Doumit Camilios Neto

Pós-doutorado

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Produções bibliográficas

• BORGHI, SERGIO M. ; MIZOKAMI, SANDRA S. ; CARVALHO, THACYANA T. ; RASQUEL-OLIVEIRA, FERNANDA S. ; FERRAZ, CAMILA R. ; FATTORI, VICTOR ; HAYASHIDA, THIAGO H. ; PERON, JEAN P.S. ; Camilios-Neto, Doumit ; AMBROSIO, SERGIO R. ; ARAKAWA, NILTON S. ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . The diterpene from Sphagneticola trilobata (L.) Pruski, kaurenoic acid, reduces lipopolysaccharide-induced peritonitis and pain in mice. JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY , v. 273, p. 113980, 2021.

• BORGHI, SERGIO M. ; DOMICIANO, TALITA P. ; RASQUEL-OLIVEIRA, FERNANDA S. ; FERRAZ, CAMILA R. ; BUSSMANN, ALLAN J.C. ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; AMBRÓSIO, SERGIO R. ; ARAKAWA, NILTON S. ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . Sphagneticola trilobata (L.) Pruski-derived kaurenoic acid prevents ovalbumin-induced asthma in mice: Effect on Th2 cytokines, STAT6/GATA-3 signaling, NFB/Nrf2 redox sensitive pathways, and regulatory T cell phenotype markers. JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY , v. 283, p. 114708, 2021.

• CONCEIÇÃO, KAREN STEFANY ; DE ALENCAR ALMEIDA, MAYARA ; SAWONIUK, ISADORA CAROLINE ; MARQUES, GABRIELA DORNELAS ; DE SOUSA FARIA-TISCHER, PAULA CRISTINA ; TISCHER, CESAR AUGUSTO ; VIGNOLI, JOSIANE ALESSANDRA ; Camilios-Neto, Doumit . Rhamnolipid production by Pseudomonas aeruginosa grown on membranes of bacterial cellulose supplemented with corn bran water extract. Environmental Science and Pollution Research , v. 27, p. 30222-30231, 2020.

• BUSSMANN, ALLAN J. C. ; BORGHI, SERGIO M. ; ZANINELLI, TIAGO H. ; DOS SANTOS, TELMA S. ; GUAZELLI, CARLA F. S. ; FATTORI, VICTOR ; DOMICIANO, TALITA P. ; PINHO-RIBEIRO, FELIPE A. ; RUIZ-MIYAZAWA, KENJI W. ; CASELLA, ANTONIO M. B. ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . The citrus flavanone naringenin attenuates zymosan-induced mouse joint inflammation: induction of Nrf2 expression in recruited CD45+ hematopoietic cells. INFLAMMOPHARMACOLOGY , v. 27, p. 1229-1242, 2019.

• CEZAR, TALITA L. C. ; MARTINEZ, RENATA M. ; ROCHA, CAMILA DA ; MELO, CRISTINA P. B. ; VALE, DAVID L. ; BORGHI, SERGIO M. ; FATTORI, VICTOR ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; BARACAT, MARCELA M. ; GEORGETTI, SANDRA R. ; VERRI, WALDICEU A. ; CASAGRANDE, RUBIA . Treatment with maresin 1, a docosahexaenoic acid-derived pro-resolution lipid, protects skin from inflammation and oxidative stress caused by UVB irradiation. Scientific Reports , v. 9, p. 9(1):3062, 2019.

• CARVALHO, THACYANA T. ; MIZOKAMI, SANDRA S. ; FERRAZ, CAMILA R. ; MANCHOPE, MARÍLIA F. ; BORGHI, SERGIO M. ; FATTORI, VICTOR ; CALIXTO-CAMPOS, CASSIA ; Camilios-Neto, Doumit ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . The granulopoietic cytokine granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) induces pain: analgesia by rutin. INFLAMMOPHARMACOLOGY , v. 27, p. 1285-1296, 2019.

• ZUCOLOTO, AMANDA Z. ; MANCHOPE, MARÍLIA F. ; BORGHI, SERGIO M. ; DOS SANTOS, TELMA S. ; FATTORI, VICTOR ; BADARO-GARCIA, STEPHANIE ; Camilios-Neto, Doumit ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . Probucol Ameliorates Complete Freund?s Adjuvant-Induced Hyperalgesia by Targeting Peripheral and Spinal Cord Inflammation. INFLAMMATION , v. 42, p. 1474-1490, 2019.

• BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE CRISTINA CAMPOS ; ALBERTON, DAYANE ; VALDAMERI, GLAUCIO ; Camilios-Neto, Doumit ; COVRE, RAFAEL ; LOPES, KATIA DE PAIVA ; ZIBETTI TADRA-SFEIR, MICHELLE ; FAORO, HELISSON ; ADELE MONTEIRO, ROSE ; BARBOSA-SILVA, ADRIANO ; JOHN BROUGHTON, WILLIAM ; OLIVEIRA PEDROSA, FABIO ; WASSEM, ROSELI ; SOUZA, EMANUEL MALTEMPI DE . Modulation of defence and iron homeostasis genes in rice roots by the diazotrophic endophyte Herbaspirillum seropedicae. Scientific Reports , v. 9, p. 9(1):3062, 2019.

• FAORO, HELISSON ; OLIVEIRA, WILLIAN K. ; WEISS, VINICIUS A. ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z. ; CARDOSO, RODRIGO L. ; BALSANELLI, EDUARDO ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE C. C. ; Camilios-Neto, Doumit ; CRUZ, LEONARDO M. ; RAITTZ, ROBERTO T. ; MARQUES, ANA C. Q. ; LIPUMA, JOHN ; FADEL-PICHETH, CYNTIA M. T. ; SOUZA, EMANUEL M. ; PEDROSA, FABIO O. . Genome comparison between clinical and environmental strains of Herbaspirillum seropedicae reveals a potential new emerging bacterium adapted to human hosts. BMC GENOMICS , v. 20, p. 630 (2019), 2019.

• GUAZELLI, CARLA F.S. ; STAURENGO-FERRARI, LARISSA ; ZARPELON, ANA C. ; PINHO-RIBEIRO, FELIPE A. ; RUIZ-MIYAZAWA, KENJI W. ; VICENTINI, FABIANA T.M.C. ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; GEORGETTI, SANDRA R. ; BARACAT, MARCELA M. ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . Quercetin attenuates zymosan-induced arthritis in mice. BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY , v. 102, p. 175-184, 2018.

• RUIZ-MIYAZAWA, KENJI W. ; STAURENGO-FERRARI, LARISSA ; MIZOKAMI, SANDRA S. ; DOMICIANO, TALITA P. ; VICENTINI, FABIANA T. M. C. ; Camilios-Neto, Doumit ; PAVANELLI, WANDER R. ; PINGE-FILHO, PHILENO ; AMARAL, FLÁVIO A. ; TEIXEIRA, MAURO M. ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . Quercetin inhibits gout arthritis in mice: induction of an opioid-dependent regulation of inflammasome. INFLAMMOPHARMACOLOGY , v. 25, p. 555-570, 2017.

• PANKIEVICZ, V. C. S. ; Camilios-Neto, D. ; BONATO, P. ; BALSANELLI, E. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; FAORO, H. ; CHUBATSU, L. S. ; DONATTI, L. ; WAJNBERG, G. ; PASSETTI, F. ; MONTEIRO, R. A. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. . RNA-seq transcriptional profiling of Herbaspirillum seropedicae colonizing wheat (Triticum aestivum) roots. Plant Molecular Biology , v. 90, p. 1-15, 2016.

• BORGHI, SERGIO M. ; PINHO-RIBEIRO, FELIPE A. ; FATTORI, VICTOR ; BUSSMANN, ALLAN J. C. ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; CASAGRANDE, RUBIA ; VERRI, WALDICEU A. . Quercetin Inhibits Peripheral and Spinal Cord Nociceptive Mechanisms to Reduce Intense Acute Swimming-Induced Muscle Pain in Mice. Plos One , v. 11, p. e0162267, 2016.

• BONATO, PALOMA ; BATISTA, MARCELO B. ; Camilios-Neto, Doumit ; PANKIEVICZ, VÂNIA C. S. ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z. ; MONTEIRO, ROSE ADELE ; PEDROSA, FABIO O. ; SOUZA, EMANUEL M. ; CHUBATSU, LEDA S. ; WASSEM, ROSELI ; RIGO, LIU UN . RNA-seq analyses reveal insights into the function of respiratory nitrate reductase of the diazotroph. Environmental Microbiology (Print) , v. 18, p. 2677-2688, 2016.

• DE SANTANA-FILHO, ARQUIMEDES PAIXÃO ; Camilios-Neto, Doumit ; DE SOUZA, LAURO MERA ; Sassaki, Guilherme Lanzi ; Mitchell, David Alexander ; Krieger, Nadia . Evaluation of the Structural Composition and Surface Properties of Rhamnolipid Mixtures Produced by Pseudomonas aeruginosa UFPEDA 614 in Different Cultivation Periods. Applied Biochemistry and Biotechnology , v. 175, p. 988-995, 2015.

