Thomáz Vieiralves

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Produções bibliográficas

• LÔBO-HAJDU, G. ; GUIMARÃES, A. C. R. ; MENDES, A. S. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano . INTRAGENOMIC, INTRA- AND INTERSPECIFIC VARIATION IN THE rDNA ITS OF PORIFERA REVEALED BY PCR-SINGLE-STRAND CONFORMATION POLYMORPHISM (PCR-SSCP).. Bollettino dei Musei e degli Istituti Biologici dell'Università di Genova (1969) , v. 68, p. 413-423, 2004.

• SALGADO, A. ; VIEIRALVES, T. ; Flávia R. M. Lamarão ; ASSUMPCAO, L. L. ; Gomes D. ; Jascone L. ; VALADAO, A. L. ; Rodolpho M. Albano ; LÔBO-HAJDU, G. . Field preservation and optimization of a DNA extraction method for Porifera. In: CUSTÓDIO, M. R.; LÔBO-HAJDU, G.; HAJDU, E;MURICY, G. (Org.). Porifera Research: Biodiversity, Innovation and Sustainability. 1ed.Rio de Janeiro: IMOS Gráfica e Editora, 2007, v. 1, p. 555-560.

• Marcelo S. Medeiros ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. ; CASTRO, C. B. . Comparação de técnicas de fixação para extração de DNA em Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa). In: XXIV Congresso Brasileiro de Zoologia, 2002, Itajaí, 2002.

• Carla M. M. Silva ; VIEIRALVES, T. ; Rodolpho M. Albano ; Beatriz Mothes ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinção de espécies de Geodia (Porifera) do Atlântico Ocidental através da diversidade genética do DNA Ribossomal.. In: XXIV Congresso Brasileiro de Zoologia, 2002, Itajaí, 2002.

• LÔBO-HAJDU, G. ; Flávia R. M. Lamarão ; GUIMARÃES, A. C. R. ; MENDES, A. S. ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano . A low-cost and quick method to distinguish Porifera species on the basis of ITS sequence variation revealed by PCR-single-strand conformation polymorphism (SSCP). In: 6th International Sponge Conference., 2002, Rapallo, 2002.

• VIEIRALVES, T. ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Amphimedon (Porifera) species from Brazilian Coast through combined morphologic and molecular methods. 6th International Sponge Conference. In: 6th International Sponge Conference., 2002, Rapallo, 2002.

• GUIMARÃES, A. C. R. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . A técnica de PCR-SSCP como método de triagem para distinguir espécies de esponjas marinhas (Porifera).. In: XVI Simpósio de Biologia Marinha do Centro de Biologia Marinha da Universidade de São Paulo, 2001, São Sebastião, 2001.

• SALGADO, A. ; GUIMARÃES, A. C. R. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Porifera Species by PCR-Linked SSCP of Ribosomal DNA ITS Sequences.. In: 47 Congresso Nacional de Genética, 2001, Águas de Lindóia, 2001.

• MEDEIROS, M. S. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. ; CASTRO, C. B. . Comparison of Preservation Techniques for DNA Extraction from Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa).. In: 47 Congresso Nacional de Genética, 2001, Águas de Lindóia, 2001.

