Ana Lígia Barbour Scott
Professora Titular na Universidade Federal do ABC.Orientadora de Doutorado de Mestrado e Doutorado. Bolsista Produtividade Nível 2. Pós-Doutorado junto ao Pós-doutorado junto a Escola de Medicina da Universidade de Pittsburgh/ MMBios. (2018). Pós-Doutorado no IGBMC, Biologie structurale intégrative group, Universidade de Strasbour (2023). Pós-doutorado Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée (LBPA)- Ecole Normale Supérieure de Cachan- Perahia Lab. (2013). Doutorado junto ao Departamento de Física do IBILCE/UNESP (2013). Lider do Laboratório de Biologia Computacional e de Bioinformática da UFABC. Atua na área de Biofísica Molecular e Biologia Estrutural.
Informações coletadas do Lattes em 24/08/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas
2000 - 2003
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: PREDICAO DE ESTRUTURAS PROTEICAS VIA REDES NEURAIS E ALGORITMOS GENÉTICOS
JORGE CHAHINE. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Predição; Estrutura de Proteínas; Redes Neurais; Algoritmos Genéticos; Modelagem Molecular.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Redes Neurais. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos; Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional
1991 - 1993
Universidade de São Paulo
Título: protótipo evolutivo de um sistema de modelagem de sólidos
, Ano de Obtenção: 1993.MARIA CRISTINA FERREIRA DE OLIVEIRA.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Orientação a Objetos; Modelagem; Computação Gráfica; MODELAGEM DE SÓLIDOS.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação. Setores de atividade: Construção Civil; Desenvolvimento de Novos Materiais; Fabricação e Montagem de Veículos Automotores Para Transporte de Carga e Passageiros.
Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação
1987 - 1990
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: SIMULAÇÃO DE POLÍMEROS UTILIZANDO MONTE CARLO
Orientador: JORGE CHAHINE
Pós-doutorado
2023
Pós-Doutorado. , Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, IGBMC, França. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2018
Pós-Doutorado. , Univesity of Pittysburgh, PITT, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2013 - 2014
Pós-Doutorado. , École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan, França. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
Formação complementar
2009 - 2009
Capacitação de Avaliadores Insit. Externa. (Carga horária: 8h). , Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira, INEP/MEC, Brasil.
2009 - 2009
Estágio/Visita técnica. , UNIVERSIDADE DE PARIS XI, UN. PARIS-SUD, França.
2007 - 2007
CAPACITAÇÃOP DO BANCO DE AVALIADORES DO SINAES. (Carga horária: 32h). , Ministério da Educação, MEC, Brasil.
2001 - 2001
Filogenia Molecular. (Carga horária: 20h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2001 - 2001
Modelagem de Biomoléculas. (Carga horária: 16h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2001 - 2001
Bioinformática Análise de Banco de Dados Genéticos. (Carga horária: 20h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
1999 - 1999
Treinamento no Banco de Dados Progress e na Lingua. (Carga horária: 40h). , Dual Software, DUAL, Brasil.
1999 - 1999
Computer Science. (Carga horária: 120h). , Instituto de Tecnologia da Geoórgia, GEATECH, Estados Unidos.
1997 - 1997
SQL Server Administration. (Carga horária: 40h). , CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1996 - 1996
Introduction to Powebuilder. (Carga horária: 40h). , CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1995 - 1995
Introduction to Sybase. (Carga horária: 40h). , CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1992 - 1992
Conceitos Básicos de Computação Gráfica. (Carga horária: 20h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1992 - 1992
Curso de Computação Algébrica e Simbólica. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1992 - 1992
Métodos Topológicos em Modelagem Geométrica. (Carga horária: 20h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1991 - 1991
Extensão universitária em Sistema Operacional UNIX. (Carga horária: 60h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1980 - 1985
Inglês. (Carga horária: 1020h). , Escolas Fisk, FISK, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Atômica e Molecular.
Organização de eventos
AL SCOTT . Simulations Methods for Drug Design and Discovery. 2023. (Outro).
Ana Lígia Scott ; Philot, E. A. ; GASPARINI, P. ; NAVARRO, R. C. ; TORRES-BONFIM, N. E. . I Workshop of Molecular Modeling in Drug and Discovery Design. 2021. (Congresso).
AL Scott ; BATISTA, P. R. ; OLIVEIRA, R. J. ; ARAUJO, A. S. . 49 Reunião da SBBq: 8 Webinar Conformational space sample of proteins: Methods and Applications. 2020. (Congresso).
ANA LíGIA SCOTT ; NASCIMENTO, A. S. ; MALTAROLLO, V. ; PULLARA, F. . 48 Reunião da SBBq 2019 - Simpósio Computational Simulations for Drug Design. 2019. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; COUTINHO-NETO, M. ; HONORIO, K. M. ; MELLO, P. H. . IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2017. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . Symposium: Dynamic of Biomolecular Systems - 46th SBBq. 2017. (Outro).
Braz, A. S. ; COUTINHO, M ; HONÓRIO, K. ; SCOTT, L. P. B. ; MELLO, P. H. . III Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2015. (Congresso).
HONÓRIO, K. ; SCOTT, L. P. B. ; MELLO, P. H. ; COUTINHO-NETO, M. ; BRAZ, A. S. K. . II ESCOLA DE BRASILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR - EBMM 2013. 2013. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; COUTINHO, M ; MELLO, P. H. ; Braz, A. S. K ; NASCIMENTO, A. S. ; HONÓRIO, K. . ESCOLA BARSILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR - EBMM 2011. 2011. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; KLEINSCHMIDT, J. H. ; MInami, M ; Born ; FRAGA, F. . I Workshop da Pós Graduação em Engeharia da Informação da UFABC. 2011. (Outro).
SCOTT, L. P. B. . IADIS Multi Conference on Computer Science and Information Systems 2010. 2010. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . IADIS Informatics 2009 (I 2009) Conference. 2009. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; Lorena, Ana . I Escola Brasileira de Bioifnromática, EBB 2008. 2008. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; Lorena, Ana . Simpósio Brasileiro de Bioinformática. 2008. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . I Congresso de Iniciação Científica da UNIFEV. 2005. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. 2005. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . I Congresso de Iniciação Científica da UNIRP. 2004. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. ; COUTINHO-NETO, M. ; HONORIO, K. M. ; MELLO, P. H. . IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2017. (Congresso).
SCOTT, L. P. B. . Symposium: Dynamic of Biomolecular Systems - 46th SBBq. 2017. (Outro).
Participação em eventos
Hands-on Workshop on Computational Biophysics 2018. 2018. (Oficina).
Hands-On Workshop on Enhanced Sampling and Free-Energy Calculation. 2018. (Oficina).
SBBq. PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES. 2017. (Congresso).
SBBq. STRUCTURAL ANALYSIS OF THE BIOLOGICAL TARGET DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) RELATED TO TYPE II DIABETES MELLITUS TREATMENT. 2017. (Congresso).
