Daniele Almeida Alves

Formação complementar

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Organização de eventos

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• JESUS, HENDOR N. R. ; RAMOS, JULIANA N. ; ROCHA, DANILO J. P. G. ; ALVES, DANIELE A. ; SILVA, CAROLINA S. ; CRUZ, JOÃO V. O. ; VIEIRA, VERÔNICA V. ; SOUZA, CASSIUS ; SANTOS, LOUISY S. ; NAVAS, JESUS ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; AZEVEDO, VASCO ; AGUIAR, ERIC R. G. R. ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; PACHECO, LUIS G. C. . The pan-genome of the emerging multidrug-resistant pathogen Corynebacterium striatum. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS , v. 23, p. 01-15, 2023.

• MENDES DE ALMEIDA, VIVIANI ; ENGEL, DAIANE F. ; RICCI, MAYRA F. ; CRUZ, CLÊNIO SILVA ; LOPES, ÍCARO SANTOS ; ALVES, DANIELE ALMEIDA ; D? AURIOL, MIRNA ; MAGALHÃES, JOÃO ; MACHADO, ELAYNE C. ; ROCHA, VICTOR M. ; CARVALHO, TONIANA G. ; LACERDA, LARISSE S. B. ; PIMENTA, JORDANE C. ; AGANETTI, MARIANA ; ZUCCOLI, GIULIANA S. ; SMITH, BRADLEY J. ; CARREGARI, VICTOR C. ; DA SILVA ROSA, ERIKA ; GALVÃO, IZABELA ; DANTAS CASSALI, GEOVANNI . Gut microbiota from patients with COVID-19 cause alterations in mice that resemble post-COVID symptoms. Gut Microbes , v. 15, p. 2249146, 2023.

• SOUZA, FÁBIO NEVES ; AGUIAR SANTOS, MAÍSA ; ALVES, DANIELE ALMEIDA ; MELO, LEYVA CECÍLIA VIEIRA DE ; MOTA, DAN JESSÉ GONÇALVES DA ; PERTILE, ARSINOÊ CRISTINA ; GAVA, RICARDO ; PINTO, PEDRO LUIZ SILVA ; EYRE, MAX THOMAS ; ZEPPELINI, CAIO GRACO ; REIS, MITERMAYER GALVÃO DOS ; KO, ALBERT ICKSANG ; BEGON, MIKE ; BAHIENSE, THIAGO CAMPANHARO ; COSTA, FEDERICO ; CARVALHO-PEREIRA, TICIANA SOARES DE ANDRADE . in urban populations of terrestrial gastropods and rats in an impoverished region of Brazil. PARASITOLOGY , v. 2, p. 1-34, 2021.

• ALVES, D. ; BOMFIM, G. C. . Determinismo genético no ideário dos alunos do 2° ano.. Revista Jovens Cientistas, p. 32 - 33, 30 set. 2015.

• ALVES, D. ; AGUIAR, E. R. G. R. ; PACHECO, L. G. C. . INTEGRATING OVERALL GENOME-RELATEDNESS INDEXES (OGRIS) TO IMPROVE GENOME-BASED SPECIES IDENTIFICATION OF BACTERIAL PATHOGENS. In: 7º Simpósio Internacional de Microbiologia, 2020, Sao Paulo. 260139-1Integrating Overall Genome-Relatedness Indexes (OGRIs) to Improve Genome-Based Species Identification of Bacterial Pathogens, 2020.

• ALVES-ALMEIDA,D. ; SANTOS, M. A. ; SOUZA, F. N. ; BAHIENSE, T. C. ; REIS, M. G. ; CARVALHO-PEREIRA, T. S. A ; COSTA, F. . The promiscuity of Angiostrongylus cantonensis in an urban slum: prevalence and intensity of infection in intermediate hosts. In: XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017, Búzios. XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017.

• SANTOS, M. A. ; ALVES-ALMEIDA,D. ; SOUZA, F. N. ; BAHIENSE, T. C. ; REIS, M. G. ; CARVALHO-PEREIRA, T. S. A ; COSTA, F. . Prevalence and risk of infection by Angiostrongylus cantonensis in an urban population of Rattus norvegicus. In: XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017, Buzios. XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017.

• SOUZA, F. N. ; SANTOS, M. A. ; ALVES-ALMEIDA,D. ; BAHIENSE, T. C. ; REIS, M. G. ; COSTA, F. ; CARVALHO-PEREIRA, T. S. A . Slugs? and snails? prevalence and abundance in an urban slum: a threat of infectious diseases. In: XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017, Buzios. XXV Congresso Brasileiro de Parasitologia, 2017.

