Jorge Hernandez Fernandez

Pós-doutorado

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• MATTOS, A. R. ; de A. Filho, João Luiz ; FERNANDEZ, J.H. . Identification of Hypericin as a Candidate Repurposed Therapeutic Agent for COVID-19 and Its Potential Anti-SARS-CoV-2 Activity. Frontiers in Microbiology , v. 13, p. 828984, 2022.

• DA ROCHA, DAVID GITIRANA ; Fernandez, Jorge Hernandez ; DE ALMEIDA, CLÁUDIA MARIA COSTA ; DA SILVA, CLÁUDIA LETÍCIA ; MAGNOLI, FÁBIO CARLOS ; DA SILVA, OSMAIR ÉLDER ; DA SILVA, WILMAR DIAS . Development of IgY antibodies against anti-snake toxins endowed with highly lethal neutralizing activity. EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES , v. 106, p. 404-412, 2017.

• DA ROCHA, DAVID GITIRANA ; Fernandez, Jorge Hernandez ; DE ALMEIDA, CLAUDIA MARIA COSTA ; DA SILVA, CLAUDIA LETÍCIA ; MAGNOLI, FABIO CARLOS ; DA SILVA, OSMAIR ÉLDER ; DA SILVA, WILMAR DIAS . The complementarity-determining region sequences in IgY antivenom hypervariable regions. DATA IN BRIEF , v. 13, p. 717-722, 2017.

• FERRAZ, F.B. ; FERNANDEZ, J.H. . Selection and validation of reference housekeeping genes in the J774A1 macrophage cell line for quantitative real-time PCR. Genetics and Molecular Research , v. 15, p. 7720, 2016.

• DUARTE, SHAYTNER ; ANDRADE, DALCIO ; SHIMODA, EDUARDO ; FERNANDEZ, JORGE ; JR, MANUEL . Scientific Areas of Fish Nutrition and Enzymatic Activity: Bibliometric Analysis of World's and Brazilian's Publications in PubMed and SCOPUS Database.. Journal of Veterinary Advances , v. 4, p. 1, 2014.

• FERRAZ, F. B. ; Fernandez, Jorge H. . Integrinas na adesão, migração e sinalização celular: associação com patologias e estudos clínicos.. Revista Científica da Faculdade de Medicina de Campos , v. 9, p. 25-34, 2014.

• Costa, Evenilton P. ; Campos, Eldo ; de Andrade, Caroline P. ; Façanha, Arnoldo R. ; Saramago, Luiz ; Masuda, Aoi ; da Silva Vaz, Itabajara ; Fernandez, Jorge H. ; Moraes, Jorge ; Logullo, Carlos . Partial characterization of an atypical family I inorganic pyrophosphatase from cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Veterinary Parasitology (Print) , v. 184, p. 238-247, 2012.

• Lopes-Ferreira, Mônica ; Magalhães, Geraldo Santana ; Fernandez, Jorge Hernandez ; Junqueira-de-Azevedo, Inácio de Loiola M. ; Le Ho, Paulo ; Lima, Carla ; Valente, Richard H. ; Moura-da-Silva, Ana Maria . Structural and biological characterization of Nattectin, a new C-type lectin from the venomous fish Thalassophryne nattereri. Biochimie (Paris. Print) , v. 93, p. 971-980, 2011.

• Conceição, Katia ; Bruni, Fernanda Miriane ; Santos, Juliane M. ; Lopes, Robson Melo ; Marques, Elineide E. ; Fernandez, Jorge H. ; Lopes-Ferreira, Mônica . The action of fish peptide Orpotrin analogs on microcirculation. Journal of Peptide Science (Print) , v. 17, p. 192-199, 2011.

• Nascimento, Viviane Veiga Do ; Castro, Helena Carla ; Abreu, Paula Alvarez ; Oliveira, Anto?nia Elenir Ama?ncio ; Fernandez, Jorge Hernandez ; Arau?jo, Juce?lia Da Silva ; Machado, Olga Lima Tavares . In Silico Structural Characteristics and -Amylase Inhibitory Properties of Ric c 1 and Ric c 3, Allergenic 2S Albumins from Ricinus communis Seeds. Journal of Agricultural and Food Chemistry , v. 59, p. 4814-4821, 2011.