IUBMB 2015. STUDY OF AGGREGATION MODELS OF PRPSC USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES AND COARSE-GRAINED. 2015. (Congresso).
reunião da SBBq 2015. STUDY OF AGGREGATION MODELS OF PRPSC USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES AND COARSE-GRAINED. 2015. (Congresso).
Workshop em Biofísica Molecular.Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2015. (Simpósio).
III Simpósio Interdisciplinar Fisica+ Bioinformática.Atudying functionally relevant changes and global motions in proteins. 2014. (Simpósio).
Reuniao Anual da SBBq 2014. Effects of the Presence of Substrates, Products and Catalytic Water in HIV1 Protease Flexibility by NMA. 2014. (Congresso).
Workshop at the interface between physics and biology. 2014. (Seminário).
9th European Biophysics Congress. HIV-1 protease double mutants analysis by NMA indicates convergence to flexibility of the wild type. 2013. (Congresso).
Frontiers in dynamics simulations of biological molecules.Flexibility of Thioredoxin1 and new binding sites using Normal Modes Analyses. 2013. (Simpósio).
WORKSHOP DEFIS - Biophysics of large macromolecular assemblies: experiments and simulations.Protein-protein docking interaction taking account global conformational changes. 2013. (Simpósio).
REUNIÃ DA SBBq. DEVELOPMENT OF A FULLY FLEXIBLE PROTEIN-PROTEIN DOCKING METHOD COMBINING NORMAL MODES AND GENETIC ALGORITHM. 2012. (Congresso).
Protein Socity Europen Meeting 2011. Using Normal Modes Analysis and Molecular Dynamics to investigate amyloid peptides and senile plaques. 2011. (Congresso).
Reunião da SBQT 2011. Protein-protein Docking using normal modes and genetic algorithm. 2011. (Congresso).
Simpósio Interdisciplinar: Física + Bioinformática. Analyses of the Inhibitor-active site binding of the HIV-1 Protease (Human Immunodeficiency Virus -1-M) in cases od strutcure and/or functional mutations. 2011. (Congresso).
9 European Conference on Computational Biology. Developing a methodology for protein-ligand docking based on genetic algorithm and normal modes. 2010. (Congresso).
II Semana Científica e Cultural da Unifesp Diadema (SCCUD). Bioinfromática: modelagem molecular. 2010. (Congresso).
ISCB Latin America 2010. A Methodological developments based on genetic algorithm and normal mode analysis for performing protein-ligand and protein-protein docking simulations. 2010. (Congresso).
XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. developing a software to extract rules for the formation of secondary structure. 2010. (Congresso).
Conference on Computational Physics. Design of Protein Sequence with Genetic Algorithms. 2008. (Congresso).
Curso de Verão em Biofísica Molecular 2008.Modelos e Técnicas para predição de Estrutura de Proteínas. 2008. (Outra).
Aula Magna para os Cursos de Física e Computação- UNIFEV.Biotecnologia: Uma área promissora para profissionais da área de extas. 2007. (Outra).
I Workshop em Sistemas Complexos e Cognição. Predicting Peptides Structure with Solvation Potential and Rotamer. 2007. (Congresso).
Semana da Computação - UNIRP.Biotecnologia: Uma área promissora para profissionais da área de computação. 2007. (Seminário).
XIV Congresso Latino-Americano de Biomatemática. Application of genetic algorithms to modeling and design proteins. 2007. (Congresso).
I Encontro da área de Saúde.Bioinformática como Ferramenta de auxílio à Pesquisa na Área de Saúda. 2006. (Simpósio).
I Fórum de Auto-Avaliação UNIFEV.Auto-Avaliação da Pesquisa de Pós-Graduação. 2006. (Encontro).
Ii CONGRESSO INICIAÇÃO CIENTÍFICA. 2006. (Congresso).
In-Silico analysis of proteins: Celebreting the 20th aniversary of Swiss-Prot. In-Silico analysis of proteins: Celebreting the 20th aniversary of Swiss-Prot. 2006. (Congresso).
XXXVII Latin American School of Physics. XXXVII latin American School of Physics. 2006. (Congresso).
I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. 2005. (Congresso).
VI Encontro nacional sobre Pós-Graduação e pesquisa nas IES Particulares. 2005. (Encontro).
II Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. II Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2004. (Congresso).
IV Jornada de Informática.Bioinformática. 2004. (Simpósio).
V Congresso de Computação da UNIFEV. V Congresso de Computação da UNIFEV. 2004. (Congresso).
XIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2003. (Congresso).
Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. I Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2002. (Congresso).
Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, LNCC- Petrópolis - Rio de Janeiro. Predição de Estruturas Secundárias Utilizando Redes Neurais. 2002. (Congresso).
Semana da Biologia da UNIFEV,.Minicurso: Conceitos Básicos de Bioinformática. 2002. (Encontro).
Semana da Química - UNIFEV. Bioinformática - Uma ferramenta para área de Química. 2002. (Congresso).
XII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2002. (Congresso).
II Escola de verão em métodos computacionais em biologia. Aplicação de Redes Neurais na Predição de Núcleos Hidrofóbicos. 2001. (Congresso).
School on Computational Physics. Predicting Protein Structure Using Genetic Algorithms. 2001. (Congresso).
IV Simpósio Brasileiro de Redes Neurais.Predição de Estruturas de Proteínas Utilizando Rede de Hopfield. 2000. (Simpósio).
ICCIMA'98, International Conference on Computacional Intelligence and Multimedia Applications. HyTime from the Object-Oriented Point of View. 1998. (Congresso).
IX Semana da Computação.Uma comparação dos métodos de modelagem e projeto de aplicações hipermídia. 1998. (Encontro).
Seminário de Tendências do Ensino Superior para o Terceiro Milênio. 1998. (Seminário).
2a Semana de Incentivo Científico e Cultural da UNIRP. Orientação a Objetos. 1997. (Congresso).
I Workshop de Iniciação Científica em Computação das FIRP. Um Estudo de Conceitos e Técnicas de Análise e Projeto orientado a Objetos. 1997. (Congresso).
1a Semana de Informática da UNIRP.Mini-curso sobre Redes Neurais Artificiais. 1996. (Encontro).
I Wokshop de Visão Cibernética. 1996. (Outra).
III Seminário de Informática e telecomunicações de Rio Preto.Conceitos Básicos de Computação Gráfica. 1995. (Seminário).
I Semana de Incentivo Científico e Cultural - SICC, FIRP. Mini-curso: Projeto de Sistemas de Tempo Real. 1995. (Congresso).
Workshop em Programação Concorrente, Sistemas Distribuídos e Engenharia de Softwar. 1991. (Encontro).
XV Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1991. (Congresso).
XV Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1991. (Congresso).
I Congresso de Iniciação Científica da UNESP. Simulação a Análise da Dinâmica Newtoniana. 1990. (Congresso).
VII Escola de Computação. Simulação e Visualização de um Polímero em Rede. 1990. (Congresso).