• ALVES, DANIELE ALMEIDA . Desvendando o dogma central da biologia através do sequenciamento de RNA. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALVES, D. . Utilização da Genômica para identificação de procariotos. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ALVES, DANIELE A. . UTILIZAÇÃO DA GENÔMICA PARA IDENTIFICAÇÃO DE PROCARIOTOS. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALVES-ALMEIDA,D. ; CARVALHO-PEREIRA, T. S. A ; COSTA, F. . The promiscuity of Angiostrongylus cantonensis in an urban slum: prevalence and intensity of infection in intermediate hosts. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ALVES-ALMEIDA,D. ; CARVALHO-PEREIRA, T. S. A ; SANTOS, M. A. ; SOUZA, F. N. ; BAHIENSE, T. C. ; REIS, M. G. ; COSTA, F. . The promiscuity of Angiostrongylus cantonensis in an urban slum: prevalence and intensity of infection in intermediate hosts. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ALVES-ALMEIDA,D. ; SANTOS, H. S. ; PAIXÃO-CÔRTES, VR . Evolução molecular do gene SRGAP2. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• ALVES, D. ; BOMFIM, G. C. . Determinismo genético no ideário de alunos do 2° ano do Ensino Médio. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALVES, D. ; BOMFIM, G. C. . Conhecendo a célula. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• ALVES-ALMEIDA,D. ; BOMFIM, G. C. ; LEME, C. L. D. . A visão dos alunos sobre o processo de expressão gênica. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - 2023

  Monitoramento de amostras biológicas complexas para a presença de sequências virais utilizando metatranscriptômica associada a inteligência artificial, Descrição: A identificação de sequências virais em amostras complexas tem grande aplicabilidade do ponto de vista biotecnológico e médico. Os vírus contribuem com uma grande parte da diversidade genética observada em diversos tipos de amostras complexas. Nesse contexto, a metagenômica permite o estudo da diversidade genética coletiva presente em um ecossistema através do sequenciamento direto do material genético isolado de amostras complexas. A metagenômica tem sido amplamente empregada em estudos para identificação do conjunto de vírus, o viroma, em amostras biológicas. Entretanto, a detecção de vírus é limitada. As estratégias convencionais de procura por similaridade de sequência contra referências conhecidas são uma grande limitação para a descoberta de novos vírus.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Daniele Almeida Alves - Integrante / João Trindade Marques - Coordenador.

• 2019 - 2020

  Avaliação da utilização dos índices de Similaridade Genômica Global (ISGG) na classificação de espécies patogênicas emergentes do gênero Corynebacterium, Descrição: A identificação específica dos organismos patogênicos emergentes do gênero Corynebacterium é dificultada pela escassez de métodos de identificação com base em seus perfis bioquímicos devido sua ampla variedade de perfis, que não estão disponíveis no sistema padronizado para tal identificação. A correta identificação da espécie bacteriana causadora da infecção pelo laboratório de microbiologia clínica, com determinação do perfil de sensibilidade a antimicrobianos, é um dos pilares de um programa de gerenciamento de sucesso da Agência Nacional de Vigilância Sanitária. No entanto, estes organismos são comumente relatados como taxonomicamente confusos, sendo um problema para a microbiologia clínica. Os métodos moleculares considerados como padrão ouro também apresentam limitações para uma classificação entre espécies intimamente relacionadas. A disponibilidade de sequências genômicas pode ajudar na padronização da taxonomia, oferecendo maior precisão. A delimitação de espécies baseada em comparações computacionais do genoma para determinar os Índices de Similaridade Genômica Global (ISGG) surgiu, e estudos recentes mostraram que a Hibridização DNA-DNA virtual pode substituir a DDH padrão baseada em laboratório, a fim de simplificar e, ao mesmo tempo, substanciar esse aspecto central da delineação de espécies procarióticas. A resistência emergente a antibióticos em espécies corineformes implica na rápida e acurada identificação destas bactérias em nível de espécie, formulação de procedimentos de testagem padrão para resistência a antibióticos, reformulação do tratamento empírico e vigilância contínua de seus padrões de resistência. Assim, este estudo prevê o desenvolvimento e a validação de uma estratégia para classificação rápida e confiável de espécies bacterianas patogênicas emergentes causadoras de infecções multirresistentes, avaliando a classificação de espécies patogênicas emergentes do gênero Corynebacterium utilizando a identidade média de nucleotídeos (ANI) baseado no método BLASTN (ANIb) e frequência de tetranucleotídeos, disponibilizando-a para a comunidade científica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Daniele Almeida Alves - Integrante / Luis Gustavo Carvalho Pacheco - Coordenador / Eric Roberto Guimarães Rocha Aguiar - Integrante.

