Camila Miranda Lopes Ramos

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (2007), mestrado em Fisiopatologia Médica pela Universidade Estadual de Campinas (2010), doutorado em Oncologia pela Fundação Antônio Prudente, AC Camargo Cancer Center (2014) e pós-doutorado em biologia computacional e genômica do câncer no Dana-Farber Cancer Institute, Harvard School of Public Health (2016). Tem experiência na área de Genética, Biologia Molecular e Biologia Computacional, atuando principalmente nos seguintes temas: genômica do câncer, redes regulatórias gênicas, miRNAs e marcadores moleculares.

Informações coletadas do Lattes em 27/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Oncologia

2010 - 2014

Fundação Antônio Prudente
Título: Identificação e estudo de expressão de variantes de poliadenilação e de microRNAs através de sequenciamento em larga escala em amostras de tumor colorretal
Raphael Bessa Parmigiani. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Mestrado em Fisiopatologia Médica

2008 - 2010

Universidade Estadual de Campinas
Título: Construção e avaliação de um modelo in vitro dos efeitos citotóxicos da ataxina-3 expandida e teste de compostos que possam reverter a formação de agregados intracelulares e seus efeitos citopáticos,Ano de Obtenção: 2010
Iscia Teresinha Lopes-Cendes.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Doença de Machado Joseph; ataxina-3; RNAi; Chaperonas químicas.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Ciencias Biologicas

2004 - 2007

Universidade Estadual de Campinas
Título: Análise de expressão dos genes IL1-beta e BDNF no modelo animal de epilepsia do lobo temporal induzido pela pilocarpina
Orientador: Iscia Teresinha Lopes-Cendes
Bolsista do(a): Pró-Reitoria de Pesquisa (PRP) - SAE/UNICAMP, SAE, Brasil.

Pós-doutorado

2015

Pós-Doutorado. , Harvard School of Public Health, HSPH, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

2014 - 2015

Pós-Doutorado. , Hospital Sírio-Libanês, SIRIO-LIBANÊS, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Formação complementar

2016 - 2016

Understanding Biomarker Science: From Molecules to Images. (Carga horária: 36h). , Harvard University, HARVARD, Estados Unidos.

2016 - 2016

Introduction to Network Medicine. (Carga horária: 26h). , Harvard University, HARVARD, Estados Unidos.

2016 - 2016

Writing and Publishing Your Research: A Scientific Writing Course. (Carga horária: 14h). , Harvard University, HARVARD, Estados Unidos.

2014 - 2014

X Summer Course Bioinformatics -R and Bioconductor. (Carga horária: 70h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2012 - 2012

II Curso de Introdução ao MATLAB. (Carga horária: 40h). , Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento, SBNeC, Brasil.

2011 - 2011

Elementos cisregulatórios em genomas eucariotos. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2009 - 2009

Migración de Neuronas em el Desarrollo. (Carga horária: 26h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2009 - 2009

Introdução à técnica RNAi e microRNAs. (Carga horária: 80h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2008 - 2008

Latin American School of Human and Medical Genetic. (Carga horária: 40h). , Rede Latino Americana de Genética Humana, RELAGH, Colômbia.

2005 - 2005

Genética do Câncer. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2005 - 2005

Células tronco: características e aplicações.. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2005 - 2005

Interferência por RNA. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.

Organização de eventos

MODOLIN, R. ; LOPES-RAMOS, CM ; Dinato, D.O. ; Duarte, F. M. ; Pião, S. ; Gomes, P. ; Vieira, E. . VIII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. 2007. (Congresso).

Participação em eventos

Transatlantic Data Science Workshop.Applying the Genomic Profile of Early Stage Cancer to Study Cancer Occurrence. 2016. (Simpósio).

Advanced Topics in Genomics and Cell Biology Translational Genomics. miR-21-5p as a predictive marker for complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. 2014. (Congresso).

Câncer de Mama Avanços e Perspectivas. 2014. (Simpósio).

Challenges and Solutions in Cancer Research and Treatment. Global miRNA expression study to predict complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. 2014. (Congresso).

X Summer Course for Bioinformatics - Introduction to R and Bioconductor.Predicting response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer through global miRNA expression study. 2014. (Outra).

63rd Annual Meeting of the American Society of Human Genetics. Large scale identification of alternative polyadenylation through next generation sequencing. 2013. (Congresso).

Câncer de Mama Avanços e Perspectivas. 2013. (Simpósio).

I International Symposium on Personalized Medicine. 2013. (Simpósio).

