Raghuvir Krishnaswamy Arni

Full professor (Professor Titular), Multiuser Center for Biomolecular Innovation, Department of Physics, IBILCE/UNESP. A BA and a MA from Bangalore University, India was followed by a BSc and MSc at the Technical University Berlin under the guidance of Prof. K. Langer and a PhD (Dr. rer. nat.) in protein crystallography jointly at the Technical University Berlin and Free University Berlin under the guidance of Prof. W. Saenger. Visiting scholar(D. Tsernoglou) and research associate in the Biological Structures Division at the European Molecular Biology Laboratory-Heidelberg (P. Metcalf) and Michigan State University (A. Tulinsky). Visiting professor at the Department of Physics, USP, São Carlos (Y.P. Mascarenhas), Department of Chemistry, Michigan State University (A. Tulinsky) and the Department of Biochemistry, Michigan State University (J. Preiss). Served as a vice-director of the Center for Applied Toxinology CAT/CEPID (Director A.C.M. Camargo). Director Multiuser Center for Biomolecular Innovation. Research areas: structural molecular biology, biochemistry, biophysics, crystallography, NMR with emphasis on blood coagulation, toxins, plant viral proteins, industrial and bacterial enzymes. Ad-hoc assessor for national and international research funding organizations, editorial board member of 5 international scientific journals and assessor of scientific journals, external international thesis examiner. Presented talks and organised events at leading institutions in Europe, USA and India. Research guide in the post-graduate courses in Molecular Biophysics and Microbiology. CNPq national research scholar level 1A. Currently serving as a member of the FAPESP area coordenation BIO II

Informações coletadas do Lattes em 09/11/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Cristalografia

1984 - 1987

Technische Universität Berlin, TUBerlin
Título: Refinement of the Structure of the Ribonuclease T1 *2'GMP complex at 1.9 A Resolution
Orientador: Wolfram Saenger
Bolsista do(a): Deutsche Forshungs Gesselshaft, DFG, Brasil. Palavras-chave: Aspergillus oryzae; Ribonuclease T1; Guanosine mono phosphate; Radiação Síncrotron; Cristalografia; Refinamento. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: Cristalografia de Proteínas. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.

Mestrado em Cristalografia e Mineralogia

1982 - 1984

Technische Universität Berlin, TUBerlin
Título: Zur Kristallchemie des Mn 3+ in Silikaten: die Strukturen von Koexistierenden Piemontit und Thulit und von Mn 3+ - fuhrendem Granat, Ano de Obtenção: 1984
Orientador: Klaus Langer
Bolsista do(a): Deutsche Forshungs Gesselshaft, DFG, Brasil. Palavras-chave: Cristalografia; Silicato; Estrutura.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Recursos Minerais.

Mestrado em Master of Arts

1975 - 1977

Bangalore University, BU, Índia
Título: X, Ano de Obtenção: 1977

Graduação em Cristalografia e Mineralogia

1978 - 1981

Technische Universität Berlin, TUBerlin

Graduação em Bachelor of Arts

1972 - 1975

Bangalore University, BU, Índia

Pós-doutorado

1997

Livre-docência. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Título: Fosfolipases A2: Aspectos Estruturais, Ano de obtenção: 1997., Grande área: Ciências Biológicas

1991 - 1992

Pós-Doutorado. , Michigan State University, MSU, Estados Unidos. , Bolsista do(a): National Institute Of Health, NIH, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

1989 - 1991

Pós-Doutorado. , European Molecular Biology Laboratory, EMBL, Alemanha. , Bolsista do(a): European Molecular Biology Laboratory, EMBL, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

1987 - 1989

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Hindi

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Cristalografia de Proteínas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Purificação de Proteínas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Estrutura e Função.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biofísica Molecular.

Organização de eventos

Arni, R. K. ; NERY, J. G. ; SOUZA, F. P. ; RUGGIERO NETO, J. ; MELO, F. . Curso de Difusão do Conhecimento "2ª. Escola de Biofísica Molecular: Ressonância Magnética Nuclear (RMN) aplicada a biofísica das moléculas da vida: uma abordagem experimental, teórica e computacional". 2014. (Outro).

Betzel, Christian ; Arni, R. K. . 15th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules. 2014. (Congresso).

ARNI, R.K. . Curso de Difusão do Conhecimento "1a. Escola de Biofísica Molecular: O papel da biofísica no século 21 na área de saúde e geração de energia limpa e renovável". 2013. (Outro).

Arni, R. K. . 5th. International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function. 2012. (Outro).

DRIGO FILHO, E. ; SOUZA, F. P. ; Arni, R. K. ; CARVALHO, S. J. de ; CABRAL, H. ; Alves, N. A. . Simpósio Interdisciplinar de Física + BIoinformática. 2011. (Congresso).

Arni, R. K. ; MURTHY, M. R. N. . Joint Indo-Brazil Symposium on Macromolecular Crystallography. 2009. (Congresso).

Arni, R. K. . International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function. 2008. (Congresso).

Participação em eventos

III Escola da Biofísica Molecular.Mecanismo e Estratégia de Inibição Enzimática. 2017. (Simpósio).

V Semana da Física. 2016. (Outra).

Fifth annual conference of Toxinology Society of India's (TSICON 2015). Structural Analysis of Snake Venom Serine Proteinases. 2015. (Congresso).

IST 2015 Oxford; The 18th. World Congress of the International Society on Toxinology. Structural Analysis of Snake Venon Serine Proteinases. 2015. (Congresso).

Enzime Mechanisms by Biological Systems EMBO. Catalytic mechanisms of Sphingomyelinase D. 2014. (Congresso).

FAPESP WEEK MUNICH, New Research Colaborations with São Paulo, Brazil.Enzyme mechanisms and inhibition by mimicry. 2014. (Simpósio).

Impacto da cristalografia nas diferentes áreas da ciência.Contribuições para a Biologia/Medicina. 2014. (Oficina).

Advanced school on Synchrotron Radiation Techniques and nanotechnology: a synergic approach to the Life Sciences and Medicine.. Purification and structural characterization of snake venom proteins.. 2013. (Congresso).

XI Congress of the Pan American Section of the International Society on Toxinology and the XII Congress of the Brazilian Society of Toxinology. Structural and computational studies of the catalytic mechanism of sphingomyelinase d from loxosceles intermedia spider venom.. 2013. (Congresso).

XI Congress of the Pan American Section of the International Society on Toxinology and the XII Congress of the Brazilian Society of Toxinology. Crystals structure of a class P-III metalloproteinase from Bothrops moojeni venom.. 2013. (Congresso).

1o. Workshop em Biofísica Molecular. Corynobacterium pseudotuberculosis, mechasnisms and pathway. 2012. (Congresso).

5th. International Symposium of Recent Trends in Macromolecular Structure and Function.Functional and structural aspects haemostatic agents from venoms. 2012. (Simpósio).

Sao Paulo School of Advanced Science Advaced Topics in Computacional Biology / Agrochemical and Drug Design.Active and Exo-site Inhibition of Human Factor Xa: Structure of des-Gla Factor Xa Inhibited by NAP5, a Potent Nematode Anticoagulant Protein from Ancylostoma caninum. 2012. (Seminário).

6th Protein Kinases in Drug Discovery. 2011. (Congresso).

Roda-Viva "Radiação Nuclear: Riscos e aplicações" no XIV Simpósio de Genética "Multiplicidade do Núcleo". 2011. (Simpósio).

Simpósio Interdisciplinar de Física + Bioinformática. 2011. (Simpósio).

XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Crystal Structure of a PIII Metalloproteinase from the Venom of Bothrops moojeni. 2011. (Congresso).

"Roda Viva" Construção de organismos que a natureza não fez, mas a sociedade precisa, durante o XIII Simpósio de Genética. 2010. (Simpósio).

4th International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function.Molecular Features and Mechanisms of Proteins that Interfere whit the Maintenance and Regulation of the Intrinsic and Extrinsic Pathways of the Blood-coagulation Cascade. 2010. (Simpósio).

First International Symposium on Structural Systems Biology.Comparative Venomic Analysis of Viparidae Snakes Inhabiting Europe, Asia and South America. 2009. (Simpósio).

I Congresso Iberoamericano de Química, Bioquímica e Ingenieria Química e VII Congresso Internacional de Química e Ingeniaria Química. Mechanisms and Structural Aspects of Venom Protein that Affect Blood Coagulation. 2009. (Congresso).

Joint Indo-Brazil Symposium on Macromolecular Crystallography.Crystal structures of proteins that perturb the blood-coagulation cascade. 2009. (Simpósio).

VII Iberoamerican Congress of Biophysics. Molecular Features and Mechanisms of Proteins that Interfere whit the Maintenance and Regulation of the Intrinsic and Extrinsic Pathways of the Blood-coagulation Cascade. 2009. (Congresso).

XVI World Congress of the International Society on Toxinology and X Congresso da Sociedade Brasileira de Toxinologia.Structural aspects of venon proteins that affect blood coabulation. 2009. (Simpósio).

Avanços em Engenharia de Proteínas e Síntese de Peptídeos.Cristalografia de proteínas: estratégias e aplicações. 2008. (Outra).

Centro de Investigação de Microorganismos.Mecanismos de Proteínas que interferem na Hemostasia e Integridade de Membranas: Aspectos Estruturais. 2008. (Outra).

International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function.Nematode Anticoagulant Proteins NAPc2 and NAP5 binding to the exo- and active sites of human des-Gla Factor Xa. 2008. (Simpósio).

Structural Bioinformatics ? Structure and Functions of Macromolecules.Structural Bioinformatics ? Structure and Functions of Macromolecules. 2008. (Simpósio).

The 8th IST - Asia Pacific Meeting on Animal, Plant & Microbial Toxins. Inhibition and the Role of LYS122 in the Polarization of the C-Terminus of Catalytically Inactive Myotoxic Phospholipase A2S.. 2008. (Congresso).

Instituto Oswaldo Cruz.Introdução e aplicação da cristalografia na resolução de estruturas proteicas. 2007. (Outra).

Seminários de Bioquímica III do Departamento de Bioquímica e Imunologia.Estrutura e Mecanismos de Proteínas envolvidas na coagulação. 2007. (Seminário).

IX Congresso Brasileiro de Toxinologia. Inibição e ativação da cascata de coagulação sanguínea por venenos e proteínas da saliva: mecanismos e candidatos potenciais para desenvolvimento de drogas. 2006. (Congresso).

XXXVII - Latin American School of Physics. 2006. (Simpósio).

17 Workshop do Centro de Toxinologia Aplicada CAT/CEPID/FAPESP "Estrutura, Atividade e Funcao de Proteinas de Venenos".Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxinas. 2005. (Simpósio).

CAT-CEPID Centro de Toxinologia Aplicada.Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxinas. 2005. (Simpósio).

Curso Avançado sobre Métodos de Estudos da Estrutura e Função de Proteínas.Curso Avançado de Estrutura e Função de Proteínas. 2005. (Simpósio).

Curso de Propriedade Intelectual e Inocação Farmacêutica 2005.Cristalografia e modelagem molecular no drug design. 2005. (Outra).

Abteilung Biochimie & Molekularbiologie.Kristallstrukturen der Blutgerinnungs - Proteine aus Blutegel, Zecke, Hakenwürm & Schlange.. 2004. (Seminário).

Ciclo de Seminários do Programa de Pós-graduação em Biofísica Molecular..Ligações nos sítios secundários de proteínas. 2004. (Seminário).

VIII Congress of the Brazilian Society of Toxinology (SVTx) and VIII Symposium of the Pan American Section of the International Society on Toxinology (IST). 2004. (Congresso).

Summer Conference in Protein Research. Tick, Hookworm and Snake Venom Proteins: Crystal Structures and Coagulation & The Structural Molecular Biology Network and the Brazilian National Laboratory for Synchrotron Light. 2003. (Congresso).

II Semana de Estudos Biológicos. Venenos animais: Purificação e cristalização para fins farmacológicos. 2002. (Congresso).

The first Indian Symposium of the Protein Society.Structure of the secundary Alcohol dehydrogenase fron Thermoanaerobacter ethanolicas 39E. 2002. (Simpósio).

VII Simpósio da Sociedade Brasileira de Toxinologia.Venom Proteins as Structural Model Systems.. 2002. (Simpósio).

7th Symposium: Pan-American Section of the Internation Society on Toxinology on Animal, Plant and Microbial Toxins.Venom Proteins as Structural Model Systems. 2001. (Simpósio).

XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.Venom Proteins as Structural Model Systems in Drug Desin. 2001. (Seminário).

.Snake Venom Phospholipase, Structure and Insights. 2000. (Seminário).

.Structures of Thermostable Alcohol Dehydrogenases. 2000. (Seminário).

IV Congresso de Biofísica do Cone-Sul. Crystal Structure of Protein Complexes in the Blood Coagulantion Pathway. 2000. (Congresso).

Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia. 2000. (Encontro).

Departamento de Bioquímica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP.A Importância da Informação Estrutural no Entendimento de Moléculas Biológicas. 1999. (Seminário).

New World Science for the Next Millenium.Macromolecular Crystallography in South America and the National Syncrotron Source for X-Ray Diffraction. 1999. (Seminário).

XIV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE.Crystallography in Biology: Macromolecular Interactions. 1999. (Encontro).

.Structural Studies of Proteins of Industrial Interest. 1997. (Seminário).

.Hinge Movement in PLA2's: A Structural Study. 1997. (Seminário).

Curso "Mass Spectrometry of Proteins and Peptides", na XXVI Reunião Anual da SBBq. 1997. (Encontro).

INTERNACIONAL SOCIEY ON TOXINOLOGY, 12th World Congress on Animal, palnt and Microbial Toxins. At the Interface: Crystal Structures of Phospholipase A2's. 1997. (Congresso).

XXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq).Protein Sequencint by X-Ray Crystallography Revisited. 1997. (Encontro).

Congresso sobre Biomoléculas.Biologia Estrutural. 1996. (Seminário).

Miotoxinas e Fosofolipase A2: Estrutura e Atividade Biológica, evento satélite ao IV Simpósio da SBTx.Structural Studies of Myotoxic Phospholipases. 1996. (Simpósio).

VII Workshop Anual de Usuários do LNLS.Crystal Structure of the RNase T1* GpuC Complex. 1996. (Seminário).

XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.Crystal Structure of Ribonuclease T1 Complexed with the Isosteric Phosphonate Analogue of the RNA Fragment GpcU:.... 1996. (Encontro).

.At the interface: Interaction of K49 Ca2+ Independent phospholipase A2 homologues with phospholipids. 1995. (Seminário).

Departamento de Física - UNESP / IBILCE.Ca2+ Independent Phospholipase A2 Homologues. 1995. (Seminário).

Instituto Politécnico - UERJ.Modelagem Molecular em Biologia e Mediciana. 1995. (Seminário).

VI Wotkdhop Anual de Usuários do LNLS no Laboratório Nacional da Luz Sincotron. 1995. (Outra).

XVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Crystallization of Bothropstoxin II Isolated fron the Venom of Bothorops jararacussu. 1995. (Encontro).

XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.At the interface: Molecular Interactions Between Calcium-Independent Phospholipase A2 Homologues and Lipids. 1995. (Simpósio).

X Semana da Biologia. 1994. (Outra).

Departamento de Física - UNESP / IBILCE.Proteínas Tóxicas. 1993. (Seminário).

III Simpósio de Pós-Graduação e Pesquisa em Ciências Exatas e Engenharias. 1993. (Simpósio).

IV Curso de Estrutura de Proteínas.X-Ray Crystallography of Proteins. 1993. (Seminário).

XVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada - ENFMC.Protein-nucleic acid and protein-protein interactions. 1993. (Encontro).

XXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 1993. (Encontro).

XII Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia. 1992. (Encontro).

Curso de CRISTALOGRAFIA DE PROTEÍNAS. 1988. (Outra).

Departamento de Bioquiímica da Facudade de Medicina de Ribeirão Preto - USP.X- Ray Diffraction and Protein Structural Analysis. 1988. (Seminário).

III Curso Internacional de Biofísica. 1988. (Outra).

Simpósio sobre TOXINAS PROTÉICAS. 1988. (Simpósio).

X Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia e do Simpósio "Cristalografia e Novos Materiais". 1988. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Gabriel Soares Guerra

R. K. Arni; CAFE, R. C.; FERNANDES, A. B.. Desenvolvimento de uma estrategia de inibição de transportadores ABC utilizando anticorpos.. 2019 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Roney Vander dos Santos

TASIC, L.; SALLES JUNIOR, A. G.;R. K. Arni. Estudo das interações entre hesperitina e as serna proteases de peçonhas de serpentes.. 2019. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Carolina Wilson

R. K. ArniSPENCER, P. J.ABREGO, J. R. B.. Purificação e caracterização parcial de proteínas presentes no veneno de Bothrops leucurus. 2013. Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Atílio Tomazini Junior

POLIKARPOV, I.; COSTA FILHO, A. J.;Arni, R. K.. Caracterização estrutural da Glicosilhidrolase de Xanthomonas campestris contendo os domínios: catalítico da família GH 5 e domínio similar a Expansina. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos USP.

Aluno: Luana Gonçales Garcia

ARNI, R.K.; SOUZA, F. P.; BELINTANI, P.. Biologia Estrutural: Expressão e Caracterização Estrutural da Proteína 25 K do Cole latent virus. 2012. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Karine Fernanda dos Santos

Arni, R. K.; SOUZA, F. P.;SPENCER, P. J.. Estudos Estruturais do Precursor dos Peptídeos potenciadores de Bradicinina e da Proteína Nudel - Nulear Distribution Element-Like. 2008. Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Flávia Barboza Camargo

Arni, R. K.; Rossit, A. R. B.;SPENCER, P. J.. Expressão, Purificação e Estudos Estruturais da Chaperona Molecular HSP65 de Mycobacterium leprae & Caracterização da Proteína NUDEL - Nuclear Distribuition Element-Like. 2008. Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Fabiana Carina Pavezzi

Arni, R. K.. Producao e Caracterizacao de Glucoamilases Termoestaveis de Aspergillus awamori obtidas por PCR mutagenico e expressas por Saccharomyces cerevisiae. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia e Ciencia de Alimentos).

Aluno: Leonardo Mussi da Silva

Arni, R. K.. Moojenina - Um inibidor protéico da trombina isolado do veneno da serpente Bothrops moojeni. 2005. Dissertação (Mestrado em Biofísica) - Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares Ipen.

Aluno: Sandro Pioli Zela

Arni, R. K.. Estudos estruturais de proteínas envolvidas na hemostasia e disrupção de membranas celulares. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Cristiane Cabral de Melo

ARNI, R.K.ABREGO, J. R. B.; CANDURI, F.. Determinação da Estrutura Cristalográfica da Miotoxina-II Isolada do Veneno da Serpente Bothrops Nummifer. 2005. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Ângelo José Magro

FONTES, M. R. M.; SOARES, A. M.;Arni, R. K.. Determinação das fosfolipases homólogas BnSP-7 e BnSP-6: considerações a respeito de suas estruturas quartenárias e mecanismo de inibição. 2004. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociêncas de Botucatu.

Aluno: André Luiz Berteli Ambrósio

Arni, R. K.. Estudo da interação entre ácidos graxos e LYS49-fosfolipases A2 por difração de raios X e Ressonância Magnética Nuclear. 2003. Dissertação (Mestrado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Alessandra Aparecida Rabalho

Arni, R. K.. Isolamento de linhagens Microbianas Termofólicas Amilolíticas, Produção, Caracterização e Aplicação das Amilases na Hidrólise do Amido de mandioca. 2002. Dissertação (Mestrado em Engenharia e Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: ROBERTO RULLER

Arni, R. K.. Avaliação da Estabilidade da Forma Dimérica de Bothropstoxina-I da Serpente Bothrops jararacussu na Atividade Danificada de menbranas Cálcio-Independente.. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Stefano Trapani

Arni, R. K.. Estudos Estruturais da Enzima Fosfoenolpiruvato Carboxiquinase (PEPCK) de Trypanossoma cruzi, um Potencial Alvo para o planejamemto de Drogas Antichagásicas. 2001. Dissertação (Mestrado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Leandra Watanabe

Arni, R. K.. Cristalização e análise do medelo estrutural da enzima Ribonuclease T1 de Aspergillus oryzae complexada com o análogo de substrato GpcU (guanilil (3'- 6') 6'- deoxihomouridina). 1998. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Andreimar Martins Soares

Arni, R. K.. Caracterização bioquímica parcial das miotoxinas básicas do veneno de Bothrops moojeni: Seqüência aminoterminal, cristalografia e estudos da transição dos estados nativo e desenovelado. 1997. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Regiane Burger

Arni, R. K.. Determinação do modelo estrutural da anidrase cabônica bovina (ACBII) por difração de raios-X.. 1996. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Adreimar Martins Soares

Giglio, J. R.; COUTINHO NETO, J.;Arni, R. K.. MembroTitular da Comissão Julgadora da Defesa de Mestrado. 1996. Dissertação (Mestrado em Medicina) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Aluno: Arun Kumar Jaiswal

AZEVEDO, V. A. C.; TIWARI, S.; GOES NETO, A.; ORTEGA, M.; GUIMARAES, L. C.;R. K. Arni. Reverse Vaccinology and Drug Target Identification for the Syphilis Causative Agent Treponema Pallidium: A Multi-pronged Approach Towards Better Vaccine and Druf Targets.. 2020. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Syed Babar Jamal Bacha

AZEVEDO, V. A. C.; TIWARI, S.; TASIC, L.; BLEICHER, L.; PIRES, D. E. V.;ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. An Integrative in Silico Approach For Therapeutic Target Identification In The Human Pathogen Corynebacterium Diphtheriae. 2018. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Liege Abdala Kawai

ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMYABREGO, J. R. B.. Mecanismo de ação e infecção por Corynebacterium pseudotuberculosis: expressão, purificação e caracterização de proteínas relacionadas ao metabolismo ou á sua virulência. 2017. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Larissa Vuitika

R. K. Arni; NAKAO, L. S.; SILVEIRA, R. B.; TRINIDADE, E. S.;VEIGA, S. S.. Mapeamento estrutural do sitio ativo de fosfolipases D presente no veneno de aranha-marrom (Loxosceles intermedia): características bioquímicas e biológicas.. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Vanessa de Oliveira Arnoldi Pellegrini

POLIKARPOV, I.; NAGEM, R. A. P.;Arni, R. K.Murakami, M. T.; DRIEMEIER, C. E.. Clonagem molecular, expressão, purificação e caracterização estrutural da endoglucanase de Trichnoderma harzianum visando o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos para a produção de etanol ligonucelulósico. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Andre Schutzer de Godoy

Nascimento A.S.;ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; Silva F.H.; Mascarenhas Y.P.;Murakami, M. T.. Estudos estruturais e funcionais das enzimas beta-galactosidases de bactérias. 2016. Tese (Doutorado em Física Apllicada) - Instituto de Fisica de Sao Carlos.

Aluno: Ícaro Putinhon Caruso

CORNELIO, M. L.;R. K. Arni; CHAHINE, J.; Ito A.S.; di Stasi L. C.. Estudos de interação dos flavonóides isovitexina e 2-fenilcromona com a albumina do soro humano: abordagem experimental e computacional.. 2016. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Rajeev Kungur Brahma

R. K. Arni. Identification and characterization of thrombin inhibitors from the salivary gland of tick (Haemaphysalis bispinosa).. 2016. Tese (Doutorado em Department of Molecular Biology and Biotechnology) - Tezpur University.