XII Congresso de Estudantil de Física. Simulação e Visualização de um Polímero em Rede. 1990. (Congresso).
Participação em bancas
SCOTT, L. P. B.; HONORIO, K. M.; IMOTO, H. T.. Triagem vistual de inibidoes da enzima di-hidrofolato redutase de Schistosoma Mansoni (SmDHFR). 2017. Dissertação (Mestrado em Fármacos e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.
FONTES, M. R. M.; TAKEDA, A. A. S.;SCOTT, L. P. B.. Um nova metodologia in silico para predição de complexos flexíveis entre proteínas: estudo de caso para inibidores plasmáticos de fosfolipase A2 de serpentes. 2016. Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
OLIVEIRA, R. J.; BRITO, B. G. A.;SCOTT, L. P. B.. Modelos Teóricos Simplificados Aplicados no Desenvolvimento de Proteínas para Diagnósticos e Imunoterapia de Alergia Respirtaório. 2016. Dissertação (Mestrado em Progrma Multicêntrico em Química de Minas Gerais) - Universidade Federal do Triângulo Mineiro.
CORDEIRO, R. M.;BRAZ, ANTÔNIO S.K.SCOTT, L. P. B.; ITRI, R.. Simulação dos produtos de Oxidação do Colesterol em Bicamadas Lipídicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia/Química) - Universidade Federal do ABC.
SCOTT, L. P. B.; SUYAMA, R.; OLIVEIRA, R. J.. Implementação da terceira versão da ferramenta GANM: considerando o ligante flexivel. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
HONÓRIO, K.; TROSSINI, G. H. G.;SCOTT, L. P. B.. Análise das Relações entre a Estrutura e Atividade de Compostos Empregados no Tratamento de Diabete mllitus Tipo II. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC.
SOUZA, F. P.; ARAUJO, A. S.;SCOTT, L. P. B.. ESTUDO DA ESTRUTURA DA PROTEÍNA SH DO VÍRUS SINCICIAL RESPIRATÓRIO HUMANO: ANÁLISE FUNCIONAL DA ESTRUTURA PENTAMÉRICA POR FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
KIHARA, A.; BUZATO, C. B. C.;SCOTT, L. P. B.. Possível Relação entre Acoplamento Celular na Neurodegeneração da Retina. 2012. Dissertação (Mestrado em Fisiologia) - Universidade de São Paulo.
TINOS, R.; VENCIO, R. Z. N.;SCOTT, L. P. B.. Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas. 2012. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
CORNELIO, M. L.; RUGGIERO, José Roberto;SCOTT, L. P. B.. ANÁLISE VIBRACIONAL DO X-TOCOFEROL. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
CHAHINE, Jorge; Araujo; RUGGIERO, José Roberto;SCOTT, L. P. B.. Estruturação do Eumenine mastparano por Dinâmica Molecular em misturas de TFE -água. 2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.
OKI, N.; VILLARREAL, D. M. O.;SCOTT, L. P. B.. Éris- Sistema de Acompanhamento e Monitoramento Climático e Meterorológico. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
CHAHINE, Jorge; ARAUJO, A. S.; GARRAT, R. C.; MORAES, F. R.;ANA LíGIA SCOTT. Estudo do enovelamento da enzima SOD1 por simulações de dinâmica molecular. 2019. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ALENCAR, A. M.; COUTINHO, K. R.; HENRIQUES, V. B.; GALVAO, D. S.;SCOTT, L. P. B.. Gotas e pontes capilares na escala nanométrica. 2017. Tese (Doutorado em Doutoramento em Física) - Universidade de São Paulo.
LAMKE, N.;SCOTT, L. P. B.; MAGRO, A. J.; BERTOLINI, M. C.; CARVALHO, R. F.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
RUGIERO, José Roberto; PAIVA, P. B.; FALCAO, P. R. K.;SCOTT, L. P. B.; SOUZA, F. P.. Predição de sítios de ligação para cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio. 2015. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
THIEMANN, O. H.; ABREGO, J. R. B.; NASCIMENTO, A. S.; MASCARENHAS, Y. P.;SCOTT, L. P. B.. Estudos Estruturais da Seril-tRNA Sintetase nativa e em interação com tRNAs cognatos de Trypanosoma brucei. 2014. Tese (Doutorado em Fisica Biomolecular) - Universidade de São Paulo.
RUGIERO, José Roberto; Calir,i A.; OLIVEIRA, L. C.;SCOTT, L. P. B.. Estudo das Interações de Peptídeos Antimicrobianos e Sistemas MIméticos de Membrana por Dinâmica Molecular. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Vitor Barbanti Pereira Leite; ARAUJO, A. P.; ALVES, N. A.;SCOTT, L. P. B.; RUGGIERO, José Roberto. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteína. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Vitor Barbanti Pereira Leite; Calir,i A.; Michel Eduardo Beleza Yamagish; Sidney Jurado de Cravalho;SCOTT, L. P. B.. Efeitos de Hidrofobicidade em evolução da proteína. 2009. Tese (Doutorado em Fisica (Sjrp)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
SATO, J.;SCOTT, L. P. B.; ZAMPIROLLI, F.. Uma Nova Abordagem de Descritor de Textura Baseada em Transformada Ripplet para Classificação de Lesões Mamográficas. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
KLEINSCHMIDT, J. H.;SCOTT, L. P. B.; KAMIENSKI, C. A.. Análise, Modelagem e Predição de Eeventos em Praças Digitais. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
FAVERO, P. B.; CHANG JUNIOR, J.;SCOTT, L. P. B.. Assitência ao Atendimento Pré-Hospitalar com Sistemas Especialistas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
FRAGA, F.;SCOTT, L. P. B.; SATO, J.. Proposta de uma Metodologia para Obtenção de Potenciais Evocados e Análise de Filtro Sensório-Motor em Pacientes com Esquizofrenia. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
NASCIMENTO, M. Z.;SCOTT, L. P. B.. Quatificação de tecidos histológicos da próstata com dimensao fractal colorida. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
YAGUI, C. O. R.;SCOTT, L. P. B.; MALTAROLLO, V.. Busca Virtual de agonistas enviesados não peptídicos do receptor angiotensina II do Tipo 1. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Fármacos e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.
SCOTT, L. P. B.BRAZ, A. S. K.; KLEINSCHIMIDT, J. H.. Investigando Padrões em Proteínas com Regiões de Desordem por mei ode Mineração de Dados. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.
HONÓRIO, K.; TROSSINI, G. H. G.; GALVAO, A. C. S. S.;SCOTT, L. P. B.. Estratégias de Modelagem Molecular para Estudo de Compostos com Afinidade pelo REceptor TGFbRI/ALK-5. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC.
