TIAGO ANTONIO DE SOUZA

Possui graduação em Ciências Biológicas (Bacharelado e Licenciatura), Mestrado em Genética e Biologia Molecular pela UNICAMP, desenvolvido no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (atual LNBio/MCT/ABTLus) e Doutorado em Ciências pelo Programa Interunidades em Biotecnologia pela USP. Foi especialista do CEFAP-USP, onde ajudou a implementar, desenvolver e manter a core-facility de serviços de genômica e transcriptômica a dezenas de pesquisadores de várias instituições de pesquisa. Atua nas grandes áreas de Bioinformática, Biologia Molecular e Bioquímica, com especial interesse nas aplicações das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) em abordagens inovadoras e interdisciplinares; na implementação e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análise de dados de resequenciamento e de processos mutagênicos em escala genômica e na caracterização funcional e molecular das relações entre genótipo e fenótipo.

Informações coletadas do Lattes em 19/09/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biotecnologia

2014 - 2018

Universidade de São Paulo
Título: Análise das alterações genéticas em exomas de camundongos
, Ano de obtenção: 2018. Carlos Frederico Martins Menck. Coorientador: Silvia Gomes Massironi. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Mestrado em Genética e Biologia Molecular

2008 - 2010

Universidade Estadual de Campinas
Título: Caracterização molecular entre proteínas envolvidas no controle da expressão gênica e a proteína efetora PthA, indutora do cancro cítrico., Ano de Obtenção: 2010
Celso Eduardo Benedetti.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Bacharelado em Ciências Biológicas

2004 - 2007

Universidade Estadual de Campinas
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas

2004 - 2007

Universidade Estadual de Campinas

Ensino Médio (2º grau)

2001 - 2003

Colégio Universitário - UFV

Formação complementar

2017 - 2017

Bioinformatics and Genome Analyses Course. (Carga horária: 80h). , European Molecular Biology Organization, EMBO/EMBL, Alemanha.

2016 - 2016

PCR quantitativa em tempo real (qPCR). (Carga horária: 20h). , Life Tecnologies, LIFE TEC, Brasil.

2016 - 2016

Treinamento ABI3130xl. (Carga horária: 16h). , Life Tecnologies, LIFE TEC, Brasil.

2016 - 2016

Armazenamento, Manuseio e Descarte de Produtos Químicos. (Carga horária: 6h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2016 - 2016

Treinamento Illumina - NextSeq. (Carga horária: 25h). , Illumina, ILLUMINA, Brasil.

2016 - 2016

Biossegurança e Boas Práticas de Laboratório do ICB. (Carga horária: 6h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

Extensão universitária em Uso de animais para experimentação. (Carga horária: 10h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

56th Annual Short Course on Mammalian Genetics. (Carga horária: 70h). , Jackson Laboratory for Genomic Medicine, JAX, Estados Unidos.

2013 - 2013

Treinamento -NGS Illumina MiSeq. (Carga horária: 16h). , Illumina, ILLUMINA, Brasil.

2012 - 2012

Treinamento - Sequenciamento de Nova Geração SOLiD. (Carga horária: 80h). , Life Tecnologies, LIFE TEC, Brasil.

2011 - 2011

Treinamento em Biossegurança. (Carga horária: 8h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2011 - 2011

FACS Aria III Cell Sorter Training. (Carga horária: 32h). , BD Biosciences, BD, Brasil.

2009 - 2009

Patogenicidade Bacteriana. , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2009 - 2009

Fundamentos para operação de Linux. (Carga horária: 12h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.

2007 - 2007

Quorum Sensing. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2006 - 2006

Proteínas Recombinantes e Suas Aplicações. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2006 - 2006

Citogenética e Biologia Molecular no Câncer. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2006 - 2006

Metodologia, Redação e Publicação Científica. (Carga horária: 24h). , Instituto Agronômico de Campinas, IAC, Brasil.

2005 - 2005

Introdução à técnica de interferência por RNA-RNAi. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2005 - 2005

Genética do Câncer. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Genética Humana e Médica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Mutagenese.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Controle da Expressão Gênica.

Participação em eventos

XV Curso de Verão em Bioinformática - USP | 2024,.Bioinformática e Empreendedorismo. 2024. (Seminário).

XXII Congresso do Programa de Pós-Graduação em Biologia Estrutural e Funcional da UNIFESP. Mesa Redonda III: Os caminhos seguintes à pós-graduação. 2024. (Congresso).

IV FÓRUM DE HLA.Desenvolvendo apps e ferramentas de bioinformatica. 2022. (Encontro).

XII Congresso Mutagen 2016. WOLAND: A tool for analysis of point mutation patterns from resequencing genomics data.. 2016. (Congresso).

29th International Mammalian Genome Conference. Whole-exome sequencing of ENU-induced mutant mice with BALB/c background. 2015. (Congresso).

56th Annual Short Course on Medical and Experimental Mammalian Genetics.Whole-exome sequencing of ENU-induced mutant mice with BALB/c background. 2015. (Simpósio).

O DNA recombinante: Técnicas, Avanços e Aplicações na atualiadade.A Tecnologia do DNA Recombinante e a era pós-Genômica: aspectos básicos e perspectivas. 2012. (Oficina).

User Meeting BD FACS ARIA III. 2012. (Encontro).

7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SoIBio). 2011. (Congresso).

Workshop Next-Generation Sequencing. 2011. (Oficina).

20 Reunião Anual dos Usuários do LNLS.Protein-Protein interactions and structural analysis of citrus proteins involved in transcriptional control during citrus canker disease.. 2010. (Encontro).

I Workshop de Citros. 2010. (Oficina).

I Workshop de Proteômica. 2010. (Encontro).

II Simpósio de Genetica e Biologia Molecular de Plantas.Interaction between a plant Auxin Response Factor and the effector protein PthA. 2009. (Simpósio).

