Patrícia Dayane Carvalho Schaker

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• BORGO, LUCÉLIA ; RABÊLO, FLÁVIO HENRIQUE SILVEIRA ; BUDZINSKI, ILARA GABRIELA FRASSON ; CATALDI, THAÍS REGIANI ; RAMIRES, THIAGO GENTIL ; SCHAKER, PATRICIA DAYANE CARVALHO ; RIBAS, ALESSANDRA FERREIRA ; LABATE, CARLOS ALBERTO ; LAVRES, JOSÉ ; CUYPERS, ANN ; AZEVEDO, RICARDO ANTUNES . Proline Exogenously Supplied or Endogenously Overproduced Induces Different Nutritional, Metabolic, and Antioxidative Responses in Transgenic Tobacco Exposed to Cadmium. JOURNAL OF PLANT GROWTH REGULATION , v. xx, p. xx, 2021.

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• DOS SANTOS, ÍRIA GABRIELA DIAS ; DE OLIVEIRA MENDES, TIAGO ANTÔNIO ; SILVA, GERLUZA APARECIDA BORGES ; REIS, AMANDA MARIA SENA ; MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS ; SCHAKER, PATRICIA DAYANE CARVALHO ; HERAI, ROBERTO HIROCHI ; FABOTTI, ANDRÉ BRAIT CARNEIRO ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; JORGE, ERIKA CRISTINA . Didelphis albiventris: an overview of unprecedented transcriptome sequencing of the white-eared opossum. BMC GENOMICS , v. 20, p. 1-20, 2019.

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• HOFF-RISSETI, C. ; SCHAKER, P. D. C. ; FIORE, M. F. . Detecção de genes envolvidos na biossintese de cilindrospermopsina e saxitoxina em isolados brasileiros de Cilindrospermopsis raciborskii. In: 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia -CBM 2011, 2011, Foz do Iguaçu. Anais do 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.

• Silva, G. A. da ; SCHAKER, P. D. C. ; MENEGOTTO, M. ; BERNARDI, T.L. . Avaliação do sistema comercial CandiFast para identificação de leveduras isoladas do mosto de uvas brancas e tintas.. In: Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, 2010, Salvador. Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, 2010.

• BERNARDI, T.L. ; SCHAKER, P. D. C. ; TODESCHINI, A. P. ; VALENTE, P. ; Silva, G. A. da . Ação do ácido gálico e da catequina na inibição da Reação em Cadeia da Polimerase. In: 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010, Bento Gonçalves. 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010.

• TODESCHINI, A. P. ; BERNARDI, T.L. ; SCHAKER, P. D. C. ; Silva, G. A. da . Ação dos princípios ativos Tebocunazol e Tetraconazol sobre a atividade metabólica da linhagem Saccharomyces cerevisiae Embrapa 1vvt/97. In: 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010, Bento Gonçalves. 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010.

• SCHAKER, P. D. C. ; BERNARDI, T.L. ; MENEGOTTO, M. ; Silva, G. A. da . Capacidade de fermentação e assimilação da xilose por parte de linhagens de micro-organismos isolados do solo. In: 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010, Bento Gonçalves. 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010.

• SCHAKER, P. D. C. ; BERNARDI, T.L. ; TODESCHINI, A. P. ; Silva, G. A. da . Comportamento assimilativo da xilose e dextrose por parte de linhagens de micro-organismos selecionados. In: 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010, Bento Gonçalves. 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010.

• BERNARDI, T.L. ; SCHAKER, P. D. C. ; TODESCHINI, A. P. ; VALENTE, P. ; Silva, G. A. da . Uso da enzima Tth Polimerase para amplificação direta de DNA de leveduras contidas em vinho. In: 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010, Bento Gonçalves. 8 Encontro de Iniciação Científica e 4 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2010.

• Silva, G. A. da ; BERNARDI, T.L. ; SCHAKER, P. D. C. ; MELLO, L. M. R. de ; VALENTE, P. . Captan and Folpan inhibition of PCR amplification of a 375bp DNA fragment for the 18S region of Saccharomyces. In: 12th International Conference on Culture Collections, 2010, Florianópolis. Proceedings of the 12th International Conference on Culture Collections, 2010.

