Maria Fernanda Ribeiro Dias

Atuou como pós-doutoranda na Universidade de Auburn - USA (2022-2023), utilizando métodos computacionais na investigação de interações entre macromoléculas de organismos infecciosos. Possui doutorado em Biotecnologia pelo INMETRO (2018), Mestrado em Modelagem Computacional com ênfase em bioinformática pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (2014) e graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (2010). Foi professora de Biologia da rede estadual do Espírito Santo (SEDU-ES). Atuou como técnica pedagógica na Superintendência Regional de Educação de Vila Velha - ES (SREVV-ES), compondo o Comitê de Monitoramento e Assessoramento das Avaliações Externas do Estado do Espírito Santo (COMAES) e pesquisando Educação e Sistema de Gestão Educacional.

Informações coletadas do Lattes em 18/10/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biotecnologia

2015 - 2018

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia
Título: Desenvolvimento de métodos para para screening de compostos de interesse no combate a doenças virais utilizando métodos de aprendizagem de máquina e informações estruturais de proteínas
, Ano de obtenção: 2018. Manuela Leal da Silva. Coorientador: Pedro Geraldo Pascutti. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Artificial Intelligence; chemical compounds.Grande área: Ciências Biológicas

Mestrado em Modelagem Computacional

2011 - 2014

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Análise empírica da utilização de técnicas de aprendizagem de máquina para classificação de sequências de proteínas de Metarhizium anisopliae
, Ano de Obtenção: 2014.Luciane Prioli Ciapina.Coorientador: Maurício Vieira Kritz. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Especialização em andamento em Acupuntura

2022 - Atual

Instituto Superior de Ciências da Saúde

Graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas

2006 - 2010

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro
Título: Aspectos Morfológicos e Bioquímicos na maturação de embriões somáticos em cana-de-açúcar
Orientador: Vanildo Silveira
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Pós-doutorado

2022 - 2023

Pós-Doutorado. , Auburn University, AU, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática.

2018 - 2019

Pós-Doutorado. , Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, INMETRO, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática.

Formação complementar

2020 - 2020

Competências Profissionais, Emocionais e Tecnológicas para Tempos de Mudanç. (Carga horária: 4h). , Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.

2019 - 2019

FORMACAO I AOS PROFISSIONAIS DA ESCOLA DE TEMPO INTEGRAL - ESCOLA VIV. (Carga horária: 24h). , Secretaria de Educação do Estado do Espírito Santo, SEDU/ES, Brasil.

2017 - 2017

Quantitative Imaging in Biophysics. (Carga horária: 40h). , Universidad Nacional de Tucumán, UNT, Argentina.

2016 - 2016

ABNT ISO NBR 17025:2005. (Carga horária: 16h). , Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, INMETRO, Brasil.

2016 - 2016

Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Biofísica. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2014 - 2014

Protein-Protein Docking and Protein Structural Alignment and Classification. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2012 - 2012

VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2012 - 2012

Ferramentas de bioinformática aplicadas às análise. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2011 - 2011

Ferramentas de Bioinformática adaptadas à análise. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

OXIGÊNIO E PROCESSO REDOX. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, SBBQ, Brasil.

2009 - 2009

Proteômica. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2009 - 2009

Biomarcadores de Contaminação Ambiental. (Carga horária: 20h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2009 - 2009

Técnica e Procedimentos de Laboratório. (Carga horária: 12h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2008 - 2008

Manipulação Molecular de Fámacos. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2003 - 2003

Dinâmica, Envolvimento e Aprendizagem. (Carga horária: 20h). , Universidade Católica de Petrópolis, UCP, Brasil.

2002 - 2002

Aprender Brincando. (Carga horária: 18h). , Universidade Católica de Petrópolis, UCP, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Fisiologia Vegetal.

Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Biotecnologia/Especialidade: Biotecnologia Vegetal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia.

Organização de eventos

DIAS, M. F. R. . Roda de conversa: EDUCAÇÃO, AGRICULTURA E MEIO AMBIENTE: DESAFIOS NACIONAIS EM TEMPOS DE PANDEMIA DE COVID- 19. 2020. (Outro).

DIAS, M. F. R. ; ROSA, V. S. D. ; ROCHA, G. K. ; BERNARDINO, H. S. . V Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional. 2012. (Outro).