XXXVII Reunião Anual da SBBq. RNA binding properties of a citrus High Mobility group Protein involved in transcriptional control. 2009. (Congresso).

18a Reuniao Anual de Usuarios do LNLS.Molecular characterization of Citrus sinensis proteins that interact with Xanthomonas citri effector protein PthA, citric canker inducer.. 2008. (Encontro).

II Structural Biology Workshop of the LNLS.. 2007. (Oficina).

VIII CAEB. Caracterização Molecular de Proteínas de Citrus sinensis que interagem com a proteína efetora PthA.. 2007. (Congresso).

XV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp. Caracterização molecular de proteínas de Citrus sinensis que interagem com a proteína efetora PthA2, indutora do cancro cítrico.. 2007. (Congresso).

XVII RAU - Reunião Anual dos Usuários do LNLS.Molecular characterization of Citrus sinensis proteins that interact with Xanthomonas citri effector protein PthA.. 2007. (Encontro).

XXXVI Reunião Anual da Sbbq e 10th IUMBMB Conference. Analysis of PthA interactions with citrus proteins involved in transcriptional control.. 2007. (Congresso).

Efeito do peróxido de hidrogênio na bioenergética mitocondrial e na atividade das fosfatases em Trypanosoma cruzi.. XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp. 2006. (Congresso).

Hydrogen peroxide treatment leads to alteration in mitochondrial functions in Trypanosoma cruzi epimastigotes.. XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2006. (Congresso).

I Simpósio Satélite da Regional de São Paulo. 2006. (Simpósio).

VI Workshop de Genética. 2006. (Oficina).

. VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. 2005. (Congresso).

.Fórum de Agronegócios - Genômica Aplicada. 2005. (Simpósio).

.Olimpíada Brasileira de Física. 2003. (Outra).

.Olimpíada Brasileira de Física. 2002. (Outra).

.Olimpíada Brasileira de Física. 2001. (Outra).

Participação em bancas

Aluno: James Eduardo Lago Londero

SCHUCH, A.P.;DE SOUZA, T.A.; ARDISSON-ARAUJO, D.M.P.. Importância da Avaliação do Fotorreparo de DNA em Anfíbios. 2019. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica Toxicológica)) - Universidade Federal de Santa Maria.

Aluno: Clara Danielly Ferreira de Carvalho

MENCK, CARLOS F. M.; KREPISCHI, A. C. V.;DE SOUZA, TIAGO A. Identificação e análise de assinaturas mutacionais em pele de pacientes Xeroderma Pigmentosum tratados com imiquimode. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: LUIZA HELENA HALAS COVRE

CAMARINI, R.; AKAMINE, E. H.;DE SOUZA, T.A.. A participação do estresse crônico na disfunção mitocondrial observada na depressão e em modelo de isolamento social. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Farmacologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rayana dos Santos Feltrin

DE SOUZA, TIAGO A.; SCHUCH, A.P.. Aspectos estruturais e evolutivo das proteínas CSA e CSB da via de reparo por excisão de nucleotídeos. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Santa Maria.

Orientou

NAYARA PATRICIA VIEIRA DE LIRA

Identificação de complexos protéicos de citros associados ao fator de patogenicidade PthA de Xanthomonas citri; 2011; Orientação de outra natureza; (Programa Bolsas de Verão) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Tiago Antonio de Souza;

Produções bibliográficas

  • IGNACIO, ALINE ; CIPELLI, MARCELLA ; TAKIISHI, TATIANE ; FAVERO AGUIAR, CRISTHIANE ; FERNANDES TERRA, FERNANDA ; GHIROTTO, BRUNO ; MARTINS SILVA, ELOISA ; CASTOLDI, ANGELA ; MAGALHÃES, YULI THAMIRES ; ANTONIO, TIAGO ; NUNES PADOVANI, BARBARA ; IOSHIE HIYANE, MEIRE ; ANDRADE-OLIVEIRA, VINICIUS ; FORTI, FABIO LUIS ; OLSEN SARAIVA CAMARA, NIELS . Lack of mTORC2 signaling in CD11c+ myeloid cells inhibits their migration and ameliorates experimental colitis. Journal Of Leukocyte Biology , v. 116, p. 779-792, 2024.

  • CORRADI, CAMILA ; VILAR, JULIANA B ; BUZATTO, VANESSA C ; DE SOUZA, TIAGO A ; CASTRO, LIGIA P ; MUNFORD, VERIDIANA ; DE VECCHI, RODRIGO ; GALANTE, PEDRO A F ; ORPINELLI, FERNANDA ; MILLER, THIAGO L A ; BUZZO, JOSÉ L ; SOTTO, MIRIAN N ; SALDIVA, PAULO ; DE OLIVEIRA, JOCELÂNIO W ; CHAIBUB, SULAMITA C W ; SARASIN, ALAIN ; MENCK, CARLOS F M . Mutational signatures and increased retrotransposon insertions in xeroderma pigmentosum variant skin tumors. CARCINOGENESIS , v. 44, p. 511-524, 2023.

  • CASTOLDI, ANGELA ; SANIN, DAVID E. ; VAN TEIJLINGEN BAKKER, NIKKI ; AGUIAR, CRISTHIANE F. ; DE BRITO MONTEIRO, LAUAR ; RANA, NISHA ; GRZES, KATARZYNA M. ; KABAT, AGNIESZKA M. ; CURTIS, JONATHAN ; CAMERON, ALANNA M. ; CAPUTA, GEORGE ; ANTÔNIO DE SOUZA, TIAGO ; SOUTO, FABRÍCIO O. ; BUESCHER, JOERG M. ; EDWARDS-HICKS, JOY ; PEARCE, ERIKA L. ; PEARCE, EDWARD J. ; SARAIVA CAMARA, NIELS OLSEN . Metabolic and functional remodeling of colonic macrophages in response to high-fat diet-induced obesity. Iscience , v. 26, p. 107719, 2023.

