Augusto Fernandes Vellozo
possui graduação em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (1989), doutorado em Ciência da Computação pela Universidade de São Paulo (2007) e pós-doutorado em bioinformática na Université Lyon I (2007-2010) e EMBRAPA (2011). Tem experiência na área de Ciência da Computação, atuando principalmente nos seguintes temas: alinhamento de sequências, biologia computacional, programação dinâmica, redes metabólicas, sistemas de anotação e árvores de sufixos. Atualmente é líder da área de pesquisa aplicada na Tecsinapse.
Informações coletadas do Lattes em 15/02/2026
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Ciencia da Computacao
2001 - 2007
Universidade de São Paulo
Título: Alinhamento de seqüências com rearranjos
Alair Pereira do Lago. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: alignment; alignment with inversions; bioinformatics; computational biology; dynamic programming; sequence alignment. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação.
Especialização em Informática e Sistemas de Informação
1997 - 1998
Universidade de Sorocaba
Título: Banco de dados orientado a objetos
Especialização em Administração de marketing
1995 - 1996
Universidade de Sorocaba
Título: Marketing em pequenas empresas
Pós-doutorado
2012 - 2013
Pós-Doutorado. , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
2009 - 2010
Pós-Doutorado. , Université Claude Bernarde Lyon 1, LYON I, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação.
2008 - 2009
Pós-Doutorado. , Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, INSA LYON, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2007 - 2008
Pós-Doutorado. , Université Claude Bernarde Lyon 1, LYON I, França. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística/Especialidade: Análise de Dados.
Participação em eventos
XII Workshop de visão computacional - WVC 2016. P+ : Um produto em desenvolvimento e seus próximos passos. 2016. (Congresso).
JOBIM 2012. co-autor do poster: The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases. 2012. (Congresso).
XMeeting. A new Blast-based Gbrowse Plugin. 2012. (Congresso).
Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l?INRA.co-autor do poster: Using the ?CycADS? annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards ?ArthropodsCyc?. 2011. (Simpósio).
6th ISS Congress.. co-autor do poster: AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database): a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis. 2009. (Congresso).
8th International Symposium on Aphids.co-autor do poster: AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses.. 2009. (Simpósio).
II Pea Aphid Genome Annotation Workshop.The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism.. 2009. (Simpósio).
Metabolic Pathways Analysis 2009. 2009. (Simpósio).
Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons.co-autor do poster: AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses.. 2009. (Simpósio).
BioCyc and Pathway Tools tutorial. 2008. (Oficina).
IPG (Integrative Post-Genomics).Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses. 2008. (Simpósio).
JOBIM 2008. 2008. (Congresso).
Pea Aphid Genome Annotation Workshop I.co-autor do poster: Annotation of metabolism genes: towards the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses. 2008. (Simpósio).
Seminário de Recuperação de Informação.Acelerando algoritmos de programação dinâmica. 2007. (Seminário).
Seminário de Teoria da Computação e Combinatória - IME-SP.Uma floresta de árvores recicladas. 2006. (Seminário).
Seminário Biologia Computacional - IME-USP.Sistema MUMmer para alinhamento de genomas. 2002. (Seminário).
VI Escola de Computação. 1988. (Congresso).
Participação em bancas
Augusto F. Vellozo. Previsão de Produção de Energia Solar. 2020. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Leitura Automática de Placas de Veículos. 2020. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Credit Card Fraud Detection. 2020. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Manutenção de Turbinas. 2019. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Previsão de Preços de Opções na Bolsa de Valores. 2019. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Previsão de preços futuros de ativos utilizando algoritmos preditivos. 2019. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Previsao do Tempo. 2019. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Augusto F. Vellozo. Previsão de Pontuação de Jogadores no CartolaFC. 2019. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciência de dados) - Faculdade de Engenharia de Sorocaba.
Waldir Antonio da Silva; Randal Victor Gibbin;Augusto F. Vellozo. HelpDesk com base na central de serviços das melhores práticas da ITIL. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Uirapuru Superior.
Waldir Antonio da Silva; Randal Victor Gibbin;Augusto F. Vellozo. Sistema ? Exames (On-Line). 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Uirapuru Superior.