Next Frontiers to Cure Cancer - Integrating Science and Patient Care. miR-21 as a biomarker to predict response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer. 2013. (Congresso).

Simpósio Internacional de Coloproctologia. 2013. (Simpósio).

Intersections - 1st International Cooperative Cancer Symposium. 2012. (Simpósio).

microRNA 2012: International Symposium. High-throughput miRNA expression profiling to predict rectal cancer treatment response. 2012. (Congresso).

Regulatory & Non-Coding RNAs meeting. Predicting response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer through miRNA expression analysis. 2012. (Congresso).

57o Congresso Brasileiro de Genética. Alternative polyadenylation study in colon tumor cell lines by high-throughput sequencing. 2011. (Congresso).

AC Camargo Global Meeting of Translational Science, 2nd São Paulo School of Translational Science.Identification of polyadenylation variants in colon tumor cell lines using a new high-throughput approach. 2011. (Encontro).

II Encontro Nacional de Epigenética. 2010. (Encontro).

II Life Technologies Next Generation Sequencing Experience. 2010. (Encontro).

3ª Semana de Pesquisa da FCM.Caminhando para um modelo in vitro da doença de Machado Joseph e seu uso na exploração de alternativas terapêuticas. 2009. (Encontro).

IX Encontro da Sociedade Brasileira de Investigação Neurológica (SBIN).Construção e avaliação de um modelo in vitro dos efeitos citotóxicos da ataxina-3 expandida & Low frequency of SPG11 mutation in brazilian patients with hereditary spastic paraplegia with thin corpus callosum. 2009. (Encontro).

Jornada de Neurociências. Doença de Machado-Joseph: criação de um modelo in vitro para investigação de alternativas terapêuticas. 2009. (Congresso).

2ª Semana de Pesquisa da FCM - UNICAMP. 2008. (Simpósio).

AIESEC Leadership Meeting. 2008. (Encontro).

IV Latin American School of Human and Medical Genetics. 2008. (Encontro).

XVI Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP. Análise de expressão do gene TrkB no modelo animal de epilepsia do lobo temporal induzido pela pilocarpina. 2008. (Congresso).

53º Congresso Brasileiro de Genética. SELEÇÃO DE SEQÜÊNCIAS-ALVO IDEAIS PARA CONFECÇÃO DE siRNA DIRECIONADAS AO GENE INTERLEUCINA 1β EM RATOS WISTARS.. 2007. (Congresso).

XV Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP. Desenhos de moléculas de siRNA contra o gene BDNF em ratos WISTARS. 2007. (Congresso).

52º Congresso Brasileiro de Genética. IDENTIFICAÇÃO DE cDNAs DIFERENCIALMENTE EXPRESSOS EM CÉLULAS DO BLASTEMA DO MEMBRO ANTERIOR DE TRITURUS CRISTATUS. 2006. (Congresso).

51º Congresso Brasileiro de Genética. 2005. (Congresso).

VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. Detecção Enzimática de Pesticidas Organofosforados em Tomates. 2005. (Congresso).

VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. Estudo Faunístico em Bromélias na Mata da Praia Dura, Ubatuba, SP. 2005. (Congresso).

