Pedro Túlio de Resende Lara

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Projetos de pesquisa

• 2018 - Atual

  Exploring mechanical and energy changes in TrkA tyrosine kinase domain activation loop autophosphorylation, Descrição: TrkA is a tyrosine kinase receptor and its signaling regulate neuronal survival, proliferation, dendrite growth and patterning, and the expression and activity of functionally important proteins, such as ion channels and neurotransmitter receptors. In the adult nervous system, the TrkA regulate synaptic strength and plasticity. The intracellular signaling promoted by tyrosine kinase domain of TrkA depends of autophosphorylation of a set of tyrosines residues, including the Y670, Y674 and Y675. These residues lies on TrkA activation loop, a region that regulates kinase activity by occluding the catalytic core of tyrosine kinase domain. Although the outcomes of the autophosphorylation are well known, the mechanisms by which local topological changes promotes global conformational changes are still uncharted. Since TrkA has a highly complex biased signaling, the comprehension of those mechanisms is important to understand many homeostatic and pathological processes, opening a new window for molecular therapies. Here, we propose to describe the complete mechanism of autophosphorylation of TrkA tyrosine kinase activation loop by exploring its mechanical and energy changes during this process.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Pedro Túlio de Resende Lara - Integrante / David Perahia - Coordenador.

• 2017 - Atual

  Self-adaptive collective motions of macromolecules incorporating structural and environmental effects, Descrição: Development of a computational protocol that enhance conformational sampling in molecular dynamics simulations taking into account the natural constraints imposed either by the macromolecule's structure or its environment.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Pedro Túlio de Resende Lara - Integrante / Antônio Sérgio Kimus Braz - Integrante / David Perahia - Coordenador / SCOTT, ANA LÍGIA - Integrante.

• 2015 - Atual

  Transferência de informação na sinalização dos receptores TrkA mediados por neurotrofinas e outros ligantes, Descrição: As interações entre o receptor tropomiosina quinase tipo A (TrkA) e as neurotrofinas fator de crescimento neural (NGF) e neurotrofina-3 (NT-3) são responsáveis por diversos papéis nos sistemas nervosos central e periférico, destacando-se a diferenciação e proteção neural e plasticidade sináptica. Mutações ao longo da estrutura do receptor TrkA produzem uma neuropatia rara conhecida como Insensibilidade Congênita à Dor com Anidrose (CIPA), patologia que incapacita os portadores de sentirem dor e temperatura, causa défices cognitivos severos e anidrose. Apesar de haver grande descrição da sinalização do TrkA sob efeito das interações com neurotrofinas, pouco se investigou sobre os mecanismos moleculares e conformacionais dessas interações bem como sobre suas modificações ocasionadas pelas mutações. O objetivo desse projeto é compreender os mecanismos de interação molecular e modificações conformacionais que levam à ativação do TrkA selvagem, através da avaliação da transdução do sinal ao longo da estrutura. Ainda, pretende-se avaliar as diferenças na transdução do sinal para o TrkA selvagem ativado pelo NGF ou NT-3, bem como buscar responder quais são as mudanças deletérias causadas pelas mutações.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Pedro Túlio de Resende Lara - Integrante / Antônio Sérgio Kimus Braz - Coordenador / David Perahia - Integrante / SCOTT, ANA LÍGIA - Integrante.

• 2013 - 2015

  Análise estrutural do fator de crescimento neural e as implicações moleculares de suas mutações na interação com os receptores TrkA e p75NTR, Descrição: Avaliação estrutural e comparativa do fator de crescimento neural selvagem e seus mutantes, relacionando sua estrutura e movimentos nativos com seus papéis biológicos descritos através da análise de modos normais. Compreensão das interações específicas do NGF e seus receptores afetadas pelas mutações, procurando entender como as alterações estruturais podem levar à condição patológica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Pedro Túlio de Resende Lara - Integrante / Antônio Sérgio Kimus Braz - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante., Número de produções C, T & A: 4

• 2012 - 2013

  Virtual Screening de um sítio alostérico da região flap da protease do HIV-1M (Human Innunodeficiency Virus 1M), Descrição: Análise da interação de diversos compostos candidatos a ligantes semelhantes química e estruturalmente em sítio alostérico da HIV-1M protease, observando as possibilidades de interação entre esse sítio da protease e cada ligante. Caso seja observada a inibição da protease através de ligação no sítio alostérico do flap elbow, o trabalho pode servir como base para o desenvolvimento farmacológico de medicamentos para uma co-terapia para a AIDS, que aliados aos medicamentos hoje ministrados, inimizariam os efeitos da alta mutação viral através da maior possibilidade de inibição.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Pedro Túlio de Resende Lara - Integrante / Antônio Sérgio Kimus Braz - Coordenador.