Waldir Antonio da Silva; Randal Victor Gibbin;Augusto F. Vellozo. Cyanu ? rede social. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Uirapuru Superior.
Waldir Antonio da Silva; Randal Victor Gibbin;Augusto F. Vellozo. .Sistema de ponto corporativo - SISPONTUAL. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Uirapuru Superior.
Augusto F. Vellozo. 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting. 2012. Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.
Orientou
Sistema de exames OnLine; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Tecnólogo em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Veris - Grupo IBMEC Educacional SA; Orientador: Augusto Fernandes Vellozo;
HelpDesk com base na central de serviços das melhores práticas da ITIL; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Tecnólogo em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Veris - Grupo IBMEC Educacional SA; Orientador: Augusto Fernandes Vellozo;
Produções bibliográficas
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BAA-PUYOULET, PATRICE ; PARISOT, NICOLAS ; FEBVAY, GÉRARD ; HUERTA-CEPAS, JAIME ; VELLOZO, AUGUSTO F. ; GABALDÓN, TONI ; CALEVRO, FEDERICA ; CHARLES, HUBERT ; COLELLA, STEFANO . ArthropodaCyc: a CycADS powered collection of BioCyc databases to analyse and compare metabolism of arthropods. DATABASE-OXFORD , v. 2016, p. baw081, 2016.
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Vellozo, A. F. ; Veron, A. S. ; Baa-Puyoulet, P. ; Huerta-Cepas, J. ; Cottret, L. ; Febvay, G. ; Calevro, F. ; Rahbe, Y. ; Douglas, A. E. ; Gabaldon, T. ; Sagot, M.-F. ; Charles, H. ; Colella, S. . CycADS: an annotation database system to ease the development and update of BioCyc databases. DATABASE-OXFORD , v. 2011, p. bar008-bar008, 2011.
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The International Aphid Genomics Consortium ; Augusto Vellozo . Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum. PLoS Biology (Online) , v. 8, p. e1000313, 2010.
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MINCHILLO, LÁ'S V. ; VELLOZO, AUGUSTO ; BORIN, EDSON ; BORIN, JULIANA F. . Towards better tools and methodologies to teach computational thinking to children. In: XXVI Workshop sobre Educação em Computação, 2018, Natal. Anais do Workshop sobre Educação em Computação (WEI), 2018.
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Augusto F. Vellozo ; carlos e r alves ; Alair Pereira do Lago . Alignment with non-overlapping inversions in {$O(n^ 3)$}-time. In: WABI, 2006, Zurique. Algorithms in Bioinformatics. Berlin / Heidelberg: Springer, 2006. v. 4175. p. 186-196.
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AZEVEDO, E. F. ; Carlos Eduardo Ferreira ; FREIRE, A. S. ; Aritanan Gruber ; Augusto F. Vellozo . Método Exato para Um Problema de Alocação Justa. In: II Encontro de Teoria da Computação, 2017, São Paulo. Anais do II Encontro de Teoria da Computação, 2017.
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carlos e r alves ; Alair Pereira do Lago ; Augusto F. Vellozo . Alignment with non-overlapping inversions in {$O(n^ 3\logn)$}-time. In: GRACO, 2005, Angra dos Reis. Electronic Notes in Discrete Mathematics - Proceedings of GRACO2005. Amsterdam: Elsevier, 2005. v. 19. p. 365-371.
Outras produções
Augusto Vellozo ; Stefano Colella . Cycads - Cyc Annotation Database system. 2009.
Augusto Vellozo ; Stefano Colella . AcypiCyc - Acyrthosiphon pisum Cyc database. 2009. (Base de Dados Cyc).
Projetos de pesquisa
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2009 - 2010
NEMO - Network Motifs, Descrição: The project is organized into 5 tasks: 1. Definition and enumeration of network motifs 2. Realistic random graph models for biological networks 3. Assessing motif exceptionality 4. Network comparison 5. From network motifs to data integration. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Augusto Fernandes Vellozo - Integrante / Marie France Sagot - Coordenador.
