Samuel Coelho Mandacaru

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• PRAÇA, YANNA REIS ; SANTIAGO, PAULA BEATRIZ ; CHARNEAU, SÉBASTIEN ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; BASTOS, IZABELA MARQUES DOURADO ; BENTES, KAIO LUÍS DA SILVA ; SILVA, SOFIA MARCELINO MARTINS ; DA SILVA, WALDEYR MENDES CORDEIRO ; DA SILVA, IONIZETE GARCIA ; DE SOUSA, MARCELO VALLE ; SOARES, CÉLIA MARIA DE ALMEIDA ; RIBEIRO, JOSÉ MARCOS CHAVES ; SANTANA, JAIME MARTINS ; DE ARAÚJO, CARLA NUNES . An Integrative Sialomic Analysis Reveals Molecules From Triatoma sordida (Hemiptera: Reduviidae). Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 11, p. 1, 2022.

• TEMEROZO, JAIRO R. ; FINTELMAN-RODRIGUES, NATALIA ; DOS SANTOS, MONIQUE CRISTINA ; HOTTZ, EUGENIO D. ; SACRAMENTO, CAROLINA Q. ; DE PAULA DIAS DA SILVA, ALINE ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; DOS SANTOS MORAES, EMILLY CAROLINE ; TRUGILHO, MONIQUE R. O. ; GESTO, JOÃO S. M. ; FERREIRA, MARCELO ALVES ; SARAIVA, FELIPE BETONI ; PALHINHA, LOHANNA ; MARTINS-GONÇALVES, REMY ; AZEVEDO-QUINTANILHA, ISACLAUDIA GOMES ; ABRANTES, JULIANA L. ; RIGHY, CÁSSIA ; KURTZ, PEDRO ; JIANG, HUI ; TAN, HONGDONG ; MOREL, CARLOS ; BOU-HABIB, DUMITH CHEQUER ; BOZZA, FERNANDO A. ; BOZZA, PATRÍCIA T. ; SOUZA, THIAGO MORENO L. . Human endogenous retrovirus K in the respiratory tract is associated with COVID-19 physiopathology. Microbiome , v. 10, p. 1, 2022.

• VASCONCELLOS, ANNA FERNANDA ; MELO, REYNALDO MAGALHÃES ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; DE OLIVEIRA, LUCAS SILVA ; DE OLIVEIRA, ATHOS SILVA ; MORAES, EMILY CAROLINE DOS SANTOS ; TRUGILHO, MONIQUE RAMOS DE OLIVEIRA ; RICART, CARLOS ANDRÉ ORNELAS ; BÁO, SÔNIA NAIR ; RESENDE, RENATO OLIVEIRA ; CHARNEAU, SÉBASTIEN . Aedes aegypti Aag-2 Cell Proteome Modulation in Response to Chikungunya Virus Infection. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 12, p. 1, 2022.

• TRUGILHO, MONIQUE R. O. ; AZEVEDO-QUINTANILHA, ISACLAUDIA G. ; GESTO, JOÃO S. M. ; MORAES, EMILLY CAROLINE S. ; MANDACARU, SAMUEL C. ; CAMPOS, MARIANA M. ; OLIVEIRA, DOUGLAS M. ; DIAS, SUELEN S. G. ; BASTOS, VIVIANE A. ; SANTOS, MARLON D. M. ; CARVALHO, PAULO C. ; VALENTE, RICHARD H. ; HOTTZ, EUGENIO D. ; BOZZA, FERNANDO A. ; SOUZA, THIAGO MORENO L. ; PERALES, JONAS ; BOZZA, PATRÍCIA T. . Platelet proteome reveals features of cell death, antiviral response and viral replication in covid-19. CELL DEATH DISCOVERY (ON LINE) , v. 8, p. 1, 2022.

• MORAES, EMILLY CAROLINE DOS SANTOS ; MARTINS-GONÇALVES, REMY ; SILVA, LUANA ROCHA DA ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; MELO, REYNALDO MAGALHÃES ; AZEVEDO-QUINTANILHA, ISACLAUDIA ; PERALES, JONAS ; BOZZA, FERNANDO A. ; SOUZA, THIAGO MORENO LOPES ; CASTRO-FARIA-NETO, HUGO CAIRE ; HOTTZ, EUGENIO D. ; BOZZA, PATRICIA T. ; TRUGILHO, MONIQUE R. O. . Proteomic Profile of Procoagulant Extracellular Vesicles Reflects Complement System Activation and Platelet Hyperreactivity of Patients with Severe COVID-19. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 12, p. 1, 2022.