Aluno: Benjamin Thomas Viart

VILELA, L. F. F.; MOLINA, F.; MINARDI, R. C. M.; MEIRA JUNIOR, W.;Arni, R. K.; LEMK, N.. Computational design of peptide ligands based on antibody-antigen interface properties. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Edson Luiz Folador

AZEVEDO, V. A. C.; FERREIRA, R. S.;Arni, R. K.; LEMK, N.; ORTEGA, J. M.; MOLINA, F.. Validação de um método para predição de redes de interação proteína-proteína e sua aplicação em Corynobacterium pseudotuberculosis para identificar proteínas essenciais. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Rehana Masood

ARNI, R.K.SPENCER, P. J.; FONTES, M. R. M.; RUGGIERO NETO, J.; Rodrigues, G. O. B.. Production, characterization and structural analysis of proteins from Corynebacterium pseudotuberculosis and snake venos. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Livia José Regatieri

ARNI, R.K.; BELINTANI, P.; SOUZA, A. E. M.;ULLAH, A.ABREGO, J. R. B.. Expressão, purificação e caracterização estrutural de proteínas codificadas por dois fitovírus. 2014. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Hévila Brognaro dos Santos

Arni, R. K.; Gomes, E.; RULLER, R.; PRADELLA, J. G. C.; SILVA, R.. Glicosídeo hidrolase de Myceliophthora thermophila M.7.7.; fermentação submersa; análise proteômica dos diferentes secretômas e purificação e caracterização bioquímica de uma beta-glicosidade. 2014. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Vinícius dos Santos Santana

ARNI, R.K.; BELINTANI, P.; MORAIS, A. T. S.; VIDOTTO, A.; MORAES, F. R.. Expressão, purificação e caracterização estrutural in silico das proteínas capsidiais codificadas pelo Grapevine virus A e B. 2014. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Ricardo Barros Mariutti

Arni, R. K.ULLAH, A.; SOUZA, F. P.; BELINTANI, P.;SPENCER, P. J.. Expressão, purificação e caracterização de proteínas dos fitovírus SBMV e RSPaV. 2014. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Jademilson Celestino dos santos

POLIKARPOV, I.; GUIDO, R. V. C.;Arni, R. K.; CORDEIRO, A. T.; NEVES, F. A. R.. Caracterização estruturalo dos complexos entre os receptores ativadores da proliferação de perixissomos (PPARs) dos tipos alfa e gama e seus agonistas. 2014. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Anwar Ullah

R. K. ArniSPENCER, P. J.; CINTRA, A. C. O.; SOUZA, F. P.;ABREGO, J. R. B.. Purification and characterization of snake venom proteins. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Syed Shah Hassan

AZEVEDO, V. A. C.; FERREIRA, R. S.;R. K. Arni; RAMOS, R. J.; SANTORO, M. M.; SORIANI, F. M.; BLEICHER, L.. Modelome Derived Intra-Species Broad Spectrum Drug and Vaccine Targets Identification in the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis. 2013. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Amanda Bernardes Muniz

POLIKARPOV, I.; FONTES, M. R. M.; NAVARRO, M. V. A. S.;Arni, R. K.; LARSON, R. E.. Estudos estruturais e funcionais dos receptores ativadores da proliferação de peroxissomos. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Física Aplicada - Opção Física Biomolecu) - Instituto de Física de São Carlos USP.

Aluno: Mônika Aparecida Conorado

Arni, Raghuvir K.SERRANO, SOLANGE M.T.SPENCER, P. J.ABREGO, J. R. B.; SILVA, R.. Estrutura e mecanismo de um peptídeo célula-penetrante extraído do veneno da serpente brasileira Crotalus Durissus Terrificus.. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Marcelo Vizoná Liberato

POLIKARPOV, I.; GUIDO, R. V. C.;ARNI, R.K.; MARANA, S. R.; IULEK, J.. Caracterização estrutural de endoglucanases da família GH5 e beta-glicosidases da família GH1: interação enzima-substrato.. 2013. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Fernanda Aparecida Heleno Batista

Policarpov, I.; BORGES, J. C.; GUIDO, R. V. C.;Arni, R. K.; WARD, R. J.. Estudos estruturais do receptor ativado por ativadores de peroxissomos humano, hPPAR. 2012. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Fábio Rogério de Moraes

NESHICH, G.; APARICIO, R.; ZUBEN, F. J. V.; SANTORO, M.;Arni, R. K.. Revelando as características do nano-ambiente das interfaces entre proteínas. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Pradeep Sharma

Arni, R. K.. Structural and Functional Studies of Peptidogylcan Recognition Protein and its Complexes with various Ligands. 2011. Tese (Doutorado em Biophysics) - All India Institute Of Medical Science.

Aluno: Amit Kumar Singh

Arni, R. K.. Structural and Functional Studies of Lactoperoxidase and its Complexes with Specfic Ligands. 2010. Tese (Doutorado em Biophysics) - All India Institute Of Medical Science.

Aluno: Cristiane Rodrigues Guzzo

FARAH, S. C.; MARANA, S. R.; ARANTES, G. M.; Garrat, R C;Arni, R. K.. Estudo estrutural e funcional das proteínas PilZ e YaeQ do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri. 2010. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carolina Merheb Dini

SILVA, R.; GIGANTE, M. L.; CABRAL, H.; IDA, E. I.;Arni, R. K.. Produção, purificação e caracterização de protease de Thermomucor indicae-seudaticae N31 e avaliação de sua aplicação na fabricação de queijo maturado. 2010. Tese (Doutorado em Engenharia e Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Daniela Priscila Marchi Salvador

FONTES, M. R. M.; SOARES, A. M.;Arni, R. K.; Palma MS; Gallacci M. Estudos Estruturais com LYS49 e ASP49 fosfolipases A2 nativas e complexadas com Brometo de p-Bromofenacila. 2008. Tese (Doutorado em Doutorado) - Instituto de Biociências, UNESP, Botucatu.

Aluno: Marcia Perez dos Santos Cabrera

RUGGIERO NETO, J.; ARAUJO FILHO, J. P.; FREUND, M. T. L.; SILVA, R.;ARNI, R.K.. Estudo da conformação e Atividade Lítica de Peptídeos Antimicrobianos de Vespas. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Artur Torres Cordeiro

Arni, R. K.. Determinação da estrutura cristalográfica com a enzima glicose-6-fosfato isomerase de Leishmania mexicana e comparação com a enzima homóloga de humanos. 2004. Tese (Doutorado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Rita de Cássia Moura do Nascimento

Arni, R. K.. Contribuições a estudos biológicos com o uso de modelos biofísicos. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Lucimara Chioato

Arni, R. K.. Papel dos resíduos positivamente carregados nas funções farmacológicas de fosfolipases A2 de serpentes e sinovial humana. 2004. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Frederico Moraes Ferreira

Arni, R. K.. Estrutura cristalografica da N-acetilglicosamina 6-fosfato desacetilase de Escherichia coli. 2004. Tese (Doutorado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Paulo Sérgio Monzani

Arni, R. K.. Estrutura Cristolográfica da Enzima Hipoxantina-guanina Fosforibosiltransferase (HGPRT) de Leishimania tarentolae Complexada com GMP. 2003. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Leandra Watanabe

Arni, R. K.. Estudos do estéreo e enantioespecificidade da SADH de Thermoanaerobacter ethanolicus - Mutagênese, expressão, purificação e estudos cristalográficos. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ronaldo Alves Pinto Nagem

Arni, R. K.. Otimização das condições para fatores de estruturas de cristais de proteínas por meio da difração da luz Síncrotron. 2003. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Física Gleb Wataghin da Universidade de Campinas.

Aluno: Luiz Everton Esmeraldino

Arni, R. K.. Avaliação da ação do extrato de Croton urucurana baillon (Euphorbiaceae) sobre a atividade hemorrágica do veneno de Bothrops jararaca. 2003. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Cleyson Valença Reis

Arni, R. K.. Clonagem, Sequenciamento, Expressão e Caracterização Parcial da Estrutura do Lopap, um Ativador de Protrombina da Lagarta Lonomia obliqua. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Rosa Maria Fernandes Cardoso

Arni, R. K.. Estudos estruturais de enzimas antioxidantes relacionadas à doença de Lou Gehring e à esquistossomose. 2002. Tese (Doutorado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Adriana Cristina Mancin

Arni, R. K.. Aspectos estruturais e funcionais da crotamina nativa e quimicamente modificada. 2001. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Andreimar Martins Soares

Arni, R. K.. Estrutura, Função e Inibição de Miotoxinas Homólogas a Fosfolipases A2 Isoladas de Venenos de Serpentes. 2000. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Aluno: Walter Filgueira de Azevedo Junior

Arni, R. K.. Introdução à Biocristalografia com o Estudo Estrutural da Cinase Dependente de Ciclina 2 (CDK2) Complexada com Inibidores. 1997. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos.

Aluno: Dulce Helena Ferreira de Souza

Arni, R. K.. Estrutura cristalográfica da enzima gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase de T. cruzi: implicações no mecanismo catalítico e potenciais sítios específicos de inibição. 1996. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular Sc) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Maria Tereza da Silva Giotto

Arni, R. K.. Estrutura cristalográfica da Bothropstoxina-I, uma miotoxina K49 tipo fosfolipase A2.. 1996. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Química de São Carlos-USP.

Aluno: Liege Abdallah Kawai

ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMYABREGO, J. R. B.; MORAES, F. R.. Mecanismo de ação e infecção por Corynebacterium pseudotuberculosis: expressão, purificação e caracterização de proteinas relacionadas ao metabolismo central ou à sua virulencia.. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Ícaro Putinhon Caruso

CORNELIO, M. L.;R. K. Arni; de Araujo A.S.. Estudos de interação dos flavonóides isovitexina e 2-fenilcromona com a albumina do soro humano: abordagem experimental e computacional.. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Rehana Masood

Arni, R. K.; Mariutti, R.B.; MELO, F. A.. Expression, purification and characterization of Proteins from Corynebacterium pseudotuberculosis. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Vinícius dos Santos Santana

ARNI, R.K.; FOSSEY, M. A.;ABREGO, J. R. B.. Expressão, purificação e caracterização estrutural das proteínas capsidiais codificadas pelo Grapevine virus A e B. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Ricardo Barros Mariutti

ARNI, R.K.ULLAH, A.; SOUZA, F. P.. Expressão, purificação e caracterização de proteínas dos fitovírus SBMVe RSPaV. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Luiz César Borro

NESHICH, G.;Arni, R. K.; SANTOS, R. V.; APARICIO, R.. Otimização de ranqueamento em triagem virtual de alto desempenho para acoplamento de pequenos compostos químicos em alvos nas proteínas. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Mônika Aparecida Conorado

Arni, Raghuvir K; SOUZA, F. P.;ABREGO, J. R. B.. Purificação e Cristalização de Proteínas do Veneno de Serpentes.. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Anwar Ullah

Arni, R. K.ABREGO, J. R. B.; SOUZA, F. P.. Purification, characterization & crystallization of an L-amino acid form Bothrops Jararacussu. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Livia José Regatieri

Arni, R. K.; SOUZA, F. P.; RAHAL, P.. Expressão, purificação e caracterização estrutural de proteínas codificadas por dois fitovírus. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Hévila Brognaro dos Santos

Arni, R. K.; Gomes, E.; Rodrigues, G. O. B.. Estudo das enzimas do complexo hemicelulítico do fungo termofílico Myceliophthora sp M.7.7.. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Mario Tyago Murakami

Arni, R. K.. Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxinas: Mecanismos e Inibicao. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofisica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP.

Aluno: Sandro Pioli Zela

Arni, R. K.; CANDURI, F.;Abrego, J. R. B.. Estudos Estruturais de Proteínas Envolvidas na Hemostasia e Disrupção de Membranas Celulares. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Leandra Watanabe

Arni, R. K.; Fossey, M.;Abrego, J. R. B.. Estudos da Estérieo e Enantioespecificidade da SADH de Thermoanaerobacter Ethanolicus - Mutagênese, Expressão, Purificação e Estudos Cristalográficos. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Marcelo Valdemir de Araujo

NERY, J. G.;ARNI, R.K.; GODOY, M. F.. Síntese e Caracterização de Agentes Hemostáticos com Base em Materiais Zeolíticos. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Carolina Wilson

ARNI, R.K.; MORAES, F. R.;ABREGO, J. R. B.. Purificação e caracterização parcial de proteínas presentes no veneno de Bothrops leucurus. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Luana Gonçales Garcia

ARNI, R.K.; SOUZA, F. P.; Rodrigues, G. O. B.. Biologia Estrutural: Expressão e Caracterização Estrutural da Proteína 25 K do Cole latent virus. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Karine Fernanda dos Santos

ARNI, R.K.; Murakami, M. T.; Caetano, R. C.. Estudos Estruturais da Proteína Precursora dos Pepitídeos Potenciadores de Bradicinina. 2007. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Flávia Barboza Camargo

ARNI, R.K.; Murakami, M. T.; Caetano, R. C.. Estudos Estruturais da Chaperona Hsp65 de Mycrobacterium leprae. 2007. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Daniella Gorete Lourenço de Oliveira

ARNI, R.K.; SILVA, R.; Rodrigues, G. O. B.. Purificação e Caracterização de Proteínas de Venenos de Serpentes Envolvidas na Coagulação Sangüínea: Serino-Protease, Metalo-Protease e Lectinas. 2006. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Cristiane Cabral de Melo

Arni, R. K.Abrego, J. R. B.Canduri, F.. Determinação da estrutura cristalográfica da Miotoxina II isolada do veneno da serpente Bothrops nummifer (Exame Geral de Qualificação). 2005. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Magno Massolino Viçoti

ABREGO, J. R. B.ARNI, R.K.; CANDURI, F.. Estudo da convulxina, um potente agregador plaquetário isolado do veneno de Crotalus durissus terrificus: purificação, caracterização bioquímica e estudos de espalhamento dinâmico de luz. 2005. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Vinícius Lucatelle da Silva

Beltran-Abrego, J.R.; SANTISTEBAN, A. R. N.;ARNI, R.K.. X-ray crystallography and structural studies of toxins. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: André Luis Lira da Silva

ARNI, R.K.. Caracterização Bioquímica e Físico-Química da Jararacussina-I: uma Serino Proteinase Purificada do Veneno de Bothrops jararacussu. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Aluno: Carolina Wilson

ARNI, R.K.; FADEL, V.; SOUZA, F. P.. Estudos de enzimas hidrolíticas produzidas a partir do fungo Myceliophthora sp cultivado em bagaço de cana. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Liliane Maria Fernandes de oliveira

ARNI, R.K.; FADEL, V.; REGATIERI, L. J.. Purificação e caracterização de proteínas de interesse farmacológico presentes no veneno de Bothrops alternatus, Bothrops atrox e Bothrops moojeni. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Eduardo Arana Soares

CORNELIO, M. L.;ARNI, R.K.. Análise da amida I da ovalbumina por espectroscopia de infravermelho. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Aluno: Lisandra Marques Gava

Arni, R. K.. Purificação da giroxina, uma trombina-símile, do veneno de Crotalus durissus terrificus. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Brasileiro G.F.;R. K. Arni; LANA, M.; Fontes, E.. Membro Titular da Comissão Avaliadora da Promoção para Classe E. 2017. Universidade Federal de Minas Gerais.