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2008 - 2009
MetNet - Systems level analysis of the Pea Aphid, Descrição: From a metabolic perspective, an animal comprises a set of metabolic compartments (including organs) connected by the inter-compartment transfer of metabolites. We seek to construct and analyse multi-compartment models of metabolism, by transforming a single global metabolic network into a set of compartment networks of overlapping composition using flux balance analysis. In parallel, we will develop and apply two computational approaches for network analysis: an exploration of metabolic network motifs, and elementary modes to characterize and compare networks. Large inter-compartment metabolic differences facilitating model development will be achieved in our system comprising two distinct genomes within a single animal: the pea aphid Acyrthosiphon pisum and its symbiotic bacteria Buchnera housed in a special organ, the bacteriome. The first model comprises two compartments, describing how the insect and bacterial networks mediate the transformation of precisely known diet components to yield biomass production (and waste); and subsequent models are of increasing complexity, involving the subdivision of the insect network into overlapping, but distinct, networks of the contributing compartments/organs. Model construction will be informed by empirical data collected on the aphid transcriptome, Buchnera proteome and embryo nutrient budgets within this project, and the model outputs will be validated against whole-insect metabolic and nutritional datasets obtained previously from the investigators' labs. Algorithms and models developed in this project will be maintained in a central Repository linked to pre-existing databases, suitable for data-sharing within the project and dissemination to the wider community. The outputs will include metabolic network data for a range of insects with well-developed genomic resources.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Augusto Fernandes Vellozo - Integrante / Marie France Sagot - Coordenador., Financiador(es): Agence Nationale de la Recherche - Remuneração.
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2006 - 2007
Computational Biology, Algorithmics, Combinatorial Optimization, Descrição: The research proposed will focus mainly on computational biology. The technological advances in biological related areas of recent years has allowed a huge amount of information to be produced. It is one of the main current challenges for biologists to be able to extract knowledge from all this data, and a challenge also for the computer scientists and mathematicians to participate with the biologists in this process. The analysis of this data involves, among many other issues, the formalization of problems and the search for efficient algorithms to solve them. This is a continuous process in the sense that the solutions produced by the algorithms will usually lead to new research that has for objective refining the models, and will therefore result in new problems and/or the development of increasingly more sophisticated algorithms. The main goal of the association between the HELIX and USP teams is to work on such types of questions: the formalization of problems coming from biology and the search for efficient algorithms to solve these problems.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Augusto Fernandes Vellozo - Integrante / Yoshiko Wakabayashi - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2004 - 2005
Algorithmic Questions on Molecular Biology, Descrição: The research proposed here will mainly focus on computational biology. The technological advances in biology related areas allowed a huge amount of information to be extracted. It is one of the main current challenges for biologists to be able to extract knowledge from all this data and a challenge also for the computer scientists to help the biologists in this process. The analysis of this data involves, among many other issues, the formalization of problems and the search for efficient algorithms to solve these problems. This is a continous process in the sense that the solutions produced by the algorithms will usually lead a refinement of the models and problem formulations, and will therefore require new algorithms. The main goal of this project is to work on these type of questions: the formalization fo problems coming from biology and the search for efficient algorithms for these problems. http://www.ime.usp.br/~cris/inria/. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Augusto Fernandes Vellozo - Integrante / Carlos Eduardo Ferreira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Histórico profissional
Experiência profissional
2015 - Atual
Tecsinapse Tecnologia da InformacãoVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Líder de pesquisa aplicada, Carga horária: 40
Atividades
-
11/2015
Pesquisa e desenvolvimento, Pesquisa Aplicada.,Linhas de pesquisa
2013 - 2015
Flextronics Instituto de TecnologiaVínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40
Outras informações:
Thecnical leader of the projects: - Openstack: make improvements in the specific vendor drivers to Cinder module of OpenStack. Build a plug-in for Swift module to use the S3 service on backend. - HAPRO: Improvements in an application to protect (snapshots and backup) the Oracle data - z/OS with OpenSSH: create a new solution to send commands from TSO/ISPF to Linux/Windows Server using a ssh connection - Mainframe Disaster Recovery: Create a solution to automate the IPLs on a secondary site to recovery a disaster on a primary site. - LTE simulators: Study the existent LTE traffic simulators at 4G telecommunications networks focused on S1 and X2 eNodeB interfaces on an EPC. - Reverse logistic system to schedule the recovery from a final user of the eletronic residues.
