Alexandre Bittencourt Pigozzo

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• DOS SANTOS, BRENNO LEMOS MELQUIADES ; CASTRO, DIEGO AUGUSTO SILVA ; DA PAZ, SÁVIO FRANCISCO CIRINO ; PINHEIRO, DAVI JANNOTTI COELHO ; DE MELO QUINTELA, BÁRBARA ; LOBOSCO, MARCELO ; Pigozzo, Alexandre Bittencourt . An open-source software for building and simulating ordinary differential equation models in biology. PLoS One , v. 20, p. e0329148, 2025.

• REIS, RUY FREITAS ; Pigozzo, Alexandre Bittencourt ; BONIN, CARLA REZENDE BARBOSA ; QUINTELA, BARBARA DE MELO ; POMPEI, LARA TURETTA ; VIEIRA, ANA CAROLINA ; SILVA, LARISSA DE LIMA E ; XAVIER, MAICOM PETERS ; WEBER DOS SANTOS, RODRIGO ; LOBOSCO, MARCELO . A Validated Mathematical Model of the Cytokine Release Syndrome in Severe COVID-19. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES , v. 8, p. 8:639423, 2021.

• Pigozzo, Alexandre B. ; MISSIAKAS, DOMINIQUE ; ALONSO, SERGIO ; DOS SANTOS, RODRIGO W. ; LOBOSCO, MARCELO . Development of a Computational Model of Abscess Formation. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 1355, 2018.

• DO NASCIMENTO, T.M. ; DE OLIVEIRA, J.M. ; XAVIER, M.P. ; PIGOZZO, A.B. ; DOS SANTOS, R.W. ; LOBOSCO, M. . On the use of multiple heterogeneous devices to speedup the execution of a computational model of the Human Immune System. APPLIED MATHEMATICS AND COMPUTATION , v. 267, p. 304-313, 2015.

• PIGOZZO, A. B. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Macedo, G.C. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, MARCELO . On the computational modeling of the innate immune system. BMC Bioinformatics , v. 14, p. S7, 2013.

• PIGOZZO, ALEXANDRE BITTENCOURT ; MACEDO, GILSON COSTA ; WEBER DOS SANTOS, RODRIGO ; LOBOSCO, MARCELO . Computational Modeling of Microabscess Formation. Computational and Mathematical Methods in Medicine (Print) , v. 2012, p. 1-16, 2012.

• Rocha, Pedro ; Pigozzo, Alexandre ; Quintela, Brbara ; Macedo, Gilson ; Santos, Rodrigo ; LOBOSCO, MARCELO . Modelling the Innate Immune System. Bio-Inspired Computational Algorithms and Their Applications. 1ed.: InTech, 2012, v. , p. 351-370.

• ASSIS, GEOVANNA VITTÓRIA DE JESUS ; ACHÁ, JULIANA AZI MARTINS ; Pigozzo, Alexandre Bittencourt ; LOUREIRO, MICHELLI MARLANE SILVA . Tecnologia e Educação: Robótica como Caminho para a Transformação do Ensino Técnico. In: Simpósio Brasileiro de Educação em Computação, 2025, Brasil. Anais do V Simpósio Brasileiro de Educação em Computação (EDUCOMP 2025), 2025. p. 548.

• SANTOS, BRENNO LEMOS MELQUIADES ; ALBERGARIA, ELISA TULER DE ; DIAS, DIEGO ROBERTO COLOMBO ; Pigozzo, Alexandre Bittencourt ; ROCHA, LEONARDO CHAVES DUTRA DA . Correlating Historical Events and Cinematic Releases Using Web Information. In: WebMedia '22: Brazilian Symposium on Multimedia and Web, 2022, Curitiba Brazil. Brazilian Symposium on Multimedia and Web, 2022. p. 178.

