Jorge Estefano Santana de Souza
Possui graduação em Ciência da Computação pela Universidade de Santo Amaro (2001). Doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (2008). Atuou na área de Bioinformática no Ludwig Institute for Cancer Research (2001-2012). Atualmente é professor adjunto no Instituto Metrópole Digital (IMD/UFRN), Tem experiência na área de Genética com ênfase em Bioinformática e Genômica, atuando principalmente nos seguintes temas: Câncer, Biologia Molecular, Genômica e Transcriptômica.
Informações coletadas do Lattes em 09/02/2026
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Bioinformatica
2002 - 2008
Universidade de São Paulo
Título: Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial
, Ano de obtenção: 2008. Sandro José de Souza. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
Graduação em Ciência da Computação
1998 - 2001
Universidade de Santo Amaro
Bolsista do(a): Instituto butanta, INTITUTO BUTANTA, Brasil.
Pós-doutorado
2009 - 2011
Pós-Doutorado. , Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, ILPC, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
Idiomas
Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.
Organização de eventos
STRANSKY, B. ; DALMOLIN, R. J. S. ; COSTA, C. R. ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA . II Natal Bioinformatics Forum - BIOINFORMATICS IN A POST-PANDEMIC WORLD. 2023. (Congresso).
Souza, Jorge Estefano Santana de . bINFO - Seminários de Bioinformática. 2022. (Outro).
DE SOUZA, JORGE E. . bINFO - Seminários de Bioinformática. 2021. (Outro).
SOUZA, JORGE E . bINFO - Seminários de Bioinformática. 2020. (Outro).
STRANSKY, B. ; DALMOLIN, R. J. S. ; COSTA, C. R. ; DE SOUZA, GUSTAVO ; TERREMATTE, P. C. A. ; SAKAMOTO, TETSU ; SOUZA, JORGE E. S. DE . I Natal Bioinformatics Forum. 2019. (Congresso).
SOUZA, JORGE ES . bINFO - Seminários de Bioinformática. 2019. (Outro).
Souza, JES . bINFO - Seminários de Bioinformática IV. 2018. (Outro).
OHNO-MACHADO, L. ; de Souza SJ ; De Souza, J. E. S. . Aplicações de Informática para a saúde global. 2018. (Outro).
Souza, JES . Curso teórico-prático em Introdução à análise de dados de sequenciadores de segunda geração. 2018. (Outro).
De Souza, J. E. S. . bINFO - Seminários de Bioinformática III. 2017. (Outro).
De Souza, J. E. S. . Seminário em Bioinformática UFRN-UFPA: Aplicações Profissionais da Bioinformática. 2017. (Outro).
Souza, JES . 1.o. Curso teórico-prático em Introdução à análise de dados de sequenciadores de segunda geração. 2017. (Outro).
De Souza, J. E. S. . bINFO - Seminários de Bioinformática II. 2016. (Outro).
Souza, JES . I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática. 2016. (Congresso).
De Souza, J. E. S. . bINFO - Seminários de Bioinformática. 2015. (Outro).
STRANSKY, B. ; EILS, R. ; De Souza, J. E. S. . SB-Meeting - Europe-Brazil Meeting on Systems and Synthetic Biology. 2014. (Congresso).
MABILA, F. ; OHNO-MACHADO, L. ; de Souza SJ ; De Souza, J. E. S. . Introductory Course in Bioinformatics. 2014. (Outro).
SILVA JUNIOR, W. ; NOUSHMEHR, H. ; DE SOUZA, JORGE E. S. . IX Curso de Verão em Bioinformática. 2013. (Outro).
DE SOUZA, JORGE E. S. ; SILVA JUNIOR, W. . Escola de estudos avançados em Genômica. 2013. (Outro).
SILVA JUNIOR, W. ; NOUSHMEHR, H. ; DE SOUZA, JORGE E. S. . Cancer Genome Workshop. 2012. (Congresso).
de Souza, Sandro J. ; OHNO-MACHADO, L. ; DE SOUZA, JORGE E. S. . A Bioinformática no Século 21. 2012. (Outro).
de Souza, S. J. ; Silva, W. A. ; de Souza, J. E. . I Oficina de Bioinformática EMU-FAPESP. 2011. (Congresso).
Souza, S.J. de ; J. Barrera ; Souza, J.E. de . 2st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2003. (Congresso).
Participação em eventos
8º Congresso da LIGA Contra o Câncer. Tecnologias computacionais para aplicação na prática clínica. 2025. (Congresso).
EMBS WEEK 2025 - IEEE.EMBS WEEK 2025 - IEEE. 2025. (Simpósio).
X-meeting 2025. 2025. (Congresso).
XXXVI CIC (2025). Estudo e Customização do Pipeline genomeassembler para Montagem e Análise de Genomas Eucariotos no ambiente computacional do BioME - IMD/UFRN. 2025. (Congresso).
Eco Tech Talks.Diversidade mitogenômica em peixes da amazônia: data mining, montagem, anotação e insights.. 2024. (Simpósio).
II Natal Bioinformatics Forum - BIOINFORMATICS IN A POST-PANDEMIC WORLD. 2023. (Simpósio).
VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática (VI SNNB). Mitogenoma. 2023. (Congresso).
XXXIV Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. Construção de tecnologias e suporte de ambiente computacional BioMe (Redes e Infraestrutura). 2023. (Congresso).
Aplicações de Informática para a saúde global.Interfaces em Bioinformática. 2018. (Simpósio).
CHALLENGES FOR THE INTEGRATION OF MEDICINE AND INFORMATION TECHNOLOGY.Integração de dados na identificação de variantes patogênicas. 2018. (Simpósio).
9th IUPAP International Conference on Biological Physics.R-Peridot: A Dynamic, Expansible and User Friendly Tool For Differential Expression Analysis of RNA-Seq and Gene Ontology.. 2017. (Simpósio).
Aplicações da Bioinformática como resposta sustentável aos desafios da Bio Ciência em Moçambique.Desenvolvimento de aplicativos para Bioinformática. 2017. (Simpósio).
III Curso Biologia de Sistema em Câncer.Bioinformática - Conceitos Básicos e Aplicados. 2017. (Oficina).
II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática. Introdução a NGS. 2017. (Congresso).
XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. Continuação de plano de trabalho para a implementação de interface amigável de análise de genes diferencialmente expressos. 2017. (Congresso).
FeSBE XI Reunião Regional. Bioinformática aplicada ao câncer.. 2016. (Congresso).
II Biologia Sistêmica do Câncer.Análise de RNAseq. 2016. (Simpósio).
II Curso de Atualização em Genética Humana.Oncogenômica na era do Big Data. 2016. (Oficina).
I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática. Bioinformática aplicada ao câncer.. 2016. (Congresso).
SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease.SGS: Statistical Gene Signature For RNA-Seq Analysis. 2016. (Simpósio).
XXVII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas.. 2016. (Congresso).
CBAB-2015: Use of Bioinformatics for the study of Vaccines.Hands-on RNAseq. 2015. (Outra).
Curso Biologia de Sistema em Câncer.Análise de mutações em exoma. 2015. (Seminário).
AC camargo Cancer Center - Disciplina de Pós-Graduação: MicroRNAs e Câncer.Análise bioinformática de miRNAs. Discussão de projetos pesquisa. 2014. (Seminário).
EV376-2014 - BIOLOGIA SISTÊMICA DO CÂNCER.Bioinformática Aplicada ao Câncer. 2014. (Oficina).
59o. Congresso Brasileiro de Genética. 2013. (Congresso).
Cancer Genome Workshop. 2012. (Oficina).
Curso de Verão 2012 - Bioinformática - FMRP - USP.Introdução ao splicing alternativo. 2012. (Oficina).
Curso RNAseq (RNAseqcourse).Bioscope and TORQUE for analysis of SOLiD reads. 2012. (Oficina).
International Workshop on Genomics of Health and Diseases. Using RNAseq to identify gene expression signature in adenocarcinoma of rectum. 2011. (Congresso).
I Oficina de Bioinformática EMU-FAPESP.Plataforma de alta-performance computacional aplicada na analise de Splicing alternativo e diversidade genética. 2011. (Oficina).
X-meetig 2009. ANALYSIS OF ALLELIC DIFFERENTIAL EXPRESSION IN THE HUMAN GENOME USING ALLELE-SPECIFIC SAGE TAGS.. 2009. (Congresso).
3st International Conference of the AB3C ?X-meeting. Identification of Mono-allelic Gene Expression and Differential Allelic Gene Expression in the Human Genome. 2007. (Congresso).
1st International Conference of the AB3C ?X-meeting?. Identification of novel imprinted genes using allele-specific SAGE and MPSS tags. 2005. (Congresso).
2st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Study of the correlation of ESEs disrupted by SNPs and alternative splicing. 2004. (Congresso).
1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology.. A large-scale study of SNPs in regulatory elements of alternative splicing and their possible association to human diseases. 2003. (Congresso).
Participação em bancas
de Souza, J. E.; FERREIRA, B. S.; MEDEIROS, INÁCIO. Uso e Desenvolvimento de Métodos Computacionais Para Solucionar Problemas Biológicos. 2024. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, A. K. C. R.; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M; QUARESMA, J. A. S.;De Souza, J. E. S.. CARACTERIZAÇÃO DO EXOMA DE POPULAÇÕES HUMANAS DA AMAZÔNIA EM RELAÇÃO À INFECÇÃO PELO SARs-CoV-2. 2023. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
de Souza, J. E.; SAKAMOTO, TETSU; COSATE, M. R. V.. ANÁLISE FILOGENÉTICA DOS GENES DO LOCUS rfb DO GÊNERO Leptospira DOS SOROGRUPOS SERJOE, MINI E HEBDOMADIS. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; ASSUMPCAO, P. P.; BORGES, B. N.; Amanda Ferreira Vidal. ANÁLISE DA EXPRESSÃO DE RNAs LONGOS NÃO CODIFICANTES NO ADENOCARCINOMA GÁTRICO. 2022. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
Pereira, Lygia V.; HADDAD, L. A.; MENCK, C. F. M.;De Souza, J. E. S.. Análises in silico e in vitro da inativação do cromossomo X em primatas. 2021. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
FIGUEROLA, W. B.;De Souza, J. E. S.; SANTOS, A. K. C. R.. RNA-Gatherer: uma ferramenta computacional para anotacao de RNAs nao-codificantes em organismos pouco conhecidos. 2021. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; DALMOLIN, R. J. S.; SANTOS, S. E. B.. Analise exploratoria do transcriptoma do Arapaima gigas. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; JERONIMO, S.; BALBINO, V.. ALPORT AUTOSSOMICA: UM ESTUDO DE DUAS FAMILIAS NORTE-RIO-GRANDENSE. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, S. J.;De Souza, J. E. S.; SANTOS, A. K. C. R.. neoANT-HILL: uma ferramenta integrada para a deteccao de potenciais neoantigenos. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LANZA, D. C. F.;De Souza, J. E. S.; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO. Metagenoma de um camarao Penaeus vannamei infectado com o virus causador da Sindrome da Mancha Branca. 2019 - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, A. K. C. R.; CORDEIRO, F. M.; SANTOS, S. E. B.;De Souza, J. E. S.. Análise de variantes do gene CDHI no banco de dados 1,000 Genomes. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
DORIA NETO, A. D.; ARAUJO, D. S. A.;De Souza, J. E. S.; SANTOS, A. M.. Autogating em Dados de Citometria de Fluxo Utilizando Classificadores SVM para Identificação de Bacterioplâncton. 2018. Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DALMOLIN, R. J. S.; FIGUEROLA, W. B.;De Souza, J. E. S.. Integração de dados e desenvolvimento de métricas escalável para análise de fatores de transcrição. 2018. Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
AGNEZ, L. F.;De Souza, J. E. S.; VESSONI, A. T.. IMPACTO DA DEFICIENCIA DE XPA NA REGULACAO DE NFE2L2 E PROTEASSOMA. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.;De Souza, J. E. S.; BALBINO, V.. Usando RINs para entender as mutacoes em cancer: mutacoes deleterias sao mais comumente associadas a aminoacidos altamente conectados. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; FERREIRA, B. S.; PASQUALI, M. A. B.. Implementacao de Funcionalidades Para uma Plataforma de Analise de Variantes Genomicas. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.; CASTRO, M. A. A.. Transcriptogramer: Pacote em R para Analise Transcricional. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
AGNEZ, L. F.; MELO, V. M. M.;De Souza, J. E. S.. Characterization of the microbial community of oil reservoir. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, A. K. C. R.; de Souza SJ; DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.. Integração de dados genômicos na identificação de vias tumorigênicas: uma perspectiva de biologia de sistemas. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
de Souza, J. E.; SILVA JUNIOR, W.; GUILIATTI, S.. Abordagem computacional para identificar novos SNVs em base de dados de ESTs. 2012. Dissertação (Mestrado em metrado em Genética) - Universidade de São Paulo.
PAIVA JUNIOR, S. S. L.; STRANSKY, B.; MARTINS, M. L. B.; BALBINO, V.;SOUZA, JORGE E. S.. Identificação de Biomarcadores e Assinaturas Moleculares em Leiomiossarcoma Uterino por Abordagem Multi-ômica. 2025. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SAKAMOTO, TETSU; LIMA, J. P. M. S.;SOUZA, JORGE ES; MONTAG, L. F. A.; SANTOS, S. E. B.. O mitogenoma de Brachyplatystoma filamentosum e a macroevolução do tamanho corporal em bagres (Siluriformes). 2025. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, S. E. B.; SAMPAIO, M. I. C.; HAMOY, I. G.;DE SOUZA, JORGE E.; MONTAG, L. F. A.. GENÔMICA APLICADA AO DESENVOLVIMENTO DE PAINEL MICROSSATÉLITE PARA A ARRAIA NEGRA Potamotrygon leopoldi PARA FINS DE RASTREABILIDADE. 2023 - Universidade Federal do Pará.
DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.; AGNEZ, L. F.; GUIZELINI, D.; MOREIRA, F. C.. MEDUSA: UM FLUXO DE TRABALHO PARA CLASSIFICACAO TAXONOMICA E ANOTACAO FUNCIONAL DE METAGENOMAS. 2022. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; SANTOS, A. M.; FERREIRA, B. S.; SANTOS, S. E. B.; LAJUS, T. B. P.. Selecao de caracteristicas de sequencias para resolucao de perguntas biologicas ligadas a analise de variantes e ao desenvolvimento de siRNAs Anti-SARS-CoV-2. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
TORREZAN, G. T.;De Souza, J. E. S.; NUNES, M. A.; SOUZA, S. J.; SANTOS, A. K. C. R.. MODELO PARA IDENTIFICACAO DE GENES BIMODAIS ASSOCIADOS AO PROGNOSTICO NO CANCER. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, A. K. C. R.; ARAUJO, G. S.; SILBIGER, V. N.; ISHAK, G.;De Souza, J. E. S.. BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AO CÂNCER COLORRETAL: ESTUDO DE PARÂMETROS GENÉTICOS E EPIGENÉTICO EM UMA AMOSTRAGEM DO ESTADO DO RIO GRANDE DO NORTE. 2020. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
JERONIMO, S.; SCORTECCI, K. C.;De Souza, J. E. S.; CARVALHO FILHO, E. M.; SCHRIEFER, N. A. B.. NADANDO CONTRA A CORRENTE: diminuicao dos marcadores inflamatorios em pessoas assintomaticas infectadas pelo virus Chikungunya. 2020. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DORIA NETO, A. D.; ARAUJO, D. S. A.;De Souza, J. E. S.; AMADO, A. M.; UNREIN, F.; MENEZES, R. F.. flowDiv: uma nova ferramenta computacional para analise da diversidade citometrica. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, A. K. C. R.; ASSUPCAO, P. P.; SANTOS, S. E. B.; CORDEIRO, F. M.;Souza, J.E. de. Oncogenômica: microRNAs no Câncer Gástrico. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
SANTOS, A. K. C. R.; SANTOS, S. E. B.; CORDEIRO, F. M.;Souza, JES; HUSNY, A. S. E.. AVALIAÇÃO IN SÍLICO DO EFEITO DAS MUTAÇÕES NOS GENES HBB e CFTR EM INDIVÍDUOS DEPOSITADOS NO 1000 GENOMES DATABASE. 2017. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
MEDEIROS, S. R. B.; THEODORO, R. C.;De Souza, J. E. S.; COUTINHO, L. G.; FARIAS, S. T.. Characterization of RadA/Sms from Chromobacterium violaceum and discovery of a new episome. 2016. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Pereira, Lygia V.; MORGANTE, A. M. V.; Rosenberg, C; Galante, P A F;Souza, JES. Estudos da inativação do cromossomo X em humanos: iniciação e imprinting. 2015. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.
