Vinícius Almir Weiss

Pós-doutorado

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Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• MORENO, LEANDRO FERREIRA ; MENEZES DA SILVA, NICKOLAS ; Weiss, Vinicius Almir ; DE FÁTIMA COSTA, FLAVIA ; BITTENCOURT, JULIANA V. ; MACEDO, LUCIANO MEDINA ; GOMES, RENATA R. ; Souza, Emanuel M. ; VICENTE, VANIA APARECIDA ; STIELOW, BENJAMIN ; DE HOOG, SYBREN . Genome Sequence of the Human Opportunistic Fungus Arthrocladium fulminans (CBS 136243). G3-Genes Genomes Genetics , v. 10, p. 1817-1821, 2020.

• SONG, YINGGAI ; DA SILVA, NICKOLAS MENEZES ; Weiss, Vinicius Almir ; VU, DUONG ; MORENO, LEANDRO F. ; VICENTE, VANIA APARECIDA ; LI, RUOYU ; DE HOOG, G. SYBREN . Comparative Genomic Analysis of Capsule-Producing Black Yeasts Exophiala dermatitidis and Exophiala spinifera, Potential Agents of Disseminated Mycoses. Frontiers in Microbiology , v. 11, p. 586, 2020.

• COSTA, FLÁVIA DE FÁTIMA ; DA SILVA, NICKOLAS MENEZES ; VOIDALESKI, MORGANA FERREIRA ; Weiss, Vinicius Almir ; MORENO, LEANDRO FERREIRA ; SCHNEIDER, GABRIELA XAVIER ; NAJAFZADEH, MOHAMMAD J. ; SUN, JIUFENG ; GOMES, RENATA RODRIGUES ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; CASTRO, MAURO ANTONIO ALVES ; DE MUNIZ, GRACIELA BOLZÓN INEZ ; DE HOOG, G. SYBREN ; VICENTE, VANIA APARECIDA . Environmental prospecting of black yeast-like agents of human disease using culture-independent methodology. Scientific Reports , v. 10, p. 14229, 2020.

• SANTOS, DANIEL WAGNER C. L. ; VICENTE, VANIA APARECIDA ; Weiss, Vinicius Almir ; DE HOOG, G. SYBREN ; GOMES, RENATA R. ; BATISTA, EDITH M. M. ; MARQUES, SIRLEI GARCIA ; QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO DE ; COLOMBO, ARNALDO LOPES ; AZEVEDO, CONCEIÇÃO DE MARIA PEDROZO E SILVA DE . Chromoblastomycosis in an Endemic Area of Brazil: A Clinical-Epidemiological Analysis and a Worldwide Haplotype Network. JOURNAL OF FUNGI , v. 6, p. 204, 2020.

• PREDIGER, KAROLINE DE C. ; DALLAGASSA, CIBELLE B. ; MORIEL, BÁRBARA ; VIZZOTTO, BRUNO STEFANELLO ; VOLANSKI, WALDEMAR ; Souza, Emanuel M. ; Pedrosa, Fábio O. ; Weiss, Vinícius ; ALBERTON, DAYANE ; GUIZELINI, DIEVAL ; FADEL-PICHETH, CYNTIA M. T. . Virulence characteristics and antimicrobial resistance of Aeromonas veronii biovar sobria 312M, a clinical isolate. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 51, p. 511-518, 2020.

• Faoro, Helisson ; OLIVEIRA, WILLIAN K. ; Weiss, Vinicius A. ; Tadra-Sfeir, Michelle Z. ; CARDOSO, RODRIGO L. ; Balsanelli, Eduardo ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE C. C. ; CAMILIOS-NETO, DOUMIT ; Cruz, Leonardo M. ; Raittz, Roberto T. ; MARQUES, ANA C. Q. ; LIPUMA, JOHN ; FADEL-PICHETH, CYNTIA M. T. ; Souza, Emanuel M. ; PEDROSA, FABIO O. . Genome comparison between clinical and environmental strains of Herbaspirillum seropedicae reveals a potential new emerging bacterium adapted to human hosts. BMC GENOMICS , v. 20, p. 1-15, 2019.