Produções bibliográficas

2018 KOYAMA, F. C. ; LOPES RAMOS, C. M. ; LEDESMA, F. ; ALVES, V. A. F. ; FERNANDES, J. M. ; VAILATI, B. B. ; SÃO JULIÃO, G. P. ; HABR-GAMA, A. ; GAMA-RODRIGUES, J. ; PEREZ, R. O. ; CAMARGO, A. A. . Effect of Akt activation and experimental pharmacological inhibition on responses to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer. BRITISH JOURNAL OF SURGERY , v. 105, p. e192-e203, 2018.
2017 SONAWANE, ABHIJEET RAJENDRA ; PLATIG, JOHN ; FAGNY, MAUD ; CHEN, CHO-YI ; PAULSON, JOSEPH NATHANIEL ; LOPES-RAMOS, CAMILA MIRANDA ; DEMEO, DAWN LISA ; QUACKENBUSH, JOHN ; GLASS, KIMBERLY ; KUIJJER, MARIEKE LYDIA . Understanding Tissue-Specific Gene Regulation. Cell Reports , v. 21, p. 1077-1088, 2017.
2017 LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; PAULSON, JOSEPH N. ; CHEN, CHO-YI ; KUIJJER, MARIEKE L. ; FAGNY, MAUD ; PLATIG, JOHN ; SONAWANE, ABHIJEET R. ; DEMEO, DAWN L. ; QUACKENBUSH, JOHN ; GLASS, KIMBERLY . Regulatory network changes between cell lines and their tissues of origin. BMC GENOMICS , v. 18, p. 723, 2017.
2017 FAGNY, MAUD ; PAULSON, JOSEPH N. ; KUIJJER, MARIEKE L. ; SONAWANE, ABHIJEET R. ; CHEN, CHO-YI ; LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; GLASS, KIMBERLY ; QUACKENBUSH, JOHN ; PLATIG, JOHN . Exploring regulation in tissues with eQTL networks. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 114, p. E7841-E7850, 2017.
2017 LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; BARROS, BRUNA P. ; KOYAMA, FERNANDA C. ; CARPINETTI, PAOLA A. ; PEZUK, JULIA ; DOIMO, NAYARA T. S. ; HABR-GAMA, ANGELITA ; PEREZ, RODRIGO O. ; PARMIGIANI, RAPHAEL B. . E2F1 somatic mutation within miRNA target site impairs gene regulation in colorectal cancer. PLoS One , v. 12, p. e0181153, 2017.
2017 PAULSON, JOSEPH N. ; CHEN, CHO-YI ; LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; KUIJJER, MARIEKE L. ; PLATIG, JOHN ; SONAWANE, ABHIJEET R. ; FAGNY, MAUD ; GLASS, KIMBERLY ; QUACKENBUSH, JOHN . Tissue-aware RNA-Seq processing and normalization for heterogeneous and sparse data. BMC BIOINFORMATICS , v. 18, p. 437, 2017.
2016 MARÇOLA, MARINA ; LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; PEREIRA, ELIANA P. ; CECON, ERIKA ; FERNANDES, PEDRO A. ; TAMURA, EDUARDO K. ; CAMARGO, ANAMARIA A. ; PARMIGIANI, RAPHAEL B. ; MARKUS, REGINA P. . Light/Dark Environmental Cycle Imposes a Daily Profile in the Expression of microRNAs in Rat CD133 Cells. Journal of Cellular Physiology (Print) , v. 231, p. 1953-1963, 2016.
2016 LOPES-RAMOS, C.M. ; Pereira, T.C. ; DOGINI, D.B. ; Gilioli, R. ; Lopes-Cendes, I. . Lithium carbonate and coenzyme Q10 reduce cell death in a cell model of Machado-Joseph disease. Brazilian journal of medical and biological research , v. 49, p. e5805, 2016.
2015 LOPES-RAMOS, CAMILA ; KOYAMA, FERNANDA C. ; HABR-GAMA, ANGELITA ; SALIM, ANNA CHRISTINA M. ; BETTONI, FABIANA ; ASPRINO, PAULA F. ; FRANÇA, GUSTAVO S. ; GAMA-RODRIGUES, JOAQUIM ; PARMIGIANI, RAPHAEL B. ; PEREZ, RODRIGO O. ; GALANTE, PEDRO A.F. ; CAMARGO, ANAMARIA A. . Comprehensive evaluation of the effectiveness of gene expression signatures to predict complete response to neoadjuvant chemoradiotherapy and guide surgical intervention in rectal cancer. Cancer Genetics , v. 15, p. 00041, 2015.
2014 HINSKE, L. C. ; FRANCA, G. S. ; TORRES, H. A. M. ; OHARA, D. T. ; LOPES-RAMOS, C. M. ; HEYN, J. ; REIS, L. F. L. ; OHNO-MACHADO, L. ; KRETH, S. ; GALANTE, P. A. F. . miRIAD--integrating microRNA inter- and intragenic data. DATABASE-OXFORD , v. 2014, p. bau099-bau099, 2014.
2014 LOPES-RAMOS, CAMILA ; HABR-GAMA, ANGELITA ; QUEVEDO, BRUNA ; FELÍCIO, NATÁLIA ; BETTONI, FABIANA ; KOYAMA, FERNANDA ; ASPRINO, PAULA ; GALANTE, PEDRO ; GAMA-RODRIGUES, JOAQUIM ; CAMARGO, ANAMARIA ; PEREZ, RODRIGO ; PARMIGIANI, RAPHAEL . Overexpression of miR-21-5p as a predictive marker for complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. BMC Medical Genomics , v. 7, p. 68, 2014.
2012 FRANCA, M. C. ; YASUDA, C. L. ; PEREIRA, F. R. S. ; LOPES-RAMOS, C. M. ; ROSA, M. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . White and grey matter abnormalities in patients with SPG11 mutations. Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry , v. 1, p. 1-1, 2012.
Pinto, S ; Sato, VN ; Souza, EA ; Ferraz, RC ; Camara, H ; Pinca, APF ; Mazzotti, DR ; Lovci, MT ; LOPES-RAMOS, CM ; Parmigiani, RB ; Massirer, KB ; Mori, M . Enoxacin extends lifespan in c. elegans by inhibiting miR-34-5p and mimicking dietary restriction. In: Cell Symposia: Aging and Metabolism, 2016, Sitges, Espanha. Abstract book, 2016.