• G. A. da SILVA ; SCHAKER, P. D. C. . Influência do meio de cultivo no controle biológico de Botrytis cinerea. In: XI SICONBIOL-Simpósio de Controle Biológico, 2009, Bento Gonçalves. Anais do XI Simpósio de Controle Biológico, 2009.

• MENEGOTTO, M. ; SCHAKER, P. D. C. ; BERNARDI, T.L. ; G. A. da SILVA . Ação do Cabrio Top no crescimento celular em condições aeróbicas. In: 7 Encontro de Iniciação Cientifica e 3 Encontro de Pós-Graduandos Embrapa Uva e Vinho, 2009, Bento Gonçalves. 7 Encontro de Iniciação Cientifica e 3 Encontro de Pós-Graduandos Embrapa Uva e Vinho, 2009.

• SCHAKER, P. D. C. ; BERNARDI, T.L. ; MENEGOTTO, M. ; G. A. da SILVA . Efeito da aeração no processo de fermentação de xilose. In: 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009, Bento Gonçalves. 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009.

• SCHAKER, P. D. C. ; MENEGOTTO, M. ; BERNARDI, T.L. ; G. A. da SILVA . Influência do uso de culturas mistas no processo de fermentação de xilose. In: 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009, Bento Gonçalves. 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009.

• BERNARDI, T.L. ; SCHAKER, P. D. C. ; MENEGOTTO, M. ; G. A. da SILVA . Inibição da Reação em Cadeia da Polimerase por taninos do vinho. In: 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009, Bento Gonçalves. 7 Encontro de Iniciação Científica e 3 Encontro de Pós-graduandos da Embrapa Uva e Vinho, 2009.

• G. A. da SILVA ; SCHAKER, P. D. C. ; MENEGOTTO, M. ; BERNARDI, T.L. . Leveduras autóctones isoladas de uvas tintas com capacidade de utilizar xilose como fonte de carbono. In: XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009, Montevideo. XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009.

• G. A. da SILVA ; BERNARDI, T.L. ; MENEGOTTO, M. ; SCHAKER, P. D. C. ; VALENTE, P. . Inibição da Reação em Cadeia de Polimerase por compostos presentes no vinho. In: XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009, Montevideo. XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009.

• G. A. da SILVA ; MENEGOTTO, M. ; SCHAKER, P. D. C. ; BERNARDI, T.L. . Ação do Cabrio Top sobre o crescimento e atividade fermentativa da linhagem Saccharomyces cerevisiae Embrapa 1vvt/97. In: XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009, Montevideo. XII Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enologia, 2009.

• SCHAKER, P. D. C. ; M., L. ; Lerin, J. ; Hendges, M. ; ANTONIOLLI, L. R. . Pontos críticos de impacto em linhas de beneficiamento e classificação de maçãs. In: 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008, Bento Gonçalves. 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008.

• M., L. ; SCHAKER, P. D. C. ; Spagnol, F. ; ANTONIOLLI, L. R. . Influência da Altura de queda e da superfície de impacto na manifestação do dano mecânico em maçãs. In: 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008, Bento Gonçalves. 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008.

• Spagnol, F. ; SCHAKER, P. D. C. ; M., L. ; ANTONIOLLI, L. R. . Efeito dos fatores intrínsecos na susceptibilidade da maçãs 'Royal Gala' ao dano mecânico. In: 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008, Bento Gonçalves. 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008.

• Hendges, M. ; Steffens, C. ; ANTONIOLLI, L. R. ; Amarante, C. do ; SCHAKER, P. D. C. . Influência de diferentes intensidades de dano mecânico por impacto na qualidade pós-colheita da maçãs 'Royal Gala'. In: 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008, Bento Gançalves. 6 Encontro de Iniciação Científica da Embrapa Uva e Vinho, 2008.

• SCHAKER, PATRÍCIA DAYANE CARVALHO . Explorando dados ômicos para compreensão da interação planta-patógeno: caso do carvão da cana-de-açúcar. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SCHAKER, PATRICIA DAYANE CARVALHO . Biossegurança. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SCHAKER, P. D. C. . Montagem de genomas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Desenvolvimento de produtos à bases de Bioinoculantes e Biocarvão: da bioprospecção à formulação, Descrição: A agricultura é um setor de extrema importância para a economia do Brasil, destacando-se como um dos maiores produtores de grãos a nível mundial e figurando na vanguarda tecnológica neste âmbito. Os custos de produção no setor agroindustrial estão baseados em uma série de fatores, entre os quais a fertilização do solo contribui com grande parcela dos gastos. Além disso, os efeitos ambientais negativos causados pelo uso desses produtos são uma preocupação mundial, alavancando estudos para o uso de biofertilizantes. Nesse sentido, o setor de insumos agrícolas tenta se encaixar de modo a elevar essa produtividade lançando novos produtos no mercado como por exemplo, insumos biológicos, como o uso de cepas nodulantes para leguminosas, e outros que ainda podem ser melhor explorados. Sabe-se que as rizobactérias promotoras de crescimento em plantas (RPCPs) apresentam uma série de características que podem ser avaliadas in vitro como indicativo de potencial utilização como biofertilizantes. Ainda, as avaliações para se prospectar um produto comercial, envolvem a otimização da produção de biomassa utilizando preferencialmente matérias-primas de baixo custo e a avaliação do modo como as bactérias serão incorporadas no solo. Tendo em vista a diversidade microbiana existente e particular a cada espécie vegetal, o presente projeto, busca englobar as várias etapas do processo de obtenção de bioinoculantes, desde o isolamento de linhagens promissoras até os testes em plantas, com foco no aproveitamento de subprodutos agroindustriais. Ao final do projeto, espera-se obter novos isolados bacterianos caracterizados que apresentem mecanismos diretos e indiretos de promoção do crescimento vegetal, que poderão futuramente fazer parte de formulações de inoculantes agrícolas comerciais, especialmente voltados para espécies não leguminosas, e desenvolvimento de alternativas para produção de biomassa microbiana e veiculação de microrganismos no solo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Coordenador / PRISCILA VAZ DE ARRUDA - Integrante / Fabiano Bisinella Scheufele - Integrante.

• 2022 - Atual

  Bioinoculantes: Bioprospecção e Otimização do processo produtivo utilizando subprodutos agroindustriais, Descrição: A agricultura é um setor de extrema importância para a economia do Brasil, destacando-se como um dos maiores produtores de grãos a nível mundial e figurando na vanguarda tecnológica neste âmbito. A região oeste do Paraná apresenta o maior Valor Bruto de Produção Agropecuária (VBP) do estado, correspondendo a 23% dos 97,7 bilhões de reais faturados em 2019. Situado nesta região, o município de Toledo configura-se como o primeiro colocado em VBP estadual com um faturamento de R$ 2,68 bilhões. Neste contexto, é imprescindível se investir em pesquisas que possam desenvolver e elevar nossa produção para que se mantenha sempre em alto nível no cenário competitivo mundial. Os custos de produção no setor agroindustrial estão baseados em uma série de fatores, entre os quais a fertilização do solo contribui com grande parcela dos gastos. Além disso, os efeitos ambientais negativos causados pelo uso desses produtos são uma preocupação mundial, alavancando estudos para o uso de biofertilizantes. Nesse sentido, o setor de insumos agrícolas tenta se encaixar de modo a elevar essa produtividade lançando novos produtos no mercado como por exemplo, insumos biológicos, como o uso de cepas nodulantes para leguminosas, e outros que ainda podem ser melhor explorados. Sabe-se que as rizobactérias promotoras de crescimento em plantas (RPCPs) apresentam uma série de características que podem ser avaliadas in vitro como indicativo de potencial utilização como biofertilizantes, entre eles produção de hormônios vegetais, solubilização de fosfato, fixação de nitrogênio, produção de sideróforos e proteção contra patógenos. Ainda, as avaliações para se prospectar um produto comercial, envolvem a otimização da produção de biomassa utilizando preferencialmente matérias-primas de baixo custo, como subprodutos da atividade agroindustrial e a avaliação do modo como as bactérias serão incorporadas no solo. Tendo em vista a diversidade microbiana existente e particular a cada espécie vegetal, o presente projeto, busca englobar as várias etapas do processo de obtenção de bioinoculantes, desde o isolamento de linhagens promissoras até os testes em plantas, com foco no aproveitamento de subprodutos agroindustriais. Destaca-se o caráter inovador da presente proposta em relação à 1) seleção dos microrganismos com potencial de promoção do crescimento vegetal, 2) a obtenção de biomassa dos microrganismos promissores a partir de subprodutos agroindustriais, e 3) avaliação do uso de biocarvões como veículo para incorporação dos microrganismos no solo. Ao final do projeto, espera-se obter novos isolados bacterianos que apresentem mecanismos diretos e indiretos de promoção do crescimento vegetal, que poderão futuramente fazer parte de formulações de inoculantes agrícolas comerciais, especialmente voltados para espécies não leguminosas, e desenvolvimento de alternativas para produção de biomassa microbiana e veiculação de microrganismos no solo. Além disso, ressalta-se a interação do projeto com empresas da região, como o Biopark e a Cooperativa Coamo, as quais fornecerão os subprodutos das suas atividades para a avaliação de meios alternativos. Assim, o reaproveitamento de subprodutos oriundos das cadeias produtivas representa uma cadeia sustentável, permitindo um equilíbrio entre produção e qualidade ambiental, além de sua conversão em produtos de valor agregado, como os bioinoculantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Coordenador / PRISCILA VAZ DE ARRUDA - Integrante / JONES ERNI SCHMITZ - Integrante / Luis F. M. Figueiredo - Integrante / Fabiano Bisinella Scheufele - Integrante.

• 2018 - Atual

  Prospecção de microrganismos promotores de crescimento em plantas e agentes de controle de fitopatógenos: em busca de alternativas para produção agrícola sustentável, Descrição: Atualmente um dos maiores desafios a curto e longo prazo para a agricultura é o desenvolvimento de processos de produção sustentáveis, ambientalmente seguros e que abasteçam a demanda de alimentos e energia de uma população que cresce exponencialmente. Uma das possibilidades de avanço nesse sentido é a exploração dos microrganismos associados às plantas. Baseando-se nas interações entre plantas e microrganismos é possível desenvolver inoculantes microbianos que atuem como biofertilizantes, fortalecedores vegetais, fitoestimulantes e agentes de biocontrole de patógenos, um mercado que apresenta crescimentos da ordem de 10% anuais em todo o mundo. Nesse contexto, muito da diversidade microbiana ainda pode ser explorada, especialmente para expansão da sua aplicação em culturas não leguminosas, e dando aporte à agricultura orgânica voltada especialmente para os pequenos produtores e agricultura familiar. A rizosfera é o principal microambiente vegetal colonizado por microrganismos benéficos às plantas, e corresponde ao solo associado às raízes, se estendendo alguns milímetros da sua superfície. Essa região do solo abriga uma comunidade microbiana rica e complexa. Um grupo especial de microrganismos que colonizam as raízes de plantas são as chamadas rizobactérias, atuando no estímulo do crescimento vegetal de forma direta pela produção de fitohormônios, fixação biológica de nitrogênio, síntese de sideróforos, solubilização de fosfato, entre outros. De forma indireta, o benefício das rizobactérias pode se dar pela ação antagonista a fitapatógenos de solo, seja pela produção de antibióticos, sideróforos, enzimas hidrolíticas, entre outros. O objetivo deste projeto é isolar e caracterizar rizobactérias presentes em diferentes espécies vegetais, cultivados em sistemas orgânicos, que apresentem potencial para promoção de crescimento de plantas e controle de fitopatógenos de solo. Para isto, será estabelecida uma coleção de microrganismos isolados da rizosfera de diferentes espécies vegetais. Esses microrganismos serão avaliados em relação à potencialidade de promover o crescimento de plantas utilizando diversos testes in vitro, como produção de ácido indol acético (AIA), fixação biológica do nitrogênio, solubilização de fosfato e produção de sideróforos, afim de selecionar os mais promissores para promoção do crescimento de plantas. Os isolados serão avaliados em relação à capacidade de controle de fungos fitopatogênicos. Os isolados mais promissores serão identificados por técnicas de biologia molecular e sua atuação no crescimento de plantas avaliados em ensaios com diferentes espécies vegetais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Coordenador / HUIGOR NATAN GENTIL - Integrante / BRAHMS RAYMUNDO - Integrante.