DIAS, M. F. R. ; MACHADO, S. H. ; Amendro, M. F. ; RODRIGUES, T. F. ; INOCENCIO, E. J. B. ; Fonseca, K.B.A . Análise da perspectiva de futuro profissional dos alunos do Ensino Médio e EJA do Ciep Brizolão Nilo Peçanha. 2010. (Outro).

DIAS, M. F. R. ; Amendro, M. F. ; LICASSALI, L. A. ; PRADO, L. A. S. . Animais silvestres da Região Norte Fluminense. 2009. (Outro).

Participação em eventos

Educador Nota 10.Educador Nota 10. 2020. (Outra).

I Congresso Internacional de Ciências Sociais Aplicadas (CICSA-20). Debatedora do Grupo de Trabalho - Didática Inovação e Aprendizagem. 2020. (Congresso).

45 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. The Combination between artificial prediction of natural substrates proteins,. 2016. (Congresso).

VIII Escola de Modelagem Molecular.Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas,. 2016. (Encontro).

23rd International Congress of the Biochemistry and Molecular Biology. Artificial Intelligence Applied to Search of Enzymatic Inhibitors in Data Banks of Chemical Compounds. 2015. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics & 9th International Conference of the AB3C: X-meeting013. Predicting ubiquitination-prone proteins of Metarhizium anisopliae using machine learning methods.. 2013. (Congresso).

II Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica; 15o Encontro de Iniciação Científica da UENF. Determinação do método de extração de proteínas totais para análise em eletroforese bidimensional em culturas embriogênicas cana-de-açúcar.. 2010. (Congresso).

III Workshop-Escola de Computação e Informação Quântica. 2010. (Outra).

XXX ERBOT MG/BA/ES. II Jornada Capixaba de Botânica.Diferenças histomorfológicas durante a maturação de culturas embriogênicas e não embriogênicas em cana-de-açúcar. 2010. (Encontro).

XXXIX Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology(SBBq). Polyamines changes during the maturationof embryogenic and non-embryogenic sugarcanes culture. 2010. (Congresso).

1 Semana Acadêmica Unificada da UENF. 2009. (Outra).

1 Simpósio Nacional de Jornalismo Científico. 2009. (Simpósio).

2 Encontro Estadual sobre Agroenergia. 2009. (Encontro).

Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica. Morfogênese in vitro de variedades de cana-de-açúcar adaptadas á região Norte Fluminense. 2009. (Congresso).

VIII Feira da Vida. 2009. (Encontro).

XXVIII Jornada Fluminense de Botânica.Efeito do carvão ativado na maturação de culturas embriogênicas de cana-de-açúcar. 2009. (Encontro).

VI Semana da Biologia da UENF. 2008. (Encontro).

II Encontro sobre questões atuais na educação. 2003. (Encontro).

Participação em bancas

Aluno: Areza Zozimo Caputo Silva

Muller, N. V.; Patricio, B. F. C.;DIAS, M. F. R.. Busca de Novos Alvos Terapêuticos para o tratamento de Leishmaniose tegumentar através da predição funcional IN SILICO de proteínas de Leishmania Braziliensis. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

Aluno: Marcela Ribeiro Xavier

DIAS, M. F. R.; OTT, T. R.; ESPINDOLA, C. S. O.. Terapia gênica e seus aspectos históricos - mundial e nacional. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Marianna Medeiros Oliveira

DIAS, M. F. R.; ESPINDOLA, C. S. O.; CABRAL, V. R.. A evolução do tratamento medicamentoso para o combate ao HIV: Referencial bibliográfico dos artigos de 2010 a 2019. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: José Victor Elias Pereira

DIAS, M. F. R.; Ott, T. F.; Souza, A. P.. A IMPORTÂNCIA DA SUPLEMENTAÇÃO DE MAGNÉSIO, COM FINS PROFILÁTICOS. UMA ANÁLISE QUALITATIVA DESTE MICRONUTRIENTE, NA MERENDA DE UMA ESCOLA MUNICIPAL EM PARAIBA DO SUL/RJ. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

DIAS, M. F. R.; Costa-Felix, B. P. R.; Midlej, V.V.P.. Comissão de Seleção do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia do Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia. 2022. Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

DIAS, M. F. R.. Comissão regional de avaliação - 15 Prêmio SEDU "Boas Práticas na Educação". 2022. Secretaria de Educação do Estado do Espírito Santo.

