Amanda Piovesan Ucci

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• UCCI, AMANDA P. ; MARTINS, PAULA M. M. ; LAU, IVY F. ; BACCI, MAURÍCIO ; BELASQUE, JOSÉ ; FERREIRA, HENRIQUE . Asymmetric chromosome segregation in ssp.. MicrobiologyOpen , v. 2, p. n/a-n/a, 2013.

• CARMO, A. U. ; UCCI, A. P. ; FERNANDES, D. ; FRARE, G. F. ; OLIVEIRA, H. C. ; BARBOSA, J. H. ; MELLO, M.C. ; SCHLINDWEIN, M. N. . Levantamento preliminar da avifauna do Parque Ecológico do do Basalto do municípiom de Araraquara-SP. Revista UNIARA , v. 17/18, p. 257-266, 2006.

• UCCI, A. P. ; Martins, P. M. M. ; Belasque Jr., J. ; Ferreira, H. . The chromosomal par locus is required for normal cell division in Xanthomonas citri. In: Workshop on Xanthomonas citri / Citrus canker, 2011, Ribeirão Preto. Workshop on Xanthomonas citri / Citrus canker, 2011.

• FREITAS, E. C. ; UCCI, A. P. ; TEXEIRA, E. C. ; PEDROSO, G. A. ; BERTOLINI, M. C . Molecular characterization of the copper resistance operon copAB in Xanthomonas citri subsp. citri. In: Workshop on Xanthomonas citri / Citrus canker, 2011, Ribeirão Preto. Workshop on Xanthomonas citri / Citrus canker, 2011.

• UCCI, A. P. ; Ferreira, H. ; VIOLLIER, P. H. . The role of ParA and ParB proteins during the chromosome segregation in Xanthomonas citri. In: Workshop on Recent Advances and Applications in Confocal and Widefield Microscopy, 2014, Campinas. Workshop on Recent Advances and Applications in Confocal and Widefield Microscopy.

• UCCI, A. P. ; ARDISSONE, S. ; FERREIRA, HENRIQUE ; VIOLLIER, P. H. . Characterization of the ParAB/S partitioning system from Xanthomonas citri. In: 5TH Congress of European Microbiologists, 2013, Leipzig. FEMS, 2013.

• UCCI, A. P. ; Ferreira, H. . Disruption of ParB alters the virulence of Xanthomonas citri subsp. citri. In: XII International Citrus Congress, 2012, Valencia. XII International Citrus Congress, 2012.

• UCCI, A. P. ; Martins, P. M. M. ; Belasque Jr., J. ; Ferreira, H. . Disruption of ParB causes loss of virulence in Xanthomonas citri. In: XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2012, Santos. XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2012.

• UCCI, A. P. ; SILVA, I. C. ; Martins, P. M. M. ; Sumares, J. A. P. ; Belasque Jr., J. ; Lau, I. F. ; Ferreira, H. . IS THERE A LINK BETWEEEN CELL DIVISION AND PATHOGENICITY IN XANTHOMONAS CITRI?. In: The 4th Congress of European Microbiologists (FEMS), 2011, Genebra. The 4th Congress of European Microbiologists (FEMS), 2011.

• Sumares, J. A. P. ; Martins, P. M. M. ; SILVA, I. C. ; UCCI, A. P. ; Belasque Jr., J. ; Ferreira, H. . Morfologia e Viabilidade de Xanthomonas Citri subsp. Citri em Condições Adversas de Temperatura. In: 58 Jornada Farmacêutica da Unesp, 2011, Araraquara. 58 Jornada Farmacêutica da Unesp, 2011.

• RIMOLDI, A. ; UCCI, A. P. ; ALVES, R. T. ; Ferreira, H. ; STEINDEL, M. ; DA ROSA, J. A. . Molecular study of Trypanosoma cruzi strains isolated from the Northest and South Brazil. In: XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas´ Disease in Foz do Iguaçu, 2011, Foz do Iguaçu. XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas´ Disease in Foz do Iguaçu, 2011.

• ALMEIDA, L. A. ; RIMOLDI, A. ; NASCIMENTO, J. D. ; Ferreira, H. ; UCCI, A. P. ; DA ROSA, J. A. . Biological and Molecular Characterization of the QMM12 of Trypanosoma cruzy isolated from Triatoma rubrovaria. In: XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas´ Disease in Foz do Iguaçu, 2011, Foz do Iguaçu. XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas´ Disease in Foz do Iguaçu, 2011.

