João Pedro Silva Climaco

Formação complementar

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Participação em eventos

Produções bibliográficas

• MOREIRA, C. N. ; CARDOSO, A. L. ; MARTINS, C. . Cromossomos B e modificações epigenéticas: como a metilação do DNA se relaciona com o estresse ambiental em Astyanax mexicanus.. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Identificação de marcadores genéticos de identificação sexual no ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata.. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, J. I. N. ; MARTINS, C. ; CARDOSO, A. L. . Variações genéticas associadas ao sexo no ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata. 2019. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Projetos de pesquisa

• 2022 - 2023

  Cromossomos B e modificações epigenéticas: como a metilação do DNA se relaciona com o estresse ambiental em Astatotilapia latifasciata, Descrição: Apesar da natureza do nome "cromossomos B" descender da ideia de elementos extra e dispensáveis do genoma, diferentemente dos chamados "cromossomos A" e de casos de aneuploidia (Beukeboom, 1994), sua presença através dos clados mais amplos de eucariotos e sua heterogeneidade na evolução e no comportamento das espécies impedem uma definição conceitual unificada (Camacho, 2005). Com efeito, descobertas recentes sugerem que esses elementos, originários de cromossomos A e sexuais (Burt & Trivers, 2009), apresentam um vasto "repositório" de sequências gênicas que podem afetar diferentes funções celulares e processos biológicos em geral (Ahmad & Martins, 2019). Considerando a presença do cromossomo B no ciclídio Astatotilapia latifasciata, afetando a expressão de sequências de DNA (Ramos et al., 2016) através de mecanismos como modificações epigenéticas (Cardoso et al., 2019) e a expressão de Elementos Transponíveis (Coan & Martins, 2018), essa espécie tem sido usada como modelo para origem, função e evolução de cromossomos B e sexuais. De forma adicional, o gênero Astatotilapia, dentre outros Haplochromini, tem sido usado em outras pesquisas como meio para estudar radiações adaptativas rápidas dos peixes ciclídeos nos lagos do leste africano (Kornfield & Smith, 2000), especialmente considerando sua diversidade ecológica e genética (Kocher, 2004). Portanto, dado o impacto de regulações epigenéticas através da metilação do DNA no perfil global da expressão gênica entre organismos (Cedar & Bergman, 2009), bem como o papel desempenhado por cromossomos B no epigenoma de A. latifasciata, o presente trabalho propõe a análise de diferenças na metilação do DNA entre indivíduos B- e B+, machos e fêmeas de A. latifasciata em resposta ao estresse ambiental controlado, assim como as prováveis diferenças epigenéticas entre esses grupos em regiões candidatas previamente ao experimento.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: João Pedro Silva Climaco - Integrante / Cesar Martins - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2019 - 2020

  Desenvolvimento de marcadores genéticos para identificação do sexo de Astatotilapia latifasciata, Descrição: A determinação sexual atua na maior parte das espécies de peixes por meio de genes efetivos ou de um grupo de genes distribuídos em cromossomos sexuais ou autossomos. Nesse sentido, apesar da grande variedade de sistemas de determinação sexual presente nos peixes, existe ainda uma grande porcentagem de espécies nas quais os cromossomos sexuais não se encontram totalmente diferenciados, impedindo uma identificação do sexo por técnicas clássicas de citogenética, incluindo hibridização fluorescente in situ (FISH). Além disso, o próprio dimorfismo sexual, principalmente no que diz respeito a características sexuais secundárias que influenciem na interação social de indivíduos da mesma espécie, como o dicromatismo presente nas espécies de ciclídeos, pode sofrer influências externas e tornar-se praticamente inexistente, tal como ocorre entre machos que disputem por uma fêmea ou por território. Por esse motivo, não somente o cariótipo, mas também a própria morfologia externa de espécies com essas características podem ser limitantes acerca da identificação sexual. No ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata (2n = 44; ou 2n = 44+1B; ou 2n = 44+2B) não foram encontrados cromossomos sexuais heteromórficos, fato que, em conjunto com a baixa confiabilidade do dicromatismo característico da espécie, impede uma identificação sexual válida. A partir desses dados e tendo como base outros estudos que já obtiveram sucesso na busca por marcadores moleculares para o sexo no genoma de diversas espécies de ciclídeos, o objetivo desse projeto é identificar, analisar e validar sequências de DNA sexo-específicas que permitam a identificação sexual de Astatotilapia latifasciata. Para isso, serão explorados genomas de machos e fêmeas de A. latifasciata, previamente sequenciados pela plataforma HiSeq (Illumina), utilizando métodos in silico e técnicas de biologia molecular. Espera-se que o desenvolvimento deste projeto auxilie na identificação sexual nessa espécie viabilizando a exploração do complexo mecanismo de determinação sexual em ciclídeos e várias outras questões sobre a biologia desta espécie.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: João Pedro Silva Climaco - Integrante / Adauto Lima Cardoso - Coordenador / Cesar Martins - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2017 - 2023

  Cromossomos sexuais, cromossomos B e seus enigmas: sistemas modelo para estudos de evolução cromossômica e genômica, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: João Pedro Silva Climaco - Integrante / Cesar Martins - Coordenador.