Orientou

Paula Lopes Cascabulho

; Aprendizado de máquina direcionado ao reconhecimento do padrão de mutações e vigilância genômica de organismos de importância clínica; ; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Prefeitura Municipal de Macaé; (Orientador);

Davi Ventura da Silva

Aprendizado de máquina direcionado ao reconhecimento do padrão de mutações e vigilância genômica de organismos de importância clínica; ; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Prefeitura Municipal de Macaé; (Orientador);

Isadora Nogueira Camelo

Rayane Souza Gonçalves

; Ferramentas de Biologia Computacional Aplicadas no Reposicionamento de Fármacos para COVID-19 e Divulgação Científica; ; Início: 2020; Orientação de outra natureza; Colégio Estadual Luiz Reid; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Yasmin Cristine Lacerda Fabio

Fernando Limoeiro Lara de Oliveira

AGNINNetwork: Aplicação de Algoritmos de Aprendizagem Profunda com Método Alternativo para Triagem em Larga Escala de Moléculas com Potencial Farmacêutico; 2018; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Maria Fernanda Ribeiro Dias;

Márcia da Silva Chagas

Inteligência Artificial Aplicada a Banco de Dados de Inibidores Enzimáticos de Compostos Químícos; 2016; Orientação de outra natureza; (Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Maria Fernanda Ribeiro Dias;

