Thiago Silva de Paula

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Produções bibliográficas

• LEITE, DORA DE MOURA BARBOSA ; DE PAULA, THIAGO SILVA ; HAJDU, EDUARDO . The complete mitochondrial genome of the deep-sea methanotrophic sponges Hymedesmia methanophila and Iophon methanophila: leveraging `waste? in metagenomic data. Journal of Genetics , v. 103, p. 34, 2024.

• DE PAULA, THIAGO SILVA ; LEITE, DORA DE MOURA BARBOSA ; LOBO-HAJDU, GISELE ; VACELET, JEAN ; THOMPSON, FABIANO ; HAJDU, EDUARDO . The complete mitochondrial DNA of the carnivorous sponge is putatively complemented by microDNAs. PeerJ , v. 12, p. e18255, 2024.

• NASCIMENTO, BEATRIZ MIGUEZ ; DE PAULA, THIAGO SILVA ; BRITO, PAULO MARQUES MACHADO . DNA barcode of tilapia fish fillet from the Brazilian market and a standardized COI haplotyping for molecular identification of Oreochromis spp. (Actinopterygii, Cichlidae). Forensic Science International: Animals and Environments , v. 3, p. 100059, 2023.

• NOGUEIRA, DENISE MONNERAT ; DE CARVALHO, RODRIGO SALLES ; DE OLIVEIRA, ANDRÉA MARIA ; DE PAULA, THIAGO SILVA ; PEREIRA, DANIEL GOMES ; PISSINATTI, ALCIDES ; LOIOLA, SILVIA DE OLIVEIRA ; CARVALHO, ELIZEU FAGUNDES ; SILVA, DAYSE APARECIDA ; BERGALLO, HELENA GODOY ; FERREIRA, ANA MARIA DOS REIS . Uniparental genetic markers to investigate hybridization in wild-born marmosets with a mixed phenotype among Callithrix aurita and invasive species. Scientific Reports , v. 12, p. 1-1, 2022.

• BREVES, ANDRÉ ; DE PAULA, THIAGO SILVA ; SPOTORNO, PAULA ; FERNANDES, MAURÍCIO ROMULO ; LÔBO-HAJDU, GISELE ; PIMENTA, ALEXANDRE DIAS . Living in solitude or building reefs: ecophenotypic variation of the vermetid Petaloconchus varians revealed by mitochondrial DNA analysis. JOURNAL OF MOLLUSCAN STUDIES , v. 88, p. eyac030, 2022.

• FERNANDES, MAURÍCIO ROMULO ; SALGUEIRO, FABIANO ; PAULA, THIAGO SILVA ; LÔBO'HAJDU, GISELE ; PIMENTA, ALEXANDRE DIAS . Cryptic speciation in the - - species complex (Gastropoda, Triphoridae) from the Western Atlantic. JOURNAL OF ZOOLOGICAL SYSTEMATICS AND EVOLUTIONARY RESEARCH , v. 59, p. 819-838, 2021.

• FORTUNATO, HUMBERTO F. M. ; DE PAULA, THIAGO S. ; ESTEVES, EDUARDO L. ; MURICY, GUILHERME ; LÔBO-HAJDU, GISELE . Biodiversity and structure of marine sponge assemblages around a subtropical island. HYDROBIOLOGIA , v. 847, p. 1281-1299, 2020.

• ESTEVES, E. L. ; DE PAULA, T. S. ; LERNER, C. ; LÔBO-HAJDU, G. ; HAJDU, E. . Morphological and molecular systematics of the -Monanchora arbuscula complex? (Poecilosclerida : Crambeidae), with the description of five new species and a biogeographic discussion of the genus in the Tropical Western Atlantic. INVERTEBRATE SYSTEMATICS , v. 32, p. 457, 2018.

• GASTALDI, M. ; DE PAULA, T. S. ; NAVARTE, M. ; DALEO, P. ; LÔBO-HAJDU, G. ; HAJDU, E. . Marine sponges (Porifera) from the Bahía San Antonio (North Patagonian Gulfs, Argentina), with additions to the phylogeography of the widely distributed Cliona aff. celata and Hymeniacidon perlevis , and the description of two new species. Marine Biology Research , p. 1-35, 2018.

• LEAL, C. V. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; SCHONBERG, C. H. L. ; ESTEVES, E. L. . Morphological and molecular systematics of the 'Cliona viridis complex' from south-eastern Brazil. Journal of the Marine Biological Association of the UK (Online) , v. 00, p. 1-10, 2015.

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; REDMOND, N. E. ; COSME, B. ; COLLINS, A. G. ; LOBO-HAJDU, G. . Mycalina: Another Crack in the Poecilosclerida Framework. Integrative and Comparative Biology , v. 00, p. 1-11, 2013.

• DE PAULA, T. S. ; ZILBERBERG, C. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . Morphology and molecules on opposite sides of the diversity gradient: Four cryptic species of the Cliona celata (Porifera, Demospongiae) complex in South America revealed by mitochondrial and nuclear markers. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print) , v. 62, p. 529-541, 2012.

• ABSALÃO, Ricardo Silva ; SILVA, Pedro Henrique de Almeida ; DE PAULA, T. S. . Shell morphometrics in four species of Gadilidae (Mollusca, Scaphopoda) in Southwestern Atlantic Ocean, Brazil. Revista Brasileira de Zoologia , Curitiba, v. 22, n.1, p. 175-179, 2005.

• ABSALÃO, Ricardo Silva ; DE PAULA, T. S. . Shell morphometrics of three species of gadilid Scaphopoda (Mollusca) from the Southwestern Atlantic Ocean: comparing the discriminating power of primary and secondary descriptors. ZOOTAXA (ONLINE) , Bellevue (Washington), v. 706, p. 1-12, 2004.

• CREED, J. C. ; ABSALÃO, R. S. ; ALVARENGA, M. F. ; AMÂNCIO, I. C. ; AMARO, F.D. ; BARCELLOS, C. F. ; BRASIL, A. C. S. ; CAETANO, C. H. S. ; CARDOSO, I. A. ; DE PAULA, T. S. . Considerações Gerais. In: Joel C. Creed; Debora O. Pires; Marcia A. de O. Figueiredo. (Org.). Biodiversidade Marinha da Baía da Ilha Grande. Brasília- DF: MMA / SBF, 2007, v. 23, p. 379-392.

• SANTOS, F. N. ; CAETANO, C. H. S. ; ABSALÃO, R. S. ; DE PAULA, T. S. . Mollusca de substrato não consolidado. In: Joel C. Creed; Debora O. Pires; Marcia A. de O. Figueiredo. (Org.). Biodiversidade Marinha da Baía da Ilha Grande.. Brasília - DF: MMA / SBF, 2007, v. 23, p. 207-236.

• DE PAULA, T. S. ; COSTA-LIMA, M. A. . Publique seu livro online usando BookDown: um tutorial passo-a-passo. In: Congresso Internacional Movimentos Docentes, 2023, São Paulo. Anais do Congresso Internacional Movimentos Docentes. Santo André: V&V Editora, 2023. v. 2. p. 382-387.

• COSTA-LIMA, M. A. ; LÔBO-HAJDU, GISELE ; DE PAULA, T. S. . Utilizando o espaço virtual para apoio ao ensino de Genética de Populações: relato de uma experiência pós isolamento social. In: Congresso Internacional Movimentos Docentes ? CMD 2022, 2022, São Paulo - SP. Anais do Congresso Internacional Movimentos Docentes. Diadema - SP: V&V Editora, 2022. v. 7. p. 1.

• SANTOS, F. N. ; ABSALÃO, Ricardo Silva ; CAETANO, C. H. S. ; DE PAULA, T. S. . Moluscos marinhos da Baía da Ilha Grande, Rio de Janeiro, Resultados preliminares. In: II Congresso Brasileiro de Oceanografia, 2005, Vitória - ES. Livro de Resumos - II CBO'2005 e XVII SNO, 2005.

• MEMORIA, M. M. G. ; MESQUITA, J. L. ; DE PAULA, T. S. . Diversidade e variabilidade das esponjas clionaidas das pequenas antilhas coletadas na expedição Pacotilles. In: 32º Semana de Iniciação Científica da UERJ, 2023, Rio de Janeiro. Livro de Resumos da 32º Semana de Iniciação Científica da UERJ. Rio de Janeiro: Pró-reitoria de Pós-graduação e Pesquisa da UERJ, 2023. v. 1. p. 206.

• LEAL, A. O. ; AIRES, R. M. ; DE PAULA, T. S. ; GITIRANA, H. M. ; LÔBO-HAJDU, G. . Caracterização genética de tartarugas-verdes (Chelonia mydas, Linnaeus 1758) encontradas na área de influência da Central Nuclear Almirante Álvaro Alberto, Angra dos Reis e Paraty, estado do Rio de Janeiro. In: IXª Reunião do Grupo de Especialistas da Rede ASO-Tartarugas e VIII Jornada de Pesquisa e Conservação de Tartarugas Marinhas do Atlântico Sul Ocidental, 2018, Niterói, RJ. Libro Resumenes 9ª ASO. Niterói, RJ: Editora da UFF, 2018. v. 1.

