Geraldo Francisco Donegá Zafalon

Possui graduação em Bacharelado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP). Mestrado em Ciência da Computação na Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP). Doutorado em Engenharia Elétrica (Engenharia de Computação) pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (EP/USP). Tem experiência na área de Ciência da Computação, especificamente em Computação Científica, Bioinformática, Computação de Alto Desempenho e Algoritmos de Otimização. Credenciado como Docente e Orientador no Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) da Unesp (Campus de São José do Rio Preto), atuando na linha de pesquisa de Inteligência Computacional.

Informações coletadas do Lattes em 18/12/2018

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Engenharia Elétrica

2010 - 2014

Universidade de São Paulo
Título: Aplicação de estratégias híbridas em algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências para ambientes de computação paralela e distribuída
Profa. Dra. Liria Matsumoto Sato. Coorientador: Prof. Dr. José Márcio Machado. Palavras-chave: Bioinformática; Processamento Paralelo; Otimização de Algoritmos.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.

Mestrado em Ciência da Computação

2007 - 2009

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Algoritmos de alinhamento múltiplo e técnicas de otimização para esses algoritmos utilizando Ant Colony,Ano de Obtenção: 2009
Prof. Dr. José Márcio Machado.Palavras-chave: Bioinformática; Processamento Paralelo; Otimização de Algoritmos.Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação

2003 - 2006

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Interface gráfica, particionamento da aplicação e dispositivo gerador de arcabouços para a CMB-Simulation
Orientador: Profa. Dra. Renata Spolon Lobato
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Pós-doutorado

2017

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

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Formação complementar

2009 - 2009

Administração Segura de Servidores e Redes - N I. (Carga horária: 30h). , ACME! Advanced Professional Training - UNESP, UNESP, Brasil.

2005 - 2006

Alemão. , English Center, ENGLISH CENTER, Brasil.

2004 - 2005

Alemão. , ACG - Centro de Idiomas, ACG, Brasil.

1999 - 2002

Inglês. (Carga horária: 350h). , Fisk - Unidade São José do Rio Preto, FISK, Brasil.

1997 - 1997

Informática. (Carga horária: 63h). , Imotec Informática, IMOTEC, Brasil.

1995 - 1995

Informática. (Carga horária: 20h). , Imotec Informática, IMOTEC, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação/Especialidade: Modelos Analíticos e de Simulação.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Computação Paralela e Distribuída.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Análise de Desempenho.

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Organização de eventos

MACHADO, J M ; NEVES, L. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; PINTO, A. R. ; MOMENTE, J. C. ; VALÊNCIO, C. R. ; PASSARO, A. ; NASCIMENTO, M. Z. . Workshop: Applying the finite element and mesh free methods for mathematical modeling in physical sciences. 2013. (Congresso).

ZAFALON, G. F. D. . IV Semana de Sistemas de Informação. 2008. (Outro).

ZAFALON, G. F. D. . XVI Semana da Computação - SEMAC. 2005. (Congresso).

ZAFALON, G. F. D. . Surfactants in Solution Symposium. 2004. (Congresso).

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Participação em eventos

O colaborador que todo empresário gostaria de ter. 2015. (Outra).

NetBeans Java Noroeste 2008. 2008. (Seminário).

II Encontro de Pós-Graduação do IBILCE/UNESP. 2007. (Encontro).

Primeiro Seminário de Pesquisa do Ibilce.Primeiro Seminário de Pesquisa do Ibilce. 2006. (Seminário).

XVIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp.Referências Bibliográficas. 2006. (Oficina).

XXVI CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO. XXVI CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO. 2006. (Congresso).

XXVI CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO. Minicurso: Fundamentos, Tecnologias e Tendências Rumo a Redes P2P Seguras. 2006. (Congresso).

XXVI CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO. Minicurso: Visualização, Simulação e Games. 2006. (Congresso).

XIII Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo / XX Congresso de Iniciação Científica e Tecnologia em Engenharia. XIII Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo / XX Congresso de Iniciação Científica e Tecnologia em Engenharia. 2005. (Congresso).

XVI Semana da Computação - SEMAC.XVI Semana da Computação - SEMAC (Organização). 2005. (Outra).

Congresso de Iniciação Científica (CIC). XVI Congresso de Iniciação Científica (CIC) - Unesp. 2004. (Congresso).

Surfactants in Solution Symposium. Surfactants in Solution Symposium - SIS. 2004. (Congresso).

XV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Cluster e Grids Computacionais e o Acesso wireless a esses ambientes. 2004. (Outra).

XV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Sistemas Evolutivos aplicados ao controle adaptativo de Robôs Móveis Autônomos. 2004. (Outra).

XV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Mineração Visual de Dados. 2004. (Outra).

XV Semana da Computação - Unesp/Ibilce.XV Semana da Computação (SEMAC) - Unesp/Ibilce. 2004. (Outra).

XIV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Programação Extrema. 2003. (Outra).

XIV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Inteligência Artificial e Bioinformática. 2003. (Outra).

XIV Semana da Computação (SEMAC).Minicurso - Aprendizado de Robôs Móveis. 2003. (Outra).

XIV Semana da Computação (SEMAC) - Unesp/Ibilce.XIV Semana da Computação (SEMAC) - Unesp/Ibilce. 2003. (Outra).