• DALLAGASSA, CIBELLE B. ; SUREK, MONICA ; VIZZOTTO, BRUNO S. ; PREDIGER, KAROLINE C. ; MORIEL, BÁRBARA ; WOLF, SUÉLEN ; Weiss, Vinícius ; Cruz, Leonardo M. ; ASSIS, FLÁVIA E.A. ; PALUDO, KATIA S. ; REGO, FABIANE G.M. ; FARAH, SÔNIA M.S.S. ; PICHETH, GERALDO ; Souza, Emanuel M. ; Pedrosa, Fábio O. ; Chubatsu, Leda S. ; FADEL-PICHETH, CYNTIA M.T. . Characteristics of an Aeromonas trota strain isolated from cerebrospinal fluid. MICROBIAL PATHOGENESIS , v. 116, p. 109-112, 2018.

• LEAO, ANIELE C. RIBAS ; WEISS, VINICIUS ALMIR ; VICENTE, VANIA APARECIDA ; COSTA, FLAVIA ; BOMBASSARO, AMANDA ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; Steffens, Maria Berenice R. ; PEDROSA, FABIO OLIVEIRA ; GOMES, RENATA R. ; BAURA, VALTER ; Faoro, Helisson ; SFEIR, MICHELLE ZIBETTI TADRA ; Balsanelli, Eduardo ; MORENO, LEANDRO F. ; NAJAFZADEH, M. JAVAD ; DE HOOG, SYBREN ; SOUZA, EMANUEL MALTEMPI . Genome Sequence of Type Strain Fonsecaea multimorphosa CBS 980.96 T , a Causal Agent of Feline Cerebral Phaeohyphomycosis. Genome Announcements , v. 5, p. e01666-16, 2017.

• MORENO, LEANDRO FERREIRA ; FENG, PEIYING ; WEISS, VINICIUS ALMIR ; VICENTE, VANIA APARECIDA ; STIELOW, J. BENJAMIN ; DE HOOG, SYBREN . Phylogenomic analyses reveal the diversity of laccase-coding genes in Fonsecaea genomes. Plos One , v. 12, p. e0171291, 2017.

• VICENTE, VANIA A. WEISS, VINÍCIUS A. BOMBASSARO, AMANDA MORENO, LEANDRO F. COSTA, FLÁVIA F. Raittz, Roberto T. LEÃO, ANIELE C. GOMES, RENATA R. BOCCA, ANAMELIA L. FORNARI, GHENIFFER DE CASTRO, RAFFAEL J. A. SUN, JIUFENG Faoro, Helisson Tadra-Sfeir, Michelle Z. BAURA, VALTER Balsanelli, Eduardo ALMEIDA, SANDRO R. DOS SANTOS, SUELEN S. TEIXEIRA, MARCUS DE MELO SOARES FELIPE, MARIA S. DO NASCIMENTO, MARIANA MACHADO FIDELIS PEDROSA, FABIO O. STEFFENS, MARIA B. ATTILI-ANGELIS, DERLENE NAJAFZADEH, MOHAMMAD J. , et al. QUEIROZ-TELLES, FLÁVIO Souza, Emanuel M. DE HOOG, SYBREN ; Comparative Genomics of Sibling Species of Fonsecaea Associated with Human Chromoblastomycosis. Frontiers in Microbiology , v. 8, p. 1924, 2017.

• BOMBASSARO, AMANDA ; DE HOOG, SYBREN ; Weiss, Vinicius A. ; Souza, Emanuel M. ; LEÃO, ANIELE C. R. ; COSTA, FLÁVIA F. ; BAURA, VALTER ; TADRA-SFEIR, MICHELE Z. ; Balsanelli, Eduardo ; MORENO, LEANDRO F. ; Raittz, Roberto T. ; Steffens, Maria Berenice R. ; PEDROSA, FABIO O. ; SUN, JIUFENG ; XI, LIYAN ; BOCCA, ANAMÉLIA L. ; FELIPE, MARIA S. ; TEIXEIRA, MARCUS ; SANTOS, GERMANA D. ; TELLES FILHO, FLÁVIO Q. ; AZEVEDO, CONCEIÇÃO M. P. S. ; GOMES, RENATA R. ; VICENTE, VÂNIA A. . Draft Genome Sequence of Strain CBS 269.37, an Agent of Human Chromoblastomycosis. Genome Announcements , v. 4, p. e00731-16, 2016.