• TADRA-SFEIR, MICHELLE Z. ; FAORO, HELISSON ; Camilios-Neto, Doumit ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE ; BALSANELLI, EDUARDO ; WEISS, VINICIUS ; BAURA, VALTER A. ; WASSEM, ROSELI ; CRUZ, LEONARDO M. ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FÁBIO ; SOUZA, EMANUEL M. ; MONTEIRO, ROSE A. . Genome wide transcriptional profiling of Herbaspirillum seropedicae SmR1 grown in the presence of naringenin. Frontiers in Microbiology (Online) , v. 6, p. 1-8, 2015.

• OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; MAGRI, A. ; ROCHA, C. B. ; Camilios-Neto, D. ; MINUCELLI, T. ; CELLIGOI, Maria Antonia P C . Sophorolipids A Promising Biosurfactant and it?s Applications. International Journal of Advanced Biotechnology and Research , v. 6, p. 161-174, 2015.

• Camilios-Neto, Doumit ; BONATO, PALOMA ; WASSEM, ROSELI ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE CC ; VALDAMERI, GLAUCIO ; DONATTI, LUCÉLIA ; FAORO, HELISSON ; WEISS, VINICIUS A ; CHUBATSU, LEDA S ; PEDROSA, FÁBIO O ; SOUZA, EMANUEL M . Dual RNA-seq transcriptional analysis of wheat roots colonized by Azospirillum brasilense reveals up-regulation of nutrient acquisition and cell cycle genes. BMC Genomics , v. 15, p. 378, 2014.

• SOUZA, EMANUEL ; CHUBATSU, LEDA ; HUERGO, LUCIANO F ; MONTEIRO, ROSE ; Camilios-Neto, Doumit ; WASSEM, ROSELI ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FÁBIO . Use of nitrogen-fixing bacteria to improve agricultural productivity. BMC Proceedings , v. 8, p. O23, 2014.

• OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; Camilios-Neto, Doumit ; ROCHA, C. B. ; MAGRI, A. ; CELLIGOI, Maria Antonia P C . Biosynthesis and Production of Sophorolipids. INTERNATIONAL JOURNAL OF SCIENTIFIC & TECHNOLOGY RESEARCH , v. 3, p. 133-143, 2014.

• Camilios-Neto, Doumit ; Bugay, Cryshelen ; Santana-Filho, Arquimedes Paixão ; Joslin, Talita ; Souza, Lauro Mera ; Sassaki, Guilherme Lanzi ; Mitchell, David Alexander ; Krieger, Nadia . Production of rhamnolipids in solid-state cultivation using a mixture of sugarcane bagasse and corn bran supplemented with glycerol and soybean oil. Applied Microbiology and Biotechnology , v. 89, p. 1395-1403, 2011.

• KRIEGER, N. ; CAMILIOS NETO, D. ; MITCHELL, D.A. . Production of Microbial Biosurfactants by Solid-State Cultivation. Advances in Experimental Medicine and Biology , v. 672, p. 203-210, 2010.

• CAMILIOS NETO, Doumit ; MEIRA, J.A. ; TIBURTIUS, E. ; ZAMORA, P. P. ; BUGAY, C. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Production of rhamnolipids in solid-state cultivation: Characterization, downstream processing and application in the cleaning of contaminated soils. Biotechnology Journal (Print) , v. 4, p. 748-755, 2009.

• Camilios Neto, Doumit ; Meira, Joel Alexandre ; Araújo, Janete Magali ; Mitchell, David Alexander ; Krieger, Nadia . Optimization of the production of rhamnolipids by Pseudomonas aeruginosa UFPEDA 614 in solid-state culture. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY , v. 81, p. 441-448, 2008.

• CASOTTI, J. F. ; CAMILIOS NETO, D. ; BRUZON, Gilcelene ; MACHADO, R. A. M. ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia Pedrine Colabone . Uso de matérias primas da agroindústria - garapa e extrato de levedura - na produção de asparaginase por Zymomonas mobilis CP4.. Semina. Ciências Agrárias (Impresso) , v. 28, p. 653-658, 2007.

• CAMILIOS NETO, D. ; BUZATO, João Batista ; Borsato, Dionísio . Produção de L-asparaginase por <em>Zymomonas mobilis</em> durante a fermentação do melaço: otimização das condições de cultivo utilizando delineamento fatorial. Acta Scientiarum. Technology (Online) , v. 28, p. 151-153, 2006.

• CAMILIOS NETO, D. ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia Pedrine Colabone ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de . Otimização da produção de etanol por Zymomonas mobilis na fermentação do melaço de cana-de-açúcar. Semina. Ciências Exatas e Tecnológicas (Impresso) , Submetido 2005, v. 26, p. 17-22, 2005.

• CAMILIOS NETO, D. ; PINOTTI, Maria Helena P . Exopolissacarídeos de Cianobactérias. Semina. Ciências Exatas e Tecnológicas (Impresso) , Londrina-Paraná, v. 25, n.1, p. 41-50, 2004.

• POÇAS, Evandro Cesar ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia Pedrine Colabone ; CAMILIOS NETO, D. . Aplicação da Bucha Vegetal (Luffa Cylindrica) como Suporte para Produção de Xarope de Açúcar Invertido. Semina. Ciências Exatas e Tecnológicas (Impresso) , Londrina - Paraná, v. 25, n.1, p. 51-56, 2004.

• CAMILIOS NETO, D. . Vacina Anti-Hepatite B, um Compromisso com a Saúde Pública ou apenas um Protocolo Oficial?. Olho Mágico (UEL) , Edição Especial PEEPIN 1997, v. Edição, 1997.

• KRIEGER, N. ; CAMILIOS NETO, D. ; MITCHELL, D.A. . Production of microbial biosurfactants by solid-state cultivation. In: Ramkrishna Sen. (Org.). Biosurfactants. Georgetown: Lands Bioscience and Springer Science+Business Media, 2010, v. 672, p. 203-210.

• CAMILIOS NETO, D. ; DA SILVA, M. F. G. ; GIROTTO, E. ; MENOLLI, R. A. ; REINO, L. F. O. ; WILTGEN, R. . Doenças Infecciosas e Parasitárias Caso clínico 9: Diagnóstico laboratorial da infecção pelo papilomavírus humano.. In: Edna Maria Vissoci Reiche; Egídio Tesser; José Wander Breganó; Leda Mezzaroba; Marsileni Pelisson.. (Org.). Abordagem interdisciplinar em análises clínicas.. 1ed.Londrina: EDUEL, 2006, v. , p. 97-118.

• VELASCO, P. F. ; WESSEL, K. B. B. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, Doumit . Quinolonas Sinalizadoras do Quorum Sensing de Pseudomonas aeruginosa e a Modulação da Resposta Imune do Hospedeiro. In: VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019, Londrina-PR. VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019.

• WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . Produção e Extração de Piorubrinas por Cultivos Submersos de Pseudomonas aeruginosa. In: VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019, Londrina-PR. VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019.

• WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; OLIVEIRA, G. G. ; SAWONIUK, I. C. ; TISCHER, C.A. ; Camilios-Neto, Doumit ; VIGNOLI, J. A. . Produção e Purificação de Ácido 5-metil fenazina-1-carboxílico por Pseudomonas aeruginosa. In: VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019, Londrina-PR. VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019.

• SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; SANTOS, G. M. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, Doumit . Avaliação da capacidade indutora de torta de milho na produção de ramnolipídeos. In: VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019, Londrina-PR. VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019.

• MARQUES, G. D. ; SAWONIUK, I. C. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR Pseudomonas aeruginosa UTILIZANDO TORTA DE MILHO. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• WESSEL, K. B. B. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . Efeito das Moléculas Sinalizadoras do Quorum Sensing de Pseudomonas aeruginosa na produção de Ramnolipídeos. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; TISCHER, C. A. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . Caracterização das Propriedades Tensoativas e Estruturais de Ramnolipídeos Produzidos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em Matriz Sólida de Celulose Bacteriana. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; TISCHER, C. A. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . Efeito da Profundidade do Leito de Cultivo Durante a Produção de Ramnolipídeos por Cultivos Submersos Estáticos em Matriz de Celulose Bacteriana. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• ALMEIDA, M. A. ; CONCEICAO, K. S. ; MATIUSSO, M. M. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . Produção de Etanol por Zymomonas mobilis a partir de hidrolisado ácido de casca de arroz. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; ALMEIDA, M. A. ; MATIUSSO, M. M. ; CONCEICAO, K. S. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em cultivos submersos com presença de matriz sólida inerte. In: VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017, Londrina. VI SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2017.