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Participação em bancas

Aluno: Raphael Campos Silva

CANSIAN, A. M.; GREGIO, A. R. A.;ZAFALON, G F D. Malflow: um framework para geração automatizada de assinaturas de malwares baseado em fluxo de dados de redes. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinicius Vassoler Galhardi

CANSIAN, A. M.; MARCONDES, C. A. C.;NEVES, L. A.; GREGIO, A. R. A.;ZAFALON, G F D. Detecção adaptativa de anomalias em redes de computadores utilizando técnica não supervisionadas (Participação como Membro Suplente). 2017. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Anderson Rici Amorim

ZAFALON, G F DSOUZA, R. C. G.; CARVALHO, A. C. P. L. F.. Alinhamento Múltiplo de Sequências Utilizando Algoritmo Genético Multifunção e Colônia de Formigas. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Andre Francisco Morielo Caetano

VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.; CORREA, P. L. P.. Griddler: uma estratégia configurável para armazenamento distribuído de objetos peer-to-peer que combina replicação e erasure coding com sistema de cache. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Chang Hsun Ming

ZAFALON, G F DVALENCIO, C. R.; SEIXAS, W.. Simulações empregando a decomposição de adomian para resolver as equações da dinâmica de voo de quadrotores. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Juliano Farias da Nóbrega

ZAFALON, G F DCANSIAN, A. M.; PASSARO, A.. Técnicas de otimização para alinhamento múltiplo de sequências via cadeias de Markov. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme Priólli Daniel

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.; SERAPHIM, E.;ZAFALON, G. F. D.; SOUSA, E. P. M.. Otimização de algoritmos de agrupamento espacial baseado em densidade aplicados em grandes conjuntos de dados (Participação como Membro Suplente). 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Henrique Moretti

ZAFALON, G F D; TRONCO, M. L.; SEIXAS, W.. Análise do efeito de entropia em computação quântica: simulações em ambiente paralelo. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: William Tenorio

VALENCIO, C. R.; COLOMBINI, A. C.;ZAFALON, G. F. D.. Algoritmo genético e adaptativo para seleção de polimorfismos de nucleotídeo único representativos. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Victor Hugo Penhalves Martins

VALENCIO, C. R.; COLOMBINI, A. C.;ZAFALON, G. F. D.. Desenvolvimento de algoritmo para análise comportamental de usuários de mídias sociais para detecção de distúrbios mentais. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: José Augusto Sabino de Oliveira

ZAFALON, G. F. D.; ALMEIDA JUNIOR, J. R.;NEVES, L. A.. Melhoramento de algoritmo de alinhamento múltiplo de sequências por meio de métodos de reorganização e do princípio da evolução mínima. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leandro Bertini Lara Gonçalves

CANSIAN, A. M.; GREGIO, A. R. A.;FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDO. Abordagem para geração automática de assinaturas para fluxos de rede. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Anderson Rici Amorim

ZAFALON, G F DSOUZA, R. C. G.; CARVALHO, A. C. P. L. F.. Alinhamento múltiplo de sequências utilizando algoritmo genético multifunção e colônia de formigas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme Freire Roberto

NEVES, L. A.; AMATE, F. C.;CANSIAN, A. M.ZAFALON, G F D; MARTINS, A. S.. Percolação Multidimensional e Multiescala Para Caracterização de Imagens (Participação como Membro Suplente). 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Andre Francisco Morielo Caetano

VALENCIO, C. R.; CIFERRI, C. D. A.;ZAFALON, G F D. Erasure Codes e suas Aplicações para o Armazenamento de Dados. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Juliano Farias da Nóbrega

ZAFALON, G F DCANSIAN, A. M.; BUENO, L. P. P.. Técnicas de otimização para alinhamento múltiplo de sequências via cadeias de markov. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Chang Hsun Ming

ZAFALON, G F DVALENCIO, C. R.; BUENO, L. P. P.. Simulações empregando a decomposição de adomian para resolver as equações da dinâmica de voo de quadrotores. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Álvaro Magri Nogueira da Cruz

ZAFALON, G. F. D.VALENCIO, C. R.NEVES, L. A.. Análise avançada de padrões para nucleotídeos de polimorfismos simples (SNP). 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Matheus Carreira de Andrade

ZAFALON, G. F. D.NEVES, L. A.SOUZA, R. C. G.. Ferramenta para análise de time points utilizando redes 1-step para avaliação de pacientes em resposta ao tratamento. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Alexandre Dias Pereira

ZAFALON, G. F. D.VALENCIO, C. R.; SANTOS, A. B.. Otimização de desempenho em ferramenta de alinhamento múltiplo MSA-GA. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Stefanini Carreira

CANSIAN, A. M.NEVES, L. A.ZAFALON, G. F. D.. Framework de detecção e visualização de eventos de cyberthreat intelligence. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Matheus Torres Pereira

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.ZAFALON, G F D. Ferramenta para otimização de desempenho em sistemas web por meio de armazenamento de consultas em cache. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Jose Carlos de Freitas

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.ZAFALON, G F D. Ambiente de extração de métricas bibliométricas em big data. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eduardo Munari

ZAFALON, G F DVALENCIO, C. R.NEVES, L. A.. Migração para ambiente gráfico e refinamento no mecanismo de pré-processamento para limpeza de sequências em ferramenta localizadora de quasiespecies. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eduardo Pavarino

NEVES, L. A.; BAIDA, L. C.;ZAFALON, G F D. Delaunay para construção de modelos 3D de estruturas torácicas. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leandro Bertini Lara Gonçalves

CANSIAN, A. M.; SANTOS, A. B.;ZAFALON, G F D. Abordagem para coleta de fluxos de rede utilizando protocolo openflow. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Victor Hugo Penhalves Martins

VALENCIO, C. R.; FERRARI, F.;ZAFALON, G F D. Aplicação de visualização em três dimensões para potencialização de análise de dados espaciais. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Gomes Regino

VALENCIO, C. R.; BAIDA, L. C.;ZAFALON, G F D. Text mining em big data otimização de desempenho na extração de radicais em palavras da língua portuguesa. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Felipe Cantos Cintra

NEVES, L. A.; SANTOS, A. B.;ZAFALON, G F D. Segmentação de malhas tetraédricas com base em critérios de qualidade. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: João Matheus Verdadeiro Visotaky

VALENCIO, C. R.; MANACERO JÚNIOR, Aleardo;ZAFALON, G F D. Uma Abordagem Utilizando Multithreading para Alinhamento Múltiplo de Sequencias com Algoritmo Genético. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Freire Casaca