• GENTILE, A. ; DITT, R. F. ; TAVARES, R. G. ; CAMARGO, S. R. ; FERNANDEZ, J. H. ; SILVA, M. J. ; Menossi, Marcelo . Analysis of the stress-inducible transcription factor SsNAC23 in sugarcane plants. Scientia Agrícola (USP. Impresso) , v. 68, p. 395-509, 2011.

• SOUZA, T. B. ; DUARTE, L. P. ; FERNANDEZ, J. H. ; Medina-Acosta E. . Farmacogenética do desenvolvimento de anticorpos inibidores do fator VIII na hemofilia A. Revista Científica da Faculdade de Medicina de Campos , v. 6, p. 7-13, 2011.

• Conceição, Katia ; Santos, Juliane M. ; Bruni, Fernanda M. ; Klitzke, Clécio F. ; Marques, Elineide E. ; Borges, Márcia H. ; Melo, Robson L. ; Fernandez, Jorge H. ; Lopes-Ferreira, Mônica . Characterization of a new bioactive peptide from Potamotrygon gr. orbignyi freshwater stingray venom. Peptides (New York, N.Y. 1980) , v. 30, p. 2191-2199, 2009.

• Bernardes, Juliana S ; FERNANDEZ, J. H. ; Vasconcelos, Ana Tereza R . Structural descriptor database: a new tool for sequence based functional site prediction. BMC Bioinformatics , v. 9, p. 492, 2008.

• FERNANDEZ, J. H. ; Mello M. O. ; Tanaka A.S ; Silva-Filho M. ; NESHICH, G. . PROTEINASE INHIBITION USING SMALL BOWMAN-BIRK TYPE STRUCTURES. Genetics and Molecular Research , v. 6, p. 1-20, 2007.

• FERNANDEZ, J ; SILVA, C ; ASSAKURA, M ; CAMARGO, A ; SERRANO, S . Molecular cloning, functional expression, and molecular modeling of bothrostatin, a new highly active disintegrin from venom. Biochemical and Biophysical Research Communications , v. 329, n.2, p. 457-464, 2005.

• Nogueira T.S.F. ; Schlögl P.S. ; Camargo S.R. ; FERNANDEZ, J. H. ; De Rosa Jr. V. E. ; Pompemayer P. ; Arruda P. . SsNAC23, a member of the NAC domain protein family, is associated with cold, herbivory and water stress in sugarcane. Plant Science (Limerick) , v. 169, p. 93-106, 2005.

• Cançado, Geraldo M. A. ; De Rosa, Vicente E. ; Fernandez, Jorge H. ; Maron, Lyza G. ; Jorge, Renato A. ; Menossi, Marcelo . Glutathione S-transferase and aluminum toxicity in maize. Functional Plant Biology (Print) , v. 32, n.11, p. 1045, 2005.

• FERNANDEZ, J. H. ; NESHICH, G. ; CAMARGO, A C M . Using Bradykinin potentiating peptide (BPPs) structures to develop new antihypertensive drugs. Genetics and Molecular Research , v. 3, n.4, p. 554-563, 2004.

• FERNANDEZ, J . Structural basis of the lisinopril-binding specificity in N- and C-domains of human somatic ACE. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , v. 308, p. 219-226, 2003.

• FERNANDEZ, J. H. ; DADASHEV SIA ; BOGDANOV, I. F. ; KARPOVA H.I. ; MIL'SHINA NV ; PENKINA M.V. ; RADCHENKO IV, . Features of the primary structure of synaptonemal complex DNA of the golden hamster .. Mol Biol (Mosk). 3:512-21., Moscou, v. 3, p. 512-521, 1995.

• de Almeida Filho, João Luiz ; Fernandez, Jorge Hernandez . MDR SurFlexDock: A Semi-automatic Webserver for Discrete Receptor-Ensemble Docking. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2020, v. 11347, p. 41-47.