SCOTT, L. P. B.; SILVA JUNIOR, E. C.; Silva, D.D.. Desenvolvimento de Aplicações para Telefones Celulares. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; SILVA JUNIOR, E. C.. Processamento de Imagens Mamográficas Através de Filtros de Suavização no Espaço de Frequência. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. PSP & XP: Proposta de melhoria na Qualidade de Desenvolvimento de Softwares. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Aplicações de Padrões de Projeto em C#. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Banco de Dados Multimídia e suas Aplicações em processamento de Imagens. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; SILVA JUNIOR, E. C.; Silva, D.D.. Inteligência Artificial e Integração com um Sistema de Controle Utilizando Recursos de Java. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; SILVA JUNIOR, E. C.. Processamento de Imagens Digitais: Uma Abordagem Direcionada a Rotinas de Segmentação. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.. Controlador de Fluxo de Veículos. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.. Controle Remoto para Exibir PowerPoint. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.. Linguagens de Programação para Internet. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.. O Aspecto Jurídico no Meio Eletrônico Brasileiro.. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.
SCOTT, L. P. B.. Qualidade de Software e a Importância para o Sucesso. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.
Crepaldi H.;SCOTT, L. P. B.. Firewalls como Alternativa para Segirança em Redes. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.
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Orientou
ESTUDO DA DINÂMICA CONFORMACIONAL DA GLICOPROTEÍNA S DO SARS-COV-2 E OS EFEITOS EFEITO DE MUTAÇÕES E DIFERENTES pHs; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Desenvolvimento de um Preditor de Regiões de Agregação em Complexos Proteicos; Início: 2023; Dissertação (Mestrado profissional em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC; (Orientador);
Conformational Heterogeneity and transition states of PPARgama 1 and 2 using Hybrid Methods and based on Cryo-EM maps; Início: 2025; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Análise do discurso de ódio nas redes sociais; Início: 2024; Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC; (Orientador);
Estudo da Dinâmica Conformacional e Estabilidade dos Meta-estados para TMEM176 e seu Papel na Ativação do Inflassoma; Início: 2023; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);
Início: 2025; Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico;
Início: 2023; Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;
Explorando técnicas de aprendizado de máquina para reclassificar poses do docking; 2023; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Covid-19 vs; Política e a Polarização no Twitter; 2021; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, ; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Desenvolvimento de um Preditor de Agregação de proteínas e peptídeos; 2016; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, ; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo de padrões de propriedades de resíduos em Proteínas Desordenadas; 2015; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, ; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo estrutural de neurotrofinas e seus receptores a partir de análise de modos normais; 2015; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, ; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Iplementação da terceira versão da ferramenta GANM: considerando o ligante flexivel; 2014; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federral do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo de padrões em proteínas virais humanas e a sua correlação com a rede de interação dessas proteínas; 2013; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Predição de Hot Spots em complexos Proteína-Proteína; 2013; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Algoritmos Imunológicos aplicados na Detecção de Intrusões com Dinâmica da Digitação; 2012; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Uso de Data Mining na descoberta ou identificação de regras de enovelamento baseado em perfis de hidrofobicidade; 2011; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Investigação do Docking da HIV-1 Protease e Ligantes utilizando Algoritmos Genéticos e Biblioteca de Rotâmeros; 2010; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Engenharia de Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federal do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Investigação do Docking da HIV-1 Protease e Ligantes utilizando Algoritmos Genéticos e Dinâmica Molecular com Modos Normais; 2008; Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Quantificação do Pré-Processamento em Sistemas De Diagnóstico Auxiliado por Computador; 2007; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Engenharia de Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
O uso de Redes Neurais Artificiais MLP na Predição de Estruturas Secundárias de Proteínas; 2004; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Compreendendo a Dinâmica Estrutural, Movimentos Funcionais e Interações Moleculares da Proteína Estrutural Spike e Proteases do SARS-CoV-2 e a busca por Bioativos; ; 2021; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Dopamine Transporter and CamKII, analyzing the interactions and molecular mechanism of Phosphorylation; 2019; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Predicao de Regiaoes Proepensa a Agregacao x Estabilidade de Proteinas; 2018; Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Caracterização teórica das interações moleculares entre os peptídeos β-Amilóides (Aβ42, Aβ40), Prion Protein (PrPc e PrPSc), APLP1, B30 por meio de dinâmica molecular, análise de modos normais de baixa frequência, docking proteína-proteína e QM/MM?; 2015; Tese (Doutorado em Biossitemas) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Movimentos Funcionais e Mudanças Conformacionais de proteínas e peptídeos relacionados com agregação; 2015; Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudos de Modelagem Molecular e Triagem Virtual de Ligantes da Enzima Dipeptidil Peptidase-4 Candidatos ao Tratamento do Diabetes Tipo II; 2015; Tese (Doutorado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, ; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Transferência de informação na sinalização dos receptores TrkA mediados por neurotrofinas e outros ligantes; 2015; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Determinação de padrões de movimentos funcionais em classes proteínas usando modos normais e técnicas de aprendizado de máquina; 2015; Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, ; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo estrutural de replicases virais a partir de análise de modos normais; 2014; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Caracterizando as Interações moleculares entre a Tioredoxina e inibidores/moduladores alostéricos; 2010; Tese (Doutorado em Biossitemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
2025; Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Ana Ligia Barbour Scott;
2021; Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Ana Ligia Barbour Scott;
2018; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
2018; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
2017; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
2017; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
2016; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
2012; Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Ana Ligia Barbour Scott;
Desenvolvimento de um software para design de fármacos baseado em estrutura e estudo de interação proteína-proteína proteína-ligante; 2011; Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Ligia Barbour Scott;
