Marilis do Valle Marques

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (1985) e doutorado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1991). Realizou estágio de pós doutoramento em Biologia Molecular na Universidade da California em Los Angeles (UCLA) de 1992-1994. Defendeu sua Livre-Docência em 2005, sendo atualmente professora associada 2 do Departamento de Microbiologia da Universidade de São Paulo. Foi coordenadora do Programa de Pós Graduação em Microbiologia de 2009 a 2011, Coordenadora de Pesquisa de 2004-2007 e 2013-2016, Vice-Chefe do Departamento de Microbiologia de 2013-2015 e 2017-2019. Tem experiência na área de Genética Bacteriana, atuando principalmente nos seguintes temas:genômica, transcriptômica, regulação gênica e respostas a estresses.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado

1986 - 1991

Universidade de São Paulo
Título: Isolamento, caracterização e expressão do gene da subunidade regulatória da proteína quinase dependente de AMP cíclico em Blastocladiella emersonii
Suely Lopes Gomes. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Ciências Biológicas

1982 - 1985

Universidade Estadual de Campinas

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Pós-doutorado

2005

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Estudos funcionais do genoma de Caulobacter crescentus, Ano de obtenção: 2005., Palavras-chave: bactéria; Caulobacter; genética; genômica funcional., Grande área: Ciências Biológicas

1994 - 1996

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

1993 - 1994

Pós-Doutorado. , University of California - Los Angeles, UCLA, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

1992 - 1993

Pós-Doutorado. , University of California - Los Angeles, UCLA, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Formação complementar

2012 - 2012

Workshop em Redação Científica e Publicação. (Carga horária: 4h). , American Society For Microbiology, Estados Unidos.

2012 - 2012

Moodle 2.2 do STOA. (Carga horária: 4h). , Instituto de Ciências Biomédicas -USP, ICB-USP, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Bacteriologia.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

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Organização de eventos

MARQUES, MV. ; OUTROS, . 31a Reunião de Genética de Microrganismos. 2018. (Congresso).

Marques, Marilis V ; GALHARDO, R. S. ; DIAS, M. B. . I Workshop in Microbial Molecular Biology. 2017. (Outro).

Marques, Marilis V ; Soares, C.M.A. . 29a Reunião de Genética de Microrganismos. 2014. (Congresso).

Soares, C.M.A. ; Rodrigues M.L. ; MARQUES, MV. . 28a REunião de Genética de Microrganismos. 2012. (Congresso).

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Participação em eventos

ASM Microbe 2019. The Caulobacter DEAD-Box RNA Helicase DbpA is Required for Growth at Low Temperature. 2019. (Congresso).

iGEM-International Genetically Engineered Machine. Genetic Switch for Bioproduction. 2019. (Olimpíada).

31 Reuniáo de Genética de Microrganismos. 2018. (Encontro).

5th Meeting of Regulating with RNA in bacteria and archaea. Identification of Hfq-binding RNAs in Caulobacter crescentus. 2018. (Congresso).

International Congress of Genetics. Characterization of iron transport systems in Caulobacter crescentus. 2018. (Congresso).

5th ASM Conference on Prokaryotic Cell Biology and Development. Caulobacter CspC Regulates the Expression of the Glyoxylate Cycle Genes at Stationary Phase. 2015. (Congresso).

60o Congresso Brasileiro de Genética. 2014. (Congresso).

27o Congresso Brasileiro de Microbiologia. The RNA metabolism on bacterial stress response. 2013. (Congresso).

28a Reunião de Genética de Micorganismos. Organizadora. 2012. (Congresso).

58 Congresso Brasileiro de Genética. Genética e Evolução. 2012. (Congresso).

XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia. 2012. (Congresso).

ASM Conference on Regulating with RNA in bacteria. Two small RNAs regulated by the Ferric Uptake Regulator. 2011. (Congresso).

FEMS 2011- 4th Congress of European Microbiologists. Role and regulation of cold shock proteins in Caulobacter crescentus. 2011. (Congresso).

27a Reunião de Genética de Microrganismos.Avaliação funcional de genes em microrganismos. 2010. (Encontro).

56o Congresso Brasileiro de Genética. Strategies of gene regulation in bacteria. 2010. (Congresso).

3rd Caulobacter Meeting. Stress Responses & Biotechnology. 2009. (Congresso).

ASM Conference on Prokaryotic Development. Identification of regulatory signals of two stationary phase-induced proteins containing double Cold Shock Domains of Caulobacter crescentus. 2009. (Congresso).

XXV Congresso Brasileiro de Microbiologia. Ensino em Microbiologia. 2009. (Congresso).

108th General Meeting of American Society for Microbiology. Characterization of Caulobacter crescentus mutants for cold shock genes. 2008. (Congresso).

26a Reunião de Genética de Microrganismos. Genética, diferenciação e adaptação ambiental em bactérias. 2008. (Congresso).

53o Congresso Brasileiro de Genética. Estudos Pós-Genômicos em Xylella Fastidiosa e Xanthomonas Axonopodis Pv. Citri: Em Busca de Alvos para Combater o Amarelinho e Cancro Cítrico. 2007. (Congresso).

International Workshop on Xylella fastidiosa.Functional Genomics. 2007. (Oficina).

11th International Symposium on Microbial Ecology.Identification of genes important for Caulobacter crescentus resistance to freezing. 2006. (Simpósio).

52o Congresso Brasileiro de Genética. Identificação de genes regulados pelo fator sigma E de Xylella fastidiosa. 2006. (Congresso).

Gordon Conference on Microbial Stress Response.The single ECF sigma factor of Xylella fastidiosa is involved in the heat shock response and presents an unusual regulatory mechanism. 2006. (Simpósio).

2nd ASM Conference on Prokaryotic Development. Overexpression of the transcription factor TacA inhibits motility in Caulobacter crescentus. 2005. (Congresso).

The 2nd Caulobacter Meeting. Identification of genes involved in resistance to cadmium in Caulobacter crescentus. 2005. (Congresso).

XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia. Coordenação da Mesa-Redonda: Genômica funcional e regulação gênica em bactérias. 2005. (Congresso).

XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia.Genes envolvidos na resposta a estresses de Caulobacter crescentus. 2005. (Simpósio).

104th Meeting of the American Society for Microbiology. Analysis of Expression of the csp Genes in Caulobacter crescentus. 2004. (Congresso).

XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia. A metodologia de geração de mutantes por transposição na identificação de genes de resposta a estresses ambientais. 2003. (Congresso).

Xth International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology. Characterization of the cold shock response in Caulobacter crescentus. 2002. (Congresso).

I Simpósio Genoma Funcional da Xylella fastidiosa.Site-directed gene disruption in Xylella fastidiosa. 2001. (Simpósio).

XXIX Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Analysis of expression of the transcription factor TacA in Caulobacter crescentus.. 2000. (Congresso).

XXIX Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Identification of genes involved in response to stress in Caulobacter crescentus.. 2000. (Congresso).

99th Meeting of the American Society for Microbiology. Regulation of tacA and pepF expression in Caulobacter. 1999. (Congresso).

XXVII Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Overexpression and purification of the Caulobacter crescentus transcription factor TacA.. 1998. (Congresso).

XIX Congresso Brasileiro de Microbiologia. Estudo da regulação da expressão do gene tacA em Caulobacter crescentus.. 1997. (Congresso).

Cold Spring Harbor Laboratory Meeting ?Molecular Genetics of Bacteria and Phage?. A gene coding for a novel sigma 54-activating protein is developmentally regulated in Caulobacter crescentus.. 1996. (Congresso).

XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. A gene coding for a novel sigma 54-activating protein is developmentally regulated in Caulobacter crescentus. 1996. (Congresso).

XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Synergistic activation of a s54 promoter by upstream and downstream enhancer sequences. 1995. (Congresso).

Keystone Symposia on Molecular & Cellular Biology: Molecular Genetic Controls of Microbial Differentiation.Control of expression of the genes encoding subunits of cAMP-dependent protein kinase during differentiation in B. emersonii.. 1993. (Simpósio).

Keystone Symposia on Molecular & Cellular Biology: Molecular Genetic Controls of Microbial Differentiation.Regulation of swarmer pole specific transcription in Caulobacter.. 1993. (Simpósio).

XX Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. cAMP-dependent protein kinase in Blastocladiella emersonii: coordinate pretranslational control of catalytic and regulatory subunit expression.. 1991. (Congresso).

XX Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Structure of the gene for the regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinase in Blastocladiella emersonii. 1991. (Congresso).

PAABS VI Congress. Characterization of a genomic clone coding for the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase from Blastocladiella emersonii.. 1990. (Congresso).

PAABS VI Congress. The expression of a phosphoprotein co-purified with the catalytic subunit of the protein kinase A is developmentally regulated in Blastocladiella emersonii.. 1990. (Congresso).

XVIII Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Isolation and characterization of cDNA clones coding for the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase from Blastocladiella emersonii. 1989. (Congresso).

XVII Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica. Developmental regulation of expression of the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase of Blastocladiella emersonii. 1988. (Congresso).

XVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica. Purification of the regulatory and catalytic subunits of the adenosine da 3?:5? cyclic monophosphate-dependent protein kinase from Blastocladiella emersonii.. 1987. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Jhonathan Stivins Benites Pariente

GUEIROS FILHO, F.;Marques, Marilis V.; CARDOSO, A. B.. Estudo do papel de MinD, um regulador chave da divisão bacteriana de Bacillus subtilis. 2015. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Débora Fernandes Custodio

Marques, Marilis V.; OUTROS,. Obtenção de L-asparaginase de Erwinia chrysanthemi melhorada por evolução sintética de proteínas. 2015. Dissertação (Mestrado em Tecnologia Bioquímico-Farmacêutica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Theopi Alexandra Varvakis Rados

MARQUES, MV.; OUTROS,. Aplicação da microscopia de série temporal para o estudo da expressão gênica e montagem do divissomo em Bacillus subtilis. 2013. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Andressa Caravelli

MARQUES, MV.; OUTROS,. Anticorpo recombinante anti-intimina:uma ferramenta para o diagnóstico rápico de Escherichia coli entreopatogênica e de E. coli enterohemorrágica. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana Coutinho Campos

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização fenotípica e genotípica da resistência a antimicrobianos em micobactérias de crescimento rápido. 2013. Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maristela Previato

Marques, Marilis V.; NETTO, L. E. S.; GUEIROS FILHO, F.. Estudo da regulação de genes envolvidos na resposta a estresse oxidativo em Caulobacter crescentus. 2013. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Juliana da Silva Santos

MARQUES, MV.Silva, A.M.Martins, E.A.L.. Identificação de fatores de transcrição e sinais celulares que regulam a expressão do gene cspC em Caulobacter crescentus. 2012. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Paulo Marques Pierry

MARQUES, MV.Silva, A.M.; HOTTA, C. T.. Pirossequenciamento e análise comparativa de genomas do fitopatógenos Xylella fastidiosa. 2012. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Mirian Molnar Rogrigues

MARQUES, MV.Silva, A.M.MARTINS, E. A.. Estudo do papel de duas ferritinas no metabolismo de ferro de Caulobacter crescentus e sua regulação. 2012. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Marcela Valente Pimenta

MARQUES, MV.; NETTO, L. E. S.; OLIVEIRA, M. A.. Investigação de facetas pró e antioxidantes de flavoproteínas de Xylella fastidiosa. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia (Genética)) - Instituto de Biociências - USP.

Aluno: Marcos Henrique de Moraes

MARQUES, MV.; OUTROS,. Construção de linhagens atenuadas de Salmonella enteria enteritidis: avaliação do potancial imunogênico e protetor. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Valquiria Tiago dos Santos

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização de novos componentes da maquinaria de divisão em Bacillus subtilis. 2011. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Yeimy Paola Galindo Rozo

MARQUES, MV.; SILVA, L. F.; LOPES, M. S. G.. Bioprospecção de genes da giossíntese de polimeros biodegradaveis a partir de uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica. 2011. Dissertação (Mestrado em Pós Grauduação Interunidades em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Christiane Yumi Ozaki

MARQUES, MV.; OUTROS,. Clonagem e expressão de um fragmento variável em cadeia única contra a toxina termo-lábil de Escherichia coli enterotoxigenica. 2011. Dissertação (Mestrado em Pós Grauduação Interunidades em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Eliezer Stefanello

MARQUES, MV.; BALDINI, R. L.; OLIVEIRA, J. C. F.. Fatores envolvidos com a mobilização de PAPI-1. 2010. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Heloise Balhesteros

FARAH, S. C.; SILVA, L. F.;MARQUES, MV.. Análise do papel do gene cspC de Caulobacter crescentus e de sua regulação. 2009. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Rita de Cássia Meireles Dias e Souza

MARQUES, MV.; OUTROS,. Eletroforese 2D-MALDI-TOF e Nano-HPLC-ESI/Ms/MS para análise do proteoma de membrana externa de Pseudomonas aeruginosa. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Priscilia Aguilar Ramirez

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização imunológica e genética da deficiência do componente C5 do sistema complemento humano. 2007. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Imunologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: José Antônio Tavares de Albuquerque

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise comparativa da transcrição de genes envolvidos na invasão e escape de Escherichia coli enteroinvasora e Shigella flexneri em macrófagos J774. 2006. Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Soraia Ferini Namora

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise do locus de b-lactamase de BCG como sítio de inserção de antígenos heterólogos. 2004. Dissertação (Mestrado em bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Julio Cesar Levano Garcia

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização de mutantes de Xanthomonas citri gerados por disrupção gênica randômica usando transposon. 2003. Dissertação (Mestrado em bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda de Oliveira Neves

MARQUES, MV.; OUTROS,. Síntese do gene de interferon alfa humano, clonagem e expressão em Escherichia coli. 2003. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Liliane Cristina Mioto

MARQUES, MV.; OUTROS,. Detecção e identificação de micoplasmas em culturas celulares por cultivo e reação em cadeia da polimerase (PCR). 2003. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Beatriz Amoroso Botelho

MARQUES, MV.; OUTROS,. Molecular characterization of Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) and non-EPEC by fliC gene polymorphisms detected by PCR-RFLP. 2002. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Flávia Cristina Machado Silva

MARQUES, MV.; OUTROS,. Dissertação de Mestrado. 2002. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Carolina Maria Berra

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização funcional do gene AtXPB2 em leveduras mutantes no gene homólogo RAD25. 2002. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Vania Santos Braz

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização do operon pep de Caulobacter crescentus. 2001. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Eric Kinnosuki Martins Ueda

MARQUES, MV.; OUTROS,. Isolamento, purificação e caracterização de prolactina humana autêntica recombinante secretada no espaço periplasmático de Escherichia coli. 2001. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Karen Cristina Massini

MARQUES, MV.; OUTROS,. Alterações epigenéticas promovidos no genoma da Aspergillus nidulans pelo tratamento com hemolinfa de insetos. 2001. Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Valéria Cristina da Silva Italiani

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação de genes envolvidos na resposta a estresses ambientais em Caulobacter crescentus. 2001. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Erica Chimara Silva

MARQUES, MV.; OUTROS,. Mycobacterium kansaii: freqüência de isolamento entre pacientes com cultura de espécime clínico pulmonar positiva para cepas isoladas. 2000. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Mazza Garrido