• COSTA, FLÁVIA F. ; DE HOOG, SYBREN ; Raittz, Roberto T. ; Weiss, Vinicius A. ; LEÃO, ANIELE C. R. ; BOMBASSARO, AMANDA ; SUN, JIUFENG ; MORENO, LEANDRO F. ; Souza, Emanuel M. ; PEDROSA, FABIO O. ; Steffens, Maria Berenice R. ; BAURA, VALTER ; TADRA-SFEIR, MICHELE Z. ; Balsanelli, Eduardo ; NAJAFZADEH, M. JAVAD ; GOMES, RENATA R. ; FELIPE, MARIA S. ; TEIXEIRA, MARCUS ; SANTOS, GERMANA D. ; XI, LIYAN ; ALVES DE CASTRO, MAURO ANTÔNIO ; VICENTE, VÂNIA A. . Draft Genome Sequence of Fonsecaea nubica Strain CBS 269.64, Causative Agent of Human Chromoblastomycosis. Genome Announcements , v. 4, p. e00735-16, 2016.

• GUIZELINI, DIEVAL ; SAIZAKI, PAULA M. ; COIMBRA, NILSON A. R. ; Weiss, Vinicius A. ; Faoro, Helisson ; SFEIR, MICHELLE Z. T. ; Baura, Valter A. ; Monteiro, Rose A. ; Chubatsu, Leda S. ; Souza, Emanuel M. ; Cruz, Leonardo M. ; PEDROSA, FABIO O. ; Raittz, Roberto T. ; MARCHAUKOSKI, JERONIZA N. ; STEFFENS, MARIA B. R. . Complete Genome Sequence of Herbaspirillum hiltneri N3 (DSM 17495), Isolated from Surface-Sterilized Wheat Roots. Genome Announcements , v. 3, p. e01288-15, 2015.

• MORENO, LEANDRO F. ; STIELOW, J. BENJAMIN ; DE VRIES, MICHEL ; Weiss, Vinicius A. ; VICENTE, VANIA A. ; DE HOOG, SYBREN . Draft Genome Sequence of the Ant-Associated Fungus Phialophora attae (CBS 131958). Genome Announcements , v. 3, p. e01099-15, 2015.

• Tadra-Sfeir, Michelle Z. ; Faoro, Helisson ; CAMILIOS-NETO, DOUMIT ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE ; Balsanelli, Eduardo ; Weiss, Vinicius ; Baura, Valter A. ; Wassem, Roseli ; Cruz, Leonardo M. ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FÁBIO ; Souza, Emanuel M. ; Monteiro, Rose A. . Genome wide transcriptional profiling of Herbaspirillum seropedicae SmR1 grown in the presence of naringenin. Frontiers in Microbiology (Online) , v. 6, p. 1-8, 2015.

• PIRO, VITOR C ; Faoro, Helisson ; WEISS, VINICIUS A ; STEFFENS, MARIA BR ; PEDROSA, FABIO O ; SOUZA, EMANUEL M ; RAITTZ, ROBERTO T . FGAP: an automated gap closing tool. BMC Research Notes , v. 7, p. 371, 2014.

• CAMILIOS-NETO, DOUMIT ; BONATO, PALOMA ; Wassem, Roseli ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE CC ; VALDAMERI, GLAUCIO ; DONATTI, LUCÉLIA ; Faoro, Helisson ; WEISS, VINICIUS A ; CHUBATSU, LEDA S ; PEDROSA, FÁBIO O ; SOUZA, EMANUEL M . Dual RNA-seq transcriptional analysis of wheat roots colonized by Azospirillum brasilense reveals up-regulation of nutrient acquisition and cell cycle genes. BMC Genomics , v. 15, p. 378, 2014.

• DE SOUZA, V. ; PIRO, V. C. ; FAORO, H. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; CHICORA, V. K. ; GUIZELINI, D. ; WEISS, V. ; VIALLE, R. A. ; Monteiro, R. A. ; Steffens, M. B. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; Pedrosa, F. O. ; CRUZ, L. M. ; Chubatsu, L. S. ; Raittz, R. T. . Draft Genome Sequence of Herbaspirillum huttiense subsp. putei IAM 15032, a Strain Isolated from Well Water. Genome Announcements , v. 1, p. e00252-12-e00252-12, 2013.