• ARAUJO, ISADORA ANGELO DE ; TISCHER, CESAR AUGUSTO ; Camilios-Neto, Doumit . Modelo de Estudo de Virulência de Pseudomonas aeruginosa PAO1 Crescida em Membrana de Celulose Bacteriana. In: V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2015, Londrina. Anais do V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia. São Paulo: Editora Edgard Blücher, 2015. p. 275.

• OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; Camilios-Neto, Doumit ; CELLIGOI, Maria Antonia Pedrine Colabone . Padronização do Inóculo na Produção de Soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 Utilizando Semente de Girassol na Fermentação em Estado Sólido. In: V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2015, Londrina. Anais do V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia. São Paulo: Editora Edgard Blücher, 2015. p. 303.

• OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; NOVELLI, ANA PAULA ; Camilios-Neto, Doumit ; ALMEIDA, JÉSSICA PRINCE FONTES DE ; CELLIGOI, Maria Antonia Pedrine Colabone . Produção de Soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214: Padronização do Inóculo na Utilização Células Imobilizadas em Alginato de Sódio. In: V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2015, Londrina. Anais do V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia. São Paulo: Editora Edgard Blücher, 2015. p. 307.

• Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por cultivo em estado sólido em fibras de algodão enriquecidas com torta de milho. In: V SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2015, Londrina. V SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2015.

• BONATO, P. ; BATISTA, M. B. ; Camilios-Neto, D. ; Pankievicz, V.C.S. ; MÜLLER-SANTOS, M. ; AMENDA, M. B. ; CREUS, C. M. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. ; Chubatsu, L.S. ; Wassen, R. ; RIGO, L. U. . Caracterização funcional da nitrato redutase respiratória de Herbaspirillum seropedicae. In: V SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2015, Londrina. V SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2015.

• Camilios-Neto, D. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. ; Klimecki, W. ; Pemberton, J.E. ; MAIER, R.M. . Análise transcriptômica do efeito da fonte de carbono na produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1. In: IV SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2014, Londrina. IV SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2014.

• AMARAL, M. ; CHAVES, H. F. ; FARIA-TISHER, P. C. S. ; TISCHER, C.A. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa crescida em membrana de celulose bacteriana. In: IV SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2014, Londrina. IV SIMPÓSIO DE BIOQUÍMICA E BIOTECNOLOGIA, 2014.

• SANTANA FILHO, A. P. ; CAMILIOS NETO, D. ; MEIRA, J.A. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa UFPEDA 614: influência do inóculo e da concentração de fonte de carbono. In: II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008, Aracajú. II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008.

• MEIRA, J.A. ; CAMILIOS NETO, D. ; MITCHELL, D.A. ; RAMOS, L. P. ; KRIEGER, N. . Aproveitamento de Residuos Sólidos da Cadeia Produtiva do Biodiesel para Produção de Biosurfactantes. In: II Congresso da Rede Brasileira de Tecnologia de Biodiesel, 2007, Brasília. Aproveitamento de Residuos Sólidos da Cadeia Produtiva do Biodiesel para Produção de Biosurfactantes, 2007.

• OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; CAMILIOS NETO, D. ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; BUZATO, João Batista . Influência da aplicação de ondas ultra-sônicas na atividade de levanasacarase de Zymomonas mobilis cultivada em meio de sacarose. In: XVSINAFERM- Simpósio nacional de Bioprocessos, 2005, Recife, 2005.

• BRUZON, Gilcelene ; CAMILIOS NETO, D. ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia P C . Otimização da atividade de glutaminase de Zymomonas mobilis CP4 cultivado em caldo de cana. In: XIX CBCTA, 2004, Recife. XIX CBCTA, 2004.

• POÇAS, Evandro Cesar ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; CAMILIOS NETO, D. . Imobilização de Invertase em bucha vegetal (luffa cylindrica) para produção de xarope de açúcar invertido. In: XIX CBCTA, 2004, Recife. XIX CBCTA, 2004.

• LINO, T. M. R. ; Camilios-Neto, D. . Extração e purificação de congêneres de di- ramnolipídeos produzidos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em cultivos submersos de composição complexa. In: Encontro Anual de Iniciação Científica, 2021, Londrina. 30 Encontro Anual de Iniciação Científica, 2021.

• PURGA, M. A. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em cultivos submersos com presença de farelo de girassol. In: Encontro Anual de Iniciação Científica, 2021, Londrina. 30 Encontro Anual de Iniciação Científica, 2021.

• TEIXEIRA, J. P. M. ; Camilios-Neto, D. . Avaliação do efeito da alimentação do meio de cultivo com óleo de soja e glicerol na produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em cultivos submersos com presença de torta de milho. In: Encontro Anual de Iniciação Científica, 2020, Londrina-PR. 29 Encontro Anual de Iniciação Científica, 2020.

• ENOKIDA, I. N. S. ; Camilios-Neto, D. . Quinolonas sinalizadoras do quorum sensing de Pseudomonas aeruginosa: produção e purificação.. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2020, Bandeirantes-PR. X Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2020.

• YAEKASHI, K. M. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 utilizando farelo de milho como substrato sólido em fermentação submersa. In: Encontro Anual de Iniciação Científica 2019, 2019, LONDRINA-PR. Encontro Anual de Iniciação Científica 2019, 2019.

• COSTA, L. M. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por Pseudomonas aeruginosa PAO1 em cultivos submersos utilizando torta de milho como substrato sólido. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2019, 2019, Guarapuava-PR. Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2019, 2019.

• SAWONIUK, I. C. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO SUBMERSA ESTÁTICA DE LEITO RASO. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação., 2018, Maringá. Oitavo Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação., 2018.

• YAEKASHI, K. M. ; Camilios-Neto, D. . AVALIAÇÃO DA EXPRESSÃO DO OPERON pqsABCDE NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR BIOFILME DE Pseudomonas aeruginosa. In: Encontro Anual de Iniciação Científica, 2018, Londrina. Encontro Anual de Iniciação Científica, 2018.

• SAWONIUK, I. C. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO SUBMERSA ESTÁTICA EM MEMBRANA DE CELULOSE BACTERIANA: ESTUDO DE PROFUNDIDADE DE LEITO DE CULTIVO. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2017, Ponta Grossa. Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2017.

• SAWONIUK, I. C. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR Pseudomonas aeruginosa UTILZADO TORTA DE MILHO COMO SUBSTRATO SÓLIDO EM FERMENTAÇÃO SUBMERSA. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2016, Londrina. Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2016.

• MARQUES, G. D. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO UTILIZANDO TORTA DE MILHO. In: XXV EAIC (Encontro Anual de Iniciação Científica), 2016, Londrina. XXV EAIC (Encontro Anual de Iniciação Científica), 2016.

• AMARAL, M. ; TISCHER, C.A. ; FARIA-TISHER, P. C. S. ; Camilios-Neto, D. . Produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido utilizando membranas de celulose bacteriana. In: Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2014, Guarapuava. Encontro Anual de Iniciação Tecnológica e Inovação, 2014.

• VELASCO, P. F. ; WESSEL, K. B. B. ; SAWONIUK, I. C. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, Doumit . Produção de Quinolonas Sinalizadoras do Quorum sensing de Pseudomonas aeruginosa. In: VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019. VII Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia, 2019.

• BUENO, E. B. T. ; VELASCO, P. F. ; WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; Camilios-Neto, Doumit ; VIGNOLI, J. A. . QUINOLONAS SINALIZADORAS DO QUORUM SENSING DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA: PRODUÇÃO E EXTRAÇÃO.. In: III Simpósio Inova Saúde, 1ª edição internacional, 2019, Londrina-PR. III Simpósio Inova Saúde, 1ª edição internacional, 2019.

• WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; Camilios-Neto, Doumit ; VIGNOLI, J. A. . PRODUÇÃO, EXTRAÇÃO E PURIFICAÇÃO DE FENAZINAS PRODUZIDAS POR CULTIVOS SUBMERSOS DE Pseudomonas aeruginosa PAO1. In: VI Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2018, Curitiba-PR. VI Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2018.

• WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; FERRAZ, I. B. G. ; CASAGRANDE, RUBIA ; Camilios-Neto, Doumit ; VIGNOLI, J. A. . ANTIOXIDANT ACTIVITY OF CRUDE EXTRACT OF PHENAZINES PRODUCED BY PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1. In: III Congresso Paranaense de Microbiologia e Internacional Symposium of Mycology, 2018, Londrina-PR. III Congresso Paranaense de Microbiologia e Internacional Symposium of Mycology, 2018.

• WESSEL, K. B. B. ; AMADOR, I. R. ; Camilios-Neto, Doumit ; VIGNOLI, J. A. . PRODUCTION, EXTRACTION AND PURIFICATION OF PHENAZINES PRODUCED BY PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1. In: III CONGRESSO PARANAENSE DE MICROBIOLOGIA E INTERNATIONAL SYMPOSIUM OF MYCOLOGY, 2018. III CONGRESSO PARANAENSE DE MICROBIOLOGIA E INTERNATIONAL SYMPOSIUM OF MYCOLOGY, 2018.

• CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; TISCHER, C. A. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS DE Pseudomonas aeruginosa PAO1 OBTIDOS POR CULTIVOS SUBMERSOS ESTÁTICOS EM MATRIZ SÓLIDA DE CELULOSE BACTERIANA. In: V Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2017, Curitiba. V Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2017.

• CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; MATIUSSO, M. M. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . RAMNOLIPIDS PRODUCTION BY STATIC-SUBMERGED FERMENTATION USING MEMBRANES OF BACTERIAL CELLULOSE AS SOLID SUPPORT. In: 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017, Foz do Iguaçú. 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017.

• ALMEIDA, M. A. ; CONCEICAO, K. S. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . ETHANOL PRODUCTION FROM RICE-HUSK ACID-HYDROLYSATE IN SEMI-SOLID FERMENTATION BY Zymomonas mobilis. In: 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017, Foz do Iguaçú. 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2017.

• ALMEIDA, M. A. ; SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; CONCEICAO, K. S. ; MATIUSSO, M. M. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR Pseudomonas aeruginosa PAO1 EM CULTIVOS SUBMERSOS COM PRESENÇA DE MATRIZ SÓLIDA INERTE. In: V Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2017, Curitiba. V Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2017.

• VANZELA, D. O. A. ; CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . PRODUÇÃO DE BIOETANOL POR Zymomonas mobilis CP4 A PARTIR DO HIDROLISADO ÁCIDO TOTAL DE TORTA DE MILHO. In: IV Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2016, Curitiba. IV Semana Científica de Bioquímica da UFPR, 2016.

• VANZELA, D. O. A. ; CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . PRODUÇÃO DE ETANOL POR Zymomonas mobilis CP4 A PARTIR DA FERMENTAÇÃO DO HIDROLISADO ÁCIDO DE TORTA DE MILHO.. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• ALMEIDA, M. A. ; CONCEICAO, K. S. ; PETENUCI, S. M. R. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . PRODUÇÃO DE ETANOL POR Zymomonas mobilis A PARTIR DA FERMENTAÇÃO DE HIDROLISADO ÁCIDO DE BAGAÇO CANA-DE-AÇÚCAR. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• PETENUCI, S. M. R. ; ALMEIDA, M. A. ; CONCEICAO, K. S. ; Camilios-Neto, D. ; VIGNOLI, J. A. . SUBSTITUIÇÃO PARCIAL DO MEIO DE FERMENTAÇÃO POR HIDROLISADOS ÁCIDOS DO BAGAÇO DE CANA-DE-AÇÚCAR E DA CASCA DE ARROZ PARA PRODUÇÃO DE ETANOL POR Zymomonas mobilis. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• CONCEICAO, K. S. ; ALMEIDA, M. A. ; VANZELA, D. O. A. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . PRODUÇÃO DE ETANOL POR Zymomonas mobilis A PARTIR DA FERMENTAÇÃO DE HIDROLISADO ÁCIDO DE CASCA DE ARROZ.. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• MARQUES, G. D. ; SAWONIUK, I. C. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS DE CULTIVO NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR Pseudomonas aeruginosa PAO1. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• SAWONIUK, I. C. ; MARQUES, G. D. ; VIGNOLI, J. A. ; Camilios-Neto, D. . AVALIAÇÃO DE DIFERENTES FONTES DE CARBONO NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR Pseudomonas aeruginosa. In: II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016, Londrina. II Congresso Paranaense de Microbiologia, 2016.

• BONATO, P. ; BATISTA, M. B. ; Camilios-Neto, D. ; Pankievicz, V.C.S. ; MÜLLER-SANTOS, M. ; AMENDA, M. B. ; CREUS, C. M. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. ; Chubatsu, L.S. ; Wassen, R. ; RIGO, L. U. . The respiratory nitrate reductase is important to a successful Herbaspirillum seropedicae-wheat interaction. In: Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

• BONATO, P. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; Camilios-Neto, D. ; WASSEM, ROSELI ; RIGO, L. U. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. ; Chubatsu, L.S. . NtrYX and NtrBC systems are required to induce genes encoding the assimilatory nitrate reductase in Herbaspirillum seropedicae SmR1. In: Simpósio Comemorativo de 50 anos do Programa de Pós-graduação em Ciências (Bioquímica), 2015, Curitiba. impósio Comemorativo de 50 anos do Programa de Pós-graduação em Ciências (Bioquímica), 2015.

• MASSI, J. B. ; Camilios-Neto, D. ; REZENDE, M. I. . Produção de lipopetídeos de Bacillus amyloliquefaciens MO.04b nos substratos farelo de soja e casca de arroz por fermentação em estado sólido (FES). In: 27 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal. Anais do 27 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013.

• PAPI, M. C. ; MASSI, J. B. ; Camilios-Neto, D. ; STRAPASSON, E. ; REZENDE, M. I. . Otimização da produção e extração de biossurfactantes de Bacillus amyloliquefaciens MO-04B por metodologia de superfície de resposta (RMS). In: 27 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal. Anais do 27 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013.

• BRUZAMARELO-SANTOS, L. C. C. B. ; Alberton, D. ; VALDAMERI, G. ; Camilios-Neto, D. ; COVRE, R. A. ; LOPES, K. P. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; FAORO, H. ; SILVA, A. B. ; Pedrosa, F.O. ; Wassen, R. ; SOUZA, E.M. . Transcriptome Analysis of Rice (Oryza sativa L. cv.Nipponbare) Roots Inoculated with Herbaspirillum seropedicae SmR1by RNA-seq. In: XLII Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2013, Foz do Iguaçu. XLII Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society in the Convention Center of the Rafain Palace Hotel, on May 18 to 21, 2013, in Foz do Iguaçu, Paraná, Brazil., 2013.

• MASSI, J. B. ; Camilios-Neto, D. ; REZENDE, M. I. . Production of biossurfactants using soybean meal andrice husk with Bacillus amyloliquefaciens mo-04b bysolid state fermentation (ssf). In: The 5th Congress of the Brazilian Biotechnology Society (SBBIOTEC), 2013, Florianópolis. The 5th Congress of the Brazilian Biotechnology Society (SBBIOTEC), 2013.

• Camilios-Neto, D. ; SANTANA FILHO, A. P. ; RUTHES, A. C. ; Sassaki, Guilherme Lanzi ; SOUZA, E.M. ; Pedrosa, F.O. ; Chubatsu, L.S. . Structural Characterization of a Beta-Glucan Produced by the Diazotrophic Bacterium Herbaspirillum seropedicae. In: XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012.

• Camilios-Neto, Doumit ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; BRUZAMARELO, L.C.C. ; Wassen, R. ; DONATTI, L. ; STETS, M. I. ; Weiss, V. ; FAORO, H. ; Chubatsu, L.S. ; MONTEIRO, R. A. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. . RNA-seq Transcriptional Profiling of Bread Wheat (Triticum aestivum) Colonized by Azospirillum brasilense FP2. In: XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012.

• Pankievicz, V.C.S. ; Camilios-Neto, D. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; FAORO, H. ; Weiss, V. ; DONATTI, L. ; Baura, V.A. ; MONTEIRO, R. A. ; Chubatsu, L.S. ; Wassen, R. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. . RNA-seq Transcriptional Profiling of Herbaspirillum seropedicae Colonizing Bread Wheat (Triticum aestivum) Seedling Roots. In: XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012.

• BONATO, P. ; Wassen, R. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; SOUZA, E.M. ; MONTEIRO, R. A. ; Camilios-Neto, D. ; FAORO, H. ; Weiss, V. ; Pedrosa, F.O. ; RIGO, L. U. . Transcriptional Profiling of Nitrate-grown Herbaspirillum seropedicae by RNAseq. In: XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012.

• FAORO, H. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; Weiss, V. ; BRUZAMARELO, L.C.C. ; Camilios-Neto, D. ; MONTEIRO, R. A. ; CRUZ, L. M. ; RIGO, L. U. ; FATEL-PICHETH, C. M. T. ; SOUZA, E.M. ; Pedrosa, F.O. . Genomic comparison of Herbaspirillum seropedicae SmR1, a plant endophytic bacteria, and Herbaspirillum seropedicae 14040, a clinical isolated. In: XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012.

• MONTEIRO, R. A. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; Camilios-Neto, D. ; BRUZAMARELO, L.C.C. ; FAORO, H. ; Weiss, V. ; Baura, V.A. ; Wassen, R. ; SOUZA, E.M. ; Pedrosa, F.O. . Whole transcriptome profile of Herbaspirillum seropedicae grown in the presence of naringenin.. In: XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2011, Foz do Iguaçu. XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society.