• GARRETO, LAÍS ; CHARNEAU, SÉBASTIEN ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; NÓBREGA, OTÁVIO T. ; MOTTA, FLÁVIA N. ; DE ARAÚJO, CARLA N. ; TONET, AUDREY C. ; MODESTO, FLÁVIA M. B. ; PAULA, LILIAN M. ; DE SOUSA, MARCELO VALLE ; SANTANA, JAIME M. ; ACEVEDO, ANA CAROLINA ; BASTOS, IZABELA M. D. . Mapping Salivary Proteases in Sjögren?s Syndrome Patients Reveals Overexpression of Dipeptidyl Peptidase-4/CD26. Frontiers in Immunology , v. 12, p. -, 2021.

• VASCONCELLOS, ANNA FERNANDA ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; DE OLIVEIRA, ATHOS SILVA ; FONTES, WAGNER ; MELO, REYNALDO MAGALHÃES ; DE SOUSA, MARCELO VALLE ; RESENDE, RENATO OLIVEIRA ; CHARNEAU, SÉBASTIEN . Dynamic proteomic analysis of Aedes aegypti Aag-2 cells infected with Mayaro virus. Parasites & Vectors , v. 13, p. 1-12, 2020.

• SANTIAGO, P. B. ; CHARNEAU, S. ; MANDACARU, S. C. ; BENTES, K. L. S. ; BASTOS, I. M. D. ; SOUSA, M. V. ; RICART, C. A. O. ; ARAUJO, C. N. ; SANTANA, J. . Proteomic Mapping of Multifunctional Complexes Within Triatomine Saliva. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 10, p. 297, 2020.

• BARTH, TANIA ; MANDACARU, SAMUEL COELHO ; CHARNEAU, SÉBASTIEN ; SOUZA, MARCELO VALLE DE ; RICART, CARLOS ANDRÉ ORNELAS ; NORONHA, ELIANE FERREIRA ; SOUZA, AMANDA ARAÚJO ; FREITAS, SONIA MARIA DE ; ROEPSTORFF, PETER ; FONTES, WAGNER ; CASTRO, MARIANA S. ; PIRES JÚNIOR, OSMINDO RODRIGUES . Biochemical and structural characterization of a protein complex containing a hyaluronidase and a CRISP-like protein isolated from the venom of the spider Acanthoscurria natalensis. Journal of Proteomics , v. 192, p. 102-113, 2019.

• MANDACARU, SAMUEL C. ; QUEIROZ, RAYNER M. L. ; ALBORGHETTI, MARCOS R. ; DE OLIVEIRA, LUCAS S. ; DE LIMA, CONSUELO M. R. ; BASTOS, IZABELA M. D. ; SANTANA, JAIME M. ; ROEPSTORFF, PETER ; RICART, CARLOS ANDRÉ O. ; CHARNEAU, SÉBASTIEN . Exoproteome profiling of Trypanosoma cruzi during amastigogenesis early stages. PLoS One , v. 14, p. e0225386, 2019.

• MANDACARU, SAMUEL C. ; VALE, LUIS H.F. DO ; VAHIDI, SIAVASH ; XIAO, YIMING ; SKINNER, OWEN S ; RICART, CARLOS ANDRÉ ORNELAS ; KELLEHER, NEIL L. ; SOUSA, MARCELO VALLE DE ; KONERMANN, LARS . Characterizing the Structure and Oligomerization of Major Royal Jelly Protein 1 (MRJP1) by Mass Spectrometry and Complementary Biophysical Tools. Biochemistry (Easton) , v. 56, p. 1645-1655, 2017.

• QUEIROZ, R. M. L. ; CHARNEAU, S. ; MANDACARU, S. C. ; SCHWAMMLE, V. ; LIMA, B. D. ; ROEPSTORFF, P. ; RICART, C. A. O. . Quantitative Proteomic and Phosphoproteomic Analysis of Trypanosoma cruzi Amastigogenesis. Molecular & Cellular Proteomics (Online) , v. 13, p. 3457-3472, 2014.

• MARTINS, A. M. A. ; CAMPOS, T. A. S. ; MANDACARU, SAMUEL C. . Perfil de Glicanos em Plasma de Pacientes com Carcinoma Hepatocelular por Espectrometria de Massas. In: Congresso de Iniciação Cientifica, 2017, Brasília. Congresso de Iniciação Cientifica da Universidade de Brasília, 2017.

• MARQUES, M. F. R. ; COLOGNA, N. M. ; GOMES, H. A. R. ; VALE, L. H. ; MANDACARU, SAMUEL C. ; F. FILHO, E. X. ; RICART, C. A. O. . Isolamento de complexos multienzimáticos secretados por fungos filamentosos com fins de caracterização molecular. In: Congresso de Iniciação Científica da Universidade de Brasília, 2017, Brasília. Congresso de Iniciação Científica da Universidade de Brasília, 2017.