• de A. Filho, João Luiz ; del Real Tamariz, Annabell ; Fernandez, Jorge H. . AutoModel: A Client-Server Tool for Intuitive and Interactive Homology Modeling of Protein-Ligand Complexes. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2018, v. 11228, p. 78-89.

• Rocha, Gustavo Lemos ; Fernandez, Jorge Hernandez ; Oliveira, Antonia Elenir Amancio ; Fernandes, Kátia Valevski Sales . Programmed Cell Death-Related Proteases in Plants. In: Murat Senturk. (Org.). Enzyme Inhibitors and Activators. 978ed.: InTech, 2017, v. , p. 25-.

• Coronado M. A. ; EBERLE, R. J. ; MORAES, F. R. ; Fernandez, Jorge H. ; PEREIRA, E. G. ; LIRA, A. ; RAGHUVIR, A. K. . Evolution, Structural Features, and Biochemical Diversity of Snake Venom Serine Proteinases. In: Uri N. Utkin; Arcadius V. Krivoshein. (Org.). Snake Venoms and Envenomation: Modern Trends and Future Prospects. 1ed.New York: Nova Science Publishers INC, 2016, v. , p. 169-213.

• ALMEIDA FILHO, JOÃO L. DE ; Fernandez, Jorge H. . HTP SurflexDock: a web tool for Structure-Based Virtual Screening analysis based on the Ensemble Docking protocol. In: Brazilian eScience Workshop, 2022, Brasil. Anais do XVI Brazilian e-Science Workshop (BRESCI 2022), 2022. p. 81.

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; FERNANDEZ, J.H. . MDR SurFlexDock: A Semi-automatic Webserver for Discrete Receptor-Ensemble Docking. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2019, Fortaleza. BSB 2019: Advances in Bioinformatics and Computational Biology, 2019.

• PASCHOAL, A. R. ; NETTO, D. S. ; NICOLAS, M. F. ; FERNANDEZ, J. H. . Homodimeric Structure of B. japonicum D-NCAase. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

• da Silveira A. R. ; FERNANDEZ, J. H. ; Caffarena E. ; Savino W. ; Vasconcelos A. T. R. . Structural model for alpha6beta1 integrin and dynamics of interaction with small ECD based ligands... In: Swiss Prot 20 years, 2006, Fortaleza. Swiss Prot 20 years.

• Coronado M. A. ; da Silveira A. R. ; Savino W. ; Vasconcelos A. T. R. ; FERNANDEZ, J. H. . Model of ADAMs disintegrin-like domain and Dynamics of Interaction with a6b1.. In: Swiss Prot 20 years, 2006, Fortaleza. Swiss Prot 20 years.

• FERNANDEZ, J. H. ; Serrano S.M. ; Savino W. ; Vasconcelos A. T. R. . Bothrostatin, a new RGD-type disintegrin from Bothrops jararaca venom: binding specificity in bothrostatin-IIb3/v3 integrin complexes.. In: 3D SIG, 2006, Fortaleza. 3D SIG.

• FERNANDEZ, J. H. ; Rioli V. ; NESHICH, G. ; Ferro E. S. ; Portaro F.C. ; CAMARGO, A C M . Dynamics of catalysis and inhibition in oligopeptidases: Natural peptide structures as promising antihypertensive agents.. In: ISMB 2006, 2006, Fortaleza. ISMB 2006.

• Fernandez, Jorge H. . Desintegrin-like domains in computer aided drug design of integrin-specific inhibitors. In: ISCB Latin America 2012, 2012, Santiago de Chile. ISCB Latin America 2012, 2012.

• GITIRANA DA ROCHA, D ; Almeida, C.M.C ; FERNANDEZ, J. H. ; SILVA, W. D. . IgY Antisnake Venom Antibodies With High Avidity Appear Latter Along the Immunization Procedure. In: 10th Meeting of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2010, San José. 10th Meeting of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2010.

