Paulo Roberto Branco Lins

Possui especialização em Inteligência Artificial pela Escola Politécnica de Pernambuco, Universidade de Pernambuco (2019), concebida através do Programa de Residência Tecnológica em Inteligência Artificial. O programa, que surgiu de um acordo de cooperação técnica entre FACEPE / SECTI / POLI-UPE / FITec, qualificou profissionais em modernas técnicas de inteligência artificial, a fim de desenvolver a competência técnica necessária para usar as estruturas disponíveis para resolver problemas práticos em empresas de tecnologia. Possui mestrado em Bioinformática pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2018). Possui graduação em Ciência da Computação pela Universidade Federal da Paraíba (2016). Possui graduação em Turismo pela Universidade Federal da Paraíba (2010).

Informações coletadas do Lattes em 22/09/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Mestrado em Bioinformática

2016 - 2018

Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Título: Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
, Ano de Obtenção: 2018.Junior Barrera.Coorientador: Sandro José de Souza. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: expressão gênica; miRNA; lincRNA; redes de associação; polimorfismo.Grande área: Ciências Biológicas

Especialização em Inteligência Artificial

2019 - 2019

Universidade de Pernambuco
Título: SuMCET: Support Machines on Clustered Electric Transformers
Orientador: Danilo R. B. de Araújo
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco, FACEPE, Brasil.

Graduação em Ciência da Computação

2012 - 2016

Universidade Federal da Paraíba
Título: Predição de piRNA através do deep learning
Orientador: Thaís Gaudencio do Rêgo

Graduação em Turismo

2006 - 2010

Universidade Federal da Paraíba
Título: Turismo e a Música Independente em João Pessoa
Orientador: Rosalma Diniz

Formação complementar

2012 - 2016

Extensão universitária em PET - Programa de Educação Tutorial. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal da Paraíba, UFPB, Brasil.

2011 - 2011

Design Gráfico. (Carga horária: 50h). , Fundação de Educação Tecnológica e Cultural da Paraíba, FUNETEC/PB, Brasil.

2010 - 2010

English. (Carga horária: 100h). , International Language Academy of Canada, ILAC, Canadá.

2009 - 2009

Conceitos Básicos de Cerimonial para Eventos Socia. (Carga horária: 12h). , Excelência Profissional Interativa, IPE, Brasil.

2006 - 2006

Seminário de Turismo de Aventura em Base Sustentáv. (Carga horária: 16h). , Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de João Pessoa, SEBRAE/PB, Brasil.

2001 - 2006

Inglês. (Carga horária: 480h). , Fundação Richard Hugh Fisk, FISK, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Organização de eventos

LINS, P. R. B. . XIII Semana da Computação. 2015. (Outro).

LINS, P. R. B. . XI Semana da Computação. 2014. (Outro).

LINS, P. R. B. . XII Semana da Computação. 2014. (Outro).

LINS, P. R. B. . X Semana da Computação. 2013. (Outro).

LINS, P. R. B. . Estagiário de Produção do Evento. 2009. (Festival).

LINS, P. R. B. . Recepção em Eventos. 2009. (Festival).

LINS, P. R. B. . Monitor das Exposições Inaugurais. 2008. (Outro).

Participação em eventos

The Developers Conference. 2019. (Outra).

A GENÔMICA APLICADA AO TRATAMENTO DO CÂNCER. 2017. (Simpósio).

II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.A influência de SNPs na regulação da expressão de genes com interesse farmacológico. 2017. (Simpósio).

International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite. 2017. (Congresso).

I Workshop em Bioinformática.Influence of SNPs on pharmacological interest genes expression regulation. 2017. (Outra).

I Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática. 2016. (Simpósio).

SB-MEETING 2016 - FROM ALGORITHMS TO DISEASE: TRANSLATIONAL RESEARCH IN BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY. 2016. (Encontro).

Treinamento Intel. 2016. (Simpósio).

