Rafael Chacon Ruiz Martinez

Pós-doutorado

Formação complementar

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Orientou

Produções bibliográficas

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• MARTINEZ, R. C. R. ; GIL, N. F. ; FRANCESCHINI, S. A. ; NUNES, A. C. ; MOREIRA, J. L. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Phenotypical versus molecular identification of lactobacilli isolated from vaginal microbiota of healthy women. In: 2º Simpósio Internacional de Pós-Graduação e Pesquisa da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP, 2006, Ribeirão Preto. 2º Simpósio Internacional de Pós-Graduação e Pesquisa da FCFRP - USP, 2006. p. Res. BC 009.

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• MARTINEZ, R. C. R. ; RATTI, R. P. ; MACIEL, V. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Efeito da adição de sacarose na formação de biofilme por Listeria monocytogenes em co-cultura com Leuconostoc mesenteroides produtor e não produtor de bacteriocina. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia (XXIII CBM), 2005, Santos. XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia (XXIII CBM), 2005. p. Res. 18/152-1.

• MACIEL, V. ; MARTINEZ, R. C. R. ; RATTI, R. P. ; ESTEVES, C. T. ; ALVES, V. F. ; DESTRO, M. T. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Quantificação de Listeria sp. em amostras de surubim: matéria-prima e produto processado. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia (XXIII CBM), 2005, Santos. XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia (XXIII CBM), 2005. p. Res. 15/218-1.

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• RATTI, R. P. ; MARTINEZ, R. C. R. ; MACIEL, V. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Formação de biofilme por Listeria monocytogenes em corpos de prova imersos em preparações contendo bacteriocina de Leuconostoc mesenteroides. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005, Santos. XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005. p. Res. 18/110-2.

• MARTINEZ, R. C. R. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Lactobacillus sakei 1 semi-purified bacteriocin did not interfer with haemolytic activity of Listeria monocytogenes 1/2a. In: 1º Simpósio Internacional de Pós-Graduação e Pesquisa da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP (1º SINPOSPq), 2004, Ribeirão Preto. 1º Simpósio Internacional de Pós-Graduação e Pesquisa da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP (1º SINPOSPq), 2004. p. Res. PAC 15.

• MARTINEZ, R. C. R. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Efeito da bacteriocina de Lactobacillus sakei 1 na multiplicação de Listeria monocytogenes 1/2a. In: III Simpósio Internacional de Inocuidade de Alimentos (ABRAPA) e VIII Simpósio Brasileiro de Microbiologia de Alimentos (SBM), 2004, São Paulo. A inocuidade dos alimentos: da produção primária ao consumidor. p. 23-23.

• MARTINEZ, R. C. R. ; ALVES, V. F. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Multiplicação e atividade hemolítica de Listeria monocytogenes 1/2a na presença de bactérias láticas (BAL) e bacteriocina. In: 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2004, Ribeirão Preto. 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2004.

• MARTINEZ, R. C. R. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Comportamento de Listeria monocytogenes frente à bacteriocina de Leuconostoc mesenteroides 11. In: XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003, Florianópolis. XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia (XXII CBM), 2003. p. Res. MAL 082.

• MARTINEZ, R. C. R. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Antilisterial activity of a crude bacteriocin preparation of Lactobacillus sakei 1. In: IV Congresso Internacional de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, 2003, Ribeirão Preto. Revista Brasileira de Ciências Farmacêuticas, 2003. v. 39. p. 65-65.

• MARTINEZ, R. C. R. ; ALVES, V. F. ; DE MARTINIS, E. C. P. . Atividade antilisterial de cultura e preparação bruta de bacteriocina de Lactobacillus sakei 1. In: 11º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2003, Ribeirão Preto. 11º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2003.