• VIEIRALVES, T. ; Oliveira I.L ; Carla M. M. Silva ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . Estudo taxonômico de Amphimedon viridis ?Porifera- da costa brasileira com base em caracteres morfológicos e moleculares.. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Gomes D. ; Jascone L. ; Soares T. ; STANKEVICINS, L. ; VALADAO, A. L. ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. . Análise do rendimento quali- e quantitativo de diversos métodos de preservação de DNA em Porifera. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Carla M. M. Silva ; VIEIRALVES, T. ; Beatriz Mothes ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Geodia Species(Porifera) from Brazilian Coast detected by genetic variability in the ITS from nuclear ribosomal RNA.. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VIEIRALVES, T. ; VALADAO, A. L. ; STANKEVICINS, L. ; Soares T. ; Jascone L. ; Gomes D. ; Carla M. M. Silva ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . A comparison of different field preservation techniques for DNA extraction in Porifera.. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VIEIRALVES, T. ; Carla M. M. Silva ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Amphimedon species(Porifera) from Brazilian Coast detected by PCR-SSCP.. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MEDEIROS, M. S. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. ; CASTRO, C. B. . Comparação de técnicas de fixação para extração de DNA em Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa). 2002. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Carla M. M. Silva ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Beatriz Mothes ; Rodolpho M. Albano ; LÔBO-HAJDU, G. . Species identification of Geodia (Porifera) from Eastern Pacific through genetic polymorphisms on the nuclear ribosomal DNA ITS sequences.. 2002. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• LÔBO-HAJDU, G. ; Flávia R. M. Lamarão ; GUIMARÃES, A. C. R. ; SALGADO, A. ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano . A low-cost and quick method to distinguish Porifera species on the basis of ITS sequence variation revealed by PCR-single-strand conformation polymorphism (SSCP).. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VIEIRALVES, T. ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Amphimedon (Porifera) species from Brazilian Coast through combined morphologic and molecular methods. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• GUIMARÃES, A. C. R. ; Flávia R. M. Lamarão ; SALGADO, A. ; VIEIRALVES, T. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano ; HAJDU, E. ; LÔBO-HAJDU, G. . A técnica de PCR-SSCP como método de triagem para distinguir espécies de esponjas marinhas (Porifera). 2001. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SALGADO, A. ; GUIMARÃES, A. C. R. ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; SILVA, C. M. M. ; MANSURE, J. J. ; Rodolpho M. Albano ; LÔBO-HAJDU, G. . Distinction of Porifera Species by PCR-Linked SSCP of Ribosomal DNA ITS Sequences. 2001. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Marcelo S. Medeiros ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. ; CASTRO, C. B. . Comparison of Preservation Techniques for DNA Extraction from Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa).. 2001. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Carla M. M. Silva ; Flávia R. M. Lamarão ; VIEIRALVES, T. ; LÔBO-HAJDU, G. ; CASTRO, C. B. . Distinção de espécies de Geodia (Porifera) do Atlântico Ocidental através da diversidade genética do DNA Ribossomal. 2001. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2013 - Atual

  Identificação molecular da biodiversidade da coleção de poríferos do Museu Nacional (MN/UFRJ): espécies crípticas, variabilidade populacional e filogenia molecular, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/01/2015., Descrição: Os museus de história natural são de crucial importância uma vez que permitem um enorme potencial de gerar conhecimento sobre a biodiversidade devido às suas coleções biológicas e as informações nelas incorporadas (genética, morfológica, etc.). O código-de-barras de DNA" têm se mostrado eficaz em estudos de biodiversidade, podendo ajudar os taxonomistas indicando caracteres morfológicos diagnósticos úteis, informando revisões necessárias e sinalizando espécies crípticas. Com a grande vantagem de uma caracterização de etiquetas taxonômicas em estrutura de larga-escala, baseada em uma plataforma operacional envolvendo isolamento de DNA, sequenciamento e bioinformática. O presente projeto tem como objetivo explorar, por meio do seqüenciamento de marcadores moleculares, a Coleção de Poríferos do Museu Nacional da Universidade Federal do Rio de Janeiro (MN/UFRJ). Conhecendo-se a composição genética do maior número de espécies nativas ou de ampla distribuição no litoral do Brasil é possível propor estratégias de gerenciamento efetivo destes organismos e preservar nossa biodiversidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Coordenador / Eduardo Hajdu - Integrante / Thiago Silva de Paula - Integrante / Mariana de S. Carvalho - Integrante / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Mariana de Paula Ribeiro Costa - Integrante / Thalita Dionísio Belmont - Integrante / Marcia Maria Giesta de Souza - Integrante / Cid Couto Chaves - Integrante / Humberto Freitas de Medeiros Fortunato - Integrante / Mariana Ventura Alves - Integrante / Larissa Lima Morgado - Integrante / Camille Victória Leal Corrêia da Silva - Integrante / João Luis Carraro - Integrante / Cássio Albernoz Fonseca - Integrante.