CANSIAN, A. M.ZAFALON, G F D; NEVES, L A. Detecção e mitigação de ataques DDOS utilizando redes definidas por software. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Anderson Rici Amorim

VALENCIO, C. R.; LOBATO, Renata Spolon;ZAFALON, G F D. Melhorias na Sensibilidade da Ferramenta MSA-GA utilizando a Função Objetivo Coffee. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinicius Vassoler Galhardi

CANSIAN, A. M.ZAFALON, G F D; NEVES, LEANDRO A.. Desenvolvimento de uma arquitetura híbrida para sistemas de detecção de intrusão colaborativos. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinícius de Oliveira Ferreira

CANSIAN, A. M.ZAFALON, G F D; DE SOUZA, ROGERIA C. G.. Um modelo para correlação e classificação de alertas em sistemas de detecção de intrusão colaborativos. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rodrigo Cleir Castellon Rodrigues

VALENCIO, C. R.; DE SOUZA, ROGERIA C. G.;ZAFALON, G F D. Ferramenta web de gerenciamento de mecanismos de armazenamento em nuvens privadas e híbridas. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Raphael Campos Silva

CANSIAN, A. M.ZAFALON, G F D; NEVES, LEANDRO A.. Desenvolvimento de um detector de intrusão de redes locais utilizando fluxo de dados. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rodrigo Dulizio Martins

VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.PINTO, A. S. R.. Extração automática de conhecimento suportada por enriquecimento semântico em prontuários médicos. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Naelson Matheus Junior

VALENCIO, C. R.Machado, J. M.ZAFALON, G. F. D.. Limpeza de base de dados em fonética: suporte à língua inglesa. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: João Mário Malosso Zitelli

SOUZA, R. C. G.VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.. Reengenharia de software voltada para a melhoria de interface. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme Priólli Daniel

VALENCIO, C. R.Machado, J. M.ZAFALON, G. F. D.. Algoritmo de agrupamento espacial baseado em densidade variada+: otimização de desempenho baseada em paralelismo. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Adriano Cesar Ribeiro

CANSIAN, A. M.; PINTO, A. R.;ZAFALON, G. F. D.. Simulação de ataque de negação de serviço em redes 802.11: uma aplicação para sistemas para sistemas embarcados críticos. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos César Neves Enumo

ZAFALON, G. F. D.SOUZA, R. C. G.VALENCIO, C. R.. Ferramenta de auxílio a limpeza de banco de dados com otimização de técnicas utilizando paralelismo. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Arianne Simonato

SOUZA, R. C. G.VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.. Apoio computacional para o processo de especificação de requisitos. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diogo Lemos Guimarães

VALENCIO, C. R.PINTO, A. S. R.ZAFALON, G. F. D.. Otimização de Algoritmo em Data Mining Multi-Relacional. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Matheus Henrique Marioto

VALENCIO, C. R.PINTO, A. S. R.ZAFALON, G. F. D.. Extração de Dados com Latência Zero no Suporte a Data warehouses. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Mauricio Amadio Olivio

VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.PINTO, A. S. R.. Ferramenta para conversão e Tunning de script entre sistemas gerenciadores de banco de dados. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Paulo Roberto Vessi Monteiro

MANACERO JÚNIOR, Aleardo;ZAFALON, G. F. D.CANSIAN, A. M.; LOBATO, Renata Spolon. Estudo comparativo de técnicas para avaliação de desempenho em nível de laços de repetição. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: RICARDO JOTARO YAMASAKI

MANACERO JÚNIOR, Aleardo;ZAFALON, G. F. D.; LOBATO, Renata Spolon; SILVA, L. L.. Funcionalidades de correção de escalonamentos no RTsim. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Paulo Roberto Vollet Junior

MANACERO JÚNIOR, Aleardo;ZAFALON, G. F. D.; LOBATO, Renata Spolon; SILVA, L. L.. Estudo sobre SOA. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Antonio Carlos da Silva Junior

ZAFALON, G. F. D.. Automação da Força de Vendas baseada em Dispositivos Móveis. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos.

Aluno: Silvia Carla de Souza

ZAFALON, G. F. D.. Proposta de um sistema especialista educacional direcionado ao pré-diagnóstico da dislexia. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos.

Aluno: Rogério Apolinário

ZAFALON, G. F. D.. Sistema para Gerenciamento de Emergência de Hospital (TRAUMA). 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos.

Aluno: Leandro Ischida e Eliérverson Rodrigues

ZAFALON, G. F. D.. Gerenciamento do Grupo de Transmissão de Dados ? GGTD. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos.

ZAFALON, G. F. D.; FERRARI, D. J.;MOMENTE, J. C.. Concurso Público de Provas e Títulos para admissão de Docente, na área de Computação, da disciplina de Bases da Internet e Criação de Conteúdo na Web. 2014. Faculdade de Tecnologia de Jales - Fatec.

SOUZA, R. C. G.VALENCIO, C. R.ZAFALON, G. F. D.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Chen Yuxuan - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Estudo sobre métodos motivacionais comom auxílio para o desenvolvimento de software educativo. 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.ZAFALON, G. F. D.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de José Carlos de Freitas - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Análise e Extração de bibliométricas com algoritmos distribuídos em ambientes com características Big Data. 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ZAFALON, G. F. D.NEVES, L. A.SOUZA, R. C. G.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Matheus Carreira Andrade - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Construção de redes one-step para estudos evolucionários utilizando GPU. 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ZAFALON, G. F. D.CANSIAN, A. M.VALENCIO, C. R.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Chen Yuxuan - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Otimização de busca por SNPs baseada em máscaras por meio de unidade de processamento gráfico (GPU). 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDO. Avaliador de trabalhos apresentados na 1 fase do XXIX Congresso de Iniciação Científica da UNESP. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDONEVES, L. A.SOUZA, R. C. G.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de José Augusto Sabino de Oliveira - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Melhoramento de algoritmo de alinhamento múltiplo de sequências por meio de métodos de reorganização e máxima vizinhança. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