Produções bibliográficas

DIAS, M. F. R. ; Oliveira, F. L.L. ; PONTES, V. S. ; SILVA, M. L. . Application of PolyPRep tools on HIV protease polyproteins using molecular docking. BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY (ONLINE) , v. 84, p. 245592, 2024.
RIBEIRO DIAS, MARIA FERNANDA ; ANDRIOLO, BRUCE VEIGA ; SILVESTRE, DIEGO HENRIQUE ; CASCABULHO, PAULA LOPES ; LEAL DA SILVA, MANUELA . Genomic surveillance and sequencing of SARS-CoV-2 across South America. REVISTA PANAMERICANA DE SALUD PUBLICA (PRINT) , v. 47, p. 1, 2023.
SILVA, M. L. ; DIAS, M. F. R. ; CASCABULHO, P. L. ; CAMELO, I. N. ; VENTURA, D. ; SILVESTRE, D. H. ; COSTA, E. P. . VIGILÂNCIA EM SAÚDE: A IMPORTÂNCIA DA PADRONIZAÇÃO DE DADOS PARA CONTROLE DA PANDEMIA DA COVID-19. Boletim Ciência Macaé , v. v. 2, p. p. 87-p. 103, 2022.
SILVA, M. L. ; DIAS, M. F. R. ; Cascabulho, P. L. ; Camelo, I. N. ; da Silva, D.V. ; SILVESTRE, DIEGO HENRIQUE ; Costa, E. P. . Health Surveillance: the importance of data standardization to control the COVID-19 pandemic.. boletim ciência macaé , v. 2, p. 1, 2022.
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M. L. Silva ; PASTOR JUNIOR, A. A. ; Ribeiro, E.G. ; FONSECA, L. F. ; BULLA, A. C. S. ; DIAS, M. F. R. . Experiências de divulgação científica e letramento científico sobre moléculas durante a pandemia da Covid-19. RAÍZES E RUMOS , v. 8, p. 252, 2020.
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SILVEIRA, VANILDO ; VITA, ALINE MARTINS ; MACEDO, AMANDA FERREIRA ; DIAS, MARIA FERNANDA RIBEIRO ; FLOH, ENY IOCHEVET SEGAL ; SANTA-CATARINA, CLAUDETE . Morphological and polyamine content changes in embryogenic and non-embryogenic callus of sugarcane. Plant Cell, Tissue and Organ Culture (Print) , v. x, p. x, 2013.
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PASTOR JUNIOR, A. A. ; SILVA, M. L. ; RIBEIRO, E. ; DIAS, M. F. R. ; RIBEIRO, E. G. ; BULLA, A. C. S. . De olho na COVID - VOL 2. 2. ed. Macaé: NUPEM, 2020.
SILVA, M. L. ; PASTOR JUNIOR, A. A. ; Abreu, L.A. ; DIAS, M. F. R. ; RIBEIRO, E. G. ; BULLA, A. C. S. ; Esteves, M.E.A. ; FONSECA, L. F. . Respira e não Pira: RESPIRA E NÃO PIRA: A RESILIÊNCIA DAS MACROMOLÉCULAS NA PANDEMIA. relatos da EXTENSÃO ações e reações em contexto de pandemia. 2ed.: , 2023, v. , p. 213-.
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Rodrigues, Neiva Sales ; DIAS, MARIA FERNANDA RIBEIRO ; da Cunha, Barbara Coelho Barbosa ; Araujo, Izabela Regina Costa ; de Paiva, Jonas Medeiros ; Mendes, Marcos da Costa ; Greco, Yasmin de Mello Canalli ; Alves, Maria Aparecida da Silva . Cenários brasileiros em tempos de pandemia de COVID-19. In: Neiva Sales Rodrigues; Maria Fernanda Ribeiro Dias; Jonas Medeiros de Paiva. (Org.). Educação, agricultura e meio ambiente: desafios nacionais em tempos de pandemia de COVID-19. 1ed.: Pantanal Editora, 2020, v. 1, p. 9-25.
DIAS, MARIA FERNANDA RIBEIRO ; de Paiva, Jonas Medeiros ; Mendes, Marcos da Costa ; da Silva, Agnes Martha ; Alves, Maria Aparecida da Silva ; Pereira, Dalton Gomes ; Nardelli, Giovanna Gaudenci ; da Silveira, Rodrigo Euripedes . Cenários da educação brasileira em tempos de pandemia de COVID-19. In: Neiva Sales Rodrigues; Maria Fernanda Ribeiro Dias, Jonas Medeiros de Paiva. (Org.). Educação, agricultura e meio ambiente: desafios nacionais em tempos de pandemia de COVID-19. 1ed.: Pantanal Editora, 2020, v. 1, p. 26-47.
DIAS, M. F. R. . Olhares da pandemia: se podemos observar, por quê não fotografar?. In: José Augusto de Souza. (Org.). Distantes, mas presentes: práticas que aproximam. 1ed.Vitória: Secretaria Estadual do Espírito Santo, 2020, v. 1, p. 119-119.
RODRIGUES, V. S. ; GOMES NETO, L. R. ; DUTRA, N. T. ; Silveira, V. ; MOLINA, M. A. B. ; CHIQUIERE, T. B. ; HERINGER, A. S. ; DIAS, M. F. R. ; Santa-Catarina, C. . PERCEPÇÃO E DIFUSÃO DE TEMAS EM BIOTECNOLOGIA PARA ALUNOS DO ENSINO MÉDIO NO MUNICÍPIO DE CAMPOS DOS GOYTACAZES ? RJ. In: VIII Workshop de Extensão da UENF II Mostra de Extensão IFF / UENF / UFF, 2010, Campos dos Goytacazes. .2010, 2010.
DIAS, M. F. R. ; Pascutti, P.G. ; DA SILVA, M.L . . Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas. In: VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2016, Petrópolis. VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2016.
DIAS, M. F. R. ; DA SILVA, M.L . ; Pascutti, P.G. . Artificial Intelligence and Molecular Docking applied on the Prediction of naturalsubstrate of HIV-1 protease with subtypes B, C and F. In: IIILAFeBS, IX IberoAmerican Congress of Biophysics, XLV SAB Annual Meeting, 2016, Tucuman. Artificial Intelligence and Molecular Docking applied on the Prediction of naturalsubstrate of HIV-1 protease with subtypes B, C and F, 2016.
DIAS, M. F. R. ; DA SILVA, M.L . ; Pascutti, P.G. . Artificial Intelligence Applied to Search of Enzymatic Inhibitors in Data Banks of Chemical Compounds. In: IUBM and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology(SBBq), 2015, Foz do Iguaçu. Anais..., 2015.
DIAS, M. F. R. ; Kritz, M. V. ; Guedes, L. P. C ; COIMBRA, R. S. . Predicting ubiquitination-prone proteins of Metarhizium anisopliae using machine learning methods.. In: In: Brazilian Symposium on Bioinformatics & 9th International Conference of the AB3C: X-meeting,, 2013, Recife. X-meeting, 2013.
DIAS, M. F. R. ; ALMEIDA, A. R. ; Silveira, V. ; Santa-Catarina, C. . Aspectos morfológicos e bioquímicos na maturação de embriões somáticos em cana-de-açúcar.. In: XIV Reunião Latino-Americana de Fisiologia Vegetal, 2011, Búzios-RJ. ...2011, 2011.
DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; MACEDO, A. F. ; FLOH, E. I. S. ; Santa-Catarina, C. ; Silveira, V. . Polyamines Changes during Maturation of Embryogenic and Non-Embryogenic Cultures of Sugarcane. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz do Iguaçu-PR. Anais do..., 2010.