  • BRAGA, TARCIO TEODORO ; DAVANSO, MARIANA RODRIGUES ; MENDES, DAVI ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; DE BRITO, ANDERSON FERNANDES ; CRUZ, MARIO COSTA ; HIYANE, MEIRE IOSHIE ; DE LIMA, DHEMERSON SOUZA ; NUNES, VINICIUS ; DE FÁTIMA GIAROLA, JULIANA ; SOUTO, DENIO EMANUEL PIRES ; PRÓCHNICKI, TOMASZ ; LAUTERBACH, MARIO ; BISCAIA, STELLEE MARCELA PETRIS ; DE FREITAS, RILTON ALVES ; CURI, RUI ; PONTILLO, ALESSANDRA ; LATZ, EICKE ; CAMARA, NIELS OLSEN SARAIVA . Sensing soluble uric acid by Naip1-Nlrp3 platform. Cell Death & Disease , v. 12, p. 158, 2021.

  • RUIZ, NATHALIA QUINTERO ; CORRADI, CAMILA ; MORENO, N. C. ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; CASTRO, LIGIA PEREIRA ; ROCHA, C.R.R. ; MENCK, CARLOS F. M. . Mutagenicity Profile Induced by UVB Light in Human Xeroderma Pigmentosum Group C Cells. Photochemistry and Photobiology , v. 98, p. 713-731, 2021.

  • PEREZ, C. ; MECKLENBURG, L. ; FERNANDEZ, A. ; CANTERO, M. ; DE SOUZA,T.A. ; LIN, K. ; DENT, S. ; MONTOLIU, L. ; AWGULEWITSCH, A. ; BENAVIDES, F. . Naked (N) mutant mice carry a nonsense mutation in the homeobox of Hoxc13. EXPERIMENTAL DERMATOLOGY , v. 1, p. 1, 2021.

  • CASTRO, LIGIA PEREIRA ; VIEIRA DE MELO, D. B. ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; TIMOTEO, A. R. D. ; COUTINHO, J. D. ; ALMEIDA, I. C. ; HENRIQUES, S. R. ; AZEVEDO, F. M. ; ROSA, R. C. ; KANNOUCHE, P. L. ; SARASIN, ALAIN ; MENCK, C.F. ; PETTA, T. B. . XPC and POLH/XPV genes mutated in a genetic cluster of xeroderma pigmentosum patients in Northeast Brazil. Frontiers in Genetics , v. 1, p. 1, 2021.

  • MORENO, NATÁLIA CESTARI ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; GARCIA, CAMILA CARRIÃO MACHADO ; RUIZ, NATHALIA QUINTERO ; CORRADI, CAMILA ; CASTRO, LIGIA PEREIRA ; MUNFORD, VERIDIANA ; IENNE, SUSAN ; ALEXANDROV, LUDMIL B ; MENCK, CARLOS FREDERICO MARTINS . Whole-exome sequencing reveals the impact of UVA light mutagenesis in xeroderma pigmentosum variant human cells. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 48, p. 1941-1953, 2020.

  • GARCIA-GOMES, MARIANA DE SOUZA ARANHA ; ZANATTO, DENNIS ALBERT ; GALVIS-ALONSO, ORFA YINETH ; MEJIA, JORGE ; ANTIORIO, ANA TADA FONSECA BRASIL ; YAMAMOTO, PEDRO KENZO ; OLIVATO, MÁRCIA CAROLINA MILLÁN ; SANDINI, THAÍSA MEIRA ; FLÓRIO, JORGE CAMILO ; LEBRUN, IVO ; MASSIRONI, SILVIA MARIA GOMES ; ALEXANDRE-RIBEIRO, SANDRA REGINA ; BERNARDI, MARIA MARTHA ; IENNE, SUSAN ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; DAGLI, MARIA LÚCIA ZAIDAN ; MORI, CLAUDIA MADALENA CABRERA . Behavioral and neurochemical characterization of the spontaneous mutation tremor, a new mouse model of audiogenic seizures. EPILEPSY & BEHAVIOR , v. 105, p. 106945, 2020.

  • CASTRO, L.P. ; SAHBATOU, M. ; KEHDY, F.S.G. ; FARIAS, A. A ; YURCHENKO, A.A. ; DE SOUZA, T.A. ; ROSA, R.C.A. ; MENDES-JUNIOR, C.T. ; BORDA, V. ; MUNFORD, V. ; ZANARDO, É.A. ; CHEHIMI, S.N. ; KULIKOWSKI, L.D. ; AQUINO, M.M. ; LEAL, T.P. ; TARAZONA-SANTOS, E. ; CHAIBUB, S.C. ; GENER, B. ; CALMELS, N. ; LAUGEL, V. ; et.al . The Iberian legacy into a young genetic xeroderma pigmentosum cluster in central Brazil. MUTATION RESEARCH-GENETIC TOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL MUTAGENESIS , v. 852, p. 503164, 2020.

  • FELTRIN, RAYANA DOS SANTOS ; SEGATTO, ANA LÚCIA ANVERSA ; DE SOUZA, TIAGO ANTONIO ; SCHUCH, ANDRÉ PASSAGLIA . Open gaps in the evolution of the eukaryotic nucleotide excision repair. DNA REPAIR , v. 95, p. 102955, 2020.

  • MAZZONETTO, P.C. ; ARIZA, C.B. ; OCANHA, S.G. ; DE SOUZA, T.A. ; KO, G.M. ; MENCK, C.F.M. ; MASSIRONI, S.M.G. ; PORCIONATTO, M.A. . Mutation in NADPH oxidase 3 (NOX3) impairs SHH signaling and increases cerebellar neural stem/progenitor cell proliferation. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE , v. 1865, p. 1502-1515, 2019.