Koyama, FC ; LOPES-RAMOS, CM ; Habr-Gama, A ; ALVES, V. A. F. ; Perez, R ; Camargo, AA . Implications of Akt inhibition for neoadjuvant radiotherapy: improving the rectal cancer treatment. In: 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, 2016, New Orleans, LA, EUA. Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, 2016. v. 76. p. Abstract nr 391.
LOPES-RAMOS, CM ; Habr-Gama, A ; Quevedo, B ; Felício, N ; Bettoni, F. ; Koyama, FC ; Asprino, P ; Gama-Rodrigues, J ; Galante, PAF ; Camargo, AA ; Perez, R ; Parmigiani, RB . Global miRNA expression study to predict complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. In: Challenges and Solutions in Cancer Research and Treatment, 2014, Rio de Janeiro. Abstract Book, 2014.
LOPES-RAMOS, CM ; Habr-Gama, A ; Quevedo, B ; Felício, N ; Koyama, FC ; Asprino, P ; Galante, PAF ; Gama-Rodrigues, J ; Camargo, AA ; Perez, R ; Parmigiani, RB . miR-21-5p as a predictive marker for complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. In: Advanced Topics in Genomics and Cell Biology Translational Genomics, 2014, Campinas. Abstract Book, 2014.
LOPES-RAMOS, C. M. ; Parmigiani, RB ; Perez, R ; Habr-Gama, A ; Gama-Rodrigues, J ; Quevedo, B ; Bettoni, F. ; Koyama, FC ; Felício, N ; Camargo, AA . Prediction of complete tumor regression of rectal cancer after neoadjuvant CRT by miRNA expression of miR-21-5p that targets a multidrug resistance gene. In: American Society of Colon and Rectal Surgeons Annual Scientific Meeting, 2014, Florida. Diseases of the colon & rectum, 2014. v. 57. p. E295.
Koyama, FC ; LOPES-RAMOS, CM ; Salim, ACM ; Asprino, P ; Bettoni, F. ; Felício, N ; Quevedo, B ; Perez, R ; Gama-Rodrigues, J ; Habr-Gama, A ; Parmigiani, RB ; Galante, PAF ; Camargo, AA . Neoadjuvant treatment in rectal cancer: Differentially expressed genes and altered pathways associated with chemoradiotherapy resistance. In: Challenges and Solutions in Cancer Research and Treatment, 2014, Rio de Janeiro. Abstract book, 2014.
Doimo, NTS ; LOPES-RAMOS, C. M. ; Rozanski, A ; Reis, L ; Parmigiani, RB . Evaluation of histone modifications profile in colorectal tumor cell lines with different patterns of DNA methylation. In: 19th World Congress on Advances in Oncology and 17th International Symposium on Molecular Medicine, 2014, Atenas, Grécia. Abstract Book, 2014.
Marçola, M ; LOPES-RAMOS, CM ; Parmigiani, RB ; Camargo, AA ; Markus, RP . Circadian variation of microRNA expression profile in CD133 progenitor cells according to environmental lighting. In: XVII Meeting of the Brazilian Society for Cell Biology, 2014, Foz do Iguaçu. Abstract Book, 2014. v. XVII.
LOPES-RAMOS, CM ; França, G ; Perez, R ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Predicting response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer using miRNA expression analysis. In: Cancer Biology & Therapeutics, 2013, Cold Spring Harbor, NY. Abstract book, 2013. p. 102.
LOPES-RAMOS, C. M. ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Large scale identification of alternative polyadenylation through next generation sequencing. In: 63rd Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2013, Boston. Abstract book, 2013. p. 142-142.
Rozenchan, PB ; Carvalho, CV ; Gonçalves, GA ; Invitti, AL ; Parreira, RM ; LOPES-RAMOS, C. M. ; Bettoni, F. ; Parmigiani, RB ; Camargo, AA ; Schor, E ; Silva, IDCG . Using Ultra-Deep miRNA sequencing for identification of possible new biomarkers in endometriosis patients. In: Experimental Biology, 2013, Boston. The FASEB Journal, 2013. v. 27. p. lb152.
Marçola, M ; LOPES-RAMOS, C. M. ; Parmigiani, RB ; Camargo, AA ; Markus, RP . Daily variation of microRNAs expression in endothelial progenitor cells. In: 45th Brazilian Congress on Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2013, Ribeirão Preto. Abstract book, 2013.
França, G ; Andrade, LF ; LOPES-RAMOS, CM ; Mariadason, JM ; Parmigiani, RB ; Camargo, AA ; Galante, PAF . Differentially regulated microRNAs and associations with chemoresistance in colorectal cancer. In: X-Meeting BSB, 2013, Recife. Abstract book, 2013.