NEVES, L. A.CANSIAN, A. M.FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDO. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Daniela Fernanda Taino - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Associação de técnicas de aprendizado de máquina baseada em algoritmo genético. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CANSIAN, A. M.FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDONEVES, L. A.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Lucas Baltazar Cayres - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Estudo sobre abordagens para detecção de registros fraudulentos de nomes e domínios. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.FRANCISCO DONEGÁ ZAFALON, GERALDO. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de William Tenório - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Aprimoramento de um algoritmo de seleção de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) representativos. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

NEVES, L. A.VALENCIO, C. R.ZAFALON, G F D. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Luiz Fernando Segato dos Santos - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Entropias Multiescalas e Multidimensionais para Qualificação e Classificação de Imagens. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

VALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.ZAFALON, G F D. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de André Francisco Morielo Caetano - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Dispersão de informação para armazenamento resiliente de dados em Big Data. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SOUZA, R. C. G.; VALÊNCIO, C. R.;ZAFALON, G. F. D.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Allan de Godoi Contessoto - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Metodologia com foco na maturidade em gerenciamento dos riscos de projetos de software. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ZAFALON, G F DVALENCIO, C. R.SOUZA, R. C. G.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Anderson Rici Amorim - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Alinhamento múltiplo de sequências utilizando algoritmo genético multifunção e colônia de formigas. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

NEVES, L. A.; MARRANGHELLO, N.;ZAFALON, G. F. D.. Comissão Examinadora do Seminário referente à disciplina de Estudos Especiais de Guilherme Freire Roberto - Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) - Título: Percolação espacial multidimensional e multiercola para caracterização de imagens. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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Comissão julgadora das bancas

Renata Spolon Lobato

LOBATO, Renata Spolon; Machado, José Márcio; SATO, L. M.. Algoritmos de alinhamento múltiplo e técnicas de otimização para esses algoritmos usando Ant Colony. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Renata Spolon Lobato

LOBATO, Renata SpolonMANACERO JR, Aleardo; PEREIRA, Aledir Silveira. Interface gráfica, particionamento da aplicação e dispositivo gerador de arcabouços para a CMB-SIMULATION. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Liria Matsumoto Sato

SATO, LIRIA M.; MIDORIKAWA, E. T.; RAHAL, P.; GUARDIA, H. C.;ALMEIDA JUNIOR, Jorge Rady de. Aplicação de estratégias híbridas em algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências para ambientes de computação paralela e distribuída. 2014. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Liria Matsumoto Sato

SATO, L. M.MACHADO,J.M.; ARIAS, M. C.. Implementação de algoritmos de alinhamento múltiplo de sequencias em ambientes "Grid". 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Hélio Crestana Guardia

SATO, Liria MatsumotoGUARDIA, H.C.; RAHAL, P.; MIDORIKAWA, Édson; ALMEIDA JUNIOR, J. R.. Aplicação de estratégias híbridas em algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências para ambientes de computação paralela e distribuída. 2014. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Jorge Rady de Almeida Junior

SATO, Liria MatsumotoALMEIDA, JORGE RADY; MIDORIKAWA, E. T.; GUARDIA, Hélio Crestana; RAHAL, P.. Aplicação de Estratégias Híbridas em Algoritmos de Alinhamento Múltiplo de Sequências para Ambientes de Computação Paralela e Distribuída. 2014. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Mário Luiz Tronco

TRONCO, M. L.. Exame de Qualificação - Mestrado. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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Orientou

Matheus Carreira Andrade

Construção de redes One-Step para estudos de evolução viral; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Álvaro Magri Nogueira da Cruz

Avaliação de SNPs em sequenciamento de nova geração utilizando GPUs; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

José Augusto Sabino de Oliveira

Processamento de árvore filogénetica considerando ordem; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Mateus Orcese Trevizam

Ferramenta Para Análise De Mutações Em Biossequências; Início: 2018; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Vitoria Zanon Gomes

Otimização de alinhamento múltiplo de sequências no âmbito de heurísticas bioinspiradas híbridas; Início: 2018; Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Anderson Rici Amorim

Alinhamento múltiplo de sequências utilizando algoritmo genético multifunção e colônia de formigas; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Chang Hsun Ming

Simulações empregando a decomposição de adomian para resolver as equações da dinâmica de voo de quadrotores; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Juliano Farias da Nóbrega

Técnicas de otimização para alinhamento múltiplo de sequências via cadeias de markov; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Rafael Henrique Moretti

Análise do efeito de entropia em computação quântica: simulações em ambiente paralelo; 2015; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Eduardo Munari

Migração para ambiente gráfico e refinamento no mecanismo de pré-processamento para limpeza de sequências em ferramenta localizadora de quasiespécies; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Matheus Carreira de Andrade

Ferramenta para análise de time points utilizando redes 1-step para avaliação de pacientes em resposta ao tratamento; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Alexandre Dias Pereira

Otimização de desempenho em ferramenta de alinhamento múltiplo MSA-GA; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Álvaro Magri Nogueira da Cruz

Análise avançada de padrões para nucleotídeos de polimorfismos simples (SNP); 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Bruno Yokomachi

Sistema de controle de frota; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Marcelo Francisco De Oliveira e Thiago Augusto Camilo Felíci

Aplicação de técnicas de marketing multi-nível em um sistema de gerenciamento de locações; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Marcelo da Silva Vargas

Ferramenta de detecção de promoções e auxílio à tomada de decisões em compras; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Thiago Henrique Ribeiro Gavioli Caramelo

Sistema de comércio eletrônico; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Sistemas de Informação) - União das Faculdades dos Grandes Lagos; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Álvaro Magri Nogueira da Cruz