• XAVIER, MAICOM PETERS ; POMPEI, LARA T. ; DE O. VIEIRA, ANA CAROLINA G. ; DE PAULA, MATHEUS A. M. ; BONIN, CARLA R. B. ; REIS, RUY F. ; Pigozzo, Alexandre B. ; QUINTELA, BARBARA DE M. ; DOS SANTOS, RODRIGO W. ; LOBOSCO, MARCELO . Modelling the Human Immune System Response to the ChAdOx1 nCoV-19 Vaccine. In: 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2021, Houston. 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2021. p. 3327.

• Paula Barros Baêta Y.H. ; PIGOZZO, A. B. ; XAVIER, C. R. . Top-Down Parsing Error Correction Applied to Part of Speech Tagging. In: International Conference on Computational Science and its Applications, 2020. The 20th International Conference on Computational Science and Its Applications.

• RIBEIRO, ELVIS H. ; Pigozzo, Alexandre B. ; XAVIER, CAROLINA R. ; DOS SANTOS, RODRIGO W. ; LOBOSCO, MARCELO . Stochastic Petri Net Models for the Study of Macrophage Reprogramming. In: 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2019, San Diego. 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2019. p. 2184.

• SOARES, T. M. ; XAVIER, M. P. ; Pigozzo, Alexandre ; CAMPOS, R. S. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . Performance Evaluation of a Human Immune System Simulator on a GPU Cluster. In: 13th International Conference, PaCT 2015, 2015. 13th International Conference, PaCT 2015, Petrozavodsk, Russia, August 31-September 4, 2015, Proceedings. v. 9251.

• Knop, Igor ; PIGOZZO, A.B. ; QUINTELA, B. M. ; Macedo, G. C. ; Barbosa, Ciro ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . System Dynamics Metamodels Supporting the Development of Computational Models of the Human Innate Immune System. In: Computational Science and Its Applications ? ICCSA 2012, 2012. Computational Science and Its Applications ? ICCSA 2012.

• Rocha, P. A. F. ; P. X, Micael ; PIGOZZO, A.B. ; QUINTELA, B. M. ; Macedo, G. C. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . A Three-Dimensional Computational Model of the Innate Immune System. In: Computational Science and Its Applications ? ICCSA 2012, 2012. Computational Science and Its Applications ? ICCSA 2012. v. 7333.

• Knop, Igor ; Pigozzo, A. B. ; M. Quintela, Barbara ; Macedo, Gilson C. ; Barbosa, Ciro ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; LOBOSCO, M. . Modeling Human Immune System Using a System Dynamics Approach. In: IFMBE, 2011. IFMBE Proceedings, 2011. v. 37.

• PIGOZZO, A.B. ; Macedo, G. C. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . Implementation of a Computational Model of the Innate Immune System. In: 10th International Conference, ICARIS 2011, 2011. 10th International Conference, ICARIS 2011, Cambridge, UK, July 18-21, 2011. Proceedings. v. 6825.

• PIGOZZO, A. B. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Parallel Implementation of a Computational Model of the HIS Using OpenMP and MPI. In: 2010 22nd International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing Workshops, 2010, Petrópolis. 2010 22nd International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing Workshops, 2010. p. 67-72.

• PIGOZZO, A.B. ; LOBOSCO, M. ; Weber dos Santos, R. . Parallel Implementation of a Computational Model of the Human Immune System. In: Euro-Par 2010 Parallel Processing Workshops, 2010. Euro-Par 2010 Parallel Processing Workshops. v. 6586.

• PIGOZZO, A. B. ; REINEHR, E. E. . DINÂMICA POPULACIONAL DE MODELO PREDADOR-PRESA-COMPETIDOR SUBMETIDO A COTAS RELATIVAS DE PESCA COM USO DE PLANILHA ELETRÔNICA. In: XIV Simpósio Nacional de Ensino de Física, 2005, Caxambu. Anais do XIV Simpósio Nacional de Ensino de Física, 2005, 2005.