ARNI, R.K.; FONTES, M. R. M.; NESHICH, G.; TASIC, L.; AZEVEDO, V. A. C.. Concurso Público de Provas e Títulos para contratação de 01 n(um) Pesquisador III, na área de Biologia Estrutural, junto ao Departamento de Física, IBILCE/UNESP. 2014. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

ARNI, R.K.; PEREIRA JUNIOR, N.; LABATE, C. A.; NAVARRO, M. V. A. S.; BONAGAMBA, T. J.. Concurso público de títulos e provas para provimento de um cargo de Professor Doutor, em Regime de Dedicação Integral à Docência e à Pesquisa, referência MS-3, junto ao Depto de Física e Informática, na área de Enzimologia Molecular. 2013. Instituto de Física de São Carlos USP.

Arni, R. K.; SCHENKMAN, S.; FERREIRA, S. T.; BONAGAMBA, T. J.; ZUCOLOTTO, V.. Concurso Público de títulos e provas para provimento de um cargo de Professor Doutor, em Regime de Dedicação Integral à Docência e à Pesquisa, referência MA-3, junto ao Departamento de Física e Informática do IFSC/USP, junto à área de Técnicas Experimentais em Biologia Molecular Estrutural. 2012. Instituto de Física de São Carlos.

GUERRINI, I. A.;Arni, R. K.; FARAH, S. C.; OLIVA, G.; GIGLIO, J. R.. Concurso Público para provimento de um cargo de Professor Titular, no conjunto de disciplinas Física Médica e Biológica I e II. 2010. Instituto de Biociências, UNESP, Botucatu.

Arni, R. K.. Concurso Público para provimento de um cargo de Professor Assistente Doutor, em RIDP, na disciplina Biofísica, junto ao Departamento de Física e Instituto. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP.

Arni, R. K.. Concurso Público para provimento de um Professor Titular na disciplina de Biofísica junto ao Departamento de Bioquímica e Microbiologia. 2009. Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho", campus Rio Claro.

Arni, R. K.. Concurso Público para contratação de um Professor Visitante na disciplina de Bioquímica junto ao Departamento de Física. 2009. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

ROCHA, G. M.; HARTFELDER, K. H.; COSTA NETO, C. M.; MARTINS, A. R.;Arni, R. K.. Concurso de títulos e provas para o cargo de Professor Doutor, referência MS-3, em RDIDP, junto ao Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioreagentes Patogênicos, Área de Biologia Estrutural, Especialidade. 2008. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Arni, R. K.. Concurso de Títulos e Provas para o Cargo de Professor Titular no Instituto de Biologia. 2008. Universidade de Brasília.

Arni, R. K.. Membro Titular da Comissao Julgadora do Concurso Publico para Contratacao de um Professor Colaborador, sob o regime juridico da C.L.T. e Legislacao Complementar. 2006. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP.

Arni, R. K.. Comissão julgadora do processo seletivo para contratação de um docente, categoria professor Doutor em RDIDP: área Biologia Estrutural. 2003. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Arni, R. K.. Membro suplente da banca examinadora do concurso público de provas e títulos para provimento de um cargo de professor assistente em RDIDP. 2002. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

R. K. Arni; FONTES, M. R. M.; TASIC, L.; Pavarino E.K>. Livre-docente em Biofisica Molecular. 2016. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Arni, R. K.. Comissao Organizadora do Concurso Publico de Titulos e provas para obtencao do Titulo de Livre-Docencia em Biofisica. 2006. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP.

Arni, R. K.. Concurso de Livre-Docência, Departamento de Química, Área de Biofísica: Especialidade I: Estrutura e função de Biomoléculas (suplente). 2005. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Arni, R. K.. Estudos Estruturais com a Importina, um Receptor de Importação Nuclear. 2002. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Arni, R. K.. Características funcionais da hexoquinase ligada aos sítios tipo A e B de mitocôndrias de cérebro bovino. 2002. Universidade de São Paulo.

REZENDE, M. A.; PECORA, I. L.;Arni, R. K.; SILVA, O. L.; KOHAWAGAWA, A.. Comissao Examinadora do Concurso de Livre-Docência na disciplina de Biofisica (Curso de Enfermagem). 2002. Instituto de Biociências, UNESP, Botucatu.

Arni, Raghuvir K. Shanti Swarup Bhatnagar Prize Committee. 2015. Council of Scientific and Industrial Research.

Arni, R. K.. Membro do Comitê Externo como parecerista Ad-hoc do processo de seleção de candidatos ao ingresso no Programa de Incentivo à Produção Científica, Técnica e Artística - Prociência - UERJ/FAPERJ. 2006. Universidade do Estado do Rio de Janeiro.

FONTES, M. R. M.; SOARES, A. M.;Arni, R. K.. Comissao Examinadora de Defesa Dissertação do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética). 2004. Instituto de Biociências, UNESP, Botucatu.

Arni, R. K.. Membro da Comissão Examinadora do Exame Geral de Qualificação ao Mestrado. 1994. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Orientou

Carolina Gismene

Determinantes da atividade necrótica da proteína esfoliativa C (ExhC) de Staphylococcus sciuri; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Rafaela dos Santos Peinado

Determinando o Modo de Ação de Moléculas Inibitórias de Proteases Virais Utilizando o Perfil Metabólico Baseado em RMN; ; Início: 2019; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Kelly Cristine Borsatto

Análise da Interação Parasito-Vetor da Doença de Chagas - Perfil Metabólico; Início: 2019; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Angela Rocio Niño Santisteban

Efeito da adição de peptídeos desenhados com base na Dsg 1 na atividade da ETD de Staphylococcus aureus; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Jorge Enrique Hernandez Gonzalez

Início: 2021; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Ricardo Barros Mariutti

Início: 2018; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Mônika Aparecida Coronado

Início: 2016; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Raphael Joseph Eberle

Início: 2013; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Carolina Wilson

Purificação e caracterização parcial de proteínas presentes no veneno de Bothrops leucurus; 2013; Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Luana Gonçales Garcia

BIOLOGIA ESTRUTURAL: Expressão e Caracterização Estrutural de Proteínas de Tomato chlorosis virus; 2012; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Karine Fernanda dos Santos

Estudos Estruturais da Proteína Precursora de Peptídeos Potenciadores de Bradicina; ; 2008; Dissertação (Mestrado em MIcrobiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Flávia Barboza Camargo

Expressão, Purificação e Estudos Estruturais da Chaperona Hsp65 de Mycobacterium leprae; 2008; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Daniella Gorete Lourenço de Oliveira

Purificação e caracterização de proteínas de venenos de serpentes que interferem na cascata de coagulação sanguínea; 2006; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Cristiane Cabral de Melo

Análise Estrutural da Miotoxina-II isolada do veneno de Bothrops nummifer; 2005; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Leandra Watanabe

Cristalizacão e Análise do Modelo Estrutural da Enzima Ribonuclease T1 de Aspergillus oryzae complexada com análogo do substrato GpcU (guanilil (3-6)6-deoxihomouridina); ; 1999; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular [Sjrp]) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Fernanda Canduri

Purificacão e Caracterizacão da Catepsina D, uma Protease Aspártica Lisossomal de Fígado Porcino; 1998; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular [Sjrp]) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Fábio Renato Lombardi

Cristalizacão e Determinacão da estrutura da Miotoxina II (MJTX-II), uma proteína Homológa da Fosfolipase A2 Purificado do Veneno de bothrops moojeni; ; 1998; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular [Sjrp]) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Liege Abdala Kawai

Expression, purification and elucidation of CobM protein involved in vitamin B12 metab olism of Corynebacterium pseudotuberculosis as a possible drug target; ; 2017; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Rehana Masood

Caracterização Biofísica e Bioquímica de Proteínas Isoladas de venenos e serpentes africanas; 2015; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Hévila Brognaro dos Santos

Purificação, caracterização e estudos estruturais de celulases e xilanases; 2014; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Livia José Regatieri

Expressão, purificação e caracterização estrutural de proteínas codificadas por dois fitovírus; 2014; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Vinícius dos Santos Santana

Expressão, purificação e caracterização estrutural das proteínas capsidiais codificadas pelo Grapevine virus A e Grapevine virus B; 2014; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Ricardo Barros Mariutti

Caracterização e Estudos Estruturais da Chaperona Hsp65 de Mycobacterium leprae; 2014; Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Anwar Ullah

Purificação, caracterização e estudos estruturais comparativos de L-amino-oxidases; 2013; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mônika Aparecida Conorado

Estrutura e mecanismo de um peptídeo célula-penetrante extraído do veneno da serpente brasileira Crotalus Durissus Terrificus; ; 2013; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mario Tyago Murakami

Estudos Estruturais de: Domino Globular da Miosina Va (Gallus domesticus), Lopap (Lonomia obliqua) e Xilanase (Bacillus subitillis); ; 2006; Tese (Doutorado em Biofisica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Sandro Pioli Zela

Estudos de proteínas envolvidas na hemostasia e disrupção de membranas celulares; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Leandra Watanabe

Estudos da enantio e esterio especificidade da SADH de Thermoanaerobacter ethanolicus 39E: Mutagênese, expressão, purificação, cristalização e estudos cristalográficos; ; 2003; 110 f; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular [Sjrp]) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Angela Rocio Niño Santisteban

Caracterização biofísica e estrutural da toxina esfoliativa E (ETE) selvagem e mutante (Ser219Ala) de Staphylococcus aureus; 2002; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Danilo da Silva Olivier

2018; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Raphael Josef Eberle

2016; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Ricardo Barros Mariutti

2016; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mônika Aparecida Coronado

2016; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Anwar Ullah

2015; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Vinícius dos Santos Santana

2015; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Pró-reitoria de Pesquisa da UNESP; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Ricardo Barros Mariutti

2015; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Reetesh Kumar

2013; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Sabrina T

Broggio Costa; 2010; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Renato Cesar Caetano

2008; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas,; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mario Tyago Murakami

2007; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Priscila Belintani

2003; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Flávia Barboza Camargo

Expressão e Purificação da Chaperona Hsp65 de Mycobacterium tuberculosis; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Carolina Gismene

Proteína esfoliativa D (ETD) de Staphylococcus aureus: inativação/ativação por peptídeos sintéticos e cacterização dos complexos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Fernanda Serrano Romano

Proteina repressora de argenina na regulação gênica de Corynebacterium pseudotuberculosis; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Sara Nicolau Flores

Interações Moleculare de Biomoleculas Bioativos com a Protease NS3 do Zika Vrius; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Unesp; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Gabriel Machado Ferreira

Expressão e purificação e refinamento das condições de cristalização da PLD de Corynebqacterium pseudotuberculosis; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Unesp; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Thais Caroline Serafim