  • YAMAMOTO, PEDRO K. ; SOUZA, TIAGO A. ; ANTIORIO, ANA T. F. B. ; ZANATTO, DENNIS A. ; GARCIA'GOMES, MARIANA DE SOUZA A. ; ALEXANDRE'RIBEIRO, SANDRA R. ; OLIVEIRA, NICASSIA DE SOUZA ; MENCK, CARLOS F. M. ; BERNARDI, MARIA M. ; MASSIRONI, SILVIA M. G. ; MORI, CLAUDIA M. C. . Genetic and behavioral characterization of a mouse mutant, a new model for Kabuki Syndrome. GENES, BRAIN AND BEHAVIOR (ONLINE) , v. 18, p. e12568, 2019.

  • AGUIAR, CRISTHIANE FAVERO DE ; CASTOLDI, ANGELA ; AMANO, MARIANE T ; IGNACIO, ALINE ; TERRA, FERNANDA FERNANDES ; CRUZ, MARIO ; FELIZARDO, RAPHAEL J F ; BRAGA, TÁRCIO TEODORO ; DAVANZO, GUSTAVO GASTÃO ; GAMBARINI, VICTOR ; ANTONIO, TIAGO ; ANTIORIO, ANA TADA FONSECA BRASIL ; HIYANE, MEIRE IOSHIE ; MORAIS DA FONSECA, DENISE ; ANDRADE-OLIVEIRA, VINICIUS ; CÂMARA, NIELS OLSEN SARAIVA . Fecal IgA Levels and Gut Microbiota Composition Are Regulated by Invariant Natural Killer T Cells. INFLAMMATORY BOWEL DISEASES , v. 26, p. 697-708, 2019.

  • DE SOUSA CAVALCANTE, LUCAS ; COSTA-SILVA, TALES A. ; SOUZA, TIAGO ANTÔNIO ; IENNE, SUSAN ; MONTEIRO, GISELE . Chemogenomic study of gemcitabine using Saccharomyces cerevisiae as model cell¿molecular insights about chemoresistance. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY (ONLINE) , v. 51, p. 489-496, 2019.

  • FERNANDES, MIRIAM R. ; SELLERA, FÁBIO P. ; MOURA, QUÉZIA ; SOUZA, TIAGO A. ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of a CTX-M-8, CTX-M-55 and FosA3 co-producing Escherichia coli ST117/B2 isolated from an asymptomatic carrier. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 12, p. 183-184, 2018.

  • SELLERA, FÁBIO P. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; MOURA, QUÉZIA ; LOPES, RALF B. ; SOUZA, TIAGO A. ; CERDEIRA, LOUISE ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of a bla CMY-2 /IncI1-harbouring Escherichia coli D:ST457 isolated from coastal benthic organisms. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 14, p. 83-84, 2018.

  • FRANCISCO, GABRIELA RODRIGUES ; BUENO, MARIA FERNANDA C. ; CERDEIRA, LOUISE ; LINCOPAN, NILTON ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; DE OLIVEIRA GARCIA, DOROTI . Draft genome sequences of KPC-2- and CTX-M-15-producing Klebsiella pneumoniae ST437 isolated from a clinical sample and urban rivers in Sao Paulo, Brazil. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 16, p. 74-75, 2018.

  • MUNFORD, V. ; CASTRO, L.P. ; SOUTO, R. ; LERNER, L.K. ; VILAR, J. BRANDSTETTER ; QUAYLE, C. ; ASIF, H. ; SCHUCH, A.P. ; DE SOUZA, T.A. ; IENNE, S. ; ALVES, F.I.A. ; MOURA, L.M.S. ; GALANTE, P.A.V. ; CAMARGO, A.A. ; LIBOREDO, R. ; PENA, S.D.J. ; SARASIN, A. ; CHAIBUB, S.C. ; MENCK, C.F.M. . A genetic cluster of patients with variant xeroderma pigmentosum with two different founder mutations. BRITISH JOURNAL OF DERMATOLOGY , p. 1270-1278, 2017.

  • CERDEIRA, LOUISE ; FERNANDES, MIRIAM R. ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; GARCIA, DOROTI DE O. ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of an environmental multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae ST340/CC258 harbouring blaCTX-M-15 and blaKPC-2 genes. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 8, p. 108-109, 2017.

  • BUENO, MARIA FERNANDA C. ; FRANCISCO, GABRIELA RODRIGUES ; CERDEIRA, LOUISE ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; LINCOPAN, NILTON ; GARCIA, DOROTI DE O. . Draft genome sequence of an aminoglycoside-resistant RmtG-producing Pseudomonas aeruginosa ST235 isolated from a cystic fibrosis patient. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 8, p. 106-107, 2017.

  • CASELLA, T. ; CERDEIRA, LOUISE ; FERNANDES, MIRIAM R. ; DE SOUZA,T.A. ; HAENNI, M. ; MADEC, J. ; LINCOPAN, NILTON ; NOGUEIRA, M. C. . Draft genome sequence of a CTX-M-15-producing Escherichia coli ST345 from commercial chicken meat in Brazil. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 9, p. 124-125, 2017.

  • DO MONTE, D. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; CERDEIRA, LOUISE ; DE SOUZA, T.A. ; MEM, A. ; FRANCO, B. D. ; LANDGRAF, M. ; LINCOPAN, NILTON . Draft Genome Sequences of Colistin-Resistant MCR-1-Producing Escherichia coli ST1850 and ST74 Strains Isolated from Commercial Chicken Meat. GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 5, p. e00329-17, 2017.