• UCCI, A. P. ; BERTOLINI, M. C . The short ORF XAC3629 from Xanthomonas axonopodis pv citri regulates the operon CopAB expression.. In: XXXVIII Annual Meeting of SBBq, 2009, Águas de Lindóia. XXXVIII Annual Meeting of SBBq, 2009.

• UCCI, A. P. ; PEDROSO, G. A. ; BERTOLINI, M. C . XAC3629, a short upstream open reading frame from Xanthomonas axonopodis pv. citri strongly regulates the operon copAB expression. In: XI Congress of the PABMB; XXXVII Annual Meeting of SBBq, 2008, Águas de Lindóia. XI Congress of the PABMB; XXXVII Annual Meeting of SBBq, 2008., 2008.

• BARBOSA, J. H. ; CARMO, A. U. ; UCCI, A. P. ; FERNANDES, D. ; FRARE, G. F. ; OLIVEIRA, H. C. ; MELLO, M.C. ; SCHLINDWEIN, M. N. . Parque Ecológico do Basalto: refugio para a diversidade da avifauna do município de Araraquara-SP. In: ? XXVI Congresso Brasileiro de Zoologia, 2006, Londrina. Anais do XXVI Congresso Brasileiro de Zoologia, 2006.

• CARMO, A. U. ; BARBOSA, J. H. ; OLIVEIRA, H. C. ; FRARE, G. F. ; PIZZAIA, D. ; UCCI, A. P. ; FERNANDES, D. ; BERTATO, A. C. . Comparação na dieta alimentar da coruja-buraqueira(Athene cunicularia) das áreas rurais e urbanas do municício de Araraquara, SP. In: 17º Encontro de Biólogos do CRBio-1, 2006, Santos. Anais do 17º Encontro de Biólogos do CRBio-1, 2006.

• OLIVEIRA, H. C. ; BARBOSA, J. H. ; CARMO, A. U. ; FERNANDES, D. ; UCCI, A. P. . Avifauna do Parque do Basalto: Composição, Freqüência e Aspectos Biológicos. In: XIV Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2006, Ouro Preto. Anais do XIV Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2006.

• Peiró, D.F. ; UCCI, A. P. ; GORNI, G. R. ; ALVES, R. G. . Entomofauna Associada a Substratos Vivos (Briófitas, Algas Filamentosas, Esponjas e Moluscos) de Ambientes Aquáticos Continentais. In: 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP ? SIICUSP, 2004, Ribeirão Preto. Anais do 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP ? SIICUSP, 2004.

• UCCI, A. P. . Biossegurança. Brasília 2015 (Material Didático).

• UCCI, A. P. . Bactéria e Micobactéria. Brasilia: Leya, 2015 (Material Didático).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2015 - 2016

  Perfil traducional do mutante de hipusinação de eIF5A dys1-1, Descrição: Os avanços no estudo de eIF5A têm mostrado um importante impacto de sua função no processo de síntese proteica, mais especificamente, na etapa de elongação da tradução. Recentemente, eIF5A foi envolvida na elongação da tradução de proteínas contendo sequências, ou motifs, com três ou mais resíduos de prolina consecutivos, através do estímulo da atividade da peptidiltransferase do ribossomo (PTC). Foi demonstrado que estas sequências podem agir como stalling motifs para o ribossomo e que a ligação de eIF5A entre os sítios P e E do ribossomo posicionam seu resíduo de lisina modificado em hipusina (K51 em Saccharomyces cerevisiae; K50 em humano) no PTC facilita sua síntese. Esta mesma função foi observada para o fator EF-P de bactérias, homólogo de eIF5A, e também foi descrito que o contexto ao redor das sequências de prolinas pode influenciar positiva ou negativamente sua produção pelo ribossomo. Assim, torna-se cada vez mais importante determinar o grupo de proteínas que requerem a atividade de eIF5A para se melhor compreender os reflexos biológicos celulares da função de eIF5A, como a importância de eIF5A para a transição G1/S, já descrita em diferentes organismos. Para tanto, propõe-se uma atualização do Plano de trabalho desta bolsa de pós-doutorado, adequado ao curto tempo restante de bolsa. Os experimentos propostos neste plano visam melhorar o entendimento da relação funcional de eIF5A com o controle da expressão gênica em nível traducional por meio da realização de perfil traducional. Desta forma, é proposto analisar o perfil traducional (mRNAs associados aos ribossomos) do mutante de hipusinação de eIF5A dys1-1, mutante da primeira enzima necessária para esta modificação (desoxi-hipusina sintase - Dys1 em S. cerevisiae), utilizando RNA-Seq. Espera-se, assim, que a comparação entre os resultados obtidos de selvagem e mutante dys1-1 por bioinformática revele mRNAs que são mais ou menos traduzidos no mutante deficiente de eIF5A funcional (dys1-1).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Piovesan Ucci - Integrante / Sandro Roberto Valentini - Coordenador.