MARQUES, MV.; OUTROS,. Construção de uma biblioteca genômica de "Streptomyces olindensis" e triagem de clones envolvidos na biossíntese do antitumoral retamicina. 2000. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Augusta Machado

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo da regulação do gene tacA em Caulobacter crescentus. 1999. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Ligia Miranda Menezes

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise da expressão do fator TacA e investigação dos promotores dependentes de TacA em Caulobacter crescentus. 1999. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Suzana Maria Ramos Costa

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise da expressão de proteínas fusionadas ao fator de virulência YopH de Yersinia enterocolitica sob o controle do promotor yopH em Escherichia coli. 1999. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Bianca Cruz Neves

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização molecular e ultra-estrutural de EspA de diferentes sorotipos de Escherichia coli enteropatogênica. 1998. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Elisabete Sbrogio de Almeida

MARQUES, MV.; OUTROS,. Resposta imune induzida por Salmonella atenuada administrada por via oral : utilização do sistema flagelina para expressão do epitopo CTP-3 da toxina colérica. 1998. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Juana Ana Gismero Ordoñez

MARQUES, MV.; OUTROS,. Influência das condições ambientais na expressão da fímbria BFP em Escherichia coli enteropatogênica (EPEC). 1998. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Amanda Billlia Flora

MARQUES, MV.; GOMEZ, J. G. C.; PADILLA, G.; GALHARDO, R. S.; BARROS, M. H.. Detecção e clonagem de genes de biossíntese de 1,3-propanodiol a partir de glicerol em Klebsiella pneumoniae GLC29. 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Lívia Soares Zaramela

Marques, Marilis V.KOIDE, T.; BALDINI, R. L.;SILVA NETO, J. F.; CRUZ, A. K.. Mapeamento de RNAs não-codificantes e suas interações com a chaperone Lsm na archaea Halobacterium salinarum. 2015 - Faculdade de Medicina USP Ribeirão Preto.

Aluno: Maíra Pmpeu Martins

Marques, Marilis V.; OUTROS,. Expressão comparativa de genes em dermatófitos durante o processo de interação com moléculas do hospedeiro e em resposta a agentes antifúngicos. 2015. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Genética) - Faculdade de Medicina USP Ribeirão Preto.

Aluno: Marcelo Bueno Batista

Marques, Marilis V.; OUTROS,. Determinação do regulon das proteínas Fnr1, Fnr2 e Fnr3 em Herbaspirillum seropedicae SmR1 em resposta à diminuição nos níveis de oxigênio. 2015. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Heloise Balhesteros

Marques, Marilis V.; NASCIMENTO, A. L. T.;Silva, A.M.; GUEIROS FILHO, F.; GALHARDO, R. S.. Caracterização do papel de dois fatores sigma de função extracitoplasmática da família FecI em Caulobacter crescentus. 2014. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Tiago Rinaldi Jacob

MARQUES, MV.; OUTROS,. Expressão, regulação e funcionalidade de genes hsps no dermatófito Trichophyton rubrum. 2014. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Genética) - Faculdade de Medicina USP Ribeirão Preto.

Aluno: Amina Potter de Carvalho Saré de Melo

MARQUES, MV.; OUTROS,. Sequenciamento do plasmídeo pRJ101, codificador da aureociclicina 4185: a primeira bacteriocina cíclica descrita em Staphylococcus spp. 2014. Tese (Doutorado em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Jonas Weissmann Gaiarsa

MARQUES, MV.; OUTROS,. História evolutiva de carbo-hidrolases ligno-celulósicas da família Xanthomonadaceae. 2013. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Silvia Regina Loureiro Teixeira

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise da variabilidade de sistema de regulação de dois componentes FimSR e expressão do operon fimA em Porphyromonas gingivalis. 2013. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Estela Ynes Valencia Morante

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo do sistema BlaR/BlaI e de dois operons codificando sistemas de efluxo RND em Caulobacter crescentus. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Marcus Livio Varella Coelho

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo de fatores relacionados com a conferencia de imunidade a aureocina A70 e com a regulação da produção desta bacteriocina. 2012. Tese (Doutorado em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Débora Trichez

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise estrutural da permease Agt1p de Saccharomyces cerevisiae. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Fabiana da Silva Paula

MARQUES, MV.; OUTROS,. Diversidade e estrutura funcional de comunidades microbianas em solos da Amazônia e resposta a mudanças na forma de uso do solo. 2012. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Carolina Antunes do Prado Tavares da Silva

MARQUES, MV.GOMES, S. L.; SPIRA, B.; BARBOSA, H. R.; GOMEZ, J. G. C.. Estudo da regulação do gene cspD de Caulobacter crescentus. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Ricardo Ruiz Mazzon

MARQUES, MV.; BALDINI, R. L.;Galhardo, R.S.; OLIVEIRA, C. C.; SILVA, R. M.. Estudo de genes de Caulobacter crescentus importantes para a sobreviência em baixas temperaturas. 2011. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Nuri Andrea Merchán Castellanos

MARQUES, MV.; OUTROS,. Avaliação do sistema de mobilização de poli-3-hidroxibutirato em Burkholderia sacchari. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: José Renato Rosa Cussiol

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização funcional de uma nova proteína antioxidante: Ohr (Organic Hydroperoxide Resistance Protein). Vias de redução e expressão em Xylella fastidiosa.. 2010. Tese (Doutorado em Biologia (Genética)) - Instituto de Biociências - USP.

Aluno: Fabiana Andrielli

MARQUES, MV.; OUTROS,. Bioprospecção de policetídeos do tipo III em actinomicetos associados às plantas. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Patricia Garrafa

MARQUES, MV.; OUTROS,. Avaliação da qualidade virológica do efluente doméstico tratado e disponibilizado para reuso na cidade de Aão Paulo. 2009. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Fernando Moreira Simambuco

MARQUES, MV.; OUTROS,. Expressão das proteínas N e P do vírus respiratório sincicial humano: estudos funcionais de imunização. 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: José Roberto Tavares

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação e caracterização de novos moduladores da divisão em Bacillus subtilis. 2009. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Luciana Mantozouramins

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise do transcriptoma regulado pela YakA e do papel de KeaA no desenvolvimento de Dictyostelium discoideum. 2009. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Michelle Christiane da Silva Rabello

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo do mecanismo de transferência horizontal da sequência de inserção IS1245, específica de Mycobacterium avium, para Mycobacterium kansasii. 2009. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Rosicler Lázaro Barbosa

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise funcional e estrutural da proteína BigR de Xylella fastidiosa envolvida da regulação do operon XF0768-0764. 2008. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Sonia Regina da Silva

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo do metabolismo de ácidos graxos em Pseudomonas putida visando a modulação da composição monomérica de elastômero biodegradável. 2008. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Marcelo Marques Zerillo

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise genômica macro comparativa entre Leifsonia xyli subsp. Cynodontis e Leifsonia xyli subsp. xyli. 2008. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Priscila Larcher Longo

MARQUES, MV.; OUTROS,. Construção, análise do fenótipo e da transcrição gênica de uma amostra mutante de Aggregatibacter actinomycetencomitans deficiente em arcB. 2008. Tese (Doutorado em pós Graduação em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Janaína Silva de Freitas

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação de genes no fungo filamentosos Aspergillus nidulans modulados por Pa1A, um componente de uma cascata sinalizadora em resposta ao pH ambiente. 2008. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carolina Maria Berra

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudos de reparao de DNA por excisão de nucleotídeos em lesões oxidativas em células de mamíferos. 2008. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Wanessa Cristina de Lima