• SOARES, M. B. ; LOLLO, P. C. B. ; MARTINEZ, R. C. R. ; Sant?Ana, A. S. . Avaliação de proteínas do sistema de estresse, HSPs, em ratos alimentados com requeijão cremoso adicionado de esporos de Bacillus probióticos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SOARES, M. B. ; MARTINEZ, RAFAEL C. R. ; SILVA, B. S. ; SANT᾿ . Survival of probiotic lactic acid bacteria and Bacillus spores in orange juice and creamy curd cheese through simulated gastrointestinal tract conditions. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2014 - 2016

  Avaliação da eficácia da utilização de nisina comercial e microencapsulada no controle da multiplicação de micro-organismos patogênicos, esporulado e não esporulado, em leite desnatado e integral, Descrição: As bacteriocinas, peptídeos antimicrobianos sintetizados no ribossomo por diferentes gêneros de micro-organismos, em especial por bactérias láticas (BAL), constituem uma alternativa promissora para o controle da multiplicação de micro-organismos deteriorantes e patogênicos em alimentos, um processo conhecido como bioconservação. Nisina, produzida por algumas linhagens de Lactococcus lactis subsp. lactis é, no mundo, a bacteriocina comercialmente mais importante, sendo aprovada para uso em alimentos pelo órgão norte-americano ?Food and Drug Administration? (FDA) (Administração de Drogas e Alimentos) e pela Organização Mundial da Saúde desde o ano de 1969. Contudo, já existem diversos relatos na literatura científica sobre a seleção de micro-organismos resistentes à ação da nisina. A técnica de microencapsulação de bacteriocinas é bastante promissora porque é capaz de permitir a liberação controlada de peptídeos antimicrobianos, prevenir possíveis interações prejudiciais com componentes alimentares e manter sua atividade biológica. Este projeto tem como objetivo avaliar a eficácia da utilização de nisina comercial e microencapsulada, testadas isoladamente e combinadas, para o controle da multiplicação de microrganismos patogênicos em leite desnatado e integral, durante o período de armazenamento sob refrigeração. Inicialmente, a nisina será microencapsulada com goma arábica (ambas avaliadas em diferentes proporções) através do emprego da técnica de spray drying. A influência do processo de microencapsulação na atividade antimicrobiana de nisina será determinada por meio da realização do teste de antagonismo em ágar frente a patógenos esporulado (Bacillus cereus IAL 55) e não esporulado (Listeria monocytogenes ATCC 7644) (individualmente). Numa etapa posterior, leite desnatado e integral serão adicionados de nisina comercial (Tratamento 1), nisina microencapsulada (Tratamento 2) e nisina comercial combinada com nisina encapsulada (Tratamento 3) e como controle negativo, nenhum agente antimicrobiano será adicionado ao produto alimentício. A seguir, amostras de leite serão desafiadas com B. cereus IAL 55 e L. monocytogenes ATCC 7644 (individualmente) e mantidas a 6 ± 1 ºC durante 15 dias. As populações dos patógenos e dos microrganismos deteriorantes (BAL, bolores e leveduras) serão determinadas no alimento em intervalos regulares de tempo (3 dias) através da utilização de metodologia tradicional - semeadura em meios de cultura seletivos e/ou diferenciais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Marcelo Thomazini - Integrante / Anderson de Souza Sant?Ana - Coordenador / Verônica Ortiz Alvarenga - Integrante / Carmen Silvia Fávaro-Trindade - Integrante., Número de produções C, T & A: 5