Inibição do crescimento de Corynebacterium pseudotuberculosis por meio de bloqueio da via de biossíntese de argenina; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Unesp; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Leticia Sayuri Sybuia

Estágio de Iniciação Científica I; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Ayvin Tatiele de Souza e Souza

Rafaela Peinado

GIOVANA CASTELUCI MOREIRA

Frederico Sales da Silva

André Luis Lira da Silva

Caracterização Bioquímica e Físico-Química da Jararacussina-I: uma Serino Proteinase Purificada do Veneno de Bothrops jararacussu; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Bolsa de Apoio Acadêmico e Extensão I; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Carolina Wilson

Estudo de Enzimas Hidrolíticas produzidas a partir do Fungo Myceliophthora sp cultivado em Bagaço de Cana; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Unesp; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Liliane Maria Fernandes Oliveira

Expressão, Purificação e Cristalização de Mutantes da Proteína Humana NUDEL (Nuclear Distribution Element-LIke)-Oligopeptidase; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Livia Bevilacqua Boldrini

Re-enovelamento e Cristalização da Chaperona Hsp65 de Mycobacterium leprae; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Química Ambiental) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Joice Paiva

Estrutura e Função de Proteínas de Venenos de Serpentes Envolvidas na Coagulação Sangüínea: Serino-proteases, Metalo-proteases e Fosfolipases; ; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Vívian Gouveia Freitas

Iniciação no laboratório de bioquímica, métodos de purificação de proteínas; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Guilherme Giovanini

Iniciação no laboratório de bioquímica, métodos de purificação de proteínas; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Simone Michelan Duarte

Estrutura e Função de Proteínas de Venenos de Serpentes Envolvidas na Coagulação Sangüínea: Serino-proteases, Metalo-proteases e Fosfolipases; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Unesp; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

B; Santos; Iniciação no laboratório de Bioquímica, Métodos de Purificação e Cristalização de Proteínas; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Lisandra Marques Gava

Iniciação no laboratório de bioquímica, métodos de purificação de proteínas; 2004; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mario Tyago Murakami

Estrutura e função de proteínas isoladas do veneno de Bothrops jararacussu; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia de Alimentos) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Ciníta B

Oliva; Proteínas de Venenos de Serpentes de Importância Farmacológica: Serina-Protease, Fosfolipase e Desintegrinas; 2002; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Tadaiti Ozato Jr

Cristalização de mutantes da enzima ADH de T; esthanolicus; 2002; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Débora Fernanda Vieira

Pufificação e Cristalização de Proteínas Isoladas do Veneno de Bothorops Jararaca; ; 2001; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Karina L

Silva; Iniciação no Laboratório de Bioquímica, Métodos de Purificação de Proteínas; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Marcelo M

Brandão; Iniciação no Laboratório de Bioquímica, Métodos de Purificação de Proteínas; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Alexandre Zanin

Configurando Proteínas: Modificações Estruturais em Fosfolipase A2; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Leandra Watanabe

Estrutura e Função das Fosfolipases; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Alessandra B

Trovó; Purificação de Catepsina D; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Mariângela T

Ruiz; Purificação de Aldolase; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Fernanda Canduri

Iniciação no laboratório de bioquímica, métodos de purificação de proteínas; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Fábio Renato Lombardi

Iniciação no laboratório de bioquímica, metodos de purificação de proteínas; 1996; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

André Luis Lira da Silva

Purificação de Serino_Proteases do veneno de Bothrops Jararacussu; 2014; Orientação de outra natureza; (Física Biológica) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Bolsa de Apoio Acadêmico e Extensão I; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

André Luis Lira da Silva

Estágio Bàsico em Biofísica Molecular; 2012; Orientação de outra natureza; (Física Biológica) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Bolsa de Apoio Acadêmico e Extensão I; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Produções bibliográficas

PEINADO, RAFAELA DOS S. ; EBERLE, RAPHAEL J. ; PACCA, CAROLINA C. ; Arni, Raghuvir K. ; CORONADO, MONIKA A. . Review of -omics studies on mosquito-borne viruses of the Flavivirus genus. VIRUS RESEARCH , v. 307, p. 198610, 2022.
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MARIUTTI, R. B. ; SANTANA, V. S. ; GARCIA, L. G. ; REGATIERI, L. J. ; ULLAH, A. ; GASPAR, J. O. ; Arni, R. K. . Expression, purification and refolding of a coat protein of rupestris stem pitting associeted virus. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
MARIUTTI, R. B. ; REGATIERI, L. J. ; SANTANA, V. S. ; GARCIA, L. G. ; ULLAH, A. ; FOSSEY, M. A. ; GASPAR, J. O. ; Arni, R. K. . Expression, purification and refolding of movement proteins of southerm bean mosaic virus. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
REGATIERI, L. J. ; MARIUTTI, R. B. ; SANTANA, V. S. ; GARCIA, L. G. ; ULLAH, A. ; FOSSEY, M. A. ; GASPAR, J. O. ; Arni, R. K. . Expression, purification and circular dichroism analysis of cole latent virus capsid protein. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
Ward, R J ; Arni, R. K. ; Murakami, M. T. ; SANTOS, C. R. ; Souza, T. A. . Nucleoside diphosphate kinase b from trypanossomatids: structural adaptation as secreted proteins and pathways for selective inhibition. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
Silva, L. S. ; Chahine, Jorge ; Araújo, A. S. ; Arni, R. K. . Estudos computacionais de esfingomielinase: modelagem e dinâmica. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
CORONADO, M. A. ; Abrego, J. R. B. ; Brognaro, H. ; Murakami, M. T. ; Betzel, C. ; Arni, R. K. . X-ray solution scattering (SAXS) combined with crystallography: defining a specific conformation of convulxin structure in solution. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
GOMES, D. E. ; SABBAG, M. P. ; CARUSO, I. P. ; FERREIRA, L. A. M. ; FADEL, V. ; Arni, R. K. ; CORNELIO, M. L. ; Fossey, M. ; SOUZA, F. P. . Investigação das Interações da Proteína NSI do Vírus Sincicial Respiratório Humano Circulante em São José do Rio Preto. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GOMES, D. E. ; SABBAG, M. P. ; CARUSO, I. P. ; FERREIRA, L. A. M. ; FADEL, V. ; Arni, R. K. ; CORNELIO, M. L. ; Fossey, M. ; SOUZA, F. P. . Clonagem, Expressão e Estudos das Interações da Proteína NSI do RSC com demais Proteínas Virais. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
STUQUI, B. ; GIL, C. D. ; Arni, R. K. ; OLIANI, S. M. . Effect of ant-inflammatory protein annexin-A1 on inflammatory process induced by crude venom from Brothrops moojeni. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).
ULLAH, A. ; Beltran-Abrego, J.R. ; Arni, R. K. ; Caetano, R. C. ; Brognaro, H. ; OLIVEIRA, L. M. . Purification and characterization of serine-protinases from the venons of Bothropos moojeni snakes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
WILSON, C. ; Brognaro, H. ; Arni, R. K. . Estudo de enzimas hidrolíticas produzidas a partir do fungo Myceliophthora sp. cultivado em bagaço-de-cana. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
R. K. Arni . Molecular Features and Mechanisms of Proteins that Interfere with the Maintenance and Regulation of the Intrinsic and Extrinsic Pathways of the Blood-coagulation Cascade. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

Arni, R. K. . Parecerista da Fundação de Amparo a Ciência e Tecnologia de PE - FACEPE. 2016.

Arni, R. K. . Parecerista do PROGRAMA INSTITUCIONAL DE BOLSAS DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNESP - PIBIC/PIBITI. 2015.

Arni, R. K. . Mesa-Redonda 'Pesquisa de Fármacos Inovadores: A Contribuição da UNESP - Campus SJRP. 2014. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Arni, R. K. . Tópicos na disciplina: TÓPICOS ESPECIAIS: IMPACTO DA CRISTALOGRAFIA NAS DIFERENTES ÁREAS DA CIÊNCIA I. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

ARNI, R.K. . Dê um passeio no lado selvagem: aranhas, cobras, carrapatos, vermes e a coagulação sangüínea. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Arni, R. K. . "Venha nos conhecer". 2002 (Apresentação do curso "Física Biológica") .

Projetos de pesquisa

2022 - Atual

EXOSÍTIOS DE PROTEÍNAS, SÍTIOS CRÍPTICOS E MOONLIGHTING: IDENTIFICAÇÃO, MAPEAMENTO FUNCIONAL E EFEITOS DE ALTERAÇÃO ESTRUTURAL., Descrição: O interior dos organismos constitui ambientes complexos e dinâmicos, com pouca semelhança com os experimentos realizados com proteínas isoladas. Dados sobre as possíveis interações nas quais proteínas específicas podem participar, dentro desses ambientes fisiológicos repletos de biomoléculas, são fundamentais para entender os múltiplos papéis que muitas vezes são desempenhados pelas proteínas. Dados estruturais de alta resolução foram fundamentais para caracterizar e definir os parâmetros estereoquímicos que promovem e definem a ligação de peptídeos, inibidores de proteínas e substratos aos locais ativos das enzimas, a ponto de agora termos uma compreensão muito abrangente de interações específicas e catalíticas, mecanismos que facilitam o projeto e o desenvolvimento de inibidores sintéticos e drogas altamente seletivas. Em um nível mais sutil, as superfícies das proteínas geralmente contém os locais de ligação secundários (exosítios), que desempenham papéis-chave na regulação e modulação de diversas atividades, que vão desde a expressão gênica, estabilização conformacional, transporte, inibição e, por extensão, modulação e exibição de funções distintas ou multitarefas da mesma enzima em resposta a mudanças que nas condições físico-químicas são pouco compreendidas. Esta proposta combina técnicas de alto rendimento / alta resolução, como exibição de fagos, metabolômica, biologia estrutural, biologia computacional, juntamente com métodos computacionais baseados em fragmentos para mapear, selecionar e avaliar superfícies de proteínas e sítios de ligação criptográficos que interagem especificamente com peptídeos e proteínas e identificar as interações proteína-proteína dinâmicas subjacentes que ocorrem sob diferentes condições fisiológicas. O núcleo desta proposta está centrado em proteínas de relevância biológica, que estão sendo estudadas atualmente em nosso grupo de pesquisa, para entender suas interações com peptídeos e com outras proteínas para discernir seus possíveis papéis múltiplos. A equipe envolvida nesta proposta é formada por pesquisadores que já estabelecem colaborações por anos, as quais renderam diversos artigos científicos e patentes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Silvio Sanches Veiga - Integrante / Goran Neshich - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Ljubica Tasic - Integrante / WILLBOLD, DIETER - Integrante / RAHAL, PAULA - Integrante.
2015 - Atual

Estudos estruturais e caracterização de proteínas por cristalografia de raios-X e Ressonância Magnética Nuclear: Investigações estruturais e biofísicas dos mecanismos moleculares de proteínas funcionais, Descrição: FAPESP Processo n 2015/13765-0; Vigência: 01/11/2015 a 31/10/2017 RESUMO: Os elevados prejuízos causados à pecuária de caprinos e ovinos por Corynebacterium pseudotuberculosis, uma bactéria patogênica gram-positiva, nos estimulam a examinar as proteínas na tentativa de buscar alternativos e novos alvos terapêuticos para combater a doença causada por este microorganismo, pois ainda não existem soluções contra a patologia provocada por esta bactéria e os animais afetados são sacrificados devido à falta de tratamentos viáveis. Outra bactéria com importância na patogenia humana e animal é a Staphylococcus aureus, que é responsável por causar diversas reações, desde infecções localizadas da pele relativamente inofensivas a condições sistêmicas com risco de morte. As proteínas esfoliativas estão relacionadas à síndrome da pele escaldada estafilocócica (Staphylococcus scalded skin syndrome-SSSS). A presente proposta realizará estudos de biologia molecular e estrutural para entender os mecanismos de ação das onze proteínas do secretoma de C. pseudotuberculosis e da proteína esfoliativa (ETD) da S. aureus. Serão realizados ainda, testes de expressão e purificação de outras proteínas do secretoma de C. pseudotuberculosis para padronizar a produção em larga escala das proteínas a fim de conduzir os ensaios de cristalização. As proteínas serão caracterizadas estruturalmente usando técnicas de cristalografia e Ressonância Magnética Nuclear e os resultados contribuirão para melhorar nosso entendimento a respeito dos mecanismos de ação e podem sugerir vias para e o desenvolvimento racional de potenciais drogas, inibidores, antitoxinas, visando o combate destas infecções.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2015 - Atual