• DE PAULA, T. S. ; COSTA-LIMA, M. A. ; LOBO-HAJDU, G. . A utilização do espaço virtual na prática de ensino de Genética: Difusão e popularização de recursos multimídia e conhecimentos técnico-científicos para estudantes lusófonos de ensino superior. In: 27ª UERJ Sem Muros, 2017, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 27ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro, 2017. v. 1.

• LEITE, D. M. B. ; DE PAULA, T. S. ; LÔBO-HAJDU, G. ; HAJDU, E. . Integrative Systematics of Tropical Western Atlantic Mycale of the immitis-group. In: 10th World Sponge Conference, 2017, Galway. 10th World Sponge Conference - Book of Abstracts. Galway: NUI Galway, 2017. v. 1. p. 155-156.

• LÔBO-HAJDU, G. ; ALVES, M. V. ; VIEIRALVES, T. ; de PAULA, TS . Phenotypic Plasticity in Sponges: a case study on Callyspongia sp. from Northeastern Brazil. In: Book of Abstracts 10th World Sponge Conference, 2017, Galway. 10th World Sponge Conference -. Galway: NUI Galway, 2017. v. 1. p. 61-61.

• FORTUNATO, H. F. M. ; FERNANDES, F. ; LOPES, M. ; ALBANO, R. M. ; DE PAULA, T. S. ; LÔBO-HAJDU, G. ; ESTEVES, E. L. . A new species of Hymeniacidon from Brazil and redescription of Halichondria (Halich.) melanadocia de Laubenfels, 1936. In: 10th World Sponge Conference, 2017, Galway. Book of Abstracts 10th World Sponge Conference. Galway: NUI Galway, 2017. v. 1. p. 137-138.

• LOURENÇO-DA-SILVA, R. ; FERNANDEZ, J. C. ; OLIVEIRA, A. M. ; DE PAULA, T. S. ; LÔBO-HAJDU, G. . timização de microssatélites heterólogos para estudos de diversificação críptica em Scopalina sp. (Porifera, Demospongiae) do Atlântico Tropical. In: 26ª Semana de Iniciação Cientifica da Universidade do Estado do Rio de Janeiro (SEMIC), 2017, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 26ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro: EDUERJ, 2017. v. 1. p. 111.

• SILVA, R. L. ; LEAL, A. O. ; GITIRANA, H. M. ; DE PAULA, T. S. ; LÔBO-HAJDU, G. . Genetic characterization of green turtles on the surroundings of the nuclear power plant of Angra dos Reis and Paraty, Rio de Janeiro State. In: 63° Congresso Brasileiro de Genética, 2017, Águas de Lindóia, SP. Resumos do GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2017. v. 1. p. 38827.

• SILVA, R. L. ; LEAL, A. O. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . Contribuição para a caracterização genética de tartarugas verdes do entorno das usinas nucleares de Angra dos Reis e Paraty - RJ: aumento do número amostral e resultados iniciais das amostras a partir de 2015. In: 26ª Semana de Iniciação Científica da UERJ, 2016, Rio de Janeiro. Livro de Resumos da 25ª SEMIC. Rio de Janeiro, 2016. v. 1. p. 124-125.

• SILVA, R. S. F. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . Estudo molecular de Aplysina fulva (Pallas, 1766) e Callyspongia sp.. In: 25ª Semana de Iniciação Científica da UERJ, 2016, Rio de Janeiro. Livro de Resumos da 25ª SEMIC. Rio de Janeiro, 2016. v. 1. p. 128-129.

• LEITE, D. M. B. ; DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. . Integrative systematics of Mycale from the Tropical Western Atlantic. In: II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO), 2016, Rio de Janeiro. II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO) - Program and Book of Abstracts. Rio de Janeiro: LIA-MARRIO, 2016. v. 1. p. 15-15.

• FORTUNATO, H. F. M. ; DE PAULA, T. S. ; ESTEVES, E. L. ; MURICY, G. R. S. ; LÔBO-HAJDU, G. . Biodiversity and structural dynamic of marine sponges assemblages of Ilha Grande and environs, Rio de Janeiro, Brazil. In: II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO), 2016, Rio de Janeiro. II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO) - Program and Book of Abstracts. Rio de Janeiro: LIA-MARRIO, 2016. v. 1. p. 18-18.

• LÔBO-HAJDU, G. ; VIEIRALVES, T. ; DE PAULA, T. S. . Phenotipic Plasticity in Porifera. In: II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO), 2016, Rio de Janeiro. II Workshop ABC/CNRS (LIA-MARRIO) - Program and Book of Abstracts. Rio de Janeiro: LIA-MARRIO, 2016. v. 1. p. 36-36.

• LEAL, A. O. ; AIRES, R. M. ; DE PAULA, T. S. ; GITIRANA, H. M. ; LOBO-HAJDU, G. . Caracterização genética de tartarugas- verdes (Chelonia mydas, Linnaeus 1758) encontradas na região de Angra dos Reis e Paraty - RJ. In: 5° Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2015, Porto de Galinhas, PE. CD do 5° Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2015. v. 1.

• ALVES, M. V. ; DE PAULA, T. S. ; SOUSA, V. A. M. ; SOUZA, M. M. G. ; VIEIRALVES, T. ; LOBO-HAJDU, G. . Plasticidade fenotípica de Callyspongia sp. (Porifera) da costa de Salvador, Bahia. In: 5° Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2015, Porto de Galinhas, PE. CD do 5° Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2015. v. 1.

• FORTUNATO, H. F. M. ; DE PAULA, T. S. ; MURICY, G. R. S. ; LOBO-HAJDU, G. . Biodiversity and structure of marine sponges assemblies in Ilha Grande Bay, Rio de Janeiro, Brazil. In: XVI Congreso Latinoamericano de Ciencias del Mar, 2015, Santa Marta, Colômbia. CD del XVI Congreso Latinoamericano de Ciencias del Mar. Bogotá, Colômbia: sociación Latinoamericana de Investigadores en Ciencias del Mar, 2015. v. 1.

• LEAL, A. O. ; AIRES, R. M. ; GITIRANA, H. M. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . Caracterização genética de tartarugas verdes encontradas na zona de influência das usinas nucleares de Angra dos Reis-RJ: padronização dos experimentos e resultados iniciais. In: 25ª UERJ Sem Muros, 2014, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 25ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro: UERJ, 2014.

• SILVA, G. G. ; MORGADO, L. L. ; SOUSA, V. A. M. ; DE PAULA, T. S. ; SOUZA, M. M. G. ; LOBO-HAJDU, G. . Uma investigação preliminar das relações filogenéticas entre as esponjas bioerosivas hadromeridas utilizando dados moleculares nucleares e mitocondriais. In: 25ª UERJ Sem Muros, 2014, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 25ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro: UERJ, 2014.

• ALVES, M. V. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . Phenotypic plasticity of Callyspongia sp. (Duchassaing & Michelotti, 1867) (Porifera, Demospongiae) from the Brasilian coast. In: 60o Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá, SP. Livro de Resumos do 60o Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. v. 1. p. 25.

• ALVES, M. V. ; DE PAULA, T. S. ; SOUSA, V. A. M. ; SOUZA, M. M. G. ; VIEIRALVES, T. ; LOBO-HAJDU, G. . Variabilidade genética e plasticidade fenotípica de Callyspongia sp. (Porifera) da costa do Nordeste do Brasil. In: 25ª UERJ Sem Muros, 2014, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 25ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro: UERJ, 2014.

• HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. ; COSME, B. ; DE PAULA, T. S. ; REDMOND, N. E. ; COLLINS, A. G. ; THACKER, R. W. . Towards an Evolutionary Classification of Mycalina and Latrunculina (Poecilosclerida). In: Annual Meeting of the Society of Integrative and Comparative Biology, 2013, San Francisco, CA. Abstract Book, 2013. p. S8-1.6.

• ESTEVES, E. L. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; HAJDU, E. . Synonymization of Crambe and Monanchora, with a taxonomic revision of the Crambe arbuscula complex, and description of three new species from the Tropical Western Atlantic. In: 9th World Sponge Conference, 2013, Fremantle, Western Australia. Abstracts: Ninth World Sponge Conference 2013. Fremantle, Western Australia: Australian Institute of Marine Science, 2013. v. 1. p. 45-46.