• Camilios-Neto, D. ; Froufe, L.G.S. ; Vendruscolo, E.C.G. ; Chubatsu, L.S. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. . Improved Growth of Wheat Plants Inoculated with Azospirillum brasilense FP2. In: XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2011, Foz do Iguaçu. XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2011.

• Pankievicz, V.C.S. ; Camilios-Neto, Doumit ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z ; FAORO, HELISSON ; Weiss, V. ; Baura, V.A. ; MONTEIRO, R. A. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. . Transcriptome profiling of Herbaspirillum seropedicae response co-cultivated with wheat seedlings root. In: 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçú. 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011.

• CAMILIOS NETO, D. ; BUGAY, C. ; Arquimedes Paixão Santana Filho ; JOSLIN, T. ; SASSAKI, G.L. ; MITCHELL, D.A. ; Nadia Krieger . Production of Rhamnolipid in Solid-State Cultivation Using a Mixture of Sugarcane Bagasse and Corn Bran Supplemented with Glycerol and Soybean Oil. In: XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2010, Foz do Iguaçú. XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2010.

• FAORO, H. ; BRUZAMARELO, L.C.C. ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; Camilios-Neto, D. ; et al. . Genomic comparison of Herbaspirillum spp species. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010, Buzios. 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010.

• CAMILIOS NETO, D. ; NEILSON, J. ; MAIER, R.M. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Rhamnolipids production by solid-state cultivation. In: The 48th Annual Meeting Of the Arizona Southern American Society for Microbiology, 2009, Tucson-AZ, USA. The 48th Annual Meeting Of the Arizona Southern American Society for Microbiology, 2009.

• CAMILIOS NETO, D. ; MEIRA, J.A. ; Arquimedes Paixão Santana Filho ; Gilherme L. Sassaki ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Production of rhamnolipids by Pseudomonas aeruginosa in solid-state cultivation. In: XXXVII Annual Meeting of SBBq and XI Congress of the PABMB, 2008, Águas Lindóia. Biotechnology, 2008.

• CAMILIOS NETO, D. ; SANTANA FILHO, A. P. ; MEIRA, J.A. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Influência do mecanismo quorum sensing na produção de ramnlipídeos por Pseudomonas aeruginosa UFPEDA 614. In: II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008, Aracajú. II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008.

• MEIRA, J.A. ; CAMILIOS NETO, D. ; SANTANA FILHO, A. P. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Produção de ramnolipídeos por fermentação no estado sólido e sua aplicação no tratamento de solos contanimados por hidrocarbonetos.. In: II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008, Aracajú. II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental, 2008.

• CAMILIOS NETO, D. ; MONTEIRO, S.A. ; MEIRA, J.A. ; ARAÚJO, J.M. ; MITCHELL, D.A. ; KRIEGER, N. . Optimization of the production of rhamnolipids by Pseudomonas aeruginosa. In: XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007, Salvador. XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.

• CAMILIOS NETO, D. ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; BUZATO, João Batista . The production of ethanol by Zymomonas mobilis in a medium of pure sugar cane juice previously treated with invertase: optimization of the treatment conditions using a factorial design. In: 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005, Campos de Jordão -SP. THE PRODUCTION OF ETHANOL BY Zymomonas mobilis IN A MEDIUM OF PURE SUGAR CANE JUICE PREVIOUSLY TREATED WITH NVERTASE: OPTIMIZATION OF THE TREATMENT CONDITIONS USING A FACTORIAL DESIGN, 2005.

• CAMILIOS NETO, D. ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; BUZATO, João Batista . Optimization of cultivation conditions in the production of ethanol by Zymomonas mobilis in sugar cane juice using the response surface methodology. In: 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005, Campos de Jordão - SP. 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005.

• CAMILIOS NETO, D. ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; BUZATO, João Batista . The influence of ultrasonic pulse in different concentrations of sugar cane syrup and the fermentation time in the production of ethanol by Zymomonas mobilis. In: 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005, Campos de Jordão - SP. 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005.

• CAMILIOS NETO, D. ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; BUZATO, João Batista . The effect of ultrasonic pulse in the production of levan in sucrose medium by Zymomonas mobilis. In: 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005, Campos de Jordão SP. 5°SIPAL-Simposio Internacional de Producción de Alcoholes y Levaduras, 2005.

• CAMILIOS NETO, D. . Zymomonas mobilis e a fermentação de melaço para a produção de asparaginase. In: VI Seminário Brasileiro de Técnologia de Enzimas, 2004, Rio de Janeiro. Zymomonas mobilis e a fermentação de melaço para produção de asparaginase, 2004.

• CAMILIOS NETO, D. ; POÇAS, Evandro Cesar ; BUZATO, João Batista . Determinação do pH ótimo para atividade de L-asparaginase de Zymomonas mobilis. In: Encontro Anual de Iniciação Científica, 2004, Londrina-Pr, 2004.

• POÇAS, Evandro Cesar ; BUZATO, João Batista ; CELLIGOI, Maria Antonia P C ; CAMILIOS NETO, D. . Variações de uma nova metodologia de imobilização de Invertase em bucha vegetal (luffa cylindrica): Utilização de hemoglobina, ovoalbumina ou polietilenoimina.. In: XIII Encontro Anual de Iniciação Científica, 2004, Londrina-PR, 2004.

• KISHIMA, V. L. H. ; CAMILIOS NETO, D. ; DA SILVA, M. F. G. ; GIROTTO, E. ; MENOLLI, R. A. ; OLIVEIRA, Marcos Roberto de ; WILTGEN, R. . Diagnóstico das displasias e infecções por HPV: Relato de Caso.. In: XXIX Congresso Brasileiro de Análises Clínicas; II Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2002, Fortaleza. Anais do XXIX Congresso Brasileiro de Análises Clínicas, 2002.

• CAMILIOS NETO, D. . Diagnóstico de displasias e infecções por HPV: relato de casos. In: V- Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina, 2001, Londrina-PR. Diagnóstico das Displasias e Infecções por HPV: relato de caso, 2001.

• CAMILIOS NETO, D. . Avaliação dos níveis séricos de citocinas em pacientes com depressão. In: 42 Congresso Médico da Associação Médica de Londrina, 2000, Londrina. Avaliação dos níveis séricos de citocinas em pacientes com depressão, 2000.

• CAMILIOS NETO, D. . Avaliação imunológica e hormonal em adultos com depressão. In: 46 Congresso Médico da Associaçào Médica de Londrina, 2000, Londrina. Avaliação imunológica e hormonal em adultos com depressão maior, 2000.

• CAMILIOS NETO, D. . Avaliação imunológica e hormonal em adultos com depressão maior. In: IV Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina, 2000, Londrina. Avaliação imunológica e hormonal em adultos com depressão maior, 2000.

• CAMILIOS NETO, D. . Avaliação dos níveis séricos de citocinas em adultos com depressão. In: IV Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina, 2000, Londrina. Avaliação dos níveis séricos de citocinas em adultos com depressão.

• CAMILIOS NETO, D. . Antinflamatórios hormonais e a terapia medicamentosa no Lúpus Eritrematoso Sistêmico. In: IV Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina, 2000, Londrina. Antinflamatórios hormonais e a terapia medicamentosa no Lúpus Eritrematoso Sistêmico, 2000.

• CAMILIOS NETO, D. . Anticorpos anti-vírus da Hepatite C (HCV) em doadores de sangue do Hemocentro, Hospital Universitário Regional Norte do Paraná. In: IIJornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina, 1999, Londrina. Anticorpos anti-vírus da Hepatite C (HCV) em doadores de sangue do Hemocentro, Hospital Universitário Regional Norte do Paraná, 1999.

• MANCHOPE, MARÍLIA F. ; MIZOKAMI, SANDRA S. ; FERRAZ, CAMILA R. ; BORGHI, SERGIO M. ; VIGNOLI, JOSIANE A. ; Camilios-Neto, Doumit ; ARAKAWA, NILTON S. ; GEORGETTI, SANDRA R. ; VERRI, WALDICEU A. ; CASAGRANDE, RUBIA . <i>Pimenta pseudocaryophyllus</i> (Gomes) Landrum extract inhibits inflammatory pain in mice: targeting neutrophil recruitment, oxidative stress, and cytokine production. NATURAL PRODUCT RESEARCH , 2022.