• Monteiro, Rose A. ; Balsanelli, Eduardo ; Tuleski, Thalita ; Faoro, Helison ; Cruz, Leonardo M. ; Wassem, Roseli ; Baura, Valter A. ; Tadra-Sfeir, Michelle Z. ; Weiss, Vinícius ; DaRocha, Wanderson D. ; Muller-Santos, Marcelo ; Chubatsu, Leda S. ; Huergo, Luciano F. ; Pedrosa, Fábio O. ; Souza, Emanuel M. . Genomic comparison of the endophyte Herbaspirillum seropedicae SmR1 and the phytopathogen Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 by Suppressive Subtractive Hybridization and partial genome sequencing. FEMS Microbiology, Ecology (Print) , v. xx, p. n/a-n/a, 2012.

• Schmidt, Maria A ; Balsanelli, Eduardo ; Pereira-Ferrari, Lilian ; Fungaro, Maria H P ; de Paula, Francine M ; Pereira, Luiz F P ; Vieira, Luiz G E ; Olivares, F bio L ; Pedrosa, F bio O ; de Souza, Emanuel M ; Monteiro, Rose A ; Yates, Marshall G ; Cruz, Leonardo M ; Faoro, Helisson ; de Baura, Valter A ; Wassem, Roseli ; Weiss, Vinicius ; Madeira, Humberto M F . The type III secretion system is necessary for the development of a pathogenic and endophytic interaction between Herbaspirillum rubrisubalbicans and Poaceae. BMC Microbiology (Online) , v. 12, p. 98, 2012.

• WEISS, V. A. ; FAORO, H. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; RAITTZ, R. T. ; DE SOUZA, E. M. ; MONTEIRO, R. A. ; CARDOSO, R. L. A. ; WASSEM, R. ; CHUBATSU, L. S. ; HUERGO, L. F. ; MULLER-SANTOS, M. ; STEFFENS, M. B. R. ; RIGO, L. U. ; PEDROSA, F. D. O. ; CRUZ, L. M. . Draft Genome Sequence of Herbaspirillum lusitanum P6-12, an Endophyte Isolated from Root Nodules of Phaseolus vulgaris. Journal of Bacteriology (Print) , v. 194, p. 4136-4137, 2012.

• Pedrosa, Fábio O. Monteiro, Rose Adele Wassem, Roseli Cruz, Leonardo M. Ayub, Ricardo A. Colauto, Nelson B. Fernandez, Maria Aparecida Fungaro, Maria Helena P. Grisard, Edmundo C. Hungria, Mariangela Madeira, Humberto M. F. Nodari, Rubens O. Osaku, Clarice A. Petzl-Erler, Maria Luiza Terenzi, Hernán Vieira, Luiz G. E. Steffens, Maria Berenice R. WEISS, V. A. Pereira, Luiz F. P. Almeida, Marina I. M. Alves, Lysangela R. Marin, Anelis Araujo, Luiza Maria Balsanelli, Eduardo Baura, Valter A. , et al. Chubatsu, Leda S. Faoro, Helisson Favetti, Augusto Friedermann, Geraldo Glienke, Chirlei Karp, Susan Kava-Cordeiro, Vanessa Raittz, Roberto T. Ramos, Humberto J. O. Ribeiro, Enilze Maria S. F. Rigo, Liu Un Rocha, Saul N. Schwab, Stefan Silva, Anilda G. Souza, Eliel M. ; Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. PLOS Genetics (Online) , v. 7, p. e1002064, 2011.

• Beneduzi, A. ; Campos, S. ; Ambrosini, A. ; de Souza, R. ; Granada, C. ; Costa, P. ; ARRUDA, L. ; Moreira, F. ; VARGAS, L. K. ; WEISS, V. A. ; Tieppo, E. ; FAORO, H. ; de Souza, E. M. ; Pedrosa, F. O. ; Passaglia, L. M. P. . Genome Sequence of the Diazotrophic Gram-Positive Rhizobacterium Paenibacillus riograndensis SBR5T. Journal of Bacteriology (Print) , v. 193, p. 6391-6392, 2011.