• MELO, R. M. ; SANTOS JUNIOR, A. C. M. ; MANDACARU, S. C. ; SOUSA, MARCELO VALLE DE ; RICART, C. A. O . Cultivo e Análise de bactérias produtoras de aminoácidos. In: 22 Congresso de Iniciação Científica da UnB, 2016, Brasília. Sustentabilidade: o futuro em nossas mãos, 2016. v. 3. p. 891-891.

• MANDACARU, S. C. ; VALE, L. H. ; VAHIDI, SIAVASH ; XIAO, YIMING ; SKINNER, O. S. ; RICART, C. A. O. ; KELLEHER, N. L. ; SOUSA, MARCELO VALLE DE ; KONERMANN, L. . Characterizing the structure, dynamics and oligomerization of Major Royal Jelly Protein 1 (MRJP1) by mass spectrometry and complementary biophysical tools. In: VI Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016, Brasília. VI Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016. v. 2. p. 86-86.

• COLOGNA, N. M. ; MANDACARU, S. C. ; MARTINS, A. M. A. ; FERREIRA FILHO, E. X. ; RICART, C. A. O. . Análise comparativa de complexos multiproteicos do secretoma de Trichoderma harzianum cultivado em bagaço de cana e fontes definidas de carbono. In: VI Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016, Brasília. VI Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016. v. 2. p. 50-50.

• MANDACARU, S. C. ; QUEIROZ, R. M. L. ; VALE, L. H. ; SKINNER, O. S. ; VAHIDI, S. ; RICART, C. A. O. ; KELLEHER, N. L. ; KONERMANN, L. ; SOUSA, M. V. . Glygosylation Sites and Oligomerization of MRJP1 ? Application of Bottom up, Top down and HDX-MS. In: 14TH Human Proteome Organization World Congress, 2015, Vancouver. Translating Proteomics and Allied -Omics to the Clinic. Vancouver: HUPO. v. 14.

• MANDACARU, S. C. ; QUEIROZ, R. M. L. ; SOUZA, A. R. ; CHARNEAU, S. ; LIMA, B. D. ; RICART, C. A. O. . Regulated nuclear protein analysis of Trypanosoma cruzi amastigogenesis. In: 1st Host-Pathogen Interactions Meeting, 2014, Brasília. 1st Host-Pathogen Interactions Meeting. v. 1. p. 30-31.

• QUEIROZ, R. M. L. ; CHARNEAU, S. ; MANDACARU, S. C. ; SCHWAMMLE, V. ; LIMA, B. D. ; ROEPSTORFF, P. ; RICART, C. A. O. . Quantitative Proteomic and Phosphoproteomic Analysis of Trypanosoma cruzi Amastigogenesis. In: 1st Host-Pathogen Interactions Meeting, 2014, Brasília. 1st Host-Pathogen Interactions Meeting, 2014. v. 1. p. 20-20.

• MANDACARU, S. C. ; QUEIROZ, R. M. L. ; SOUSA, M. V. . Mapeamento de sítios de glicosilação de MRJP1 e sua influência nas estruturas terciárias e oligoméricas. In: IV Simpósio de Biologia Molecular, 2014, Brasília. IV Simpósio de Biologia Molecular, 2014. v. 1. p. 92-92.