• 2012 - 2014

  PorToL (The Porifera Tree of Life) Brasil - Árvore da vida das esponjas brasileiras, Parte II: identificação molecular com COI, Processo n E-26/110.421/2012, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/01/2015., Descrição: A comparação de sequências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Sequências de marcadores moleculares que permitam a identificação de espécies são denominadas de código-de-barras de DNA e tem por pretensão utilizar o gene codificante da subunidade I da citocromo c oxidase (COI) para a identificação de grupos animais. O objetivo principal deste projeto é explorar o banco de DNA de espécies de esponjas marinhas do Brasil e desenvolver ferramentas para a detecção de variabilidade genética, contribuindo para a construção de uma árvore da vida das esponjas marinhas brasileiras. Sequências de código-debarras de DNA organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, conservação, identificação de espécies crípticas, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, desenvolvimento de sondas de DNA, estudos taxonômicos e filogenéticos, ecofisiológicos, forenses, entre outros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Coordenador / Thiago Silva de Paula - Integrante / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Mariana de Paula Ribeiro Costa - Integrante / Thalita Dionísio Belmont - Integrante / Marcia Maria Giesta de Souza - Integrante / Cid Couto Chaves - Integrante / Humberto Freitas de Medeiros Fortunato - Integrante / Mariana Ventura Alves - Integrante / Larissa Lima Morgado - Integrante / Débora Maína Braga de Mello - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Plasticidade fenotípica de Amphimedon viridis Duchassaing & Michelotti (1864) da costa brasileira e estudos das relações filogenéticas das Famílias da Ordem Haplosclerida, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/01/2015., Descrição: O estudo das relações filogenéticas foi descrito como uma forma de avaliar a diversidade biológica e de determinar prioridades de conservação em diferentes grupos. Nesse trabalho utilizaremos seqüências polimórficas de DNA como caracteres adicionais aos morfológicos para propor relações filogenéticas para as Famílias das Subordens Haplosclerina e Petrosina, e para determinar o status taxonômico dos principais morfotipos de Amphimedon viridis Duchassaing & Michelotti, 1864 da costa brasileira. As regiões gênicas escolhidas para abordar a variabilidade genética destas espécies de esponjas são: o gene codificante da subunidade I da citocromo c oxidase (COI ou cox1) e o gene do 16S RNAr do genoma mitocondrial (altamente variáveis entre as esponjas) e os espaçadores internos transcritos (ITS1 e ITS2) do RNA ribossomal (RNAr) nuclear. Projeto de Tese de Doutorado do PPGEE.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Coordenador / Caroline Cordonis Borges da Silva - Integrante.

• 2010 - 2014

  Rede Brasileira de Identificação Molecular de Organismos Marinhos, Descrição: O projeto propõe o levantamento de parte da biodiversidade de alguns grupos de organismos eucarióticos marinhos distribuídos ao longo da costa brasileira. Para tanto, será utilizada a técnica de DNA barcoding , complementada com dados de morfologia e de distribuição geográfica. Esses dados serão integrados aos obtidos nos demais projetos compõem a Rede, para a produção de bancos de dados e de amostras preservadas em coleções (ex. museus e herbários). O conhecimento da diversidade de organismos marinhos tem sido objeto de muitos estudos anteriores, porém esse conhecimento é baseado principalmente em dados morfológicos e só esporadicamente complementado por abordagens moleculares. A taxonomia de muitos desses grupos é notoriamente difícil devido à morfologia e anatomia relativamente simples, e em muitos casos convergentes, grande plasticidade fenotípica e alternância de gerações heteromórficas, dificuldade de coleta, ampla distribuição geográfica, entre outros. A comparação de sequências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Sequências de marcadores moleculares que permitam a identificação de espécies são denominadas de DNA barcodes . Sequências de DNA barcodes , organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, conservação, identificação de espécies crípticas, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, desenvolvimento de sondas de DNA, estudos taxonômicos e filogenéticos, ecofisiológicos, forenses, entre outros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Integrante / Thiago Silva de Paula - Integrante / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Mariana Cabral de Oliveira - Coordenador / Melanie Lopes da Silva - Integrante.