Identificação de Padrões em SNPs utilizando multithread e multimascaramento; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Matheus Carreira de Andrade

Ferramenta para análise de time points utilizando redes 1-Step para avaliação de pacientes em resposta ao tratamento; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Álvaro Magri Nogueira da Cruz

Identificação de Padrões em SNPs (SNP Verifier); 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

Anderson Rici Amorim

Melhorias na sensibilidade da ferramenta MSA-GA utilizando a função objetivo COFFEE; 2015; Orientação de outra natureza; (Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Geraldo Francisco Donegá Zafalon;

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Foi orientado por

José Márcio Machado

Implementação de algoritmos para alinhamento múltiplo de sequências em ambientes Grid; Início: 2010; Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo; (Coorientador);

José Márcio Machado

Algoritmos de alinhamento múltiplo e técnicas de otimização para esses algoritmos utilizando Ant Colony; 2009; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: José Márcio Machado;

Renata Spolon Lobato

Interface gráfica, particionamento da aplicação e dispositivo gerador de arcabouços para a CMB-Simulation; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Renata Spolon Lobato;

Renata Spolon Lobato

INTERFACE GRÁFICA, PARTICIONAMENTO DA APLICAÇÃO E DISPOSITIVO GERADOR DE ARCABOUÇOS PARA A CMB-Simulation; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Renata Spolon Lobato;

Liria Matsumoto Sato

Aplicação de estrat´rgias híbridas em algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências para ambientes de computação paralela e distribuída; 2014; Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Liria Matsumoto Sato;

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Produções bibliográficas

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  • MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; MOMENTE, J. C. ; SHIYOU, Y. ; SATO, L. M. ; Machado, J. M. . An efficient parallel algorithm for multiple sequence similarities calculation. In: III Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo - ERAD-SP, 2012, Campinas. III Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo - ERAD-SP, 2012.

  • ZAFALON, G. F. D. ; MARUCCI, E. A. ; AMAZONAS, J. R. A. ; SATO, L. M. ; Machado, J. M. . Improvements in the score matrix calculation in multiple sequence alignments. In: II Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo, 2011, São José dos Campos. II Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo, 2011.

  • DOIMO, D. R. ; ZAFALON, G. F. D. ; Machado, J. M. . Acoplamento de Interface Gráfica e Prototipação de Módulo de Alinhamento Múltiplo de Sequências para o LOCQSPEC. In: XXIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp - CIC Unesp, 2011, São Pedro. XXIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2011.

  • MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; MANACERO JÚNIOR, Aleardo ; SATO, L. M. ; Machado, J. M. . Finding Fractional Identities in Multiple Sequences Using a Fast Parallel Algorithm. In: I Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo, 2010, São Paulo. I Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo, 2010.

  • ZAFALON, G. F. D. ; LOBATO, Renata Spolon . Interface Gráfica, Particionamento da Aplicação e Mecanismo Gerador de Arcabouços para a CMB-Simulation. In: Congresso de Iniciação Científica (CIC) - Unesp, 2006, Bauru. XVIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2006.

  • ANDRADE, M. C. ; AMORIM, A. R. ; CRUZ, A. M. N. ; ZAFALON, G. F. D. . Utilização de grafos para análise de sequências de DNA. In: Colóquio Brasileiro de Matemática, 2017, Rio de Janeiro. 31 Colóquio Brasileiro de Matemática - 2017 - IMPA. Rio de Janeiro: IMPA, 2017.

  • CRUZ, A. M. N. ; AMORIM, A. R. ; ZAFALON, G F D . Estratégia computacional eficiente para busca de padrões em biossequências. In: XXVIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp - CIC, 2016, São José do Rio Preto. Anais do XXVIII Congresso de Iniciação Científica da Unesp - CIC, 2016.

  • ZAFALON, G F D ; MARUCCI, EVANDRO A. ; NEVES, L. A. ; VALENCIO, C. R. ; AMORIM, A. R. ; CANSIAN, A. M. ; AMAZONAS, J. R. A. ; SATO, L. M. ; MACHADO, JOSÉ M. . Optimizations in multiple sequence alignment algorithm using parallel score estimating and ant colony. In: 11th International Conference of the AB3C (X-Meeting 2015)/Brazilian Symposium of Bioinformatics (BSB 2015), 2015, São Paulo. Proceedings of 11th International Conference of the AB3C (X-Meeting 2015)/Brazilian Symposium of Bioinformatics (BSB 2015), 2015.

  • AMORIM, A. R. ; ZAFALON, G F D ; VALENCIO, C. R. ; MACHADO, JOSÉ M. . Melhorias na sensibilidade da ferramenta MSA-GA utilizando a função objetivo COFFEE. In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP - SIICUSP, 2014, São Carlos. 22 Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP - SIICUSP, 2014.

  • NOBREGA, J. F. ; DOIMO, D. R. ; ZAFALON, G F D ; BELLINI, M. F. ; MACHADO, JOSÉ M. . LOCQSPEC, Multiple Sequence Alignment: Graphic Design, Implementation and Functionality. In: Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. 59 Congresso Brasileiro de Genética, 2013.

  • MOMENTE, J. C. ; NEVES, L. A. ; ZAFALON, G F D ; MACHADO, J M . Three-Dimensional Simulation of a Corona Discharge in a Needle-Plane Configuration. In: International Symposium on Applied Electromagnetics and Mechanics, 2013, Quebec. Proceedings of the 16th International Symposium on Applied Electromagnetics and Mechanics, 2013. p. 424-425.

  • DOIMO, D. R. ; ZAFALON, G. F. D. ; Machado, J. M. . LOCQSPEC: Funcionalidades, Interface Gráfica e Protótipo de Módulo de Alinhamento Múltiplo. In: XIX Simpósio Internacional de Iniciação Científica, 2011, São Carlos. XIX Simpósio Internacional de Iniciação Científica - SIICUSP, 2011.

  • MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; JARDIM, A. C. G. ; YAMASAKI, L. H. T. ; OLIVA, C. B. ; RAHAL, P. ; Machado, J. M. . Library's Routines for Pattern Recognition in Quasispecies. In: 3rd Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Proceedings of 3rd Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007. p. 108-108.

  • PROVAZZI, P. J. S. ; PINHO, J. R. R. ; MELO, I. M. ; AOKI, S. ; MARUCCI, E. A. ; MENDES, R. M. S. ; ZAFALON, G. F. D. ; FACHINNI, R. M. ; Machado, J. M. ; RAHAL, P. . Analysis of serino-protease NS3 from patients Infected with HCV genotype 3. In: 14th International Symposium on Hepatitis C Virus & Related Viruses, 2007, Glasgow - Scotland. 14th International Symposium on Hepatitis C Virus & Related Viruses, 2007. Virus Evolution and Fitness, 2007.

  • JARDIM, A. C. G. ; YAMASAKI, L. H. T. ; MELLO, I. M. V. G. C. ; FACHINNI, R. M. ; PINHO, J. R. R. ; MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; SIMAS, P. V. M. ; ZANETTA, D. ; Machado, J. M. ; RAHAL, P. . Analysis of Genomic Region NS5A of Hepatitis C Virus Genotype 1 in Before Treatment Samples of Sustained Responders end of Treatment Responder and Non Responders Patients. In: XVIII Encontro Nacional de Virologia, 2007, Búzios - Brasil. XVIII Encontro Nacional de Virologia, 2007, Armação de Búzios. Journal of the Brazilian Society for Virology, 2007, 2007. v. 12. p. 203-204.

  • OLIVA, C. B. ; JARDIM, A. C. G. ; RAHAL, P. ; YAMASAKI, L. H. T. ; FACHINNI, R. M. ; MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; Machado, J. M. ; PINHO, J. R. R. ; MELLO, I. M. V. G. C. . Análise da Variabilidade Genética da Região NS5A do Vírus da Hepatite C (HCV) Genótipo 3a. In: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia - Brasil. 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. www.sbg.org.br, 2007. v. 0. p. 61-61.

  • ZAFALON, G. F. D. ; LOBATO, Renata Spolon . Um protótipo de interface gráfica para geração de arcabouços em simulação distribuída conservativa. In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2005, São Carlos. Um protótipo de interface gráfica para geração de arcabouços em simulação distribuída conservativa / A GUI prototype to archetype generation for conservative distributed simulation, 2005.

  • ZAFALON, G. F. D. ; MANACERO JÚNIOR, Aleardo . Desenvolvimento de um gerador de números aleatórios independente, segundo distribuições probabilísticas variadas. In: Congresso de Iniciação Científica (CIC) - Unesp, 2004, Ilha Solteira. Desenvolvimento de um gerador de números aleatórios independente, segundo distribuições probabilísticas variadas, 2004.

  • VALENCIO, C. R. ; FREITAS, J. C. ; SOUZA, R. C. G. ; NEVES, L. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; TENORIO, W. ; COLOMBINI, A. C. . Analysing research collaboration through co-authorship networks in a big data environment: an efficient parallel approach. International Journal of Computational Science and Engineering , 2019.

  • ZAFALON, G F D . Bioinformática: Conceitos e Evoluções. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • OLIVA, C. B. ; JARDIM, A. C. G. ; YAMASAKI, L. H. T. ; FACHINNI, R. M. ; ZAFALON, G. F. D. ; Machado, J. M. ; PINHO, J. R. R. ; MELLO, I. M. V. G. C. ; RAHAL, P. . Análise da Variabilidade Genética da Região NS5A do Vírus da Hepatite C (HCV) Genótipo 3A. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • JARDIM, A. C. G. ; YAMASAKI, L. H. T. ; MELLO, I. M. V. G. C. ; FACHINNI, R. M. ; PINHO, J. R. R. ; MARUCCI, E. A. ; ZAFALON, G. F. D. ; SIMAS, P. V. M. ; ZANETTA, D. ; Machado, J. M. ; RAHAL, P. . Analysis of Genomic Region NS5A of Hepatitis C Virus Genotype 1 in Before Treatment Samples of Sustained Responders, end of Treatment Responder and non Responders Patients. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

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Outras produções

ZAFALON, G. F. D. . Linux. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

ZAFALON, G. F. D. . Linux. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

ZAFALON, G. F. D. . Festival de bandas - TKT. 2000 (Feira Internacional da música - São Paulo).

ZAFALON, G. F. D. . Latex, mais fácil do que disseram, mais eficiente do que você imagina. 2006 (Extensão) .

ZAFALON, G. F. D. . Curso de Latex para Universitários. 2006 (Extensão) .