Marçola, M ; LOPES-RAMOS, CM ; Parmigiani, RB ; Camargo, AA ; Markus, RP . MicroRNAs profile of endothelial progenitor (CD133+) cells varies according to environmental lighting at the hour of euthanasia. In: American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting, 2013, New Orleans. Abstract Book, 2013.
LOPES-RAMOS, CM ; França, G ; Quevedo, B ; Felício, N ; Asprino, P ; Perez, R ; Habr-Gama, A ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . High-throughput miRNA expression profiling to predict rectal cancer treatment response. In: microRNA 2012: International Symposium, 2012, São Paulo. Abstract book, 2012.
LOPES-RAMOS, CM ; França, G ; Quevedo, B ; Felício, N ; Asprino, P ; Perez, R ; Habr-Gama, A ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Predicting response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer through miRNA expression analysis. In: Regulatory & Non-Coding RNAs meeting, 2012, Cold Spring Harbor, NY, USA. Abstract book, 2012.
LOPES-RAMOS, CM ; França, G ; Quevedo, B ; Felício, N ; Asprino, P ; Perez, R ; Habr-Gama, A ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Predicting Treatment Response of Rectal Cancer Patients through MicroRNA Expression Profile. In: X-Gen Congress & EXP, 2012, San Diego. Abstract book, 2012.
LOPES-RAMOS, CM ; Salim, ACM ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Identification of polyadenylation variants in colon tumor cell lines using a new high throughput aproach. In: Changing Landscape of the Cancer Genome, 2011, Boston. Abstract Book, 2011. p. 98.
LOPES-RAMOS, CM ; Salim, ACM ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Alternative polyadenylation study in colon tumor cell lines by high-throughput sequencing. In: 57o Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia. Abstract Book, 2011. p. 125.
LOPES-RAMOS, CM ; Salim, ACM ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . Identification of polyadenylation variants in colon tumor cell lines using a new high throughput aproach. In: AC Camargo Global Meeting of Translational Science, 2nd São Paulo School of Translational Science, 2011, São Paulo. Abstract Book, 2011. p. 24.
LOPES-RAMOS, CM ; Pereira, T.C. ; Gilioli, R. ; Lopes-Cendes, I. . Lithium reduces cell death in an in vitro model of Machado−Joseph disease. In: American Academy of Neurology 62nd Annual Meeting, 2010, Toronto, Canada. American Academy of Neurology 62nd Annual Meeting, 2010.
LOPES-RAMOS, CM ; Pereira, T.C. ; Lopes-Cendes, I. . Caminhando para um modelo in vitro da doença de Machado Joseph e seu uso na exploração de alternativas terapêuticas. In: 3ª Semana de Pesquisa da FCM, 2009, Campinas. 3ª Semana de Pesquisa da FCM, 2009.
LOPES-RAMOS, CM ; Pereira, T.C. ; Gilioli, R. ; Lopes-Cendes, I. . Construção e avaliação de um modelo in vitro dos efeitos citotóxicos da ataxina-3 expandida. In: IX Encontro da Sociedade Brasileira de Investigação Neurológica (SBIN), 2009, Curitiba. O Dendrito, 2009. p. 16-16.
LOPES-RAMOS, CM ; França Jr., M.C. ; Rosa, M.M. ; Maurer-Morelli, C.V. ; Lopes-Cendes, I. . Low frequency of SPG11 mutation in brazilian patients with hereditary spastic paraplegia with thin corpus callosum. In: IX Encontro da Sociedade Brasileira de Investigação Neurológica (SBIN), 2009, Curitiba. O Dendrito, 2009. p. 16-16.
MARQUES, A. F. R. ; LOPES-RAMOS, CM ; Lopes-Cendes, I. . Construção e avaliação de um modelo in vitro dos efeitos citotóxicos da ataxina-3 expandida. In: XVII Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP, 2009, Campinas. XVII Congresso Interno de Iniciação Científica, UNICAMP, 2009.
LOPES-RAMOS, CM ; Pereira, T.C. ; Gilioli, R. ; Lopes-Cendes, I. . Doença de Machado-Joseph: criação de um modelo in vitro para investigação de alternativas terapêuticas. In: Jornada de Neurociências, 2009, Campinas. Jornada de Neurociências 2009, 2009.
França Jr., M.C. ; LOPES-RAMOS, CM ; Maurer-Morelli, C.V. ; Rosa, M.M. ; D'Abreu, A ; Lopes-Cendes, I. . Hereditary spastic paraplegia with thin corpus callosum (HSP-TCC) is a frequent phenotype in Brazilian patients with hereditary spastic paraplegia. In: The American Society of Human Genetics, 2009, Honolulu, Hawaii. The American Society of Human Genetics, 2009.
LOPES-RAMOS, CM ; Marchesini, R.B. ; Pascoal, V.D.B. ; Lopes-Cendes, I. . Análise de expressão do gene TRKB no modelo animal de epilepsia do lobo temporal induzido pela pilocarpina. In: XVI Congresso interno de iniciação científica da UNICAMP, 2008, Campinas. XVI Congresso interno de iniciação científica da UNICAMP, 2008.