• MANDACARU, S. C. . Novas variantes, vacinas e a COVID-19. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MANDACARU, S. C. . A Ciência e o Método Científico. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MANDACARU, S. C. . A Ciência e o Método Científico. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MANDACARU, S. C. . A corrida pelas vacinas contra o coronavírus. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PRACA, Y. R. ; SILVA, S. M. M. ; BENTES, K. L. S. ; CHARNEAU, S. O. ; MANDACARU, S. C. ; SANTIAGO, P. B. ; BASTOS, I. M. D. ; ARAUJO, C. N. ; SANTANA, J. M. . The Triatoma sordida salivary proteome: a cocktail of pharmacologic reagents. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MANDACARU, S. C. . Utilização da Técnica de Espectrometria de Massas em Agentes Infecciosos (Plasmodium Falciparum, Trypanossoma Cruzi e Vírus): A pesquisa básica, clínica e aplicada no contexto multidisciplinar. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MANDACARU, S. C. . Espectrometria de massas aplicada à clínica: HDX e IMS (Ion Mobility Separation), desvendando a natureza dos biomarcadores. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MANDACARU, S. C. ; VALE, L. H. ; SKINNER, O. S. ; RICART, C. A. O. ; KELLEHER, N. L. ; SOUSA, M. V. ; KONERMANN, L. . Characterizing the structure, dynamics and oligomerization of Major Royal Jelly 1 (MRJP1) by mass spectrometry and complementary biophysical tools. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• MANDACARU, S. C. . Regulated nuclear protein analysis of Trypanosoma cruzi amastigogenesis. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MANDACARU, S. C. ; SILVA, L. P. ; SOUSA, M. V. . Análise dos estados oligoméricos de MRJP1 de Apis mellifera. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• MANDACARU, S. C. ; SILVA, L. P. ; SOUSA, M. V. . Caracterização de estados oligoméricos de MRJP1 de Apis mellifera. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• MANDACARU, S. C. ; CORDEIRO, A.N ; XAVIER, M. A. S ; LIMA, B.D ; ERICSSON, A. R. O . Oligonucleotídeos de Leishmania chagasi Signficativos ao Diagnóstico de Leishmaniose Visceral. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• MANDACARU, S. C. ; CORDEIRO, A.N ; XAVIER, M. A. S ; LIMA, B.D ; ERICSSON, A. R. O . Pesquisa de Oligonucleotídeos de Leishmania chagasi Significativos ao Diagnóstico Molecular da Leishmaniose Visceral por PCR. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• MANDACARU, S. C. . Estrutura Oligomérica e Dinâmica de Major Royal Jelly Protein 1 (MRJP1)/Apisimina Analisadas por Espectrometria de Massas e Técnicas Complementares 2017 (Tese de doutorado).

• MANDACARU, S. C. . Análise de proteínas nucleares reguladas na amastigogênese e complexos proteico de Trypanosoma cruzi 2013 (Dissertação).

• MANDACARU, S. C. ; GRELIER, P. . Introduction to mass spectrometry, sample preparation and data analysis. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  Aspirado traqueal como fonte de biomarcadores de gravidade para prognóstico clínico na COVID-19, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Fernando Augusto Bozza - Integrante / Ana Gisele da Costa Neves Ferreira - Integrante / Camila Ribeiro Rodrigues de Pão Cunha - Integrante / Eugenio Damaceno Hottz - Integrante / Monique Ramos de Oliveira Trugilho - Coordenador.

• 2018 - Atual

  Análise proteômica funcional de proteínas envolvidas na invasão eritrocitária de Plasmodium falciparum por marcação de proximidade baseado em APEX2 mediado pelo sistema CRISPR/Cas9, Descrição: A malária se deve ao desenvolvimento e multiplicação de parasitos Plasmodium dentro de eritrócitos humanos e aos seus ciclos eritrocitários repetidos. Uma vez que bloquear a invasão deve impedir o crescimento do parasito, uma melhor compreensão da biologia do ciclo eritrocitário de P. falciparum e das interações moleculares com o eritrócito hospedeiro são um pré-requisito fortemente esperado para desenvolver estratégias terapêuticas alternativas. Um estudo detalhado das redes de interação proteína-proteína (IPP) é muito útil para a caracterização funcional de proteínas. Nesse contexto, dois aspectos da invasão eritrocitária pelo merozoíto, a forma infecciosa nos interessam. Por um lado, a invasão da célula hospedeira pelo merozoíto é um processo ativo alimentado por um complexo motor actina-miosina localizado entre a membrana plasmática do parasito e a organela chamada de Complexo de Membrana Interno (- CMI - um conjunto de cisternas de membranas ligadas abaixo da membrana plasmática). A identificação de proteínas que se localizam nos componentes de CMI e interagem com o motor poderia revelar alguns componentes importantes para a invasão. Além disso, o estudo recente do palmitoma de P. falciparum permitiu a identificação de um número significativo de proteínas palmitoiladas que desempenham um papel crucial na interação entre P. falciparum e a célula hospedeira, incluindo na invasão eritrocitária e na patogênese, várias delas localizadas no CMI. Esta modificação pós-traducional (MPT) lipídica, palmitoilação, parece particularmente importante na regulação da estrutura ou função do CMI. Determinar com precisão quais proteínas são palmitoiladas por palmitoil-acil-transferase (PAT) e quais interagem com PAT expressa em merozoíto poderia revelar importante(s) mecanismo(s) da invasão. Por outro lado, a calmodulina (CaM) é uma proteína mensageira intermediária multifuncional que transmite sinais de cálcio ao ligar-se a esses íons. Após a formação do complexo de CaM-Ca2+, este interage e regula vários alvos proteicos, incluindo as proteínas cinases. Foi relatado o envolvimento de PfCaM-Ca2+ na invasão eritrocitária e a identificação de uma via de sinalização que envolve a ativação da proteína cinase B-like (PfPKB) por PfCaM-Ca2+. Além disso, PfPKB interage com o CMI e ativa por fosforilação a PfGAP45, um componente do motor actina-miosina. Muito poucos alvos de CaM foram identificados em P. falciparum. O estudo dos interatomas com PfCaM-Ca2+ e com PfPKB poderia revelar vias de sinalização de invasão de eritrócitos. Os métodos existentes de identificação de proteínas de complexos proteicos, tais como a geração de anticorpos monoclonais, purificação de afinidade, e de screening por duplo híbrido em levedura, todos têm inconvenientes e as limitações técnicas são comuns. Neste projeto, serão empregadas estas técnicas para o uso em P. falciparum para atender a duas problemáticas: 1) Como a palmitoilação e os componentes do CMI estão especificamente envolvidos na invasão eritrocitária pelo merozoíto? 2) Como a via de transdução de sinal desencadeada por PfCaM-Ca2+ está envolvida na invasão eritrocitária pelo merozoíto, além de como através da PfPKB esta via está relacionada aos componentes do CMI? Assim, para buscar responder a essas perguntas, queremos avaliar, através de modificação genética e transfecção, o papel de 4 proteínas de interesse, GAPM2, a palmitoil-acil-transferase DHHC9, a PfCaM, e a PfPKB, na invasão eritrocitária pelo merozoíto, identificando os parceiros ligantes que estão interagindo com as proteínas de interesse e para realizar sua citolocalização. Vamos aplicar a estratégia de enriquecimento citada acima, com proteína de interesse fusionada à APEX2 obtida pelo sistema CRISPR/Cas9. FAPDF - Edital 04/2017 - SELEÇÃO PÚBLICA DE PROPOSTAS DE PESQUISA CIENTÍFICA, TECNOLÓGICA E INOVAÇÃO DEMANDA ESPONTÂNEA. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Sébastien Olivier Charneau - Coordenador.