• 2012 - 2013

  Chromosome segregation in Xanthomonas citri subsp. citri, Descrição: Data from our group showed that ParB encoded by Xanthomonas citri (Xac) is involved with chromosome segregation, and we also noticed the existence of phenotypic similarities between the segregation-cell division processes of Xac and C. crescentus. If our suspicious are correct, Xac may exhibit a control of septation in cell division that is reminiscent of the one documented for C. crescentus, where a factor, not yet identified in Xac, associates with ParB and interferes with septum placement during cell cycle progression. In C. crescentus, this factor was named MipZ, which has as main function the inhibition of FtsZ polymerization in cellular sites other than in the middle of the rods. MipZ function and sub-cellular localization depends on ParB. The mipZ gene was identified in C. crescentus on a screen for parA-like ORFs; Xac also has a handful of ORFs annotated as parA to which function has not been assigned. In order to unveil such relation between the two microorganisms and to verify if Xac had a control of septum placement similar to C. crescentus, we need to knockout/disrupt the parA-like ORFs of the former in an attempt to identify the analogue of mipZ . In addition, we would like to study the influences that the ParA-like proteins encoded by Xac have on ParB function. To achieve this, mutants expressing different combinations of ParB-GFP/parA- or parB-/ParA-GFP will be characterized by advanced techniques of fluorescence microscopy so to detect perturbations of the normal patterns of ParAB subcellular localization. We also intend to identify experimentally the DNA-binding sites of ParB on the main chromosome of Xac, and evaluate the influence of ParA-like proteins on the interaction of ParB with the DNA. These associations will be explored using Deep sequencing/ChIP-seq experiments. The elucidation of such systems and their functions in Xac will contribute not only for the understanding of its biology, but may open a new field of research in the sense that perturbations of ParB in Xac led to a loss of virulence in this plant pathogen (please, se draft of a manuscript in preparation attached).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Piovesan Ucci - Integrante / Henrique Ferreira - Coordenador / Patrick Viollier - Integrante.

• 2010 - 2014

  Funcionalidade das proteínas ParA e ParB na segregação cromossômica de Xanthomonas citri ssp. citri., Descrição: A bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) é o agente etiológico do cancro cítrico, uma doença severa que afeta plantas de citros em todo o mundo e para a qual não há uma forma eficaz de controle. Há praticamente uma década, o genoma de Xcc foi completamente seqüenciado em um esforço para se acelerar o conhecimento da biologia desta bactéria e também, em parte, devido à importância econômica da doença que ela causa. A anotação de seu genoma revelou 4.313 ORFs das quais 2.710 codificam para produtos homólogos a proteínas já conhecidas, sendo o restante, 30-40%, desconhecidas ou hipotéticas. A obtenção do genoma de Xcc sem dúvida representou um marco nos estudos deste microrganismo, porém, muito pouco ainda se sabe sobre alguns de seus processos essenciais como replicação e segregação do material genético, septação, divisão e crescimento celular. Tais processos são em geral conduzidos em bactérias por complexos protéicos apresentando diferenças significativas quando em comparação com complexos de função análoga em eucariotos mais derivados e são, portanto, excelentes alvos para o desenvolvimento de agentes antimicrobianos. Esta proposta tem por finalidade iniciar estudos sobre o processo de segregação cromossômica em Xcc através da caracterização da proteína ParB, potencialmente codificada por este microrganismo (ParBXcc). Proteínas do tipo ParB se ligam ao DNA e são capazes de formar complexos funcionalmente semelhantes aos centrômeros eucarióticos, tendo uma provável atuação na correta partição de cromossomos. A caracterização de ParBXcc envolverá disrupção gênica da ORF que a codifica para medirmos sua essencialidade; sua expressão em Xcc na forma de proteína de fusão contendo a cauda TAP para averiguarmos a provável interação de ParBXcc-TAP com ParB nativo (proteínas tipo ParB em outros microrganismos formam dímeros) e ainda com ParA e SMC; faremos também a localização subcelular de ParB-GFP em Xcc, que poderá apresentar fenótipo semelhante aos observados para proteínas análogas em outras bactérias (dois foci co-localizando com as regiões das origens de replicação cromossômica); finalmente, faremos a caracterização bioquímica de ParBXcc purificada a partir de E. coli onde mediremos suas propriedades de ligação ao DNA e formação de complexos núcleo-protéicos de alta ordem. A constatação de existência e funcionalidade de um sistema de partição cromossômica ParA/B em Xcc abrirá nova frente de pesquisa sobre a manutenção da integridade cromossômica nesta bactéria e fornecerá informações que poderão contribuir para o desenvolvimento de novas estratégias e drogas para o controle do cancro cítrico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Piovesan Ucci - Integrante / Henrique Ferreira - Coordenador.