• Cruz, Leonardo Magalhães ; Trefflich, Sheyla ; Weiss, Vinícius Almir ; Castro, Mauro Antônio Alves . Protein Function Prediction. Methods in Molecular Biology. 3ed.: Springer New York, 2017, v. 1654, p. 55-75.

• CARDOSO, R. L. A. ; Weiss, Vinícius ; Faoro, Helison ; Balsanelli, Eduardo ; Monteiro, R. A. ; Chubatsu, L. S. ; Huergo, Luciano F. ; Wassem, Roseli ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; Steffens, Maria Berenice R. ; Muller-Santos, Marcelo ; Rigo, L. U. ; Pedrosa, F. O. ; Souza, Emanuel M. ; Cruz, Leonardo M . Evolutionary relationship within the genus Herbaspirillum. In: XLII Annual Meeting of SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. Anais do XLII Annual Meeting of SBBq, 2013.

• Faoro, Helison ; Tadra-Sfeir, Michelle Z. ; Weiss, Vinícius ; BRUSAMARELLO, L. C. ; CAMILIOS, D. ; Monteiro, Rose Adele ; Cruz, Leonardo M ; FADEL-PICHETH, C. M. T. ; Souza, Emanuel M. ; Pedrosa, F. O. . Genomic comparison of Herbaspirillum seropedicae SmR1, a plant endophytic bacteria, and Herbaspirillum seropedicae 14040, a clinical isolated. In: XLI Annual Meeting of SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. Book of Abstracts - XLI Annual Meeting of SBBq, 2013.

• WEISS, V. A. ; Faoro, Helison ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; CHICORA, V. K. ; MAGNANI, G. S. ; Souza, Emanuel M. ; Pedrosa, F. O. ; Raittz, Roberto T. ; Cruz, Leonardo M . Sequencing, Assembly and Annotation of the Genome of Herbaspirillum lusitanum P6-12, an Endophyte Isolated from Phaseolous vulgaris Root Nodules. In: XLI Annual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. Book of Abstracts - XLI Annual Meeting of SBBq, 2012.

• Schwab, Stefan ; CRIVELARO, A. ; WEISS, V. A. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; Faoro, Helisson ; Cruz, Leonardo M ; Pedrosa, F. O. ; Souza, Emanuel M. ; BALDANI, J. . Global Transcriptional Shift Analysis of Glutamate Shock in N2-Fixing Cells of Azospirillum amazonense strain CBAmc. In: XLI Annual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. Book of Abstracts - XLI Annual Meeting of SBBq, 2012.

• Cruz, Leonardo M ; WEISS, V. A. ; Faoro, Helisson ; CARDOSO, R. L. A. ; Monteiro, R. A. ; FADEL-PICHETH, C. M. T. ; Chubatsu, L. S. ; Huergo, Luciano F. ; Steffens, M. B. R. ; Muller-Santos, M. ; Rigo, L. U. ; Wassem, Roseli ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; Raittz, R. T. ; Pedrosa, F. O. . Comparative genomics of Herbaspirillum genus. In: XLI Annual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. Book of Abstracts - XLI Annual Meeting of SBBq, 2012.

• SCHMIDT, M. A. ; SOUZA, E. M. ; FAORO, H. ; Balsanelli, Eduardo ; WEISS, V. A. ; CRUZ, L. M. ; PEDROSA, F. O ; MONTEIRO, R.A . Herbaspirillum rubrisubalbicans Type Three Secretion System. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - Book of Abstracts, 2011., 2011.

• TADRA-SFEIR, M. Z. ; CAMILIOS, D. D ; BRUSAMARELLO, L. C. C. ; FAORO, H. ; WEISS, V. A. ; Baura, Valter A. ; WASSEM, R. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O ; MONTEIRO, R.A . Whole transcriptome profile of Herbaspirillum seropedicae grown in the presence of naringenin.. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular- Book of Abstracts, 2011., 2011.

• WEISS, V. A. ; PEDROSA, F. O ; SOUZA, E. M. ; RAITTZ, R. T ; MONTEIRO, R.A ; FAORO, H. ; WASSEM, R. ; GENOPAR consortium ; CRUZ, L. M. . The Genomes of the Diazotrophic Endophytes Herbaspirillum seropedicae SmR1 and Herbaspirillum rubrisubalbicans M1, share extensive similarity. In: Sbbq,2010, 2010, Foz do Iguau. XXXIX Reunião Anual da SBBq - 18 a 21 de maio de 2010, 2010, 2010.