Integração de Bancos de dados Biológicos e Implementação de um Workflow para Mineração de Dados filogenéticos; 2009; Universidade Federral do ABC, Universidade Federral do ABC; Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados Multimídia e suas Aplicações em Processamento de Imagens; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados genéticos e de Proteínas; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados Genéticos e de Proteínas; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados Móveis e Computação Móvel: Uma discussão de seus recursos e aplicações; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados móveis e Computação móvel:Uma discussão de seus Recursos e Aplicações; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados Multimídia na Medicina; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Banco de Dados Multimídia na Medicina; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Datamining: Aplicacões, conceitos, casos de uso e sua importância no mercado na tomada de decisão; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Datamining: Aplicações, Conceitos, Casos de Uso e sua Importância no Mercado na Tomada de Decisão; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Ferramentas Computacionais Utilizadas para o Desenvolvimento do Projeto Genoma; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Ferramentas Computacionais Utilizadas para o Desenvolvimento do Projeto Genoma; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Ferramentas para WEB e um Levantamento Regional; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Redes Neurais Artificiaise Reconhecimento de Padrões; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Redes Neurais Artificiais e Reconhecimento de Padrões; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Um estudo sobre Sistemas Gerenciadores de Banco de Dados na Região de Votuporanga; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Um estudo sobre Sistema Gerenciadores de Banco de Dados, na Região de Votuporanga ; ; 2004; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Equilíbrio de gênero e uma maior participação feminina em áreas da tecnologia da informação via ações imersivas na região do Grande ABC; 2025; Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo in silico da dinâmica estrutural e movimentos funcionais e não funcionais da Protease principal da SARS-COV-2 e suas interações com inibidores; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Análise estrutural e funcional de alguns mutantes da Prions (PrPC, PrPSc) por meio de dinâmica molecular e análise de modos normais; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo estrutural e funcional da Alfa-sinucleína por meio de análise de modos normais e dinâmica molecular; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Aplicação de Redes Neurais Artificiais para Predizer Estruturas Secundárias de Proteínas; 2013; Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Análise Estrutural e de Flexibilidade dos Mutantes da Prion via Dinâmica Molecular e Modos Normais; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Análise dos Modos Normais de nano estruturas de peptídeos; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Análise in silico da afinidade de inibidores ao sítio ativo da protease do HIV-1MNO (Human Immunodeficiency Virus ? 1MNO) em casos de mutações não sinônimas sob pressão de seleção positiva; ; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Análise in silico da flexibilidade da SOD em casos de mutações não sinônimas sob pressão de seleção positiva; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, MEC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Investigando a Flexibilidade da Tioredoxinas e Tioredoxinas Redutase por meio de análise de modos normais de baixa frequência e dinâmica molecular; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
; Investigando a estrutura e flexibilidade de peptídeos β-Amilóides (Aβ42, Aβ40) e a formação de agregados por meio de dinâmica molecular e análise de modos normais de baixa frequência; 2010; Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo dos softwares: VMD, ArgusLab na Simulação de Docking de Sistemas Proteína-Ligante relacionados à doenças auto-imunes; 2009; Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo dos softwares: VMD, ArgusLab e Gromac na Simulação de Docking de Sistemas Proteína-Ligante; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Modelagem por hmologia de proteínas envolvidas em doenças auto imunes; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Aplicação de Redes Neurais do Tipo MLP na Predição de Doenças Cardíacas; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em BC&T) - Universidade Federral do ABC, Universidade Federral do ABC; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Aplicação de Monte Carlo no Estudo de Enovelamento, Dinâmica e Estabilidade de EstruturasProtéicas em uma Rede Cúbica; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Predição de pepetídeos usando Algoritmo genético e Bilbioteca de Rotâmeros; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Predição de Estruturas de proteínas Usando Algoritmos Genéticos e Biblioteca de Rotãmeros dependente do backbone; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Desenvolvimento de um CD para ensino e treinamento em UML; ; 2004; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudos de Ferramentas e Softwares de Bioinformática; ; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Estudo das interações moleculares entre Tioredoxinas/Tioredoxinas Redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx; 2012; Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária; E as aplicações para estudar interação Proteína-Proteína, Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas; 2011; Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária; E suas aplicações para estudar interação Proteína-Proteína , Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas; 2010; Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ana Ligia Barbour Scott;
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QUEIROZ, S. ; PHILOT, E.A. ; MAGRO, A. J. ; AL SCOTT . STUDY OF BIOACTIVE MOLECULES FROM NATURAL PRODUCTS WITH KEY PROPERTIES TO ACT ON THE TMEM176B PROTEIN IN ITS HOMO/HETERODIMERIC FORMS. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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GASPARINI, P. ; PANTALEÃO, SIMONE QUEIROZ ; MAGRO, A. J. ; MARCELO, Y. ; SIMOES, R. ; PHILOT, E.A. ; AL SCOTT . IDENTIFICATION OF NATURAL COMPOUNDS BIOACTIVES ON SOME SARS-COV-2 MPRO MUTANTS (VARIANTS) AND WILD TYPE,. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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ALVES, I. ; PANTALEAO, S. Q. ; MARCELO, Y. ; Philot, E. A. ; AL SCOTT . UNVEILING THE EFFECT OF PHOSPHORYLATION AND PH CONDITIONS ON THE CONFORMATIONAL DYNAMICS TMEM176B WITH A APPROACH BASED ON HYBRID METHODS,. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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PANTALEAO, S. Q. ; MARCELO, Y. ; PHILOT, E.A. ; MAGRO, A. J. ; ANA LIGIA SCOTT . IDENTIFICATION OF NATURAL PRODUCTS WITH KEY CHARACTERISTICS TO ACT ON THE TMEM176B PROTEIN IN HOMO AND HETERODIMERIC FORMS,. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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MARCELO, Y. ; PANTALEAO, S. Q. ; PHILOT, ERIC A. ; HILL, M. ; MAGRO, A. J. ; SCOTT, ANA LÍGIA . 'UNVEILING THE EFFECT OF PHOSPHORYLATION AND PH CONDITIONS ON THE CONFORMATIONAL DYNAMICS TMEM176B WITH A APPROACH BASED ON HYBRID METHODS. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Ana Lígia Scott . A invisibilidade das mulheres TRANS no meio acadêmico/científico e barreiras e desafios existentes? no simpósio MULHERES NA CIÊNCIA: DESAFIOS DA DIVERSIDADE. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GASPARINI, P. ; MATTOS, J. C. ; TORRES-BONFIM, N. E. ; MOREIRA, C. ; NAVARRO, R. C. ; MAGRO, A. J. ; Perahia, D. ; Philot, E. A. ; Ana Lígia Scott . UNVEILING MUTATION EFFECTS ON THE STRUCTURAL DYNAMICS OF THE MAIN PROTEASE FROM SARS-COV-2 WITH HYBRID SIMULATION METHODS. 2021. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
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ANA LíGIA SCOTT . Protein-Ligand and Protein-protein Docking considering global and local conformational changes: some studies cases.. 2019. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