• Camilios-Neto, D. . Quorum sensing: O paradigma da comunicação bacteriana. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SOUZA, E.M. ; Chubatsu, L.S. ; HUERGO, LUCIANO F ; MONTEIRO, R. A. ; Camilios-Neto, D. ; Pedrosa, F.O. . Use of nitrogen-fixing bacteria to improve agricultural productivity. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Camilios-Neto, D. . Produção de biossurfactantes por fermentação em estado sólido. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Camilios-Neto, D. . Quorum Sensing: O Paradigma da Comunicação Entre Bactérias. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Wassen, R. ; Camilios-Neto, Doumit ; TADRA-SFEIR, M.Z. ; BRUZAMARELO, L.C.C. ; DONATTI, L. ; STETS, M. I. ; Weiss, V. ; FAORO, H. ; Chubatsu, L.S. ; MONTEIRO, R. A. ; Pedrosa, F.O. ; SOUZA, E.M. . Transcription Profiling of wheat (triticum aestivum) roots colonized by Azospirillum brasilense. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CAMILIOS NETO, D. . Biossurfactantes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CAMILIOS NETO, Doumit . Rhamnolipids Production by Solid State Cultivation. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

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Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  SynBioVac, uma plataforma de Biologia Sintética aplicada para o desenvolvimento de vacinas, Descrição: O SUS gasta anualmente, bilhões de reais com a compra e distribuição de vacinas e imunoterápicos. Grande parte desses insumos são importados o que pressiona ainda mais o orçamento do Ministério da Saúde em momentos que o câmbio é altamente desfavorável para a importação. Nos próximos anos, a pandemia de COVID-19 tende a aumentar os gastos federias com saúde devido à demanda massiva por vacinas e eventualmente outros tratamentos que se mostrarem promissores como a imunoterapia para neutralizar o SARS-CoV-2, em casos mais graves da doença. Entretanto, o Brasil ainda tem escassez em tecnologias nacionais desenvolvidas para a rápida produção de vacinas e de anticorpos monoclonais. Sendo assim, esse projeto visa (i) desenvolver uma plataforma para a rápida construção de moléculas de DNA recombinante empregando biologia sintética, (ii) transferir para hospedeiros procarióticos e eucarióticos convencionais para a produção de proteínas recombinantes e (iii) empregar os produtos gerados pela plataforma como imunizantes contra o SARS-CoV-2. A plataforma foi desenhada de forma que o usuário poderá montar sob demanda moléculas de DNA que permitirão a expressão de antígenos virais, bacterianos, fúngicos e de outros agentes infecciosos, selecionando a opção de capturá-los em nanopartículas de um polímero biocompatível. Estima-se que após otimização da metodologia proposta, o usuário que empregar essa plataforma terá imunizantes prontos no seu laboratório para os testes em estágio pré-clínico, em um período de 15 a 30 dias de trabalho. Além disso, a mesma molécula de DNA construída poderá ser transferida entre diferentes hospedeiros para triar em qual deles há o melhor rendimento de produção e qual expressou a molécula com maior atividade (imunogenicidade ou reconhecimento do antígeno viral). Embora essa proposta foque em soluções para a COVID-19 devido ao surto atual, ela é plenamente adaptável para se desenvolver vacinas e imunoterapias contra outras doenças infecciosas de relevância no Brasil. Os dados a serem coletados com essa plataforma fomentarão a tomada de decisão para o escalonamento de processos biotecnológicos e reduzirão os gastos com a obtenção de vacinas e imunoterápicos, além de permitir o desenvolvimento de uma tecnologia nacional e reduzir a dependência do mercado exterior, especialmente em momentos de crise sanitária como o da pandemia atual.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Marcelo Müller dos Santos - Coordenador / Wanderson Duarte da Rocha - Integrante / LUIS PAULO SILVEIRA ALVES - Integrante / MARITZA TODO BOM - Integrante / Maria Luisa Terribile Budel - Integrante / Breno Castello Branco Beirão - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - 2018

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / César Augusto Tischer - Integrante / André Luiz Martinez de Oliveira - Integrante.

• 2014 - 2018

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: ? Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; ? Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; ? Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helison Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / César Augusto Tischer - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Gabriela Dornelas Marques - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2017

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 16/09/2013., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2012 - 2017

  REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO DOS GENES DO METABOLISMO DE NITRATO EM Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Herbaspirillum seropedicae é uma bactéria diazotrófica que pode ser utilizada como inoculante, uma forma alternativa ao uso de fertilizantes nitrogenados, especialmente em gramíneas.O objetivo deste projeto é estudar as regiões regulatórias dos genes envolvidos no processo de utilização de nitrato, avaliando e quantificando a expressão dos genes envolvidos e identificando potenciais elementos regulatórios.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Roseli Wassen - Integrante / paloma bonato - Integrante / Liu Un Rigo - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2016

  Estudo proteômico de plântulas de arroz e cana-de-açúcar colonizadas por Herbaspirillum seropedicae e Herbaspirillum rubrisubalbicans, Descrição: O presente projeto propõe a análise proteômica das raízes de plântulas de arroz colonizadas por Herbaspirilum seropedicae, bem como a análise proteômica comparativa das raízes de cana-de-açúcar colonizadas por Herbaspirilum seropedicae e Herbaspirilum rubrisubalbicans.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Glaucio Valdameri - Integrante / SOUZA, EMANUEL - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2015

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2015

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2014

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 16/09/2013., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2015

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Helisson Faoro - Integrante / Liziane Brusamarello - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Roseli Wassen - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2015

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / KRIEGER, N. - Integrante / David Alexander Mitchell - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Corn Products Brasil - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214 ) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214 ) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214 ) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país. . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de RNA em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - Atual

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - Atual

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante.Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2017 - Atual

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2016 - Atual

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - Atual

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - Atual

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC® 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2019

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2017 - Atual

  Avaliação das atividades antioxidante, anti-inflamatória e analgésica de fatores de virulência de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de sobreviver em vários tipos de ambiente. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a sua habilidade de produzir vários fatores de virulência, como a formação de biofilme, secreção de exotoxinas, motilidade, fenazinas, ramnolipídeos, entre outros. Estes fatores de virulência desempenham um papel central durante a infecção incluindo uma modulação direta das respostas do sistema imune do hospedeiro. Dado a importância da influência do arsenal de fatores de virulência na interação com o hospedeiro a presente proposta é motivada pela hipótese de que estes compostos apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Monique Moleiro Matiusso - Integrante.

• 2016 - 2019

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2019

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - 2017

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2021 - Atual

  Aplicação de biotensoativos na otimização de processo de extração de óleos essenciais por arraste a vapor, Descrição: Os óleos essenciais são misturas voláteis complexas, extraídas de plantas aromáticas, com propriedades bioativas. A destilação por arraste a vapor é a tecnologia mais utilizada, sobretudo em escala industrial, para a obtenção dos óleos essenciais. Embora seja eficiente, o arraste a vapor apresenta algumas limitações relacionados ao alto custo energético do processo. As tecnologias alternativas, encontradas até o momento, também apresentam suas próprias limitações, sobretudo relacionadas ao alto custo de implantação e complexidade de operação. Deste modo, a presente proposta tem como objetivo desenvolver e validar um produto a base de biotensoativos para a otimização dos processos de extração de óleos essenciais por arraste a vapor. Tal tecnologia tem potencial de reduzir os custos globais do processo, aumentado o rendimento e diminuindo o tempo necessário para extração dos óleos essenciais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / MICHEL PEDRO BATISTA - Integrante / JULIANA PEREZ MARQUES TEIXEIRA - Integrante.

• 2020 - Atual

  Produção, purificação e avaliação de potencial antioxidante e anti-inflamatório de ramnolipídeos e de quinolonas de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista metabolicamente versátil capaz de causar infecções de alto risco em pacientes com queimaduras graves, imunocomprometidos, portadores de doença pulmonar obstrutiva crônica e de fibrose cística. A maior contribuição para a patogenicidade deste microrganismo deve-se a habilidade em produzir fatores de virulência, entre estes os pigmentos o biossurfactante ramnolipídico. Os ramnolipídeos apresentam aplicações intrínsecas às suas propriedades surfactantes, que sugerem um grande potencial para as indústrias farmacêutica e cosmética, além de apresentarem atividade imunomoduladora tanto em animais quanto em plantas. A expressão de genes que codificam as enzimas responsáveis pela síntese das fenazinas e dos ramnolipídeos é regulada por um sistema de comunicação, denominado quorum sensing (QS). O QS envolve a produção, liberação e reconhecimento de moléculas sinalizadoras difusíveis (MSQS). P. Aeruginosa apresenta um qs hierárquico composto por duas classes de msqs: (1) N-acetil-homoserinolactonas (acil-HSLS) e (2) alquil-quinolonas (AQS). As msqs desempenham um papel central durante a infecção, modulando tanto a já mencionada produção de fatores de virulência, assim como interferindo diretamente na resposta do sistema imune do hospedeiro. Embora a modulação da resposta imune do hospedeiro pelas acil-hsls tenha sido intensamente explorada, pouco ainda se sabe sobre efeitos das AQS sobre o hospedeiro. Dado a importância da influência dos ramnolipídeos e AQS na interação com o hospedeiro e a deficiência nas informações sobre os efeitos destes compostos, a presente proposta é motivada pela hipótese de que os ramnolipídeos e as AQS apresentem potencial para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias e antioxidantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Isadora Caroline Sawoniuk - Integrante / ISABELLA NAOMI SIMÕES ENOKIDA - Integrante / ANDREI LINCOLN YAMACHITA - Integrante / MICHEL PEDRO BATISTA - Integrante / JULIANA PEREZ MARQUES TEIXEIRA - Integrante / Thaísa Maria da Roda Lino - Integrante.