MACEDO, A. F. ; DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; FIM, L. G. ; CHIQUIERI, T. B. ; FLOH, E. I. S. ; Silveira, V. . Spermidine is Essential to Maturation of Sugarcane Callus. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz do Iguaçu-PR. Anais do..., 2010.
DIAS, M. F. R. ; CHIQUIERI, T. B. ; Silveira, V. . Determinação do método de extração de proteínas totais para análise em eletroforese bidimensional em culturas embriogênicas cana-de-açúcar.. In: II Congresso Fluminense de Iniciação científica e Tecnológica; 15° Encontro de IC da UENF, 2010, Campos dos Goytacazes. anais...2010, 2010.
DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; Silveira, V. ; Santa-Catarina, C. . Diferenças histomorfológicas durante a maturação de culturas embriogênicas e não embriogênicas em cana-de-açúcar. In: XXX ERBOT MG/BA/ES II Jornada Capixaba de Botânica, 2010, Vitória. ...2010, 2010.
de VITA, A. M. ; DIAS, M. F. R. ; MACEDO, A. F. ; Santa-Catarina, C. ; FLOH, E. I. S. ; Silveira, V. . Metabolismo de poliaminas associado com a maturação de embriões somáticos de cana-de-açúcar. In: XII Congresso de Fisiologia Vegetal, 2009, Fortaleza-CE. Anais do..., 2009.
DIAS, M. F. R. ; Silveira, V. . Morfogênese in vitro de variedades de cana-de-açúcar adaptadas à Região Norte Fluminense. In: Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2009, Campos dos Goytacazes-RJ. Anais do..., 2009.
DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; Silveira, V. . Efeito do carvão ativado na maturação de culturas embriogênicas de cana-de-açúcar. In: XXVIII Jornada Fluminense de Botânica, 2009, Rio de Janeiro-RJ. Anais do..., 2009.
DIAS, M. F. R. . Introdução a Metodologias de Aprendizagem de Máquina Aplicadas na Resolução de Sistemas Biológicos. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Oliveira, F. L.L. ; DIAS, M. F. R. ; M. L. Silva . 'AGNINetworks: Redes Neurais Convolucionais como funções de compatibilidade entre ligante e receptor em ensaios de Ancoragem molecular'. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Pascutti, P.G. ; M. L. Silva . 'A NEW VIRTUAL SCREENING METHOD TO SEARCH FOR ENZYME INHIBITORS BY MACHINE LEARNING AND PROTEIN INFORMATION'. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Oliveira, F. L.L. ; M. L. Silva ; DIAS, M. F. R. . AUTOMAÇÃO DO PROCESSO DE CLIVAGEM DAS POLIPROTEINAS GAG E GAG-POL PELA HIV-1 PROTEASE: UM ESTUDO DE DOCKING EM LARGA ESCALA E OTIMIZAÇÃO ESTRUTURAL DE PEPTÍDEOS. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Oliveira, F. L.L. ; M. L. Silva ; DIAS, M. F. R. . AUTOMAÇÃO DO PROCESSO DE CLIVAGEM DAS POLIPROTEINAS GAG E GAG-POL PELA HIV-1 PROTEASE: UM ESTUDO DE DOCKING EM LARGA ESCALA E OTIMIZAÇÃO ESTRUTURAL DE PEPTÍDEOS. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Chagas, M. S. ; DA SILVA, M.L . ; Pascutti, P.G. . The Combination between artificial prediction of natural substrates proteins. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Pascutti, P.G. ; DA SILVA, M.L . . Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).
Oliveira, F. L.L. ; DIAS, M. F. R. ; M. L. Silva . Automation of polyproteins GAG and GAG-POL-1 cleavage site mapping: A study of large scale molecular docking,. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; DA SILVA, M.L . ; Pascutti, P.G. . Artificial Intelligence Applied to Search of Enzymatic Inhibitors in Data Banks of Chemical Compounds. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Chagas, M. S. ; DA SILVA, M.L . ; Pascutti, P.G. . Análise de redução dimensional na representação de dados biológicos utilizando aprendizagem de máquina e substratos naturais de proteínas.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Chagas, M. S. ; DIAS, M. F. R. ; DA SILVA, M.L . . Evaluation of the influence of the use of imbalanced data in biological problems.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Chagas, M. S. ; DIAS, M. F. R. ; Pascutti, P.G. ; DA SILVA, M.L . . Avaliação de métodos de classificação de substratos naturais de proteínas utilizando métodos de aprendizagem de máquina.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Kritz, M. V. ; COIMBRA, R. S. ; Guedes, L. P. C . Predicting ubiquitination-prone proteins of Metarhizium anisopliae using machine learning methods. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; CHIQUIERI, T. B. ; Silveira, V. . Determinação do método de extração de proteínas totais para análise em eletroforese bidimensional em culturas embriogênicas cana-de-açúcar.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; MACEDO, A. F. ; FLOH, E. I. S. ; Santa-Catarina, C. ; Silveira, V. . Polyamines Changes during Maturation of Embryogenic and Non-Embryogenic Cultures of Sugarcane. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; de VITA, A. M. ; Silveira, V. ; Santa-Catarina, C. . Diferenças histomorfológicas durante a maturação de culturas embriogênicas e não embriogênicas em cana-de-açúcar. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. . Aspectos socioeconômicos e ambientais gerados pelo complexo portuário do Açú,. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DIAS, M. F. R. . Influência do Carvão ativado na maturação de culturas embriogênicas de cana-de-açúcar. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. ; Silveira, V. . Morfogênese in vitro de variedades de cana-de-açúcar adaptadas à Região Norte Fluminense. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DIAS, M. F. R. . Animais Silvestres na região Norte Fluminense. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