Encontro de Estudantes RSG-Brazil. 2015. (Encontro).

Study Jams Android Fundamentals.Study Jams Android Fundamentals. 2015. (Oficina).

X-meeting + BSB.Predicting Piwi-interacting RNAs by deep learning. 2015. (Outra).

Profissional de Informática. 2011. (Outra).

IV Encontro de Software Livre da Paraíba. 2010. (Congresso).

Produções bibliográficas

  • HARRISON, PETER W ; AMODE, M RIDWAN ; AUSTINE-ORIMOLOYE, OLANREWAJU ; AZOV, ANDREY G ; BARBA, MATTHIEU ; BARNES, IF ; BECKER, ARNE ; BENNETT, RUTH ; BERRY, ANDREW ; BHAI, JYOTHISH ; BHURJI, SIMARPREET KAUR ; BODDU, SANJAY ; BRANCO LINS, PAULO R ; BROOKS, LUCY ; RAMARAJU, SHASHANK BUDHANURU ; CAMPBELL, LAHCEN I ; MARTINEZ, MANUEL CARBAJO ; CHARKHCHI, MEHRNAZ ; CHOUGULE, KAPEEL ; COCKBURN, ALEXANDER . Ensembl 2024. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 52, p. D891-D899, 2024.

  • MARTIN, FERGAL J ; AMODE, M RIDWAN ; ANEJA, ALISHA ; AUSTINE-ORIMOLOYE, OLANREWAJU ; AZOV, ANDREY G ; BARNES, IF ; BECKER, ARNE ; BENNETT, RUTH ; BERRY, ANDREW ; BHAI, JYOTHISH ; BHURJI, SIMARPREET KAUR ; BIGNELL, ALEXANDRA ; BODDU, SANJAY ; BRANCO LINS, PAULO R ; BROOKS, LUCY ; RAMARAJU, SHASHANK BUDHANURU ; CHARKHCHI, MEHRNAZ ; COCKBURN, ALEXANDER ; DA RIN FIORRETTO, LUCA ; DAVIDSON, CLAIRE . Ensembl 2023. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 51, p. D933-D941, 2023.

  • COELHO, ANA CAROLINA M. F. ; FONSECA, ANDRÉ L. ; MARTINS, DANILO L. ; LINS, PAULO B. R. ; DA CUNHA, LUCAS M. ; DE SOUZA, SANDRO J. . neoANT-HILL: an integrated tool for identification of potential neoantigens. BMC Medical Genomics , v. 13, p. 30, 2020.

  • BRANCO, Paulo ; AZEVÊDO, VICTOR MENDONÇA ; DE ARAÚJO, DANILO R. B. . SuMCET: Support Machines on Clustered Electric Transformers. REVISTA DE ENGENHARIA E PESQUISA APLICADA , v. 5, p. 27-35, 2020.

  • BRANCO, Paulo R. ; DE ARAÚJO, GILDERLANIO S. ; BARRERA, JÚNIOR ; SUAREZ-KURTZ, GUILHERME ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Uncovering association networks through an eQTL analysis involving human miRNAs and lincRNAs. Scientific Reports , v. 8, p. 15050, 2018.

  • SILVA, ARNALDO G. A. ; GOMES, HERMAN M. ; OLIVEIRA, HUGO N. ; LINS, Paulo R. B. ; LIMA, DIEGO F. S. ; BATISTA, LEONARDO V. . BioPass-UFPB: a Novel Multibiometric Database. In: 2019 International Conference on Biometrics (ICB), 2019, Crete. 2019 International Conference on Biometrics (ICB), 2019. p. 1.

  • RAMOS, THAÍS ; BATISTA, LEONARDO VIDAL ; NETO, JOSÉ ALVES MONTEIRO ; SANTOS, AELLISON ; MACHADO, KARLA ; BRANCO, Paulo . Ensino de programação para Olimpíada Brasileira de Informática. In: XXI Workshop de Informática na Escola, 2015, Maceió. org.crossref.xschema._1.Title@1d9ff7ac, 2015. p. 122.

  • BATISTA, L. V. ; DINIZ, Y. C. ; BARBOSA, I. A. M. ; MELO, M. C. ; SILVA, P. R. ; SANTOS, A. C. T. ; GAJADHAR, A. A. T. ; SAMPAIO, G. B. ; ANTUNES, I. L. ; SANTOS, I. N. ; ANDRADE JUNIOR, J. E. ; MACHADO, K. C. T. ; LINS, P. R. B. ; RAMOS, T. A. R. ; MONTEIRO, J. A. . Grupo PET de Ciência da Computação da Universidade Federal da Paraíba. In: VIII Encontro Nordestino de Grupos PET, 2014, Campina Grande. Anais VIII Encontro Nordestino de Grupos PET, 2014.

  • BATISTA, L. V. ; BARBOSA, I. A. M. ; DINIZ, Y. C. ; MELO, M. C. ; LINS, P. R. B. ; SILVA, P. R. ; SANTOS, A. C. T. ; GAJADHAR, A. A. T. ; SAMPAIO, G. B. ; SANTOS, I. N. ; ANDRADE JUNIOR, J. E. ; ANTUNES, I. L. ; MACHADO, K. C. T. ; RAMOS, T. A. R. ; MONTEIRO, J. A. . Treinamento em Introdução à Programação para Alunos Ingressantes no Curso de Bacharelado em Ciência da Computação da UFPB. In: XIII Encontro Nordestino dos Grupos PET, 2014, Campina Grande. Anais XIII Encontro Nordestino dos Grupos PET, 2014.

  • BATISTA, L. V. ; BULHOES JUNIOR, T. L. ; SILVA, A. G. A. E. ; GAJADHAR, A. A. T. ; MENESES, D. A. ; LINS, P. R. B. ; SAMPAIO, G. B. ; MACHADO, K. C. T. ; RAMOS, T. A. R. ; DINIZ, Y. C. ; VILAROUCA FILHO, J. I. B. ; DANTAS, Y. G. ; MELO, M. C. ; CARVALHO, R. B. M. ; ANDRADE JUNIOR, J. E. ; BARBOSA, I. A. M. ; SANTOS, I. N. ; ANTUNES, I. L. ; SILVA, P. R. . Curso de Informática básica para idosos. In: Encontro Unificado de Ensino, Pesquisa e Extensão, 2013, João Pessoa. Anais Encontro Unificado de Ensino, Pesquisa e Extensão, 2013.

  • LINS, P. R. B. ; MACHADO, K. C. T. ; RAMOS, T. A. R. ; MENESES, D. A. ; MONTEIRO, J. A. . Semana da Computação. In: IV EXPO PEP, 2014, Campina Grande. Anais IV EXPO PEP, 2014. p. 239-247.

  • MACHADO, K. C. T. ; LINS, P. R. B. ; DARDENNE, L. E. ; REGO, T. G. . Prediction of protein-ligand binding affinity using machine learning. In: 61º Brazilian-International Congress of Genetics, 2015, Águas de Lindóia. Anais 61º Brazilian-International Congress of Genetics, 2015.

  • LINS, P. R. B. ; MACHADO, K. C. T. ; OLIVEIRA, H. N. ; COUTINHO, V. M. ; REGO, T. G. . Detecting bacterial genomic islands using PPM. In: X-meeting + BSB - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais X-meeting + BSB - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.

  • LINS, P. R. B. ; SOUTO, M. ; BATISTA, L. V. ; REGO, T. G. ; COUTINHO, V. M. . Predicting Piwi-interacting RNAs by deep learning. In: X-meeting + BSB - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais X-meeting + BSB - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.

  • BRANCO, P. ; FONSECA, A. ; SUAREZ-KURTZ, G. ; SOUZA, S. J. . A influência de SNPs na regulação da expressão de genes com interesse farmacológico. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • BRANCO, P. ; SUAREZ-KURTZ, G. ; SOUZA, S. J. . Influence of SNPs on the regulation of expression of genes of pharmacological interest. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BRANCO, P. ; ARAUJO, G. ; SUAREZ-KURTZ, G. ; SOUZA, S. J. . Influence of SNPs on pharmacological interest genes expression regulation. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • LINS, P. R. B. ; SOUTO, M. ; BATISTA, L. V. ; REGO, T. G. ; COUTINHO, V. M. . Predicting Piwi-interacting RNAs by deep learning. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BRANCO, P. ; MACHADO, K. C. T. ; OLIVEIRA, H. N. ; BATISTA, L. V. ; REGO, T. G. . Detecting bacterial genomic islands using PPM. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

BRANCO, P. ; MACHADO, K. C. T. ; RAMOS, T. A. R. ; OLIVEIRA, F. A. . Educa SA. 2015.

Histórico profissional

Experiência profissional

2020 - 2021

ALANA AI

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: AI Research Engineer, Carga horária: 40

2019 - 2020

Fundação para Inovações Tecnológicas

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Espec. em Des. de Software (PL), Carga horária: 40

Outras informações:
Desenvolvimento e manutenção do BLAT, sistema de auditorias da Ericsson (Índia). O sistema é escrito em JAVA e utiliza tecnologias como Primefaces, Spring, Hibernate e JSF. Responsabilidades: Coordenar o time de desenvolvimento; Refatorar antigas funcionalidades; Desenvolver novas funcionalidades; Identificar possíveis falhas no código. Idealização e implementação de abordagens de Inteligência Artificial. Responsabilidades: Coordenação da equipe de residentes; Concepção e Desenvolvimento de algoritmo preditor de falha de transformadores da rede elétrica; Concepção e Desenvolvimento de algoritmo classificador, com base no sinal do telefone, do ambiente do usuário; Utilização da linguagem Python com o suporte das bibliotecas: Tensorflow, Scikit-learn, numpy, pandas, entre outras; Aplicação de algoritmos de classificação e regressão (Ex.: Rede neural, Random Forest, SVM, Boosting), otimização (Ex.: FishSchool Search, Ant colony, Particle Swarm) e clusterização (Ex.: Fuzzy, Adaptative Clustering, KNN, K-means

2016 - 2018

Bioinformatics Multidisciplinary Environment

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor

Outras informações:
Identificar variantes localizadas em regiões reguladoras, que tiveram influência putativa no nível de expressão de genes patológicos e / ou genes de interesse farmacológico e fornecer uma visão sistêmica da paisagem relatada por meio de redes de associação. Responsabilidades: Programação usando Python, R, Perl, Bash e SQL; Operação de sistemas baseados em UNIX; Trabalhar com big data; Desenvolvimento de gasodutos de trabalho usando GIT e Docker; Apresentar o projeto em conferências.

2015 - 2016

Laboratório de Visão Computacional

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor

Outras informações:
Desenvolvimento de um preditor de RNA interagindo com piwi usando redes neurais artificiais. Responsabilidades: Programação usando MatLab e Python; Operação de sistemas operacionais baseados em UNIX; Trabalhar com dados biológicos; Apresentar o projeto em conferências.

2015 - 2016

Laboratório de Aplicações de Vídeo Digital

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor, Carga horária: 20

Outras informações:
Desenvolvimento do aplicativo Quero Ver Cultura. Uma plataforma de vídeo sob demanda para a televisão digital financiada pelo governo federal brasileiro. Responsabilidades: Programação usando NCL-Lua e Java; Trabalhar com grandes mídias em um ambiente de programação que requer otimização de código e resposta em tempo real; Codificação com uma grande equipe de programadores em um único projeto.

2021 - Atual

European Bioinformatics Institute

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 39