• 2010 - 2011

  PorToL (The Porifera Tree of Life) Brasil - Árvore da vida das esponjas brasileiras, Parte I: 28S e COI, Auxílio à Pesquisa, APQ1 FAPERJ, Processo no. E-26/110.260/2010, Descrição: A informação fundamental de uma espécie é aquela contida em seu genoma. A estocagem de amostras em bancos de DNA é uma forma de preservação da diversidade biológica. Entretanto, pouco esforço tem sido feito no sentido de coletar e documentar amostras de DNA como recursos genéticos. No Brasil existem diversos bancos de DNA de espécies brasileiras, principalmente voltado para espécies endêmicas e ameaçadas de extinção. O objetivo principal deste projeto é implantar e explorar o primeiro banco de DNA do Brasil de espécies de esponjas marinhas e gerar/construir hipóteses filogenéticas das relações dos gêneros e famílias assinaladas para a subordem Mycalina, Ordem Poecilosclerida. Pretendemos promover o estudo em detalhe desses genomas, desenvolver ferramentas para detecção de variabilidade genética e contribuir para a construção de uma árvore da vida das esponjas marinhas brasileiras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Coordenador / Eduardo Hajdu - Integrante / Thiago Silva de Paula - Integrante / Thiago da Silva Farias - Integrante / André Rennó Ribeiro Chaves - Integrante / Bruno Cosme da Silva Gomes - Integrante / Rafaela Magalhães Aires - Integrante / Dayane Sereno B. Rodrigues - Integrante / Yuri Izidoro Tassara - Integrante / Robert W. Thacker - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / National Science Foundation - Outra.

• 2003 - 2006

  Distinção de espécies de invertebrados marinhos através da análise de variabilidade genética - Auxílio à Pesquisa APQ1 FAPERJ E-26/170.576/2003, Descrição: Descrição: Distinção de espécies de invertebrados marinhos através da análise de variabilidade genéticaA classificação baseada somente em caracteres morfológicos tem sido a causa da dificuldade de alocação de muitos organismos marinhos, sobretudo naqueles em que os caracteres morfológicos são escassos. Este projeto tem como objetivo geral utilizar técnicas genéticas de biologia molecular e bioquímica para estudos populacionais e da biologia de espécies de invertebrados marinhos. O objetivo específico é avaliar a variabilidade genética entre espécies de populações naturais de esponjas, corais e cracas através do método do polimorfismo de conformação de fita simples vinculado à reação em cadeia da polimerase (PCR-SSCP) utilizando como alvo regiões polimórficas no RNA nuclear e mitocôndrial. Pretendemos utilizar abordagens moleculares para estudar três gêneros de esponjas: Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Haplosclerida); Aplysina Nardo, 1834 (Verongida) e Geodia Lamarck, 1815 (Astrophorida); e em corais do gênero Thesea (Anthozoa) e crustáceos do gênero Megabalanus (Cirripedia). Síntese da metodologia: 1) Amostragem de espécimes de invertebrados; 2) Extração de DNA genômico total; 3) Reações de amplificação por PCR e visualização dos produtos em gel de agarose (visualizados após incubação em brometo-de-etídeo); 4) Análise dos produtos do PCR por SSCP; 5) Tabulação dos dados e análise computacional. Como resultados esperados deste projeto estão, pelo menos: três artigos, duas monografias de conclusão de curso de graduação em Ciências Biológicas, duas dissertações de Mestrado e no mínimo oito comunicações em congressos nacionais e internacionais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Coordenador / Rodolpho Mattos Albano - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Integrante / Flávia R. M. Lamarão - Integrante / Ana Carolina Ramos Guimarães - Integrante / Eduardo Hajdu - Integrante / Adriana Salgado - Integrante / Marcelo Semeraro Medeiros - Integrante / Leonardo L.M. Assumpção - Integrante / Carla M. Menegola Silva - Integrante / Yuri Izidoro Tassara - Integrante / Roberto Curty Penteado - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2001

  Genética de Populações e Organização Genomica de Porifera - Auxílio à Pesquisa - APQ1 FAPERJ E-26/171.800/1999, Descrição: O projeto " Genética de Populações e Organização Genomica de Porifera" teve como principal objetivo o levantamento da biodiversidade existente de esponjas marinhas. Foi utilizada a técnica de RAPD (random amplified polymorphic DNA) de amplificação do DNA por PCR (polymerase chain reaction).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) . , Integrantes: Thomáz Vieiralves - Integrante / Rodolpho Mattos Albano - Integrante / Gisele Lôbo-Hajdu - Coordenador / Flávia R. M. Lamarão - Integrante / Ana Carolina Ramos Guimarães - Integrante / Adriana Salgado - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.