• FERNANDEZ, J. H. ; HAYASHI, Mirian A F ; NESHICH, G. ; CAMARGO, A C M . DYNAMICS OF THE HUMAN ACE INHIBITION BY BPPs: N- AND C- DOMAIN RESIDUES DEFINING INHIBITION SPECIFICITY. In: International Symposium of Vasoactive Peptides, 2004, Ouro Preto. International Symposium of Vasoactive Peptides, 2004.

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; FERNANDEZ, J.H. . HTP SurflexDock 1.2: Improving SBVS campaign by including the post-processing stage. In: Special Interest Group:Drug-Design, 2020. Special Interest Group:Drug-Design, 2020. p. 13.

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; Fernandez, Jorge H. . Using MDR SurFlexDock for enhanced protein surface structural sampling in docking experiments. In: IX Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2018, Petropolis. IX EMMSB Scientific Program, 2018.

• Fernandez, Jorge H. ; EVARISTO, J. A. M. ; ALMEIDA FILHO, J. L. ; PERALES, J. H. ; OLIVARES, F. L. . Metadynamics studies of arginine gate in the major porin-like outher-membrane protein of G diazotrophicus. In: XLII Brazilian Biophysical Society Congress, 2017, Santos, SP. Scientific Program, 2017.

• Fernandez, Jorge H. . New insights in oligopeptidases inhibition. In: ISCB Latin America 2016, 2016, Buenos Aires. ISCB LA 2016 Scientific Program, 2016.

• CUNHA, P. M. ; FERRAZ, F. B. ; Fernandez, Jorge H. . In vitro inhibition of B16F10 lineage adhesion to fibronectin by integrin antagonist peptide. In: VIII International Symposium on Extracelular Matrix, 2015, Buzios. Annals of VIII International Symposium on Extracelular Matrix, 2015.

• FERRAZ, F. B. ; CUNHA, P. M. ; Fernandez, Jorge H. . Using alpha6beta1-antagonist to dowregulate macrophages adhesion, migration and proliferation on Laminin. In: VIII International Symposium on Extracelular Matrix, 2015, Buzios. Annals of VIII International Symposium on Extracelular Matrix, 2015.

• Fernandez, Jorge H . Computer aided drug design of integrin-specific inhibitors. In: IX Congress of Chemical Sciences, Technology and Innovation, 2015, Havana. QuimCuba 2015 Scientific Program, 2015.

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; Fernandez, Jorge H. . AutoModel, a graphical interface for protein homology modeling: Refining loops and remote access.. In: VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014, Petropolis. 7 EMMSB 2014, 2014.

• FRAGA, H. M. ; Fernandez, Jorge H. . Comparative analysis of free docking programs in experimental conditions: cations in the surface. In: VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014, Petropolis. 7 EMMSB 2014, 2014.

• FERRAZ, F. B. ; CUNHA, P. M. ; Fernandez, Jorge H. . Modulation of cell migration associated with integrin specific peptides. In: XVII meeting of the Brazilian society for Cell Biology, 2014, Foz do Iguazu. Annals of XVII meeting of the Brazilian society for Cell Biology, 2014.

• FERRAZ, F. B. ; CUNHA, P. M. ; Fernandez, Jorge H. . In vitro evaluation of cyclic peptides action in B16-F10 cell adhesion to fibronectin. In: XVII meeting of the Brazilian society for cell Biology, 2014, Foz do Iguazu. Annals of XVII meeting of the Brazilian society for Cell Biology, 2014.

• CUNHA, P. M. ; FERRAZ, F. B. ; Fernandez, Jorge H. . Influencia de peptídeos cíclicos A9(x) na adesão in vitro da linhagem metastática B16-F10 à Fibronectina. In: VIII Simpócio de Oncologia, 2014, Rio de Janeiro. Anais do VIII Simpócio de Oncologia, 2014.

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; Fernandez, Jorge H. . AUTOMODEL: Interactive service for protein modeling.. In: X-Meeting BSB 2013, 2013, Recife. X-Meeting 2013, 2013.

• FERRAZ, F. B. ; Fernandez, Jorge H. . Molecular basis of cell adhesion associated with laminin and fibronectin.. In: VII International Symposium on extracellular matrix, 2013, Buzios. SIMEC 2013, 2013.