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NAVARRO, R. C. ; SCOTT, ANA . STRUCTURAL DYNAMIC ANALYSIS FOR hDAT USING ELASTIC NETWORK MODELS. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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TORRES-BONFIM, N. E. ; SCOTT, ANA ; Lima, A N. ; CARLDERON, L. A. .. . Synthetic Peptides and New Molecular Targets Against Leshimaniases: A Large-scale Virtual Screening. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SANTOS, A. L. ; SCOTT, ANA . A protocol to investigate protein stability with Molecular Dynamics and Dihedral Perturbation. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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ANA LíGIA SCOTT . Studies about Conformational Changes and Functional Movements using Full-Atom model combined with Coarse-Grained and QM/MM. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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ANA LIGIA SCOTT . Integrating Models all-toms and cooarse grained to study movements in proteins. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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ANA LíGIA SCOTT ; PANTALEAO, S. Q. ; HONÓRIO, K. . Structural Dynamics of DPP-4 and its influence on the projection of inhibitors. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SCOTT, L. P. B. ; Perahia, D. ; Lima, A N. ; COSTA, M. . pH and aggregation effects in the convesrsion of human prion into scrapie form: a study suing Molecular Dynamics with excited Normal Modes. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONORIO, K. M. . STRUCTURAL ANALYSIS OF THE BIOLOGICAL TARGET DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) RELATED TO TYPE II DIABETES MELLITUS TREATMENT. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONÓRIO, K. . Análise de Propriedade Farmacocinéticas do Inibidor N7F para a enzima DDP-4. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Philot, E. A. ; MORO, P. ; OLIVEIRA, R. J. ; SCOTT, L. P. B. . USING STRUCTURE-BASED MODEL AND NORMAL MODE ANALYSIS TO INVESTIGATE SOD 1 AGGREGATION. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SCOTT, L. P. B. ; Lima, A N. ; OLIVEIRA, R. J. ; Perahia, D. ; COSTA, M. . PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; PANTALEAO, S. Q. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; HONÓRIO, K. . Functional Movements and Conformational Changes of dipeptidil peptidase-4 (DPP-4) related with biding sites and ligands. 2016. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
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SCOTT, L. P. B. . Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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SCOTT, L. P. B. . Modelagem e simulação de mecanismos moleculares e da interação de fármacos com proteínas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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SCOTT, L. P. B. . Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. ; GOMES, D. H. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. . Protein-protein docking interaction taking account global conformational changes. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Philot, E. A. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. . Flexibility of Thioredoxin 1 and new binding sites using Normal Modes Analyses. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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GOMES, D. H. ; SCOTT, L. P. B. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. ; David Perahia . Deveopment of a fully Flexible Protein-Protein Docking method combining Normal Modes and Genetic Algorithm. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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GOMES, D. H. ; SCOTT, L. P. B. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. ; Perahia, D. . Protein-Protein docking using normal modes and genetic algorithm. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
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Angélica Lima ; Eric Phillot ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. . THE SECOND AND THIRD VERSION OF GANM: AN APPROACH FOR MOLECULAR DOCKING. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; TISSUER, P. ; Faria, A. . A study of hydrophobic Effect in Real sequences using Monte Carlo and HP Model. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Stelle, D. ; SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. . Develping a software to extract rule for the formation of secondary strutucture. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Stelle, D. ; SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. . Using Data mining to identify Hydrophobicity Patterns and sequences motifs in proteins classes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Design of protein Sequence with Genetic Algorithms. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . A Surdy of Hydrophobic effect on The Protein Folding using Monte Carlo. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. . Técnicas de Predição de Estruturas de Proteínas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Predicting Peptides Structure with Solvation Potential and Rotamer. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Application of Genetic Algorithms to modeling and design of proteins. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; Joselisa Paiva . . Estudo de Aplicação de Diferentes Arquiteturas de Redes Neurais Artificiais no Diagnóstico de Propensão à Doenças Cárdiacas. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Prediction of Pepetides Structure Using Genetic Algorithms and Rotamer Library Dindependent fo Backbone. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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CHAHINE, Jorge ; SCOTT, L. P. B. ; RUGGIERO, José Roberto . Predicting Protein using Genetic Algorithms and Rotamer Library. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto ; SCOTT, L. P. B. . Using Neural Networks MLP to predict the Secondary Structure of Proteins. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Prediction of Peptides Structure using Genetic Algorithms. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SCOTT, L. P. B. . Técnicas de Predição de Estruturas Protéicas. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Ferramentas de Bioinformática aplicadas à Química. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Bioinformática e o Genoma Estrutural. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Aplicações de Redes Neurais e Algoritmos Genéticos na Predição de Estruturas Terciárias de Proteínas. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Bioinformática: análise de banco de dados genéticos e estudo de estruturas de macromoléculas. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Bioinformáitca. 2001. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SCOTT, L. P. B. . Aplicação de Geometria Analítica em Computação Gráfica. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
SCOTT, L. P. B. . Projeto e Desenvolvimento de Sistemas para Web. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Introdução à Computação Gráfica. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCOTT, L. P. B. . Mini- Curso: Modelos e técnicas para predição de estruturas de proteínas. 2008 (Material Didático).
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SCOTT, L. P. B. . A Importância da Bioinformáitca 2004 (Artigo Eletrônico).
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SCOTT, L. P. B. ; BOTTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . Curso Introdutório à Bioinformática 2003 (Material Didático).
Outras produções
SCOTT, L. P. B. . Desenvolvolvimento e Implantação de um Sistema Cliente Servidor. 1995.
SCOTT, L. P. B. ; FOGO, Cleber Pressunto . CD PARA ENSINO E TREINAMENTO EM UML. 2004.
SCOTT, L. P. B. ; BOTTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . CD-ROM PARA ENSINO E TREINAMENTO EM BIOINFORMÁTICA. 2003.
SCOTT, L. P. B. . YODA. 2003.
SCOTT, L. P. B. . Formatador. 2002.
SCOTT, L. P. B. . Composer. 2002.
SCOTT, L. P. B. . Modelador de Sólidos. 1993.
SCOTT, L. P. B. . Nina: Um método para modelagem e desenvolvimento orientado a objetos de websites. 2000.
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática e Banco de Dados GenétiCOS. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Introdução aos Conceitos e Técnicas de Computação Gráfica. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Redes Neurais Artificiais. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Introdução aos Conceitos e Técnicas de Computação Gráfica. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Redes Neurais Artificiais. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Programação Orientada a Objetos. 1996. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. . Projeto de Sistemas de Tempo Real. 1995. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCOTT, L. P. B. ; BOTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . Estudo de Ferramentas e Softwares de Boinformática. 2002 (PESQUISA) .
SCOTT, L. P. B. . Simulação e animação de redes e padrões de drenagem. 1995 (Demais trabalhos relevantes) .