• PIGOZZO, A. B. ; CALDAS, D. M. ; BARROS, B. G. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; LOBOSCO, M. . Modelling the Human Immune System by Combining Two Different Types of Models. In: Brasil Deutschland System Biology Meeting (SB-meeting 2010), 2010, Ouro Preto. Brasil Deutschland System Biology Meeting Abstract Book, 2010. v. 1. p. 43-43.

• PIGOZZO, A.B. . Computational Modeling of the Immune System. 2025. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• Pigozzo, A. B. ; Weber dos Santos, R. ; Macedo, G.C. ; LOBOSCO, M. . Computational modeling of microabscess formation. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Pigozzo, A. B. ; Macedo, G.C. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . Implementation of a computational model of the innate immune system. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Pigozzo, A. B. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . Implementação de um modelo local do sistema imunológico humano. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Pigozzo, A. B. ; CALDAS, D. M. ; BARROS, B. G. . Modelling the Human Immune System by Combining Two Different Types of Models. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Pigozzo, A. B. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Parallel Implementation of a Computational Model of the HIS Using OpenMP and MPI. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Pigozzo, A. B. ; LOBOSCO, M. ; Weber dos Santos, R. . A computational model of the innate immune system. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• REINEHR, E. E. ; PIGOZZO, A. B. . Dinâmica Populacional de modelo predador-presa submetido a cotas relativas de pesca. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• REINEHR, E. E. ; PIGOZZO, A. B. . Dinâmica Populacional de modelo predador-presa-competidor submetido a cotas relativas de pesca com uso de planilha eletrônica. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PIGOZZO, A.B. . Computational Immunology. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

• 2022 - 2025

  Desenvolvimento de um software open source para a modelagem e simulação do Sistema Imune Humano (Projeto FAPEMIG APQ-00694-22)., Descrição: Para que a modelagem computacional contribua efetivamente com o avanço do conhecimento na área de Imunologia, é necessário que ferramentas de software sejam desenvolvidas, aprimoradas e estendidas para darem suporte à todas as etapas de construção, implementação, simulação e validação de um modelo. Os softwares terão que fornecer toda uma infraestrutura e muitos recursos para tornar possível o desenvolvimento de modelos cada vez mais sofisticados sem muito esforço e num tempo pequeno. Nesse contexto, um dos objetivos deste trabalho é desenvolver um software open source que facilite a construção e implementação de vários tipos de modelos matemáticos e computacionais. O software permitirá a construção de modelos baseados em autômatos celulares (ACs), Equações Diferenciais Ordinárias (EDOs), Equações Diferenciais Parciais (EDPs) e estocásticos sem ter que iniciar a implementação computacional dos modelos do zero e sem a necessidade de ter muito conhecimento dos métodos que são usados na implementação. O pesquisador poderá usar o código gerado pelo software diretamente para realizar as simulações, ou como base para desenvolver seu próprio código estendendo o modelo atual, por exemplo. Além da aplicação na pesquisa com modelos matemáticos e computacionais, o software também poderá ser utilizado no processo ensino-aprendizagem dos conteúdos das áreas de modelagem matemática e computacional. Por exemplo, os alunos podem aprender a construir, implementar e simular modelos na prática. O objetivo principal deste projeto é desenvolver um software para facilitar a construção e simulação de modelos do sistema imune humano. O software terá uma interface gráfica e diversos recursos para que o usuário possa criar e simular, sem muito esforço, diversos tipos de modelos matemáticos e computacionais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Coordenador / Marcelo Lobosco - Integrante / Bárbara de Melo Quintela - Integrante / Carolina Ribeiro Xavier - Integrante / Brenno Lemos Melquíades dos Santos - Integrante / Diego Augusto Silva Castro - Integrante / Sávio Francisco Cirino da Paz - Integrante.

