuária foram identificadas regiões gênicas ligadas a produção e qualidade do leite e queijo, a incidência de doenças hereditárias, resistência e susceptibilidade a verminose, maciez e marmoreio da carne, ganho de peso, entre outras. A tendência é um aumento na geração de novas informações sobre regiões gênicas e genes que possam influenciar na produção, saúde e qualidade das populações de animais criadas para alimentação humana. Estas informações tiveram um grande impacto no delineamento de novas opções tecnológicas para os sistemas produtivos, destacando-se as associadas ao melhoramento genético. Os programas de melhoramento genético animal estão baseados na correta identificação de animais superiores, que serão os progenitores das futuras gerações. Técnicas reprodutivas, tais como inseminação artificial e transferência de embriões, vêm sendo utilizadas pelos pesquisadores para aumentar o número de progênies de animais geneticamente superiores. Em 2008 o Governo do Pará implanta sua Rede Genoma consolidando a competência em Genômica e Bioinformática na Região Amazônica. Esta ação governamental visa a oferta de serviços biotecnológicos que atendam à demanda da sociedade paraense e da região. Atividades de pesquisa e ensino desenvolvidas na Rede Genoma Pará permitiram a criação de um núcleo atuante em Genômica e Bioinformática no Brasil, que hoje conta com 51 projetos de sequenciamento de micro-organismos no NCBI, fazendo deste programa de pesquisa o maior colaborador latino americano junto ao NCBI.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Adriana - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Vasco - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2015

  Avaliação do potencial de biorremediação da Amazônia Atlântica pela indústria de petróleo, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Artur Luiz da Costa da Silva em 11/08/2015., Descrição: Apesar de o Brasil ser um dos lideres mundiais em investimentos na área de energias renováveis, este ainda tem uma tradição e atual domínio de sua matriz energética por combustíveis fósseis, predominantemente o petróleo (Sachs 2005; Goldemberg & Lucon 2007). Inclusive, a expansão recente na rede de infraestrutura brasileira é em grande parte resultado dos investimentos no setor energético, essencialmente a exploração de petróleo e gás natural na costa brasileira, tal como realizado no projeto Pré-sal, na Bacia de Santos. Fator que contribuiu para o crescimento expressivo do país, bem como o desenvolvimento econômico e social. Aliado a esse desenvolvimento, houvera um aumento significativo da população e consequentemente um aumento na demanda de energia. Desta forma, para suprir essa demanda, umas das medidas necessárias é a busca por novas áreas de exploração de petróleo, a exemplo da Bacia Pará-Maranhão (Tolmasquim 2012). A importância do petróleo para o cotidiano da população e da indústria nacional e mundial como destacada acima, também traz consigo um grande risco ao meio ambiente. Risco o qual está associado a derramamentos e vazamentos acidentais durante os processos de exploração, produção, refinamento e principalmente transporte e armazenamento deste produto e seus derivados. Grandes desastres ambientes, tal como o do navio Exxon Valdez e da plataforma Deepwater Horizon, deterioram o ecossistema local e por isso atraem a atenção para estudos de comunidades em áreas contaminadas ou de possível contaminação por petróleo (Leahy & Colwell 1990; Das & Chandran 2011; Atlas & Hazen 2011). O petróleo é constituído, predominantemente por hidrocarbonetos, que podem chegar a 97% de sua composição e, em menor quantidade, de derivados orgânicos sulfurados, nitrogenados, oxigenados e organo-metálicos (Atlas, 1981; Atlas, 1995; Mair & Schicktanz, 1936; Posthuma, 1977; Santos et al, 2010). Devido à predominância dos hidrocarbonetos no petróleo, esses são os compostos mais utilizados como indicadores deste tipo de poluição, e podem ser divididos em quatro classes: os saturados, os aromáticos, asfaltenos (fenóis, ácidos graxos, cetonas, ésteres e porfirinas), e as resinas (piridinas, quinolinas, carbazóis, sulfóxidos e amidas) (Colwell 1977). A biodegradação por microrganismos representa um dos primeiros mecanismos de remoção de petróleo e hidrocarbonetos do ambiente, além de ser o método mais barato de biorremediação (Leahy & Colwell 1990), porém é um processo complexo que depende da natureza e da quantidade de hidrocarbonetos presentes. A suscetibilidade dos hidrocarbonetos do petróleo a degradação microbiana é ordenada da seguinte forma: alcanos lineares > alcanos ramificados > pequenos aromáticos > alkanos cíclicos. Os Hidrocarbonetos Policíclicos Aromáticos (HPAs) merecem atenção especial por serem de difícil degradação e um dos mais tóxicos ao homem. A biodegradação destes hidrocarbonetos do petróleo já foi reportada em diversos trabalhos, e mais de 79 gêneros bacterianos já foram identificados como capazes de realizar a degradação (Head et al. 2006). 6 A biodegradação microbiana de hidrocarbonetos do petróleo envolve um ataque oxidativo inicial intracelular dos poluentes orgânicos catalisada por oxigenases e peroxidases. Vias de degradação periféricas convertem poluentes orgânicos em intermediários do metabolismo central, por exemplo, o ciclo de ácido tricarboxilico. A biossíntese de biomassa celular ocorre a partir dos precursores metabólitos centrais, por exemplo, acetil-CoA, succinato e piruvato. Açúcares necessários para várias biossínteses são sintetizados através da gliconeogênese (Das & Chandran, 2011). .. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Adriana Carneiro - Integrante / Silva, Artur - Coordenador / Rommel Thiago Jucá Ramos - Integrante / Vivian Helena Pellizari - Integrante / DAS GRACAS, D. A. - Integrante / LEÃO, TIAGO F - Integrante / SCHNEIDER, MARIA PC - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2015