• 2011 - 2014

  Abordagem bioquímico-molecular para avaliação da bacteriocinogênese e do controle de Listeria monocytogenes por Lactobacillus sakei 2a em um produto lácteo simbiótico potencialmente funcional, Descrição: Bactérias láticas (BAL) produtoras de bacteriocinas são uma alternativa interessante para o controle da multiplicação de microrganismos deteriorantes e patogênicos em alimentos. BAL são também importantes porque algumas cepas apresentam efeito probiótico, ou seja, quando presentes em alimentos (alimentos funcionais) podem melhorar a saúde e o bem-estar do consumidor. Produtos lácteos, em especial queijos, devido às suas características físico-químicas, são veículos apropriados para cepas probióticas. Este projeto teve como finalidade avaliar a capacidade de uma cepa de BAL (Lactobacillus sakei subsp. sakei 2a), isolada de alimentos no Laboratório de Microbiologia de Alimentos da FCF-USP, e que apresenta potencial probiótico demonstrado em pesquisas anteriores, produzir bacteriocina em um produto lácteo simbiótico potencialmente funcional desenvolvido no Laboratório de Tecnologia de Alimentos da FCF/USP, cuja formulação-base é o queijo quark, durante armazenamento em temperatura de refrigeração (4ºC) e de abuso de refrigeração (15ºC) por 28 dias. A atividade antimicrobiana foi monitorada empregando-se Listeria monocytogenes como bactéria-alvo, que é uma bactéria patogênica ubíqua, psicrotrófica, a qual apresenta elevada taxa de fatalidade em pacientes de grupos de risco e é frequente contaminante de queijos. Essa avaliação foi realizada através de análise fenotípica e também de expressão gênica pela técnica de RT-qPCR. A determinação do seu efeito no controle da multiplicação de L. monocytogenes (sorotipos 4b e 1/2a) foi realizada por meio de teste de desafio no produto. Para o estudo da viabilidade das BAL produtora e não produtora de bacteriocinas (Lactobacillus sakei ATCC 15521) no referido produto, foram empregadas, além do método tradicional cultivo-dependente (semeadura em meios de cultura seletivos), técnica molecular cultivo-independentes (qPCR). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Susana Marta Isay Saad - Integrante / Bernadette Dora Gombossy de Melo Franco - Coordenador / Svetoslav Dimitrov Todorov - Integrante / Cristina Dini Staliano - Integrante / Antonio Diogo Silva Vieira - Integrante / Martha Lissete Villarreal Morales - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8

• 2010 - 2011

  Culturas láticas bacteriocinogênicas na bioconservação de alimentos: ciência, inovação e aplicação tecnológica, Descrição: Projeto de Pós-Doutorado (PNPD CAPES 2009): As bactérias láticas (BAL) têm diversas aplicações na indústria de alimentos. Além da sua utilização como culturas starters em alimentos fermentados, podem produzir uma grande variedade de compostos de aplicação tecnológica, como os peptídeos antimicrobianos, denominados bacteriocinas. Por serem produzidas por microrganismos naturalmente presentes nos alimentos, as bacteriocinas representam uma alternativa tecnológica para o uso de aditivos artificiais, permitindo a oferta de novos alimentos de grande aceitação pelo consumidor. Avanços recentes no estudo das bacteriocinas das BAL permitiram um grande desenvolvimento no conhecimento de vários aspectos relativos à estrutura, mecanismos de ação, fatores genéticos envolvidos na produção, imunidade e regulação da bacteriocinogênese e potencial de aplicação em alimentos. O projeto de pesquisa proposto para o Programa Nacional de Pós-Doutorado tem como objetivos promover a geração de novos conhecimentos e inovação na área de bioconservação de alimentos através do uso de BAL bacteriocinogênicas, através do desenvolvimento dos seguintes tópicos: Triagem de BAL produtoras de bacteriocinas em diferentes tipos de alimentos e caracterização das cepas isoladas, através de técnicas fenotípicas e genotípicas; caracterização in vitro das bacteriocinas produzidas; otimização das condições para a bacteriocinogênese; purificação das bacteriocinas e identificação através de técnicas convencionais e nãoconvencionais; genômica da bacteriocinogênese e sua regulação; avaliação da atividade in situ das bactérias láticas bacteriocinogênicas e das bacteriocinas purificadas em diferentes matrizes alimentares, em diferentes condições experimentais e avaliação da atividade in situ em diferentes matrizes alimentares, quando combinadas com outros obstáculos antimicrobianos (hurdle technology). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Bernadette Dora Gombossy de Melo Franco - Coordenador / Svetoslav Dimitrov Todorov - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4