• 2019 - Atual

  Processo de produção, extração e purificação de fenazinas de Pseudomonas aeruginosa: avaliação do potencial antioxidante e anti-inflamatório, Descrição: As fenazinas são importantes pigmentos redox-ativos produzidos por muitas bactérias gram-negativas. Pseudomonas aeruginosa excreta várias tonalidades destas substâncias, incluindo piocianina (azul-esverdeada) e piorubrina (vermelho). apesar do grande número de estudos dos diferentes pigmentos fenazínicos produzidos por Pseudomonas aeruginosa pouco se sabe sobre as funções biológicas destes compostos. No entanto, há relatos na literatura científica sobre potenciais propriedades antioxidantes e não-citotóxicas destes compostos, que sugerem um grande potencial de aplicação nas indústrias farmacêutica e cosmética. Neste contexto, o presente projeto propõe o desenvolvimento de um processo de produção extração, purificação e avaliação da atividade antioxidante e anti-inflamatória de piocianina e piorubrinas produzidas por Pseudomonas aeruginosa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / CASAGRANDE, RUBIA - Integrante / VERRI, WALDICEU A. - Integrante / Kamila Byanca Baldin Wessel - Integrante / Gabriella Gonçalves Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2017 - 2019

  PRODUÇÃO E PURIFICAÇÃO DOS DIFERENTES CONGÊNERES DE RAMNOLIPÍDEOS POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA E AVALIAÇÃO DO POTENCIAL ANTIOXIDANTE., Descrição: Biossurfactantes são compostos de natureza anfipática- apresentam uma região hidrofílica caracterizada por uma porção polar, podendo ser iônica, não iônica ou anfotérica, e outra hidrofóbica, caracterizada pela cadeia de ácido graxo apolar. Dentre os principais biossurfactantes microbianos destacam-se os ramnolipídeos (RL). São classificados como glicolipídeos, podendo apresentar uma ou duas moléculas de ramnose ligadas a diferentes ácidos graxos beta hidroxilados (monorramnolipídeos e dirramnolipídeos, respectivamente). Os RL são produzidos por Pseudomonas aeruginosa em uma mistura heterogênea contendo diversas espécies de homólogos. A ação desses congêneres quando isolados e purificados é de grande interesse para indústria farmacêutica, pois garante a aplicação das propriedades tensoativa e surfactante com precisão possibilitando o desenvolvimento de fármacos. Assim, o presente trabalho propõe a produção e purificação dos diferentes congêneres de ramnolipídeos a partir de cromatografia líquida de alta performance (CLAE) preparativa, assim como, a avaliação in vitro do potencial antioxidante dos congêneres através dos métodos ABTS e FRAP, visando o desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Ana Paula Queiroz Mello - Integrante.

• 2016 - 2019

  PRODUÇÃO DE ETANOL DE SEGUNDA GERAÇÃO POR Zymomonas mobilis: AVALIAÇÃO DE DIFERENTES PROCESSOS FERMENTATIVOS, Descrição: O uso de combustíveis fósseis como principal matriz energética mundial é um fator limitante do desenvolvimento sustentável da sociedade moderna. As mudanças climáticas globais, a poluição atmosférica, o acúmulo de gases estufa e a própria disponibilidade limitada dos combustíveis fósseis são fatores complicadores do atual cenário. Adicionalmente, a crescente demanda energética mundial e a dada dependência pelos combustíveis fósseis evidenciam a necessidade urgente de desenvolvimento de tecnologias alternativas para obtenção de energia sustentável. Neste contexto, a substituição parcial dos combustíveis fósseis por biocombustíveis já é uma realidade e está em grande evidência. No entanto, as tecnologias de biocombustíveis de primeira geração também apresentam suas próprias limitações, principalmente as relacionadas à necessidade de ampliação de área plantada e a competição com a produção de alimentos. Desta forma, as tecnologias de obtenção de biocombustíveis de segunda geração, com destaque para o etanol proveniente de biomassa lignocelulósica, estão em ampla escala de estudo e em menor escala de desenvolvimento e implantação. Assim, a presente proposta tem como objetivo estudar a produção de etanol de segunda geração por Zymomonas mobilis, proveniente da substituição parcial dos meios de cultivo por hidrolisados de resíduos lignocelulósicos agroindustriais (e.g., torta de milho, bagaço de cana-de-açúcar e casca de arroz) através de diferentes processos fermentativos (i.e., fermentação submersa, fermentação submersa com suporte sólido e fermentação em estado sólido).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Coordenador / Sheila Marim Raksa Petenuci - Integrante / Mayara de Alencar Almeida - Integrante / Karen Stefany Conceição - Integrante.

• 2014 - 2019

  Análise transcricional por RNA-seq de Pseudomonas aeruginosa durante a produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, Descrição: Descrição: O presente projeto é motivado pela hipótese de que as altas taxas de produção de ramnolipídeos obtidas por fermentação em estado sólido (FES) estão relacionadas com estímulos ao circuito quorum sensing (QS) de P. aeruginosa proporcionados por esta tecnologia fermentativa. Esta hipótese baseia-se nas considerações: (1) a produção de ramnolipídeos por FES apresenta maiores taxas de produção; (2) a produção de ramnolipídeos é quorum-regulada; e (3) as condições fornecidas pela FES ao microrganismo podem ser capazes de estimular os circuitos QS. Com o intuito de se testar a hipótese levantada, o presente plano de trabalho tem como objetivos: (a) Fazer um estudo do transcriptoma por RNA-seq de P. aeruginosa crescendo em cultivos sólidos versus crescendo em cultivos líquidos; (b)Fazer fermentações em estado sólido utilizando substratos sólidos com potencial para estimular o circuito QS e consequentemente a produção de ramnolipídeos; e (d) Avaliar a produção das moléculas sinalizadoras dos circuitos QS durante a produção dos ramnolipídeos... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Nadia Krieger - Integrante / David Alexander Mitchell - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Helisson Faoro - Integrante / Michelle Z. Tadra-Sfeir - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / paloma bonato - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante / Josiane Alessandra Vignoli - Integrante / Cesar A.Tischer - Integrante.

• 2014 - 2017

  ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DE Pseudomonas aeruginosa NA PRODUÇÃO DE RAMNOLIPÍDEOS POR FERMENTAÇÃO EM ESTADO SÓLIDO, Descrição: Nos últimos anos os biossurfactantes têm chamado a atenção pela baixa toxicidade, biodegradabilidade, e alta aceitabilidade ecológica. No entanto, a aplicação destes compostos ainda é muito limitada, devido aos altos custos de produção. A fermentação em estado sólido apresenta-se como uma tecnologia alternativa para produção de biossurfactantes, com a importante vantagem de evitar a formação de espuma, um severo problema da produção de biossurfactantes por fermentação submersa, sem onerar o processo. Os ramnolipídeos, produzidos por Pseudomonas aeruginosa, são uma das mais importantes classes de biossurfactantes. Estes compostos possuem excelentes propriedades tensoativas e podem ser produzidos em altas concentrações. Altas taxas de produção de ramnolipídeos são obtidas por fermentação no estado sólido, no entanto muito pouco se sabe sobre as razões fisiológicas e moleculares dessa alta produção. Frente ao potencial de aplicação dos ramnolipídeos e as altas taxas de produção destes compostos produzidos por fermentação em estado sólido, o presente projeto propõe um estudo de análise de expressão gênica por PCR quantitativo e proteômica em gel unidimensional, de Pseudomonas aeruginosa, durante a produção de ramnolipídeos em fermentação no estado sólido. O intuito desta proposta é melhor entender a produção de ramnolipídeos obtidos por esta tecnologia fermentativa e promover incrementos nas taxas de produção deste tensoativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Coordenador / Maria Antonia P C Celligoi - Integrante / MARIA INES REZENDE - Integrante / André Luiz M Oliveira - Integrante.