2013 - 2014
Universidade de SorocabaVínculo: , Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 12
Atividades
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02/2014 - 06/2014
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Engenharia, Prática de Pesquisa 1, Prática de Pesquisa 3, Programação para Internet, Projeto Supervisionado 2
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08/2013 - 12/2013
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Engenharia, Prática de Pesquisa II, Programação Distribuída e Paralela, Programação Orientada a Objetos, Projeto Supervisionado I
-
02/2013 - 07/2013
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Engenharia, Programação para Internet, Sistemas Multimídia
-
02/2013 - 04/2013
Ensino, Biotecnologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Matemática
2012 - 2013
Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40
Outras informações:
Suffix trees: creating and implementing an algorithm to check and analyze hundreds of millions of reads of next generation sequencing (NGS) using a suffix tree structure. Hadoop: installing and configuration of Hadoop for performance tests with files of hundreds of millions of rows. GBrowse: installation.configuration and customization, including code updates to Blast, Blat and Protein dumper plugins. Chado: importing genomic data (gene, mRNA, CDS, SNP, QTL, etc.) of corn, cattle and Oil Palm in a Chado database model.
2011 - 2011
Universidade Federal de São CarlosVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Subtituto, Carga horária: 20
Atividades
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04/2011 - 07/2011
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução a Conceitos Computacionais e Algoritmos
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04/2011 - 07/2011
Ensino, Ciências Econômicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução a Conceitos Computacionais e Algoritmos
2011 - 2011
Anhanguera - SorocabaVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Titular I, Carga horária: 4
Atividades
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03/2011 - 07/2011
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Programação Orientada a Objetos I
2011 - 2011
Veris - Grupo IBMEC Educacional SAVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Titular I, Carga horária: 12
2011 - 2011
Veris - Grupo IBMEC Educacional SAVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Coordenador, Carga horária: 8
Outras informações:
Coordenador dos cursos de TI (Tecnólogo em Redes de Computadores, Tecnólogo em Análise e Desenvolvimento de Sistemas e Bacharelado em Sistemas de Informação)
Atividades
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02/2011 - 07/2011
Ensino, Tecnólogo em Análise e Desenvolvimento de Sistemas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Sistemas de Banco de Dados
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02/2011 - 07/2011
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Pesquisa e Ordenação, Programação com Objetos Distribuídos, Sistemas Distribuídos
2009 - 2010
Université Claude Bernarde Lyon 1Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2007 - 2008
Université Claude Bernarde Lyon 1Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2008 - 2009
Institut National des Sciences Appliquees de LyonVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2004 - 2007
Universidade de São PauloVínculo: Outro (Aluno), Enquadramento Funcional: Aluno Doutorado
2002 - 2003
Instituto Brasileiro de Tecnologia AvançadaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor titular II, Carga horária: 12
Outras informações:
Professor de Linguagem de Programação Orientada a Objetos
Atividades
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02/2002 - 06/2003
Ensino, Administração de redes, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de software, Programção orientada a objetos
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02/2002 - 06/2003
Ensino, Banco de Dados, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de software, Programação orientada a objetos
2000 - 2004
Universo OnLine Ltda.Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista programador, arquiteto e coordenador, Carga horária: 40
Atividades
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04/2000 - 01/2004
Serviços técnicos especializados , Departamento de desenvolvimento de software.,Serviço realizado, Desenvolvimento de software.
1999 - 2000
Banco BradescoVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Analista programador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
1997 - 1999
Banco FinasaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista programador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
1995 - 1997
Vellozo InformáticaVínculo: Proprietário, Enquadramento Funcional: Analista programador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Prestava consultoria a várias empresas de Sorocaba e região.
1992 - 1995
ABR SistemasVínculo: Sócio, Enquadramento Funcional: Diretor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Sócio de uma empresa que comercializava computadores e desenvolvia softwares
1989 - 1991
Quantum ComputadoresVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista programador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Analista de BIOS. Desenvolvimento da BIOS para um micro-computador PC 486.
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Augusto Fernandes Vellozo e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
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Confirma a exclusão?