Mecanismos moleculares da infecção por Corynebacterium pseudotuberculosis, Descrição: Processo n 307338/2014-2 (Bolsas no País / Produtividade em Pesquisa - PQ - 2014); Vigência: 01/03/2015 60 mês(es). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador.
2014 - 2017

Interação e design de enzimas, Descrição: Processo n 401270/2014-9 (Bolsas no Pais - Ciências sem Fronteiras / Chamadas de Projetos MEC/MCTI/CAPES/CNPQ/FAPS - Bolsa Pesquisador Visitante Especial - PVE 2014) Resumo: Desenvolvimentos científicos e tecnológicos estão tornando a ressonância magnética nuclear em uma ferramenta extremamente poderosa para entendermos o funcionamento e o comportamento de macromoléculas em solução. Juntamente com dados cristalográficos podemos entender interações especificas e a dinâmica de macromoléculas. Nessa proposta pretendemos colaborar com o Prof. Dieter Willbold, diretor do Institute of Complex Systems, Research Center Jülich, uma autoridade mundial na utilização de técnicas do-estado-da-arte de RMN, incorporando-o em nosso laboratório. Ênfase também será dada para a disseminação e incorporação dessas técnicas em outros laboratórios no país e para a execução de cursos e workshops.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2014 - 2016

SOLICITAÇÃO DE AUXÍLIO PARA CONSERTO DE EQUIPAMENTOS, Descrição: FAPESP Processo n 2014/23623-6 (Programas Regulares / Auxílios a Pesquisa / Reparo de Equipamentos - Fluxo Contínuo); Vigência: 01/02/2015 a 31/01/2016. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Fatima Pereira de Souza - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2014 - 2014

1 Workshop de Ressonância Magnética Aplicada a Biofísica Molecular e Tecnologia e 2a. Escola de Biofísica Molecular da UNESP, Descrição: FAPESP Processo n 2014/09734-0 (Programas Regulares / Auxílios a Pesquisa / Organização de Evento Científico / Organização de Reunião Científica ou Tecnológica - Fluxo Contínuo); Vigência: 01/09/2014 a 05/09/2014. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Fatima Pereira de Souza - Integrante / José Geraldo Nery - Integrante / João Ruggiero Neto - Integrante / Fernando Melo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2013 - 2017

Functional and Structural Characterization of Snake Venom Proteins with Angiogenic Potential from Bothrops atrox, Descrição: CNPq Processo n 401388/2013-1 (Convênios Bilaterais / Chamada N° 12/2013 - Cooperação MCTI-CNPq/DBT (ÍNDIA)), Início: 22/11/2013 (36 meses) Resumo: Venenos ofídicos são misturas complexas de moléculas bioativas com um amplo leque de alvos fisiológicos. Esta complexa mistura engloba desde proteínas multiméricas de alta massa molecular até peptídeos que, apesar de seu diminuto tamanho, são capazes de interferir em mecanismos chave da homeostasia, como pressão arterial, agregação plaquetária e integridade do endotélio vascular. Dentre os componentes enzimáticos, destacam-se as proteases, (serino- e metallo-proteinases), L-amino-acido-oxidases, nucleases, esterases, fosfolipases e hialuronidases (2). Este vasto espectro de atividades tem atraído a atenção de bioquímicos, dado o potencial terapêutico de vários componentes do veneno ofídico. Por exemplo: Batroxobin, uma enzima trombina-símile isolada do veneno de Bothrops atrox é hoje um fármaco utilizado no tratamento de tromboses (3). Também existem evidências da atividade anti-tumoral de proteínas do veneno de serpentes. A fosfolipase A2 de Bothrops brazili se mostrou citotóxica em células Jurkat (4). A saxatilina, uma disintegrina do veneno de uma serpente Coreana inibiu crescimento de tumores metastáticos em modelos murinos. (5). A angiogenese é um pré-requisito para o desenvolvimento tumoral e metástase. A terapia anti-angiogênica é uma das estratégias recentes para o tratamento de tumores sólidos, ao passo que moléculas pró-angiogênicas têm sido usadas para o tratamento de doenças isquêmicas. Venenos de serpentes já se mostraram fontes de moléculas com capacidade de modular a neovascularização. MVL-PLA2, uma fosfolipase A2 apresentou atividade anti-angiogênica em modelos invitro e in vivo (6). Triflavin, uma disintegrina de Trimeresurus flavovridis inibia angiogênese induzida por TNF-em modelo de membrana corioalantoíca de ovo (7). Um estudo focando no veneno de Trimeresurus flavoviridis identificou proteínas VEGF-símile, com especificidade pelo receptor VEGFR1, e sem afinidade pelo VEGFR2 (8). Moléculas VEGF-símile também foram identificadas em Bothrops insularis (9). Bothrops atrox é uma serpente encontrada na região amazônica. Estudos de proteoma e transcriptoma apontam para a presença de várias proteínas, incluindo metaloproteases, fosfolipases e proteínas capazes de interferir na cascata da coagulação (10 & 11). No presente projeto, o objetivo é identificar e caracterizar proteínas que modulam a angiogênese, que poderiam ser usadas para inibir ou estimular a angiogênese, um processo de extrema relevância para diversas patologias.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Patrick Jack Spencer - Integrante / Sônia Maria Oliani - Integrante / Anwar Ullah - Integrante / Igor Polikarpov - Integrante / Kapaettu Satyamoorthy - Integrante / SG Biligiri - Integrante / Manjunath B Joshi - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2013 - 2014

Apoio a Pesquisa de Fronteira / Mecanismos Moleculares da Infecção por Corynebacterium pseudotuberculosis: epidemiologia, proteômica, genômica, metabolômica, biologia estrutural e computacional, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Mario Sergio Palma - Integrante / Fatima Pereira de Souza - Integrante / Marcos Roberto de Mattos Fontes - Integrante / Marcelo Andrés Fossey - Integrante., Financiador(es): Pro-Reitoriia de Pesquisa da UNESP - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Toxinas inseticidas do veneno da aranha-marrom (Loxosceles intermedia): Da Clonagem às análises funcionais e estruturais, Descrição: Este projeto tem como objetivo a clonagem, expressão heteróloga e caracterização estrutural (por cristalografia e difração de raios-X), bioquímica e biológica de toxina com atividade inseticida de L. intermedia com potencial para aplicações biotecnológicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Silvio Sanches Veiga - Coordenador / Olga Meiri Chaim - Integrante / Andrea Senff-Ribeiro - Integrante / Wademiro Gremski - Integrante / Luiza Helena Gremski - Integrante / Gabriel Otto Meissner - Integrante / Fernando Hitomi Matsubara - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Caracterização funcional e estrutural de toxinas do veneno de aranhas do gênero Loxosceles (aranha-marrom), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Silvio Sanches Veiga em 04/09/2013., Descrição: Realizar clonagem, expressão heteróloga e avaliação funcional de toxinas dos venenos loxoscélicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Silvio Sanches Veiga - Coordenador / Nader, H. B. - Integrante / Waldemiro Gremski - Integrante / Olga Meiri Chaim - Integrante / Helena Gremski - Integrante / K.C. Barbaro - Integrante / Andrea Senff-Ribeiro - Integrante / Rafael Bertoni da Silveira - Integrante / Hélio K. Takashi - Integrante / Marcos S. Toledo - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Establishing a Platform for the production of Nano- and Micro-Crystals for third Generation Synchrotron Radiation Sources and Free Electron Laser Sources, Descrição: Processo n 400641/2012-7 (Chamada 61/2011 Bolsa Pesquisador Visitante Especial); Vigência: 01/06/2012 (36 meses); Resumo: The recent development of very high brllliance micro-focus Synchrotron Radiation Beamlines and Free-Electron-Laser Beamlines promise to open new avenues in structural biology. Diffraction data can now be collected using micro- and nano- crystals of biological samples, allowing, in the futur. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Christian Betzel - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

Aptamers for diagnostic marker and therapeutic inhibitor discovery in infectious diseases, Descrição: Resumo: DNA aptamers interact with their target proteins with high selectivity, specificity and affinity. Iterative cycles of in vitro screening of a combinatorial oligonucleotide library for target binding (SELEX) followed by PCR amplification of selected sequences can be developed to target almost any protein. Due to the wide spectrum of applications, these novel molecules are used in numerous pharmacological, clinical and industrial processes. While the technique is yet emerging in Brazil, it is widely used for academic and industrial applications in most industrialized countries. The aim of the proposed Brazilian-German joint project is the application to exploit the SELEX technology in targeting organisms causing parasitic diseases including Plasmodium falciparum, Onchocerca volvolus and Trypanosoma cruzi. The evolved high-affinity DNA aptamers will be used for ligand-mediated target purification of parasite proteins. Inhibition assays will elucidate the effects of aptamer target protein binding. The importance of P. falciparum proteins, identified by aptamers in the erythrocyte cell membrane, will be further studied in protein trafficking and proliferation assays. Knock-out constructs of these proteins are foreseen to evaluate identified proteins on its viability for the parasite. In addition to creating scientific knowledge this project will active continuous exchange of scientists and students with the intention of creating a long-lasting research network. Moreover, since therapeutic applications are foreseen for most of the developed aptamers, these are intended to be commercialised within the translational framework of a Public Private Partnership .. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Ricardo Giordano - Integrante / Ariel Mariano Silber - Integrante / Carsten Wrenger - Coordenador / Gerhard Wunderlich - Integrante / Ulrich Henning - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - 2015

(Universal 2012) Virologia Estrutural, Descrição: Processo n 471193/2012-7 (Chamada Pública MCT/CNPq - N 14/2012 - Universal); Vigência: início 01/11/2012 (36 meses) Resumo: A replicação viral envolve a intrusão do vírus na célula vegetal e o seqüestro do maquinário das hospedeiras para a produção das proteínas necessárias para a formação de novas partículas virais. Estudos moleculares dos vírus de plantas têm sido feitos como, o seqüenciamento dos RNAs, a detecção dos RNAs subgenômicos e a determinação da estratégia para a expressão do genoma do vírus. Entretanto, muitos aspectos a respeito da função e estrutura de algumas proteínas, bem como sua relação com o ciclo de replicação viral ainda são desconhecidos. O presente trabalho tem como objetivo a produção de proteínas virais em estado nativo a partir de expressão em Escherichia coli tendo como alvo a determinação de suas estruturas tridimensionais em alta resolução, podendo assim trazer contribuições a cerca dos mecanismos e modos de funcionamento. As seguintes proteínas serão estudadas neste projeto de pesquisa: (i) proteína capsidial (CP) do Rupestris stem pitting-associated virus, (ii) do Pepper ringspot virus, (iii) do Grapevine virus A e (iv) Grapevine virus B; RNA dependente RNA polimerase (RdRp) (v) do Southern bean mosaic virus e (vi) do Pepper ringspot virus; possível proteína do movimento (vii) do Southern bean mosaic virus e (viii) do Pepper ringspot virus e (ix) Cole latent virus (25k); (x) genome-linked protein (VPg) do Southern bean mosaic virus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2014

Centro Multiusuários de Inovação Biomolecular Fase III, Descrição: Aquisição de um difratômetro de raios-X.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Fatima Pereira de Souza - Integrante / Valmir Fadel - Integrante / Marcelo Andrés Fossey - Integrante., Financiador(es): FINEP - Auxílio financeiro.
2011 - 2014