QUARESMA, J. A. S.; CAVALCANTE, G. C.;de Souza, J. E.; NASCIMENTO, M. C. F.. CARACTERIZAÇÃO E ANÁLISE DO MITOGENOMA DE INDIVÍDUOS COM SEQUELAS NEUROLÓGICAS E CARDIOVASCULARES CAUSADAS PELA INFECÇÃO AGUDA DO SARS-CoV-2. 2025 - Universidade Federal do Pará.
Souza, JES; MOIOLI, R. C.; COSTA, C. R.. BioRemPP: uma aplicação Web para identificar o potencial de bactérias, fungos e plantas para biorremediação de poluentes ambientais prioritários. 2025. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Souza, JES; Stefanes, Marco A.; Araujo, Eloi; Rozante, Luiz C. S.. Computação de Alto Desempenho Empregado em um Método de Reconstrução de Árvores Filogenéticas.. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.
PASQUALI, G.;De Souza, J. E. S.; FERREIRA, L. S.. INTEGRACAO DE DADOS MOLECULARES E QUIMICOS PARA ANALISE DA BIOSSINTESE E FLUXO DE METABOLITOS ESPECIAIS EM Erythrina velutina Willd.. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LUCHESSI, A. D.;DE SOUZA, JORGE E. S.; SOUTO, J. T.. Assinatura molecular da COVID-19: análise integrada de conjuntos de dados de RNAseq revela novos alvos e reguladores transcricionais associados à gravidade da doença.. 2023 - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
AGNEZ, L. F.;De Souza, J. E. S.; DALMOLIN, R. J. S.; SAKAMOTO, TETSU. O MICROBIOMA HUMANO NO DESENVOLVIMENTO, PROGRESSAO E TRATAMENTO DO CANCER DE MAMA. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SAKAMOTO, TETSU;de Souza, J. E.; SANTOS, S. E. B.. Prospeccao de Genes com Potencial Biotecnologico para Piscicultura na Regiao Amazonica. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SANTOS, S. E. B.; SAMPAIO, M. I. C.; RAMOS, R. T. J.;De Souza, J. E. S.. GENÔMICA APLICADA AO DESENVOLVIMENTO DE PAINEL MICROSSATÉLITE PARA A ARRAIA NEGRA Potomotrygon leopoldi PARA FINS DE RATREABILIDADE. 2021 - Universidade Federal do Pará.
LANZA, D. C. F.; FERREIRA, L. C.;De Souza, J. E. S.. SINDROME DE ALPORT NO RIO GRANDE DO NORTE: ANALISE DE EXOMA EM DUAS FAMILIAS. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DALMOLIN, R. J. S.; AGNEZ, L. F.;De Souza, J. E. S.. PROTOCOLO MODULAR DE TRANSFERENCIA DE ANOTACAO TAXONOMICA E FUNCIONAL PARA METAGENOMAS. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.. FRAMEWORK PARA EXPANSAO DE ANALISES EVOLUTIVAS DE PLASTICIDADE E ENRAIZAMENTO ATRAVES DE DIFERENTES BANCOS DE ORTOLOGOS. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.; SOUZA, G. A.;De Souza, J. E. S.. Analise e comparacao das mutacoes missense em adenocarcinoma de estomago e suas consequencias estruturais.. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; FERREIRA, B. S.. ANALISE EVOLUTIVA DE GENES ESSENCIAIS EM EUCARIOTOS. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
FERREIRA, L. C.; DALMOLIN, R. J. S.;Souza, JES. REMANDO CONTRA A MARE: diminuicao dos marcadores inflamatorios em pacientes assintomaticos infectados pelo virus Chikungunya. 2019 - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, S. J.;De Souza, J. E. S.; FERREIRA, B. S.. MODELO DE MISTURA DE DISTRIBUICOES PARA EFEITOS DE ALTERACOES GENETICAS NA PROGRESSAO TUMORAL DO CANCER DE MAMA. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
de Souza SJ;De Souza, J. E. S.. Analises de bioinformática revelam novos alvos terapeuticos no surfaceoma humano. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DORIA NETO, A. D.; COSTA, C. R.; ARAUJO, D. S. A.;DE SOUZA, JORGE E. S.. Estudo dos Padrões Citométricos do Bacterioplâncton de Águas Marinhas e Continentais. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
COSTA, C. R.;Stransky, B.De Souza, J. E. S.. S-Score tools no Estudo do Câncer e Uso em Simulação do Desenvolvimento de Células Cancerígenas. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
COSTA, C. R.;De Souza, J. E. S.; de Souza SJ. Identificação genome-wide de genes do câncer/testículo e sua associação com prognóstico em uma análise pan-cancer. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
UCHOA, A. F.; SANTOS, E. A.;Souza, JES. PROSPECÇÃO E OBTENÇÃO DE UM BIOSSURFACTANTE DERIVADO DE UMA BIBLIOTECA METAGENÔMICA.. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, S. J.; MATOS, J. P.; DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.. Exoma de Populações Nativo Americanas da Amazônia e suas Implicações para a Saúde Humana. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
MOREIRA, S. M. G.; SILBIGER, V. N.;Souza, J.E. de. The identification and molecular caracterization of germline mutations in individuals with hereditary breast and ovarian cancer. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, JORGE ES; FERREIRA, B. S.. Análise Integrativa de Dados Genômicos: Mitocôndrias, Variantes Genéticas em Câncer Gástrico e Ferramenta de Predição. 2024. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DE SOUZA, JORGE E. S.; SAKAMOTO, TETSU. AmazonMitoFish: Investigação de genomas mitocondriais de peixes amazônicos. 2024. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; SAKAMOTO, TETSU. EPIDEMIOLOGIA EVOLUTIVA DO GENERO Leptospira e CARACTERIZACAO DE BASES GENETICAS DA IDENTIFICACAO SOROLOGICA. 2023. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SAKAMOTO, TETSU;de Souza, J. E.; JERONIMO, S.. Aplicacao de Aprendizado de Maquina para Encontrar Bases Geneticas Associadas a Classificacao Sorologica de Bacterias do Genero Leptospira. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LANZA, D. C. F.;de Souza, J. E.; DALMOLIN, R. J. S.. Desenho e validacao in silico de primers para reacao em cadeia da polimerase para deteccao de sindrome respiratoria severa aguda do coronavirus 2 (SARS-CoV-2). 2022. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
FERNANDES, M. A. C.; OLIVEIRA, L. A. H. G.;De Souza, J. E. S.. Aprendizagem Profunda Aplicada a Classificacao e Avaliacao do Comportamento do SARS-CoV-2. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia Elétrica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DORIA NETO, A. D.; STRANSKY, B.;De Souza, J. E. S.; SAKAMOTO, TETSU. O Uso de Redes Neurais Artificiais na Analise de Dados de Cancer de Pulmao. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
FIGUEROLA, W. B.;De Souza, J. E. S.. RNA Nexus: um novo software para anotacao de ncRNA e predicao funcional. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SAKAMOTO, TETSU;De Souza, J. E. S.. Investigacao exploratoria dos fatores geneticos associados ao sistema de determinacao sexual em Arapaima gigas (Pirarucu). 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LAJUS, TIRZAH BRAZ PETTA;De Souza, J. E. S.; CAMPOS, J. T. A. M.. CO-EXPRESSAO DE GENES DAS VIAS BER E NER E FATORES DE TRANSCRICAO EM TECIDOS CEREBRAIS. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; LAJUS, T. B. P.. ALPORT AUTOSSOMICA: UM ESTUDO DE DUAS FAMILIAS POTIGUARES. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; SAKAMOTO, TETSU. Analise exploratoria do transcriptoma do Arapaima gigas. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DORIA NETO, A. D.; ARAUJO, D. S. A.;De Souza, J. E. S.. Autogating em Dados de Citometria de Fluxo Utilizando Classificadores SVM para Identificação de Bacterioplâncton. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; DALMOLIN, R. J. S.. TFAT ? TRANSCRIPTION FACTOR ANALYSIS TOOLS. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.;De Souza, J. E. S.. Implementação de Funcionalidades Para uma Plataforma de Análise de Variantes Genômicas. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LIMA, J. P. M. S.;De Souza, J. E. S.; DALMOLIN, R. J. S.; SOUZA, S. J.. Usando RINs para entender as mutacoes em cancer: mutacoes deleterias sao mais comumente associadas a aminoacidos altamente conectados.. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.. Transcriptogramer: Pacote em R para Analise Transcricional. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
VOIGT, E. L.; DALMOLIN, R. J. S.;De Souza, J. E. S.. ESTUDO DA INFLUÊNCIA DO VOO COM O FOGUETE VSB-30 NO TRANSCRIPTOMA DE PLANTAS DE Saccharum spp. (CANA-DE-AÇÚCAR). 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SCORTECCI, K. C.; SALHA, D. R. A. M.;De Souza, J. E. S.. L. infantum genome shows prevalent homogeneity among populations with different clinical outcomes. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
FERREIRA, B. S.; FERREIRA, L. C.;Souza, J.E. de. GLIOBLASTOMA MULTIFORME: ANÁLISE DE DADOS ÔMICOS PARA A CARACTERIZAÇÃO DO PROCESSO TUMORAL. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; FERREIRA, B. S.; MAIA, S. M. D. M.. Desenvolvimento de um aplicativo movel para predicao de mutacoes patogenicas. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Souza, J.E. de; SAKAMOTO, TETSU; LUCIO, P. S. M.. ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO E DETECÇÃO DE POLIMORFISMOS DE BASE ÚNICA ASSOCIADOS A DIFERENCIAÇÃO SEXUAL EM CARICA PAPAYA. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LAJUS, T. B. P.; AZEVEDO, F. M.;De Souza, J. E. S.. Estudo das vias de reparo de DNA em Carcinoma Urotelial. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
LAJUS, T. B. P.; AGNEZ, L. F.;De Souza, J. E. S.. ALTERAÇÃO DA EXPRESSÃO DE GENES RELACIONADOS A DOENÇAS NEURODEGENERATIVAS EM MODELOS INFLAMATÓRIOS TRATADOS COM INIBIDORES DE APE1. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
de Souza SJ;De Souza, J. E. S.; KROLL, JOSÉ E.. Comparação entre amostras selvagens e BRCA-Associadas em câncer de ovário. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.; SOUZA, S. J.; FONSECA, M. M. B.. Reanotacao do surfaceoma e sua integracao com dados genomicos provenientes de amostras de cancer.. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SILVA JUNIOR, W. A.;DE SOUZA, JORGE E. S.; RUIZ, E. E. S.. Uma abordagem computacional para a identificação de vias gênicas reguladas por micro RNAs. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo.
DE SOUZA, JORGE E. S.; BEZERRA, L. C. T.; SANTOS, A. M.. Comissão Examinadora de Concurso Público de Provas e Títulos para o Cargo de Professor área de Inteligência Computacional,. 2018. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.;De Souza, J. E. S.; GUBITOSO, M. D.. Comissão Examinadora de Concurso Público de Provas e Títulos para o Cargo de Professor do Magistério Superior na Classe Adjunto-A/DE, na área de Bioinformática. 2015. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
de Souza, J. E.. Comissão de avaliação científica dos trabalhos do XXXVI Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. 2025. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, JORGE E. S.. revisor do Prêmio Jovem Bioinformata durante o 21º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X Meeting. 2025. Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.
de Souza, J. E.. Comissão de avaliação científica dos trabalhos do XXXV Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. 2024. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, JORGE E. S.. Comissão de avaliação dos trabalhos de Iniciação Científica apresentados pelos alunos durante XXXIV Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN - eCICT 2023. 2023.
Souza, J.E. de. Comissão de avaliação científica dos trabalhos do VI Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, realizado no dia 30, 31 de outubro e 1 de novembro de 2023. 2023. Universidade Federal do Pará.
NUNES, I. D.;de Souza, J. E.; AQUINO, L. D.. Comissão de avaliação do processo de estágio probatório do servidor docente. 2021. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.. Comissão de Avaliação dos trabalhos submetidos à 73ª Reunião Anual da SBPC. 2021. Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - São Paulo.