• ESTEVES, E. L. ; FROMONT, J. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; HAJDU, E. . Taxonomy of Crambe s.l. (Crambeidae, Myxillina, Poecilosclerida) from south-western Australia, a morphological and molecular approach, with the description of four new species. In: 9th World Sponge Conference, 2013, Fremantle, Western Australia. Abstracts: Ninth World Sponge Conference 2013. Fremantle, Western Australia: Australian Institute of Marine Science, 2013. v. 1. p. 133.

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . Phylogenetic relationships within Mycale Gray, 1867 inferred from molecular data, and implications for morphological character evolution. In: 9th World Sponge Conference, 2013, Fremantle, Western Australia. Abstracts: Ninth World Sponge Conference 2013. Fremantle, Western Australia: Australian Institute of Marine Science, 2013. v. 1. p. 85-86.

• COSTA, M. P. R. ; ALVES, M. V. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . PorToL Brasil, Parte I: relações filogenéticas do gênero Mycale Gray, 1867 (Porifera, Poecilosclerida). In: 24ª UERJ Sem Muros, 2013, Rio de Janeiro. Anais de Resumos da 24ª UERJ Sem Muros. Rio de Janeiro: UERJ, 2013. v. 1. p. 167.

• LEAL, C. V. ; ESTEVES, E. L. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; SCHONBERG, C. H. L. . First record of the 'Cliona viridis complex' in the Southwestern Atlantic. In: 9th World Sponge Conference, 2013, Fremantle, Western Australia. Abstracts: Ninth World Sponge Conference 2013. Fremantle, Western Australia: Australian Institute of Marine Science, 2013. v. 1. p. 106-107.

• FIGUEIRA, R. M. A. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; ABSALAO, R. S. . Molecular analysis of the complex Olivella minuta (Link, 1807), preliminary results. In: XI International Congress on Medical and Applied Malacology, 2012, Rio de Janeiro. XI International Congress on Medical and Applied Malacology - ABSTRACTS BOOK, 2012. p. 79.

• COSME, B. ; HAJDU, E. ; SILVA, M. L. ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . AMPHILECTUS - POECILOSCLERIDA OU HAPLOSCLERIDA? UMA PERSPECTIVA FILOGENÉTICO-MOLECULAR. In: XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia, 2012, Salvador. CD de resumos do XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ). Curitiba: Sociedade Brasileira de Zoologia (SBZ), 2012. v. 1. p. 167.

• DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . 20 anos da primeira sequência de DNA publicada de porifera ou o que aprendemos até agora dos estudos moleculares em ecologia e evolução em esponjas. In: XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ), 2012, Salvador. CD de resumos do XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ). Curitiba: Sociedade Brasileira de Zoologia (SBZ), 2012. v. 1. p. 196.

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . CARACTERIZAÇÃO MORFOMÉTRICA ESPICULAR DA ESPONJA PERFURANTE CLIONA CHILENSIS (PORIFERA, DEMOSPONGIAE) NA AMÉRICA DO SUL: UMA ANÁLISE QUANTITATIVA EXTENSIVA EM ESCALA GEOGRÁFICA E GENÉTICA. In: XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ), 2012, Salvador. CD de Resumos do XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ), 2012. v. 1. p. 1630.

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . ESTUDO MOLECULAR DAS RELAÇÕES FILOGENÉTICAS ENTRE OITO GÊNEROS DE ESPONJAS HADROMERIDAS PERFURANTES. In: XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ), 2012, Salvador. CD de Resumos do XXIX Congresso Brasileiro de Zoologia (CBZ). Curitiba: Sociedade Brasileira de Zoologia (SBZ), 2012. v. 1. p. 1645.

• Nogueira, DM ; Oliveira, AM ; Bergallo, HG ; DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. ; Pissinatti, A ; Loiola, SA ; Rosa, LG ; Carvalho, EF . Different pattern of cytochrome oxidase gene subunit II (COII) digested with AluI enzyme to Callithrix species involved in natural hybridization. In: 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia, São Paulo. Programa do 57º Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto - SP: Sociedade Brasileira de Genética (SBG), 2011. v. 1. p. 96-96.

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . UMA INVESTIGAÇÃO PRELIMINAR DAS RELAÇÕES FILOGENÉTICAS ENTRE AS ESPONJAS PERFURANTES HADROMERIDAS UTILIZANDO DADOS MOLECULARES. In: II Workshop para o Desenvolvimento da Taxonomia de Porifera no Brasil, 2010, Rio de Janeiro. Resumos, 2010. p. 20.

• DE PAULA, T. S. ; TASSARA, Y. I. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . CARACTERIZAÇÃO MORFOMÉTRICA ESPICULAR EM TRÊS ESCALAS GEOGRÁFICAS DA ESPONJA PERFURANTE CLIONA CHILENSIS THIELE, 1905 (DEMOSPONGIAE) NA AMÉRICA DO SUL. In: II Workshop para o Desenvolvimento da Taxonomia de Porifera no Brasil, 2010, Rio de Janeiro. Resumos, 2010. p. 21.

• DE PAULA, T. S. ; ZILBERBERG, C. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . Less spicules, more trouble: five cryptic species of the Cliona celata (Porifera, Demospongiae) complex in South America. In: VIII World Sponge Conference, 2010, Girona, Espanha. Book of abstracts of the VIII World Sponge Conference. Girona, Espanha: Centre d'Estudis Avançats de Blanes, 2010. v. 1. p. 42-42.

• DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata na América do Sul: uma abordagem molecular e morfológica para a detecção de espécies crípticas em esponjas bioerosivas. In: I Workshop da Rede Temática Desenvolvimento da Taxonomia de Porifera no Brasil, 2009, Rio de Janeiro. Livro de resumos do I Workshop da Rede Temática Desenvolvimento da Taxonomia de Porifera no Brasil. Rio de Janeiro: Imos, 2009. v. 1. p. 29-29.

• DE PAULA, T. S. ; ZILBERBERG, C. ; AIRES, R. M. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata Grant, 1826, na América do Sul: uma abordagem molecular para a detecção de espécies crípticas em esponjas bioerosivas. In: XXVII Congresso Brasileiro de Zoologia, 2008, Curitiba. LIvro de Resumos - XXVII Congresso Brasileiro de Zoologia, 2008.

• DE PAULA, T. S. ; AIRES, R. M. ; MENEZES, V. L. ; ZILBERBERG, C. ; LOBO-HAJDU, G. . ESPÉCIES CRÍPTICAS EM ESPONJAS BIOEROSIVAS?! EVIDÊNCIAS FAVORÁVEIS COM CONGRUÊNCIA DE DADOS MOLECULARES E MORFOLÓGICOS. In: II Jornada de Zoologia da UNIRIO, 2007, Rio de Janeiro. Livro de Resumos - II Jornanada de Zoologia da UNIRIO, 2007.

• DE PAULA, T. S. ; OLIVEIRA, ABM ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata Grant, 1826 (Porifera, Hadromerida) da costa brasileira pode ser separado em grupos utilizando ITS e COI como marcadores moleculares. In: 52o Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu - PR. Livro de Resumos do 52o Congresso Brasileiro de Genética, 2006.

• DE PAULA, T. S. ; OLIVEIRA, A. B. ; OLIVEIRA, M. P. C. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . O COMPLEXO CLIONA CELATA GRANT, 1826 (PORIFERA, HADROMERIDA) DA COSTA BRASILEIRA PODE SER SEPARADO EM GRUPOS UTILIZANDO ITS E COI COMO MARCADORES MOLECULARES. In: 15a. Semana de Iniciação Científica da Universidade do Estado do Rio de Janeiro, 2006, Rio de Janeiro. 15a. SEMIC - Resumos dos Trabalhos. Rio de Janeiro, 2006. p. 70.

• SANTOS, F. N. ; ABSALÃO, Ricardo Silva ; DE PAULA, T. S. . Novos registros de ocorrência de moluscos marinhos para o Atlântico Sudoeste. In: XIX Encontro Brasileiro de Malacologia, 2005, Rio de Janeiro. Livro de Resumos - XIX Encontro Brasileiro de Malacologia. Rio de Janeiro: EdUERJ, 2005. p. 228-228.

• ABSALÃO, Ricardo Silva ; SILVA, P. H. A. ; DE PAULA, T. S. . Análise morfométrica comparativa de quatro espécies da família Gadilidae (Mollusca, Scaphopoda) no sudoeste do Oceano Atlântico. In: XVIII Encontro Brasileiro de Malacologia, 2003, Rio de Janeiro. Livro de Resumos do XVIII Encontro Brasileiro de Malacologia. Rio de Janeiro: Gráfica UERJ, 2003. p. 95-95.

• DE PAULA, T. S. ; SANTOS, F. N. ; ABSALÃO, Ricardo Silva . Primeiro registro de três moluscos marinhos para a costa brasileira. In: XVIII Encontro Brasileiro de Malacologia, 2003, Rio de Janeiro. Livro de Resumos do XVIII Encontro Brasileiro de Malacologia. Rio de Janeiro: Gráfica UERJ, 2003. p. 191-191.

• DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . 20 ANOS DA PRIMEIRA SEQUÊNCIA DE DNA PUBLICADA DE PORIFERA OU O QUE APRENDEMOS ATÉ AGORA DOS ESTUDOS MOLECULARES EM ECOLOGIA E EVOLUÇÃO EM ESPONJAS. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . CARACTERIZAÇÃO MORFOMÉTRICA ESPICULAR DA ESPONJA PERFURANTE CLIONA CHILENSIS (PORIFERA, DEMOSPONGIAE) NA AMÉRICA DO SUL: UMA ANÁLISE QUANTITATIVA EXTENSIVA EM ESCALA GEOGRÁFICA E GENÉTICA. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . ESTUDO MOLECULAR DAS RELAÇÕES FILOGENÉTICAS ENTRE OITO GÊNEROS DE ESPONJAS HADROMERIDAS PERFURANTES. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata na América do Sul: uma abordagem molecular e morfológica para a detecção de espécies crípticas em esponjas bioerosivas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; ZILBERBERG, C. ; AIRES, R. M. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata Grant, 1826, na América do Sul: uma abordagem molecular para a detecção de espécies crípticas em esponjas bioerosivas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata na América do Sul: uma abordagem molecular para a detecção de espécies crípticas em esponjas bioerosivas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• DE PAULA, T. S. ; AIRES, R. M. ; MENEZES, V. L. ; ZILBERBERG, C. ; LOBO-HAJDU, G. . ESPÉCIES CRÍPTICAS EM ESPONJAS BIOEROSIVAS?! EVIDÊNCIAS FAVORÁVEIS COM CONGRUÊNCIA DE DADOS MOLECULARES E MORFOLÓGICOS. 2007. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; OLIVEIRA, A. B. M. ; OLIVEIRA, M. P. C. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . O COMPLEXO CLIONA CELATA GRANT, 1826 (PORIFERA, HADROMERIDA) DA COSTA BRASILEIRA PODE SER SEPARADO EM GRUPOS UTILIZANDO ITS E COI COMO MARCADORES MOLECULARES. 2006. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DE PAULA, T. S. ; OLIVEIRA, A. B. M. ; HAJDU, E. ; LOBO-HAJDU, G. . O complexo Cliona celata Grant, 1836 (Porifera, Hadromerida) da costa brasileira pode ser separado em grupos utilizando ITS e COI como marcadores moleculares. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTOS, F. N. ; ABSALÃO, Ricardo Silva ; CAETANO, C. H. S. ; DE PAULA, T. S. . Moluscos marinhos da Baía da Ilha Grande, Rio de Janeiro, Resultados Preliminares. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, T. S. ; SANTOS, F. N. ; ABSALÃO, R. S. . Primeiro registro de três moluscos marinhos para a costa brasileira. 2003. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• ABSALÃO, R. S. ; SILVA, P. H. A. ; DE PAULA, T. S. . Análise morfométrica comparativa de quatro espécies da família Gadilidae (Mollusca, Scaphopoda) no sudoeste do Oceano Atlântico. 2003. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Saúde Única do Oceano esponjas, tatuís, anfípodes e tartarugas marinhas como biomonitores de 'poluentes emergentes' no ambiente marinho, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 13/03/2025., Descrição: A presença de poluentes emergentes, como produtos químicos, resíduos plásticos, produtos farmacêuticos (incluindo antibióticos e reguladores endócrinos) e outros contaminantes ambientais em águas residuais e aterros sanitários é uma preocupação crescente. Os antibióticos, em particular, representam uma ameaça significativa devido ao seu papel no surgimento de bactérias resistentes, que contaminam o ambiente e acabam contaminando o oceano. Os resíduos plásticos, especialmente os microplásticos, tornaram-se onipresentes nos ambientes marinhos, causando perturbações ecológicas e ameaçando a vida marinha. O biomonitoramento envolve o uso de organismos que apresentam alterações observáveis, reações morfológicas, bioquímicas ou fisiológicas, em resposta a mudanças ambientais. Consequentemente, qualquer mudança ambiental deve resultar em mudanças no organismo que sejam reproduzíveis e quantificáveis. Espécies marinhas como Chelonia mydas (tartarugas marinhas verdes), esponjas marinhas (Filo Porifera) e Emerita brasiliensis (caranguejos-toupeira, Crustacea) são adequadas para este propósito. Esses organismos habitam regiões costeiras, onde entram em contato com diversos tipos de poluentes dissolvidos provenientes das atividades humanas. O projeto visa identificar, caracterizar e descrever os efeitos de poluentes específicos, bactérias resistentes a antibióticos e microplásticos, no ambiente marinho, utilizando tartarugas, tatuís e esponjas marinhas como bioindicadores. A metagenômica, técnica de recuperação de informações genéticas de amostras ambientais, será empregada para analisar o genoma coletivo de comunidades marinhas. Métodos de biologia molecular e abordagens interdisciplinares são importantes para observar eventos e processos que contribuem para definir, reconhecer e compreender a interação de organismos marinhos com poluentes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (8) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Cláudia M. Moura - Integrante / André R. de Senna - Integrante / Márcia Maria Giesta de Souza - Integrante / Andrea Maria de Oliveira - Integrante / Cid Couto Chaves - Integrante / Beatriz Marcelino Ferreira - Integrante / Fernanda Sobral Short - Integrante / Yasmin Rocha Mattos - Integrante / Bruno Edelenyi Pinto de Almeida - Integrante / Rayane Romão Saad Abude - Integrante / Beatriz Queiroz de Matos - Integrante., Financiador(es): UERJ-SR2 Prociência - Auxílio financeiro.

• 2024 - Atual

  MARseille to RIO: MARine biodiversity under global change scenaRIOs (MARRIO), Descrição: Mitigating the effects of climate change on socio-ecosystems and protecting biodiversity are the major challenges of the coming decades. Associated with strong ethical arguments, the provision of ecosystem services to humanity constitutes a powerful communication tool to convince the citizens of the world of the need to preserve nature. Therefore, global change in the ocean is the main frame of this international collaborative project. This includes climate change, bioinvasions and local changes caused by pollution. Our objectives are to (1) Provide large-scale marine biodiversity baselines and highlight long-term changes (up to 150 years) to understand evolutionary trajectories in the current context of global change; (2) Compare the responses of Mediterranean, Caribbean and South Atlantic organisms to global change to understand the mechanisms driving changes in biodiversity; (3) Describe bioinvasions in/between the Mediterranean Sea and the South Atlantic Ocean, deciphering the mechanisms that explain their success; (4) Demonstrate unknown/underestimated marine ecosystem services to better convince of the interdependence of ocean and mankind; (5) Convince the general public and decision-makers that it is still possible to stop the catastrophic human-caused damage to the ocea. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (15) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Carla Zilberberg - Integrante / Michelle Regina Lemos Klautau - Integrante / Cristiano Lazoski - Integrante / Thierry Pérez - Coordenador / Pierre Chevaldonné - Integrante / Gisele Lôbo Hajdu - Integrante / Charlotte Simmler - Integrante / Stéphane Greff - Integrante / Christophe Lejeusne - Integrante / Marinella Laport - Integrante / Antônio Mateo Solé-Cava - Integrante.

• 2024 - Atual

  Evolução das regiões intergênicas do DNA mitocondrial das esponjas marinhas da Ordem Clionaida, Descrição: A mitocôndria é uma organela citoplasmática relacionada com a produção de energia nas células heterotróficas, utilizando-se do transporte de elétrons acoplado com reações de fosforilação oxidativa para gerar ATP. O DNA mitocondrial (DNAmit) dos bilatérios, de forma geral, não possuem regiões intrônicas em seus genes, e as regiões intergênicas (IGRs) são extremanente reduzidas ou ausentes. Contudo, o DNAmit das esponjas (Filo Porifera), em contraste ao encontrado nos animais bilatérios, pode apresentar genes adicionais, RNAs ribossomais maiores e longas IGRs; características supostamente intermediárias ao dos bilatérios e de outros opistocontes não-metazoários. As IGRs das esponjas podem ainda abrigar elementos repetitivos formadores de grampos (RHE), que muito provavelmente invadiram o genoma mitocondrial das esponjas múltiplas vezes ao longo de sua evolução. Contudo, ainda há poucas sequências disponíveis de genomas mitocondriais de poriferos para examinar a grande variação de tamanho e organização desses DNAmit sob contextos evolutivos específicos. O objetivo deste projeto é investigar a evolução das IGRs das esponjas marinhas em uma escala filogenética familiar, para que, desta forma, seja possível avaliar os efeitos dos eventos de diversificação sobre o tamanho e organização do genoma organelar desses metazoários. Para tal, três regiões intergênicas do DNAmit das esponjas da Ordem Clionaida serão amplificadas, sequenciadas, anotadas e utilizadas em análises comparativas, tendo como base relações filogenéticas reconstruídas a partir de sequências do gene do rRNA 28S.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador.