  • MOURA, QUÉZIA ; FERNANDES, MIRIAM R. ; CERDEIRA, LOUISE ; SANTOS, ANA CAROLINA M. ; DE SOUZA, TIAGO A. ; IENNE, SUSAN ; PIGNATARI, ANTONIO CARLOS C. ; GALES, ANA C. ; SILVA, ROSA M. ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of MDR Aeromonas hydrophila ST508 carrying rmtD and bla CTX-M-131 genes isolated from bloodstream infection. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 10, p. 289-290, 2017.

  • MOURA, QUÉZIA ; FERNANDES, MIRIAM R. ; CERDEIRA, LOUISE ; NHAMBE, LÚCIA F. ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of a multidrug-resistant KPC-2-producing Enterobacter aerogenes isolated from a hospitalized patient, Brazil. Journal of Global Antimicrobial Resistance , p. 277-278, 2017.

  • SELLERA, FÁBIO P. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; MOURA, QUÉZIA ; SOUZA, TIAGO A. ; CERDEIRA, LOUISE ; LINCOPAN, NILTON . Draft Genome Sequence of Enterobacter cloacae ST520 Harboring the bla KPC-2 , bla CTX-M-15 , and bla OXA-17 Genes Isolated from Coastal Waters of the South Atlantic Ocean. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 10, p. 279-280, 2017.

  • SELLERA, FÁBIO P. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; MOURA, QUÉZIA ; SOUZA, TIAGO A. ; NASCIMENTO, CRISTIANE L. ; CERDEIRA, LOUISE ; LINCOPAN, NILTON . Draft Genome Sequence of an Extensively Drug-Resistant (XDR) Pseudomonas aeruginosa belonging to ST644 Isolated from a Footpad Infection in a Magellanic penguin ( Spheniscus magellanicus ). Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 12, p. 88-89, 2017.

  • MOURA, QUÉZIA ; ESPOSITO, FERNANDA ; FERNANDES, MIRIAM R. ; ESPINOZA-MUÑOZ, MARIA ; SOUZA, TIAGO A. ; SANTOS, SILVIA R. ; CERDEIRA, LOUISE ; CASSETTARI, VALÉRIA ; LINCOPAN, NILTON . Genome sequence analysis of a hypermucoviscous/hypervirulent and MDR CTX-M-15/K19/ST29 Klebsiella pneumoniae isolated from human infection. Pathogens and Disease , v. 75, p. 279-280, 2017.

  • SARTORI, LUCIANA ; FERNANDES, MIRIAM R. ; IENNE, SUSAN ; DE SOUZA, TIAGO A. ; GREGORY, LILIAN ; CERDEIRA, LOUISE ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequences of two fluoroquinolone-resistant CTX-M-15-producing Escherichia coli ST90 (ST23 complex) isolated from calve and dairy cow in South America. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 11, p. 145-147, 2017.

  • CERDEIRA, LOUISE ; SILVA, KETRIN C. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; IENNE, SUSAN ; DE SOUZA, TIAGO A. ; DE OLIVEIRA GARCIA, DOROTI ; MORENO, ANDREA M. ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of a CTX-M-15-producing Klebsiella pneumoniae sequence type 340 (clonal complex 258) isolate from a food-producing animal. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 7, p. 67-68, 2016.

  • CERDEIRA, LOUISE ; FERNANDES, MIRIAM R. ; FRANCISCO, GABRIELA R. ; BUENO, MARIA FERNANDA C. ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; DE OLIVEIRA GARCIA, DOROTI ; LINCOPAN, NILTON . Draft Genome Sequence of a Hospital-Associated Clone of Klebsiella pneumoniae ST340/CC258 Coproducing RmtG and KPC-2 Isolated from a Pediatric Patient. Genome Announcements , v. 4, p. e01130-16, 2016.

  • MOURA, QUÉZIA ; FERNANDES, MIRIAM R. ; CERDEIRA, LOUISE ; IENNE, SUSAN ; SOUZA, TIAGO A. ; NEGRÃO, FÁBIO JULIANO ; LINCOPAN, NILTON . Draft genome sequence of a multidrug-resistant CMY-2-producing Salmonella enterica subsp. enterica serovar Minnesota ST3088 isolated from chicken meat. Journal of Global Antimicrobial Resistance , v. 8, p. 67-69, 2016.

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  • DE SOUZA,T.A. ; SOPRANO, A. S. ; LIRA, N.P.V. ; QUARESMA, A. J. C. ; PAULETTI, B.A. ; PAES-LEME, A.F. ; BENEDETTI, C.E. . The TAL Effector PthA4 Interacts with Nuclear Factors Involved in RNA-Dependent Processes Including a HMG Protein That Selectively Binds Poly(U) RNA. Plos One , v. 7, p. e32305, 2012.

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  • DOMINGUES, M. N. ; SOUZA, T. A. ; CERNADAS, R. A. ; OLIVEIRA, ML ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . The Xanthomonas Type III Effector Protein PthA Interacts with Citrus Proteins Involved in Nuclear Transport, Protein Folding and inhibits K63-linked Ubiquitination Associated with DNA Repair.. In: XX Reunião Anual dos Usuários do LNLS, 2010, Campinas. Caderno de Resumos da XX Reunião Anual dos Usuários do LNLS, 2010.

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  • DOMINGUES, M. N. ; DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Protein-Protein interactions reveal a citrus protein complex implicated in post-translational modification of a bacterial type III effector. In: II Simpósio de Genetica e Biologia Molecular de Plantas, 2009, Buzios. Anais do II Simpósio de Genetica e Biologia Molecular de Plantas, 2009.

  • DOMINGUES, M. N. ; SOUZA, T. A. ; CERNADAS, R. A. ; OLIVEIRA, ML ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Interactions of a Xanthomonas Type III Effector with Sweet Orange Proteins Reveal a Citrus Protein Complex Involved in Protein Folding and K-63 Polyubiquitination. In: International Plant Molecular Biology Congress (IPMB), 2009, St Louis - Missouri. International Plant Molecular Biology Congress (IPMB), 2009.