De Souza, J. E. S.. Comissão de avaliação dos trabalhos de Iniciação Científica apresentados pelos alunos durante o XXXI Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. 2020. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.; SOUZA, G. A.;DE SOUZA, JORGE E. S.; SOUZA, S. J.. Comissão de Avaliação de Estágio Probatório. 2019. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
DORIA NETO, A. D.;de Souza, J. E.; COSTA, C. R.. Comissão de revalidação de diploma de Pós-Graduação. 2019. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
MATOS, J. P.; SOUZA, S. J.;de Souza, J. E.; COSTA, C. R.; LANZA, D. C. F.. Comissão de seleção do Doutorado, do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. 2019. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.. Comissão de avaliação dos trabalhos de Iniciação Científica apresentados pelos alunos durante o XXX Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. 2019. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
de Souza, J. E.; SILVA, I. M. D.; XAVIER JUNIOR, J. C.. Comissão de avaliação do processo de estágio probatório do servidor docente. 2018. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
SOUZA, S. J.;de Souza, J. E.; COSTA, C. R.; LANZA, D. C. F.; MATOS, J. P.. Comissão de seleção do Doutorado, do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática,. 2018. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
De Souza, J. E. S.. Comissão de avaliação dos trabalhos de Iniciação Científica apresentados pelos alunos durante o XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN. 2017. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Orientou
Análise de Genomas de Fungos Patogênicos Humanos Brasileiros Utilizando Biologia Computacional; Início: 2025; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);
Busca de variantes genomicas provenientes do Brasil; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Estudo de Antígenos Tumorais: Uma Abordagem com RNA-seq de Células Únicas; ; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);
Contribuições e correlação na montagem de genomas eucariotos; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);
APLICAÇÃO DE TÉCNICAS DE INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL EM DADOS DE PACIENTE BRASILEIROS JOVENS COM CÂNCER GÁSTRICO; Início: 2024; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Estudo e Customização do Pipeline genomeassembler para Montagem e Análise de Genomas Eucariotos no ambiente computacional do BioME; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Estabelecimento e manutenção de ambientes de desenvolvimento e pesquisa em bioinformática; ; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);
Desenvolvimento de Ferramentas para Análise de Sintenia e Colinearidade de Regiões Genômicas; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Analise exploratória de genes Hox em espécimes de peixes amazônicos; 2023; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Análise de variantes em amostras de câncer em pacientes jovens; 2022; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
RNA-Gatherer: uma ferramenta computacional para anotação de RNAs não-codificantes em organismos pouco conhecidos; 2021; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
EPIDEMIOLOGIA EVOLUTIVA DO GÊNERO Leptospira e CARACTERIZAÇÃO DE BASES GENÉTICAS DA IDENTIFICAÇÃO SOROLÓGICA; 2021; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Fundação de Amparo à Pesquisa ao Desenvolv; Científico e Tecnológico - MA; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Análise exploratória do transcriptoma do Arapaima gigas; 2020; Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
ALPORT AUTOSSÔMICA: UM ESTUDO DE DUAS FAMÍLIAS NORTE-RIO-GRANDENSE; 2019; Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Integração de dados e desenvolvimento de métricas escalável para análise de fatores de transcrição; ; 2018; Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Implementação de Funcionalidades Para uma Plataforma de Análise de Variantes Genômicas; 2018; Dissertação (Mestrado em BIOINFORMATICA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Análise do miRNoma de sangue periférico de pacientes com Leucemia Linfocítica Crônica,; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Seleção de características de sequências para resolução de perguntas biológicas ligadas à análise de variantes e ao desenvolvimento de siRNAs Anti-SARS-CoV-2; 2021; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Caracterização molecular aplicada à identificação de perfis de expressão em leiomiossarcoma uterino com uso da transcriptômica e proteômica; 2020; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
FRAMEWORK PARA EXPANSÃO DE ANÁLISES EVOLUTIVAS DE PLASTICIDADE E ENRAIZAMENTO ATRAVÉS DE DIFERENTES BANCOS DE ORTÓLOGOS; 2018; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Coorientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de um aplicativo móvel para predição de mutações patogênicas; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Análise de Enriquecimento de Genes Obtidos por RNA-seq de Infectados por Vírus Zika e Chykungynya: Uma Abordagem Acerca da Assinatura Biológica no Hospedeiro; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Ambiente de Bioinformática: Suporte/desenvolvimento de ambiente computacional; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de Soluções com Microserviços e Containers para Análises de Genomas Mitocondriais; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de Soluções com Microserviços e Containers para Análises de Genomas Mitocondriais; 2024; Iniciação Científica - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Continuação de desenvolvimento de soluções de softwares modulares, baseada na arquitetura de microserviços e containers; ; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Continuação de desenvolvimento de soluções de softwares modulares, baseada na arquitetura de microserviços e containers; ; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Construção e suporte de ambiente computacional BioMe (Redes e Infraestrutura); 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de solução de software modular, baseada na arquitetura de microserviços e containers; ; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Organização do banco de dados de Doenças Raras na MEJC; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
implementação de interface amigável de análise de genes diferencialmente expressos; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Estudos de métodos para analise e identificação de genes diferencialmente expressos; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Levantamento de Bases de dados de TFs para integração; ; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Fundação Norte Riograndense de Pesquisa e Cultura; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Calculadora de risco para câncer hereditário; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Continuação de plano de trabalho para a implementação de interface amigável de análise de genes diferencialmente expressos; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de interfaces para analise de expressão gênica; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Fundação Norte Riograndense de Pesquisa e Cultura; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de interfaces para análise de Expressão Gênica; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, fundação Hemocentro; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Desenvolvimento de interfaces para analises de variantes genômicas; ; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, fundação Hemocentro; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Treinamento em análises e ferramentas de bioinformática focado em sequenciamento de segunda geração; ; 2013; Orientação de outra natureza - Departamento de Genética, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Treinamento em análises e ferramentas de bioinformática focado em sequenciamento de segunda geração; ; 2013; Orientação de outra natureza - Departamento de Genética, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Treinamento em análises e ferramentas de bioinformática focado em sequenciamento de segunda geração; ; 2013; Orientação de outra natureza - Departamento de Genética, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Plataforma de alta-performance voltada para análises computacionais; ; 2012; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Aplicação da bioinformática no estudo do genoma e transcriptoma humano; ; 2012; Orientação de outra natureza - Instituto de Bioinformática e Biotecnologia; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
; Metodos in silico na identificaçao de genes submetido a imprinting genomico; ; 2012; Orientação de outra natureza - Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Analises de expressão gênica diferencial em osteogenese imperfeita; ; 2012; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;
Produções bibliográficas
-
LILIAN DANTAS CAVALCANTE, RENATA ; SANTOS SILVA, CAIO ; FERREIRA VIDAL, AMANDA ; SOARES PIRES, ÉDER ; LOPES NUNES, GISELE ; FOGAÇA DE ASSIS MONTAG, LUCIANO ; OLIVEIRA, GUILHERME ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; SANTOS, SIDNEY ; JOSÉ DE SOUZA, SANDRO ; ESTEFANO DE SANTANA SOUZA, JORGE ; SAKAMOTO, TETSU . The complete mitogenome of Amazonian Brachyplatystoma filamentosum and the evolutionary history of body size in the order Siluriformes. Scientific Reports , v. 15, p. 9873, 2025.
-
GOMES, DANIEL HENRIQUE FERREIRA ; MEDEIROS, INÁCIO GOMES ; PETTA, TIRZAH BRAZ ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA . DTreePred: an online viewer based on machine learning for pathogenicity prediction of genomic variants. BMC BIOINFORMATICS , v. 26, p. 101, 2025.
-
DE ARAÚJO, WASHINGTON CANDEIA ; FALCÃO, RAUL MAIA ; UCHOA, RAQUEL ARAUJO COSTA ; GARCIA, CARLOS ALEXANDRE ; DA SILVA, ARTHUR QUINTILIANO BEZERRA ; QUIRINO, KESIA LARISSA MEDEIROS ; FREIRE-NETO, FRANCISCO PAULO ; GURGEL, GENILSON PEREIRA ; NASCIMENTO, PAULO RICARDO PORFIRIO ; FERREIRA, LEONARDO CAPISTRANO ; DUGGAL, PRIYA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO S. ; JERONIMO, SELMA M. B. . Whole exome sequencing shows novel COL4A3 and COL4A4 variants as causes of Alport syndrome in Rio Grande do Norte, Brazil. BMC GENOMICS , v. 26, p. 331, 2025.
-
GUERREIRO, SÁVIO L. M. ; VIDAL, AMANDA F. ; SILVA, CAIO S. ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; GOMES, DANIEL H. F. ; FILHO, JÚLIO CÉSAR DA SILVA ; SOUZA, JORGE E. S. DE ; PIRES, ÉDER ; OLIVEIRA, GUILHERME ; MELO, DEBORA SAYUMI DOAMI ; SÁ, ANDRÉ LUIZ ALVES DE ; HAMOY, IGOR ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; SANTOS, SIDNEY E. B. . Analysis of the Entire Mitogenome of the Threatened Freshwater Stingray Potamotrygon leopoldi (Myliobatiformes: Potamotrygonidae) and Comprehensive Phylogenetic Assessment in the Xingu River, Brazilian Amazon. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 26, p. 8252, 2025.
-
FALCAO, RAUL MAIA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO ; MATHIESON, WILLIAM ; CARLSON, JOSEPH WOODWARD ; PETTA, TIRZAH BRAZ . Abstract 1751: Deep multi-omics analysis of uterine leiomyosarcoma reveals defective HRD signature, a novel gene fusion and the amplification of the poor-prognosis CTHRC1 gene. Cancer Research , v. 84, p. 1751-1751, 2024.
-
FALCAO, RAUL MAIA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; GONZALEZ-MOLINA, JORDI ; MATHIESON, WILLIAM ; CARLSON, JOSEPH W. ; PETTA, TIRZAH BRAZ . Deep multi-omics integration approach reveals new molecular features of uterine leiomyosarcoma. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE , v. online, p. 167632, 2024.
-
BARROS, MARIA CLARA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; GOMES, DANIEL HENRIQUE F. ; PINHO, CATARINA TORRES ; SILVA, CAIO S. ; BRAGA-DA-SILVA, CÍNTIA ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; AZEVEDO-PINHEIRO, JHULLY ; QUARESMA, JUAREZ ANTÔNIO SIMÕES ; FALCÃO, LUIZ FÁBIO MAGNO ; COSTA, PATRÍCIA FAGUNDES ; SALGADO, CLÁUDIO GUEDES ; CARNEIRO, THIAGO XAVIER ; BURBANO, ROMMEL RODRIGUES ; DOS SANTOS VIEIRA, JOSÉ RICARDO ; SANTOS, SIDNEY ; SOARES-SOUZA, GIORDANO BRUNO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; et.al . Unraveling the protective genetic architecture of COVID-19 in the Brazilian Amazon. Scientific Reports , v. 14, p. 27332, 2024.
-
MONTAG, LUCIANO FOGAÇA DE ASSIS ; KOROIVA, RICARDO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; MAGALHÃES, LEANDRO ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; SILVA, CAIO S. ; GUERREIRO, SÁVIO ; GOMES, DANIEL H. F. ; SOUZA, JORGE E. S. DE ; SOUZA, SANDRO J. DE ; SEABRA, LIDIA BRASIL ; LUCENA, MARIA DAYANNE LIMA DE ; PRATA, ERIVAL GONÇALVES ; PENHA, IZABELLA CRISTINA DA SILVA ; MICHELAN, THAISA SALA ; LIGEIRO, RAPHAEL ; JUEN, LEANDRO . The Complete Mitogenome of Amazonian Hyphessobrycon heterorhabdus (Characiformes: Characidae) as a Valuable Resource for Phylogenetic Analyses of Characidae. Fishes , v. 8, p. 233, 2023.
-
PINHO, C. T. ; VIDAL, A. F. ; Tatianne Costa Negri Rocha ; OLIVEIRA, R. R. M. ; Maria Clara da Costa Barros ; Laura Closset ; Jhully Azevedo-Pinheiro ; Cíntia Braga-da-Silva ; Caio Santos Silva ; MAGALHAES, L. L. ; Pablo Diego do Carmo ; Giordano Bruno Soares Souza ; José Ricardo dos Santos Vieira ; Rommel Mario Rodríguez Burbano ; Maísa Silva de Sousa ; Souza, Jorge Estefano Santana ; Gisele Nunes ; Moises Batista da Silva ; Patrícia Fagundes da Costa ; Claudio Guedes Salgado ; et.al . Transmission dynamics of SARS-CoV-2 variants in the Brazilian state of Pará. FRONTIERS IN PUBLIC HEALTH , v. 11, p. 1186463, 2023.
-
JUEN, LEANDRO ; KOROIVA, RICARDO ; GERALDO DE CARVALHO, FERNANDO ; MENDOZA-PENAGOS, CRISTIAN CAMILO ; BRITO, JOÁS DA SILVA ; CALVÃO, LENIZE BATISTA ; FERREIRA, VICTOR RENNAN SANTOS ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; SILVA, CAIO S. ; GUERREIRO, SÁVIO ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; SOUZA, JORGE E. S. DE ; GOMES, DANIEL H. F. ; MONTAG, LUCIANO FOGAÇA DE ASSIS ; MICHELAN, THAISA S. ; LIGEIRO, RAPHAEL . The First Mitochondrial Genome of an Odonata Endemic to South America, Chalcopteryx rutilans (Rambur, 1842) (Odonata: Polythoridae), and Its Implications for the Phylogeny of the Zygoptera. DIVERSITY , v. 15, p. 908, 2023.
-
CLOSSET, LAURA ; BARROS, MARIA CLARA DA COSTA ; PINHO, CATARINA TORRES ; BRAGA-DA-SILVA, CÍNTIA ; SILVA, CAIO SANTOS ; BURBANO, ROMMEL ; CAVALCANTE, GIOVANNA CHAVES ; MAGALHÃES, LEANDRO LOPES ; SOAREZ-SOUSA, GIORDANO BRUNO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA . O IMPACTO DAS MUTAÇÕES EM UM GENE RECEPTOR DO TIPO TOLL E SUA ASSOCIAÇÃO COM A TEMPESTADE DE CITOCINAS EM PACIENTES COM COVID-19 EM UMA POPULAÇÃO NA AMAZÔNIA. Brazilian Journal of Infectious Diseases , v. 27, p. 102932, 2023.
-
OLIVEIRA, RENATO R. M. ; COSTA NEGRI, TATIANNE ; NUNES, GISELE ; MEDEIROS, INÁCIO ; ARAÚJO, GUILHERME ; DE OLIVEIRA SILVA, FABRICIO ; ESTEFANO SANTANA DE SOUZA, JORGE ; ALVES, RONNIE ; OLIVEIRA, GUILHERME . PipeCoV: a pipeline for SARS-CoV-2 genome assembly, annotation and variant identification. PeerJ , v. 10, p. e13300, 2022.
-
MAIA FALCÃO, RAUL ; KOKARAKI, GEORGIA ; DE WISPELAERE, WOUT ; AMANT, FRÉDÉRIC ; DE SOUZA, GUSTAVO ANTÔNIO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; CARLSON, JOSEPH WOODWARD ; PETTA, TIRZAH BRAZ . The Expression of the Immunoproteasome Subunit PSMB9 Is Related to Distinct Molecular Subtypes of Uterine Leiomyosarcoma. Cancers , v. 14, p. 5007, 2022.
-
MOREIRA, FABIANO CORDEIRO ; SARQUIS, DIONISON PEREIRA ; Souza, Jorge Estefano Santana de ; AVELAR, DANIEL DE SOUZA ; ARAÚJO, TAÍSSA MARIA THOMAZ ; KHAYAT, ANDRÉ SALIM ; SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA DOS ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL . Treasures from trash in cancer research. Oncotarget , v. 13, p. 1246-1257, 2022.
-
CASSEB, SAMIR MANSOUR MORAES ; KHAYAT, ANDRÉ SALIM ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; DE OLIVEIRA, EDIVALDO HERCULANO CORREA ; DOS SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA ; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL . Anticipating the Next Chess Move: Blocking SARS-CoV-2 Replication and Simultaneously Disarming Viral Escape Mechanisms. Genes , v. 13, p. 2147, 2022.
-
DE ASSUMPÇÃO, PAULA BARAÚNA ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL ; MOREIRA, FABIANO CORDEIRO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; VIDAL, AMANDA F. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; KHAYAT, ANDRÉ SALIM ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; PEREIRA, ADENILSON LEÃO ; MEDEIROS, INÁCIO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; BURBANO, ROMMEL MARIO RODRÍGUEZ ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; DOS SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA . Incidence of Hereditary Gastric Cancer May Be Much Higher than Reported. Cancers , v. 14, p. 6125, 2022.
-
BISELLI, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-CHICOTE, PATRÍCIA MATOS ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; DA SILVA JR, WILSON ARAÚJO ; GOLONI-BERTOLLO, ENY MARIA ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA . Differential microRNA expression profile in blood of children with Down syndrome suggests a role in immunological dysfunction. Human Cell , v. 35, p. 639-648, 2022.
-
FAZZI-GOMES, PAOLA ; AGUIAR, JONAS ; CABRAL, GLEYCE FONSECA ; MARQUES, DIEGO ; PALHETA, HELBER ; MOREIRA, FABIANO ; RODRIGUES, MARILIA ; CAVALCANTE, RENATA ; SOUZA, JORGE ; SILVA, CAIO ; HAMOY, IGOR ; SANTOS, SIDNEY . Genomic approach for conservation and the sustainable management of endangered species of the Amazon. PLoS One , v. 16, p. e0240002, 2021.