• 2018 - Atual

  Análise interatômica da proteína calmodulina de Plasmodium falciparum, Descrição: A malária, em humanos, pode ser transmitida por cinco espécies do gênero Plasmodium. Dentre elas, P. falciparum é a espécie que tem a maior mortalidade e a única que transmite a malária cerebral, forma mais severa da doença. O parasito desenvolveu resistência à maioria dos antimaláricos que foram introduzidas no campo. Derivados de artemisinina permanecem como a droga de primeira linha para combater esta doença, no entanto atender o recente surgimento de resistência tornou-se uma prioridade global de saúde. A malária se deve ao desenvolvimento e multiplicação do parasito Plasmodium dentro de eritrócitos humanos. Esse desenvolvimento se dá em ciclos de período determinado, alterando a sua célula hospedeira para permitir a absorção dos nutrientes, a sua reprodução e evasão imune. Como o parasito não pode se replicar fora da célula hospedeira, a sua capacidade de reconhecer e invadir os eritrócitos é um passo essencial para a sua sobrevivência e a patogênese da malária. A sequência ordenada dos eventos celulares deste protozoário é razoavelmente definida em nível subcelular, mas as moléculas envolvidas em níveis estruturais e regulatórios e, principalmente, a interação entre elas não são bem conhecidas. Entender esses mecanismos é mais do que simplesmente uma questão biológica interessante. Como a invasão eritrocitária é uma parte obrigatória do ciclo de vida, bloquear a invasão deve impedir o crescimento do parasito, tornando a invasão um alvo atraente de drogas e vacinas. Baseados em técnicas de bioquímica, biofísica, biologia molecular e engenharia genética, tal projeto visa buscar alvos proteicos que interagem com a calmodulina e que podem servir como alvos de drogas contra o parasita Plasmodium falciparum.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Coordenador / Sébastien Olivier Charneau - Integrante / Ygor Gabriel Alves Pinheiro - Integrante / Guilherme Henrique de Jesus Pereira - Integrante / Lucas Vinícius Oliveira Sousa - Integrante / Izadora Bonifácio de Carvalho - Integrante / Brenda Lúcia Burtuli Perondi - Integrante.