• 2014 - 2017

  NOVAS ESTRATÉGIAS DE FERMENTAÇÃO PARA A PRODUÇÃO DE SOFOROLIPÍDEOS A PARTIR DE ÓLEOS E GORDURAS RESIDUAIS E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE SANITIZANTE EM CARCAÇAS DE FRANGO., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 13/11/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem grande potencial para aplicações em diversas áreas como: biorremediação, alimentos, cosméticos e fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, algumas estratégias tais como o uso de substratos de baixo custo (óleos e gorduras residuais) podem ser utilizadas. Apesar de possuir atividade antimicrobiana, o uso dos soforolipídeos como agentes sanitizantes ainda não foi avaliada. A contaminação microbiana das carcaças de frango prejudica a produção resultando em grandes prejuízos para o setor. Desta forma, o uso de novos agentes sanitizantes, tais como os soforolipídeos, pode reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango aumentando o tempo de prateleira da carne refrigerada. Neste sentido pesquisas que permitam desenvolver novas estratégias e protocolos para a Produção de soforolipídeos por candida bombicola em biorreator utilizando óleos e Gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e o desenvolvimento de novos sanitizantes, visando à redução da carga microbiológica, são essenciais para a redução dos custos de produção e melhora da qualidade das carcaças de frangos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver novas estratégias e protocolos para a produção de soforolipídeos por Candida bombicola em biorreator utilizando óleos e gorduras residuais (borra de refino de óleo de soja, gordura vegetal hidrogenada e óleo de soja utilizado em frituras) e avaliar a atividade sanitizante dos soforolipídeos, com a finalidade de reduzir a contaminação bacteriana de carcaças de frango, assim como aumentar do tempo de prateleira da carne de frango refrigerada.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante / AGNES MAGRI - Integrante / ANA PAULA NOVELLI - Integrante / CRISTIANI BALDO DA ROCHA - Integrante / MAYKA REGHIANY PEDRÃO - Integrante / TAMIRES MINUCELLI - Integrante.

• 2013 - 2016

  Produção de soforolipídeos por Candida bombicola ATCC 22214 utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: Os soforolipídeos são biossurfactantes produzidos principalmente pela levedura Candida bombicola - ATTC 22214. Apresentam propriedades muito semelhantes aos surfactantes de origem petroquímica e apresentam diversas vantagens sobre estes como: baixa toxicidade, maior biodegradabilidade, melhor compatibilidade ambiental, alta seletividade e atividade específica em condições extremas de temperatura, pH e salinidade. Possuem um grande potencial para aplicações em diversas áreas como: Biorremediação; Alimentos; Cosméticos e Fármacos. Apesar destas inúmeras vantagens e aplicações que os biossurfactantes possuem sobre os surfactantes de origem petroquímica, a produção em larga escala e o custo relativamente elevado, ainda são um grande obstáculo para os soforolipídeos tornarem-se competitivos economicamente. Para superar estes obstáculos, três estratégias básicas podem ser utilizadas: (a) o uso de substratos de baixo custo, como os subprodutos da cadeia do biodiesel - tortas e farelos de oleaginosas (algodão, amendoim, canola, girassol, linhaça, nabo forrageiro, mamona, milho e soja) para a formulação de meios de fermentação; (b) desenvolvimento de processo fermentativos eficientes como a fermentação em estado sólido; (c) otimização do meio e condições de cultivo utilizando metodologias estatísticas que permitem o aprimoramento e aperfeiçoamento de produtos e processos, obtendo-se níveis ótimos de produção, produtividade e redução de custos. Considerando-se o amplo campo de aplicação dos SLPs; os altos custos para a produção em larga escala de SLPs e a ampla disponibilidade de resíduos e subprodutos agroindustriais. O presente trabalho tem por objetivo principal desenvolver, avaliar e otimizar a produção de soforolipídeos por Candida bombicola (ATCC 22214?) utilizando tortas de oleaginosas através de fermentação em estado sólido, utilizando as técnicas de planejamento fatorial e análise de superfície de resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador / Marcos Roberto de Oliveira - Integrante.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Lipopolissacarídeos de Herbaspirillum ssp. Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos Lipopolissacarídeos (LPS) de Herbaspairilum ssp, uma vez que estes estão relacionados com a interação planta-bactéria. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos LPS produzidos por diferentes estirpes selvagem de Herbaspirillum, que por sua vez apresentam diferentes padrões de colonização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Sassaki, Guilherme Lanzi - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Determinação Estrutural de Exopolissacarídeos de Herbaspirillum seropedicae Envolvidos na Interação Planta-Bactéria, Descrição: Este projeto propõe um estudo dos exopolissacarídeos de Herbaspairilum seropedicae relacionados com a interação com gramíneas de interesse comercial. O projeto tem como estratégia o a determinação estrutural dos exopolissacarídeos produzidos pela estirpe selvagem deste microrganismo (SmR1), assim como de mutandes com fenótipo de interação com plantas alterado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / SANTANA FILHO, A.P. - Integrante / Guilherme L. Sassaki - Integrante / Leda Satie Chubatsu - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - 2016

  Transcriptoma da Bactéria Diazotrófica Herbaspirillum seropedicae Cultivada em Exudato de Plântulas de Triticum aestivum, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Vânia Carla Silva Pankievicz - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Proteoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Dayane Alberton - Integrante / Fabio Cordeiro - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Aplicação de processos biotecnológicos para biorremediaçãode ambientes poluídos com resíduos lipídicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Antonia Pedrine Colabone Celligoi em 10/04/2014., Descrição: A poluição ambiental é atualmente a pauta principal em muitos discursos, tanto da sociedade civil quanto dos governos, sendo considerada um problema mundial. a crescente preocupação vem mobilizando vários segmentos, governamentais ou não, para buscar alternativas que diminuam os impactos negativos à natureza. Encontrar soluções no próprio ambiente contaminado pode tornar o processo menos oneroso e menos agressivo. por exemplo, através de microrganismos que crescem em ambientes contaminados com resíduos gordurosos é possível a biorremediação a partir de lipases e biossurfactantes gerados neste ambiente. Neste contexto, este projeto pode contribuir para a descontaminação de água e solo contaminados com óleos e gorduras provenientes de indústrias, principalmente do setor alimentício, a partir da seleção de microrganismos produtores de lipases e biossurfactantes, otimização da produção destes produtos microbianos em laboratório e caracterização química para aumentar a especificidade do processo e consequentemente a sua eficiência. Além da contribuição para o meio-ambiente, o presente projeto poderá fortalecer as linhas de pesquisa existentes no programa de mestrado em biotecnologia da instituição executora, pois o programa é novo e precisa de parcerias; permitirá a participação de mais acadêmicos na iniciação científica; possibilitará o treinamento de recursos humanos para futura inserção de jovens doutores no mercado de trabalho como docentes e pesquisadores; permitirá a ampliação de publicações do mestrado e assim, a geração mais artigos científicos, firmando o brasil no cenário da pesquisa. Enfim, poderá contribuir de diferentes formas para a produção científica no mestrado, na instituição (uel) e consequentemente no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / João Batista Buzato - Integrante / Maria Antonia P C Celligoi - Coordenador.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Trigo (Triticum aestivum) e a Bactéria Diazotrófica Azospirillum brasilense, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de trigo durante a colonização por Azospirillum brasilense. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Transcriptoma da Interação entre Plântulas de Arroz (Oryza sativa) e a Bactéria Diazotrófica Endofítica Herbaspirillum seropedicae, Descrição: Este projeto propõe o estudo do transcriptoma de plantas de arroz durante a colonização por Herbaspirillum seropedicae. O projeto tem como estratégia o seqüenciamento de ?RNA? em larga escala para análise quantitativa e qualitativa dos transcritos da planta e do microrganismo em diferentes condições fisiológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Liziane Brusamarello - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Integrante., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2016

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fixação Biológica de Nitrogênio, Descrição: INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio tem como objetivo o desenvolvimento de tecnologia inovadoras da produtividade agrícola com a utilização de bactérias fixadoras de nitrogênio. O Instituto desenvolve pesquisas fundamentais em biologia molecular da fixação de nitrogênio, interação planta-bactéria, ecologia molecular de diazotrofos, seleção de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio e promotoras de crescimento vegetal e melhoramento de germoplasmas vegetais mais eficientes em fixação de nitrogênio... , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fabio de Oliveira Pedrosa - Coordenador., Financiador(es): INCT DA FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO EM GRAMÍNEAS - CNPq - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Transcriptoma de Pseudomonas aeruginosa Durante a Produção de Ramnolipídeos, Descrição: Durante o desenvolvimento do trabalho de produção de ramnolipídeos, ficou evidenciado o potencial papel do sistema quorum sensing na regulação da síntese destes compostos. Desta maneira, este projeto teve como objetivo investigar o papel deste sistema através de um estudo do transcriptoma de P. aeruginosa crescendo na presença ou na ausência de caseinato de sódio no meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Julie Neilson - Integrante / Raina M. Maier - Coordenador., Financiador(es): Grant CHE 071-4245, United State National Science - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2010

  Produção de Ramnolipídeos por Fermentação no Estado Sólido, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nadia Krieger em 25/05/2015., Descrição: Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de um processo de produção de ramnolipídeos por fermentação em estado sólido, visando a obtenção de níveis de produção comparáveis aos obtidos por fermentação submersa.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Doumit Camilios Neto - Integrante / Nadia Krieger - Coordenador / David Alexander Mitchell - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.