-
FONSECA, ALINE SIMONETI ; RAMÃO, ANELISA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; ZANETTE, DALILA LUCÍOLA ; DE MOLFETTA, GREICE ANDREOTTI ; DE ARAÚJO, LUIZA FERREIRA ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; AGUIAR, GRAZIELA MOURA ; PLAÇA, JESSICA RODRIGUES ; ALVES, CLEIDSON DE PÁDUA ; DOS SANTOS, ANEMARI RAMOS DINARTE ; Vidal, Daniel Onofre ; SILVA, GYL EANES BARROS ; PANEPUCCI, RODRIGO ALEXANDRE ; PERIA, FERNANDA MARIS ; FERES, OMAR ; DA ROCHA, JOSÉ JOAQUIM RIBEIRO ; ZAGO, MARCO ANTONIO ; SILVA, WILSON ARAÚJO ; et.al . ETV4 plays a role on the primary events during the adenoma-adenocarcinoma progression in colorectal cancer. BMC CANCER , v. 21, p. 207, 2021.
-
FELIPE, STELA MIRLA DA SILVA ; FREITAS, RAQUEL MARTINS DE ; PENHA, EMANUEL DIEGO DOS SANTOS ; PACHECO, CHRISTINA ; MARTINS, DANILO LOPES ; ALVES, JULIANA OSÓRIO ; SOARES, PAULA MATIAS ; LOUREIRO, ADRIANO CÉSAR CARNEIRO ; LIMA, TANES ; SILVEIRA, LEONARDO R. ; FERRAZ, ALEX SOARES MARREIROS ; Souza, Jorge Estefano Santana de ; LEAL-CARDOSO, JOSE HENRIQUE ; CARVALHO, DENISE P. ; CECCATTO, VANIA MARILANDE . Transcriptional profile in rat muscle: down-regulation networks in acute strenuous exercise. PeerJ , v. 9, p. e10500, 2021.
-
MEDEIROS, INÁCIO GOMES ; KHAYAT, ANDRÉ SALIM ; STRANSKY, BEATRIZ ; SANTOS, SIDNEY ; ASSUMPÇÃO, PAULO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA . A small interfering RNA (siRNA) database for SARS-CoV-2. Scientific Reports , v. 11, p. 8849, 2021.
-
DE LIMA, DANIEL CHAVES ; MEDEIROS, INÁCIO GOMES ; DE CÁSSIA SILVA-PORTELA, RITA ; DA SILVA JUNIOR, FRANCISCO CARLOS ; FASSARELA AGNEZ-LIMA, LUCYMARA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BATISTUZZO DE MEDEIROS, SILVIA R. . Identification of plasmids from Brazilian strains. CANADIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 67, p. 1-10, 2021.
-
KOKARAKI, GEORGIA ; XAGORARIS, IOANNA ; FARRAJOTA NEVES DA SILVA, PEDRO ; SUTTON, LESLEY ANN ; MAIA FALCÃO, RAUL ; ESTEFANO SANTANA DE SOUZA, JORGE ; ÖSTERBORG, ANDERS ; WIRTA, VALTTERI ; ROSENQUIST BRANDELL, RICHARD ; RASSIDAKIS, GEORGIOS Z. . Mutations of the Novel Tumor Suppressor Gene SAMHD1 Are Frequent and Correlate with Decreased Protein Expression in Peripheral T-Cell Lymphomas (PTCL). BLOOD , v. 138, p. 3515-3515, 2021.
-
DO NASCIMENTO, PRISCILLA MACHADO ; MEDEIROS, INÁCIO GOMES ; FALCÃO, RAUL MAIA ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA . A decision tree to improve identification of pathogenic mutations in clinical practice. BMC Medical Informatics and Decision Making , v. 20, p. 52, 2020.
-
ROJO-BARTOLOMÉ, IRATXE ; Santana de Souza, Jorge Estefano ; DIAZ DE CERIO, OIHANE ; CANCIO, IBON . Duplication and subfunctionalisation of the general transcription factor IIIA (gtf3a) gene in teleost genomes, with ovarian specific transcription of gtf3ab. PLoS One , v. 15, p. e0227690, 2020.
-
BRANCO, GABRIELA PEREIRA ; VALIERIS, RENAN ; POVOA, LUCAS VENEZIAN ; ARAÚJO, LUIZA FERREIRA DE ; FERNANDES, GUSTAVO RIBEIRO ; Souza, Jorge Estefano Santana de ; AMORIM, MARIA GALLI DE ; FERREIRA, ELISA NAPOLITANO E ; SILVA, ISRAEL TOJAL DA ; NUNES, DIANA NORONHA ; DIAS-NETO, EMMANUEL . A comparison between SOLiD 5500XLand Ion Torrent PGM-derived miRNA expression profiles in two breast cell lines. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION) , v. 43, p. e20180351, 2020.
-
MIGUEZ, ANA CAROLINA KEREKES ; BARROS, BRUNA D. DE FIGUEIREDO ; SOUZA, JORGE E. S. ; COSTA, CECÍLIA MARIA L. ; CUNHA, ISABELA WERNECK ; BARBOSA, PAULA NICOLE VIEIRA P. ; APEZZATO, MARIA LÚCIA P. ; SOUZA, SANDRO J. ; CARRARO, DIRCE MARIA . Assessment of somatic mutations in urine and plasma of Wilms tumor patients. Cancer Medicine , v. 9, p. 5948, 2020.
-
FERREIRA, ELISA NAPOLITANO ; BRIANESE, RAFAEL CANFIELD ; DE ALMEIDA, RENAN VALIERIS BUENO ; DRUMMOND, RODRIGO DUARTE ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO ; DA SILVA, ISRAEL TOJAL ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; CARRARO, DIRCE MARIA . Influence of BRCA1 Germline Mutations in the Somatic Mutational Burden of Triple-Negative Breast Cancer. Translational Oncology , v. 12, p. 1453-1460, 2019.
-
DE SOUZA TIMOTEO, ANA RAFAELA ; GONÇALVES, ANA ÉLIDA MENEZES MAGALHÃES ; SALES, LUCAS AMADEUS PORPINO ; ALBUQUERQUE, BETINA MENEZES ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; DE MOURA, PATRÍCIA CRISTINA PASCOTO ; DE AQUINO, MARCOS ALBERTO ARRUDA ; AGNEZ-LIMA, LUCYMARA FASSARELA ; LAJUS, TIRZAH BRAZ PETTA . A portrait of germline mutation in Brazilian at-risk for hereditary breast cancer. BREAST CANCER RESEARCH AND TREATMENT , v. 3, p. 637-646, 2018.
-
GARCIA-ROSA, SHEILA ; TRIVELLA, DANIELA BB ; MARQUES, VANESSA D ; SERAFIM, RODOLFO B ; PEREIRA, JOSÉ GC ; LORENZI, JULIO CC ; MOLFETTA, GREICE A ; CHRISTO, PAULO P ; OLIVAL, GUILHERME S ; MARCHITTO, VANIA BT ; BRUM, DORALINA G ; SABEDOT, THAIS S ; NOUSHMEHR, HOUTAN ; FARIAS, ALESSANDRO S ; SANTOS, LEONILDA MB ; NOGUEIRA-MACHADO, JOSÉ A ; SOUZA, JORGE ES ; ROMANO, CAMILA M ; CONDE, RODRIGO M ; SANTOS, ANTONIO C ; et.al . A non-functional galanin receptor-2 in a multiple sclerosis patient. PHARMACOGENOMICS JOURNAL , v. 1, p. 72-82, 2018.
-
VIALLE, RICARDO ASSUNÇÃO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; LOPES, KATIA DE PAIVA ; TEIXEIRA, DIEGO GOMES ; ALVES SOBRINHO, PITÁGORAS DE AZEVEDO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M ; FURTADO, CAROLINA ; SAKAMOTO, TETSU ; OLIVEIRA SILVA, FÁBIO AUGUSTO ; HERCULANO CORRÊA DE OLIVEIRA, EDIVALDO ; HAMOY, IGOR GUERREIRO ; ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; SANTOS LIMA, JOÃO PAULO MATOS ; SEUÁNEZ, HÉCTOR N ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; SANTOS, SIDNEY . Whole Genome Sequencing of the Pirarucu (Arapaima gigas) Supports Independent Emergence of Major Teleost Clades. Genome Biology and Evolution , v. 10, p. 2366-2379, 2018.
-
TORREZAN, GIOVANA T. ; DE ALMEIDA, FERNANDA G. DOS SANTOS R. ; FIGUEIREDO, MÁRCIA C. P. ; BARROS, BRUNA D. DE FIGUEIREDO ; DE PAULA, CLÁUDIA A. A. ; VALIERIS, RENAN ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; RAMALHO, RODRIGO F. ; DA SILVA, FELIPE C. C. ; FERREIRA, ELISA N. ; DE NÓBREGA, AMANDA F. ; FELICIO, PAULA S. ; ACHATZ, MARIA I. ; de Souza, Sandro J. ; PALMERO, EDENIR I. ; CARRARO, DIRCE M. . Complex Landscape of Germline Variants in Brazilian Patients With Hereditary and Early Onset Breast Cancer. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 161, 2018.
-
DA SILVA, VANDECLECIO ; FONSECA, ANDRÉ ; FONSECA, MARBELLA ; DA SILVA, THAYNA ; COELHO, ANA ; KROLL, JOSÉ ; DE SOUZA, JORGE ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, GUSTAVO ; DE SOUZA, SANDRO . Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis. Oncotarget , v. -, p. -, 2017.
-
PUTNAM, CHRISTOPHER D. ; SRIVATSAN, ANJANA ; NENE, RAHUL V. ; MARTINEZ, SANDRA L. ; CLOTFELTER, SARAH P. ; BELL, SARA N. ; SOMACH, STEVEN B. ; E.S. DE SOUZA, JORGE ; FONSECA, ANDRÉ F. ; de Souza, Sandro J. ; KOLODNER, RICHARD D. . A genetic network that suppresses genome rearrangements in Saccharomyces cerevisiae and contains defects in cancers. Nature Communications , v. 7, p. 11256, 2016.
-
SILVA, CLÁUDIA REGINA SANTOS ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; SILVA, WILSON ARAUJO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; GOLONI-BERTOLLO, ENY MARIA ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA . Differential Expression of Inflammation-Related Genes in Children with Down Syndrome. Mediators of Inflammation (Print) , v. 2016, p. 1-8, 2016.
-
FERREIRA, ELISA NAPOLITANO ; BARROS, BRUNA DURÃES FIGUEIREDO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO ; ALMEIDA, RENAN VALIERIS ; TORREZAN, GIOVANA TARDIN ; GARCIA, SHEILA ; KREPISCHI, ANA CRISTINA VICTORINO ; MELLO, CELSO ABDON LOPES DE ; CUNHA, ISABELA WERNECK DA ; PINTO, CLÓVIS ANTONIO LOPES ; SOARES, FERNANDO AUGUSTO ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; LOPES, ADEMAR ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; CARRARO, DIRCE MARIA . A genomic case study of desmoplastic small round cell tumor: comprehensive analysis reveals insights into potential therapeutic targets and development of a monitoring tool for a rare and aggressive disease. Human Genomics , v. 10, p. 10-36, 2016.
-
FONSECA, ANDRÉ L. ; DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; DA FONSÊCA, MARBELLA M. ; MEIRA, ISABELLA T. J. ; DA SILVA, THAYNÁ E. ; KROLL, JOSÉ E. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; FREITAS, CLÉBER R. ; FURTADO, RAIMUNDO ; DE SOUZA, JORGE E. ; STRANSKY, BEATRIZ ; de Souza, Sandro J. . Bioinformatics Analysis of the Human Surfaceome Reveals New Targets for a Variety of Tumor Types. International Journal of Genomics , v. 2016, p. 1-7, 2016.
-
DE ARAUJO, LUIZA F. ; FONSECA, ALINE S. ; MUYS, BRUNA R ; PLAÇA, JESSICA R. ; BUENO, RAFAELA B. L. ; LORENZI, JULIO C. C. ; SANTOS, ANEMARI R. D. ; MOLFETTA, GREICE A. ; ZANETTE, DALILA L. ; SOUZA, JORGE E. S. ; VALENTE, VALERIA ; SILVA, WILSON A. . Mitochondrial genome instability in colorectal adenoma and adenocarcinoma. Tumor Biology , v. 36, p. 1423-0380, 2015.
-
RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; DE SOUZA, JORGE E.S. ; de Souza, Sandro J. . Populational landscape of INDELs affecting transcription factor-binding sites in humans. BMC Genomics , v. 16, p. 536, 2015.
-
DE SOUZA, JORGE E. S. ; FONSECA, ANDRÉ F. ; VALIERIS, RENAN ; CARRARO, DIRCE M. ; WANG, JEAN Y. J. ; KOLODNER, RICHARD D. ; de Souza, Sandro J. . S-Score: A Scoring System for the Identification and Prioritization of Predicted Cancer Genes. Plos One , v. 9, p. e94147, 2014.
-
ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; SILVA JÚNIOR, WILSON ARAÚJO ; GOLONI-BERTOLLO, ENY MARIA ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA . Altered Expression of Immune-Related Genes in Children with Down Syndrome. Plos One , v. 9, p. e107218, 2014.
-
BORGES, ALEXANDRE S. ; BARBOSA, JOSÉ D. ; RESENDE, LUIZ ANTÔNIO L. ; MOTA, LÍGIA S.L.S. ; AMORIM, ROGÉRIO M. ; CARVALHO, THAÍS L. ; GARCIA, JOSÉ F. ; OLIVEIRA-FILHO, JOSÉ P. ; OLIVEIRA, CARLOS M.C. ; SOUZA, JORGE ESTEFANO S. ; WINAND, NENA J. . Clinical and molecular study of a new form of hereditary myotonia in Murrah water buffalo. Neuromuscular Disorders , v. 23, p. 206-213, 2013.
-
ALVES, CLEIDSON PÁDUA ; FONSECA, ALINE SIMONETI ; MUYS, BRUNA RODRIGUES ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; VALENTE, VALERIA ; ZAGO, MARCO ANTONIO ; SILVA, WILSON ARAÚJO . The lincRNA Hotair is required for epithelial-to-mesenchymal transition and stemness maintenance of cancer cells lines. Stem Cells (Dayton, Ohio) , v. Epub, p. n/a-n/a, 2013.
-
RAMALHO, RODRIGO F. ; GELFMAN, SAHAR ; SOUZA, JORGE E. ; AST, GIL ; SOUZA, SANDRO J. ; MEYER, DIOGO . Testing for Natural Selection in Human Exonic Splicing Regulators Associated with Evolutionary Rate Shifts. Journal of Molecular Evolution , v. 76, p. 228-239, 2013.
-
DA CUNHA, JÚLIA PINHEIRO CHAGAS ; GALANTE, PEDRO ALEXANDRE FAVORETTO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; PIEPRZYK, MARTIN ; CARRARO, DIRCE MARIA ; OLD, LLOYD J. ; Camargo, Anamaria Aranha ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . The Human Cell Surfaceome of Breast Tumors. BioMed Research International , v. 2013, p. 1-11, 2013.
-
RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; ALMEIDA, RENAN ; ALENCAR, DAYSE O. ; BARBOSA, MARIA SILVANIRA ; GUSMÃO, LEONOR ; SILVA, WILSON A. ; de Souza, Sandro J. ; SILVA, ARTUR ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; DARNET, SYLVAIN ; SANTOS, SIDNEY . High-Throughput Sequencing of a South American Amerindian. Plos One , v. 8, p. e83340, 2013.
-
Soares, Ibere Cauduro ; Simões, Kleber ; Santana de Souza, Jorge Estefano ; Keith Okamoto, Oswaldo ; Wakamatsu, Alda ; Carolina Tuma, Maria ; Ritter, Gerd ; Ferreira Alves, Venancio Avancini . In Silico Analysis and Immunohistochemical Characterization of NaPi2b Protein Expression in Ovarian Carcinoma With Monoclonal Antibody Mx35. Applied Immunohistochemistry & Molecular Morphology (Print) , v. 20, p. 165-172, 2012.