• 2022 - 2024

  Evolução das regiões intergênicas do DNA mitocondrial das esponjas marinhas da Ordem Clionaida, Descrição: A mitocôndria é uma organela citoplasmática relacionada com a produção de energia nas células heterotróficas, utilizando-se do transporte de elétrons acoplado com reações de fosforilação oxidativa para gerar ATP. O DNA mitocondrial (DNAmit) dos bilatérios, de forma geral, não possuem regiões intrônicas em seus genes, e as regiões intergênicas (IGRs) são extremanente reduzidas ou ausentes. Contudo, o DNAmit das esponjas (Filo Porifera), em contraste ao encontrado nos animais bilatérios, pode apresentar genes adicionais, RNAs ribossomais maiores e longas IGRs; características supostamente intermediárias ao dos bilatérios e de outros opistocontes não-metazoários. As IGRs das esponjas podem ainda abrigar elementos repetitivos formadores de grampos (RHE), que muito provavelmente invadiram o genoma mitocondrial das esponjas múltiplas vezes ao longo de sua evolução. Contudo, ainda há poucas sequências disponíveis de genomas mitocondriais de poriferos para examinar a grande variação de tamanho e organização desses DNAmit sob contextos evolutivos específicos. O objetivo deste projeto é investigar a evolução das IGRs das esponjas marinhas em uma escala filogenética familiar, para que, desta forma, seja possível avaliar os efeitos dos eventos de diversificação sobre o tamanho e organização do genoma organelar desses metazoários. Para tal, três regiões intergênicas do DNAmit das esponjas da Ordem Clionaida serão amplificadas, sequenciadas, anotadas e utilizadas em análises comparativas, tendo como base relações filogenéticas reconstruídas a partir de sequências do gene do rRNA 28S.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2021 - 2024

  Saúde Única do Oceano - esponjas e tartarugas marinhas como biomonitores de 'poluentes emergentes', Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/06/2022., Descrição: O conhecimento da variabilidade dos organismos marinhos que vivem no fundo do mar, tem sido objeto de muitos estudos, mas o oceano tem sofrido com as atividades humanas. Grande parte da população humana vive próxima do oceano; nossos rios, esgotos domésticos, resíduos da agricultura e pecuária e das indústrias são despejados no mar. As atividades de exploração de recursos naturais, como a exploração do petróleo, também são responsáveis por poluição. Mas o que acontece com um animal marinho quando ele encontra a tampinha da garrafa pet que eu deixei cair na minha rua? Como o surgimento de bactérias resistentes a antibióticos tem relação com a poluição do oceano? Como a poluição do oceano afeta a vida de uma família na cidade grande? Alimentos vindos do mar, como peixes, crustáceos, moluscos (polvo, lula), acabam se contaminando com muitos poluentes perigosos! Vamos conversar como a pesquisa pode alertar sobre a poluição do oceano e como esse assunto é importante na nossa vida. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Júlio César Fernandez - Integrante / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Márcia Maria Giesta de Souza - Integrante / Gisele Lôbo Hajdu - Coordenador / FORTUNATO, HUMBERTO F. M. - Integrante / Hudson Carvalho Ferreira - Integrante / Andrea Maria de Oliveira - Integrante., Financiador(es): UERJ-SR2 Prociência - Bolsa.

• 2020 - 2022

  Evolução das regiões intergênicas do DNA mitocondrial das esponjas marinhas da Ordem Clionaida, Descrição: A mitocôndria é uma organela citoplasmática relacionada com a produção de energia nas células heterotróficas, utilizando-se do transporte de elétrons acoplado com reações de fosforilação oxidativa para gerar ATP. O DNA mitocondrial (DNAmit) dos bilatérios, de forma geral, não possuem regiões intrônicas em seus genes, e as regiões intergênicas (IGRs) são extremanente reduzidas ou ausentes. Contudo, o DNAmit das esponjas (Filo Porifera), em contraste ao encontrado nos animais bilatérios, pode apresentar genes adicionais, RNAs ribossomais maiores e longas IGRs; características supostamente intermediárias ao dos bilatérios e de outros opistocontes não-metazoários. As IGRs das esponjas podem ainda abrigar elementos repetitivos formadores de grampos (RHE), que muito provavelmente invadiram o genoma mitocondrial das esponjas múltiplas vezes ao longo de sua evolução. Contudo, ainda há poucas sequências disponíveis de genomas mitocondriais de poriferos para examinar a grande variação de tamanho e organização desses DNAmit sob contextos evolutivos específicos. O objetivo deste projeto é investigar a evolução das IGRs das esponjas marinhas em uma escala filogenética familiar, para que, desta forma, seja possível avaliar os efeitos dos eventos de diversificação sobre o tamanho e organização do genoma organelar desses metazoários. Para tal, três regiões intergênicas do DNAmit das esponjas da Ordem Clionaida serão amplificadas, sequenciadas, anotadas e utilizadas em análises comparativas, tendo como base relações filogenéticas reconstruídas a partir de sequências do gene do rRNA 28S.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador., Financiador(es): Universidade do Estado do Rio de Janeiro - Bolsa.

• 2018 - 2021

  Biodiversidade e conectividade de esponjas marinhas com distribuição ao longo do Golfo do México, Mar do Caribe e Oceano Atlântico Tropical: integração de caracteres genéticos, morfológicos e químicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/06/2022., Descrição: O conhecimento da diversidade de invertebrados marinhos tem sido objeto de muitos estudos anteriores, porém esse conhecimento é baseado principalmente em dados morfológicos e só esporadicamente complementado por abordagens moleculares. A taxonomia de muitos desses grupos é notoriamente difícil devido à morfologia e anatomia relativamente simples, e em muitos casos convergentes, grande plasticidade fenotípica, dificuldade de coleta, ampla distribuição geográfica, entre outros. A comparação de seqüências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Seqüências de marcadores moleculares, organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, identificação de espécies crípticas, conservação, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, análise de híbridos e determinação de espécies parentais, estudos taxonômicos e filogenéticos, entre outros. O projeto propõe o levantamento de parte da biodiversidade de alguns grupos de Porifera marinhos distribuídos ao longo da costa brasileira. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Márcia Maria Giesta de Souza - Integrante / FORTUNATO, HUMBERTO F. M. - Integrante / Roberto Lourenço da Silva - Integrante., Financiador(es): UERJ-SR2 Prociência - Bolsa.

• 2018 - 2020

  Evolução das regiões intergênicas do DNA mitocondrial das esponjas marinhas da Ordem Clionaida, Descrição: A mitocôndria é uma organela citoplasmática relacionada com a produção de energia nas células heterotróficas, utilizando-se do transporte de elétrons acoplado com reações de fosforilação oxidativa para gerar ATP. O DNA mitocondrial (DNAmit) dos bilatérios, de forma geral, não possuem regiões intrônicas em seus genes, e as regiões intergênicas (IGRs) são extremanente reduzidas ou ausentes. Contudo, o DNAmit das esponjas (Filo Porifera), em contraste ao encontrado nos animais bilatérios, pode apresentar genes adicionais, RNAs ribossomais maiores e longas IGRs; características supostamente intermediárias ao dos bilatérios e de outros opistocontes não-metazoários. As IGRs das esponjas podem ainda abrigar elementos repetitivos formadores de grampos (RHE), que muito provavelmente invadiram o genoma mitocondrial das esponjas múltiplas vezes ao longo de sua evolução. Contudo, ainda há poucas sequências disponíveis de genomas mitocondriais de poriferos para examinar a grande variação de tamanho e organização desses DNAmit sob contextos evolutivos específicos. O objetivo deste projeto é investigar a evolução das IGRs das esponjas marinhas em uma escala filogenética familiar, para que, desta forma, seja possível avaliar os efeitos dos eventos de diversificação sobre o tamanho e organização do genoma organelar desses metazoários. Para tal, três regiões intergênicas do DNAmit das esponjas da Ordem Clionaida serão amplificadas, sequenciadas, anotadas e utilizadas em análises comparativas, tendo como base relações filogenéticas reconstruídas a partir de sequências do gene do rRNA 28S.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador., Financiador(es): Universidade do Estado do Rio de Janeiro - Bolsa.