• 2009 - 2010

  Avaliação in vitro da sobrevivência gastrintestinal de Lactobacillus sobrius, isoladamente e na presença de Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bb12 e GOS e seu impacto na microbiota do cólon, Descrição: Projeto de cooperação internacional vinculado ao Projeto CAPES-Wageningen nº 17/07. (Bolsa de Pós-Doutorado CAPES - Processo nº 4252/08-0): este projeto visou elucidar a capacidade in vitro de Lactobacillus sobrius DSMZ 16698, um microrganismo com potencial probiótico isolado a partir do trato gastrintestinal (TGI) de leitões não desmamados, em sobreviver à passagem pelas porções superiores do TGI e modular a microbiota do cólon (de origem humana e suína). Para tanto, L. sobrius foi avaliado isoladamente e na presença de prebiótico galactooligossacarídeo (GOS) e/ou probiótico Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bb-12, utilizando-se os sistemas in vitro TIM-1 e TIM-2. Estes dispositivos in vitro são totalmente computadorizados e simulam parâmetros microbiológicos, enzimático-bioquímicos e demais condições encontradas in vivo no trato gastrintestinal superior (TIM-1) e inferior (TIM-2). As taxas de sobrevivência de L. sobrius no sistema TIM-1 foram determinadas em intervalos regulares de 1h (0 a 6h) através da semeadura das amostras obtidas a partir do modelo in vitro na superfície de placas contendo meio de cultura seletivo e avaliação das colônias que se desenvolveram através da técnica de RAPD (Random Amplification of Polimorphic DNA). O impacto de L. sobrius (introduzido isoladamente e na presença de pre- e/ou probiótico) na microbiota presente no dispositivo TIM-2 foi determinado através da utilização de diversas técnicas de biologia molecular, incluindo PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction Denaturing Gradient Gel Electrophoresis), qPCR (Quantitative PCR) e ensaios de microarranjos de DNA [HIT (Human intestinal tract) e PIT (Pig intestinal tract) Chips]. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Elaine Cristina Pereira De Martinis - Integrante / Erwin Zoetendal - Integrante / Koen Venema - Integrante / Azz-Eddine Aynaou - Integrante / Susana Marta Isay Saad - Coordenador / Hauke Smidt - Integrante / Henk Schols - Integrante / Simone Albrecht - Integrante / Wendy S. Borst - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4

• 2005 - 2008

  Efeito da utilização de culturas láticas probióticas na microbiota vaginal de pacientes acometidas por infecções bacterianas e fúngicas, Descrição: Projeto de Doutorado Direto (Bolsa de Estudo e Auxílio Pesquisa - Processos Fapesp n° 04/14580-0 e 06/06595-2, respectivamente): Juntas, candidíase vulvovaginal (CVV), vaginose bacteriana (VB) e infecções do trato urinário (ITU), acometem 1 bilhão de mulheres no mundo anualmente. A utilização dos probióticos Lactobacillus rhamnosus GR-1 e Lactobacillus reuteri RC-14, representa uma alternativa terapêutica promissora na abordagem dessas patologias. 64 mulheres saudáveis, 68 diagnosticadas com CVV e 64 diagnosticadas com VB foram atendidas por médicos ginecologistas de centros de saúde ligados à USP (campus de Ribeirão Preto) e 2 amostras vaginais de cada paciente foram coletadas com o auxílio de swabs esterilizados. Um swab foi utilizado para semeadura em ágar MRS, os isolados de bactérias láticas obtidos foram identificados com a técnica de PCR-ARDRA e a habilidade de Lactobacillus spp. produzir H2O2 foi determinada. O outro swab foi usado para a análise das espécies de lactobacilos pela técnica de PCR-DGGE. As leveduras do gênero Candida foram obtidas através da semeadura das amostras vaginais no meio Chromagar® Candida e identificadas com provas bioquímicas. As pacientes diagnosticadas com CVV participaram de um estudo randomizado, duplo-cego, placebo-controlado (DCPC) e foram tratadas com dose única de fluconazol (150mg) e suplementação diária por 28 dias com (i) duas cápsulas contendo L. rhamnosus GR-1 e L. reuteri RC-14 (Urex-Cap-5®) ou (ii) duas cápsulas de placebo. As pacientes com VB participaram de um estudo randomizado, DCPC e foram tratadas com dose única de tinidazol (2g) e suplementação diária com cápsulas do probiótico (Urex-Cap-5®) ou placebo, conforme descrito acima. Todas as pacientes foram reavaliadas no 28º dia de tratamento. Também foram realizados experimentos para averiguar o efeito de L. rhamnosus GR-1 e L. reuteri RC-1 na modulação in vitro da infecção por Candida albicans em culturas de células epiteliais vaginais humanas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Elaine Cristina Pereira De Martinis - Coordenador / Natalia Ferreira Gil - Integrante / Sílvio Antônio Franceschini - Integrante / Regina Celia Candido - Integrante / Álvaro Cantini Nunes - Integrante / Gregor Reid - Integrante / Silvana Maria Quintana - Integrante / Maristela Carbol Patta - Integrante / Kingsley Chidozie Anukan - Integrante / Kelly L Summers - Integrante / Auro Nomizo - Integrante / Shannon Mifflin - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 19