  Análise pangenômica de Corinebactérias patogênicas emergentes, Descrição: O principal objetivo deste projeto é combinar métodos de genômica estrutural e funcional numa estratégia sistêmica para entender a variabilidade bioquímica normalmente observada entre diferentes isolados de corinebactérias patogênicas emergentes, além de identificar novos determinantes moleculares de virulência para um conhecimento mais aprofundado da patogênese bacteriana, e também a seleção de candidatos para o desenvolvimento de medidas profiláticas eficientes contra as enfermidades causadas por C. pseudotuberculosis. Será utilizado um método de seqüenciamento de nova geração de vanguarda que, combinados com estratégias bioinformáticas já disponíveis, permitirá que a montagem e anotação dos genomas sejam feitas em tempo recorde. Espera-se que os resultados gerados neste trabalho contribuam significativamente para a identificação rápida e segura destas corinebactérias no futuro próximo, além melhorar nossa compreensão em escala genômica acerca dessas novas espécies patogênicas do gênero.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Vasco - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Maria Silvanira Barbosa - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2015

  CoryDB - um ambiente computacional para integração de estudos genômicos e transcriptômicos de Corynebacterium pseudotuberculosis, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Rommel Ramos - Coordenador / Vasco - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante.

• 2012 - 2015

  NEAR: Ambientes naturais como reservatórios de resistência a antibióticos de último recurso, Descrição: A resistência bacteriana a antibióticos foi recentemente considerada pela Organização Mundial da Saúde como uma das três maiores ameaças deste século em termos de saúde pública, aumentando consideravelmente a mortalidade associada a doenças infecciosas. A utilização de antibióticos de último recurso, como carbapenemos, tem sido restringida para prevenir a disseminação da sua resistência. Em ambientes naturais esta dispersão está certamente no início, o que constitui uma oportunidade para estudar e compreender o processo de disseminação e de evolução dos genes de resistência a carbapenemos. Os objetivos do projeto são: (i) caracterizar o reservatório de genes que codificam para carbapenemases num sistema aquático; (ii) integrar dados de abundância, diversidade de genes e dados ambientais para elucidar vias de disseminação e evolução destes genes; (iii) avaliar o potencial da resistência a carbapenemos como indicador de disseminação de resistência e de risco para a saúde humana.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Schneider, Maria Paula C. - Coordenador / Silva, Artur - Integrante / Adriana - Integrante / Isabel Henriques - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.

• 2011 - 2014

  Emissão de gases do efeito estufa em reservatórios de centrais hidrelétricas, Descrição: Objetivos Investigar o papel dos microorganismos presente em reservatórios hidrelétricos na produção e consumo de metano. Específicos: Isolar, cultivar e caracterizar morfológica e geneticamente arquéias metanogênicas nos reservatórios objeto de estudo. Isolar, cultivar e caracterizar morfológica e geneticamente bactérias metanotróficas nos reservatórios objeto de estudo Correlacionar os componentes microbianos com parâmetros físico-químicos dos lagos: Temperatura, profundidade, pH, redox, condutividade, oxigênio, turbidez, amônia, nitrato, cloretos, metano, oxigênio, nitrogênio, hidrogênio, monóxido e dióxido de carbono. Medir a expressão do gene mcrA, envolvido na metanogênese Medir a expressão do gene pmoA, envolvido na metanotrofia Gerar uma estimativa do balanço de produção/consumo de metano nos reservatórios.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Vivian Helena Pellizari - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador., Financiador(es): Centrais Elétricas do Norte do Brasil - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2013