• 2017 - Atual

  Núcleo de Genômica, Proteômica, Metabolômica e Enzimologia em Biorrefinarias, Descrição: A presente proposta do ?Núcleo de Genômica, Proteômica, Metabolômica e Enzimologia em Biorrefinarias? surge como continuação e ampliação natural do Núcleo de Excelência estabelecido em resposta a edital Pronex anterior da FAPDF e denominado ?Núcleo de Genômica, Proteômica e Enzimologia de Fungos e Bactérias Anaeróbicas Lignocelulolíticos?. Ao fim do projeto anterior, algumas perspectivas para projetos futuros foram definidas: (a) continuar aplicando genômica, proteômica e enzimologia sobre fungos e bactérias, porém utilizando agora técnicas muito mais modernas, que foram implantadas durante o projeto; (b) assar a usar fungos e bactérias como produtores não apenas de enzimas lignocelulolíticas, mas também de aminoácidos para uso em aplicações biotecnológicas, químicas e farmacêuticas; (c) Passar a usar fungos, bactérias e suas enzimas em biorrefinarias não apenas para produção de bioetanol, mas também para produção de outras moléculas de interesses biotecnológico, químico e farmacêutico a a partir de substratos e resíduos agroindustriais. Biorrefinaria é definida como uma instalação que integra processos e equipamentos de conversão de biomassa para produzir combustíveis, energia e produtos químicos a partir de biomassa. Assim, o objetivo de uma biorrefinaria é agregar valor à biomassa, incluindo lignocelulósica, em sua conversão a produtos úteis usando uma combinação de tecnologias e processos. Bioprocessos consistem no uso de reações enzimáticas via microrganismos, extrato celular ou enzimas puras com o objetivo de se obter um maior rendimento e produtividade do composto a ser sintetizado. O presente Núcleo de Excelência tem como objetivos (1) utilizar fungos, leveduras, bactérias e suas enzimas em biorrefinarias a fim de (2) produzir biomoléculas como mono/oligossacarídeos, derivados de lignina, aminoácidos e, a partir destes, (3) direcionar fermentações por leveduras até produtos de interesses biotecnológico, químico e farmacêutico. Para tal, utilizará metodologias de microcultivo e fermentação, genômica, transcriptômica, proteômica, metabolômica, bioinformática, purificação e caracterização de enzimas, expressão heteróloga de genes, entre outras. FAPDF - - Edital: 07/2016 Programa de Apoio a Núcleos de Excelência PRONEX/FAPDF/CNPq.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Marcelo Valle de Sousa - Coordenador.

• 2017 - Atual

  Explorando a Interação Vírus/Vetor/Hospedeiro e o Desenvolvimento de Drogas Antivirais como Estratégias de Controle de Arboviroses e seu Vetor Aedes Aegypti, Descrição: Embora o vírus da dengue seja responsável por epidemias anuais no Brasil, a recente introdução do vírus Zika potencializou a importância de prevenir e combater as arboviroses transmitidas por mosquitos do gênero Aedes. Apesar da maioria das pessoas infectadas por Zika apresentarem infecções assintomáticas, esse vírus está associado com a indução de malformações neurológicas em recém-nascidos como microcefalia, Síndrome de Guillan-Barré e malformações oculares. No Distrito Federal (DF) - apesar do longo período de seca anual - dengue, febre amarela, febre chikungunya e zika já foram reportadas. Como os vetores destas doenças, principalmente o A. aegypti, estão adaptados às condições climáticas brasileiras, evitar a proliferação desses mosquitos é uma medida que deve ser mantida ininterruptamente. Embora crucial, a adição de larvicidas em água parada nos centros urbanos não é suficiente para abolir a reprodução desses mosquitos e, consequentemente, erradicar essas arbovirores. Assim, táticas holísticas são imprescindíveis nesse combate, não só englobando o controle da população de mosquitos vetores, mas também com foco na imunização da população e no tratamento de indivíduos quem venham a ser infectados. Para tal, principalmente em se tratando de doenças emergentes como a febre chikungunya e zika, é necessário o conhecimento biológico da tríplice interação vírus, vetor e hospedeiros para o uso e desenvolvimento de inseticidas, larvicidas, vacinas e drogas antivirais, além do estudo de aspectos e padrões ecológicos das transmissões. Essa parece ser uma condição única do Brasil, pelas características de infeções simultâneas de arboviroses e de interações diferencias com o mosquito vetor. Nesse sentido, este projeto apresenta objetivos práticos e claros, agrupados em três subgrupos principais. O primeiro subgrupo possui linhas de pesquisa voltadas às relações arbovírus-vetor, com foco na aquisição e eficiência de transmissão de arbovírus por mosquitos presentes no DF; além disso, visa produzir clones infecciosos (genética reversa) e analisar a resposta genética de células infectadas (análises de expressão gênica e proteica - proteômica e transcriptoma) a fim de entender os mecanismos virais de replicação e propagação. O segundo subgrupo possui linhas de pesquisa voltadas para respostas celulares à infecção, como respostas imunológicas e inflamatórias de células e modelos animais após infecção por arbovírus. O terceiro subgrupo tem como foco a busca, o desenvolvimento e avaliação de drogas antivirais. As linhas de pesquisa dos três subgrupos são complementares e inter-relacionadas, visando a produção de conhecimentos básicos e aplicados no combate às arboviroses e o seus vetores. Este projeto está sob a coordenação do Doutor Renato de Oliveira Resende, professor titular do Laboratório de Microscopia Eletrônica e Virologia da Universidade de Brasília (UnB). Os pesquisadores envolvidos representam, nas áreas do conhecimento em virologia, bioquímica, estrutura de proteínas, imunologia, interação patógeno-hospedeiro, os principais e mais produtivos grupos de excelência de pesquisa na região Centro-Oeste, com tradição na produção e publicação de conhecimentos básicos e aplicados. A qualificação das equipes permite antecipar o sucesso do apoio financeiro do GDF ao projeto, e a transferência e aplicação do conhecimento gerado às instituições públicas e privadas e á comunidade do Distrito Federal. FAPDF - Edital 04/2016 - Demanda Induzida - Aedes Aegypti e as arboviroses Zika, Chikungunya e Dengue. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Renato de Oliveira Resende - Coordenador.