• MONTEIRO, R.A ; SOUZA, E. M. ; SCHMIDT, M. A. ; FAORO, H. ; Balsanelli, Eduardo ; WEISS, V. A. ; CRUZ, L. M. ; WASSEM, R. ; RAITTZ, R. T ; Rigo, Liu Un ; Steffens, Maria Berenice R. ; Chubatsu, Leda S. ; YATES, ; PEDROSA, F. O . Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 type three secretion system.. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010, 2010, Búzios. 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-LegumesBúzios - Book of Abstracts, 2010., 2010.

• CARDOSO, R. L. A. ; RAITTZ, R. T ; TIEPPO, E ; MARCHAUKOSKI, J. N ; PEDROSA, F. O ; SOUZA, E. M. ; WEISS, V. A. ; MONTEIRO, R.A ; FAORO, H. ; WASSEM, R. ; Baura, Valter A. ; CRUZ, L. M. . Herbaspirillum Rubrisubalbicans Genome Sequencing. In: 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop in Bioinformatics - Abstracts Book, 2010.

• PISA, F. R. O ; WEISS, V. A. ; SOUZA, E. M. ; CRUZ, L. M. . DESENVOLVIMENTO DE PROGRAMA INTEGRADO DE MONTAGEM E ANOTAÇÃO DE GENOMAS. In: 18o EVINCI, 2010, Curitiba. Livro de resumos do 18o EVINCI 2010, 2010.

• CRUZ, L. M. ; SOUZA, E. M. ; MONTEIRO, R.A ; WASSEM, R. ; WEISS, V. A. ; Balsanelli, Eduardo ; Baura, Valter A. ; Chubatsu, Leda S. ; FAORO, H. ; RAITTZ, R. T ; PISA, F. R. O ; Rigo, Liu Un ; Steffens, Maria Berenice R. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; GENOPAR ; PEDROSA, F. O . Comparative analysis of complete genome sequence of Herbaspirillum seropedicae and a draft genome sequence of Herbaspirillum rubrisubalbicans. In: 9th European Nitrogen Fixation Conference, 2010, Genebra. 9th European Nitrogen Fixation Conference, 2010.

• MORENO, L. F. ; Willemann, G. M. ; MARCHAUKOSKI, J. N ; PEDROSA, F. O ; SOUZA, E. M. ; VALVERDE, C. ; PARISI, G. ; ZEA, D. ; KADOWAKI, M. A. S. ; WEISS, V. A. ; Steffens, Maria Berenice R. . sRNATool: A Tool applied for predicting noncoding RNAs in Herbaspirillum seropedicae SmR1. In: 1st International Workshop on Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop on Bioinformatics, Abstracts Book, 2010.

• Beneduzi, A. ; Campos, S. ; Ambrosini, A. ; Granada, C. ; Moreira, F. ; ARRUDA, L. ; Costa, P. ; SOUZA, R. ; VARGAS, L. K. ; WEISS, V. A. ; TIEPPO, E ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O ; Passaglia, L. M. P. . The draft genome of Paenibacillus riograndensis SBR5 strain isolated from wheat fields in the South of Brazil. In: 1st International Workshop on Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop on Bioinformatics, Abstracts Book, 2010.

• WEISS, V. A. ; PEDROSA, F. O ; SOUZA, E. M. ; RAITTZ, R. T ; PISA, G. ; GENOPAR consortium ; CRUZ, L. M. . Comparative Analysis of the Genomes of the Diazotrophic Endophytic Bacteria Herbaspirillum seropedicae and Herbaspirillum rubrisubalbicans. In: 1st International INCT Symposium on Biological Nitrogen Fixation, 2009., 2009, Curitiba. 1st International INCT Symposium on Biological Nitrogen Fixation, 2009, 2009.

• PISA, G. ; ALVES, R. L. ; WEISS, V. A. ; CRUZ, L. M. ; PEDROSA, F. O ; SOUZA, E. M. ; RAITTZ, R. T . Analysis of the transport system of Herbaspirillum Seropedicae. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq e XI Congresso da PABMB, 2008, Águas de Lindóia. XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq e XI Congresso da PABMB, 2008.