  • SOPRANO, A. S. ; DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; BENEDETTI, C.E. . Characterization of interactions between PthA protein from Xanthomonas axonopodis pv. citri and citrus proteins involved in transcription and translation.. In: 19 Reunião Anual dos Usuários do LNLS, 2009, Campinas. Livro de Resumos da 19 Reunião Anual de Usuários do LNLS, 2009.

  • SOPRANO, A. S. ; DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; BENEDETTI, C.E. . Characterization of interactions between PthA, the effector protein from Xanthomonas axonopodis pv. citri and proteins from sweet orange implicated in cell proliferation. In: II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009, Buzios. Livro de Resumos do II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009.

  • SOPRANO, A. S. ; DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; BENEDETTI, C.E. . Characterization of interactions between PthA protein from Xanthomonas citri and citrus proteins involved in transcription and translation.. In: XXXVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2009, Aguas de Lindoia. Livro de Resumos da SBBq, 2009.

  • DOMINGUES, M. N. ; DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Evidence of a Novel Citrus Protein Complex Involved in Lys63-linked Polyubiquitylation of a Xanthomonas Type III Effector.. In: XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2009, Aguas de Lindoia. Anais da XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2009.

  • DOMINGUES, M. N. ; DE SOUZA,T.A. ; DOCENA, C. ; CERNADAS, R. A. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Molecular characterization of Citrus sinensis proteins that interact with Xanthomonas citri effector protein PthA, citric canker inducer.. In: 18a Reuniao Anual de Usuarios do LNLS, 2008, Campinas. Anais da 18a Reuniao Anual de Usuarios do LNLS, 2008.

  • DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; BENEDETTI, C.E. . Molecular characterization of Citrus sinensis proteins that interact with Xanthomonas citri effector protein PthA.. In: XVII RAU - Reunião Anual dos Usuários do LNLS, 2007, Campinas. Caderno de Resumos da XVII RAU, 2007.

  • DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Analysis of PthA interactions with citrus proteins involved in transcriptional control.. In: XXXVI Reunião Anual da SbbQ e 10th IUMBMB Conference, 2007, Salvador. Caderno de Resumos da Sbbq, 2007.

  • DE SOUZA,T.A. ; CERNADAS, R. A. ; DOCENA, C. ; FARAH, S.C. ; BENEDETTI, C.E. . Caracterização molecular de proteínas de Citrus sinensis que interagem com a proteína efetora PthA2, indutora do cancro cítrico.. In: XV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp, 2007, Campinas. Caderno de Resumos do XV Congresso Interno de Iniciação Científica, 2007.

  • DE SOUZA,T.A. ; GADELHA, F.R. . Hydrogen peroxide treatment leads to alteration in mitochondrial functions in Trypanosoma cruzi epimastigotes.. In: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Anais da XXXV Reunião Anual da SBBq, 2006.

  • DE SOUZA,T.A. ; NETO, R.M. ; GADELHA, F.R. . Efeito do peróxido de hidrogênio na bioenergética mitocondrial e na atividade das fosfatases em Trypanosoma cruzi.. In: XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp, 2006, Campinas. Anais do XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp.

  • Bitarello, B.D. ; DINATO, D.O. ; NOGUEIRA,D.M. ; GIACHINI, N.G. ; PEREIRA, N.S. ; CARDOSO, P. R. ; RIBEIRO, T.B. ; DE SOUZA,T.A. ; MAGALHAES, E. M. Z. . Infecção Experimental de três linhagens de Mus musculus com larvas L1 de Angiostrongylus costaricensis. In: XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp, 2006, Campinas. XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp.

  • BAJAY, M..M. ; Bitarello, B.D. ; DURIGAN, M. ; Sassaki, R.P. ; DE SOUZA,T.A. ; MAGALHAES, E. M. Z. ; ARRUDA, P. . Efeito do silenciamento pós-transcricional (RNAi) in vitro da proteína disferlina em vermes adultos de Schistossoma mansoni.. In: XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp, 2006, Campinas. XIV Congresso Interno de Iniciação Científica da Unicamp.

  • CONSONNI, S. R. ; GHIRALDINI, F. G. ; IGNARRO, R. S. ; RIZZO, L.Y. ; SILVA, M.R.B. ; TRAD, R. J. ; MATTIOLI, M.A.P. ; VICENTINI, R. ; DE SOUZA,T.A. ; MENOSSI,M. . Caracterização de transcritos "no hits" da cana-de-açúcar. In: 52° Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do 52° Congresso Brasileiro de Genética.

  • CARDOSO, P. R. ; DINIZ, S. ; DUARTE, M. M. ; GODOY, G. F. ; LOURENCO, V. T. ; MILANI, R. ; PRADO, L. R. ; ROMANO, A.A.S. ; DE SOUZA,T.A. ; MENOSSI,M. . Analisys of the genes involved in the ubiquitin tagging in sugarcane.. In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia-SP. Anais do 51 Congresso Brasileiro de Genetica, 2005.

  • SOUZA, T. A. ; IENNE, S. ; CARVALHO, M. ; MASSIRONI, S.G. ; MENCK, CARLOS F.M. . Whole-exome sequencing of ENU-induced mutant mice with BALB/c background. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SOUZA, T. A. . Análise Funcional e Estrutural da Interação entre o Efetor Bacteriano PthA e Proteinas de Citros Envolvidas no Controle da Expressão Gênica. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • DE SOUZA,T.A. . Caracterização molecular de proteínas de Citrus sinensis que interagem com a proteína efetora PthA2, indutora do cancro cítrico.. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

DE SOUZA, T.A. ; DEFELICIBUS, A. ; MENCK, C.F.M. . WOLAND. 2017.