• 2017 - Atual

  Estudos genômicos e funcionais da interação Sporisorium scitamineum-cana e de outros fungos causadores do carvão: avanços e desafios, Descrição: Sporisorium scitamineum é o agente causal da doença conhecida como carvão da cana-de-açúcar, identificada em todas as regiões de cultivo da cana no mundo. As características da interação com a cana-de-açúcar são únicas, pois culminam com a formação de uma estrutura em forma de chicote a partir do meristema apical da cana. Esta estrutura composta de células da planta e do fungo (smut whip) é o local da esporogênese do patógeno. A disseminação dos esporos é rápida no campo se a planta infectada não for erradicada. Os métodos para conter a doença dependem de variedades resistentes e técnicas de manejo. Vários grupos de pesquisa têm estudado os principais mecanismos de defesa da cana ativados durante a interação. Porém, mesmo variedades consideradas altamente resistentes são colonizadas pelo fungo e podem eventualmente desenvolver o chicote, o que mostra a complexidade desse patossistema e da sinalização envolvida no desenvolvimento dos sintomas. Este projeto tem como objetivo dar continuidade aos estudos sobre a interação cana-Sporisorium com cinco focos principais: 1) identificar as proteínas de parede celular, apoplasto e membrana da célula vegetal responsivas à presença do patógeno de maneira comparativa aos resultados obtidos anteriormente (Schaker et al., 2016; Schaker et al., 2017; Schaker et al., manuscrito em preparação sobre proteômica total); 2) a análise funcional de genes candidatos a análogos de resistência (RGAs) identificados em projeto anterior (Schaker et al., 2016); 3) análise funcional do metabolismo de ROS em canas resistentes ao carvão, de forma a identificar respostas comuns às verificada em trabalho anterior (Peters et al., 2016); 4) estudos funcionais de efetores candidatos selecionados anteriormente (Taniguti et al., 2015; Benevenuto et al., em preparação); e 5) estudos de genômica comparativa sobre a contribuição dos elementos transponíveis na evolução das espécies de carvão. Todos os objetivos desde projeto visam aprofundar o entendimento da biologia da interação de forma que candidatos bem definidos relacionados à resistência da cana a doenças possam ser indicados para utilização no manejo ou em programas de melhoramento genético.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Coordenador / Natalia Teixeira-Silva - Integrante.

• 2015 - 2017

  Ligando os fatos sobre a interação molecular da cana-de-açúcar e o fungo biotrófico patogênico Sporisorium scitamineum, causador do carvão da cana, Descrição: Sporosorium scitamineum é o agente causal da doença conhecida como carvão da cana-de-açúcar. O carvão é uma das doenças danosas ao cultivo da cana-de-açúcar e ocorre praticamente em todos os países produtores. É caracterizada por inutilizar os colmos, deixando-os em condições inadequadas para serem industrializados, reduzindo biomassa e a produção de açúcar e etanol. S. scitamineum é um fungo basideomiceto, dimórfico e biotrófico. As características da interação com a cana-de-açúcar são únicas, pois a planta e o patógeno desenvolveram uma relação próxima que culmina na formação de uma estrutura em forma de chicote composta de tecidos da planta e do fungo que abrigam os milhões de esporos de resistência do fungo. Essa interação é parte integrante do ciclo de vida do fungo, que só é infeccioso durante a formação de uma hifa dicariótica e reprodução sexuada no hospedeiro. A disseminação dos esporos é rápida no campo se a planta infectada não for erradicada. Os métodos para conter a doença dependem de variedades resistentes e técnicas de manejo para a retirada das plantas infectadas no campo. O objetivo geral deste projeto é de ligar os fatos disponíveis na literatura aos dados obtidos em nossos projetos anteriores com relação a relevância de algumas das fases associadas a resistência e susceptibilidade da cana ao carvão: defesa pré-formada, defesa induzida, e modificações no transcriptoma da cana quanto ao metabolismo de açúcares e hormônios vegetais durante o desenvolvimento do fungo. Os experimentos serão conduzidos com base nos resultados de análises de transcriptômica realizadas anteriormente e de proteômica e metabolômica que integram esta proposta. A defesa pré-formada está associada aos metabólitos de folhas modificadas que protegem a região meristemática em variedades com níveis variáveis de resistência; o estresse oxidativo e proteínas kinases LRR serão alvos de análise quantitativa da expressão gênica na resposta induzida; e os genes associados ao metabolismo de açúcares e relacionados a síntese e regulação hormonal durante o desenvolvimento da planta da mesma forma analisados. Novos candidatos serão selecionados com base na metabolômica e proteômica e todos os dados serão integrados aqueles encontrados na literatura de forma a proporcionar um panorama mais acurado do que acontece in vivo durante a interação molecular cana-S. scitamineum. Considerando ainda a interação, um estudo visando o entendimento sobre a variabilidade populações do patógeno foi iniciado em projeto anterior (PROJETO FAPESP N. 2010/05591-9). Neste projeto propomos a expansão dessas análises a espécies causadoras de carvão em outras gramíneas e de relevância para o Brasil fazendo uso das tecnologias de sequenciamento de nova geração.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Coordenador.

• 2015 - 2017

  Análise compreensiva da interação molecular entre a cana-de-açúcar e o patógeno do carvão, Descrição: O Brasil é referência no desenvolvimento de variedades e uso comercial da cana-de-açúcar, e também na geração de energia a partir da sua biomassa. A produção de cana dos últimos anos vem se mantendo ao redor de 600 milhões de toneladas em uma área plantada de aproximadamente 10 milhões de hectares. Dentre os fatores que resultam em redução na produção da cana, de biomassa e de seus subprodutos, estão as perdas ocasionadas por doenças. No Brasil, dentre os patógenos fúngicos, além da ferrugem alaranjada, que recentemente acometeu os canaviais, o carvão da cana, causado pelo basidiomiceto Sporisorium scitamineum, é uma preocupação constante dos produtores e de programas de melhoramento. Apesar de controlada, a doença vem se mantendo em baixos níveis em todas as regiões de cultivo, mesmo com o uso de variedades comerciais consideradas resistentes. No entanto, com o aumento das áreas plantadas, mudanças climáticas inesperadas e o término das queimadas durante os ciclos sucessivos da cultura, previsto para 2017; o acúmulo de inóoculo (esporos do fungo) no campo aliado às condições edafoclimáticas favoráveis para a propagação da doença poderiam retornar ao quadro preocupante da década de 80 onde aconteceram as maiores epidemias de carvão no Brasil. Plantas de cana infectadas por S. scitamineum apresentam modificações metabólicas profundas, que levam a emissão de uma estrutura em forma de chicote composta por tecidos vegetais e do fungo. Nesta estrutura ocorre a esporogênese do fungo e a produção de milhões de esporos que são disseminados facilmente pelo vento no campo. A doença é ainda caracterizada pelo aumento de tecido fibroso e diminuição do conteúdo de sacarose e de perfilhos industrializáveis. Análises do perfil transcricional da planta e do fungo (dual transcriptome) realizadas pelo nosso grupo de trabalho mostraram que em plantas infectadas, o fluxo de carbono da cana pode estar sendo desviado para outras rotas que não o acúmulo de sacarose, o que é consistente com os sintomas da doença. Atualmente, as análises integradas entre perfis de expressão gênica, perfis protéicos e perfis metabólicos são reconhecidas como ferramentas poderosas para a biotecnologia, por disponibilizar cenários muito mais próximos da verdadeira complexidade dos sistemas vivos. Desta forma, um estudo aprofundado das redes metabólicas e suas alterações em resposta a este estímulo biótico pode favorecer a descoberta de novos conhecimentos sobre a fisiologia da planta e sobre os mecanismos inerentes a esta interação planta-patógeno, como por exemplo, a resistência interna. O objetivo deste trabalho é obter os perfis proteicos e metabólicos em diferentes fases da interação planta-patógeno e analisá-los de maneira integrada aos dados obtidos previamente pela transcriptômica. O conhecimento sobre a modulação do metabolismo da sacarose in vivo pode gerar insights que levem a sua utilização em processos biotecnológicos e na manipulação genética dessas vias. Desta forma, compreender os mecanismos associados à interação cana-Sporisorium pode trazer informações relevantes que permitam tanto identificar biomarcadores a serem utilizados em programas de melhoramento, bem como fornecer subsídios para um manejo integrado mais eficiente da doença.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Coordenador / Giselle de Carvalho - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2017

  Estudo da modulação do metabolismo da cana-de-açúcar pelo fungo fitopatogênico Sporisorium scitamineum, Descrição: A cana-de-açúcar é cotada atualmente como uma das principais fontes de biomassa energética. Neste sentido, a partição do carbono obtido durante a fotossíntese é fundamental para gerar altas concentrações de sacarose no colmo da planta. Esta distribuição pode ser afetada por diversos fatores inerentes ou não à planta, como a idade e a presença de patógenos, respectivamente. O fungo patogênico Sporisorium scitamineum estabelece uma relação biotrófica com a cana-de-açúcar, causando a doença conhecida como carvão da cana, caracterizada pela formação de uma estrutura na forma de chicote. Dados de sequenciamento de transcritos (RNAseq) da interação cana-de-açúcar e S. scitamineum mostram que a presença do fungo causa mudanças na expressão de genes relacionados com o metabolismo primário e secundário da planta, incluindo a síntese de sacarose, celulose, amido, xilose, lignina e fitohormônios. No entanto, alterações nos níveis de mRNA nem sempre se correlacionam diretamente a alterações de mesmo grau nas respectivas proteínas e metabólitos, e consequentemente no fenótipo bioquímico da planta. Desta forma, o objetivo deste projeto é investigar como o fungo fitopatogênico S. scitamineum modula o metabolismo da cana-de-açúcar e influencia na partição do carbono entre intermediários das principais vias bioquímicas da planta durante o desenvolvimento da doença. Para tanto, será utilizada uma variedade de cana-de-açúcar bioquimicamente susceptível (RB925345) da qual serão obtidos perfis de metabólitos e proteínas em diferentes momentos do desenvolvimento da planta, e consequentemente da doença. A partir dos dados gerados serão selecionados genes envolvidos nas vias metabólicas reguladas pela presença do fungo e suas respectivas expressões serão acompanhadas durante o desenvolvimento da doença utilizando a técnica de qRT-PCR. Com os resultados obtidos espera-se traçar um panorama das mudanças metabólicas ocasionadas pela presença de um patógeno biotrófico na cana-de-açúcar e disponibilizar novas informações sobre os mecanismos inerentes à interação planta-patógeno.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Coordenador.

• 2007 - 2008

  Inovações tecnológicas para a modernização do setor da maçã - INOVAMAÇÃ, Descrição: O projeto está estruturado em três temas, envolvendo 13 atividades. Tema 1: Proteção vegetal Tema 2: Inovaçõe tecnológicas para pomares de qualidade Tema 3: Fisiologia vegetal e tecnologia pós-colheita. Objetivo: desenvolvimento e implementação de tecnologias para contribuir para a modernização do setor da maçã e sua adequação aos cenários futuros. Para isto serão desenvolvidas ações no sentido de: gerar conhecimentos básicos sobre a fisiologia da macieira usando técnicas de biotecnologia, organizar os bancos de dados disponíveis no setor da maçã e transformar essas informações em instrumentos para apoio a tomada de decisões pelos técnicos e produtores, validar nas principais áreas produtoras de maçã as técnicas disponibilizadas pela pesquisa, contribuir para a melhoria domanejo de pomares estabelecidos em alta densidade, diminuir as perdas nos pomares e em pós-colheita e racionalizar o uso de agrotóxicos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Patricia Dayane Carvalho Schaker - Integrante / Lucimara Rogéria Antoniolli - Integrante / Gilmar Ribeiro Nachtigall - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

Prêmios