DA SILVA, M.L . ; PASTOR JUNIOR, A. A. ; RIBEIRO, E. G. ; DIAS, M. F. R. . Macromoléculas na Saúde. 2019; Tema: Macromoléculas - Divulgação Científica. (Rede social).

DIAS, M. F. R. . Medidas Preventivas não Farmacológicas para Prevenção da COVID-19 na Escola. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DA SILVA, M.L . ; DIAS, M. F. R. ; FROSSARD, Y. ; BULLA, A. C. S. ; RIBEIRO, E. G. ; MELO, J. R. ; FONSECA, L. F. ; BARBOZA, L. E. M. . Ferramentas Computacionais para Visualização de Moléculas em 3D. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

SILVA, M. L. ; RENNO, M. ; Cheoen, C.F. ; Ribeiro, E.G. ; BULLA, A. C. S. ; DIAS, MARIA FERNANDA RIBEIRO . Uso de Inteligência artificial como ferramenta computacional para visualização de moléculas em 3D. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

DIAS, M. F. R. . Práticas Exitosas no Ambiente Escolar: o Uso de Projetos na Abordagem de Temas Interdisciplinares. 2019. .

DIAS, M. F. R. . Técnicas e Procedimentos de Laboratório.. 2011. .

DIAS, M. F. R. . II Simpósio de Pesquisas do NUPEM - Pesquisa em tempos de pandemia. 2020 (Simpósio) .