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Projetos de pesquisa

  • 2016 - Atual

    Ferramenta para Análise de Time Points Utilizando Redes 1-Step para Avaliação de Pacientes em resposta ao Tratamento, Descrição: Devido às novas tecnologias e procedimentos utilizados por profissionais da área biológica, a quantidade de dados genômicos disponíveis e que devem ser analisados tem aumentado consideravelmente, de modo que as análises manuais se tornaram impraticáveis. Com isso, houve a necessidade da utilização de recursos computacionais para auxiliar os biólogos em suas análises. Diversas operações podem ser realizadas para se proceder estas análises, como os alinhamentos de sequências, os reconhecimentos de padrões, construções de árvores filogenéticas, entre outras. Dentre as diversas técnicas que podem ser empregadas, encontram-se os algoritmos baseados em teoria dos grafos. Assim, o presente projeto tem como objetivo a análise de sequências de haplotipos por meio da geração de um grafo, em que cada uma das sequências representam um vértice no grafo. Além dos vértices é possível observar arestas (conexões) entre nós (vértices), em que tais conexões são realizadas de acordo com o cálculo da distância entre cada sequência. Este projeto auxiliará os biólogos na melhor visualização das interações e mudanças ocorridas entre sequências em um determinado período de tempo utilizando-se de uma interface gráfica amigável, além da possibilidade estudos filogenéticos.Este projeto trata-se de uma cooperação científica entre o Grupo de Computação Científica (Unesp/SJRP - Brasil) e o Centers for Disease Control and Prevention (CDC-Estados Unidos).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Geraldo Francisco Donegá Zafalon - Coordenador / Anderson Rici Amorim - Integrante / Matheus Carreira de Andrade - Integrante / Livia Maria Gonçalves Rossi - Integrante / Gilberto Vaughan - Integrante / Paula Rahal - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Análise avançada de SNPs utilizando ferramentas de software, Descrição: Devido ao aumento crescente no volume de dados genômicos gerados, novas estratégias precisam ser desenvolvidas para darem suporte à análise dessas informações. Assim, a Bioinformática assume um papel preponderante sob a ótica do desenvolvimento de estratégias para essas análises, particularmente na vertente de alinhamentos múltiplos de sequências e reconhecimentos de padrões. Dentre as diversas subáreas que compõem a Bioinformática, a análise de Nucleotídeos de Polimorfismo Simples (SNPs) destaca-se como uma das mais relevantes atualmente. Os SNPs são responsáveis por cerca de 90% a 95% das variações genômicas humanas, mostrando-se assim elementos de grande suma importância para numerosas pesquisas. As análises sobre os SNPs são extensas e de grande complexidade, demandando uma gama de recursos computacionais. Sendo assim, este presente projeto de pesquisa tem por objetivo implementar uma ferramenta para análise de posições de SNPs, a qual possibilitará a classificação de bases de nucleotídeos heterozigotos ou homozigotos das posições de SNPs conhecidas, por meio de máscaras. Porém, no contexto atual, com o grande volume de informações gerado pelos sequenciadores de nova geração (NextGen), uma implementação sequencial não permite a extração da maior parte das informações significativas, com um desempenho computacional aceitável. Para isso, será utilizada uma abordagem paralela, permitindo uma análise multimáscara otimizada. A partir disso, espera-se obter resultados com boa significância biológica, além do ganho de tempo considerável em termos de análise, beneficiando os pesquisadores. Este projeto trata-se de uma cooperação científica entre o Grupo de Computação Científica (Unesp/SJRP - Brasil) e o Centers for Disease Control and Prevention (CDC-Estados Unidos).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Geraldo Francisco Donegá Zafalon - Coordenador / Anderson Rici Amorim - Integrante / Álvaro Magri Nogueira da Cruz - Integrante / Livia Maria Gonçalves Rossi - Integrante / Gilberto Vaughan - Integrante / Paula Rahal - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Estudos sobre alinhamento múltiplo de sequências e reconhecimento de padrões em bioinformática por meio de transformadas, Descrição: A utilização de diversas estratégias para otimizar os processos de alinhamento múltiplo de sequências e reconhecimento de padrões, em bioinformática, têm se mostrado interessante. Dentre as diversas estratégias utilizadas para otimizar, encontram-se as transformadas. O uso dessas estratégias converge em duas vertentes: melhorar a significância biológica dos resultados e garantir um bom desempenho em termos de tempo de execução das ferramentas computacionais. Assim, o presente projeto de pesquisa tem por objetivo desenvolver uma ferramenta de alinhamento de sequências e reconhecimento de padrões mais otimizada, beneficiando-se do uso de transformadas. Este projeto trata-se de uma cooperação científica entre o Grupo de Computação Científica (Unesp/SJRP - Brasil), a Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (EP/USP - Brasil) e Universitat Politècnica de Catalunya - BarcelonaTech (Barcelona - Espanha).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Geraldo Francisco Donegá Zafalon - Coordenador / Liria Matsumoto Sato - Integrante / José Roberto de Almeida Amazonas - Integrante / Anderson Rici Amorim - Integrante / Paula Rahal - Integrante.

  • 2013 - 2014

    Desenvolvimento de um sistema de informação para gerenciamento de logística reversa, baseado em sistemas de informação geográficos e algoritmos de otimização utilizando colônia de formigas (ant colony), Descrição: A preocupação crescente com questões ambientais e desenvolvimento sustentável tem norteado diversas discussões em ciclos de palestras empresariais e industriais, além de assumir um papel relevante e de grande atenção por parte dos governantes em suas pautas diárias. Um dos problemas latentes levantados, em diversas circunstâncias, está relacionado à implantação de sistemas de gestão ambientais eficientes. O gerenciamento da produção industrial e a adequação da cadeia de produção e distribuição são pontos fundamentais para que as empresas e indústrias consigam a excelência em gestão sustentável. Adicionalmente, foi aprovada no Brasil a Política Nacional de Resíduos Sólidos (PNRS), pela lei 12.305, regulamentada pelo Decreto 7.404, de 2010. Essa legislação trouxe a obrigatoriedade da Logística Reversa e instituiu a Responsabilidade Compartilhada, pontos que obrigam os setores produtivos a estabelecer uma conexão permanente entre as diferentes fases de produção. Dessa forma, o presente projeto tem por prerrogativa, o estudo para auferir a viabilidade do desenvolvimento de um sistema de informação para controle de processos de logísticas operacionais dessas cadeias de produção e distribuição, além da criação dos primeiros protótipos desse sistema, para testes iniciais. A abordagem do sistema de informação oferecerá um controle baseado nos conceitos de logística reversa, com diversas informações de gerenciamento e cadastro que poderão ser inseridas. Como inovação, em relação aos sistemas desse seguimento, disponíveis no mercado, todo o controle dos processos de roteamento da logística será feita através da integração de sistemas de informação geográficos e algoritmos de otimização bioinspirados, particularmente utilizando Colônias de Formigas (Ant Colony). A expectativa é de que o sistema de informação integrado, proposto no presente projeto, torne-se uma ferramenta útil, de fácil operação e singular para as em presas que necessitam da realização do gerenciamento de processos logísticos descritos e para o cumprimento de suas metas com as questões ambientais. A maior eficiência da cadeia de retorno dos produtos será consideravelmente maior pelo sistema proposto, viso que este possibilitará levantamento de dados e praticas como: mapeamento dos processos em todas as etapas de distribuição e retorno; respeito a características peculiares dos produtos retornados; implantação de procedimentos operacionais e normas gerais adequados para controle de fluxo de produtos, operações e posterior recebimento; uso de benchmark; disponibilização de um sistema de informações para planejar e otimizar fluxos e custos; planejamento e espacialização através de Sistema de Informação Geográfica (SIG) e os algoritmos de otimização bioinspirados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