• FRAGA, H. M. ; Fernandez, Jorge H. . Molecular aspects of docking integrin inhibitors. In: X-Meeting BSB 2013, 2013, Recife. X-Meeting 2013, 2013.

• Coronado M. A. ; Vasconcelos A. T. R. ; Savino W. ; Lopes-Ferreira, Mônica ; Fernandez, Jorge H. . Blocking integrins: looking for desintegrin based specific inhibitors. In: Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2011, 2011, São Jose do Rio Preto. Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2011, 2011.

• FERNANDEZ, J. H. . Molecular insights in blocking integrins. In: XI Congresso da Sociedade Brasileira de Toxinologia, 2010, Araxa. XI Congresso da Sociedade Brasileira de Toxinologia, 2010.

• Costa E. P. ; L., S. ; CAMPOS, E. ; Andrade C.P. ; FACANHA, A. R. ; MASUDA, A. ; VAZ, I. S. J. ; FERNANDEZ, J. H. ; LOGULLO, C. J. . Structural and Biochemical Characterization of a New Inorganic Pyrophosphatase from the Cattle Tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: XXXVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2009, Águas de Lindóia. Program and Index, 2009.

• FERNANDEZ, J. H. ; Coronado M. A. ; Savino W. ; CAMARGO, A ; Vasconcelos, Ana Tereza R . Modeling the dynamics of integrin recognition. In: X meeting 2007, 2007, São Paulo. Abstract Boklet and Program, 2007. p. 31-33.

• FERNANDEZ, J. H. ; NESHICH, G. ; CAMARGO, A C M . BRADYKININ POTENTIATING PEPTIDE (BPP) STRUCTURES AS SPECIFIC ANTIHIPERTENSIVE DRUGS. In: Reunião Cientifica do Instituto Butantan, 2005, São paulo. Reunião Cientifica do Instituto Butantan, 2005.

• Rioli V. ; FERNANDEZ, J. H. ; Prezoto B.C. ; Melo R. L. ; Konno K. ; Ferro E. S. ; CAMARGO, A C M ; Portaro F.C. . SEARCH FOR NEW METALLO-OLIGOPEPTIDASES EP24.15 AND EP24.16 INHIBITORS IN BOTHROPS JARARACUÇU VENOM. In: XX FESBE, 2005, Aguas de lindoya. XX FESBE, 2005.

• FERNANDEZ, J. H. ; NESHICH, G. ; CAMARGO, A C M . USING BRADYKININ POTENTIATING PEPTIDE (BPPs) STRUCTURES TO DEVELOP NEW ANTIHIPERTENSIVE DRUGS. In: ICoBiCoBi 2004, 2004, Angra dos Reis. ICoBiCoBi 2004, 2004.

• FERNANDEZ, J. H. ; HAYASHI, M. ; NESHICH, G. ; CAMARGO, A C M . IN SILICO MODEL FOR HUMAN sACE SUBSTRATE BINDING: STRUCTURAL PARAMETERS DEFINING N- AND C- DOMAIN SUBSTRATE SPECIFICITY.. In: I São Paulo Research Conference in Molecular Medicine, 2003, São Paulo. I São Paulo Research Conference in Molecular Medicine, 2003.

• FERNANDEZ, J. H. ; Ottoboni L.M.M. . Differential gene expression in the zygotic embryo of Araucaria angustifolia.. In: Congresso Nacional de Genetica, 2000, Aguas de Lindoia. Genetics and Molecular Biology, 2000. v. V. 23. p. 440-440.

• FERNANDEZ, J. H. ; Ottoboni L.M.M. . Caracterização das principais proteínas de reserva de A. angustifolia. In: 44 Congresso Nacional de Genética, 1998, Aguas de Lindoya. 44 Congresso Nacional de Genética.

• FERNANDEZ, J. H. ; GUERRA, M. P. ; SILVEIRA, V. . Introduction and long-term stabilization of polyembryogenic cell lines of the Brazilian pine (A. angustifolia Bert O. Ktze.). In: II Cuban Congress of Biotecnology, 1997, Habana. II Cuban Congress of Biotecnology, 1997.

• FERNANDEZ, J. H. ; GUERRA, M. P. ; SILVEIRA, V. . Zygotic and somatic polyembryogenesis in A. angustifolia: Morfogenesis and cytogenetics.. In: Congresso Nacional de Genetica, 1996, Caixambu. Genetics and Molecular Biology, 1996.

• FERNANDEZ, J. H. ; Ottoboni L.M.M. . Diferential expression in A. angustifolia zygotic embryo. Genetics and Molecular Biology , v. 23, n.3, p. 440, 2000.

• Fernandez, Jorge H. . Computer aided drug design of integrin-specific inhibitors. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fernandez, Jorge H. . Computer aided drug design of integrin-specific inhibitors. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA FILHO, J. L. ; Fernandez, Jorge H . AutoModel: new tool for interactive protein homology modeling. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fernandez, Jorge H. . Desintegrin-like domains in computer aided drug desing of integrin-specific inihibitors. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDEZ, J. H. . Storage protein as secondary line of defense in plants. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Coronado M. A. ; Vasconcelos, Ana Tereza R ; Lopes-Ferreira, Mônica ; Savino W. ; Fernandez, Jorge H. . Blocking integrins: looking for desintegrin based specific inhibitors. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• GITIRANA DA ROCHA, D ; Almeida, C.M.C ; Silva, C.L. ; FERNANDEZ, J. H. ; SILVA, W. D. . IgY antisnake venom antibodies with high avidity appear latter along the immunization procedure. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDEZ, J. H. . Structural model for integrin-ligand interaction. Dynamics of alphaIIbbeta3 AND alpha6beta1 inhibition.. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDEZ, J. H. . Modeling protein-ligand complexes.. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fernandez, Jorge H. . Integrin inhibition and applications in cancer research. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDEZ, J. H. . Integrin structure-function relationships.. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fernandez, Jorge H. . ECM, Integrins and Cell Signalling. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDEZ, J. H. . Toxinology in drug Discovery: ?in silco? approach.. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDEZ, J.H. ; NESHICH, G. . Utilização de Alinhamento Estrutural de Proteínas no Estudo de Interface Forming Residues de Proteína-quinases com Inibidores Protéicos. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária Área de Comunicação e Negócios (ACN), 2002 (Comunicado Técnico).

• FALCAO, P. K. ; SIRQUEIRA NETO, J. L. ; FERNANDEZ, J.H. ; HIGA, R. H. ; BAUDET, C. ; NESHICH, G. . Primeiro Curso STING Millennium Suite Chemogenomics: Ferramentas para Analisar Macromoleculares e Aplicac~oes em Chemogenomics. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002 (Documento tecnico).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2011 - Atual

  DESENHO DE INIBIDORES ALTAMENTE ESPECÍFICOS DE INTEGRINAS E APLICAÇÃO ANTI-INFLAMATÓRIA EM MODELO DE ISQUEMIA CEREBRAL, Descrição: A estratégia geral pretendida nesta proposta é: 1) síntese de inibidores desenhados no nosso grupo com ação comprovada sobre a movimentação de linfócitos murinos; 2) desenho ?in silico? de novos inibidores protéicos antagonistas de integrinas relacionadas com migração de leucócitos; 3) testes ?in vitro? da ação capacidade de bloqueio destes inibidores da movimentação de leucócitos (linfócitos, macrófagos e neutrófilos) no modelo do transwell; 4) tentativa de inibição da migração de neutrófilos com os inibidores propostos em modelo de lesão isquêmica do Sistema Nervoso Central (SNC) e verificação do possível efeito neuroprotetor, como a redução da neurodegeneração e da extensão da lesão.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Hernandez Fernandez - Coordenador.