Projetos de pesquisa

2022 - Atual

Inteligência artificial aplicada na investigação de propriedades mecânicas de complexos proteicos envolvidos em interações patógeno/hospedeiro por espectroscopia de força de molécula única in silico, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Manuela Leal da Silva em 11/08/2023., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Maria Fernanda Ribeiro Dias - Integrante / Manuela Leal da Silva - Coordenador / Rafael de Cássio Bernardi - Integrante.
2020 - Atual

Aprendizado de máquina direcionado ao reconhecimento do padrão de mutações e vigilância genômica de organismos de importância clínica, Descrição: A pandemia de COVID-19, doença causada pelo coronavírus SARS-CoV-2, impõe um grande desafio devido à alta transmissibilidade do vírus e à gravidade dos casos. A necessidade de terapia intensiva para uma grande parcela dos pacientes e o longo tempo de internação desafiam os sistemas de saúde. Visando a contribuir para o desenvolvimento de ferramentas que possam auxiliar no combate à COVID-19, esta proposta reúne um grupo de pesquisadores com reconhecida experiência em biotecnologia e ciências farmacêuticas, com o objetivo de propor alvos e terapias inovadoras.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Maria Fernanda Ribeiro Dias - Integrante / Manuela Leal da SIlva - Coordenador / Caio Felipe Cheoen - Integrante / Evenilton Pessoa Costa - Integrante / Paula Lopes Cascabulho - Integrante / Isadora Nogueira Camelo - Integrante / Davi Ventura da Silva - Integrante.
2012 - Atual

Desenvolvimento de aplicativos de bioinformática para anotação estrutural de sequências genômicas, metagenômicas, proteômicas e transcriptômicas em larga escala, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Maria Fernanda Ribeiro Dias - Integrante / Manuela Leal da Silva - Coordenador / Pedro Geraldo Pascutti - Integrante / Wanderley de Souza - Integrante / Paulo Mascarello Bisch - Integrante / Daniel Moreira da Costa Leite - Integrante / Marcelo Cardoso dos Reis Melo - Integrante.
2008 - 2010

Projeto de Iniciação Científica - UENF/FAPERJ (Proc. E-26/110.746/2007): Morfogênese in vitro de variedades de cana-de-açúcar adaptadas à Região Norte Fluminense, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Maria Fernanda Ribeiro Dias - Integrante / Vanildo Silveira - Coordenador / Claudete Santa-Catarina - Integrante / Eny Iochevet Segal Floh - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

Prêmios

2016

Menção Honrosa ao trabalho Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas, VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.

2015

Menção Honrosa pelo trabalho ?Avaliação de métodos de classificação de substratos naturais de proteínas utilizando métodos de aprendizagem de máquina., JICTAC.

2013

Best Poster Award (Databases & Data Integration; Text Mining & Information Extraction), 9th International Conference of the AB3C: X-meeting / BSB 2013 Conference..

Histórico profissional

Experiência profissional

2024 - Atual

Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Dedicação Exclusiva, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2020 - 2023

Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Parcial

2023 - Atual

Instituto Nacional de Câncer

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: bolsista, Carga horária: 40

Outras informações:
Bolsista DTI no projeto "Genomas Brasil"

2022 - 2023

Auburn University

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador visitante

2022 - 2022

Secretaria Estadual do Espírito Santo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Técnica Pedagógica, Carga horária: 40

2018 - 2022

Secretaria Estadual do Espírito Santo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 25

2020 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador, Carga horária: 20

2020 - 2021

Prefeitura Municipal de Macaé, PM/Macaé

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador, Carga horária: 20

2018 - 2019

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Pós - Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2018

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Doutorado, Carga horária: 40

2014 - 2015

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Técnico Bolsista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2013 - 2018

Centro Educacional Itaipava

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 12

2014 - 2018

Escola João de Barro

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 12

2010 - 2010

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Voluntária, Enquadramento Funcional: Voluntária, Carga horária: 20

2009 - 2010

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Iniciação Cientíifca, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 20

2008 - 2009

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitora, Carga horária: 20

Outras informações:
Disciplina: Fundamentos da Educação

Atividades

03/2009 - 06/2010
Ensino,,Disciplinas ministradas, Ministrou aulas de Biologia para o ensino médio e fundamental, sendo 14 horas de conteúdo curricular e 16 horas de reforço escolar, totalizando 30 horas.
04/2008 - 02/2009
Ensino, Licenciatura em Biologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Monitoria das disciplinas de Fundamentos da Educação / Fundamentos Teóricos da Educação ( LEEL/CCH)
08/2008 - 01/2009
Estágios , Centro de Biociências e Biotecnologia.,Estágio realizado, Estágio Voluntário de Iniciação Científica Projeto: Morfogênese in vitro de variedades de cana-de-açúcar adaptadas à Região Norte Fluminense.