MILANI, R. ; QUEIROZ, K.C.S. ; ZAMBUZZI, W.F. ; DE SOUZA,T.A. ; AZOUBEL, S. ; PEPPELENBOSCH, M.P. ; FERREIRA, C.V. ; GALEMBECK, E. . Pepmatrix. 2009.

DE SOUZA, TIAGO A ; DEFELICIBUS, A. . Genômica Computacional: Fundamentos. 2022. .

OLIVEIRA, MC ; IENNE, SUSAN ; DE SOUZA,T.A. . Ficómica: Curso Básico de Secuenciación de Nueva Generación, Aplicaciones en Ficología. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

IENNE, S. ; DE SOUZA,T.A. . Curso Básico de Sequenciamento de Nova Geração. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

  • 2018 - 2019

    Bioinformática aplicada ao estudo de mutagênese humana, através de dados de exomas humanos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Frederico Martins Menck em 25/11/2020., Descrição: Esta proposta prevê o desenvolvimento de estudos de identificação de variantes e assinaturas mutacionais em exomas sequenciados diretamente de cultura de células (deficiente em processos de reparo de DNA) que foram submetidas a irradiação com luz ultravioleta (UVA e UVB) e clonadas para permitir a fixação das mutações. Da mesma forma, tumores de pele coletados principalmente em pacientes XP poderão ter seus exomas sequenciados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Integrante / Natalia Cestari Moreno - Integrante / Camila Carrião - Integrante / MENCK, C.F.M. - Coordenador / RUIZ, NATHALIA QUINTERO - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 2013 - 2018

    Análise das alterações genéticas em exomas de camundongos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Frederico Martins Menck em 16/01/2017., Descrição: Camundongos mutantes, que sirvam de modelos para o estudo de doenças humanas, consistem em uma ferramenta valiosa que vem revelando mecanismos que governam processos biológicos básicos. Um dos principais desafios é identificar e associar fenótipos complexos a sua variante causal no DNA em modelos murinos. O mapeamento tradicional dessas mutações é realizado utilizando microssatélites e posterior sequenciamento pelo método de Sanger. Apesar de ser o método mais utilizado, ele tem se mostrado bastante caro e trabalhoso. Utilizando o sequenciamento de exoma, alguns grupos de pesquisa vêm identificando mutações induzidas por ENU (Sun et al., 2012, Andrews et al., 2012, Hilton et al., 2011). Considerando-se que 75% das mutações induzidas por ENU são causadas por SNVs (single nucleotide variants) em éxons, resultando em mutações missense ou nonsense (Justice et al., 1999), o sequenciamento dos exomas dos mutantes deve identificar grande parte das variantes induzidas por ENU nos camundongos mutantes selecionados. A caracterização desses mutantes será de muito valor para a comunidade acadêmica, visto que todos os animais serão disponibilizados para eventuais cruzamentos e caracterizações por grupos de pesquisa independentes. Além disso, com o sequenciamento e mapeamento de SNPs e small INDELs de linhagens wild-type oferecidas pelo biotério a todo o ICB, será possível fornecer a todos os pesquisadores do Instituto o primeiro background genético de linhagens estabelecidas no Brasil. As informações obtidas serão uma fonte importante de informação no planejamento e análise dos resultados obtidos com o uso dessas linhagens, fornecidas pelo Biotério do Departamento de Imunologia ao ICB e a instituições de todo o Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Integrante / MENCK, CARLOS F.M. - Coordenador / Silvia Massironi - Integrante.

  • 2013 - 2017

    Estabelecimento de uma facility de sequenciamento de nova geração como ferramenta de investigação em sistemas biológicos, Descrição: In this country, the development of scientific core facilities of any kind is a major challenge for various reasons, including lack of culture, limited support for infrastructure and management, difficulties of reagent importations, etc. For next generation sequencing cores even more challenges are found, due to the rapid technological evolution for new equipments and the high costs of reagents for performing sequencing runs, that in general promote the generation data amount greater than the actually required by users. This huge amount of data also implies the need of Bioinformatics cores, able to analyze the data for the researcher. These issues make the sequencing facilities in Brazil as uncompetitive with similar services abroad, reducing the ability of nucleate competent groups in these technologies in the country. In this project, we propose centralizing the purchase of reagents in the facility GENIAL (Genome Investigation and Analysis Laboratory) inserted in CEFAP (Centro de Facilidades de Apoio à Pesquisa - Center of Facilities to Support Research), through own funding and importation by FAPESP, especially for those who need to sequence small genomes (<50 Mb as exomes and microbial genomes) and transcriptomes. This centralization would make the use of the equipments in the CEFAP-USP much more simple and practical, greatly expanding the capacity to use such devices. The specific sequencing of exomes from mutant mice of the ICB Vivarium is also planned in this project. Furthermore, the request for scholarships for two technicians can troubleshoot Bioinformatics limitations related to data analysis, driving the use of this technology. Support to buy a new sequencer is also included. This sequencer, also of next generation, is more limited in terms of quantity of material to be sequenced, but it produces longer reads and uses a different technology, that will certainly be helpful for various uses including confirmation results of DNA sequence requiring validation.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Integrante / MENCK, CARLOS F.M. - Coordenador / Susan Ienne da Silva Vançan - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2011

    Análise Funcional e Estrutural de Proteínas de Citros Envolvidas no Desenvolvimento Cancro Cítrico., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Coordenador / Celso Eduardo Benedetti - Integrante / Adriana Santos Soprano - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2006 - 2010