• 2008 - Atual

  Dinamica da interação entre proteinas e ligantes, Descrição: O acesso à estrutura tridimensional de macromoléculas contribui para o desenvolvimento do conhecimento da Bilogia, Fisiologia e Evolução dos seres vivos, e ainda nos auxilia no desenvolvimento de novos fármacos e agroquímicos. Através do estudo de diversas estruturas dentro de uma família de proteínas é possível identificar sítios evolutivamente conservados (prováveis candidatos para a ligação de inibidores). Compostos utilizados em quimioterapia e farmacologia; são importantes para o controle biológico de sinalização celular e também podem atuar como inseticidas. Pretende-se utilizar ferramentas de modelagem computacional para identificar estruturas candidatas que sejam inibidoras potenciais de proteína importantes na fisiologia e desenvolvimento de espécies de importância ecologia e econômica para o Brasil.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Hernandez Fernandez - Coordenador.

• 2003 - 2006

  Desenvolvimento de Farmacos, Descrição: O CAT proporciona condições para uma abordagem multidisciplinar na investigação de toxinas animais e de microorganismos, utilizando os recursos de laboratórios contendo pessoal qualificado e equipamentos de última geração, buscando a auto-suficiência tecnológica. São utilizados tanto os recursos já existentes no Instituto Butantan, como também aqueles das instituições parceiras, como da USP (Instituto de Ciências Biomédicas, Museu de Zoologia e Centro de Biologia Marinha-IB) e UNESP (Laboratório de Química Estrutural e Zooquímica, Rio Claro; Laboratório de Cristalografia, São José do Rio Preto). As principais atividades de pesquisa que estão sendo desenvolvidas envolvem toxinas que atuam: (1) no sistema cardio-vascular, em particular anti-hipertensivas (2) no sistema de coagulação do sangue (3) sobre tecidos excitáveis (bloqueadores de canais iônicos, entre outras) (4) no sistema imune e em processos inflamatórios (ação sobre o sistema de complemento) (5) na percepção dolorosa (analgésicos) (6) no sistema digestivo (toxinas bacterianas causadoras de diarréria) (7) no crescimento tumoral e processos metastásticos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Jorge Hernandez Fernandez - Coordenador / Antonio C M Camargo - Integrante.

• 2002 - 2004

  Modelagem e Dinámica Molecular de proteínas, Descrição: O acesso à estrutura tridimensional de macromoléculas contribui para o desenvolvimento de novos fármacos e agroquímicos. Através do alinhamento de diversas estruturas dentro de uma família de proteínas é possível identificar sítios (prováveis candidatos para a ligação de inibidores). Visando o desenvolvimento de descritores estruturais que determinem a especificidade enzimática de famílias protéicas em interação com inibidores, e o estudo de características específicas da evolução molecular destas proteínas, serão estruturalmente alinhadas 50 estruturas não redundantes de proteína quinases e serino-proteases depositadas no PDB. Compostos utilizados em quimioterapia e farmacologia; são importantes para o controle biológico de sinalização celular e também podem atuar como inseticidas. Pretendemos utilizar ferramentas de modelagem computacional para identificar candidatos nestas classes de produtos que sejam inibidores potenciais de proteína quinases e de serino proteases. Objetivos e metas: 1-Criar bases atualizadas de dados com estruturas tridimensionais de proteína quinases e de serino proteases 2-Identificar alvos comuns para a ligação de inibidores 3-Fazer cálculos de Interface Forming Residues (IFR) e finger print match para a ligação destes compostos nos alvos identificados nas proteínas das famílias escolhidas. 4-Prever, através de cálculos, mutações estruturais nestes inibidores para obter um melhor encaixe: inibidor-alvo protéico com conseqüente maior constante de inibição. Para cumprir os objetivos listados será necessário atingir as seguintes metas: 1-Aperfeicuar a utilização do sistema operacional UNIX-Irix para uso das ferramentas: Modeller, Prism, AutoDock e SMS. 2-Automatizar a utilização do software Prism no alinhamento estrutural de proteínas pertencentes a uma mesma famílias protéica, com conseqüente identificação dos alvos para as drogas que são comuns para toda família protéica sobre a investigação. 3-Utilizar o programa Modeller par. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Jorge Hernandez Fernandez - Coordenador.