-
De Souza, J. E. S. ; Galante, P A ; VALIERIS, R. ; da Cunha, J. P. C. ; Ohno-Machado, L. ; Old, L. J. ; de Souza, Sandro J. . SurfaceomeDB: a cancer-orientated database for genes encoding cell curface proteins. Cancer Immunity , v. 12, p. 15, 2012.
-
Vidal, D. O ; de Souza, J. E. ; Pires, L. C. ; Masotti, C ; Salim, A. C. M. ; Costa, M. C. F. ; Galante, P. A. F. ; Souza, S.J. de ; Camargo, A. A. . Analysis of allelic differential expression in the human genome using allele-specific serial analysis of gene expression tags. Genome (Ottawa. Print) , v. 54, p. 120-127, 2011.
-
Rodini, Carolina Oliveira ; Suzuki, Daniela Emi ; Saba-Silva, Najsla ; Cappellano, Andréa ; Souza, Jorge Estefano Santana ; Cavalheiro, Sérgio ; Toledo, Silvia Regina Caminada ; Okamoto, Oswaldo Keith . Expression analysis of stem cell-related genes reveal OCT4 as a predictor of poor clinical outcome in medulloblastoma. Journal of Neuro-Oncology , v. 1, p. 1-9, 2011.
-
De Souza, J. E. S. ; Ramalho, R. F. ; Galante, P. A. F. ; Meyer, D. ; de Souza, S. J. . Alternative splicing and genetic diversity: silencers are more frequently modified by SNVs associated with alternative exon/intron borders. Nucleic Acids Research , v. 39, p. 4942-4948, 2011.
-
Galante, P. A. F. ; Parmigiani, R. B. ; Zhao, Q. ; Caballero, O. L. ; De Souza, J. E. S. ; Navarro, F. C. P. ; Gerber, A. L. ; Nicolas, M. F. ; Salim, A. C. M. ; Silva, A. P. M. ; Edsall, L. ; Devalle, S. ; Almeida, L. G. ; Ye, Z. ; Kuan, S. ; Pinheiro, D. G. ; Tojal, I. ; Pedigoni, R. G. ; de Sousa, R. G. M. A. ; Oliveira, T. Y. K. ; et.al . Distinct patterns of somatic alterations in a lymphoblastoid and a tumor genome derived from the same individual. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 39, p. 6056-6068, 2011.
-
Moreira de Mello, Joana Carvalho ; Araújo, Érica Sara Souza de ; Stabellini, Raquel ; Fraga, Ana Maria ; Souza, Jorge Estefano Santana de ; Sumita, Denilce R. ; Camargo, Anamaria A. ; Pereira, Lygia V. . Random X Inactivation and Extensive Mosaicism in Human Placenta Revealed by Analysis of Allele-Specific Gene Expression along the X Chromosome. Plos One , v. 5, p. e10947, 2010.
-
Ferreira, Elisa N ; Rangel, Maria CR ; Galante, Pedro F ; de Souza, Jorge E ; Molina, Gustavo C ; de Souza, Sandro J ; Carraro, Dirce M . Alternative splicing enriched cDNA libraries identify breast cancer-associated transcripts. BMC Genomics , v. 11, p. S4, 2010.
-
da Cunha, J. P. C. ; Old, L. J. ; Caballero, O. ; de Souza, R. F. ; De Souza, J. E. S. ; de Souza, S. J. ; Ohara, D. T. ; Gama-Rodrigues, J. ; Oba-Shinja, S. M. ; Galante, P. A. F. ; Stransky, B. ; Simpson, A. J. ; Carvalho, P. M. ; SILVA, W. A. ; Moura, R. P. ; Moore, J. ; marie sk ; Habr-Gama, A. ; Pieprzyk, M. ; et.al . Bioinformatics construction of the human cell surfaceome. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Online) , v. 106, p. 16752-16757, 2009.
-
Galante, Pedro AF ; Vidal, Daniel O ; de Souza, Jorge E ; Camargo, Anamaria A ; de Souza, Sandro J . Sense-antisense pairs in mammals: functional and evolutionary considerations. GenomeBiology.com (London. Print) , v. 8, p. R40, 2007.
-
Silva, A. P. M. ; De Souza, J. E. S. ; Galante, P. A. F. ; Riggins, G.J. ; Souza, S.J. de ; Camargo, A. A. . The impact of SNPs on the interpretation of SAGE and MPSS experimental data. Nucleic Acids Research (Online) , v. 32, p. 6104-6110, 2004.
-
2004 de Souza, Jorge E . A Transcript Finishing Initiative for Closing Gaps in the Human Transcriptome. Genome Research , v. 14, p. 1413-1423, 2004.
-
Osório, E.C. ; De Souza, J. E. S. ; Zaiats, A.C. ; Oliveira, P.S.L. de ; Souza, S.J. de . pp-Blast: a. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (Impresso) , v. 36, p. 463-467, 2003.
-
Ana Paula M. Silva ; Anna Christina M. Salima ; Adriana Bulgarelli ; De Souza, J. E. S. ; E. Ossorio ; S. J. de Souza . Identification of 9 novel transcripts and two RGSL genes within the hereditary prostate cancer region (HPC1) at 1q25. Gene (Amsterdam) , v. 310, p. 49-57, 2003.
-
N.J. Sakabe ; De Souza, J. E. S. ; P.A.F. Galante ; P. S. de Oliveira ; F. PASSETTI ; S. J. de Souza . ORESTES are enriched in rare exon usage variants affecting the encoded proteins. Comptes Rendus. Biologies , v. 326, p. 979-985, 2003.
-
Brentani H ; Caballero OL ; A.A. Carmago ; Simpson AJ ; De Souza, J. E. S. ; S. J. de Souza ; Verjovski-Almeida S . The generation and utilization of a cancer-oriented representation of the human transcriptome by using expressed sequence tags. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 100, p. 13418-13423, 2003.
-
M. Sakharkar ; F. PASSETTI ; De Souza, J. E. S. ; M. Long ; S. J. de Souza . ExInt: an Exon Intron Database. Nucleic Acids Research (Online) , Oxford University Press, v. 30, n.1, p. 191-194, 2002.
-
de O. Siqueira, Rodrigo A. ; Stefanes, Marco A. ; Rozante, Luiz C. S. ; Martins-Jr, David C. ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; Araujo, Eloi . Multi-GPU Approach for Large-Scale Multiple Sequence Alignment. Lecture Notes in Computer Science. .ed.: Springer International Publishing, 2021, v. , p. 560-575.
-
Cavalcante, Renata Lilian Dantas ; Ortega, Jose Miguel ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; SAKAMOTO, TETSU . Assessing the Sex-Related Genomic Composition Difference Using a k-mer-Based Approach: A Case of Study in Arapaima gigas (Pirarucu). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2020, v. , p. 50-56.
-
MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, ANDRÉ ; de Souza SJ ; Souza, JES . Continuação das implementações/estudos de métodos para analise de genes diferencialmente expressos. In: XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017, Natal. XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017.
-
PESSOA NETO, S. N. C. ; LAJUS, T. B. P. ; De Souza, J. E. S. . Aplicativo para médicos: calculadora de risco para câncer hereditário. In: XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017, Natal. XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017.
-
ALVES SOBRINHO, P. A. ; MARTINS, D. L. ; FONSECA, ANDRÉ ; de Souza SJ ; De Souza, J. E. S. . Continuação de plano de trabalho para a implementação de interface amigável de análise de genes diferencialmente expressos. In: XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017, Natal. XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017.
-
MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, ANDRÉ ; de Souza SJ ; Souza, JES . Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas. In: XXVII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2016, Natal. XXVII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2016.
-
LAUREANO, T. C. ; Silva, WA JR ; De Souza, J. E. S. . Bioinformática na Predição do Secretoma Humano. In: Workshop de Informática Biomédica (WIBm), 2012, Ribeirão Preto. Workshop de Informática Biomédica (WIBm), 2012. v. 2. p. 76-78.
-
SANTOS, G. G. C. ; GOMES, DANIEL HENRIQUE FERREIRA ; SILVA FILHO, J. C. ; DE SOUZA, JORGE ; STRANSKY, B. . REEVALUATION OF RARE GENETIC VARIANTS IN BRAZILIAN POPULATIONS USING DEEP LEARNING TOOLS. In: X-meeting 2025, 2025, Joao Pessoa. X-meeting 2025, 2025.
-
TAVARES, T. V. ; DE SOUZA, JORGE ; FONSECA, ANDRÉ F. . Beyond the immune microenvironment: a preliminary exploration of malignant cells and tumor antigens in scRNA-seq data. In: X-meeting 2025, 2025, Joao Pessoa. X-meeting 2025, 2025.
-
REVOREDO NETO, J. M. ; de Souza, J. E. . Desenvolvimento de Ferramentas para Análise de Sintenia e Colinearidade de Regiões Genômicas. In: XXXVI CIC (2025), 2025, Natal. XXXVI Congresso de Iniciação Científica, 2025.
-
COSTA, A. B. C. ; de Souza, J. E. . Desenvolvimento de Soluções com Microserviços e Containers para Análises de Genomas Mitocondriais. In: XXXVI CIC (2025), 2025, natal. XXXVI Congresso de Iniciação Científica, 2025.
-
MARIA CLARA BARROS ; SOUZA, F. G. ; Caio Santos Silva ; Souza, JES ; MARQUES, K. C. ; FALCAO, L. F. M. ; SANTOS, A. K. C. R. ; QUARESMA, J. . THE IMPACT OF MITOCHONDRIAL VARIANTS ON POST-ACUTE SEQUELAE OF COVID-19 IN AN AMAZONIAN POPULATION. In: GENETICA 2025 - International Congress of the Brazilian Genetics Society, 2025, Belém. GENETICA 2025 - International Congress of the Brazilian Genetics Society,, 2025.
-
GOMES, DANIEL H. F. ; MEDEIROS, I. G. ; LAJUS, T. B. P. ; STRANSKY, B. ; de Souza, J. E. . DTreePred: an Online Viewer Based on Machine Learning for Pathogenicity Prediction of Genomic Variants. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
SILVA FILHO, J. C. ; SILVA, L. M. B. E. ; AZEVEDO, G. M. ; MEDEIROS, I. A. ; GOMES, DANIEL H. F. ; GUERREIRO, S. L. M. ; DALMOLIN, R. J. S. ; de Souza, J. E. . Unveiling Mitogenomic Diversity in Amazonian Fish: Assembly, Annotation, and Evolutionary from 100 New Mitogenomes. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
LOURENCO, M. E. ; COSTA, A. B. C. ; SILVA FILHO, J. C. ; de Souza, J. E. . Study and Customization of the GenomeAssembler Pipeline for Eukaryotic Genome Assembly and Analysis in the BioME ? IMD/UFRN Computational Environment. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
COSTA, A. B. C. ; LOURENCO, M. E. ; SILVA FILHO, J. C. ; de Souza, J. E. . Adaptation and Expansion of the Alignment Pipeline for Eukaryotic Genome Analysis in a Local Development Environment. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
TAVARES, T. V. ; de Souza, J. E. ; FONSECA, ANDRÉ F. . Looking beyond the immune microenvironment: a exploration of malignant cells and tumor antigens in scRNA-seq data. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
SANTOS, G. G. C. ; GOMES, DANIEL H. F. ; SILVA FILHO, J. C. ; de Souza, J. E. ; STRANSKY, B. . REEVALUATION OF RARE GENETIC VARIANTS IN BRAZILIAN POPULATIONS USING DEEP LEARNING TOOLS. In: III Natal Bioinformatics Forum, 2025, Natal. III Natal Bioinformatics Forum - Bioinformatics and Its Impact on Society: Bridging Science, Industry, and Health, 2025.
-
Maria Clara da Costa Barros ; SOUZA, F. G. ; Caio Santos Silva ; de Souza, J. E. ; FALCAO, L. F. M. ; SANTOS, A. K. C. R. ; QUARESMA, J. A. S. . THE IMPACT OF MITOCHONDRIAL VARIANTS OF MT-RNR2 GENE ON POST-ACUTE SEQUELAE OF COVID-19 DEVELOPMENT IN AN AMAZONIAN POPULATION. In: XXV Encontro de Genética do Nordeste (ENGENE), 2025, São Luís. XXV Encontro de Genética do Nordeste (ENGENE), 2025.
-
NUNES, A. K. C. ; FORTE, C. S. ; REIS, A. F. V. F. ; Souza, JES ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; SANTOS, S. E. B. ; SANTOS, A. K. C. R. ; ARAUJO, G. S. . Predição do Impacto Funcional de Variantes do Gene CFTR em Populações Indígenas do Brasil. In: 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática, 2024, Salvador. X-Meeting 2024, 2024.
-
MEDEIROS, I. A. ; de Souza, J. E. . Continuação de desenvolvimento de soluções de softwares modulares, baseada na arquitetura de microserviços e containers.. In: XXXV Congresso de Iniciação Científica, 2024, Natal. eCICT 2024, 2024.
-
SILVA, D. N. ; SILVA FILHO, J. C. ; SANTOS, D. C. ; SILVA, V. S. P. ; de Souza, J. E. . Otimização e Expansão da Infraestrutura do BioME: Inovação em Bioinformática e Suporte Técnico. In: XXXV Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2024, Natal. eCICT 2024, 2024.
-
MARIA CLARA BARROS ; PINHO, C. T. ; CAVALCANTE, G. C. ; GIORDANO BRUNO SOARES-SOUZA ; LEANDRO MAGALHÃES ; THIAGO CARNEIRO ; ROMMEL BURBANO ; DE SOUZA, JORGE ; SOUZA, S. J. ; Ândrea Ribeiro-dos-Santos . EXOME-WIDE ASSOCIATION STUDY REVEALS PROTECTIVE VARIANTS TO COVID-19 SEVERITY IN THE AMAZON POPULATION. In: 26th Human Genome Meeting - HUGO-HGM 2023, 2023, Rio de Janeiro. Human Genome Meeting - HUGO-HGM 2023, 2023.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; SANTOS, A. K. C. R. ; SANTOS, S. E. B. ; de Souza, Sandro J. ; DE SOUZA, JORGE ; SAKAMOTO, TETSU . UNRAVELING THE EVOLUTIONARY DYNAMICS OF BODY SIZE IN SILURIFORMES: A PHYLOGENOMIC ANALYSIS OF MTDNA AND GROWTH-RELATED GENES. In: X-Meeting 2023, 2023, Curitiba-PR. Abstract book, 2023.
-
GOMES, DANIEL H. F. ; De Souza, J. E. S. . Analysis of hereditary gastric cancer variants in young patients. In: II Natal Bioinformatics Forum - BIOINFORMATICS IN A POST-PANDEMIC WORLD, 2023, Natal. Abstract book, 2023.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; SANTOS, A. K. C. R. ; SANTOS, S. E. B. ; de Souza, Sandro J. ; SOUZA, JORGE E. S. ; SAKAMOTO, TETSU . EVOLUTIONARY DYNAMICS OF BODY SIZE IN THE ORDER SILURIFORMES. In: II Natal Bioinformatics Forum - BIOINFORMATICS IN A POST-PANDEMIC WORLD, 2023, Natal. Abstract book, 2023.
-
Marília Viana Albuquerque de Almeida[ ; Elionai Moura Cordeiro ; DANIELA COELHO BATISTA GUEDES PEREIRA ; DALMOLIN, R. J. S. ; SOUZA, JORGE E. S. ; LIMA, J. P. M. S. . Analysis of Mutations Related to Stomach Cancer and Their Structural Impacts in a Dynamic/Conformational Context. In: II Natal Bioinformatics Forum - BIOINFORMATICS IN A POST-PANDEMIC WORLD, 2023, Natal. Abstract book, 2023.