Projetos de pesquisa
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2022 - Atual
Efeitos de fosforilação e mecanismos moleculares envolvidos com hDAT e o transporte de dopamina (absorção e efluxo)e as interações com CaMKII, Descrição: . Este projeto visa compreender os mecanismos moleculares envolvidos no transporte do metabolismo da dopamina por meio várias técnicas de simulação com métodos híbridos MDeNM que integrados que combinam NMA (usando ENMs ou modelos atômicos completos), dinâmica molecular e dados experimentais de técnicas biofísicas. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / David Parahia - Integrante / Roberto Carlos Navarro - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2021 - Atual
Adjuvant for COVID-19: Drug repurposing and discovery of plant based novel therapeutics/adjuvants with anti-inflammatory and immunostimulatory properties., Descrição: Vários tipos de vírus se multiplicam no hospedeiro sem causar danos graves, incluindo aqueles capazes de causar doenças. Mas, em alguns casos, a resposta do hospedeiro pode causar efeitos fisiopatológicos importantes, que podem ser relativamente inespecíficos ou mais direcionados pela resposta imune humoral e/ou celular. É geralmente conhecido que os macrófagos fazem parte de uma população de células do sistema imune inato que responde a agentes microbianos pela produção de moléculas inflamatórias que matam os patógenos e promovem a reparação dos tecidos. No entanto, uma resposta inadequada dessas células pode levar a danos ao próprio indivíduo, como pode ser visto na Página síndrome de ativação macrofágica induzida por infecções graves, incluindo aquelas relacionadas ao SARS-CoV-2. A ocorrência e evolução do COVID-19 depende da interação entre o vírus e o sistema imunológico de cada indivíduo. Portanto, a identificação de agentes imunomoduladores capazes de manter uma resposta imune controlada e ao mesmotempo responder adequadamente aos patógenos são de grande interesse neste momento de pandemia. Este projeto de pesquisa propõe unir estudos in silico (docking molecular, triagem virtual, modelagem molecular, simulações de dinâmica molecular, análise de modos normais, etc.) e in vitro (experimentos de interação imunológica e biofísica contra alvos validados e ensaios de inibição viral) para identificar moléculas de origem vegetal, ou compostos sintéticos semelhantes a essas substâncias naturais, com propriedades antiinflamatórias e imunomoduladoras contra COVID-19 ou SARS-CoV-2. Espera-se que o resultado direto deste projeto seja a aquisição de informações que permitirão um melhor entendimento da estrutura / função de proteínas-chave na infecção por SARS-CoV-2 que podem auxiliar na formulação de candidatos a fármacos para auxiliar no tratamento. de COVID-19. A complementaridade e interdisciplinaridade dos grupos pode ser muito produtiva para desenvolver o projeto.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Eric Allison Philot - Integrante / Angelo José Magro - Integrante / Marcelo Hill - Integrante / Ignacio Generale - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2016 - Atual
Estudo das interações moleculares envolvidas na formação de agregados da Superóxido Dismutase 1 (SOD1) e de seus aspectos termodinâmicos por meio de Molecular Dynamics with excited Normal Modes e técnicas de mineração de dados, Descrição: A enzima humana Cu,Zn-SOD é um homodímero de 35-kDa (Rumfeldt, 2009), no qual cada monômero se liga a um átomo de zinco e um átomo de cobre. O Cobre está diretamente envolvido nas reações de catálise, enquanto o Zinco tem função estrutural na região do sítio ativo. Expressada em praticamente, todos os tecidos e em altas concentrações, esta enzima converte o ânion superóxido, um danoso produto do metabolismo protéico, em peróxido de hidrogênio e oxigênio molecular. Este projeto de pesquisa possui como principais objetivos: i) compreender as interações moleculares envolvidas na formação dos agregados da SOD1; ii) identificar padrões (flexibilidade e área acessível ao solvente) em mutantes da SOD1 que estejam correlacionados com a formação de agregados e com diferentes doenças, iii) estudar e compreender melhor o papel do cobre (Cu) e do zinco (Zn) para a estabilidade da estrutura da SOD1 e na propensão de formação de agregados, iv) contribuir para compreensão, de forma mais geral, do mecanismo de agregação de proteínas. O projeto de pesquisa será desenvolvido no Laboratório de Biologia Computacional e Bioinformática da UFABC com a colaboração do Dr. David Perahia que é especialista nas técnicas de Análise de Modos Normais e Dinâmica Molecular. Estudos sobre os mecanismos e agregados envolvidos com patologias podem auxiliar na compreensão das mesmas e no desenvolvimento de novos medicamentos e tratamentos. Mais especificamente, a compreensão das interações moleculares envolvidas na formação dos agregados da SOD e seus mutantes são importantes e contribuem para a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos em doenças neurodegenerativas como a Esclerose Lateral Amiotrófica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2014 - 2016
Estudo de estrutural e funcional de proteínas envolvidas em doenças neurodegenerativa utilizando analise de modos normais e dinâmica molecular, Descrição: Este projeto de pesquisa propõem investigar diferentes doenças neurodegernerativas do ponto de vista molecular, estudando as proteínas envolvidas com essas patologias a partir de vários aspectos: estrutura, dinâmica, formação de agregados, função e interação. Pretende-se investigar os mecanismos moleculares a partir de diferentes visões: evolução, busca de padrões (bioinformática), enovelmamento, formaçao de agregado, interação proteína-ligante e drug design. Essa visão/estudo hierarquico permitirá um melhor entendimento do processo molecular envolvido nessas doenças neurodegenerativas. Este projeto de pesquisa possui como principais objetivos: i) compreender as interações moleculares envolvidas na formação dos agregados de proteínas e doenças neurodegenerativas; ii) identificar padrões (flexibilidade, área acessível ao solvente e outros) nas proteínas e em seus respectivos mutantes que estejam relacionados com as diferentes doenças, iii) identificar possíveis sítios de ligação alostéricos por meio de mudanças conformacionais globais, iv) investigar o docking dessas proteínas com compostos candidatos a inibidores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2011 - 2013
Study of moleuclar interactions among Thioredoxin/Thioredoxin Reductase and inhibitors and alosteric modulators the characterization of moecular interactions presents in the system Trx., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Eric Allison Philot - Integrante / Ricardo Hildebrand Theodoro da Silv - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2011 - 2013
Estudo de padrões em proteínas virais humanas e a sua correlação com a rede de interação dessas proteínas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Denis Lucas Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
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2010 - 2015
DESENVOLVIMENTO DE UM SOFTWARE PARA DESIGN DE FÁRMACOS BASEADO EM ESTRUTURA E ESTUDO DE INTERAÇÃO PROTEÍNA-PROTEÍNA PROTEÍNA-LIGANTE, Descrição: Projeto Bolsa PNPD. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
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2010 - 2012
Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária. E suas aplicações para estudar interação Proteína-Proteína , Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas, Descrição: Projeto de Auxílio regular à Pesuqisa - Fapesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Perahia, D - Integrante / Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2010 - Atual
Laboratório de Modelagem e Simulação de Sistemas não Lineares (LMSSNL), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
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2009 - 2010
Methodological developments based on genetic algorithm and normal mode technique to simulate molecular docking, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / David Parahia - Integrante., Financiador(es): Chamada Fapesp/CNRS - Auxílio financeiro.
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2007 - 2009
Aplicação de Monte Carlo e Wang-Landau Estudo de Enovelamento, Dinâmica e Estabilidade de Estruturas Protéicas em uma Rede Cúbica, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Hudson Roger - Integrante.
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2007 - 2008
Investigação do uso de algoritmos genéticos e redes neurais na modelagem e predição de estruturas de macromoléculas e na simulação de docking entre proteína e ligante, Descrição: Investigação e desenvolvimento de ferramentas para áre de modelagem de proteínas, utilizando algoritmos genéticos e redes neurais. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador.