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Prêmios

2018

Membro do Comitê Científico da 20th International Conference on Enterprise Information Systems (ICEIS 2018), INSTICC.

2017

Membro do Comitê Científico da 19th International Conference on Enterprise Information Systems (ICEIS 2017), INSTICC.

2017

Membro do Comitê Científico da Conferência Ibero-Americana em Computação Aplicada 2017 (CIACA 2017), IADIS.

2016

Membro do Comitê Científico da Conferência Ibero-Americana em Computação Aplicada 2016 (CIACA 2016), IADIS.

2015

Membro do Comitê Científico da Conferência Ibero-Americana em Computação Aplicada 2015 (CIACA 2015), IADIS.

2015

Paraninfo do Curso de Bacharelado em Ciência da Computação - Unesp/Ibilce - Formandos 2015, Universidade Estadual Paulista.

2014

Membro do Comitê Científico da Conferência Ibero-Americana em Computação Aplicada 2014 (CIACA 2014), IADIS.

2013

Membro do Comitê Científico da Conferência Ibero-Americana em Computação Aplicada 2013 (CIACA 2013), IADIS.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Ciência da Computação e Estatística. , Rua Cristovão Colombo, 2265, Jardim Nazareth, 15054-000 - Sao Jose do Rio Preto, SP - Brasil, Telefone: (17) 32212200, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2013 - 2014

    Verdaz Gestão Sustentável

    Vínculo: , Enquadramento Funcional:

  • 2007 - Atual

    União das Faculdades dos Grandes Lagos

    Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor

    Atividades

    • 02/2014

      Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Engenharia da Computação, Introdução ao Processamento de Dados, Algoritmos

    • 08/2012

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Habilidades em Informática

    • 06/2008

      Ensino, Bacharelado em Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Redes de Computadores, Análise e Projeto de Sistemas, Arquiteturas e Organização de Computadores

    • 02/2011 - 12/2011

      Ensino, MBA em Gestão de Tecnologia da Informação, Nível: Especialização,Disciplinas ministradas, Comunicação de Dados, Prospecção e Seleção de Novas Tecnologias

  • 2010 - Atual

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor

  • 2003 - Atual

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pesquisador

  • 2009 - 2014

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Doutorado, Enquadramento Funcional: Pesquisador

  • 2007 - 2009

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Mestrado, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 40

  • 2003 - 2006

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Graduação, Enquadramento Funcional: Graduação - Iniciação Científica, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Bolsista de Iniciação Científica do CNPq.

    Atividades

    • 03/2018

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Análise e Projeto de Algoritmos

    • 08/2017

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Inteligência Artificial

    • 03/2017

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática

    • 02/2016

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Ciência da Computação

    • 02/2015

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Linguagens de Programação, Projeto de Sistemas Operacionais, Sistemas Operacionais

    • 01/2015

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Ciência da Computação e Estatística.,Linhas de pesquisa

    • 08/2014

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos em Sistemas de Informação, Fundamentos em Computação Científica

    • 02/2013

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estruturas de Dados

    • 02/2012

      Ensino, Bacharelado Em Ciências de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Arquiteturas e Organização de Computadores, Projeto e Desenvolvimento de Sistemas de Informação, Software Numérico

    • 08/2011

      Ensino, Bacharelado em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Linguagem Computacional

    • 08/2011

      Ensino, Bacharelado em Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução ao Processamento de Dados

    • 02/2011

      Ensino, Bacharelado Em Ciências de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Organização e Recuperação de Informações, Projeto Final de Curso, Software Numérico

    • 08/2010

      Ensino, Bacharelado Em Ciências de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Programação I

    • 03/2017 - 06/2017

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Arquitetura de Computadores

    • 08/2016 - 12/2016

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Técnicas de Simulação

    • 08/2010 - 12/2010

      Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Linguagem Computacional

  • 2007 - 2016

    CENTRO UNIVERSITÁRIO DO NORTE PAULISTA

    Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor

    Atividades

    • 02/2009

      Ensino, Análise e Desenvolvimento de Sistemas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Arquiteturas e Organização de Computadores, Linguagem de Programação, Sistemas Distribuídos, Sistemas Operacionais II, Linguagem Técnica de Programação I

    • 05/2007

      Ensino, Bacharelado em Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Arquiteturas e Organização de Computadores, Sistemas Distribuídos

    • 05/2007

      Ensino, Bacharelado em Engenharia de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Arquiteturas de Computadores, Redes de Computadores

    • 05/2007

      Ensino, Bacharelado em Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Arquiteturas de Computadores

  • 2016 - Atual

    Universidade Paulista

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Doutor - Titular Nível IV, Carga horária: 12

    Atividades

    • 02/2016

      Ensino, Sistema de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Governança de Tecnologia da Informação, Auditoria e Avaliação de Sistemas

    • 02/2016

      Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estruturas de Dados, Aspectos Teóricos da Computação, Redes de Computadores, Tópicos em Atuação Profissional, Telecomunicações, Lógica de Programação e Algoritmos