• 2022 - Atual

  Desenvolvimento de modelos computacionais personalizados da miocardite e da formação de edemas decorrentes de infecção viral, Descrição: A miocardite, uma inflamação do músculo cardíaco, normalmente resulta de uma infecção viral seguida por destruição inflamatória do miocárdio. A miocardite pode resultar em insuficiência cardíaca, arritmias ventriculares e na formação de edemas, e está associada a altas taxas de mortalidade. A caracterização e o diagnóstico desta doença apresentam grandes desafios e ainda existem muitos aspectos do seu comportamento e de suas consequências que são desconhecidos. A recente pandemia aumentou ainda mais estes desafios, já que a miocardite se apresenta de forma mais significativa em pacientes que tiveram a COVID-19. Este projeto de pesquisa tem por objetivo demonstrar que modelos matemáticos e computacionais são capazes de reproduzir a inflamação do músculo cardíaco e formação de edemas como consequência da resposta imune à infecção viral pelo Sars-CoV-2. Nesse contexto, com diferentes fenômenos, escalas e interações entre os sistemas cardiovascular e imunológico, essas ferramentas podem ajudar a avançar o entendimento e o tratamento da miocardite. A justificativa da hipótese se baseia em modelos desenvolvidos pela equipe deste projeto, que foram capazes de reproduzir, quantitativamente ou qualitativamente, dados experimentais obtidos para outras doenças. Espera-se que os modelos computacionais sejam capazes de responder a perguntas como: a) O que leva a alguns pacientes desenvolverem um quadro de miocardite durante a infecção com SARS-CoV-2? b) Qual o impacto da miocardite no sistema cardiovascular e a sua relação com outros distúrbios cardíacos? c) Por quanto tempo após a eliminação do patógeno os efeitos da miocardite perduram? As questões a serem abordadas neste projeto serão estudadas através de modelos matemáticos e computacionais, que são capazes de descrever os diversos fenômenos e suas interações. Os modelos matemáticos da miocardite e da formação de edemas serão calibrados com base em dados clínicos e imagens e serão resolvidos através de métodos numéricos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Integrante / Marcelo Lobosco - Integrante / Bárbara de Melo Quintela - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante / Rafael Alves Bonfim de Queiroz - Integrante / Bernardo Martins Rocha - Coordenador / Michelli Marlane Silva Loureiro - Integrante / Carolina Ribeiro Xavier - Integrante / Vinícius da Fonseca Vieira - Integrante / Ruy Freitas Reis - Integrante / Rafael Sachetto Oliveira - Integrante.

• 2020 - Atual

  Modelagem computacional da resposta imune ao Sars-Cov-2, Descrição: O modelo que está sendo desenvolvido, no projeto de pesquisa, é uma extensão de um modelo da resposta imune adaptativa à vacina da febre amarela. O modelo considera as principais células e moléculas presentes na resposta imune, como, por exemplo, células apresentadoras de antígenos, células T CD4 + e CD8 +, células B e anticorpos IgM e IgG. Neste projeto, estendemos ainda mais o modelo, incluindo citocinas pró-inflamatórias e células infectadas do sistema imunológico. O modelo foi validado com dados experimentais de viremia, anticorpos (IgM e IgG) e citocinas obtidas de pacientes com COVID-19. Simulações usando técnicas de quantificação de incerteza direta e inversa (UQ) foram realizadas para fornecer uma análise rigorosa das incertezas nos parâmetros e nos resultados da simulação do modelo. Além disso, uma análise de sensibilidade (SA) revelou características importantes da resposta imune ao SARS-CoV-2.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Integrante / Marcelo Lobosco - Coordenador / Bárbara de Melo Quintela - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante / Carla Rezende Barbosa Bonin - Integrante / Ruy Freitas Reis - Integrante.