• 2018 - 2019

  Variação filogenética de regiões intergênicas do genoma mitocondrial de esponjas marinhas da Ordem Clionaida, Descrição: A mitocôndria é uma organela citoplasmática relacionada com a produção de energia nas células heterotróficas, utilizando-se do transporte de elétrons acoplado com reações de fosforilação oxidativa para gerar ATP. O DNA mitocondrial (DNAmit) dos bilatérios, de forma geral, não possuem regiões intrônicas em seus genes, e as regiões intergênicas (IGRs) são extremanente reduzidas ou ausentes. Contudo, o DNAmit das esponjas (Filo Porifera), em contraste ao encontrado nos animais bilatérios, pode apresentar genes adicionais, RNAs ribossomais maiores e longas IGRs; características supostamente intermediárias ao dos bilatérios e de outros opistocontes não-metazoários. As IGRs das esponjas podem ainda abrigar elementos repetitivos formadores de grampos (RHE), que muito provavelmente invadiram o genoma mitocondrial das esponjas múltiplas vezes ao longo de sua evolução. Contudo, ainda há poucas sequências disponíveis de genomas mitocondriais de poriferos para examinar a grande variação de tamanho e organização desses DNAmit sob contextos evolutivos específicos. O objetivo deste projeto é investigar a evolução das IGRs das esponjas marinhas em uma escala filogenética familiar, para que, desta forma, seja possível avaliar os efeitos dos eventos de diversificação sobre o tamanho e organização do genoma organelar desses metazoários. Para tal, três regiões intergênicas do DNAmit das esponjas da Ordem Clionaida serão amplificadas, sequenciadas, anotadas e utilizadas em análises comparativas, tendo como base relações filogenéticas reconstruídas a partir de sequências do gene do rRNA 28S.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2020

  Laboratoire International Associé (LIA), «MARRIO 2», Patrons de biodiversité et chimiodiversité marine de la MARtinique à RIO de Janeiro: biologie et écologie des éponges, Descrição: A ecologia química marinha pode trazer sua contribuição para a compreensão dos processos ecológicos que regem a organização e o funcionamento dos ecossistemas marinhos. No entanto, as moléculas produzidas pelos organismos marinhos têm sido estudadas principalmente por sua atividade biológica e por suas possíveis aplicações nesse campo. As funções mais estudadas são aquelas de defesa contra predadores, organismos oportunistas incrustantes e microrganismos patogênicos. Há ainda muito o que aprender sobre as funções dos mediadores químicos no âmbito dos ecossistemas marinhos, sobre as modalidades de transmissão da informação química, eventualmente à distância, ou da ação sobre o comportamento e/ou a fisiologia de outros organismos.Tratar-se-à de determinar o papel dos metabólitos secundários expulsos pelos organismos sésseis na estruturação e no funcionamento dos ecossistemas bentônicos. De maneira mais particular, haverá a tentativa de determinar se o ?panorama químico? condicionado por uma comunidade bentônica, pode influenciar o comportamento da fauna vágil, e ainda determinar como uma modificação da biodiversidade das esponjas pode afetar o funcionamento dessa mediação química. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Integrante / Michelle Regina Lemos Klautau - Integrante / André R. de Senna - Integrante / Thierry Pérez - Coordenador / Eduardo Leal Esteves - Integrante / Júlio César Fernandez - Integrante / Humberto F. M. Fortunato - Integrante / Beatriz Grosso Fleury - Integrante / Hudson Carvalho Ferreira - Integrante / Fábio Vieira de Araújo - Integrante.

• 2015 - 2018

  Biologia integrativa e biodiversidade marinha: conectividade, espécies crípticas e plasticidade fenotípica, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/06/2022., Descrição: O conhecimento da diversidade de invertebrados marinhos tem sido objeto de muitos estudos anteriores, porém esse conhecimento é baseado principalmente em dados morfológicos e só esporadicamente complementado por abordagens moleculares. A taxonomia de muitos desses grupos é notoriamente difícil devido à morfologia e anatomia relativamente simples, e em muitos casos convergentes, grande plasticidade fenotípica, dificuldade de coleta, ampla distribuição geográfica, entre outros. A comparação de seqüências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Seqüências de marcadores moleculares, organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, identificação de espécies crípticas, conservação, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, análise de híbridos e determinação de espécies parentais, estudos taxonômicos e filogenéticos, entre outros. O projeto propõe o levantamento de parte da biodiversidade de alguns grupos de Porifera marinhos distribuídos ao longo da costa brasileira. Pretendemos explorar o primeiro banco de DNA do Brasil de espécies de esponjas marinhas, gerar/construir hipóteses filogenéticas das relações dos gêneros e famílias assinaladas para a subordem Mycalina, Ordem Poecilosclerida, Filo Porifera e identificar espécies crípticas de cinco esponjas abundantes da costa brasileira: Amphimedon viridis, Cliona celata, Dragmacidon reticulatum, e Mycale microsigmatosa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Rafaela Magalhães Aires - Integrante / Thomáz Vieiralves - Integrante / Júlio César Fernandez - Integrante / FORTUNATO, HUMBERTO F. M. - Integrante / Hudson Carvalho Ferreira - Integrante / Roberto Lourenço da Silva - Integrante., Financiador(es): UERJ-SR2 Prociência - Bolsa.

• 2013 - 2016

  Laboratoire International Associé (LIA), «MARRIO», Patrons de biodiversité et chimiodiversité marine de la MARtinique à RIO de Janeiro: les éponges comme modèle d?étude, Descrição: Este projeto permitirá o desenvolvimento das atividades científicas do Laboratório Internacional Associado (LIA) MARRIO, criado por iniciativa do CNRS (IMBE) e da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Esse LIA é formado por uma equipe de especialistas em sistemática, biologia e ecologia evolutiva de esponjas, reconhecidos mundialmente pela sua competência. Assim, tornamos agora institucional uma antiga colaboração, responsável pela formação do grupo brasileiro de esponjólogos. O grupo brasileiro é atualmente um dos mais produtivos do mundo no estudo de esponjas e tem muita similaridade, mas também complementaridade com o grupo francês. Em comparação com as colaborações anteriores, este projeto de LIA é claramente interdisciplinar, combinando duas equipes de químicos especialistas em produtos naturais marinhos e em metabolômica marinha e de esponjas. Esse consórcio permitirá a continuação dos esforços que visam promover a taxonomia integrativa e ecologia química marinha. Os participantes do LIA pretendem desenvolver aspectos teóricos e práticos do estudo da biologia de organismos marinhos, ecologia evolutiva, ecologia química e química de produtos naturais marinhos, tendo as esponjas como modelo. Trata-se também de enfrentar novos desafios relativos à evolução das classificações, aos avanços nos estudos de filogenia dos metazoários e, particularmente, das mudanças constantes da sistemática de esponjas. Nenhum laboratório marinho do CNRS é formalmente instalado no Atlântico Ocidental Tropical, onde será desenvolvido o presente projeto. Além disso, embora o laboratório proponente do CNRS (IMBE) já tenha desenvolvido numerosos trabalhos científicos, nenhum deles é relacionado ao ambiente marinho (Martinica). O LIA é, portanto, uma forma de se consolidar a posição do CNRS no meio marinho nessa parte do mundo, a partir de uma sólida rede de colaboradores. Objetiva-se então fazer a partir de um pólo franco-brasileiro, a força maior desse espaço marinho para o estudo de padrões de biodiversidade entre o Atlântico Sul e o Caribe. Este projeto fornecerá um ambiente científico de alto nível para estudantes e gestores ambientais envolvidos no projeto científico ou nas diferentes atividades pedagógicas planejadas, com a finalidade de preparar a geração de amanhã. As aulas e workshops previstos permitirão que os especialistas acompanhem os trabalhos dos participantes, sejam eles trabalhos de pesquisa científica ou estratégias de gestão do meio marinho. De acordo com as nossas experiências anteriores, é esperado que as reuniões regulares de biólogos, ecólogos e químicos criem um dinâmica que levará à criação de vários outros programas de pesquisa internacionais. O programa de pesquisa proposto visa melhorar o conhecimento da biodiversidade de esponjas marinhas do Caribe, a partir da exploração de ambientes relativamente desconhecidos: cavernas submarinas e montes submarinos. Esses ambientes permitem que se teste os efeitos de diferentes níveis de fragmentação do habitat na estruturação de populações ou seu grau de conectividade e suas conseqüências evolutivas nas populações e nos fenômenos de especiação. Além disso, os conhecimentos adquiridos com o LIA destinam-se a ser compartilhados com gestores ambientais, de forma a promover a criação de áreas marinhas protegidas em regiões de alto endemismo. Finalmente, um produto importante do LIA será também a criação de um banco de dados colaborativo acessível aos promotores do projeto e também ao público em geral (mergulhadores, professores, gestores etc.). O projeto é coordenado por Michelle Klautau pelo lado brasileiro e por Thierry Pérez pelo lado Francês. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Integrante / Eduardo Carlos Meduna Hajdu - Integrante / Michelle Regina Lemos Klautau - Coordenador.