• 2016 - 2017

  Fatores de riscos de infecção de Angiostrongylus cantonensis em lesmas e caramujos em comunidade carente de Salvador-Bahia, Descrição: Roedores presentes nos ambientes peri-urbano e rural podem servir como reservatório e veículo para diversos parasitas, a exemplo, bactérias, fungos, vírus e helmintos. Rattus norvegicus, Berkenhout (1769) é um dos vertebrados invasores mais bem sucedidos, sendo responsável por prejuízos na agricultura e na infraestrutura urbana, onde fatores ambientais e sociais podem influenciar na distribuição, na densidade e na adaptação de sua população. Além disso, está espécie é um reservatório para diversos parasitas, tendo apresentado co-infecção por Leptospira spp, Bartonella spp, e vírus Seoul. Por outro lado, seu papel como hospedeiro para helmintos de importância para a saúde pública é menos conhecido. Condições ambientais que tornem favoráveis a ocorrência de infecção por A. cantonensis na população de ratos pode se tornar um fator de risco para infecção humana, em locais onde populações de ratos e humanos convivem intimamente. Este trabalho objetiva identificar fatores de risco associados à infecção por Angiostrongylus cantonensis em uma população urbana de Rattus norvegicus, com foco em fatores ambientais, demográficos e de condição corporal do rato, e coinfecção. Os resultados contribuirão para a tomada de medidas mitigadoras visando a vigilância epidemiológica, além de permitir a previsão de risco de aquisição e transmissão deste helminto tanto para a fauna em geral como para humanos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Daniele Almeida Alves - Integrante / Federico Costa - Coordenador / Ticiana Soares de Andrade de Carvalho Pereira - Integrante.

• 2015 - 2016

  Evolução molecular dos genes SRGAP1, SRGAP2, SRGAP3 e ARHGAP4, Descrição: Entre os diversos genes responsáveis pelo desenvolvimento cerebral, a família dos genes SRGAPs (SLIT-ROBO RHO GTPASE ACTIVATING PROTEIN) tem um papel destacado. Esta família é constituída por quatorze genes. O projeto estudou a evolução molecular da família SRGAP e associando mudanças nos padrões evolutivos a inovações funcionais em humanos e outros vertebrados. O aluno recebeu treinamento nas ferramentas de bioinformática, coletando as sequências dos genes SRGAP1, SRGAP2, SRGAP3 e ARHGAP4 para as 68 espécies de vertebrados disponíveis nos bancos de dados genômicos. O projeto consistiu na utilização de programas para determinar as taxas evolutivas dos genes SRGAP1, SRGAP2, SRGAP3 e ARHGAP4 nas espécies de vertebrados disponíveis em bancos genômicos e testou se as mudanças nas proteínas nos diferentes membros da família apresentavam um padrão de coevolução de sítios.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Daniele Almeida Alves - Integrante / Vanessa Rodrigues Paixão Côrtes - Coordenador.

• 2014 - 2015

  A visão dos alunos sobre o processo de expressão gênica., Descrição: Na sociedade atual, marcada pelo avanço das técnicas de Biologia Molecular, com a manipulação do material genético, é fundamental a orientação dada pelos PCN? Ensino Médio, segundo os quais o desenvolvimento de técnicas de manipulação do DNA levanta aspectos éticos que suscitam a reflexão sobre as relações entre ciência, tecnologia e sociedade. Nesse contexto, o posicionamento criterioso dos cidadãos requer o conhecimento sobre a estrutura do DNA e os processos envolvidos na sua expressão, o que justifica o ensino dos conceitos fundamentais da genética clássica e molecular. O estudo investigou o entendimento dos alunos sobre o processo de expressão gênica, e verificou o quanto esse entendimento está povoado por uma visão determinista da genética. O trabalho foi realizado no Colégio Estadual Luiz Viana (Salvador ? Bahia) com alunos do 2° ano do Ensino Médio, e teve como estratégia a realização de discussões apresentando os conceitos da genética para o dia-a-dia do estudante. Inicialmente foram feitas discussões para sondar o imaginário dos alunos a respeito da expressão de características genéticas, uma vez que ainda não estudaram formalmente esse conteúdo ministrado no 3° ano. Os resultados revelaram, como esperado, limitações nos conhecimentos sobre a estrutura do DNA, hereditariedade, genes, mutações e processos de expressão gênica. Além disso, mostraram que os alunos entendem que a genética ?é a passagem de uma característica de pai para filho?, mas possuem uma visão determinista da genética, ou seja, todas as características se devem exclusivamente aos genes. Essa visão torna parcial o entendimento da expressão gênica ao desconsiderar a influência do ambiente e pode levar a distorções na atitude dos indivíduos pois, por exemplo, na visão elaborada pelos alunos ?alguém é bom aluno porque é favorecido geneticamente e não por desenvolver um potencial através do empenho com os estudos?.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Daniele Almeida Alves - Integrante / Gilberto Cafezeiro Bomfim - Coordenador.

Prêmios