• 2017 - Atual

  Caracterização de proteínas e complexos proteicos de bactérias produtoras de aminoácidos por proteômica top-down, Descrição: Aminoácidos são os monômeros formadores de proteínas, entretanto, possuem diversas outras funções em qualquer organismo, seja ele microbiano, vegetal ou animal. O Brasil é um grande importador de aminoácidos, principalmente metionina, tanto para uso em nutrição animal, quanto vegetal. Segundo estudo do Ministério do Desenvolvimento, Indústria e Comércio (MDIC), o país importou mais de R$ 350 milhões em aminoácidos, com mais de R$ 291 milhões em metionina (90 mil ton) em 2011. A produção comercial de aminoácidos é realizada atualmente via síntese química ou hidrólise proteica, que são processos caros. Por exemplo, a síntese química de metionina leva à geração de uma mistura de D- e L-metionina e é um processo poluidor, enquanto que a hidrólise de proteína produz misturas complexas de aminoácidos, das quais a metionina tem quer ser separada. É extremamente desejável o desenvolvimento de processo de produção de metionina baseado em fermentação biológica, à semelhança de processos correntes para outros aminoácidos. Face a importância dos aminoácidos em nutrição e fisiologia animal e da posição do Brasil como importador de diversos aminoácidos, propomos o desenvolvimento de atividade de pesquisa proteômica aplicada a bactérias produtoras de aminoácidos, através do uso de uma técnica de espectrometria de massas proteômica chamada top-down, visando a maior compreensão do metabolismo destes micro-organismos. As proteínas são nano-máquinas essenciais para o metabolismo celular, mas a alta variabilidade e complexidade de suas estruturas e funções continuam a desafiar a ciência. A estratégia tradicional em proteômica, chamada bottom-up, degrada as proteínas em fragmentos menores a fim de analisá-las, mas, no processo, perde informações importantes sobre o contexto biológico. Em contraste, a proteômica top-down permite analisar diretamente proteínas intactas em suas estruturas primárias a fim de preservar informações biologicamente importantes, tais como (1) modificações pós-traducionais, (2) interações proteicas, (3) sitio de interações proteína-ligante, (4) receptores de membrana, (5) proteoformas, (6) desvendamento completo de sequências de proteínas e (7), atualmente, vislumbrando o estudo de complexos proteicos em formas nativas. Em relação a estudos proteômicos em bactérias, a abordagem bottom-up sempre esteve como a mais utilizada, por se tratar da técnica mais antiga de espectrometria de massas proteômica e pela sua maior facilidade de execução. Por outro lado, a proteômica top-down é relativamente jovem e requer espectrômetros de massas de última geração e pesquisadores com o conhecimento, treinamento e experiência na técnica. A proteômica top-down está sendo implantada pelo coordenador deste projeto, Prof. Luis H. F. do Vale, no Laboratório de Bioquímica e Química de Proteínas da Universidade de Brasília (LBQP-UnB). O LBQP, por sua vez, adquiriu um espectrômetro de massas de alto desempenho, acurácia e resolução, via projeto CT-Infra, FINEP (ref. 0439/11) coordenado pelo Prof. Marcelo Valle de Sousa, que possibilita a execução eficiente da proteômica top-down. A presente proposta tem como objetivo aplicar a proteômica top-down em estudo da bioquímica de bactérias produtoras de aminoácidos, especialmente à aquelas com maior produção de metionina, utilizando da caracterização de suas proteínas e complexos proteicos secretados e intracelulares, como a determinação da natureza e localização de modificações pós-traducionais, as sequências de proteoformas, a distribuição de pontos de interações proteína-proteína e/ou proteína-ligante, visando a melhor compreensão do metabolismo dos aminoácidos destes micro-organismos. FAPDF - Edital 04/2017 - SELEÇÃO PÚBLICA DE PROPOSTAS DE PESQUISA CIENTÍFICA, TECNOLÓGICA E INOVAÇÃO DEMANDA ESPONTÂNEA. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Luis Henrique Ferreira do Valle - Coordenador.