-
GOMES, DANIEL H. F. ; REGO, J. F. M. ; de Souza SJ ; SALES, S. ; FALCAO, R. M. ; Souza, J.E. de ; LAJUS, T. B. P. . The Challenge of Variant Classification in Young Patients Suspected of Gastric Cancer-Related Syndromes in Brazil. In: 27th CGA-IGC Annual Meeting, 2023, Las Vegas, Nevada. Abstract book, 2023.
-
Maria Clara da Costa Barros ; Giordano Bruno Soares Souza ; GOMES, DANIEL H. F. ; Catarina Torres Pinho ; CAVALCANTE, G. C. ; LEANDRO MAGALHÃES ; Caio Santos Silva ; SOUZA, S. J. ; de Souza, J. E. ; Ândrea Ribeiro-dos-Santos . Exome-wide association study reveals nine protective variants to COVID-19 severity in the Amazon population. In: VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática (VI SNNB), 2023, Salinópolis. VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática, 2023.
-
GUERREIRO, S. L. M. ; Caio Santos da Silva ; VIDAL, A. F. ; GOMES, DANIEL H. F. ; SOUZA, JORGE E. S. ; SANTOS, A. K. C. R. ; HAMOY, IGOR ; SANTOS, S. E. B. . Genomic clues to adaptation mitochondrial markers in Potamotrygon leopoldi explain the transition from saline to freshwater. In: VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática (VI SNNB), 2023, Salinópolis. VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática, 2023.
-
SILVA FILHO, J. C. ; de Souza, J. E. . Construção de tecnologias e suporte de ambiente computacional BioMe (Redes e Infraestrutura). In: XXXIV Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2023, Natal. eCICT 2023, 2023.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; SANTOS, A. K. C. R. ; DOS SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA ; SOUZA, S. J. ; de Souza, J. E. ; SAKAMOTO, TETSU . Exploring the Evolutionary History of Body Size in Siluriformes through Phylogenomic mtDNA Analysis. In: VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática (VI SNNB), 2023, Salinópolis. VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática, 2023.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; SANTOS, A. K. C. R. ; SANTOS, S. E. B. ; de Souza, Sandro J. ; DE SOUZA, JORGE ; SAKAMOTO, TETSU . Análise Filogenômica de mtDNA de Siluriformes e a história evolutiva do tamanho corporal.. In: V Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2022, Campina Grande - PB. Abstract book, 2022.
-
Catarina Torres Pinho ; Maria Clara da Costa Barros ; Jhully Azevedo dos Santos Pinheiro ; Caio Santos ; Cintia Helena Braga da Silva ; Laura Closset ; Amanda Ferreira Vidal ; Tatiane Piedade ; Rita Catarina Medeiros Sousa ; Pablo Diego Pinto ; Claudio Guedes Salgado ; Guilherme Oliveira ; De Souza, J. E. S. ; de Souza, Sandro J. ; José Ricardo Vieira6 ; SANTOS, A. K. C. R. . ANALYSIS OF THE TEMPORAL DISPERSION OF SARS-COV-2 STRAINS/LINEAGES IN PATIENTS FROM THE NORTH REGION OF BRAZIL. In: 67th brazilian congress of genetics, 2022, Natal. Abstract book, 2022.
-
Giovanna Melo Martins Silva ; FALCAO, R. M. ; De Souza, J. E. S. ; Diego Arthur de Azevedo Morais ; DALMOLIN, R. J. S. ; Lucymara Fassarella Agnez Lima3 ; Riva de Paula Oliveira . IDENTIFICATION OF CORONAVIRIDAE FAMILY SEQUENCES IN HUMAN METAGENOMES USING KAIJU AND BWA TOOLS. In: 67th brazilian congress of genetics, 2022, Natal. Abstract book, 2022.
-
Maria Clara da Costa Barros ; GOMES, DANIEL H. F. ; Catarina Torres Pinho ; Jhully Azevedo Torres ; Cintia Helena Braga da Silva ; Caio Santos da Silva ; Amanda Ferreira Vidal ; de Souza, Sandro J. ; De Souza, J. E. S. ; SANTOS, A. K. C. R. . EXOME SEQUENCING IN SAMPLES OF COVID-19 PATIENTS. In: 67th brazilian congress of genetics, 2022, Natal. Abstract book, 2022.
-
FALCAO, R. M. ; KOKARAKI, GEORGIA ; Souza, J.E. de ; CARLSON, J. W. ; PETTA, TIRZAH BRAZ . PSMB9/LMP2 as a controversial diagnostic biomarker for uterine leiomyosarcoma. In: American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022, Philadelphia. Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022.
-
Jordi Gonzalez-Molina ; Paula Hahn ; FALCAO, R. M. ; Georgia Kokaraki ; de Souza, J. E. ; LAJUS, T. B. P. ; Kaisa Lehti ; CARLSON, J. W. . The microarchitecture and fibrillar collagen expression of leiomyosarcoma are associated with malignancy. In: American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022, Philadelphia. Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022.
-
CAI, CHEN ; FALCAO, R. M. ; Georgia Kokaraki ; SOUZA, JORGE E. S. DE ; DE SOUZA, GUSTAVO ; CARLSON, J. W. ; LAJUS, T. B. P. . SMOC2 as a potential biomarker with diagnostic value in uterine leiomyosarcoma. In: American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022, Philadelphia. Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting, 2022.
-
DANIELA COELHO BATISTA GUEDES PEREIRA ; João Paulo Matos SantosLima ; Thaís Gaudencio ; FALCAO, R. M. ; Souza, Jorge Estefano Santana de . A Database to Validate a Machine Learning Model to Improve the Prediction ofMissense Cancer-Associated Mutations. In: x-meeting 2021, 2021, Virtual. Xmeeting Xperience 2021, 2021.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; ORTEGA, J. M. ; SANTOS, S. E. B. ; Souza, Jorge Estefano Santana de ; SAKAMOTO, TETSU . Sex-specific co-assembly of Arapaima gigas (Pirarucu) genome.. In: x-meeting 2021, 2021, Virtual. Xmeeting Xperience 2021, 2021.
-
Renata Lilian Dantas Cavalcante ; De Souza, J. E. S. ; SANTOS, S. E. B. ; SAKAMOTO, TETSU . Sequence data mining of near error-free genome assembly of Golden Arowana (Scleropages formosus) for identifying sex-linked regions.. In: 66th brazilian congress of genetics, 2021, On-Line. Abstract book, 2021.
-
CAVALCANTE, R. L. D ; ORTEGA, J. M. ; SANTOS, S. E. B ; Souza, JES ; SAKAMOTO, TETSU . Large runs of homozigozity regions in Arapaima gigas (Pirarucu) suggest the existence of genomic regions in single-copy and a sex-related dosage-compensation mechanism.. In: Xmeeting, 2020. Xmeeting Xperience 2020.
-
SILVA, D. F. L. ; MARTINS, D. L. ; Souza, JES ; KANNOUCHE, P. L. ; LAJUS, T. B. P. . ESTUDO DA ASSINATURA MUTACIONAL EM CÂNCER DE BEXIGA. In: Next Frontiers to Cure Cancer, 2018, São Paulo. Next Frontiers to Cure Cancer, 2018.
-
AGUIAR, T. ; RODRIGUES, T. ; COSTA, C. M. L. ; WERNECK, I. ; CYPRIANO, M. ; TOLEDO, S. R. C. ; Santana de Souza, Jorge Estefano ; TOJAL, I. ; CARRARO, D. M. ; ROSENBERG, C. ; KREPISCHI, A. . Insights into the somatic mutation burden of hepatoblastomas using whole exome sequencing. In: AACR International Conference, 2017, São Paulo. AACR International Conference held in cooperation with the Latin American Cooperative, 2017. v. 24. p. 18A-18A.
-
TORREZAN, G. T. ; ALMEIDA, F. G. ; FIGUEIREDO, M. C. ; BARROS, B. D. ; PAULA, C. A. ; VALIERIS, R. ; Souza, JES ; FERREIRA, ELISA NAPOLITANO ; SILVA, F. C. ; NOBREGA, A. F. ; ACHATZ, M. I. ; PALMERO, E. I. ; RAMALHO, R. F. ; de Souza SJ ; CARRARO, D. M. . Complex landscape of germline variants in hereditary and early onset breast cancer ascertained through whole exome sequencing. In: AACR International Conference, 2017, São Paulo. AACR International Conference held in cooperation with the Latin American Cooperative, 2017. v. 24. p. A37-A37.
-
TIMOTEO, A. R. S. ; Souza, JES ; LAJUS, T. B. P. . The identification of germline mutations in DNA repair genes in Brazilian individuals at-risk for hereditary breast cancer. In: AACR Special Conference, 2017, São Paulo. Molecular Cancer Research, 2017. v. 15. p. A44-A44.
-
ALVES SOBRINHO, P. A. ; MARTINS, D. L. ; FONSECA, ANDRÉ ; de Souza SJ ; Souza, JES . R-Peridot: A Dynamic, Expansible and User Friendly Tool For Differential Expression Analysis of RNA-Seq and Gene Ontology. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite, 2017, Natal. 9th IUPAP International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite, 2017.
-
DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; FONSECA, ANDRÉ ; De Souza, J. E. S. ; de Souza SJ . Parallel-simMut ? pacote R para simulação de enriquecimento de mutação. In: II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017, Belém. II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2017.
-
DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; FONSECA, ANDRÉ L. ; FONSECA, MARBELLA ; DA SILVA, THAYNA ; COELHO, A. ; KROLL, JOSÉ E. ; De Souza, J. E. S. ; STRANSKY, BEATRIZ ; SOUZA, G. A. ; de Souza SJ . Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite, 2017, Natal. Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis, 2017.
-
CRUZ, P. P. ; MELO, J. R. L. ; de Souza, J. E. . Set of modules that models the differential gene expression analysis results. In: I Simpósio Norte-nordeste de Bioinformática, 2016, natal. I Simpósio Norte-nordeste de Bioinformática - "A supercomputação na Bioinformática", 2016. p. 4-4.
-
FONSECA, ANDRÉ F. ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; Souza, SJ . An systems biology approach identifies survival-associated modules in breast cancer subtypes. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática - "A supercomputação na Bioinformática", 2016. p. 12-12.
-
MELO, J. R. L. ; CRUZ, P. P. ; RIBEIRO, M. B. ; de Souza, J. E. . Development of friendly interface gene expression analysis. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática - "A supercomputação na Bioinformática", 2016. p. 17-17.
-
NASCIMENTO, P. M. ; de Souza, J. E. . Friendly interface to variants analysis clinics. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática - "A supercomputação na Bioinformática", 2016. p. 19-19.
-
MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, ANDRÉ L. ; de Souza SJ ; Souza, JES . SGS: Statistical Gene Signature For RNA-Seq Analysis. In: SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease: Translational research in bioinformatics and systems biology, 2016, Natal. SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease, 2016.
-
NASCIMENTO, P. M. ; KROLL, JOSÉ E. ; de Souza SJ ; Souza, JES . ViVa - Viewer of Variants. In: SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease: Translational research in bioinformatics and systems biology, 2016, Natal. SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease, 2016.
-
MACEDO, R. C. ; AGNEZ, L. F. ; LEAL, A. ; SILVA, L. F. ; Souza, JES . IDENTIFICATION OF REGULATORY DOMAINS ON PROTEIN?S XPA TARGET. In: SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease: Translational research in bioinformatics and systems biology, 2016, Natal. SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease, 2016.
-
GARCIA, S. ; AMORIM, M. G. ; VALIERIS, R. ; De Souza, J. E. S. ; OLIVAL, G. S. ; DINIZ, J. A. ; BARRERA, A. A. ; BRUM, D. ; SILVA, I. T. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; LORENZI, J. C. ; NUNES, D. N. ; DIAS-NETO, E. . Achados moleculares derivados do sequenciamento completo de exoma indicam potenciais mecanismos biológicos e novos possíveis alvos para o tratamento da esclerose múltipla. In: X Congresso Paulista de Neurologia, 2015, Guarujá. X Congresso Paulista de Neurologia, 2015.
-
COELI-LACCHINI, F. B. ; BODONI, A. F. ; De Souza, J. E. S. ; MOREIRA, A. C. ; ELIAS, L. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; CASTRO, M. ; ANTONINI, S. R. R. . WHOLE EXOME: ANÁLISE EXPLORATÓRIA DO EXOMA DE UM PACIENTE COM DEFICIÊNCIA FAMILIAR DE GLICOCORTICOIDE. In: XXVII Congresso Brasileiro de Genética Médica, 2015, Ribeirão Preto -SP. XXVII Congresso Brasileiro de Genética Médica, 2015.
-
BODONI, A. F. ; COELI-LACCHINI, F. B. ; CAVALCANTI, M. M. ; De Souza, J. E. S. ; MARTINELLI JUNIOR, C. E. ; MOREIRA, A. C. ; ELIAS, L. L. K. ; SILVA JUNIOR, W. ; CASTRO, M. ; ANTONINI, S. R. R. . WHOLE EXOME SEQUENCING IDENTIFIES A HOMOZYGOUS MUTATION IN NICOTINAMIDE NUCLEOTIDE TRANSIDROGENASE AS THE CAUSE OF FAMILIAL GLUCOCORTICOID DEFICIENCY (FGD) IN A BOY WITH PRIMARY ADRENAL INSUFICIENCY. In: 11º Congresso Brasileiro Pediátrico de Endocrinologia e Metabologia, 2015. 11º Congresso Brasileiro Pediátrico de Endocrinologia e Metabologia.
-
Ramalho, R. ; VALIERIS, R. ; ANDRADE, C. ; BARROS, B. ; NAPOLITANO, E. ; De Souza, J. E. S. ; SOUZA, S. J. ; CARRARO, D. M. . Improving SNV validation of Ion-based sequence data by using GATK metrics. In: GLBIO 2015 - International Society for Computational Biology, 2015, Purdue University - west lafay. GLBIO 2015 - International Society for Computational Biology, 2015.
-
BODONI, A. F. ; COELI-LACCHINI, F. B. ; De Souza, J. E. S. ; MOREIRA, A. C. ; ELIAS, L. L. K. ; SILVA, WILSON A. ; CASTRO, M. ; ANTONINI, S. R. R. . WHOLE EXOME SEQUENCING IDENTIFIES A HOMOZYGOUS MUTATION IN NICOTINAMIDE NUCLEOTIDE TRANSIDROGENASE AS THE CAUSE OF FAMILIAL GLUCOCORTICOID DEFICIENCY. In: XI Congresso Paulista de Endocrinologia e Metabologia, 2015, São Paulo - SP. XI Congresso Paulista de Endocrinologia e Metabologia, 2015.
-
RAMALHO, RODRIGO F. ; NAKAHATA, A. M. ; FERREIRA, E. N. ; DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; de Souza, J. E. ; de Souza, S. J. ; CARRARO, DIRCE M. . ANALYSIS OF DEREGULATED MIRNAS AND GENE TARGETS IN WILM'S TUMOR WITH THE E1147K-DROSHA MUTATION. In: 61o. Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia –SP. 61o. Congresso Brasileiro de Genética, 2015.
-
FERREIRA, E. N. ; Ramalho, R. F. ; BRIANESE, R. C. ; VALIERIS, R. ; MELLO, K. ; KREPSICHI, A. C. V. ; ANDRADE, V. P. ; LIMA, V. C. C. ; de Souza, J. E. ; SILVA, I. T. ; de Souza, S. J. ; Carraro, Dirce M . GENOMIC AND EPIGENOMIC LANDSCAPE OF TRIPLE-NEGATIVE BREAST CANCER MEDIATED BY BRCA1 GERMLINE MUTATIONS. In: 61o. Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia –SP. 61o. Congresso Brasileiro de Genética, 2015.