MARQUES, MV.; OUTROS,. Mapeamento de ilhas de transferência gênica em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xanthomonas campestris pv. campestris. 2007. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Ana Claudia Bonatto

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização in vitro da modificação pós traducional das proteínas GlnB e GlnK de Herbaspirillum seropedicae. 2007. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Michelle Darrieux Sampaio bertoncini

MARQUES, MV.; OUTROS, E.. Expressão, purificação e avaliação imunológica de formas truncadas e híbridos da Proteína de Superfície de Pneumococo A (PspA). 2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Liliana Moura Massis

MARQUES, MV.; OUTROS,. Imunogenicidade e potencial vacinal das flagelinas de Salmonella enterica sorovar Typhimurium. 2007. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Fernanda de Oliveira Neves

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação, clonagem, expressão, purificação e caracterização de lipoproteínas de Leptospira interrogans. 2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: José Freire da Silva Neto

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo dos genes regulados pelos fatores sigma alternativos de Xylella fastidiosa. 2007. Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Aluno: Nathalia Pasternak Taschner

BALDINI, R. L.;Silva, A.M.MARQUES, MV.; Menck, C.F.M.; SPIRA, B.. A regulação da fosfatase alcalina pelo fator sigmaS da RNA polimerase de E. coli. 2006. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Andresa Zamboni

MARQUES, MV.; AMARAL, T. A. T. G.; ELIAS JR., W. P.; FERREIRA, L. C. S.; SCALETSKY, I. C. A.. Estudos genéticos sobre a virulência de Escherichia coli enteroagregativa atípica. 2006. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Melissa Buzinhani

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação sorológica e diversidade genotípica das estirpes de Ureaplasma diversum isoladas do trato reprodutivo bovino. 2006. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Rodrigo Tavanelli Hernandes

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo da aderência localizada de uma amostra de Escherichia coli enteropatogênica atípica. 2006. Tese (Doutorado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Vania Santos Braz

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização de genes envolvidos na resposta a metais em Caulobacter crescentus. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Valéria Cristina da Silva Italiani

MARQUES, MV.; OUTROS,. Caracterização do fator de terminação de transcrição Rho de Caulobacter crescentus. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Paula de Mattos Arêas

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo do efeito adjuvante de CTB em fusões com as proteínas pneumocócicas PsaA e PspA no desenvolvimento de vacinas proteicas contra Streptococcus pneumoniae. 2005. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcos Roberto Buim

MARQUES, MV.; OUTROS,. Mycoplasma synoviae: diagnóstico, caracterização molecular e interação parasita-hospedeiro. 2005. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Silvia Yumi Bando

MARQUES, MV.; OUTROS,. Avaliação da diversidade genética e análise filogenética de Escherichia coli diarreiogênicas usando RAPD e MLST. 2004. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Angelica Gargione Cardoso

MARQUES, MV.; OUTROS,. Sequenciamento e análise do genoma mitocondrial de Paracoccidioides brasiliensis. 2004. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Cristina Viana Niero

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise de polimorfismos genéticos afetando os quatro genes de fosfolipase C (plc) em isolados clínicos do complexo Mycobacterium tuberculosis. 2004. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Leonardo Costa Fiorini

MARQUES, MV.; OUTROS,. Identificação de genes codificadores de serina/treonina fosfatases em Dictyostelium discoideum e caracterização funcional da proteína fosfatase do tipo 4 (PP4). 2003. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Márcia Aikawa

MARQUES, MV.; OUTROS,. Mutagênese biológica em Streptomyces avermitilis: aplicação do transposon Tn 5424 para geração de mutantes na bactéria produtora de avermectina. 2003. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Juana Ana Gismero Ordoñez

MARQUES, MV.; OUTROS,. Tese de Doutorado. 2003. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Ligia Miranda Menezes

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo do regulador de transcrição TacA de Caulobacter crescentus. 2003. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Abdussalam Ali Ramadan Ashour

MARQUES, MV.. Tese de Doutorado. 2002. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Ivan Pereira Nascimento

MARQUES, MV.. Expressão de antígenos de Bordetella pertussis em BCG Recombinante: : Subunidade 1 da toxina Pertussis e fragmento A da hemaglutinina filamentosa (FHA). 2002. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Angela Mehta

MARQUES, MV.; OUTROS,. Expressão diferencial de Xanthomonas axonopodis pv. citri na interação com Citrus sinensis utilizando eletroforese bidimensional de proteínas e cDNA RDA (Representational Difference Analysis. 2002. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Maria Elisabete Sbrogio de Almeida

MARQUES, MV.; OUTROS,. Propriedades imunológicas e potencial vacinal da flagelina de Salmonella. 2002. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Lucia Beirão Cabral

MARQUES, MV.; OUTROS,. Estudo da regulação da expressão do gene da proteína prion celular. 2001. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Regina Célia de Assis

MARQUES, MV.; OUTROS,. Proteólise em Blastocladiella emersonii : evidência da participação da proteassômica e de um novo tipo de montagem da partícula 26S. 2001. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Aluno: Sandra Toshico Tahara

MARQUES, MV.. Tese de Doutorado. 2000. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rita de Cássia Garcia Simão

MARQUES, MV.. Estrutura, expressão e análise funcional do gene codificando calmodulina no fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2000. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: EUCLIDES MATHEUCCI JUNIOR

MARQUES, MV.; OUTROS,. Isolamento e análise funcional do gene que codifica para uma proteina serina-treonina quinase que modula a expressão de genes regulados por carboidratos em Trichoderma reesei. 2000. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Monica Aparecida Midolli Vieira

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise do potencial de virulência de amostras de Escherichia coli não pertencentes a sorogrupos de EPEC, portadoras do gene eae e desprovidas das sequências das sondas EAF e stx. 2000. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: LUIZ FERNANDO CELIDÔNIO ZERBINI

MARQUES, MV.; OUTROS,. Modificação de adenovírus do tipo 2 através de uma mutação na proteína de capsídeo fibra para utilização em terapia gênica e imunização. 1999. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Angela Maria Girardi Dias

MARQUES, MV.; OUTROS,. Características de virulência e análise clonal de Escherichia coli do sorogrupo 0128. 1998. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

Aluno: Mara Lucia Zucheran Silvestri

MARQUES, MV.; OUTROS,. Mapeamento da sequência sinal responsável pela adição da ancora glicolipídica na molécula de adesão celular GP80 em Dictyostelium discoideum. 1998. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Elaine Machado Benelli

MARQUES, MV.; OUTROS,. Análise Funcional e estrutural da proteína PII, controladora da fixação de nitrogênio em Herbaspirillum seropedicae. 1997. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Jacinta Sanchez Pelayo

MARQUES, MV.; OUTROS,. Propriedades de virulência de amostras de Escherichia coli enteropatogênica atípica. 1997. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; VALLINOTO, A. C. R.; PAULA, S. O.; GODARD, A. L. B.; SORIANI, F. M.. Provimento de cargo de professor doutor. 2018. Universidade Federal de Minas Gerais.

MARQUES, MV.; VALLINOTO, A. C. R.; PAULA, S. O.; GODARD, A. L. B.; SORIANI, F. M.. Provimento de cargo de professor doutor. 2017. Universidade Federal de Minas Gerais.

MARQUES, MV.; TERSARIOL, I.; SILVA, S. S.. provimento de cargo de professor doutor. 2016. Universidade Federal de Goiás.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Provimento de Cargo de Professor Doutor. 2012. Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Provimento de Cargo de Professor Doutor. 2010. Faculdade de Medicina USP Ribeirão Preto.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Provimento de Cargo Professor Adjunto. 2010. Universidade Federal de Minas Gerais.