• Cruz, Leonardo M ; Souza, Emanuel M. ; Monteiro, R. A. ; Wassem, Roseli ; WEISS, V. A. ; Balsanelli, Eduardo ; Baura, Valter A. ; Chubatsu, L. S. ; Faoro, Helison ; Raittz, R. T. ; PISA, F. R. O ; Rigo, L. U. ; Steffens, M. B. R. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; GENOPAR consortium ; Pedrosa, F. O. . Comparative analysis of complete genome sequence of Herbaspirillum seropedicae and a draft genome sequence of Herbaspirillum rubrisubalbicans. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2013 - Atual

  BIOLOGIA COMPUTACIONAL - REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA PARA O ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS PARA A GENÔMICA ESTRUTURAL E FUNCIONAL, Descrição: Objetivo Geral: Fortalecer e ampliar o intercâmbio acadêmico entre os programas interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e da USP (5), o de Genética e Biologia Molecular da UFPA (CAPES 5) e o de Bioinformática da UFPR (CAPES 3). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vinicius Almir Weiss - Integrante / Steffens, Maria Berenice R. - Coordenador / Jeroniza M - Integrante / Cruz, Leonardo M - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Integrante / PEDROSA, F. D. O. - Integrante / SOUZA, EMANUEL M - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Bioinformática aplicada à proteômica e à genômica estrutural e funcional, Descrição: PROCAD realizado entre os programas de pósgraduação em Bioinformática das universidades federais do Paraná e de Minas Gerais OBJETIVO GERAL: Desenvolvimento de ferramentas e metodologias computacionais aplicados à genômica estrutural e funcional, montagem e análise de dados de genomas, e aplicação no sequenciamento e anotação de genomas bacterianos. Para a execução deste projeto os parceiros dos dois Programas da área de genômica estrutural e funcional identificarão metodologias e softwares de Bioinformática já disponíveis e/ou a serem implementados e/ou aperfeiçoados. Os parceiros também atuarão na construção de uma Base de Dados e Conhecimento na área de genômica estrutural e funcional, além de participarem da análise de dados genômicos e na geração de novos conhecimentos na área. Os recursos e conhecimentos desenvolvidos serão compartilhados pelos grupos envolvidos. As ferramentas desenvolvidas serão testadas em dois genomas bacterianos a serem sequenciados por membros do Programa de Bioinformática da UFPR. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (16) / Doutorado: (20) . , Integrantes: Vinicius Almir Weiss - Integrante / Fábio Oliveira Pedrosa - Integrante / Jeroniza M - Integrante / Steffens, M. B. R. - Integrante / Cruz, Leonardo M - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Integrante / SOUZA, EMANUEL M - Coordenador / Geraldo Picheth - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2008 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: O INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras para aumento da produtividade agrícola utilizando bactérias fixadoras de nitrogênio e promotoras do crescimento vegetal. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactériaq, ecologia molecular bacteriana, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogenio.Fazem parte deste Instituto grupos de pesquisa da UFPR, Universidade Estadual de Goiás, Embrapa-CNPAF, Embrapa-CNPAB-Seropédica, UENF, UFSC, UFRGS, UFFRJ, UNIOESTE, Universidade Estadual de Ponta Grossa, Universidade Estadual de Londrina e UNESP. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (60) / Mestrado acadêmico: (37) / Doutorado: (46) . , Integrantes: Vinicius Almir Weiss - Integrante / Wassem, Roseli - Integrante / Baura, Valter A. - Integrante / Passaglia, L. M. P. - Integrante / Chubatsu, L. S. - Integrante / Huergo, L. F. - Integrante / Muller-Santos, M. - Integrante / Steffens, M. B. R. - Integrante / Rigo, L. U. - Integrante / Cruz, Leonardo M - Integrante / de Souza, Emanuel M - Integrante / Rose Adele Monteiro - Integrante / PEDROSA, F. D. O. - Coordenador / Cyntia M. T. Fadel-Picheth - Integrante / J.I. Baldani - Integrante / K. R. S. Teixeira - Integrante / Ana Claudia Bonatto - Integrante / C. W. Galvão - Integrante / c.m. diDONET - Integrante / E.G.D.M. Lemos - Integrante / Adriana Hermely - Integrante / Fabio Olivares - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.