• 2003 - 2004

  Avaliação da atividade hemolítica de Listeria monocytogenes sorotipos 4b e 1/2a inoculadas em preparação bruta de bacteriocina de Lactobacillus sakei 1, Descrição: Projeto de Iniciação Científica (Renovação da Bolsa de Estudo - Processo Fapesp nº 02/05672-2): Listeria monocytogenes é um microrganismo psicrotrófico, ubíquo e patogênico, podendo causar graves problemas de saúde ou mesmo levar à morte indivíduos imunocomprometidos e recém-nascidos. Todas as linhagens virulentas de L. monocytogenes são produtoras da hemolisina listeriolisina (LLO), apesar de nem todas as linhagens LLO positivas serem patogênicas. Acredita-se que a principal rota de transmissão de L. monocytogenes seja a ingestão de alimentos contaminados. Portanto, há necessidade de implementação de medidas para que o patógeno não se desenvolva e seja veiculado por alimentos. Uma tecnologia em potencial envolve a utilização de bioconservadores para inibir L. monocytogenes, por exemplo: cultura de bactérias láticas (BAL) e/ou seus peptídeos antimicrobianos. Neste trabalho avaliou-se a capacidade hemolítica de dois sorotipos de L. monocytogenes (4b e 1/2a) cultivadas separadamente a 8ºC, cultivadas por dez dias, em preparação bruta de bacteriocina de Lactobacillus sakei 1. Determinou-se também o título da bacteriocina na preparação bruta após o período de incubação. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Elaine Cristina Pereira De Martinis - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 14

• 2002 - 2003

  Avaliação da atividade antilisterial de preparações brutas de bacteriocinas de bactérias láticas, Descrição: Projeto de Iniciação Científica (Bolsa de Estudo - Processo Fapesp n° 02/05672-2): As bactérias láticas (LAB) incluem um grupo de microrganismos com diversas aplicações industriais que podem tanto interferir com o crescimento de bactérias responsáveis pela deterioraçào de alimentos como aquelas que se mostram patogênicas ao homem. Tal interferência pode ocorrer de diversas formas, por exemplo através da produção de peptídeos antimicrobianos denominados bacteriocinas. No presente trabalho avaliaram-se duas cepas de BAL produtoras de bacteriocinas (Lactobacillus sakei 1 e Leuconostoc mesenteroides 11) quanto à atividade antilisterial de preparações brutas. A inibição de Listeria monocytogenes foi avaliada em condições de refrigeração (8ºC) e de abuso de temperatura (15ºC), por meio da determinação da população desses microrganismos nos tempos 0, 5 e 10 dias, acompanhando-se também a estabilidade da bacteriocina produzida. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Rafael Chacon Ruiz Martinez - Integrante / Elaine Cristina Pereira De Martinis - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4

Prêmios