GOMPERTZ, O. F.; MARTINEZ, M. B.; VASCONCELOS, S. A.;MARQUES, MV.; CORREA, B.. Provimento de Cargo de Professor Doutor. 2009. Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Silva, A.M.MARQUES, MV.; FERREIRA, L. C. S.; FARAH, S. C.; GARCIA, C. R. S.. Provimento de cargo de Professor Doutor. 2008. Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; outros participantes. Provimento de um cargo de professor adjunto junto ao Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. 2006. Universidade Federal de São Paulo.

MARQUES, MV.; CASTRO, A. F. P.; YANO, T.; AMARAL, T. A. T. G.; VASCONCELOS, S. A.. Provimento de um cargo de professor doutor junto ao Departamento de Microbiologia. 2005. Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; HARSI, C. M.; outros participantes. Provimento de Três Cargos para Professor Doutor, junto ao Departamento de Microbiologia. 2004. Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; BALDINI, R.; CORREA, B.; FRANCOY, T.. Banca de Livre-Docência. 2016. Universidade de São Paulo.

BROCCHI, M.; FARAH, S. C.; FERREIRA, L. C. S.;MARQUES, MV.; RABINOVITCH, M.. Escherichia coli enteropatogência atípica: um típico patógeno?. 2011. Universidade Federal de São Paulo.

MARQUES, MV.GOMES, S. L.; FARAH, S. C.; PADILLA, G.; CASTILHO, B. A.. Estudos sobre a adptação de Escherichia coli à limitação nutricional. 2010. Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

MARQUES, MV.; OUTROS,. julgamento de projeto PNPD/CAPES. 2015. Instituto de Ciências Biomédicas -USP.

Marques, Marilis V.; OUTROS,. Mostra de Destaques do 23o Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnologica da USP. 2015. Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Avaliação Trienal da área de Ciências Biológicas III. 2013. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Prêmio Pós Graduação/Iniciação Científica do 56o Congresso Brasileiro de Genética. 2010. Sociedade Brasileira de Genética.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Premio Jovem Cientista da X Reunião Anual do Instituto Butantan. 2008. Instituto Butantan.

MARQUES, MV.; OUTROS,. Premio CAPES de Teses. 2008. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

MARQUES, MV.; VENTURA, A. M.. Processo Seletivo para técnico de nível superior Procontes. 2005. Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

MARQUES, MV.; Menck, C.F.M.; VENTURA, A. M.. Processo Seletivo para técnico de nível superior Procontes. 2002. Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Francisco Gorgonio da Nobrega

NOBREGA, F. G.. IQUSP. 1991. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Quimica da Usp.

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Orientou

Naara Marcondes dos Santos

MECANISMOS DE MANUTENÇAO DA HOMEOSTASE DE FERRO E PAPEL DO REGULADOR IscR EM Caulobacter crescentus; Início: 2019; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Hugo Libonati de Araujo

Estudo do papel das RNA helicases da família DEAD-box RhlB e RhlE na estabilidade de RNAs e na expressão gênica em Caulobacter crescentus; Início: 2018; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Bianca Perez Martins

Estudo da regulação genica em resposta a baixa temperatura em Caulobacter; Início: 2019; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Victor de Napole Gregolin

Estudo de duas proteínas com domínio DUF4198 em Caulobacter crescentus; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Biologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP; (Orientador);

Naara Marcondes dos Santos

Caracterização de sistemas de transporte de ferro em Caulobacter crescentus; 2019; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP,; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Rodolfo Alvarenga Ribeiro

Caracterização da DEAD-box RNA helicase cc1478 em Caulobacter crescentus e sua regulação; 2018; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Alexandre Magno Vicente

Estudo da RNA helicase da família DEAD-box codificada pelo gene CC0835 em Caulobacter crescentus; 2017; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP,; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Julia Albano de Barros

Estudo do papel da proteína CspD na fase estacionária de Caulobacter crescentus; 2017; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Maristela Previato

Estudo da regulação de genes envolvidos na resposta a estresse oxidativo em Caulobacter crescentus; 2013; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Mirian Molnar Rodrigues

Estudo do papel de duas ferritinas no metabolismo de ferro de Caulobacter crescentus e sua regulação por um pequeno RNA; 2012; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Juliana da Silva Santos

Identificação de fatores de transcrição e sinais celulares que regulam a expressão do gene cspC em Caulobacter crescentus; 2012; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP,; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Heloise Balhesteros

Análise do papel do gene cspC de Caulobacter crescentus e de sua regulação; 2009; Dissertação (Mestrado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP,; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Vania Santos Braz

Caracterização do operon pep de Caulobacter crescentus; 2001; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Valéria Cristina da Silva Italiani

Identificação de genes envolvidos na resposta a estresses ambientais em Caulobacter crescentus; 2001; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Maria Augusta Machado

Estudo da regulação da expressão do gene tacA durante o desenvolvimento de Caulobacter crescentus; ; 1999; 0 f; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Ligia Miranda Menezes

Análise da expressão do fator TacA e investigação dos promotores dependentes de TacA em Caulobacter crescentus; ; 1999; 0 f; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Angel Alfonso Aguirre Durán

Caracterização fenotípica de linhagens mutantes das RNA helicases DEAD-box de Caulobacter crescentus em condições de baixa temperatura; 2017; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Juliana da Silva Santos

Caracterização dos mecanismos de ação da proteína CspC na manutenção da viabilidade e na resposta de Caulobacter crescentus a estresses; 2016; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Heloise Balhesteros

Caracterização de fatores sigma de função extracitoplasmática envolvidos na resposta a carência de ferro em Caulobacter crescentus; 2014; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Estela Ynes Valencia Morante

Estudo do sistema BlaR/BlaI e de dois operons codificando sistemas de efluxo RND em Caulobacter crescentus; 2012; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Carolina Antunes do Prado Tavares Silva

Estudo da regulação do gene cspD de Caulobacter crescentus; 2011; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Ricardo Ruiz Mazzon

Caracterização de genes de Caulobacter crescentus importantes para a sobrevivência em baixas temperaturas; 2011; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

José Freire da Silva Neto

Estudo dos genes regulados pelos fatores sigma alternativos de Xylella fastidiosa; 2007; Tese (Doutorado em Pós Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Valéria Cristina da Silva Italiani

Caracterização do fator de terminação de transcrição Rho em Caulobacter crescentus; 2006; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Vania Santos Braz

Caracterização de genes envolvidos na resposta a metais em Caulobacter crescentus; 2006; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Luiz Fernando Goda Zuleta

Caracterização da resposta a estresse osmótico em Caulobacter crescentus; 2005; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Elza Akie Sakamoto Lang

Caracterização dos genes que codificam proteínas com domínio de choque frio em Caulobacter crescentus; 2005; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Ligia Miranda Menezes

Estudo do regulador de transcrição TacA de Caulobacter crescentus; 2003; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Laura Leaden

2018; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

Larissa Gomes da Silva

2017; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Marilis do Valle Marques;

Carolina Antunes do Prado Tavares da Silva

2015; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

Ricardo Ruiz Mazzon

2014; Instituto de Ciências Biomédicas -USP,; Marilis do Valle Marques;

José Freire da Silva Neto

2011; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

Vania Santos Braz

2010; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

Valéria Cristina da Silva Italiani

2010; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

REGINA LUCIA BALDINI

2005; Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marilis do Valle Marques;

Lucas Borges de Lima

Estudo da regulação e função da proteína CspD de Caulobacter crescentus; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências - USP; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Nadine Giménez de Assis

Caracterização do papel do fator Hfq na expressão gênica de Caulobacter crescentus; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biomédicas) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Rodolfo Alvarenga Ribeiro

Identificação dos genes regulados pelo produto do gene CC_0517; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Ivan Gonçalves de Castro Ferreira

Determinação da importância e regulação das ferritinas na homeostase de ferro em Caulobacter crescentus; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Daniela Marques de Alvelos

Obtenção e análise fenotípica de mutantes de genes codificando RNA helicases da família DEAD/DEAH em Caulobacter crescentus; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

André Murilo Magro Freddi

Estudo da diversidade bacteriana da represa de Guarapiranga por cultivo e metagenômica; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Ricardo Ruiz Mazzon

Identificação e análise fenotípica de mutantes de Caulobacter crescentus sensíveis ao congelamento; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Heloise Balhesteros

Análise em gel bidimensional das proteínas do periplasma de Caulobacter crescentus induzidas por estresse osmótico; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marilis do Valle Marques;

José Freire da Silva Neto

Obtenção de mutantes de Xylella fastidiosa; 2002; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Taís Waldschmidt Tanamatis

Estudo dos mecanismos de regulação de CspC em Caulobacter crescentus; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Naara Marcondes dos Santos

Caracterização de sistemas de transporte de ferro em Caulobacter crescentus; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Centro Universitário das Faculdades Metropolitanas Unidas; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Gabriela Bassi Maia

Estudo da interação Hfq-CspC em Caulobacter; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Centro Universitário São Camilo; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Carlos Eduardo Oliveira Vido

Identificação de genes induzidos em resposta a estresse oxidativo regulados por OxyR em Caulobacter crescentus; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Moleculares) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Letícia Franco Bisson

Obtenção de mutantes nulos para os genes oxyR e fur de Caulobacter crescentus; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP; Orientador: Marilis do Valle Marques;

Emerson de Souza Santos

Obtenção de mutantes dos genes CC3510 e CC1640 de Caulobacter crescentus; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas -USP; Orientador: Marilis do Valle Marques;

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Foi orientado por

Suely Lopes Gomes

Isolamento, Caracterizacao e Expressao do Gene da Subunidade Regulatoria da Proteina Quinase Dependente de Amp Ciclico de Blastocladiella Emersonii; 1991; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Suely Lopes Gomes;

Suely Lopes Gomes

1996; Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Suely Lopes Gomes;

Suely Lopes Gomes

1992; Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Suely Lopes Gomes;

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Produções bibliográficas

  • SILVA, LARISSA G. ; LORENZETTI, ALAN P.R. ; RIBEIRO, RODOLFO A. ; ALVES, INGRID R. ; LEADEN, LAURA ; GALHARDO, RODRIGO S. ; Koide, Tie ; Marques, Marilis V. . OxyR and the hydrogen peroxide stress response in Caulobacter crescentus. GENE , v. 700, p. 70-84, 2019.

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  • Nascimento, A.L.T.O. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; Van Sluys, M.A. ; Monteiro-Vitorello, C.B. ; Camargo, L.E.A. ; Digiampietri, L.A. ; Harstkeerl, R.A. ; HO, P.L. ; Marques, M.V. ; Oliveira, M.C. ; Setubal, J.C. ; Haake, D.A. ; Martins, E.A.L. ; MARQUES, MV. . Genome features of Leptospira interrogans serovar Copenhageni. Brazilian Journal of Medical and Biological Research , v. 37, p. 459-477, 2004.

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  • MARQUES, MV. ; GOBER, J. W. . Activation of a temporally regulated Caulobacter promoter by upstream and downstream sequence elements. Molecular Microbiology , v. 16, p. 279-289, 1994.

  • MARQUES, MV. ; GOMES, S. L. . Cloning and structural analysis of the gene for the regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinase in Blastocladiella emersonii. The Journal of Biological Chemistry , v. 267, p. 1721-1727, 1992.

  • MARQUES, MV. ; BORGES, A. C. C. ; OLIVEIRA, J. C. F. ; GOMES, S. L. . Coordinate pretranslational control of cAMP-dependent protein kinase subunit expression during development in Blastocladiella emersonii. Developmental Biology , v. 149, p. 432-439, 1992.

  • MARQUES, MV. ; JULIANI, M. H. ; MAIA, J. C. C. ; GOMES, S. L. . Developmental regulation of expression of the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase of Blastocladiella emersonii. European Journal of Biochemistry , v. 178, p. 803-810, 1989.

  • GOMES, S. L. ; JULIANI, M. H. ; MAIA, J. C. C. ; MARQUES, MV. . Developmental expression of the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase of Blastocladiella emersonii.. Arch. Biol. Med. Exp., v. 21, p. 455-459, 1988.

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Outras produções

MARQUES, MV. . Resposta bacteriana a situações de estresse é objeto de estudo na USP. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

MARQUES, MV. ; GALHARDO, R. S. ; SOUZA, R. F. . Consequências Evolutivas da Transferência Horizontal de Material Genético. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MAZZON, R. R. ; MARQUES, MV. . Métodos clássicos e moleculares de avaliação da expressão gênica em bactérias. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

TORRES, B. B. ; BARBOSA, H. R. ; MARQUES, MV. . Organizador Avançado. 2005. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático).

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Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    COMPLEXOS MULTIENZIMÁTICOS BACTERIANOS QUE REGULAM A HOMEOSTASE CELULAR EM RESPOSTA A ESTRESSES AMBIENTAIS, Descrição: Caulobacter crescentus é uma -proteobactéria oligotrófica que são importantes na reciclagem de matéria orgânica proveniente principalmente de material vegetal em decomposição. Esta bactéria é muito bem adaptada a sobreviver em condições de baixo teor nutricional e em baixa temperatura, e possui como diferencial um ciclo de diferenciação celular. Complexos multienzimáticos exercem funções vitais para a sobrevivência da célula, especialmente em condições de estresse, onde cada proteína do complexo tem uma função específica e colabora para o resultado final. Em baixa temperatura as moléculas de RNA tendem a formar estruturas secundárias estáveis, dificultando sua tradução e degradação, e as RNA helicases são ativadas, podendo estar associadas ao degradossomo de RNA. O degradossomo de RNA é um complexo multienzimático que atua como maquinário de processamento do RNA ribossômico e de degradação do mRNA, afetando assim a expressão gênica. O sistema TonB-ExbB-ExbD-Receptor é um complexo multienzimático envolvido na homeostase do ferro intracelular, responsável pela passagem de complexos sideróforo-ferro pela membrana externa da bactéria. O objetivo principal deste projeto é definir a participação de alguns participantes destes complexos proteicos nestes sistemas de C. crescentus. O papel das RNA helicases da família DEAD-box no processamento dos RNAs celulares será avaliado em diferentes condições de crescimento por analise transcriptomica global. Também serão identificados os RNAs, particularmente sRNAs e mRNAs, que interagem com o degradossomo, e será definido os sítios de interação da helicase com o degradossomo. Para estudar os sistemas de transporte de ferro, este projeto propõe definir os papeis de diferentes componentes destes sistemas, identificando o complexo férrico transportado, caracterizando a cinética de transporte, e determinando a estrutura e o papel de proteínas acessórias que ainda não foram estudadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / Tie Koide - Integrante / Naara Marcondes dos Santos - Integrante / Ben Luisi - Integrante / Phil Klebba - Integrante / Hugo Libonati de Araújo - Integrante / Bianca Perez Martins - Integrante / Lucas Borges de Lima - Integrante / Victor de Napole Gregolin - Integrante., Número de orientações: 2

  • 2017 - Atual

    Resposta SOS e resistência bacteriana, Descrição: A resposta SOS é o paradigma de resposta celular aos danos no DNA em procariotos. Muitas funções celulares são reguladas por esta resposta, incluindo mecanismos de reparo de DNA, vias mutagênicas de síntese translesão, e vias que controlam a divisão celular. Mais recentemente, grande atenção vem sendo dispensada ao estudo do envolvimento do SOS na resposta bacteriana a agentes antimicrobianos, especialmente no papel desta resposta na gênese de mutações de resistência. Neste contexto, buscaremos compreender como a resposta SOS modula a fisiologia celular em resposta a uma das classes de agentes antimicrobianos mais importantes da atualidade, as quinolonas, como a ciprofloxacina. Estes antibióticos são reconhecidos indutores de danos no DNA, por inibirem a atividade de DNA girase e topoisomerase. Iremos investigar através de varreduras genéticas genes que afetam a indução da resposta SOS por ciprofloxacina em Pseudomonas aeruginosa. Também iremos caracterizar o transcriptoma de P. aeruginosa em resposta à ciprofloxacina, e o efeito da combinação desta droga com amicacina, recentemente descrita por nosso grupo como inibidora da indução da reposta SOS por ciprofloxacina. Por último, iremos investigar DNA polimerases reguladas pela resposta SOS presentes em transposons conjugativos comumente encontrados no patógeno Proteus mirabilis, estudando seu papel na mutagênese induzida pela exposição a agentes genotóxicos e antibióticos e na transmissão deste elemento por conjugação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Integrante / Rodrigo da Silva Galhardo - Coordenador / Marina Rocha Borges Fonseca - Integrante / Marco Antonio Lima Noronha - Integrante.

  • 2014 - Atual

    SISTEMAS REGULATÓRIOS DA RESPOSTA BACTERIANA A ESTRESSES, Descrição: Projeto Temático. O principal objetivo deste projeto é identificar os sinais ambientais, os sistemas de transdução de sinais e os mecanismos regulatórios importantes para a resposta a estresses na bactéria oligotrófica Caulobacter crescentus. A manutenção da funcionalidade dos RNAs celulares sob situações de estresse é garantida pela indução de proteínas que modulam a transcrição, tradução e turnover dos RNAs. As proteínas de choque frio (CSP) e as RNA helicases da família DEAD são induzidas em baixa temperatura e/ou em fase estacionária, e atuam como chaperones de RNA, permitindo a tradução nestas condições, e também agindo como reguladoras da expressão gênica. As bactérias aeróbias também têm que responder a um aumento na concentração de espécies reativas de oxigênio, que ocorre especialmente quando a população entra em fase estacionária. A homeostase de ferro e de outros metais redox-ativos é um ponto importante no controle do estresse oxidativo, e deve ser estritamente regulada por diversos mecanismos. Além dos reguladores Fur e OxyR, pequenos RNAs regulatórios exercem controle sobre a expressão dos genes do metabolismo de ferro, e serão estudados neste projeto.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / Tie Koide - Integrante / Juliana da Silva Santos - Integrante / Angel Alfonso Aguirre Durán - Integrante / Alexandre Magno Vicente - Integrante / Julia Albano de Barros - Integrante / Larissa Gomes da Silva - Integrante / Naara Marcondes dos Santos - Integrante / Rodolfo Alvarenga Ribeiro - Integrante / Ben Luisi - Integrante / Phil Klebba - Integrante / Salete Newton - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2014

    Estudo da regulação de genes de resposta a estresse oxidativo e metabolismo de ferro em Caulobacter crescentus, Descrição: O principal objetivo do projeto é identificar genes importantes para a resposta à carência de ferro em Caulobacter crescentus e sua relação com o estresse oxidativo, definindo o papel dos reguladores transcricionais conhecidos Fur e OxyR e confirmando em C. crescentus a existência de um possível RNA regulatório. Será analisada a expressão dos genes codificando duas proteínas estocadoras de ferro (ferritinas) e do pequeno RNA em resposta a níveis de ferro e ao estresse oxidativo. O papel dos fatores sigma ECF do tipo FecI na regulação de genes do metabolismo de ferro será avaliado pela construção de linhagens mutantes e análise do padrão de expressão gênica. Os sistemas regulatórios das principais enzimas de resposta a estresse oxidativo (superóxido-dismutases e alquil-hidroperóxido redutases) serão caracterizados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / José Freire da Silva Neto - Integrante / Heloise Balhesteros - Integrante / Mirian Molnar Rodrigues - Integrante / Maristela Previato - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3

  • 2012 - 2014

    SISTEMAS REGULATÓRIOS E FISIOLÓGICOS DA RESPOSTA BACTERIANA A ESTRESSES, Descrição: À medida que a população aumenta, as células enfrentam uma redução progressiva da disponibilidade de nutrientes que traz a necessidade de responder diminuindo a taxa de reprodução e adequando os sistemas metabólicos para permanecer em situação de carência prolongada. Os efeitos fisiológicos da baixa temperatura em parte são similares aos da carência nutricional, no que se refere à diminuição da função ribossomal. A percepção de sinais ambientais nesta fase é crucial para a célula modificar seu padrão de expressão gênica para enfrentar esta nova situação. As proteínas contendo domínio de cold shock (CSD) são induzidas em baixa temperatura e/ou em fase estacionária, e atuam como chaperonas de RNA, permitindo a tradução nestas condições, e também agindo como reguladoras da expressão de outros genes. Outro sistema importante para esta resposta é constituído pelas RNA helicases, que são responsáveis por desfazer as estruturas secundárias. O principal objetivo deste projeto é caracterizar os mecanismos regulatórios importantes para a resposta a estresses na alfa-Proteobactéria Caulobacter crescentus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / Ricardo Ruiz Mazzon - Integrante / Carolina Antunes do Prado Tavares da Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2012

    Mecanismos regulatórios da resposta a choque frio e fase estacionária em Caulobacter crescentus, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / Ricardo Ruiz Mazzon - Integrante / Heloise Balhesteros - Integrante / Carolina Antunes do Prado Tavares da Silva - Integrante / Juliana da Silva Santos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2008 - 2010

    ESTUDO DA REGULAÇÃO DE SISTEMAS DE RESPOSTA A METAIS NA ALFA-PROTEOBACTÉRIA Caulobacter crescentus, Descrição: O principal objetivo do projeto é identificar genes importantes para a resposta aos metais cádmio, zinco e ferro em Caulobacter crescentus e sua relação com o estresse oxidativo, definindo o papel dos reguladores transcricionais conhecidos Fur e OxyR, e de dois reguladores de transcrição específicos, identificados como importantes para a resposta a cádmio.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador / Vânia Santos Braz - Integrante / Valéria C.S. Italiani - Integrante / José Freire da Silva Neto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1

  • 2007 - 2009

    Estudo dos genes envolvidos na resposta à baixa temperatura em Caulobacter crescentus, Descrição: O choque frio causa a estabilização de estruturas secundárias em RNA e DNA, resultando em eficiência reduzida de tradução, transcrição e replicação de DNA. Na queda brusca de temperatura, as bactérias exibem uma resposta sintetizando proteínas de choque de frio (CSPs) que permitem às células superar os efeitos deletérios causados pelo frio. Em Caulobacter existem quatro genes codificando CSPs, sendo que cspA e cspB são altamente induzidos a 10C, mas cspC e cspD não são induzidos pela baixa temperatura, e sim na fase estacionária. Este projeto propõe o estudo do papel dos genes csp em Caulobacter, determinando o fenótipo dos mutantes, os mecanismos de regulação dos genes cspC e cspD na fase estacionária, a identificação dos fatores de transcrição envolvidos e dos sinais celulares que ativam sua expressão.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3

  • 2005 - 2011

    Obtenção e caracterização de um banco de mutantes de Chromobacterium violaceum por inserção aleatória de transposons, Descrição: Visto que 40% do genoma de C. violaceum foi anotado como ORfs hipotéticas, este projeto tem como objetivo principal a construção de bibliotecas de mutantes de Chromobacterium violaceum por inserção aleatória de transposons e, posteriormente, a caracterização de fenótipos mutates e sequenciamento nucleotídico para identificação de novos genes... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Integrante / Carlos F. M. Menck - Integrante / Valéria Karla de Brito Vieira - Integrante / Lucymara Agnez-Lima - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2004 - 2014

    Genes de Reparo de DNA: Análise Funcional e Evolução, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Integrante / Carlos F. M. Menck - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2004 - 2007

    Genômica funcional da resposta a estresses de Caulobacter crescentus, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 8 / Número de orientações: 1

  • 2003 - 2010

    Análise global da expressão gênica em Xylella fastidiosa, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Integrante / Suely Lopes Gomes - Coordenador / Tie Koide - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2002 - 2004

    Caracterização funcional de genes envolvidos na resistência de Caulobacter crescentus a estresses ambientais, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 6 / Número de orientações: 1

  • 2000 - 2002

    Caracterização de genes envolvidos na resposta a estresses em Caulobacter crescentus, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 9 / Número de orientações: 2

  • 1997 - 1999

    Determinação do papel do ativador de transcrição TacA no metabolismo e desenvolvimento de Caulobacter crescentus, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 8 / Número de orientações: 3

  • 1995 - 1996

    Isolamento e clonagem de fatores ativadores da transcrição pela s54-RNA polimerase em Caulobacter crescentus, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marilis do Valle Marques - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 6

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Prêmios

2018

Orientadora de Naara Marcondes dos Santos - Menção Honrosa Premio Milton Krieger, Sociedade Brasileira de Genética.

2017

Orientadora de NADINE GIMENEZ DE ASSIS - Menção Honrosa Premio Milton Krieger, Sociedade Brasileira de Genética.

2016

Orientadora de Alexandre Magno Vicente - Prêmio Milton Krieger, Sociedade Brasileira de Genética.

2013

orientadora de Ricardo Ruiz Mazzon, finalista do Prêmio Jovem Geneticista, Sociedade Brasileira de Genética.

2012

Orientadora de Carolina A. P. Tavares da Silva, finalista do Premio Jovem Geneticista, Sociedade Brasileira de Genética.

2010

Analysis of the role of iron in regulation of putative iron starvation sigma factors from Caulobacter crescentus. Traalho recebeu Menção Honrosa na 27ª Reunião de Genética de Microrganismos, Sociedade Brasileira de Genética.

2010

SpdR, a response regulator required for stationary phase induction of Caulobacter crescentus cspD. Trabalho recebeu premio Destaque em Produção Científica, Departamento de Microbiologia ICB-USP.

2009

orientadora de Vânia Santos Braz, finalista do Prêmio Jovem Geneticista 2009, Sociedade Brasileira de Genética.

2008

Orientadora de José Freire da Silva Neto, ganhador do premio Jovem Geneticista 2008, Sociedade Brasileira de Genética.

2008

Papel de um regulador de transcrição da família BlaI na resposta a estresse oxidativo em Caulobacter crescentus, Trabalho recebeu Menção Honrosa na 26a Reunião de Genética de Microrganismos.

2007

Orientadora de Valéria C. S. Italiani, finalista do premio Jovem Geneticista 2007, Sociedade Brasileira de Genética.

2006

O fator sigma ECF sigmaE de Xylella fastidiosa apresenta um novo sistema de regulação. Trabalho recebeu Menção Honrosa, 25ª Reunião de Genética de Microrganismos.

2006

Identificação de um cluster de genes envolvidos na resistência a cádmio em Caulobacter crescentus. Trabalho recebeu Menção Honrosa, 25ª Reunião de Genética de Microrganismos.

2005

Identificação de genes regulados pelo fator sigma alternativo E de Xylella fastidiosa. Trabalho eleito como melhor da área de Genética de Microorganismos, 51o Congresso Brasileiro de Genética.

2004

Disrupção dos genes que codificam para os fatores sigma alternativos de Xylella fastidiosa. Trabalho eleito como melhor da área de Genética Molecular de Bactérias, 24a Reunião de Genética de Microrganismos.

2004

Estudo da autoregulação do fator de terminação de transcrição Rho de Caulobacter crescentus. Trabalho recebeu Menção Honrosa na área de Genética de Microrganismos, 50o Congresso Brasileiro de Genética.

2000

Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.

2000

Prêmio Cláudia 2000, Revista Cláudia - Editora Abril.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia. , Av. Prof. Lineu Prestes, 1374, Cidade Universitária, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30917299, Fax: (11) 30917354

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Experiência profissional

  • 2013 - Atual

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado 2, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2005 - 2013

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Associado 1, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 1996 - 2005

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 10/2019

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, Membro suplente da Congregação.

    • 04/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, representante professores associados no Conselho de Departamento.

    • 08/1996

      Ensino, Ciências Biológicas (Microbiologia), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos da Biologia Molecular Bacteriana, Regulação gênica em bactérias

    • 05/1996

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Linhas de pesquisa

    • 05/1996

      Ensino,,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular da Célula II, Microbiologia Básica para Biologia, Microbiologia Básica para Odontologia

    • 10/2017 - 10/2019

      Direção e administração, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, Vice-Chefe do Departamento de Microbiologia.

    • 07/2017 - 10/2019

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Ética e Direitos Humanos do IQ.

    • 09/2013 - 09/2016

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, Coordenador de Pesquisa.

    • 10/2013 - 10/2015

      Direção e administração, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, Vice-Chefe do Departamento.

    • 10/2005 - 10/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, Vice Presidente da Comissão de Proteção Radiológica.

    • 04/2011 - 06/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, representante dos professores associados na Congregação.

    • 02/2014 - 02/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, Prsidente da Comissão de Corpo Docente do ICB.

    • 03/2012 - 02/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, membro da Comissão Corpo Docente do ICB.

    • 10/2009 - 10/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, Coordenadora do Programa de Pós Graduação em Microbiologia.

    • 05/2009 - 05/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, representante dos associados na Congregação do ICB.

    • 09/2008 - 09/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, Vice-Coordenadora do Programa de Pós Graduação em Microbiologia.

    • 10/2006 - 09/2008

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, Membro da Coordenadoria de Pós Graduação do Programa de Microbiologia.

    • 09/2004 - 09/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, Coordenadora da Comissão de Pesquisa do Departamento de Microbiologia.

    • 01/1997 - 05/2006

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, membro da Comissão de Biblioteca.

    • 06/2003 - 06/2005

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, representante dos Doutores junto à Congregação do Instituto.

    • 04/2003 - 04/2005

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, membro suplente do Conselho do Departamento.

    • 06/2001 - 06/2003

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, representante dos Doutores junto à Congregação do Instituto.

    • 04/2001 - 04/2003

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, membro do Conselho do Departamento.

    • 02/1998 - 01/2003

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, membro suplente da Coordenadoria de Graduação.

    • 02/1997 - 01/2002

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, .,Cargo ou função, membro da Comissão Interna de Biossegurança.

    • 10/1998 - 10/2001

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.,Cargo ou função, membro da Coordenadoria de Pesquisa do Departamento.

  • 2018 - 2018

    University Of Cambridge

    Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: professor visitante, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Estágio de pesquisa de 25 dias.

  • 2016 - 2016

    University Of Cambridge

    Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: professor visitante, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Estágio de pesquisa de 30 dias

  • 2013 - 2013

    University Of Cambridge

    Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: professor visitante, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Estágio de pesquisa de 30 dias

  • 1997 - Atual

    Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: assessor ad hoc

  • 2004 - Atual

    Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: assessor ad hoc

  • 2017 - Atual

    Instituto Serrapilheira

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: assessor adhoc

  • 2008 - Atual

    Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: assessor ad hoc