Proteômica e Peptidômica Estrutural de Toxinas, Descrição: Processo n 364-11, Vigência: 01/01/2011 a 31/12/2014; Resumo: Os objetivos do projeto colaborativo Brasil-Alemanha consistem, em seu caráter interdisciplinar, em explorar o potencial farmacêutico e biotecnológico de venenos de insetos, serpentes e aranhas a partir da biodiversidade européia e, principalmente, da brasileira, por meio da colaboração científica dos grupos de ambos os países com tradição na área de estudos estruturais de toxinas. A combinação do potencial científico, de equipamentos tecnológicos e do intercâmbio de conhecimento entre os grupos brasileiro e alemão permitirá uma caracterização estrutural e farmacológica detalhada de novos componentes de venenos e sua aplicação com propósitos médicos e biotecnológicos. Isso inclui a determinação da composição proteômica completa de venenos utilizando a combinação de técnicas como eletroforese bidimensional, espectrometria de massa, análise de seqüências, caracterização de atividades farmacológicas como propriedades anticancerígenas de venenos da família Viperidae, proporcionar maior conhecimento sobre os mecanismos patológicos de acidentes com venenos como os das aranhas do gênero Loxosceles e determinação da relação estrutura-função desses componentes usando espectroscopia de Ressonância Magnética Nucelar (RMN) e cristalografia da alta resolução usando radiação Síncrotron de alta energia disponível no DESY, Hamburgo. A espectroscopia de RMN, o espalhamento de raios-X a baixos ângulos e a espectroscopia Raman serão empregados para estudos da dinâmica e interações em solução de proteínas. Acidentes ofídicos com serpentes da família Viperidae causam intensa mionecrose, neurotoxicidade, hemólise intravascular, hemorragia e aumento da permeabilidade capilar. Tipicamente, o envenenamento ofídico é tratado com antissoros preparados a partir do veneno bruto, mas sua efetividade é limitada apesar do amplo espectro de ação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (8) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / C Betzel - Integrante / Patrick Jack Spencer - Integrante / Dessislava Georgieva - Integrante / Nicolay Genov - Integrante / Valmir Fadel - Integrante / Silvio Sanches Veiga - Integrante / Lars Redecke - Integrante / Markus Perbrandt - Integrante., Financiador(es): CAPES/DAAD/PROBAL - Auxílio financeiro.
2011 - 2014

Estudo funcional e estrutural de toxinas recombinantes do veneno de do Gênero Loxosceles (Aranha marrom)., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Silvio Sanches Veiga em 04/09/2013., Descrição: A proposta principal do projeto é expressar toxinas recombinantes do veneno de aranhas do gênero Loxosceles e estudar suas atividades biológicas, suas características bioquímicas, elucidar suas estruturas moleculares e os seus mecanismos de ação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Silvio Sanches Veiga - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - 2014

Modificações Pós-Traducionais e Interações Proteína-Proteína no Contexto das Toxinas de Venenos de Serpentes e seus Ligantes: Um Estudo Vênomico Detalhado, Descrição: Valor aprovado: aproximadamente R$ 1.600.000,00; Resumo: Classicamente, estudos proteômicos de venenos (venômica) têm por objetivo a identificação da composição proteica destas secreções, empregando principalmente a abordagem de eletroforese em gel, seguida de identificação por espectrometria de massas e/ou degradação de Edman. Entretanto, venenos de serpentes são secreções complexas muito ricas em isoformas, que podem interagir diferencialmente com receptores e/ou canais iônicos, enzimas e inibidores, interferindo com a homeostasia, a coagulação sanguínea e os sistemas nervoso, cardiovascular e/ou neuromuscular. Portanto, para compreendermos atividades biológicas tão diversas, é preciso identificar não só a composição de proteínas/peptídeos destes venenos, mas também avançar no detalhamento molecular de seus componentes e de seus ligantes (alvos moleculares e inibidores naturais). Neste projeto, pretendemos empregar a espectrometria de massas de alta resolução (nLC-LTQ-Orbitrap) para estudar o proteoma de venenos de serpentes relevantes para o continente americano, com ênfase no estudo em larga escala das isoformas das diferentes toxinas, incluindo a caracterização de suas modificações pós-traducionais (PTMs/glicosilações e fosforilações). Ainda que, provavelmente, sejam as maiores responsáveis pela grande heterogeneidade dos venenos, as PTMs têm sido muito pouco estudadas de modo sistemático nestas amostras. Estas informações deverão subsidiar estudos sobre a relação estrutura-função das toxinas, além de contribuir para análises onto- e filogenéticas em serpentes e potencialmente para a seleção mais eficaz dos venenos a serem utilizados na produção de soros antiofídicos. A Biologia Molecular, através da técnica de mutações sítio-dirigidas, será empregada como ferramenta complementar de validação dos estudos da relação estrutura-função de toxinas. A segunda grande vertente do projeto terá por objetivo aprofundar o conhecimento sobre o mecanismo de ação de proteínas antiofídicas isoladas do soro de animais resistentes ao envenenamento por serpentes. Estes inibidores naturais de toxinas hemorrágicas (ex.: DM43, BJ46a) e miotóxicas (ex.: DM64) funcionam como aceptores solúveis, prontos para neutralizar rapidamente os efeitos deletérios das toxinas. As constantes de dissociação de velocidade e no equilíbrio da interação entre as toxinas e os inibidores serão determinadas através de ressonância plasmônica de superfície (Biacore). Os complexos toxina-inibidor serão submetidos à cristalização e posterior análise por difração de raios X, para obtenção de informações estruturais de alta resolução. Em associação com as técnicas de cross-linking, intensity fading e/ou hidrólise enzimática, a espectrometria de massas será empregada no mapeamento das regiões de interação entre os inibidores e as toxinas hemorrágicas ou miotóxicas, identificando os requisitos estruturais que definem a especificidade de cada complexo. Posteriormente, fragmentos recombinantes e/ou peptídeos sintéticos dos inibidores serão utilizados para validar os resultados do mapeamento molecular. A porção glicídica dos inibidores também será analisada, assim como sua participação na manutenção da atividade inibitória destas moléculas. Com estas abordagens complementares, esperamos contribuir para a definição da estrutura mínima dos inibidores responsável por sua importante atividade biológica, abrindo caminho para o desenho racional de enfoques terapêuticos inovadores, principalmente para o tratamento das lesões teciduais locais. Dada a homologia de estruturas primária e terciária existente entre algumas toxinas de veneno e enzimas humanas, pretendemos igualmente testar o potencial de utilização dos inibidores naturais na modulação da atividade de metaloproteases e fosfolipases que participam em processos fisiológicos normais e/ou patológicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Jonas Enrique Perales Aguilar - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.
2011 - 2013

Proinfra 02/2010- Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular - Etapa II, Descrição: Instalação de Centro Multiusuário para estudos biofísicos e estruturais de biomloeculas - continuidade.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Fatima Pereira de Souza - Integrante / Valmir Fadel - Integrante / Marcelo Andrés Fossey - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
2010 - 2015

Biologia Estrutural de Proteínas de Vírus de Plantas, Descrição: Processo n 303593/2009-1 (Bolsas no País / Produtividade em Pesquisa - PQ - 2009), Nível 1A, Vigência: 01/03/10 (60 meses) A replicaçao viral envolve a entrada do vírus na célula vegetal e o seqüestro do maquinário das hospedeiras para a produção das proteínas necessárias para a formação de novas partículas. Estudos moleculares dos vírus de plantas têm sido feitos como, o seqüenciamento dos RNAs, a detecção dos RNAs subgenômicos e a determinação da estratégia para expressão do genoma do vírus. Entretanto, muitos aspectos a respeito da função e estrutura de algumas proteínas, bem como sua relação com o ciclo de replicação viral, ainda são desconhecidos. O presente trabalho tem como objetivo a produção de algumas proteínas virais em estado nativo, a partir de expressão em Escherichia coli, tendo como alvo a determinação de suas estruturas tridimensionais em alta resolução, podendo assim trazer contribuições a cerca dos mecanismos e modos de funcionamento. Serão estudadas as seguintes proteínas: proteína capsidial (CP) do Rupestris stem pittingassociated virus, do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus; RNA polimerase RNA dependente (RdRp) do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus; possível proteína do movimento do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2010 - 2014

EMU: AQUISICAO DE ESPECTROMETRO DE RESSONANCIA MAGNETICA NUCLEAR PARA ESTUDOS DE BIOMOLECULAS, Descrição: Processo n 2009/53989-4; Vigência: 01/08/2010 a 31/01/13. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / Marcelo Fossey - Integrante / Fatima Pereira de Souza - Integrante / Valmir Fadel - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2010 - 2012

Análise por Cristalografia e Difração de Raios-X de Proteínas e Produção de Proteínas Recombinantes utilizando Sistemas de Expressão em Células de Invertebrados, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Silvio Sanches Veiga em 04/09/2013., Descrição: Realizar expressão heteróloga de toxinas recombinantes do veneno da aranha marrom, cristalizar estas toxinas e obter por difração de RX estrutura tridimensional destas moléculas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Silvio Sanches Veiga - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2010 - 2012

Ampliação do Centro Multiusário de Inovação Biomolecular- PROINFRA 01/2009, Descrição: Criação e Ampliação do Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): FINEP - Auxílio financeiro.
2009 - 2011

(Universal 2009) Biologia Estrutural de Proteínas de Vírus de Plantas, Descrição: Processo n 474989/2009-7 (Edital MCT/CNPq 14/2009 - Universal); Vigência: 01/11/2009 (24 meses) A replicaçao viral envolve a entrada do vírus na célula vegetal e o seqüestro do maquinário das hospedeiras para a produção das proteínas necessárias para a formação de novas partículas. Estudos moleculares dos vírus de plantas têm sido feitos como, o seqüenciamento dos RNAs, a detecção dos RNAs subgenômicos e a determinação da estratégia para expressão do genoma do vírus. Entretanto, muitos aspectos a respeito da função e estrutura de algumas proteínas, bem como sua relação com o ciclo de replicação viral, ainda são desconhecidos. O presente trabalho tem como objetivo a produção de algumas proteínas virais em estado nativo, a partir de expressão em Escherichia coli, tendo como alvo a determinação de suas estruturas tridimensionais em alta resolução, podendo assim trazer contribuições a cerca dos mecanismos e modos de funcionamento. Serão estudadas as seguintes proteínas: proteína capsidial (CP) do Rupestris stem pitting-associated virus, do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus; RNA polimerase RNA dependente (RdRp) do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus; possível proteína do movimento do Southern bean mosaic virus e do Pepper ringspot virus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2008 - 2011

Applied Venom Proteomics, Descrição: Processo n 2007/54865-1, Vigência: 01/07/2008 a 30/06/2011. O projeto tem como alvo unificar o potencial científico de grupos de pesquisa do Brasil e Alemanha nas investigações de aspectos estruturais, funcionais, biotecnológicos e farmacológicos de novas proteínas e outras biomoléculas isoladas de insetos, serpentes, aranhas e outros organismos provenientes da biodiversidade européia e principalmente brasileira. A colaboração irá implicar uma sofisticada combinação de "Know-How" e técnicas analíticas como biologia molecular, bioquímica, cristalografia e espectroscopia, assim como permuta de venenos animas e de insetos. O primeiro alvo será a determinação de forma detalhada e comparativa da composição proteômica de venenos selecionados de serpentes européias e brasileiras. Resultados preliminares mostraram mais de 100 diferentes componentes protéicos nos venenos de serpentes européias, das quais 50% são ainda desconhecidas. No Brasil a biodiversidade de generos e espécies de serpente é extremamente ampla sendo que existem ainda serpentes, insetos e aranhas ainda não identificados e classificados, principalmente na região da mata atlântica e amazônica. Assim, neste projeto pretende-se isolar e caracterizar funcionalmente e estruturalmente novas proteínas de venenos que possam afetar o sistema hemostático, tanto na via coagulante com fibrinolítica, assim como leishmaniose e crescimento de tumores cancerígenos. O conhecimento detalhado da composição dos venenos permitirá a produção de anti-venenos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2007 - 2010

Aspectos Estruturais e Funcionais de Toxinas, Peptídeos Potenciadores de Bradicinina e Serino-Proteases., Descrição: Processo n 307853/2006-3 (PQ 10/2006), Vigência: 01/03/07 a 01/02/10 Nos últimos anos, ocorreu um grande avanço nos estudos estruturais e nos efeitos farmacológicos das toxinas dos venenos de serpentes. A extensão dos trabalhos realizados até o momento indica um grande potencial a ser explorado na avaliação da estrutura e função dessas proteínas que modulam alterações no sistema hemostático e membranas biológicas. O presente projeto tem como principal objetivo à determinação das estruturas tridimensionais de (a) proteínas miotóxicas, (b) proteína precursora dos peptídeos potenciadores de bradicinina e (c) serino-proteases presentes no veneno de serpentes. Almeja-se delinear os determinantes estruturais da atividade miotóxica de Lys49 PLA2s através de estudos bioquímicos in vitro e in vivo e resolução de estruturas tridimensionais de complexos de Lys49 PLA2s com substâncias polianiônicas como suramina, derivados de heparina e extratos de plantas que são efetivas na inibição da atividade miotóxica. Determinar a estrutura tri-dimensional da proteína precursora dos peptídeos potenciadores de bradicinina (BPP), pois se acredita que a mesma tenha o potencial de revelar um novo enovelamento protéico assim como o de elucidar o mecanismo envolvido no processamento do precursor para a liberação dos peptídeos potenciadores de bradicinina. Estudos adicionais relacionados à estrutura-função dos peptídeos com a ACE (angiotensin converting enzyme) também se fazem necessários para que os elementos estruturais críticos envolvidos na interação seletiva dos BPPs com os domínios da ACE sejam desvendados. Por fim, objetiva-se determinar a estrutura serino-proteases ? que interferem nos processos de coagulação e agregação de plaquetas - assim como das mesmas em complexo com inibidores objetivando-se, das interações enzima/inibidor e estéreo-especificidade. Esses estudos estruturais fornecerão informações valiosas com potencial aplicação no desenvolvimento de antivenenos e em trata. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
2007 - 2009