  Bioprospecção de Moléculas Protéicas de Cianobactérias do Reservatório da UHE Tucuruí, Descrição: Este projeto tem como objetivo geral iniciar estudos proteômicos em cianobactérias dos recursos hídricos amazônicos com ênfase na identificação de novas moléculas protéicas de interesse industrial e biotecnológico e como objetivos específicos: (1) isolar e identificar as principais cianobactérias do reservatório da UHE Tucuruí; (2) Identificar novas moléculas protéicas de Synechococcus sp., e (3) potencialmente ampliar a validação da anotação do genoma de Synechococcus elongatus PCC 7942. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Evonnildo Costa Gonçalves - Coordenador / José Maria dos Santos Vieira - Integrante / Adriano Monteiro de Castro Pimenta - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovações - Outra.

• 2010 - 2013

  Núcleo Amazônico de Excelência em Genômica de Microrganismos, Descrição: Investimentos na formação de recursos humanos e na implantação de infra-estrutura fizeram do Pará um estado referência na genética. O início da genômica na Amazônia remota aos trabalhos pioneiros dos grupos da Genética Animal e da Genética Humana. No primeiro momento fazendo uso de sequenciamento manual, posteriormente automatizado, construção de bibliotecas genômicas de grandes fragmentos, e em 2000 a UFPA integra a BRgene e em 2005 a Rede Nacional de Proteômica. O grupo paraense organiza-se, realiza parcerias e fazendo uso da moderna Plataforma de Sequenciamento do Laboratório de Engenharia Biológica do PCT-Guamá, estabelece a Rede Paraense de Genômica e Proteômica, concluindo em maio de 2009, o primeiro sequenciamento de próxima geração na América Latina. Foram decodificadas naquele momento duas linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis, isoladas de cavalo e camelo. Os primeiros organismos do Pangenoma de Coryne são montados, anotados e curados em prazo recorde de 21 dias. A associação do grupo do Pará com pesquisadores da Rede Genoma Minas foi decisiva para o sucesso alcançado até o momento. A consolidação e ampliação desta parceria, com foco na genômica de microrganismos, formação em alto nível de recursos humanos e geração de publicações de impacto internacional é objeto de interesse deste projeto. Nossa meta é a consolidação de um núcleo referência internacional no aproveitamento biotecnológico de genomas de microrganismos na Amazônia brasileira... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Adriana - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Vasco - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Maria Silvanira Barbosa - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2013

  Genes biossintéticos e produtos naturais bioativos de cianobactérias da Amazônia: Fronteiras em Biotecnologia, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Coordenador / Marli de Fátima Fiore - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2012

  Prospecção do potencial biotecnológico da bactéria psicrotrófica Exiguobacterium antarcticum: estudo de novas proteínas envolvidas na adaptação ao frio, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Artur Silva - Integrante / Maria Silvanira Ribeiro Barbosa - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Coordenador / Soraya Silva Andrade - Integrante / Evonnildo Costa Gonçalves - Integrante / Hivana Patrícia Melo Barbosa - Integrante / Adriana Carneiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2011

  Compreensão dos mecanismos celulares envolvidos na resistência a arsênio, antimonito e cianato em Chromobacterium Violaceum com potencial aplicação na destoxificação ambiental, Descrição: Análise proteômica comparativa da resposta molecular de Chromobacterium violaceum ao cianato, arsênio e antimônio por obtenção de extratos protéicos de um grupo tratado com os compostos em comparação com um grupo controle não tratado, utilizando as técnicas de Eletroforese Bidimensional em Gel Diferencial (2D-DIGE) e espectrometria de massas MALDI-TOF.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Artur Silva - Coordenador / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Evonnildo Costa Gonçalves - Integrante / Alessandra Ciprandi - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

• 2006 - 2009

  Bioprospecção, Valoração e Conservação do Ecogenoma do Reservatório da UHE Tucuruí, Descrição: Análise da diversidade de bactérias e arqueias presentes em ambiente aquático de três diferentes pontos de amostragem (MR, M5, ITU) do reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí na Amazônia brasileira, através da análise do gene marcador filogenético 16S rDNA obtido a partir de DNA genômico extraído diretamente do ambiente em estudo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Artur Silva - Coordenador / Paulo Roberto de Oliveira Miranda - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Rubens Ghilardi Júnior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Centrais Elétricas do Norte do Brasil - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

Prêmios