• 2007 - 2009

  Participação da ORF XAC3629 na regulação do operon de resistência a cobre copAB em Xanthomonas citri subsp. citri., Descrição: Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri) é uma bactéria gram-negativa responsável pelo o cancro cítrico. A doença causada por este fitopatógeno constitui numa das mais graves doenças da citricultura brasileira, cujas medidas de controle capazes de eliminar completamente a doença são ineficientes até o momento. A participação do nosso laboratório no sequenciamento e anotação do genoma da X. citri, juntamente com estudos relacionados a genômica funcional nesta bactéria realizados pelo nosso laboratório mostraram algumas proteínas envolvidas com o mecanismo de resistência a cobre (CopA e CopB). Os genes que codificam ambas proteínas estão organizados em um operon, cuja transcrição é induzida por cobre e é específica ao metal cobre. Componentes a base de cobre são comumente usados na agricultura como agentes microbicidas a fim de reduzir a severidade desta e também de outras doenças nas plantas. Contudo, a eficácia do cobre está sendo reduzida pelo aparecimento de linhagem de bactérias resistentes a este metal, portanto, estudos visando a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na resistência a cobre em X. citri são de grande importância. Esse projeto tem como objetivo principal estudar os mecanismos regulatórios envolvidos na expressão das duas proteínas analisando o papel da ORF XAC3629 na regulação da expressão do operon copAB.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Piovesan Ucci - Integrante / Maria Célia Bertolini - Coordenador.

• 2005 - 2006

  Determinação dos fenótipo de Mdh-1 por RFLP-PCR em amostras de Apis mellifera Linnaeus (1758) (Hymenoptera Apidae), Descrição: O polimorfismo de Mdh-1 constitui o marcador racial mais utilizado nos estudos genéticos das populações de Apis mellifera. As variantes F, M e S são características de Apis mellifera scutellata, Apis mellifera mellifera e Apis mellifera ligustica, respectivamente, permitindo, desta forma, estimar o grau de Africanização das populações da América do Sul e Central. Entretanto, a determinação dos fenótipos requer que a amostra tenha sido mantida a baixas temperaturas desde a coleta até o momento de uso, já que o método alozímico se baseia na detecção de atividade enzimática sobre o suporte eletroforético. A coleta de amostras em locais isolados usualmente requer que a amostra seja estocada em etanol absoluto, o que favorece a análise de polimorfismos de DNA, mas não permite as análises alozímicas. No sentido de contornar tal difilculdade, este projeto visa determinar os fenótipos de Mdh-1 por meio de padrões de restrição diferenciais das três alozimas. Com base na terceira versão do genoma de Apis mellifera recentemente disponível em banco de dados, o presumido gene de interesse permite delinear oligos iniciadores, os quais serão utilizados para amplificar os alelos F, M e S de Mdh-1. Os produtos desta amplificação serão sequenciados e submetidos à digestão diferencial. Caso este método seja validado, amostras de operárias adultas da Venezuela, estocadas em álcool, poderão ser analisadas e a frequência dos alelos estimada, permitindo comparar os dados deste país com os de populações do norte do Brasil. Esta comparação é importante também para que se possa obter evidências relativas a uma segunda introdução de material Africano (Apis mellifera scutellata) nas Américas a partir da Venezuela, em 1974.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Piovesan Ucci - Integrante / Marco Antonio Del Lama - Coordenador.

Prêmios