(Universal 2007) Expressão, Purificação, Cristalização e Determinação das Estruturas Cristalográficas das Proteínas Nudel Humana (Nuclear Distribution Element-Like)-Oligopeptidase, Chaperonas HSP65 e Proteínas Precursoras de Peptídeos Reguladores da, Descrição: Processo n 473997/2007-0 (Universal 2007 Faixa B), Valor Total: R$ 36.200,00, Vigência: 21/11/07 (24 meses) Este projeto tem como alvo estudar proteínas de grande interesse médico como a NUDEL-oligopeptidase ligadas a doenças neurodegenerativas, Hsp65 com possível atividade catalítica e proteínas precursoras de peptídeos potenciadores de bradicicina que é responsável pela regulação da pressão sanguínea. Técnicas de biologia molecular, bioquímica, espectroscopia e principalmente cristalografia serão empregadas para a elucidação dos determinantes estruturais dos mecanismos moleculares envolvidas em tais processos biológicos. Nos estudos com as proteínas precursoras de BPP tem-se como alvo a elucidação do mecanismo evolvido no processamento do precursor para a liberação destes peptídeos que é de suma importância na modulação destes medicamentos. Por outro lado, estamos estudando a Hsp65 de Mycobacterium leprae, que são extremamente imunogênicas, acarretando, em infecções bacterianas, reações humorais e celulares por parte do hospedeiro. Além disso, foi evidenciada que a Hsp65 de M. leprae apresenta atividade de peptidase. Por fim, a NUDEL-olipeptidase, que é uma cisteíno-protease envolvida na conversão e inativação de peptídeos bioativos. Essa proteína interage com proteínas neuronais e é essencial no desenvolvimento e organização do córtex cerebral durante a embriogênese. Mais recentemente encontrou-se evidência de seu possível envolvimento em processos como, rota metabólica, sinalização celular e mudança do citoesqueleto, além da modulação de processos fisiopatológicos de desordens neurológicas e neuroespecíficas como a Esquizofrenia e a Lisencefalia. Assim, o estudo e a melhor compreensão do papel desempenhado por essa proteína bem como a elucidação de sua estrutura serão de grande importância para o entendimento da NUDEL no desenvolvimento e na manutenção das funções normais do sistema nervoso central, possibilitando o desenho. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
2005 - 2007

(Universal 2004) Estruturas Cristalográficas de Proteínas envolvidas na Coagulação Sangüínea, Transporte Intracelular e Termoestabilidade, Descrição: Processo n 473097/2004-4 (Universal 2004), Valor Total: R$ 11.998,93, Vigência: 01/02/2005 (24 meses) Neste projeto de pesquisa pretendemos determinar as estruturas cristalográficas das proteinas Fator Xa humana, esfingomielinase, fosfolipases A2, miosina Va e xilanase. Estas proteinas exercem um papel chave nos processos de coagulação sanguínea, transporte intracelular e termoestabilidade. As informações estruturais serão importantes para entender a esteroespecificidade dessas proteinas e também para caraterizar o exosítio, permitindo o desenvolvimento de novos inibidores e drogas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
2005 - 2007

Estruturas Cristalográficas de Proteínas envolvidas na Coagulação Sangüínea, Transporte Intracelular e Termoestabilidade, Descrição: Processo n 2004/11258-0 (Auxílio Pesquisa - Regular), Valor Total: R$ R$ 213.807,57, Vigência: 01/04/05 a 30/09/07. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.
2004 - 2007

Radiação Sincroton de Alta Energia e Resolução Atômica de Estruturas de Proteínas Envolvidas na Coagulação Sangüínea e Miotoxicidade, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador / C Betzel - Integrante / P. A. TUCKER - Integrante., Financiador(es): CAPES/DAAD/PROBAL - Outra.
2000 - 2009

Center for Applied Toxicology, Descrição: Processo n 1998/14307-9 (Auxílio Pesquisa - Programa Centros de Pesquisa), Vigência: 01/10/000 a 31/12/09. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Antônio Carlos Martins de Camargo - Coordenador / Osvaldo Augusto Brazil Esteves Sant'Anna - Integrante / Denise Vilarinho Tambourgi - Integrante / Solange Maria de Toledo Serrano - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra.
2000 - 2003

Estrutura e Função da Desidrogenase Alcoólica Secundária de Thermoanaerobacter e Thanolicus 39E e da ADP-Glicose Pirofosforilase (ADP-GLC-PPASES)., Descrição: Processo n 1999/09162-4 (Auxílio Pesquisa - Regular), Valor Contratado: R$ 413.365,13, Vigência: 01/01/00 a 30/06/03. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra.
2000 - 2001

Michigan State University - Estados Unidos, Descrição: Processo n 2000/10768-3 (Bolsa no Exterior - Regular - Pesquisa), Valor Total: R$ R$ 21.715,11. Vigência: 16/12/00 a 15/04/01. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
1993 - 1996

Cristalografia de Macromoléculas, Descrição: Processo n 1993/00278-3 (Auxílio Pesquisa - Regular), Valor Contratadol: R$ R$ 15.504,16, Vigência: 01/07/93 a 30/06/96. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raghuvir Krishnaswamy Arni - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

Prêmios

2015

SBBq Award 2015 ? o trabalho 'POTENTIAL IMPLICATIONS FOR DRUG DESIGN AGAINST PHOSPHOLIPASE-D FROM Loxosceles intermedia' recebeu a premiação de um dos melhores posteres apresentados durante o evento, 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq).

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física. , Rua Cristovão Colombo, no. 2265, Jardim Nazareth, 15054000 - São José do Rio Preto, SP - Brasil, Telefone: (017) 32212240, Fax: (017) 32212247

Experiência profissional

2007 - Atual

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - UNESP/ SJRP

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40

Atividades

07/2018
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Turma 1 (60 h/a); Física Turma 2 (60 h/a)
05/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Membro da Comissão Interna de Biossegurança - CIBio, do IBILCE/UNESP.
08/2019 - 12/2019
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estagio Curricular
08/2019 - 12/2019
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física
03/2019 - 07/2019
Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Laboratório de Física 1 Turma 1 e Turma 2
03/2019 - 07/2019
Ensino, Bacharelado em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Estrutural
03/2019 - 07/2019
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estagio Curricular
03/2018 - 06/2018
Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, 1820SQ1 - Laboratório de Física I, 1820SQ2 - Laboratório de Física I
06/2014 - 06/2016
Direção e administração, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Vice-chefe do Departamento de Física do IBILCE/UNESP.
06/2012 - 06/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Membro do Conselho do Departamento de Física deste instituto.
02/2015 - 12/2015
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física - turma 1 (60 h/a); Física - turma 2 (60 h/a)
03/2014 - 08/2014
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física - turma 1 (60 h/a); Física - turma 2 (60 h/a)
11/2013 - 11/2013
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Recobinant protein production for X-ray-Crystallography (60 h/a), Studying Protein-Ligand-Interaction using latest NMR techniques (60 h/a)
08/2013 - 11/2013
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Estrutural Avançada (120 h/a)
09/2012 - 11/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Membro da COMISSÃO INTERNA DE ACOMPANHAMENTO E RECEBIMENTO da obra referente à Construção do prédio para o Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular.
02/2013 - 07/2013
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física - turma 1 (60 h/a), Física - turma 2 (60 h/a)
07/2012 - 12/2012
Ensino, Bacharelado em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Estrutural (60h/a)
02/2012 - 12/2012
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estratégias para produção e purificação de proteínas recombinantes em sistemas heterólogos (120h/a)
10/2012 - 10/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Avaliou e emitiu parecer sobre Resumo Expandido de trabalho a ser apresentado na primeira fase do XXIV Congresso de Iniciação Científica da UNESP - CIC/2012.
02/2012 - 06/2012
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física (60h/a) - Turma 1, Física (60h/a) - Turma 2
03/2012 - 03/2012
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Structural Biology: Methods and Applications (120h/a)
03/2012 - 03/2012
Ensino, Microbiologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Structural Biology: Methods and Applications (60h/a)
08/2011 - 12/2011
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais: Characterizing Proteins in Solution by Dynamic Light Scattering - 120 horas
02/2011 - 12/2011
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física (Regime Especial de Recuperação), Física (60h/a) (Turma 2), Física (60h/a) (Turma 1)
02/2011 - 02/2011
Direção e administração, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Chefia do Departamento de Física no período de 11 a 25/02/2011, tendo em vista as férias regulamentares do Prof. Dr. Marcelo Andrés Fossey, chefe de departamento e férias e afastamento integral do Prof. Dr. Lucas Fugikawa Santos, vice-chefe do depart.
07/2010 - 12/2010
Direção e administração, Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Cargo ou função, Designado como primeiro substituto do Chefe e do Vice-Chefe do Departamento de Física em seus eventuais impedimentos legais de acordo com a Portaria do Vice-Diretor no exercício da direção de 21 de Julho de 2010..
02/2010 - 07/2010
Ensino, Bacharelado em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Cristalografia - 60 horas
02/2010 - 07/2010
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física - 60 horas - Turma 2, Física - 60 horas - Turma 1
03/2008 - 12/2008
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física - 60 horas - Turma 1, Física - 60 horas - Turma 2, Biofísica - 60 horas - Turma 1, Biofísica - 60 horas - Turma 2

1997 - 2007

Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSOR LIVRE-DOCENTE, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

1992 - 1997

Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSESOR ASSISTENTE DOUTOR, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2007 - 11/2007
Ensino, Microbiologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estrutura e função de proteínas
01/2007
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Universitat Hamburg com auxílio Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
01/2006
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Universitat Hamburg com auxílio Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
01/2006
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Universitat Hamburg com auxílio Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
01/2005
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Universitat Hamburg com auxílio Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
03/2004 - 12/2004
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Biológica - 60 Horas - Turma 1, Física Biológica - 60 Horas - Turma 2, Biofísica - 60 Horas - Turma 1, Biofísica - 60 Horas - Turma 2
01/2004
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Universitat Hamburg com auxílio Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
01/2002
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Michigan State University, M.S.U., Estados Unidos com auxílio National Institute Of Health.
08/2001 - 12/2001
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biofísica - 60 Horas - Turma 1, Biofísica - 60 Horas - Turma 2
12/2000 - 04/2001
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, ESTRUTURA CRISTALOGRAFICA DE ADP GLICOSE PIROFOSFORILASE (Prof. Visitante - Michigan State University, M.S.U., Estados Unidos com auxílio Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo FAPESP (Processo n 2000/10768-3)).
01/1999
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Michigan State University, M.S.U., Estados Unidos.
01/1997
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Michigan State University, M.S.U., Estados Unidos com auxílio National Institute Of Health.
01/1993
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.,Atividade de extensão realizada, Prof. Visitante - Michigan State University, M.S.U., Estados Unidos com auxílio National Institute Of Health.

1999 - 2000

Michigan State University

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 0

Outras informações:
Visiting Adjunct Professor Department of Biochemistry Michigan State University East Lansing

Atividades

02/1999 - 12/1999
Pesquisa e desenvolvimento, Department Of Biochemistry.,Linhas de pesquisa

2004 - 2017

Universidade de Hamburgo

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor visitante no Depto de Química

2005 - 2009

Instituto Butantan

Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Vice-Diretor do CAT/CEPID

Atividades

10/2005 - 08/2009
Direção e administração, Laboratório Especial de Toxinologia Aplicada - Instituto Butantan.,Cargo ou função, Vice-Diretor do CAT/CEPID.
10/2005 - 08/2009
Pesquisa e desenvolvimento, Unesp - SJRP/ Depto de Física/ Lab. de Cristalografia.,Linhas de pesquisa

2011 - 2017

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Coordenador de Equipe, Enquadramento Funcional: Colaborador