    Caracterização de proteínas de Citrus sinensis que interagem com a proteína efetora PthA, indutora do cancro cítrico, Descrição: Citrus canker disease, caused by Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac), affects most citrus species and represents a major threat to the Brazilian citriculture. The disease is easily disseminated by rain and stormy weather. Plants are infected through natural openings like stomata or wounds in the surface of leaves, stems and fruits. Once in the plant tissue, the bacteria use a type 3 secretion system to inject effector proteins into the plant cell. These effector proteins, including PthAs, alter transcription of the cell host to the benefit of the pathogen, leading to the development of the cancer lesions, such as hypertrophy and hyperplasia. A number of studies have shown that members of the AvrBs3/PthA family function as transcriptional factors in plant cells. To elucidate how PthA activates transcription and to establish its molecular mode of action, a two-hybrid approach was used to identify host proteins that interact with PthA and therefore could be important for the development of the canker lesions.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Integrante / Celso Eduardo Benedetti - Coordenador / Mariane Noronha Domingues - Integrante / Adriana Santos Soprano - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2005 - 2006

    Efeito do Peróxido de Hidrogênio na Bionergética Mitocondrial e na Transdução de Sinal de T. cruzi, Descrição: Esse estudo além de elucidar o mecanismo de transdução de sinal induzido pelas espécies reativas de oxigênio (EROs) e os seus efeitos na bioenergética mitocondrial do T. cruzi poderá servir como base para a identificação de outros agentes e/ou outras vias que poderiam ser utilizados como alvos para o desenvolvimento de agentes farmacológicos mais específicos que não interfiram com o metabolismo do hospedeiro, e portanto, seja uma quimioterapia mais efetiva.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Tiago Antonio de Souza - Integrante / Fernanda Ramos Gadelha - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Bolsa Pesquisa UNICAMP/SAE - Bolsa.

Prêmios

2016

Poster Presentation Mutagen-Brasil 2016, Associação Brasileira de Mutagênese e Genômica Ambiental.

2015

Travel Scholarship Award, JAX, USA, March of Dimes Foundation, USA.

2015

IMGC Travel Scholarship Award, Yokohama, Japan, International Mammalian Genome Society, USA.

2013

Menção Honrosa Reunião Científica do Departamento de Microbiologia (co-autor), ICB-USP.

2009

Menção Honrosa - II Simpósio Brasileiro de Genética e Biologia Molecular de Plantas, Sociedade Brasileira de Genética - SBG.

2009

SBBq Award - Melhor Poster XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular ? SBBq, SBBq.

2002

Menção Honrosa - Olimpíada Brasileira de Física, Sociedade Brasileira de Física-SBF-USP.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Tau GC Bioinformatics. , Rua General Fernando Vasconcellos Cavalcanti de Albuquerque, 80 - 201B, Bosque do Vianna, 06711020 - Cotia, SP - Brasil, Telefone: (11) 47770926, URL da Homepage:

Experiência profissional

2018 - 2019

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista TT5 - Bioinformática, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2014 - 2018

Universidade de São Paulo

Vínculo: Doutorando, Enquadramento Funcional: Estudante

2011 - 2017

Universidade de São Paulo

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Celetista, Carga horária: 40

Atividades

  • 03/2018 - 10/2019

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.Linhas de pesquisa

  • 01/2014 - 03/2018

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Ciências Biomédicas.Linhas de pesquisa

  • 01/2013 - 06/2017

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Ciências Biomédicas, Centro de Facilidades de Apoio a Pesquisa (CEFAP-USP).Linhas de pesquisa

  • 07/2011 - 03/2017

    Serviços técnicos especializados , Instituto de Ciências Biomédicas, Centro de Facilidades de Apoio a Pesquisa (CEFAP-USP).Serviço realizado, Sample prep DNA e RNA, Lib prep, sequenciamento NGS (SOLiD, Illumina MiSeq, Illumina NextSeq), infraestrutura de bioinformática.

2010 - 2014

Centro Universitário Padre Anchieta, UniAnchieta

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 6

Atividades

  • 02/2012 - 07/2012

    Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioquímica dos Alimentos I

  • 02/2012 - 07/2012

    Ensino, Gestão Ambiental, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Química Geral

  • 03/2010 - 06/2010

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Química Geral

  • 03/2010 - 06/2010

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Química Orgânica e Bioquímica

2010 - 2011

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista DC, Carga horária: 40

2008 - 2010

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2007

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 30

Atividades

  • 08/2006 - 06/2011

    Pesquisa e desenvolvimento, Laboratório Nacional de Biociências.Linhas de pesquisa

  • 03/2008 - 05/2010

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.Atividade realizada, Aluno de mestrado no laboratório do Dr. Celso Eduardo Benedetti.

  • 06/2006 - 12/2007

    Estágios , Laboratório Nacional de Biociências.Estágio realizado, Aluno de iniciação científica no laboratório do Dr. Celso E. Benedetti.

2008 - 2010

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Aluno de Mestrado, Enquadramento Funcional: Mestrado

2005 - 2006

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Aluno de Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 12

Atividades

  • 08/2007 - 12/2007

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Monitor Voluntário da disciplina Bioquímica Básica (BB280) - Prof. Resp. Eduardo Galembeck

  • 03/2006 - 07/2006

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Monitor Voluntário da disciplina Genética Fisiológica e Molecular (BG280) - Prof. Responsável: Ana Espin / Módulo Prático (Bioinformática) Prof. Responsável: Marcelo Menossi

  • 01/2005 - 10/2005

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biologia.Cargo ou função, Representante discente - suplente - do curso de Ciências Biológicas junto ao Departamento de Bioquímica..

  • 10/2004 - 01/2005

    Estágios , Instituto de Biologia, Departamento de Bioquímica.Estágio realizado, Estágio no laboratório de Bionergética e Oxidações Biológicas - Profa. Fernanda Gadelha.

2019 - Atual

Tau GC Bioinformática

Vínculo: Founder, Enquadramento Funcional: Founder e Biólogo Computacional