• 2013 - 2015

  Caracterização genética de tartarugas marinhas e de hepesvirus quelonídeo associados a tumores no âmbito do Projeto Promontar - Angra, Descrição: No contexto da conservação das tartarugas marinhas no Brasil, se encontra em fase de implementaçao o Projeto PROMONTAR - ANGRA, que constitui um Programa de Monitoramento de Ocorrências de Tartarugas Marinhas na Área de Influência das Usinas Nucleares de Angra dos Reis. Dentre as diversas atividades a serem implementadas ao longo do desenvolvimento do Projeto PROMONTAR - ANGRA serão coletados dados biológicos a cerca dos indivíduos de tartarugas marinhas analisadas, que incluem: 1) registros fotográficos; 2) biometria; 3) análise da condição de saúde física corporal; 4) coleta de material sanguíneo; 5) prevalência de fibropapilomatose e biopsia dos tumores; 6) necropsia e coleta de conteúdo estomacal. Sendo assim, no âmbito do desenvolvimento do Projeto PROMONTAR ANGRA, este projeto de pesquisa visa a caraterização genética das tartarugas marinhas encontradas na área de influência da Central Nuclear Almirante Álvaro Alberto (CNAAA) no Município de Angra dos Reis - RJ. Para isso, dois tipos de marcadores moleculares serão utilizados: a região controle (LCR) do DNA mitocondrial (DNAmt) e microssatélites (STR's). Adicionalmente, este projeto visa examinar as variantes virais do herpesvirus associado a fibropapilomas de tartarugas (FPTHV) presentes nos tumores encontrados nas tartarugas marinhas e estimar a prevalência do herpesvirus em indivíduos saudáveis, além do estabelecimento de padrões filogeográficos de disseminação do herpesvirus nas tartarugas encontradas na região. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Rafaela Magalhães Aires - Integrante / Humberto Mas Gitirana - Integrante.

• 2012 - 2015

  Identificação Molecular da Biodiversidade: espécies crípticas e variabilidade populacional em Porifera, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gisele Lôbo Hajdu em 22/06/2022., Descrição: A perda de biodiversidade está ocorrendo em diversos níveis e apenas uma pequena fração das espécies já descritas foi analisada com vistas a levantamentos de sua diversidade genética ou molecular. A informação fundamental de uma espécie é aquela contida em seu genoma, sendo a estocagem de amostras em bancos de DNA uma forma de preservação da diversidade biológica. Entretanto, pouco esforço tem sido feito no sentido de coletar e documentar amostras de DNA como recursos genéticos. O conhecimento da diversidade de invertebrados marinhos tem sido objeto de muitos estudos anteriores, porém esse conhecimento é baseado principalmente em dados morfológicos e só esporadicamente complementado por abordagens moleculares. A taxonomia de muitos desses grupos é notoriamente difícil devido à morfologia e anatomia relativamente simples, e em muitos casos convergentes, grande plasticidade fenotípica, dificuldade de coleta, ampla distribuição geográfica, entre outros. A comparação de seqüências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Seqüências de marcadores moleculares, organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, identificação de espécies crípticas, conservação, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, análise de híbridos e determinação de espécies parentais, estudos taxonômicos e filogenéticos, entre outros. O projeto propõe o levantamento de parte da biodiversidade de alguns grupos de Porifera marinhos distribuídos ao longo da costa brasileira. Pretendemos explorar o primeiro banco de DNA do Brasil de espécies de esponjas marinhas, gerar/construir hipóteses filogenéticas das relações dos gêneros e famílias assinaladas para a subordem Mycalina, Ordem Poecilosclerida, Filo Porifera e identificar espécies crípticas de cinco esponjas abundantes da costa brasileira: Amphimedon viridis, Cliona celata, Dragmacidon reticulatum, Mycale microsigmatosa e Tedania ignis.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Thomáz Vieiralves - Integrante / Bruno Cosme - Integrante / Melanie Lopes da Silva - Integrante / Larissa Lima Morgado - Integrante / Valeria Aguiar Mello de Sousa - Integrante / Márcia Maria Giesta de Souza - Integrante / Gisele Lôbo Hajdu - Coordenador / FORTUNATO, HUMBERTO F. M. - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2014

  PorToL (The Porifera Tree of Life) Brasil - Árvore da vida das esponjas brasileiras, Parte II: identificação molecular com COI, Descrição: A comparação de sequências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Sequências de marcadores moleculares que permitam a identificação de espécies são denominadas de código-de-barras de DNA e tem por pretensão utilizar o gene codificante da subunidade I da citocromo c oxidase (COI) para a identificação de grupos animais. O objetivo principal deste projeto é explorar o banco de DNA de espécies de esponjas marinhas do Brasil e desenvolver ferramentas para a detecção de variabilidade genética, contribuindo para a construção de uma árvore da vida das esponjas marinhas brasileiras. Sequências de código-de-barras de DNA organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, conservação, identificação de espécies crípticas, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, desenvolvimento de sondas de DNA, estudos taxonômicos e filogenéticos, ecofisiológicos, forenses, entre outros. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2014

  Rede Brasileira de Identificação Molecular de Organismos Marinhos, Edital MCT/CNPq/FNDCT Nº 50/2010, Identificação Molecular da Biodiversidade, Processo no. 564945/2010-2, Descrição: O projeto propõe o levantamento de parte da biodiversidade de alguns grupos de organismos eucarióticos marinhos distribuídos ao longo da costa brasileira. Para tanto, será utilizada a técnica de DNA barcoding , complementada com dados de morfologia e de distribuição geográfica. Esses dados serão integrados aos obtidos nos demais projetos compõem a Rede, para a produção de bancos de dados e de amostras preservadas em coleções (ex. museus e herbários). O conhecimento da diversidade de organismos marinhos tem sido objeto de muitos estudos anteriores, porém esse conhecimento é baseado principalmente em dados morfológicos e só esporadicamente complementado por abordagens moleculares. A taxonomia de muitos desses grupos é notoriamente difícil devido à morfologia e anatomia relativamente simples, e em muitos casos convergentes, grande plasticidade fenotípica e alternância de gerações heteromórficas, dificuldade de coleta, ampla distribuição geográfica, entre outros. A comparação de sequências de DNA tem sido fundamental para estudos de biodiversidade e de filogenia. Sequências de marcadores moleculares que permitam a identificação de espécies são denominadas de DNA barcodes . Sequências de DNA barcodes , organizadas e disponíveis em bancos eletrônicos podem servir de base para um amplo espectro de estudos que incluem levantamentos de biodiversidade, conservação, identificação de espécies crípticas, detecção de espécies exóticas e/ou ameaçadas de extinção, desenvolvimento de sondas de DNA, estudos taxonômicos e filogenéticos, ecofisiológicos, forenses, entre outros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Thomáz Vieiralves - Integrante / Melanie Lopes da Silva - Integrante / Mariana Cabral de Oliveira - Integrante.

• 2010 - 2011

  PorToL (The Porifera Tree of Life) Brasil - Árvore da vida das esponjas brasileiras, Parte I: 28S e COI, Auxílio à Pesquisa, APQ1 FAPERJ, Processo no. E-26/110.260/2010, Descrição: A informação fundamental de uma espécie é aquela contida em seu genoma. A estocagem de amostras em bancos de DNA é uma forma de preservação da diversidade biológica. Entretanto, pouco esforço tem sido feito no sentido de coletar e documentar amostras de DNA como recursos genéticos. No Brasil existem diversos bancos de DNA de espécies brasileiras, principalmente voltado para espécies endêmicas e ameaçadas de extinção. O objetivo principal deste projeto é implantar e explorar o primeiro banco de DNA do Brasil de espécies de esponjas marinhas e gerar/construir hipóteses filogenéticas das relações dos gêneros e famílias assinaladas para a subordem Mycalina, Ordem Poecilosclerida. Pretendemos promover o estudo em detalhe desses genomas, desenvolver ferramentas para detecção de variabilidade genética e contribuir para a construção de uma árvore da vida das esponjas marinhas brasileiras. Auxílio à Pesquisa APQ1 FAPERJ; Proc E-26/110.260/2010.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Robert W. Thacker - Integrante / Thomáz Vieiralves - Integrante / Eduardo Carlos Meduna Hajdu - Integrante / Bruno Cosme - Integrante / Yuri Isidoro Tassara - Integrante / Melanie Lopes da Silva - Integrante., Financiador(es): National Science Foundation - Cooperação / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2013

  Evolução em três níveis: Filogenia molecular, evolução de caracteres, e filogeografia de Mycale Gray, 1867 (Demospongia: Poecilosclerida) do Atlântico, Descrição: Dados morfológicos, basicamente da morfologia das espículas, são amplamente utilizados para gerar hipóteses sobre taxonomia, filogenia e biogeografia das esponjas marinhas (Porifera). Contudo, sabe se que muitos desses dados podem sofrer considerável plasticidade fenotípica, e dessa forma, tais análises estariam sujeitas a um potencial erro. Como o conhecimento sobre os processos de desenvolvimento desses dados morfológicos é ínfimo, atribuir homologias a várias categorias criadas pela sistemática tradicional é discutível, se não, errôneo. E tendo como base apenas a morfologia para reconstruir as relações filogenéticas desse grupo, a fim de determinar a homologia desses caracteres, estaríamos ocorrendo em uma tautologia. Assim, de forma a estabelecer relações filogenéticas independentes dos caracteres morfológicos, é proposto o uso de marcadores moleculares com o intuito de inferir uma filogenia robusta para o grupo; e, assumindo tal reconstrução, testar a homologia dos caracteres morfológicos utilizados hoje na sistemática de gênero Mycale Gray, 1867 (Porifera: Demospongiae: Poecilosclerida). Serão utilizados os genes 18S e 28S do RNA ribossomal (RNAr) nuclear como marcadores moleculares supra-específicos, os quais têm gerado bons resultados para esponjas na literatura. Ainda, a fim de avaliar as hipóteses biogeográficas existentes para esse grupo, tomaremos como exemplo Mycale (Carmia) microsigmatosa para estabelecer uma filogeografia para a costa do Brasil. Dessa forma, será possível inferir dados sobre seu tamanho populacional, dispersão e fluxo gênico, além de seu centro de origem, o que permitirá comparações com a biogeografia de Mycale. Será utilizado como marcador a região intergênica mitocondrial (RIM), uma região recentemente descoberta no genoma mitocondrial das esponjas, promissora para análises populacionais, e que já vem dando bons resultados em outros trabalhos de nosso grupo. Também serão testados outros marcadores populacionais clássicos em esponjas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Yuri Izidoro Tassara - Integrante / Melanie Lopes da Silva - Integrante / Thiago da Silva Farias - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2009 - 2011

  Variabilidade populacional de Mycale (Zygomycale) angulosa (Duchassaing & Michelotti, 1864) (Porifera, Demospongiae) da costa brasileira, Descrição: O gênero Mycale Gray, 1867 é considerado especioso para esponjas (são 228 espécies válidas, distribuídas entre 11 subgêneros), sendo sua história taxonômica problemática. A dinâmica e estrutura populacional das espécies, dispersão, fluxo gênico e histórias de expansão das Mycale do Atlântico são desconhecidas. A avaliação desses parâmetros populacionais poderá elucidar a história evolutiva desses organismos e das áreas que habitam. Usaremos como modelo a espécie Mycale (Zygomycale) angulosa (Duchassaing & Michelotti, 1864), bem representada na costa Atlântica da América do Sul e Central. Nesse trabalho utilizaremos seqüências polimórficas de DNA como caracteres adicionais aos morfológicos para comparar populações de M. (Z.) angulosa da costa brasileira. A regiões gênicas do genoma mitocondrial escolhidas para abordar a variabilidade genética destas espécies de esponjas são o gene codificante da subunidade I da citocromo c oxidase (COI ou cox1) do genoma mitocondrial (altamente variável entre as esponjas) e os espaçadores internos transcritos (ITS1 e ITS2) do RNA ribossomal (RNAr) nuclear. Projeto de TCC de Bacharel em Ciências Biológicas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador / Gisele Lobo Hajdu - Integrante / Bruno Cosme - Integrante / Thiago da Silva Farias - Integrante.

• 2008 - 2013

  PorToL - The Porifera Tree of Life Project (Assembling the Tree of Life Program), Descrição: Sponges are among the earliest diverging metazoans and, despite being common residents of benthic habitats worldwide, they are relatively understudied. Phylum Porifera contains 8,122 valid species with an estimated 4,000 awaiting discovery and/or description. They are classified in three classes, 25 orders, 127 families and 680 genera. The ancient origin, simple body organization, close microbial associations and morphological plasticity of sponges make them one of the most challenging groups in animal systematics. Reflecting these difficulties, phylogenetic relationships within Porifera remain mostly unresolved. In particular, the monophyly of the phylum and its largest class, Demospongiae, has been questioned, as well as the relationships among its major lineages. The lack of a robust phylogenetic hypothesis for this phylum hampers progress in basic studies of sponge biology and biodiversity, including comparative evolutionary studies that employ sponge species as model organisms and efforts to conserve or economically exploit sponges. The goal of our team is to provide a phylogenetic context that will improve the understanding of all aspects of sponge biology. We will establish robust phylogenetic relationships among sponges at three hierarchical levels, pursuing five specific objectives: 1. Assess the monophyly and resolve the branching order of the major, Tier 1, lineages (corresponding roughly to orders and suborders) of Demospongiae, Hexactinellida and Calcarea; 2. Reconstruct Tier 2 (corresponding to interfamilial) relationships and character evolution within each major clade; 3. Explore Tier 3 (roughly intergeneric) relationships within Tier 2 clades by providing a community sequencing service; 4. Develop an Internet-accessible database (PorToL: The Porifera Tree of Life Project) that will allow sponge biologists to share biodiversity, phylogenetic and non-molecular data with the wider scientific community and the general public; 5. Create and enhance outre. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Integrante / Robert W. Thacker - Coordenador., Financiador(es): National Science Foundation - Cooperação.

• 2008 - 2012

  Filogenia de Mycalina Hajdu, Van Soest & Hooper, 1994 (Poecilosclerida, Demospongiae): dados morfológicos e moleculares, Descrição: Poecilosclerida é a maior e mais diversificada ordem de Demospongiae. A subordem Mycalina abriga nove famílias e 30 gêneros sendo definida como uma Poecilosclerida que possui quelas palmadas, megascleras lisas de um único tipo e sigmas. A arquitetura do esqueleto é de plumosa a plumoreticulada. A constituição taxonômica desta subordem não é universalmente aceita. Dentre os principais pontos de divergência, está a família Isodictyidae Dendy, 1924, antes alocada na ordem Haplosclerida, e que foi movida para Mycalina, com base na arquitetura esquelética. A mais recente revisão do grupo segue a proposta mencionada, com dúvidas e ressalvas, recomendando uma análise mais extensiva dos caracteres e táxons. Além desta, as relações entre as outras famílias da referida subordem, particularmente Desmacellidae, Esperiopsidae e Podospongiidae, permanecem inconsistentes. No filo Porifera existem dificuldades de delimitar caracteres homólogos, quase sempre de variação contínua. Neste projeto, seqüências do gene nuclear para o RNA ribossomal (RNAr) 28S e da subunidade I da citocromo c oxidase (COI) do genoma mitocondrial serão utilizados como caracteres adicionais na construção de filogenias. Projeto de Tese de Doutorado do PPGEE.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador / Bruno Cosme - Integrante / Yuri Isidoro Tassara - Integrante / Thiago da Silva Farias - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2007 - 2009

  Banco de DNA e identificação taxonômica de esponjas marinhas do Brasil com código-de-barras de DNA, Descrição: Banco de DNA e identificação taxonômica de esponjas marinhas do Brasil com código-de-barras de DNA - Edital MCT/CNPq 15/2007 - Universal - Faixa A. Processo: 481077/2007-3. 2007. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Gisele Lobo Hajdu - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2004 - 2006

  RAP da Ilha Grande: estudo faunístico de moluscos marinhos do substrato não consolidado, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Ricardo Silva Absalão - Coordenador.

• 2003 - 2005

  Taxonomia de bivalves protobrânquios de águas profundas da Bacia de Campos, Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Ricardo Silva Absalão - Coordenador.

• 2002 - 2004

  Morfometria da concha de moluscos escafópodes como ferramenta de identificação taxonômica, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Integrante / Ricardo Silva Absalão - Coordenador.

Projetos de desenvolvimento

• 2022 - Atual

  Plataforma Genômica do PHLC/IBRAG: adequação de infraestrutura para recebimento e operacionalização de novos equipamentos MULTIUSUÁRIOS, Descrição: PROGRAMA DE APOIO À COMPRA OU MANUTENÇÃO DE EQUIPAMENTOS E À PEQUENAS REFORMAS (PROINFRA UERJ 2021 ? no 01/2021. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Thiago Silva de Paula - Coordenador / Marcelo Aguiar Costa Lima - Integrante / Gisele Lôbo Hajdu - Integrante / Cíntia Barros Santos Rebouças - Integrante / Adriana Helena de Oliveira Reis - Integrante / Anderson Vilasboa de Vasconcellos - Integrante / Andrea Carla de Souza Góes - Integrante / Clarissa Coimbra Canedo - Integrante / Haydée Andrade Cunha - Integrante / Jaqueline Gusmão da Silva - Integrante / Karina Alessandra Morelli - Integrante / Márcia Mattos Gonçalves Pimentel - Integrante., Financiador(es): Universidade do Estado do Rio de Janeiro - Auxílio financeiro.

Prêmios