LOPES-RAMOS, CM ; Pascoal, V.D.B. ; Marchesini, R.B. ; Lopes-Cendes, I. . SELEÇÃO DE SEQÜÊNCIAS-ALVO IDEAIS PARA CONFECÇÃO DE siRNA DIRECIONADAS AO GENE INTERLEUCINA 1 BETA EM RATOS WISTARS.. In: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. Resumos do 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007. p. 218-218.
LOPES-RAMOS, CM ; Lopes-Cendes, I. . Desenhos de moléculas de siRNA contra o gene BDNF em ratos WISTARS. In: XV Congresso Interno de Iniciação Científica da UNICAMP, 2007, Campinas. Congresso Interno de Iniciação Científica, 2007. v. 15. p. 37-38.
CARLOS, C. ; Grassi, M.C.B. ; LOPES-RAMOS, CM ; ROCHA, G.Z. ; TERRA, T.N. ; Rapp, I. ; LIMA, E.C.T. ; SILVA, ; Yunes, JA ; NOWILL, A.E. ; ARRUDA, P. . IDENTIFICAÇÃO DE cDNAs DIFERENCIALMENTE EXPRESSOS EM CÉLULAS DO BLASTEMA DO MEMBRO ANTERIOR DE TRITURUS CRISTATUS. In: 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. 52º Congresso Brasileiro de Genética, 2006.
TERRA, T.N. ; Dinato, D.O. ; LOPES-RAMOS, CM ; Trevizan, G. ; Grassi, M.C.B. ; Duarte, M.M. ; Souza, A.A.R. ; Andrea, G.D. ; Maciera, F.M. ; Gallembeck, E. . Detecção Enzimática de Pesticidas Organofosforados em Tomates. In: VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2005, Campinas. Caderno de Resumos - VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2005. p. 158.
Pires, M.M. ; Trevizan, G. ; LOPES-RAMOS, CM ; TERRA, T.N. ; Maturana, V.G. ; Grassi, M.C.B. ; Freitas, A.V.L. . Estudo Faunístico em Bromélias na Mata Dura, Ubatuba, SP. In: VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2005, Campinas. Caderno de Resumos - VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2005. p. 118-118.
LOPES-RAMOS, CM . Sexual dimorphism in colon cancer revealed by gene regulatory networks. Cancer Biology Seminar, Dana-Farber Cancer Institute. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, CM . Regulatory network changes between cell lines and their tissues of origin. Genomics Get Together, Dana-Farber Cancer Institute. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, CM . Using gene regulatory networks to understand sex diferences. Program in Quantitative Genomics Working Group Series, Harvard T.H. Chan School of Public Health. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, CM . Transcriptional landscape of cell lines and their tissues of origin. Channing Division of Network Medicine Statistical Genetics and Networks Science Meeting, Brigham and Women?s Hospital. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, C. M. . Predicting response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer through global miRNA expression study. X Summer Course for Bioinformatics - Introduction to R and Bioconductor. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LOPES-RAMOS, C. M. . Global miRNA expression study to predict complete tumor regression to neoadjuvant chemoradiotherapy in rectal cancer patients. Challenges and Solutions in Cancer Research and Treatment. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LOPES-RAMOS, CM . miRNAs como marcadores preditivos de resposta ao tratamento do câncer de reto. Tópicos Especiais de Genética - Mecanismos de Regulação da Expressão Gênica. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, CM . Predição de resposta ao tratamento com radio e quimioterapia neoadjuvante em pacientes com câncer de reto através do perfil de expressão de microRNAs. Instituto Sírio-Libanês de Ensino e Pesquisa. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
LOPES-RAMOS, CM ; França, G ; Perez, R ; Habr-Gama, A ; Camargo, AA ; Galante, PAF ; Parmigiani, RB . miR-21 as a biomarker to predict response to neoadjuvant therapy in patients with rectal cancer. Next Frontiers to Cure Cancer - Integrating Science and Patient Care. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LOPES-RAMOS, CM ; Pereira, T.C. ; Gilioli, R. ; Lopes-Cendes, I. . Construção e avaliação de um modelo in vitro dos efeitos citotóxicos da ataxina-3 expandida. IX Encontro da Sociedade Brasileira de Investigação Neurológica. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
LOPES-RAMOS, CM ; França Jr., M.C. ; Rosa, M.M. ; Maurer-Morelli, C.V. ; Lopes-Cendes, I. . Low frequency of SPG11 mutation in brazilian patientswith hereditary spastic paraplegia with thin corpus callosum. IX Encontro da Sociedade Brasileira de Investigação Neurológica. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