• 2013 - 2017

  Caracterização estrutural de MRJP1 e sua estrutura terciária, Descrição: Proteínas como as MRJPs (Major Real JellyProteins) são as principais glicoproteínas encontradas na geleia real. Essas proteínas estão relacionadas com a determinação de casta e funções sociais durante diferenciação das larvas. Estudos demonstraram que a proteína MRJP1 está também entre as proteínas mais expressas no cérebro de abelhas nutridoras, além de ter sido detectadas na secreção da glândula hipofaríngea em nutridoras. Anteriormente descrita como uma reserva de aminoácidos, MRJP1 passou recentemente a ser reconhecida como uma importante proteína envolvida na regulação da diferenciação larval em rainha, induzindo a diminuição do tempo de desenvolvimento e aumento no tamanho da massa na fase adulta e no tamanho do ovário. O processo foi atribuído a mecanismos relacionados com ativação de quinase p70 S6 e aumento do título do hormônio juvenil, essencial ao desenvolvimento do ovário. Curiosamente, o monômero de MRJP1 também induziu mudanças fisiológicas e morfológicas em Drosophila fêmeas, lembrando o fenótipo de abelhas rainhas, também por um mecanismo semelhante ao destes insetos. Em tecido neural, MRJP1 parece ter eventuais funções ainda desconhecidas, que possivelmente surgiram durante a evolução da sociabilidade. Diante da evidente importância funcional de MRJP1 e reconhecendo-se que a estrutura tridimensional de uma macromolécula biológica está intimamente relacionada à sua função, este projeto visa a caracterização e elucidação da estrutura terciária da proteína MRJP1.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Marcelo Valle de Sousa - Coordenador.

• 2011 - 2013

  Análise de complexos proteicos de Trypanosoma cruzi, Descrição: O projeto é destinado à geração de conhecimento no contexto de complexos proteicos de Trypanosoma cruzi, assunto pouco abordado que poderá direcionar uma melhor compreensão da biologia do parasita causador da doença de Chagas. Desta forma, pode a médio e longo prazo contribuir para a geração e escolha de novas abordagens terapêuticas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Beatriz Dolabela de Lima - Integrante / Carlos André Ornelas Ricart - Coordenador.

• 2009 - 2011

  Diagnóstico Molecular da Leishmaniose Visceral por PCR, Descrição: Estabelecer metodologia de diagnóstico molecular da Leishmaniose Visceral (LV) em pacientes atendidos no Hospital Universitário Clemente de Faria - Montes Claros - MG. Serão realizadas análises Parasitológicas, Imunológicas (Calazar detect) e Moleculares (PCR) em amostras sanguíneas e medula óssea dos pacientes que derem entrada no hospital com suspeita de LV. Projeto aprovado pelo Comitê de Ética da UNIMONTES (processo no: 1006/08).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Mauro Aparecido de Souza Xavier - Integrante / Beatriz Dolabela de Lima - Integrante / Alessandra Rejane Ericsson Xavier - Coordenador.

• 2009 - 2011

  Desenvolvimento de Metodologias para Diagnóstico Molecular de Doenças Parasitárias, Descrição: Doenças parasitárias como as Leishmanioses e Doença de Chagas são moléstias causadas por parasitas da Família Trypanosomatidae e afetam milhares de pessoas em todo o mundo. A evolução destes parasitas os permitiu modular e proporcionar o sistema imune do hospedeiro de maneira a se tornar apto para o estabelecimento da infecção. Os métodos clássicos de detecção das infecções ainda apresentam algumas dificuldades para o diagnóstico. A mortalidade e as seqüelas/severidade dessas doenças podem ser prevenidas com um correto diagnóstico, uma vez que este possibilita um melhor direcionamento ao tratamento. As técnicas moleculares vem como uma poderosa ferramenta rápida, sensível e específica para diagnóstico de doenças parasitárias como as Leishmanioses e Doença de Chagas. Edital FAPDF 04/2009 Pesquisa para o SUS - Gestão Compartilhada em Saúde - PPSUS-DF (2010 - 2011).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Samuel Coelho Mandacaru - Integrante / Beatriz Dolabela de Lima - Coordenador / Alessandra Rejane Ericsson Xavier - Integrante.

Prêmios