-
ZAMPIERI, B. L. ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; BÜRGER, M. C. ; De Souza, J. E. S. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; Ferreira, Elisa N ; CARRARO, D. M. ; GOLONI-BERTOLLO, E. M ; PAVARINO, E. C. . Analysis of microrna and gene expression profile in down syndrome children. In: XLIII Congreso Argentino de Genética, 2014, S. C. de Bariloche, Rio Negro. XLIII Congreso Argentino de Genética, 2014.
-
SILVA, C. R. S ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, B. L. ; De Souza, J. E. S. ; BÜRGER, M. C. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; GOLONI-BERTOLLO, E. M ; PAVARINO, E. C. . Low expression of genes related to inflammatory processes in peripheral blood mononuclear cells of children with down syndrome. In: 60o. Congresso Brasileiro de genética., 2014, Garujá - SP. 60o. Congresso Brasileiro de genética., 2014.
-
PLACA, J. R. ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; SILVA JUNIOR, W. A. . Whole Exome Sequencing to Identify new genes related with hereditary breast and ovary cancer. In: X-Meeting BSB 2013, 2013, Recife. X-Meeting BSB 2013, 2013.
-
RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; ALMEIDA, RENAN ; Alencar, DO ; Barbosa, MSR ; Gusmão, L ; SILVA, W. A. ; Souza, SJ ; Silva, A ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; DARNET, SYLVAIN ; SANTOS, SIDNEY . Discovery of new SNPs and Indels variants in a native South American Individual. In: 59o. Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. 59o. Congresso Brasileiro de Genética, 2013.
-
FONSECA, ALINE SIMONETI ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; De Souza, J. E. S. ; Silva, KA ; ALVES, CLEIDSON PÁDUA ; Zanette, DL ; Peria, FM ; Ferres, O ; Rocha, JJR ; Ramos, AD ; Araujjo, AG ; Pannepucci, RA ; Silva, WA JR . Comparative Genomic Analysis of Colorectal Cancer. In: 59o. Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. 59o. Congresso Brasileiro de Genética, 2013.
-
LAUREANO, T. C. ; Silva, WA JR ; De Souza, J. E. S. . Bioinformatics in the prediction of Human Secretome. In: X-Meeting 2012, 2012, Campinas. X-Meeting 2012, 2012.
-
de Souza, J. E. ; Galante, P. A. F. ; Lima, L. R. ; Parmigiani, R. B. ; Salim, A. C. M. ; Perez, R. O. ; Habr-Gama, A ; Gama-Rodrigues, JJ ; Camargo, A. A. ; de Souza, S. J. . Using RNAseq to identify gene expression signature in adenocarcinoma of rectum. In: International Workshop on Genomics of Health and Diseases, 2011, Natal ? RN. International Workshop on Genomics of Health and Diseases, 2011.
-
Virgili N S ; Galante, P. A. F. ; Souza, J.E. de ; Old, L. J. ; Souza, S.J. de . THE SURFACEOME EXPRESSION IN BREAST CANCER CELL LINES USING NEXT-GENERATION SEQUENCING DATA. In: 6st International Conference of the AB3C "X-meeting", Ouro Preto - MG, 2010, Ouro Preto. 6st International Conference of the AB3C "X-meeting", 2010. p. 117-117.
-
MENDES, F. H. K ; Souza, J.E. de ; Ramalho, R. ; Souza, S.J. de ; Meyer, D. . NATURAL SELECTION IN DIFFERENT REGIONS OF MEMBRANE MOLECULES. In: 6st International Conference of the AB3C "X-meeting", Ouro Preto - MG, 2010, Ouro Preto. 6st International Conference of the AB3C "X-meeting", 2010. p. 8-8.
-
Ramalho, R. ; Souza, J.E. de ; Souza, S.J. de ; Meyer, D. . Padrão distinto de seleção natural entre os ESEs sugere diferença funcional. In: 56º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, Guarujá - SP, 2010, Guarujá. 56º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 2010. p. 390-390.
-
Salim, ACM ; Habr-Gama, A ; Parmigiani, RB ; Galante, PA ; Souza, J.E. de ; Quevedo, BS ; Felício, NM ; Perez, RO ; Gama-Rodrigues, JJ ; Souza, SJ ; Camargo, AA . Predição da resposta ao tratamento neoadjuvante com radioterapia associada à quimioterapia em pacientes com adenocarcinoma de reto utilizando a metodologia de sequenciamento em larga escala. In: 56º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, Guarujá - SP, 2010, Guarujá. 56º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 2010. p. 415-415.
-
JE Kroll ; FCP Navarro ; Souza, J.E. de ; S. J. de Souza ; A.A. Carmago ; P.A.F. Galante . INACTIVATION OF TARGETS AND GENES OF MICRORNAS BY INDELS: IMPACT ON CANCER-RELATED GENES. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009. v. GE18. p. 15-15.
-
Ramalho, R. ; De Souza, J. E. S. ; Meyer, D. ; Souza, S.J. de . EVALUATING THE SIGNATURE OF RECENT NATURAL SELECTION IN COMBINED EXONIC SPLICING ENHANCERS USING SNP ALLELIC FREQUENCY FROM HAPMAP. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, 2009. v. GE34. p. 34-34.
-
Rodrigues, T. C. ; da Cunha, J. P. C. ; Galante, P. A. F. ; Souza, J.E. de ; Souza, S.J. de . NEW ALTERNATIVE SPLICING VARIANTS IN BREAST CANCER.. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009. v. GE35. p. 35-35.
-
da Cunha, J. P. C. ; Rodrigues, T. C. ; De Souza, J. E. S. ; Galante, P. A. F. ; Souza, S.J. de . DOES TUMOR SOMATIC MUTATION AFFECT THE SPLICING PATTERN?. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009. v. TP4. p. 81-81.
-
De Souza, J. E. S. ; Vidal, D. O ; Pires, L. C. ; Masotti, C ; Salim, A. C. M. ; Costa, M. C. F. ; Galante, P. A. F. ; Souza, S.J. de ; A.A. Carmago . ANALYSIS OF ALLELIC DIFFERENTIAL EXPRESSION IN THE HUMAN GENOME USING ALLELE-SPECIFIC SAGE TAGS.. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009. v. TP14. p. 89-89.
-
Ezquina, S. A. ; De Souza, J. E. S. ; Souza, S.J. de . STUDY OF ALTERNATIVE POLYADENYLATION IN HUMAN GENES. In: 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009, Angra dos Reis, RJ. 5st International Conference of the AB3C X-meeting, 2009. v. TP25. p. 102-102.
-
MELLO, J. C. M. ; STABELLINI, R ; ARAUJO, E. S. S ; HERNANDES, L. M. ; Vidal, D. O ; De Souza, J. E. S. ; A.A. Carmago ; PEREIRA, L. V. . X chromosome inactivation patterns in human placenta.. In: Meeting of MC-GARD.eu - Highe order of genome architecture, 2009, 2009, Edimburgo - Amsterdan. Meeting of MC-GARD.eu - Highe order of genome architecture,, 2009. v. 31. p. 65-160.
-
MELLO, J. C. M. ; STABELLINI, R ; ARAUJO, E. S. S ; HERNANDES, L. M. ; Vidal, D. O ; De Souza, J. E. S. ; A.A. Carmago ; PEREIRA, L. V. . Analysis of allele-specific gene expression reveals random X chromosome inactivation pattern in human term placenta. In: 55 Congresso Brasileiro de Genética., 2009, Águas de Lindóia, SP. 55 Congresso Brasileiro de Genética., 2009.
-
da Cunha, J. P. C. ; Galante, P. A. F. ; De Souza, J. E. S. ; de Souza, R. F. ; Carvalho, P. M. ; Ohara, D. T. ; Moura, R. P. ; Oba-Shinja, S. M. ; Marie, S. K. N. ; Silva, W. A. ; Perez, R. O. ; Stransky, B. ; Pieprzyk, M. ; Moore, J. ; Caballero, O. ; Habr-Gama, A. ; Kuo, W. P. ; Simpson, A. J. ; A.A. Carmago ; Old, L. J. ; et.al . Bioinformatics construction of the human surfaceome and experimental identification of new tumor targets at cell surface. In: 100th Annual Meeting of AACR, 2009, 2009, Colorado, USA. 100th Annual Meeting of AACR, 2009.
-
Ramalho, R. ; Souza, J.E. de ; Meyer, D. ; Souza, S.J. de . The frequency spectrum of polymorphisms of ESEs in constitutive and alternative exons of the human genome. In: Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution ?SMBE?., 2008, Spain. Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, 2008.
-
Soares, I. C ; Santo, K. S. E ; Wakamatsu, A ; Réssio, RA ; Souza, S.J. de ; Souza, J.E. de ; Okamoto, O. K. ; Alves, VAF . Immunohistochemical characterization of ovarian carcinoma with monoclonal antibody MX35.. In: XXVIIth International Congress of the International Academy of Pathology, 2008, Athenas. XXVIIth International Congress of the International Academy of Pathology, 2008.
-
da Cunha, J. P. C. ; De Souza, J. E. S. ; Souza, S.J. de . Somatic mutations in splicing regulators elements and its association with alternative splicing.. In: 54 Congresso Brasileiro de Genética, 2008, 2008, Salvador, BA. 54 Congresso Brasileiro de Genética, 2008.
-
Souza, J.E. de ; D.O. Vidal ; P.A.F. Galante ; Souza, S.J. de ; A.A. Carmago . Identification of Mono-allelic Gene Expression and Differential Allelic Gene Expression in the Human Genome. In: 3st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2007, São Paulo. 3st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2007.
-
S. Ezquina ; Souza, J.E. de ; Souza, S.J. de . The effect of polymorphisms and somatic mutations in the repertoire of polyadenylation variants. In: 3st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2007, São paulo. 3st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2007.
-
Souza, J.E. de ; P.A.F. Galante ; L.C. Pires. ; Souza, S.J. de ; A.A. Carmago . Identification of novel imprinted genes in human.. In: 2st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2006, Fortaleza. 2st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2006.
-
D.O. Vidal ; P.A.F. Galante ; L.C. Pires. ; Souza, J.E. de ; A.A. Carmago ; Souza, S.J. de . High-throughput identification and gene expression analysis of novel antisense transcripts using MPSS. In: 2st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2006, Fortaleza. 2st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2006.
-
Souza, J.E. de ; O.M. Chaim ; P.A.F. Galante ; Silva, A. P. M. ; Souza, S.J. de ; A.A. Carmago . Identification of novel imprinted genes using allele-specific SAGE and MPSS tags. In: 1st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2005, Caxambu. 1st International Conference of the AB3C ?X-meeting?, 2005.
-
Souza, J.E. de ; N.J. Sakabe ; Souza, S.J. de . Study of the correlation of ESEs disrupted by SNPs and alternative splicing. In: 2st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004, Angra dos Reis. 2st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004.
-
F. Prosdocimi, ; G.C. Cerqueira ; L.P. Camargo ; CAMARGO, F. ; A.C.M Junqueira ; R.G.M. Ferreira ; Á.V.F. Flatschart ; A.F. Silva ; A.N. dos Reis ; A.C.F. dos Santos ; A.N. Júnior ; CL. Wust ; E. Binneck ; J.L. Kessedjian ; J.H. Petretski ; R.P. Lima ; R.M. Pereira ; S. Jardim ; V.S. Sampaio ; Souza, J.E. de ; et.al . Candidate genes for the late onset Alzheimer disease in human chromosome 10. In: 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003.
-
Souza, J.E. de ; N.J. Sakabe ; J. Barrera ; Souza, S.J. de . A large-scale study of SNPs in regulatory elements of alternative splicing and their possible association to human diseases. In: 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003.
-
SOUZA, JORGE E. S. . Tecnologias computacionais na prática clínica. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
-
Souza, JES . Tecnologias computacionais para aplicações na prática clínica. 2025. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
SOUZA, JORGE E. S. . Diversidade mitogenômica em peixes da amazônia: data mining, montagem, anotação e insights.. 2024. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
Souza, JES . Interfaces em Bioinformática. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
De Souza, J. E. S. . Integração de dados na identificação de variantes patogênicas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
Souza, JES . Ferramentas para análises de dados de RNA-seq. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
De Souza, J. E. S. . Bioinformática - Conceitos Básicos e Aplicados. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
-
Souza, JES . Desenvolvimento de aplicativos para Bioinformática. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
Souza, JES . Aplicações em Bioinformática. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
de Souza, J. E. . Oncogenômica na era do Big Data. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
de Souza, J. E. . Bioinformática aplicada ao câncer. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
DE SOUZA, JORGE E. S. . Análise de mutações em exoma. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
De Souza, J. E. S. . Análise de mirnoma. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
De Souza, J. E. S. . Análise de RNAseq. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
-
de Souza, J. E. . Hands-on RNAseq. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
de Souza, J. E. . Análise de mutações em exoma. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
De Souza, J. E. S. . Análises de formas alternativas de splicing. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
de Souza, J. E. . Análises de RNA-seq: Do dado bruto à expressão diferencial. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
Souza, JES . Fundamentos Computacionais Para a Bioinformática. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
De Souza, J. E. S. . Tutorial RNA-seq. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
De Souza, J. E. S. . Bioscope and Torque for analysis of SOLiD reads. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
Souza, JES . Bioinformática. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
de Souza, J. E. . Plataforma de alta-performance computacional aplicada na analise de Splicing alternativo e diversidade genética. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
-
De Souza, J. E. S. . Introdução ao splicing alternaivo. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
-
Souza, J.E. de . Identificação de Genes submetidos a Imprinting Através de tags de SAGE e MPSS associadas com SNPs. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
Souza, J.E. de . Estudo em larga escala de ocorrência de SNPs em elementos reguladores de splicing e sua possível relação com doenças humanas. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
Souza, J.E. de . Estudo em larga escala de ocorrência de SNPs em elementos reguladores de splicing e sua possível relação com doenças humanas. 2003. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
Souza, J.E. de . Alinhamento e scoring (Programação Dinâmica). 2003. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
Outras produções
De Souza, J. E. S. . Consultor(a) interno(a) do processo de avaliação de projetos de pesquisa da UFRN. 2020.
De Souza, J. E. S. . Consultor(a) interno(a) do processo de avaliação de projetos de pesquisa da UFRN. 2017.
De Souza, J. E. S. ; GOMES, DANIEL H. F. ; MEDEIROS, I. G. ; PETTA, TIRZAH B. ; STRANSKY, B. . DTreePred: An online viewer based on machine learning for pathogenicity prediction of genomic variants. 2023.
de Souza, J. E. ; Galante, P. A. F. ; de Souza, S. J. . SurfaceomeDB. 2011.
De Souza, J. E. S. ; E. Ossorio . pp-Blast. 2001.
De Souza, J. E. S. ; L. Koopp ; P. S. de Oliveira . TFI. 2001.
DE SOUZA, JORGE E.S. . TÓPICOS AVANÇADOS II: PROCESSAMENTO E ANÁLISE DE DADOS DE NGS. 2025. .
de Souza, J. E. . Avaliador no congresso: XXXVI Congresso de Iniciação Científica - 2025. 2025. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: XXXV Congresso de Iniciação Científica - Natal, RN - 2024. 2024. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE E. S. . Mitogenoma - VI Simpósio Norte e Nordeste de Bioinformática (VI SNNB), 2023, Salinópolis. 2023. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: XXXIV Congresso de Iniciação Científica - Natal, RN - 2023. 2023. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: VI Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, Salinopolis, Pará - 2023. 2023. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: II Natal Bioinformatics Forum, - Natal, RN - 2013. 2023. (Participação como avaliador em congresso).
De Souza, J. E. S. . Introdução à Analise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração - UFRN - Natal, RN. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: 73ª Reunião Anual da SBPC, Local: Virtual - Transmissão pelo canal da SBPC no Youtube - 2021. 2021. (Participação como avaliador em congresso).
De Souza, J. E. S. . Introdução à Analise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração - URFN - Natal, RN. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Souza, JES ; SOUZA, S. J. . INTRODUÇÃO À ANÁLISE DE DADOS DE SEQUENCIADORES DE SEGUNDA GERAÇÃO - Fiocruz/Biomanguinhos Rio de Janeiro - RJ. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: XXXI Congresso de Iniciação Científica - Natal, RN - 2020. 2020. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: XXX Congresso de Iniciação Científica - Natal, RN - 2019. 2019. (Participação como avaliador em congresso).
DE SOUZA, JORGE . Avaliador no congresso: I Natal Bioinformatics Forum, - Natal, RN - 2019. 2019. (Participação como avaliador em congresso).
OHNO-MACHADO, L. ; de Souza SJ ; DALMOLIN, R. J. S. ; MATOS, J. P. ; De Souza, J. E. S. . Bioinformática Básica - Universidade Eduardo Mondlane - Maputo/Moçambique. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . Curso teórico-prático em Introdução à análise de dados de sequenciadores de segunda geração - Natal, RN. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Souza, JES ; MATOS, J. P. . Introdução a NGS - UFPA - II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática. Belém.. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
OHNO-MACHADO, L. ; de Souza SJ ; DALMOLIN, R. J. S. ; COSTA, C. R. ; De Souza, J. E. S. . Aplicações da Bioinformática como resposta sustentável aos desafios da Bio Ciência em Moçambique, Maputo - Universidade Eduardo Mondlane. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . 1º Curso teórico-prático em Introdução à análise de dados de sequenciadores de segunda geração- UFRN. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
MABILA, F. ; OHNO-MACHADO, L. ; de Souza, S. J. ; De Souza, J. E. S. . Curso de Introdução em Bioinformática - Maputo, Moçambique. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. ; de Souza SJ . Aplicações do sequenciamento de nova geração - 59o. Congresso Brasileiro de Genética, Águas de Lindóia. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . Fundamentos em Bioinformática - UNESP - Botucatu, SP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . Introduction to next Generation Sequencing - USP, Ribeirão Preto, SP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . Escola de estudos avançados em Genômica. - USP, Ribeirão Preto, SP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
A.A. Carmago ; Brentani H ; Souza, J.E. de . Análise de transcriptomas - LNCC - Petrópolis, Rio de Janeiro. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).
Souza, S.J. de ; Souza, J.E. de . Alternative Splicing e Análise de expressão por SAGE - - LNCC - Petrópolis, Rio de Janeiro. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).
De Souza, J. E. S. . M39 - Excel - Universidade de Santo Amaro - Unisa. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . M30 - Excel - Universidade de Santo Amaro - Unisa. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
De Souza, J. E. S. . M40 - Excel - Universidade de Santo Amaro - Unisa. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Projetos de pesquisa
-
2024 - Atual
ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE TECNOLOGIAS COMPUTACIONAIS EM BIOINFORMÁTICA PARA AVANÇOS NA PESQUISA EM GENÔMICA E SAÚDE, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador., Financiador(es): Universidade Federal do Rio Grande do Norte - Outra.
-
2022 - Atual
Estabelecimento e manutenção de ambientes de desenvolvimento e pesquisa em bioinformática, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / CESAR RENNO COSTA - Integrante / SAKAMOTO, TETSU - Integrante / Renan Cipriano Moioli - Integrante.
-
2020 - 2023
Fighting Global Cancer: A Swedish-Brazilian Partnership focused on Research, Education and Innovatio (em Rede/Internacional), Descrição: A medicina personalizada é uma realidade no Brasil, porém ainda existe uma discrepância na distribuição de centros e profissionais qualificados, principalmente na região Norte/Nordeste do Brasil. A colaboração entre o Instituto Karolinska (KI) e a UFRN surgiu do interesse do grupo brasileiro em aprimorar os conhecimentos na pesquisa do câncer e pelo fato do KI ter experiência nesses tumores e querer fortalecer as pesquisas em bioinformática.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN - Integrante / TIRZAH BRAZ PETTA LAJUS - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez - Integrante / João Paulo Matos Santos Lima - Integrante / KAISA IRENE LEHTI - Integrante / JOSEPH WOODWARD CARLSON - Integrante.
-
2018 - 2022
Metagenômica aplicada à descoberta de genes com potencial biotecnológico., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / Lucymara Fassarela Agnez - Integrante / INACIO GOMES MEDEIROS - Integrante.
-
2018 - 2020
Integração de dados e desenvolvimento de métricas para análise de fatores de transcrição, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / Lucas Felipe da Silva - Integrante / INACIO GOMES MEDEIROS - Integrante / JHEYNNE LAINA ALVES DE LIMA - Integrante / SHIRLEY OHARA TELEMACO DE FREITAS - Integrante., Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa.
-
2018 - Atual
Estudo do padrão global de variações genômicas de famílias com portadores da Síndrome de Alport., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / Raul Maia Falcao - Integrante / Selma Jeronimo - Integrante / Washington Araujo - Integrante.
-
2018 - Atual
Oncologia de precisão utilizando banco de dados, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / TIRZAH BRAZ PETTA LAJUS - Integrante / Raul Maia Falcao - Integrante / INACIO GOMES MEDEIROS - Integrante.
-
2017 - Atual
O Câncer de Próstata no Rio Grande do Norte: Análise Epidemiológica e Genômica Comparativa utilizando Banco de Dados, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / STRANSKY, BEATRIZ - Coordenador.
-
2017 - Atual
Estudo da estrutura genômica de espécies de peixes de importância econômica para a piscicultura, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / Sandro José de Souza - Integrante / Danilo Lopes Martins - Integrante / PITAGORAS DE AZEVEDO ALVES SOBRINHO - Integrante / Wilfredo Blanco - Integrante / Sidney Santos - Integrante / João Paulo Matos Santos Lima - Integrante / André M Ribeiro-dos-Santos - Integrante / Paulo Pimentel Assumpção - Integrante.
-
2016 - 2019
Calculadora de risco para câncer hereditário, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / TIRZAH BRAZ PETTA LAJUS - Integrante / SEBASTIAO NOBERTO CAMELO PESSOA NETO - Integrante.
-
2015 - Atual
Desenvolvimento de interfaces para analise de expressão gênica, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador / Sandro José de Souza - Integrante / FONSECA, ANDRÉ - Integrante / Danilo Lopes Martins - Integrante / PITAGORAS DE AZEVEDO ALVES SOBRINHO - Integrante.
-
2015 - Atual
REDE DE PESQUISA EM GENÔMICA POPULACIONAL HUMANA (em Rede), Descrição: O projeto Rede de pesquisa em genômica populacional humana , propõe o desenvolvimento de uma rede de biologia computacional baseado no estudo do genoma de populações humanas da Amazônia, obtidos por meio de plataforma NGS (Sequenciamento Nova Geração). Este permitirá: uma melhor compreensão da variabilidade genética de populações tradicionais da região Amazônica; o estudo da variabilidade dos sítios de ligação de fatores transcricionais humanos; o conhecimento de mecanismos envolvidos no câncer gástrico; e o desenvolvimento de sistemas inteligentes (área computacional) aplicados à descoberta de padrões biológicos. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Coordenador / Ney Pereira Carneiro dos Santos - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Igor Guerreiro Hamoy - Integrante / Paulo Pimentel de Assumpçã - Integrante., Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
-
2014 - Atual
ASPECTOS MOLECULARES ENVOLVIDOS NO RISCO, DESENVOLVIMENTO E PROGRESSÃO DO CARCINOMA DUCTAL DE MAMA: Busca de Novos Genes de Susceptibilidade e Investigação da Progressão do Carcinoma in situ e do Papel da Mutação em BRCA1 no Tumor Triplo Negativo (rede), Descrição: Essa proposta engloba aspectos moleculares de risco, de desenvolvimento e progressão do câncer de mama (CaM) usando sequenciamento de próxima geração como abordagem principal. Mutação nos genes de susceptibilidade, BRCA1/BRCA2, é um dos principais fatores de risco associados com o desenvolvimento de CaM. A identificação da causa genética que induz ao risco de desenvolver CaM é crucial para as mulheres serem adequadamente assistidas e inseridas dentro de programas de rastreamento adequados e adoção de medidas preventivas.... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / Adriana Miti Nakahata - Integrante / Cynthia Aparecida Bueno de Toledo Osorio - Integrante / Daiana Karol Koshimae Marin - Integrante / Dirce Maria Carraro - Coordenador / Eliana Vanina Elias - Integrante / Elisa Napolitano e Ferreira - Integrante / Felipe Cavalcanti Carneiro da Silva - Integrante / Giovana Tardin Torrezan - Integrante / Mabel Gigliola Pinilla Fernandez - Integrante / Marcia Cristina Pena Figueiredo - Integrante / Maria Isabel Alves de Souza Waddington Achatz - Integrante / Rafael Canfield Brianese - Integrante / Sandro José de Souza - Integrante / Tiago Góss dos Santos - Integrante / Victor Piana de Andrade - Integrante / Vilma Regina Martins - Integrante / Vladmir Cláudio Cordeiro de Lima - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
-
2014 - Atual
Biologia Sistêmica do Câncer (em Rede), Descrição: Descrição: Rede de pesquisa, extensão e ensino financiada pela Capes. Para maiores detalhes, ver http://neuro.ufrn.br/bsc.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / Sandro José de Souza - Coordenador / Junior Barrera - Integrante / Dirce M Carraro - Integrante / José Miguél Ortega - Integrante., Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
-
2009 - 2013
EMU - Aquisição de uma plataforma de alta perfomance para análises computacionais aplicadas a medicina (em Rede), Descrição: A proposta visa a aquisição e estabelecimento de uma plataforma de alta-performance voltada para análises computacionais aplicados à medicina, com ênfase em genômica. A disponibilidade de diversos seqüenciadores de nova-geração tem produzido um grande volume de dados e há um evidente gargalo na capacidade de processamento e análise computacional dos dados gerados. Para a solução deste problema, um dos requisitos fundamentais é o investimento em uma infra-estrutura computacional que propicie tanto computação de alto desempenho como alta capacidade e confiabilidade de armazenamento de dados. Os grupos envolvidos nessa proposta tem muita experiência com dados de sequenciamento e estão (e estiveram) diretamente envolvidos em vários projetos na área de genômica. Os dados provenientes das plataformas genômicas vem também sendo usados em diversas análises incluindo, desenho de drogas e modelagem de sistemas biológicos. A plataforma aqui proposta visa também auxiliar projetos nessas áreas de conhecimento. Esperamos que a plataforma venha a ter um significativo impacto nos projetos dos grupos envolvidos. A proposta engloba também a execução de dois cursos sobre processamento e análise de dados genômicos, abertos à comunidade interessada. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / Paulo S. de Oliveira - Integrante / Brentani H - Integrante / Stransky, B. - Integrante / Pedro Alexandre Favoretto Galante - Integrante / Anamaria Aranha Camargo - Integrante / Wilson Araújo da Silva Junior - Coordenador / Dirce Maria Carraro - Integrante / Emmanuel Dias-Neto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Projetos de desenvolvimento
-
2021 - Atual
Desenvolvimento institucional do IMD 2021-2026: formação de recursos humanos, pesquisa e inovação através do empreendedorismo e inclusão digital., Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jorge Estefano Santana de Souza - Integrante / ADRIAO DUARTE DORIA NETO - Coordenador.
Prêmios
2023
Oncotarget?s Top 10 Papers in 2022, Oncotarget.
2021
BEST PAPER AWARD, 21th International Conference on Computational Science and Applications (ICCSA 2021), Italy..
2020
Honorable Mention Award, Poster session Genes and Genomics of the Xmeeting eXperience 2020 held online, between 11-09-2020 -.
2016
Scholar-in-training award, AACR, DNA Repair: Tumor Development and Therapeutic Response, Montreal, Canadá.
Histórico profissional
Endereço profissional
-
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto Metrópole Digital. , Avenida Odilon Gomes de Lima, 1722, Capim Macio, 59078400 - Natal, RN - Brasil, Telefone: (84) 997085398
Experiência profissional
2014 - 2014
A.C. Camargo Cancer Center/ACCCC/FAPVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador
2024 - Atual
Universidade Federal do Rio Grande do NorteVínculo: Diretor Técnico, Enquadramento Funcional: Diretor Técnico do BIOME - CMB, Carga horária: 2
Outras informações:
Diretor Técnico do BIOME - Centro Multiusuário em Bioinformática, vinculado ao Instituto Metrópole Digital.
2018 - Atual
Universidade Federal do Rio Grande do NorteVínculo: Membro de Colegiado, Enquadramento Funcional: Membro do Colegiado do BTI, Carga horária: 1
Outras informações:
Membro do Colegiado do BTI (Bacharelado em Tecnologia da Informação) da UFRN - UFRNPeríodo: 2018-2025
2016 - Atual
Universidade Federal do Rio Grande do NorteVínculo: Membro Comitê Gestor, Enquadramento Funcional: Comitê Gestor do BIOME - CMB, Carga horária: 2
Outras informações:
Comitê Gestor do BIOME - Centro Multiusuário em Bioinformática, vinculado ao Instituto Metrópole Digital.
2016 - Atual
Universidade Federal do Rio Grande do NorteVínculo: Membro de Colegiado, Enquadramento Funcional: Membro do Colegiado do PPgBioinfo, Carga horária: 1
Outras informações:
Membro do Colegiado do Programa de Pós-graduação em Bioinformática (PPgBioinfo) - UFRN
2014 - Atual
Universidade Federal do Rio Grande do NorteVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
-
01/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Metrópole Digital.Cargo ou função, Colegiado do BTI-IMD.
-
10/2014
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto Metrópole Digital.Linhas de pesquisa
2014 - Atual
Universidade Federal do ParáVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador
2013 - 2014
Universidade de São PauloVínculo: , Enquadramento Funcional: Especialista em Bioinformática, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2012 - 2014
Instituto de Bioinformática e BiotecnologiaVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador
2012 - 2013
Fundação Hemocentro de Ribeirão PretoVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador
2007 - 2012
Recepta Biopharma S.A.Vínculo: Analista/Desenvolvedor, Enquadramento Funcional: Analista/Desenvolvedor em Bioinformática, Carga horária: 12
2007 - 2009
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia ComputacionalVínculo: Analista de Sistemas e Desenvo, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas e Desenvolvedor WEB, Carga horária: 6
2011 - 2012
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o CâncerVínculo: Pesquisador Junior., Enquadramento Funcional: Pesquisador Junior., Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2007 - 2011
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o CâncerVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Desen. Colaborador em Bioinformática, Carga horária: 10
2006 - 2007
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o CâncerVínculo: técnico, Enquadramento Funcional: técnico de bioinformática, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2001 - 2002
Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o CâncerVínculo: tecnico, Enquadramento Funcional: tecnico de bioinformatica, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
09/2000 a 09/2001 - bolsista
Atividades
-
09/2001 - 10/2002
Serviços técnicos especializados , Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer.Serviço realizado, Bioinformatica.
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Jorge Estefano Santana de Souza e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?