PAULSON, J. ; CHEN, C. ; LOPES-RAMOS, CM ; KUIJJER, M. L. ; PLATIG, J. ; SONAWANE, A. R. ; FAGNY, M. ; GLASS, K. ; QUACKENBUSH, J. . YARN: Robust Multi-Condition RNA-Seq Preprocessing and Normalization. 2016.

LOPES-RAMOS, C. M. . microRNA e Câncer - IX Simpósio de Biomedicina - UNICID. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

LOPES-RAMOS, CM . miRNA e câncer - Curso Biologia Molecular do Câncer - Instituto Sírio-Libanês de Ensino e Pesquisa. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

LOPES-RAMOS, CM . Genética Humana - III Encontro de Ciências da Vida - UNESP. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

LOPES-RAMOS, CM . Avaliação de painéis no IX CAEB. 2009. (Avaliação de painéis).

Projetos de pesquisa

2016 - Atual

SPORE in gastrointestinal cancer: genomics and bioinformatics core, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Integrante / John Quackenbush - Coordenador.
2015 - 2016

Identificação de uma assinatura de expressão gênica preditiva para o câncer colorretal através da análise combinada de dados públicos de expressão gênica, Descrição: Os fatores clinicopatológicos utilizados hoje para o câncer colorretal ainda são insuficientes para identificar os pacientes de estádio II com alto risco de recorrência, bem como os pacientes de estádio III com baixo risco, ocorrendo um sub ou super tratamento dos mesmos. Sendo assim, o estudo do perfil global de expressão gênica poderia auxiliar no prognóstico e predição à resposta terapêutica desses pacientes. Atualmente, o maior desafio não depende dessa aquisição de dados genômicos, mas, principalmente, da sua interpretação e tradução para a prática clínica. Considerando o grande número de informações genômicas disponíveis hoje, as meta-análises representam um enorme potencial para melhorar a coleta e interpretação desses dados. O objetivo deste projeto é identificar uma assinatura de expressão gênica capaz de predizer a resposta ao tratamento adjuvante para o câncer colorretal através da análise combinada de dados públicos de expressão gênica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Coordenador / John Quackenbush - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2013 - 2015

Identificação de mutações somáticas em genes de miRNAs em amostras de tumor colorretal através de sequenciamento em larga escala, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raphael Bessa Parmigiani em 06/03/2015., Descrição: O presente trabalho tem como objetivo avaliar a ocorrência de mutações somáticas em genes de miRNA em amostras de tumor colorretal, através do sequenciamento em larga escala. Os dados de sequenciamento serão analisados e comparados com o banco de dados de genes de miRNA (miRBase) e, quando necessário, com dados de amostras de cólon sadio dos mesmos indivíduos, para descartar a ocorrência de possíveis SNPs. Finalmente, se mutações forem encontradas, será analisado o impacto das mesmas na expressão dos miRNAs mutados. Além de auxiliar no melhor entendimento da biologia tumoral, a identificação destas alterações certamente poderá revelar futuros alvos de terapias mais específicas e eficazes no tratamento da doença.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Integrante / Raphael Parmigiani - Coordenador / Rodrigo Perez - Integrante / Fernanda Koyama - Integrante / Bruna Paes de Barros - Integrante / Nayara Trevisan dos Santos Doimo - Integrante.
2013 - 2015

Caracterização do perfil epigenético global de linhagens celulares de tumor colorretal, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raphael Bessa Parmigiani em 06/03/2015., Descrição: A recente caracterização do fenótipo metilador de ilhas CpG (CIMP, do inglês CpG island methylator phenotype), identificado em 20 a 30 % das amostras de câncer colorretal, confirma o importante papel desempenhado por mecanismos epigenéticos na patogênese deste tipo de tumor. Este fenótipo é caracterizado pela frequente hipermetilação de diferentes regiões do genoma de maneira tumor específica, e está associado a características clinicopatológicas do tumor. Considerando-se que modificações epigenéticas são moduladas coordenadamente, é razoável especular que além da metilação do DNA, os tumores que possuem este fenótipo também apresentem outras alterações epigenéticas singulares (modificações de histonas e expressão de microRNAs), as quais podem ter envolvimento com a biologia e evolução do tumor. O presente trabalho pretende caracterizar o perfil epigenético global de linhagens celulares de tumor colorretal. Para tanto, serão estudadas tanto linhagens celulares nas quais o perfil CIMP está presente quanto linhagens onde o mesmo está ausente. Com o auxílio de técnicas de análise global, baseadas no sequenciamento em larga escala, serão estudadas a metilação do DNA, modificações de histonas e expressão de microRNAs. Juntamente com dados de transcriptoma que estão sendo gerados a partir destas mesmas linhagens celulares, espera-se que esta completa caracterização epigenética melhore o entendimento sobre as alterações moleculares desta patologia e consequentemente, no futuro, possa auxiliar na escolha do tratamento mais adequado para os pacientes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Integrante / Raphael Parmigiani - Coordenador / Bruna Paes de Barros - Integrante / Nayara Trevisan dos Santos Doimo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Associação do perfil de expressão de microRNAs com a resposta a diferentes agentes terapêuticos em linhagens celulares de tumor de cólon, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raphael Bessa Parmigiani em 10/01/2013., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Integrante / Anamaria Camargo - Integrante / Pedro Galante - Integrante / Raphael Parmigiani - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - 2012

Identificação e estudo de expressão de variantes de poliadenilação e de microRNAs através de sequenciamento em larga escala, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raphael Bessa Parmigiani em 10/01/2013., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Camila Miranda Lopes Ramos - Integrante / Anamaria Camargo - Integrante / Pedro Galante - Integrante / Raphael Parmigiani - Coordenador / Sandro José de Souza - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

Prêmios

2016

Travel award, Transatlantic Data Science Workshop, National Institutes of Health, USA.

2014

Travel award, X Summer Course Bioinformatics ? R and Bioconductor, Universidade Estadual de São Paulo.

Histórico profissional

Endereço profissional

Harvard School of Public Health. , 450 Brookline Ave, Boston, Boston, - Estados Unidos, Telefone: (617) 5829054

Experiência profissional

2015 - Atual

Harvard School Of Public Health

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2014 - 2015

Hospital Sirio-Libanes

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2011 - 2014

Hospital Sirio-Libanes

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2010 - 2014

Fundação Antônio Prudente

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2008 - 2010

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2007 - 2008

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica

Atividades

10/2005 - 06/2006
Estágios , Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP, Departamento de Genética Médica da FCM/UNICAMP.,Estágio realizado, Interferência por RNA - desenho de moléculas siRNA..

2006 - 2007

Université de Franche-Comté

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Intercâmbio acadêmico

Outras informações:
Cursou 2 disciplinas do terceiro ano de Ciências Biológicas: Metodologia em Biologia Molecular (58 horas) e Técnicas para pesquisas bibliográficas (18 horas).

Atividades

07/2006 - 02/2007
Estágios , UFR Sciences et Techniques, Laboratório de Bioquímica e Biologia Molecular.,Estágio realizado, Estabelecimento e caracterização de culturas de células estáveis, expressando o gene QSOX que está envolvido na regulação do estado oxidativo de proteínas..