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2004 - 2004
Desenvolvimento de um CD multimídia para ensino e treinamento de UML, Descrição: O porjeto consisitu na elbaoração de um CD muiltimídia que possa ser utilizado para o ensino e treinamento de UML. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Cleber Pressunto Fogo - Integrante., Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
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2003 - 2004
Desenvolvimento e Investigação de Ferramentas para Predição de Estruturas Protéicas, Descrição: Estudar ferramentas prontas e desenevolver softwrae utilizando redes neurais e algoritmos genéticos para predição de estrutura secundária e terciária de proteínas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / Luiz Henrique Boiago - Integrante / Sinval Jardineti - Integrante / Ellen Quirino de Fátima Silva - Integrante., Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
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2003 - 2003
Estudo e Avaliação de Ferramentas para Bioinformática, Descrição: Esse projeto visou estudar as ferramentas disponíveis para estudo de estruturas moleculares (principalmente proteínas) e realizar uma coparação e avaliação dessas ferramentas e desenvolver um CD educativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador / PATRÍCIA FERREIRA QUEIROZ - Integrante / LEONARDO BOTTARO - Integrante., Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
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2002 - 2003
Desenvolvimento de um Preditor de Estrutura Secundária de Proteínas, Descrição: Este projeto consiste no desenvolvimento de uma ferramenta, baseada em redes neurais artificiais, para realizar a predição de estrutura secundária de proteínas a partir da sequência primária das mesmas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração., Número de produções C, T & A: 3
Projetos de desenvolvimento
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Lígia Scott - Integrante / Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking, Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Ana Ligia Barbour Scott - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Não informado.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade Federal do ABC, Centro de Matemática, Computação e Cognição. , Avenida dos Estados, 5001, Santa Terezinha, 09210580 - Santo André, SP - Brasil, Telefone: (11) 49960041, Ramal: 0041, Fax: (11) 44361700, URL da Homepage:
Experiência profissional
2007 - Atual
Universidade Federal do ABCVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professora Titular, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Membro do Conselho Editorial da Editora da UFABC
Atividades
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06/2014
Direção e administração, Programa de Pos Graduaçao em Engenharia da Informaçao -UFABC.,Cargo ou função, Coordenador.
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02/2007
Pesquisa e desenvolvimento, Centro de Matemática, Computação e Cognição.,Linhas de pesquisa
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02/2007
Ensino, Bacharelado em Ciência e Tecnologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, lógica Computacional, Metodologia e Algoritmos Computacionais, Sistemas de Gerencimaento de Banco de dados
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08/2021 - 01/2023
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão de Políticas Afirmativas (CPAf).,Cargo ou função, Representante Docente do CMCC.
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04/2019 - 02/2021
Conselhos, Comissões e Consultoria, omissão Especial para Pessoas Transgêneras ? CEPT,.,Cargo ou função, Presidente.
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03/2019 - 02/2021
Conselhos, Comissões e Consultoria, Conselho do Centro de Matemática, Computação e Cognição.,Cargo ou função, Representante Docente.
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03/2017 - 01/2018
Conselhos, Comissões e Consultoria, Consuni.,Cargo ou função, Representante Docente.
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05/2012 - 01/2013
Direção e administração, Centro de Matemática, Computação e Cognição.,Cargo ou função, Coordeanador do Mestrado em Engenharia da Informação da UFABC.
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08/2008 - 12/2009
Direção e administração, Centro de Matemática, Computação e Cognição.,Cargo ou função, Diretor Adjunto.
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09/2008 - 12/2008
Ensino, Engenharia da Informação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Modelagm e Simulação de Sistemas
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02/2007 - 08/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão de Biblioteca da UFABC.,Cargo ou função, Representante do CMCC.
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07/2007 - 11/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão do BC&T.,Cargo ou função, Representante do CMCC.
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03/2007 - 07/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão do Bacharelado em Ciências da Computação.,Cargo ou função, Representante dos docentes.
2007 - Atual
Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio TeixeiraVínculo: Avaliador, Enquadramento Funcional: Avaliador Insitucional e de Curso
Atividades
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06/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, inep.,Cargo ou função, Avaliado Insitucional e de Curso.
2002 - 2007
Centro Universitário de VotuporangaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40
Atividades
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10/2005 - 01/2007
Direção e administração, Coordenação de Pós Graduação, Campus Centro.,Cargo ou função, Coordeandor de Pós-Graduação.
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01/2005 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comitê Executivo da Revista Científica Mosaico da Unifev, Campus Centro.,Cargo ou função, Membro do Comitê Executivo.
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10/2004 - 01/2007
Direção e administração, Coordenadoria de Pesquisa.,Cargo ou função, Coordenador de Pesquisa.
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10/2004 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comitê Científico.,Cargo ou função, Membro Presidente do Comitê Científico.
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05/2004 - 01/2007
Ensino, Redes de Computadores, Nível: Especialização,Disciplinas ministradas, Engenharia da Informação, Métodos e Técnicas de Pesquisa
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08/2002 - 01/2007
Ensino, Bacharel em Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Banco de Dados I, Banco de Dados II, Estrutura de Dados I, Estrutura de Dados II, Tópicos Avançados em Computação I, Tópicos Avançados em Computação II
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08/2004 - 12/2006
Ensino, Psicopedagogia, Nível: Especialização,Disciplinas ministradas, Métodos e Técnicas de Pesquisa
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08/2002 - 12/2006
Pesquisa e desenvolvimento, Curso de Engenharia de Computação, Campus Centro.,Linhas de pesquisa
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10/2006 - 10/2006
Extensão universitária , Campus Centro.,Atividade de extensão realizada, Organização do II Congresso de Iniciação Científica.
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01/2006 - 06/2006
Ensino, Mba Em Gestão da Produção, Nível: Especialização,Disciplinas ministradas, Métodos e Técnicas de Pesquisa
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11/2005 - 11/2005
Extensão universitária , Coordenadoria de Pesquisa, Campus Centro.,Atividade de extensão realizada, Organização do I Congresso de Iniciação Científica da UNIFEV.
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11/2005 - 11/2005
Extensão universitária , Coordenadoria de Pesquisa, Campus Centro.,Atividade de extensão realizada, Palestra: A importância da Iniciação Científica na Formação Acadêmica - I Congresso de Iniciação Científica.
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05/2005 - 05/2005
Extensão universitária , Depto de Ciências Exatas, Campus Centro.,Atividade de extensão realizada, Palestra "Bioinformática: Uma nova área da Bioinformática ", V Congresso de Computação.
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02/2003 - 11/2003
Extensão universitária , Depto de Ciências Exatas, Campus Centro.,Atividade de extensão realizada, INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA - MINICURSO.
2002 - 2004
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Professor MS-II, Carga horária: 24
Atividades
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08/2002 - 07/2004
Ensino, Bacharelado Em Ciências da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, ASPECTOS TEÓRICOS DA COMPUTAÇÃO E FUND. DE LINGUAGEM DE PROGRAMAÇÃO, COMPLEXIDADE DE ALGORITMOS, COMPUTABILIDADE, LINGUAGENS FORMAIS E AUTÔMATOS
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02/2002 - 05/2004
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Ciência da Computação e Estatística.,Linhas de pesquisa
2017 - 2017
École Normale Supérieure de Cachan, ENS/CachanVínculo: CONVIDADO, Enquadramento Funcional: Professor Visitante
Outras informações:
Sem Vinculo Empregaticio
2020 - 2020
Ecole Normale Supériore Paris-SaclayVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professos Visitante no Exterior Senior, Carga horária: 40
Outras informações:
Bolsa pesquisador Senior Visitante - Programa Capes-Print.
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