• 2020 - Atual

  Desenvolvimento de um Ambiente Virtual de Aprendizagem para o ensino-aprendizagem de Modelagem Computacional, Descrição: O objetivo deste projeto de pesquisa é desenvolver um site com diversos conteúdos e recursos que darão suporte para o processo ensino-aprendizagem de modelagem computacional. A área de modelagem computacional foi escolhida por ser a área em que atuo e por estar em franca expansão exigindo profissionais com formação e qualificação nessa área. O ambiente que está sendo desenvolvido abordará diversos assuntos sobre modelos matemáticos/computacionais (EDOs, EDPs, autômatos celulares, agentes, modelos estocásticos) e conceitos fundamentais da área. A abordagem para apresentação dos conteúdos combina um pouco de teoria com a prática através de uma sequência: introdução, conteúdo principal, implementação prática e resultados. Além disso, neste projeto, pretende-se desenvolver interfaces simples e intuitivas para a construção, simulação interativa e visualização dos resultados para cada tipo de modelo matemático/computacional. Uma parte inicial está sendo construída com os conteúdos iniciais e com conteúdos sobre autômatos celulares.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Coordenador / Brenno Lemos Melquíades dos Santos - Integrante.

• 2019 - 2020

  Desenvolvimento de uma biblioteca para construção e simulação de autômatos celulares, Descrição: O projeto consistiu no desenvolvimento de uma biblioteca que possa ser usada por pesquisadores para criar, simular e estudar autômatos celulares. Foi uma prioridade do projeto manter a simplicidade de uso da interface da biblioteca para que com poucas linhas de código fosse possível construir, simular e visualizar os resultados de modelos baseados em autômatos celulares. Os modelos são construídos através de scripts em Python. O código da biblioteca foi desenvolvido em Cython (C + Python).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Coordenador / Brenno Lemos Melquíades dos Santos - Integrante.

• 2018 - 2021

  Desenvolvimento de redes de Petri estocásticas da resposta imune à infecções bacterianas e virais, Descrição: O objetivo deste projeto de pesquisa é desenvolver redes de Petri estocásticas para modelar e simular a resposta imune à infecções bacterianas e virais. A rede de Petri desenvolvida atualmente está sendo utilizada para estudar comportamentos observados em infecções bacterianas que podem ser agudas ou crônicas. A rede atual também estuda a importância do papel regulador do macrófago na resolução da resposta imune e os efeitos da inflamação e do dano tecidual nessa resposta.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Coordenador / RIBEIRO, ELVIS H. - Integrante.

• 2011 - 2015

  Modelagem computacional da resposta imune inata à infecção por Staphylococcus aureus, Descrição: Nos últimos anos, tem havido um crescente interesse na modelagemmatemática e computacional do sistema imune humano (SIH). Modeloscomputacionais da dinâmica do SIH podem contribuir para um melhorentendimento da relação entre fenômenos complexos e a resposta imune. Alémdisso, no futuro, modelos computacionais irão auxiliar o desenvolvimento de novosmedicamentos e terapias para diferentes doenças. Este trabalho pretende estudara resposta imune durante uma infecção por Staphylococcus aureus e a formaçãode abscessos durante esse processo infeccioso. As infecções por S. aureus estãoassociadas à formação de abscessos e à persistência da bactéria no corpo. Após aadministração intravenosa de S. aureus em camundongos, a bactéria S. aureus sedissemina rapidamente em tecidos de órgãos e provoca lesões chamadasabscessos que se desenvolvem ao longo de semanas. Os estafilococos crescemcomo colônias no centro da lesão do abscesso e são fechados porpseudocápsulas (coágulos de fibrina), separando-os e protegendo-os de leucócitospolimorfonucleares (também conhecidos como neutrófilos) e outras células dosistema imunológico. O objetivo dessa pesquisa é modelar e simular a dinâmicaespaço-temporal de células e moléculas representativas da resposta imune inata auma infecção por Staphylococcus aureus. Além disso, pretende-se validar omodelo desenvolvido com dados experimentais. Tal objetivo constitui a extensão eaplicação de modelos desenvolvidos no escopo de trabalhos anteriores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Bittencourt Pigozzo - Coordenador / Marcelo Lobosco - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante.