Renato Graciano de Paula

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; TAVEIRA, IASMIN CARTAXO ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; SILVA, ROBERTO N. . Advances in fungal sugar transporters: unlocking the potential of second-generation bioethanol production. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY , v. 109, p. 19, 2025.

• SILVA, ROBERTO N. ; DE PAULA, RENATO GRACIANO . Editorial for Special Issue: Fungal Biology and Interactions. Microorganisms , v. 12, p. 282, 2024.

• NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; MENDES, VANESSA ; KAMATH, KARTHIK SHANTHARAM ; CHERUKU, ANUSHA ; OSHIQUIRI, LETÍCIA HARUMI ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; CARRARO, CLAUDIA ; PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS ; PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; VIEIRA, LUIZ CARLOS ; STEINDORFF, ANDREI STECCA ; AMIRKHANI, ARDESHIR ; MCKAY, MATTHEW J. ; NEVALAINEN, HELENA ; MOLLOY, MARK P. ; SILVA, ROBERTO N. . Proteome profiling of enriched membrane-associated proteins unraveled a novel sophorose and cello-oligosaccharide transporter in Trichoderma reesei. Microbial Cell Factories , v. 23, p. 22, 2024.

• OSHIQUIRI, LETÍCIA HARUMI ; PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; MILANI, ELIZABETE ROSA ; SILVA, ALINNE COSTA ; JESUS, LUIZ FELIPE DE MORAIS COSTA DE ; SILVA-NETO, JULIO ALVES ; VERAS, FLÁVIO PROTÁSIO ; DE PAULA, R.G. ; SILVA, R. N. . Regulatory Role of Vacuolar Calcium Transport Proteins in Growth, Calcium Signaling, and Cellulase Production in Trichoderma reesei. JOURNAL OF FUNGI , v. 10, p. 853, 2024.

• CAMPOS ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; Steindorff, Andrei Stecca ; KENNEDY, JOHN F. ; PANDEY, ASHOK ; GUPTA, VIJAI KUMAR ; SILVA, ROBERTO N. . Engineering of holocellulase in biomass-degrading fungi for sustainable biofuel production. JOURNAL OF CLEANER PRODUCTION , v. 1, p. 133488-133488, 2022.

• ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; MENDES, VANESSA ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; OSHIQUIRI, LETÍCIA HARUMI ; ZENAIDE-NETO, HERMANO ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; GAFFEY, JAMES ; TABATABAEI, MEISAM ; GUPTA, VIJAI KUMAR ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO . Use of carbohydrate-directed enzymes for the potential exploitation of sugarcane bagasse to obtain value-added biotechnological products. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 221, p. 456-471, 2022.

• LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO ; DE PAULA, RENATO GRACIANO . Molecular Characterization of Xyloglucanase cel74a from Trichoderma reesei. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 22, p. 4545, 2021.

• PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; TAVEIRA, IASMIN CARTAXO ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; MARTINS, MAÍRA POMPEU ; RIBEIRO, LILIANE FRAGA COSTA ; DAMASIO, ANDRÉ RICARDO DE LIMA ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; FILHO, ANTÔNIO ROSSI ; SILVA, ROBERTO N . Analysis of the phosphorylome of trichoderma reesei cultivated on sugarcane bagasse suggests post-translational regulation of the secreted glycosyl hydrolase Cel7A. BIOTECHNOLOGY REPORTS , v. 31, p. e00652, 2021.

• IMBERTI, G. A. ; PEREIRA, S. S. ; DE PAULA, R.G. ; GONCALVES, E. C. ; COITINHO, J. B. . Emergency remote education during the pandemic in Freire's perspective: analysis of focus groups with students from an IFES. REVISTA OLHARES E TRILHAS , v. 23, p. 342-349, 2021.

• MARTINS-SANTANA, LEONARDO ; PAULA, RENATO GRACIANO DE ; SILVA, ADRIANO GOMES ; LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES ; SILVA, ROBERTO DO NASCIMENTO ; SILVA-ROCHA, RAFAEL . CRZ1 regulator and calcium cooperatively modulate holocellulases gene expression in Trichoderma reesei QM6a. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY , v. 43, p. 1, 2020.

• BRAUER, VERÔNICA S. ; PESSONI, ANDRÉ M. ; BITENCOURT, TAMIRES A. ; DE PAULA, RENATO G. ; DE OLIVEIRA ROCHA, LILIANA ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; ALMEIDA, FAUSTO . Extracellular Vesicles from Induce M1 Polarization. mSphere , v. 5, p. 1, 2020.

• DE PAULA, R.G. ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; RIBEIRO, LILIANE FRAGA COSTA ; SRIVASTAVA, NEHA ; O'DONOVAN, ANTHONIA ; MISHRA, P.K. ; GUPTA, VIJAI K. ; SILVA, R. N. . Engineered microbial host selection for value-added bioproducts from lignocellulose. BIOTECHNOLOGY ADVANCES , v. 1, p. 1-10, 2019.

• DE PAULA, R.G. ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; RIBEIRO, LILIANE FRAGA COSTA ; ROCHA, MARINA CAMPOS ; MALAVAZI, IRAN ; ALMEIDA, FAUSTO ; SILVA, R. N. . Extracellular vesicles carry cellulases in the industrial fungus Trichoderma reesei. Biotechnology for Biofuels , v. 12, p. 146, 2019.

• ANTONIETO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; NORA, LUÍSA CZAMANSKI ; CASSIANO, MURILO HENRIQUE ANZOLINI ; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA ; ALMEIDA, FAUSTO ; DA SILVA, THIAGO APARECIDO ; RIES, LAURE NICOLAS ANNICK ; DE ASSIS, LEANDRO JOSE ; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO ; SILVA-ROCHA, RAFAEL . A Novel Cys2His2 Zinc Finger Homolog of AZF1 Modulates Holocellulase Expression in Trichoderma reesei. mSystems , v. 4, p. 1, 2019.

• BRAUER, VERONICA SOARES ; REZENDE, CAROLINE PATINI ; PESSONI, ANDRE MOREIRA ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; RANGAPPA, KANCHUGARAKOPPAL S. ; NAYAKA, SIDDAIAH CHANDRA ; GUPTA, VIJAI KUMAR ; ALMEIDA, FAUSTO . Antifungal Agents in Agriculture: Friends and Foes of Public Health. Biomolecules , v. 9, p. 521, 2019.

• RIBEIRO, MARCELA SURIANI ; DE PAULA, R.G. ; VOLTAN, A. R. ; GEORG, RAPHAELA DE CASTRO ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; DE ASSIS, LEANDRO JOSE ; STEINDORFF, ANDREI STECCA ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; SILVA, R. N. ; ULHOA, CIRANO JOSE ; NEVES MONTEIRO, VALDIRENE . Endo-β-1,3-glucanase (GH16 Family) from Trichoderma harzianum Participates in Cell Wall Biogenesis but Is Not Essential for Antagonism Against Plant Pathogens. doi.org/10.3390/biom9120781 , v. 9, p. 781, 2019.

• NOGUEIRA, KAROLINE M. V. ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; DOS REIS, THAILA F. ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; SILVA, ALINNE COSTA ; ALMEIDA, FAUSTO ; RECHIA, CAREM GLEDES VARGAS ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; SILVA, ROBERTO N. . Characterization of a novel sugar transporter involved in sugarcane bagasse degradation in Trichoderma reesei. Biotechnology for Biofuels , v. 11, p. 84, 2018.

• DE PAULA, R.G. ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; RIBEIRO, LILIANE FRAGA COSTA ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES ; SILVA, ALINNE COSTA ; ZERBINI, MARIANA TAÍSE ; PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS ; COSTA, MARIANA DO NASCIMENTO ; SILVA, R. N. . New Genomic Approaches to Enhance Biomass Degradation by the Industrial Fungus Trichoderma reesei. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS (ONLINE) , v. 2018, p. 1-17, 2018.

• DE PAULA, RENATO GRACIANO ; ANTONIÊTO, AMANDA CRISTINA CAMPOS ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; PERES, NALU TEIXEIRA AGUIAR ; MARTINEZ-ROSSI, NILCE MARIA ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO . The Duality of the MAPK Signaling Pathway in the Control of Metabolic Processes and Cellulase Production in Trichoderma reesei. Scientific Reports , v. 8, p. 14931, 2018.

• ORNELAS, ALICE MARIA DE M. ; DE PAULA, RENATO G. ; MORAIS, ENYARA R. ; MAGALHÃES, LIZANDRA G. ; DA SILVA, ANNIELLE M. B. ; GOMES, MATHEUS S. ; DE CASTRO-BORGES, WILLIAM ; RODRIGUES, VANDERLEI . Molecular characterization of transport lectin vesicular integral membrane protein 36 kDa (VIP36) in the life cycle of Schistosoma mansoni. PARASITOLOGY RESEARCH , v. 24, p. 1-9, 2017.

• MORAIS, ENYARA R. ; OLIVEIRA, KATIA C. ; PAULA, RENATO G. DE ; ORNELAS, ALICE M. M. ; MOREIRA, ÉRIKA B. C. ; BADOCO, FERNANDA RAFACHO ; MAGALHÃES, LIZANDRA G. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO ; RODRIGUES, VANDERLEI . Effects of proteasome inhibitor MG-132 on the parasite Schistosoma mansoni. PLoS One , v. 12, p. e0184192, 2017.

• DOS SANTOS CASTRO, LILIAN ; DE PAULA, RENATO G. ; ANTONIÊTO, AMANDA C. C. ; PERSINOTI, GABRIELA F. ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; SILVA, ROBERTO N. . Understanding the Role of the Master Regulator XYR1 in Trichoderma reesei by Global Transcriptional Analysis. Frontiers in Microbiology (Online) , v. 7, p. 1, 2016.

• GUPTA, VIJAI KUMAR ; Steindorff, Andrei Stecca ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; MACH-AIGNER, ASTRID R. ; MACH, ROBERT L. ; SILVA, ROBERTO N. . The Post-genomic Era of Trichoderma reesei: What's Next?. Trends in Biotechnology (Regular ed.) , v. 6, p. 1, 2016.

• MAGALHÃES, LIZANDRA G. ; LIMA, THAIS C. ; DE PAULA, RENATO G. ; MORAIS, ENYARA R. ; AGUIAR, DANIELA P. ; GARDINASSI, LUIZ G. ; GARCIA, GUSTAVO R. ; LAURENTIZ, ROSANGELA S. ; RODRIGUES, VANDERLEI ; BASTOS, JAIRO K. ; FILHO, ADEMAR A.S. ; YATSUDA, ANA P. ; CUNHA, WILSON R. ; SILVA, MÁRCIO L.A. . Effects of (−)-6,6--dinitrohinokinin on adult worms of Schistosoma mansoni: a proteomic analyses. Revista Brasileira de Farmacognosia (Impresso) , v. 26, p. 334-341, 2016.

• DE PAULA AGUIAR, DANIELA ; BRUNETTO MOREIRA MOSCARDINI, MAYARA ; REZENDE MORAIS, ENYARA ; GRACIANO DE PAULA, RENATO ; FERREIRA, PEDRO MANUEL ; AFONSO, ANA ; BELO, SILVANA ; TOMIE OUCHIDA, AMANDA ; CURTI, CARLOS ; CUNHA, WILSON ROBERTO ; RODRIGUES, VANDERLEI ; MAGALHÃES, LIZANDRA GUIDI . Curcumin Generates Oxidative Stress and Induces Apoptosis in Adult Schistosoma mansoni Worms. Plos One , v. 11, p. e0167135, 2016.

• DE PAULA, RENATO GRACIANO ; DE MAGALHÃES ORNELAS, ALICE MARIA ; MORAIS, ENYARA REZENDE ; DE SOUZA GOMES, MATHEUS ; DE PAULA AGUIAR, DANIELA ; MAGALHÃES, LIZANDRA GUIDI ; RODRIGUES, VANDERLEI . Proteasome stress responses in Schistosoma mansoni. Parasitology Research (1987. Print) , v. 114, p. 1747-1760, 2015.

• NOGUEIRA, KAROLINE MARIA VIEIRA ; COSTA, MARIANA DO NASCIMENTO ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; MENDONÇA-NATIVIDADE, FLÁVIA COSTA ; RICCI-AZEVEDO, RAFAEL ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO . Evidence of cAMP involvement in cellobiohydrolase expression and secretion by Trichoderma reesei in presence of the inducer sophorose. BMC Microbiology (Online) , v. 15, p. 1, 2015.

• GOMES, ERISTON VIEIRA ; COSTA, MARIANA DO NASCIMENTO ; DE PAULA, RENATO GRACIANO ; RICCI DE AZEVEDO, RAFAEL ; DA SILVA, FRANCILENE LOPES ; NORONHA, ELIANE F. ; JOSÉ ULHOA, CIRANO ; NEVES MONTEIRO, VALDIRENE ; ELENA CARDOZA, ROSA ; GUTIÉRREZ, SANTIAGO ; NASCIMENTO SILVA, ROBERTO . The Cerato-Platanin protein Epl-1 from Trichoderma harzianum is involved in mycoparasitism, plant resistance induction and self cell wall protection. Scientific Reports , v. 5, p. 17998, 2015.

• CRISTINA CAMPOS ANTONIETO, AMANDA ; GRACIANO DE PAULA, RENATO ; DOS SANTOS CASTRO, LILIAN ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; FELIX PERSINOTI, GABRIELA ; NASCIMENTO SILVA, ROBERTO . Trichoderma Reesei CRE1-Mediated Carbon Catabolite Repression in Response to Sophorose Through RNA Sequencing Analysis. Current Genomics , v. 17, p. 1-1, 2015.

• MOTA, PAULO ROBERTO DA ; RIBEIRO, MARCELA SURIANI ; GEORG, RAPHAELA DE CASTRO ; SILVA, GABRIELLE ROSA ; PAULA, RENATO GRACCIANO DE ; SILVA, ROBERTO DO NASCIMENTO ; ULHOA, CIRANO JOSE . Expression analysis of the α-1,2-mannosidase from the mycoparasitic fungus Trichoderma harzianum. Biological Control (Print) , v. 95, p. 1, 2015.

• DE PAULA, RENATO GRACIANO ; DE MAGALHÃES ORNELAS, ALICE MARIA ; MORAIS, ENYARA REZENDE ; DE CASTRO BORGES, WILLIAM ; NATALE, MASSIMO ; MAGALHÃES, LIZANDRA GUIDI ; RODRIGUES, VANDERLEI . Biochemical characterization and role of the proteasome in the oxidative stress response of adult Schistosoma mansoni worms. Parasitology Research (1987. Print) , v. 113, p. 2887-2897, 2014.

• CARRARA, V.S. ; VIEIRA, S.C.H. ; DE PAULA, R.G. ; Rodrigues, V. ; MAGALHÃES, L.G. ; CORTEZ, D.A.G. ; DA SILVA FILHO, A.A. . In vitro schistosomicidal effects of aqueous and dichloromethane fractions from leaves and stems of Piper species and the isolation of an active amide from P. amalago L. (Piperaceae). Journal of Helminthology , v. 88, p. 321-326, 2013.

• FERNANDES, FÁBIO DE SOUZA ; REZENDE JÚNIOR, CELSO O. ; FERNANDES, TAYRINE SILVA ; DA SILVEIRA, LÍGIA SOUZA ; REZENDE, CARLOS A. M. ; DE ALMEIDA, MAURO V. ; DE PAULA, RENATO G. ; RODRIGUES, VANDERLEI ; DA SILVA FILHO, ADEMAR A. ; COURI, MARA R. C. . Anthelmintic Effects of Alkylated Diamines and Amino Alcohols against Schistosoma mansoni. BioMed Research International , v. 2013, p. 1-9, 2013.

• DE PAULA, R.G. . Dosagem Proteica: Princípios e Métodos. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um Guia Prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 43-58.

• DE PAULA, R.G. . Zimograma: Uma ferramenta para o estudo da atividade enzimática. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um Guia Prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 91-97.

• PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS ; DE PAULA, R.G. . Eletroforese em gel bidimensional. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um Guia Prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 101-117.

• Ornelas, A. M. M. ; DE PAULA, R.G. ; Morais, E. R. ; MAGALHÃES, L.G. . Extração de RNA e síntese de cDNA. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um Guia Prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 199-210.

• DE PAULA, R.G. ; ARRUDA, L. M. . Reação em Cadeia da Polimerase: Princípios gerais. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um guia prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 211-218.

• DE PAULA, R.G. ; Ornelas, A. M. M. ; Morais, E. R. . PCR em Tempo Real: Fundamentos para a análise de expressão gênica. In: Malson Neilson de Lucena. (Org.). Bioquímica Experimental: Um Guia Prático para Jovens Pesquisadores. 1ed.Rio de Janeiro: Interciência, 2019, v. 1, p. 221-239.

• DE PAULA, R.G. ; CRISTINA CAMPOS ANTONIETO, AMANDA ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO . The Panorama for Biofuels Biotechnology: Present and Future. In: Roberto do Nascimento Silva. (Org.). Mycology: Current and Future Developments - Fungal Biotechnology for Biofuel Production. 1ed.Beijing: Bentham e-books, 2016, v. 1, p. 3-22.

• JUNGER, L.A. ; DE PAULA, R.G. ; FRANK, H. O. ; MARINATO, J. ; NEVES, R.G. ; SANTILIANO, F.C. ; IGNACCHITI, M.D.C ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Caracterização molecular das subunidades Beta2 e Beta7 do complexo proteolítico Proteassoma 20S DE Biomphalaria glabrata. In: Encontro Latino Americano de Iniciação Americano, 2010, São José dos Campos. Encontro Latino Americano de Iniciação Científica - Biodiversidade: Conservação, Preservação e Recuperação., 2010.

• DE PAULA, R.G. ; JUNGER, L.A. ; FRANK, H. O. ; MARINATO, J. ; NEVES, R.G. ; SANTILIANO, F.C. ; IGNACCHITI, M.D.C ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Caracterização molecular das subunidades Alfa2 E Alfa5 do complexo proteolítico Proteassoma 20S DE Biomphalaria glabrata. In: Encontro Latino Americano de Iniciação Científica, 2010, São José dos Campos. Encontro Latino Americano de Iniciação Científica - Biodiversidade: Conservação, Preservação e Recuperação., 2010.

• DE PAULA, R.G. ; FRANK, H. O. ; Mangaravite, E. ; SOUZA, F. B. ; JUNGER, L.A. ; SOARES, T.C.B. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Análise malacológica da presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistosoma mansoni no município de Alegre, Espírito Santo. In: Encontro Latino Americano de Iniciação Científica, 2008, São José dos Campos. Encontro Latino Americano de Iniciação Científica, 2008.

• FRANK, H. O. ; DE PAULA, R.G. ; SOUZA, F. B. ; Sena ; NUNES, E.T. ; OLIVEIRA, M.L. ; SOARES, T.C.B. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Análise malacológica das presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistoma mansoni no distrito de Araraí, município de Alegre, Espírito Santo. In: Encontro Latino Americano de Iniciação Científica, 2008, São José dos Campos. Encontro Latino Americado de Iniciação Científica, 2008.

• ORNELAS, ALICE M. M. ; DE PAULA, R.G. ; MAGALHÃES, L.G. ; Rodrigues, V. . Characterization of gene expression of VIP36 in the development stages and its possible role in oogenesis of Schistosoma mansoni. In: 13 International Symposium on Schistosomiasis, 2012, Belo Horizonte. 13 International Symposium on Schistosomiasis, 2012.

• DE PAULA, R.G. ; Ornelas, A. M. M. ; Morais, E. R. ; Magalhães, L. G. ; Rodrigues, V. . Protein Expression Profile of Schistosoma mansoni adult worms in response to oxidative stress. In: 13º International Symposium on Schistosomiasis, 2012, Belo Horizonte. 13º International Symposium on Schistosomiasis, 2012.

• Mangaravite, E. ; ARAUJO, I.B.B.A. ; DE PAULA, R.G. ; NOGUEIRA, E.U. ; BERTULOSO, B.D. ; LIMA, A.B.P. . Efeito da concentração salina e do fotoperíodo sob a germinação in vitro de sementes de Pitcairnia flammea (Bromeliaceae). In: XVII Congresso Brasileiro de Floricultura e Plantas Ornamentais e IV Congresso Brasileiro de Cultura de Tecidos de Plantas, 2009, Aracaju. Anais de IV Congresso Brasileiro de Cultura de Tecidos de Plantas, 2009.

• DE PAULA, R.G. ; Martins-Silva, C ; COITINHO, J. B. . Genômica Funcional para Identificação de Fatores Regulatórios Envolvidos na Biossíntese de Metabólitos Secundários pelo Fungo Filamentoso Trichoderma reesei. 2025. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• AZEVEDO, D. B. L. ; Simon, T.A. ; SILVA, R. A. L. ; VICTORIA, C. S. ; MARTINS-SANTANA, LEONARDO ; COITINHO, J. B. ; DE PAULA, R.G. . Calcium Signaling in Trichoderma reesei: Unlocking the Secrets of Secondary Metabolite Biosynthesis. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Simon, T.A. ; AZEVEDO, D. B. L. ; SILVA, R. A. L. ; VICTORIA, C. S. ; MAUÉS, DAVID BATISTA ; SILVA, R. N. ; COITINHO, J. B. ; DE PAULA, R.G. . Exploring MAPK-Mediated Regulation of Secondary Metabolite Biosynthesis in Trichoderma reesei: A Step Toward Metabolic Engineering. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, R. A. L. ; Simon, T.A. ; VICTORIA, C. S. ; AZEVEDO, D. B. L. ; COITINHO, J. B. ; DE PAULA, R.G. . The biosynthesis of polyketides, terpenes, and non-ribosomal peptides is regulated in a carbon source-dependent manner in the filamentous fungus Trichoderma reesei. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PAIVA, A. P. P. ; SOUZA, A. R. ; DE PAULA, R.G. ; COITINHO, J. B. . The Non-Conventional Food Plant (PANC) Xanthosoma sagittifolium (L.) Schott (Taioba) as a Source of Lectins with Antitumor Potential. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, R.G. . Biossíntese, regulação e aplicação biotecnológica de metabólitos secundários de fungos filamentosos. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; AZEVEDO, D. B. L. ; Simon, T.A. ; SILVA, R. A. L. ; VICTORIA, C. S. ; MARTINS-SANTANA, LEONARDO . Biossíntese de Policetídeos é Transcricionalmente Regulada pela Via de Sinalização de Cálcio no Fungo Filamentoso Trichoderma reesei. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA, R. A. L. ; Simon, T.A. ; VICTORIA, C. S. ; DE PAULA, R.G. . Análise transcriptômica de fatores regulatórios envolvidos no controle da expressão de cluster gênicos para biossíntese de metabólitos secundários em Trichoderma reesei após cultivo em celulose e glicose. 2023. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Simon, T.A. ; SILVA, R. A. L. ; VICTORIA, C. S. ; DE PAULA, R.G. . O papel regulatório da via de sinalização MAPK no controle da expressão de genes para biossíntese de metabólitos secundários em Trichoderma reesei. 2023. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• DE PAULA, R.G. ; MAGALHÃES, L.G. . Estudos moleculares e bioquímicos em Trichoderma reesei. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; Lucena, M. N. . Biochemical and Molecular Studies on Trichoderma reesei. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; SANTANA, L. M. ; LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES ; SILVA, ROBERTO N. ; SILVA-ROCHA, RAFAEL . Unraveling transcriptional regulation networks in Trichoderma reesei through bioinformatics approaches. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SANTANA, L. M. ; NORA, L. C. ; DE PAULA, R.G. ; SILVA, R. N. ; SILVA-ROCHA, RAFAEL . UNDERSTANDING TRICHODERMA REESEI TRANSCRIPTIONAL REGULATION THROUGH SYNTHETIC PROMOTERS AND NEW CIS-REGULATORY ELEMENTS. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, R.G. . Global transcriptome and gene regulation network of MAPK signaling pathway in Trichoderma reesei. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. . Global transcriptome and gene regulation network of MAPK signaling pathway in Trichoderma reesei. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. . Vírus. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. . Estudos bioquímicos e moleculares com o gênero Trichoderma. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. . Schistosoma mansoni: desenvolvimento versus Sistema Ubiquitina Proteassoma. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; Rodrigues, V. ; Morais, E. R. ; Magalhães, L. G. ; Ornelas, A. M. M. . In vitro response of adult worms from S. mansoni to oxidative stress. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• DE PAULA, R.G. ; Rodrigues, V. ; Morais, E. R. ; Magalhães, L. G. ; Ornelas, A. M. M. . Protein Expression Profile of Schistosoma mansoni adult worms in response to oxidative stress. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Ornelas, A. M. M. ; DE PAULA, R.G. ; MORAIS, ENYARA R. ; MAGALHÃES, L.G. ; Rodrigues, V. . Importance of vesicular integral-membrane protein (VIP36) in the cycle life of Schistosoma mansoni. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• ORNELAS, ALICE M. M. ; DE PAULA, R.G. ; MORAIS, ENYARA R. ; MAGALHÃES, L.G. ; Rodrigues, V. . Characterization of Gene Expression of VIP36 in the Development Stages and its Possible Role In Oogenesis of Schistoma mansoni. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• ORNELAS, ALICE M. M. ; DE PAULA, R.G. ; MORAIS, ENYARA R. ; MAGALHÃES, L.G. ; Rodrigues, V. . Characterization of Gene Expression of Vesicular Integral-Membrane Protein 36 kDa (VIP36) in the Development Stages and its Possible Role In Oogenesis of Schistoma mansoni. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• DE PAULA, R.G. . Schistosoma mansoni: Importância da via Ubiquitina-Proteassoma. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. ; IGNACCHITI, M.D.C . Caracterização Molecular das Subunidades Alfa2 e Alfa5 do Complexo Proteolítico Proteassoma 20S de Biomphalaria glabrata. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• DE PAULA, R.G. . Levantamento malacológico do distrito de Anutiba na região sul do estado do Espírito Santo e classificação molecular de Biomphalaria sp.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• DE PAULA, R.G. ; FRANK, H. O. ; MARINATO, J. ; NEVES, R.G. ; SANTILIANO, F.C. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. ; IGNACCHITI, M.D.C . Caracterização Molecular das Subunidades Beta2 e Beta7 do Complexo Proteolítico Proteassoma 20S de Biomphalaria glabrata. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, R.G. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. ; IGNACCHITI, M.D.C ; MARTINS, I. V. F. . Levantamento malacológico do Distrito de Anutiba na região sul do Espírito Santo e classificação molecular de Biomphalaria sp.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Mangaravite, E. ; ARAUJO, I.B.B.A. ; DE PAULA, R.G. ; NOGUEIRA, E.U. ; BERTULOSO, B.D. ; LIMA, A.B.P. . Efeito da concentração salina e do fotoperíodo sob a germinação in vitro de sementes de Pitcairnia flammea (Bromeliaceae). 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, R.G. ; SOUZA, F. B. ; FRANK, H. O. ; Mangaravite, E. . ESQUISTOSSOMOSE, XISTOSE, BARRIGA D´ÁGUA OU DOENÇA DO CARAMUJO. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DE PAULA, R.G. ; FRANK, H. O. ; Mangaravite, E. ; JUNGER, L.A. ; SOUZA, M.F. ; OLIVEIRA, M.L. ; VAZ-TOSTES, M.G. ; SOARES, T.C.B. ; DE PAULA, H. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Análise malacológica da presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistosoma mansoni no município de Alegre, Espírito Santo. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FRANK, H. O. ; DE PAULA, R.G. ; SOUZA, F. B. ; Sena ; NUNES, E.T. ; OLIVEIRA, M.L. ; VAZ-TOSTES, M.G. ; SOARES, T.C.B. ; DE PAULA, H. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Análise malacológica da presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistosoma mansoni no distrito de Araraí, município de Alegre, Espírito Santo. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DE PAULA, R.G. ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . Análise da presença de caramujos do gênero Biomphalaria infectados ou não com o parasito Schistosoma mansoni no distrito de Anutiba, município de Alegre, Espírito Santo, e ações para minimizar o efeito desta parasitose. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Mangaravite, E. ; SOUZA, F. B. ; DE PAULA, R.G. ; FRANK, H. O. ; Sena ; PEREIRA JUNIOR, O. S. . ESQUISTOSSOMOSE, XISTOSE, BARRIGA D'ÁGUA OU DOENÇA DO CARAMUJO. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Estudos funcionais para produção, identificação e caracterização estrutural de peptídeos bioativos produzidos por fungos de interesse biotecnológico, Descrição: Os fungos filamentosos são organismos com ampla diversidade biológica capazes de produzir metabólitos secundários (SMs) importantes à saúde humana. Neste contexto, pequenos peptídeos bioativos como os peptaibols produzidos por fungos filamentosos têm despertado grande interesse biotecnológico devido às suas atividades antibacteriana, anti-helmíntica, antifúngica e antitumoral. Embora peptídeos bioativos já tenham sido isolados, a produção destas moléculas é muito baixa o que dificulta os estudos de caracterização estrutural e funcional. Além disso, ainda é pouco compreendido quais são os fatores e mecanismos moleculares envolvidos na sua biossíntese, e faltam estudos de caracterização da estrutura química e funcionais para determinar a atividade biológica destas moléculas. O objetivo dessa proposta é o desenvolvimento de um protocolo experimental para purificar, identificar e caracterizar estrutural- e funcionalmente os peptídeos bioativos produzidos por fungos filamentosos estabelecendo condições ótimas de produção dessas moléculas. Para isso, linhagens fúngicas isoladas de diversos ambientes capixabas serão cultivadas em diferentes fontes de carbono e a identificação, a purificação e a caracterização química dos peptídeos bioativos no sobrenadante das culturas será realizada por cromatografia líquida de alta performance, espectrometria de massas, dicroísmo circular e ressonância magnética nuclear. O potencial biotecnológico destas moléculas isoladas será avaliado pela atividade citotóxica (antibacteriana, antifúngica e antitumoral). Desta forma, os dados gerados contribuirão para melhor compreensão da intricada rede metabólica envolvida na produção dessas moléculas e para o desenvolvimento de linhagens superprodutoras de peptídeos bioativos. Ainda servirão de base para estudos que relacionem as propriedades químicas dos peptaibols com seu efeito citotóxico, abrindo possibilidades para o desenvolvimento de produtos biotecnológicos, especialmente, fármacos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Juliana Barbosa Coitinho Gonçalves - Integrante.

• 2024 - Atual

  Diversidade microbiana e potencial biotecnológico dos manguezais do estado do Espírito Santo, Descrição: A bioprospecção é uma abordagem muito eficiente para a identificação e caracterização de novos microrganismos e seus produtos. É uma técnica relevante principalmente do ponto de vista econômico e gera grandes investimentos financeiros na utilização de moléculas de origem microbiológica como arcabouço estrutural para o desenvolvimento de novos fármacos. Neste contexto, a exploração de ecossistemas como os manguezais é uma grande oportunidade para a descoberta de biomoléculas com enorme potencial biotecnológico. Isso porque os manguezais fornecem ambientes únicos que conectam terra e mar e sustentam ecossistemas contendo uma variedade de organismos e microrganismos que se interdependem. Esses ecossistemas de manguezais são fonte de biomoléculas com enorme valor econômico para a indústria, para a agricultura e para a medicina uma vez que são encontradas atividades biológicas diversas como de degradação de poluentes, de biomassa, atividades antimicrobianas e citotóxicas.Por meio de abordagens microbiológicas, bioquímicas, genéticas e moleculares, o objetivo desta proposta é identificar atividades biológicas interessantes visando a identificação e caracterização de microrganismos (bactérias e fungos leveduriformes e filamentosos) oriundos de manguezais do Espírito Santo intactos e submetidos à poluição ambiental . Além disso, após o isolamento e identificação desses microrganismos, será possível investigar o seu potencial para produção de biomoléculas ativas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Juliana Barbosa Coitinho Gonçalves - Coordenador / Cristina Martins e Silva - Integrante / Suely Gomes de Figueiredo - Integrante.

• 2024 - Atual

  Evaluation of the antifungal potential of silver nanoparticles (AgNPs) and secondary metabolites (SMs) produced by Trichoderma reesei against clinically pathogenic fungi with multi-resistance to antifungals, Descrição: The fungusTrichoderma reesei , commonly used in enzyme production, is now being explored for its bioactive secondary metabolites (SMs) and silver nanoparticles (AgNPs) with various activities, including hormonal, antibiotic, and antitumor effects. Our research has shown that non cytotoxic doses of AgNPs can reduce pathogenic fungus viability by 60 after 48 hours in liquid culture. With the rise of new bacterial targets, evolving infectious diseases, antibiotic resistance, and the toxicity of some antibiotics, there's growing interest in new bioactive molecules. Thus, our proposal aims to develop a protocol to identify and characterize the antifungal effects of AgNPs and SMs from T. reesei against multi resistant strains of A. fumigatus, C. auris, and T. rubrum , prevalent i n immunocompromised individuals.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Roberto do Nascimento Silva - Integrante / PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS - Integrante.

• 2023 - Atual

  Efeito da ciclagem de peso e da compulsão alimentar em parâmetros dos tipos ansiogênico e compulsivo em camundongos fêmeas e suas interferências no metabolismo lipídido, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Cristina Martins e Silva - Coordenador / Magno Silva Gomes - Integrante / Nathalia Barcelos da Silva - Integrante.

• 2022 - 2025

  Genômica Funcional para Identificação de Fatores Regulatórios Envolvidos na Biossíntese de Metabólitos Secundários pelo Fungo Filamentoso Trichoderma reesei, Descrição: Os fungos são organismos com ampla diversidade biológica, existindo aproximadamente 1,5 milhões de espécies, com apenas 7 dessas formalmente classificadas. Podem ser encontrados em associação simbiótica com plantas favorecendo a obtenção de nutrientes, causando alterações fisiológicas que promovem melhoria na resistência aos patógenos e estresse abiótico, na aquisição de fontes de nitrogênio e também na eficiência fotossintética. Além disso, diversas espécies são utilizadas na agricultura, como agente de controle biológico e mediadores capazes de beneficiar o meio ambiente através da biorremediação de metais pesados e outros poluentes ambientais ou produzir metabólitos secundários de importância clínica. Nesse contexto, os fungos filamentosos despertam grande interesse por produzirem enzimas hidrolíticas importantes para a indústria alimentícia, farmacêutica, têxtil e biotecnológica. Vários estudos têm demonstrado o uso desses microrganismos para a produção de proteínas recombinantes e moléculas com atividades hormonais, antibióticas, antitumorais, antifúngicas, citotóxicas, antivirais, imunossupressoras e antiparasitárias. Logo, a exploração dos microrganismos como fonte de substâncias biologicamente ativas, com ênfase, na busca de novas substâncias com atividade antimicrobiana vêm crescendo continuamente. O surgimento de novos alvos bacterianos, a evolução das doenças infecciosas, a resistência aos antibióticos e a toxicidade de alguns antibióticos em uso clínico são alguns dos fatores que têm despertado o interesse à identificação de novas classes de moléculas bioativas. Os metabólitos secundários microbianos (SMs) são moléculas de baixo peso molecular com estruturas químicas diversas formadas durante a fase tardia de crescimento microbiano, não essenciais para o desenvolvimento do microrganismo, no entanto, sendo muito importantes à saúde humana. A síntese de SMs é controlada por uma complexa rede regulatória que involve diferentes proteínas e complexos que respondem para vários estímulos ambientais. Ao nível transcricional, a síntese de SMs é controlada em diferentes níveis por fatores de transcrição globais ou via-específicos, por regulação epigenética e pela ação de vias de sinalização intracelular. Alguns estudos têm revelado que existe uma conexão direta entre vias de sinalização e a produção de moléculas bioativas específicas. No entanto, a maioria desses estudos focou apenas em dados de expressão gênica, sendo poucos resultados validados por meio de análise metabolômica. Sendo assim, o objetivo deste trabalho é entender o envolvimento de diferentes vias de sinalização na regulação da produção de metabólitos secundários de interesse biotecnológico no fungo filamentoso Trichoderma reesei. Para isso, linhagens mutantes para genes de diferentes vias de sinalização do fungo T. reesei serão cultivadas na presença de diferentes fontes de carbono e o sobrenadante de cultura será utilizado para identificação de SMs através de cromatografia líquida de alta performance acoplada à espectometria de massa (LC-MS/MS). Além disso, será realizada análise de expressão gênica para identificação de fatores de transcrição e genes de remodelamento de cromatina relacionados à expressão de clusters gênicos envolvidos na biossíntese de SMs. Desta forma, a elucidação dos mecanismos moleculares regulatórios envolvidos na biossíntese de SMs não só permitirá uma visão mais ampla dessa intrincada rede de regulação metabólica, como também contribuirá para a identificação de novos SMs e engenharia genética para obtenção de linhagens superprodutoras de SMs para aplicação biotecnológica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Roberto do Nascimento Silva - Integrante / Juliana Barbosa Coitinho - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Espírito Santo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2020 - Atual

  Estudos bioquímicos e de sinalização celular em fungos filamentosos com aplicação biotecnológica, Descrição: Os fungos são organismos com ampla diversidade biológica e estima-se que existem cerca de 1,5 milhões de espécies, com apenas 5 destas formalmente classificadas. Esses organismos são extremamente importantes e utilizados na produção de alimentos, como produtos fermentados e bebidas alcoólicas, contribuem na indústria farmacêutica, estão presentes no processo de biodegradação e tratamento biológico de efluentes, na produção de enzimas de interesse industrial, biotecnológico e na biotransformação. Eles também são de grande importância agrícola e ecológica, pois mantém o equilíbrio do ambiente, decompondo restos vegetais, degradando substâncias tóxicas, auxiliando as plantas a crescerem e se protegerem contra inimigos, como outros microrganismos patogênicos. Dentre esses, os fungos filamentosos apresentam grande interesse biotecnológico por produzirem enzimas extracelulares, holocelulases, capazes de degradar a parede celular vegetal e promover liberação de açúcares que serão utilizados no processo de fermentação para produção de bioetanol. Dentre as enzimas holocelulolíticas, as xilanases, possuem um grande potencial em várias aplicações na área da biotecnologia e o interesse nessas enzimas aumentou muito devido ao seu uso em processos de branqueamento da polpa de papel, com processos que dispensam a utilização do cloro, reduzindo assim poluição ambiental por causa, dos organoclorados produzidos. A aplicação de xilanases em indústrias alimentícias é muito ampla, com atuação progressiva em associação com as celulases e pectinases, promovendo a hidrólise de componentes da parede celular e diminuição da viscosidade e a clarificação dos sucos de frutas, a liberação de xilose e xilitol para obtenção de etanol e adoçante, respectivamente. Em panificações, essas enzimas promovem a hidrólise de arabinoxilanas, facilitando a redistribuição da água na massa, favorecendo seu volume, textura e estabilidade, com considerável aumento no valor nutritivo do alimento. Na indústria vinícola, as xilanases são utilizadas na hidrólise da parede celular das uvas, facilitando a maceração de sua casca, a clarificação e aumento da qualidade e estabilidade do vinho. Na indústria têxtil também existe a utilização das xilanases no processamento de fibras vegetais e, na indústria de rações para animais, a utilização de xilanases aumenta o valor nutritivo da dieta, devido a melhor digestão e absorção dos componentes das rações. Vários estudos têm demonstrado que fungos filamentosos pertencentes ao gênero Aspergillus, têm sido utilizados com muito sucesso para a produção de proteínas recombinantes como glicoamilase, quimiosina bovina, lactoferrina humana, interleucina-6 humana, dentre outras. A espécie A. terreus, e algumas outras espécies de Penicillium, Hypomyces, Doratomyces, Phoma, Eupenicillium, Gymnoascus e Trichoderma são utilizadas para produção de lovastatina, um inibidor que revolucionou o tratamento da hipercolesterolemia. Do mesmo modo, a espécie Penicillium chrysogenum responsável pela produção do antibiótico penicilina permitiu grandes avanços na área farmacêutica. Assim, estudos que visam caracterizar o potencial biotecnológico desses organismos podem contribuir para a conservação da biodiversidade nos ecossistemas e favorecer o desenvolvimento de bioprodutos. Deste modo, essa proposta de pesquisa tem por objetivo realizar estudos bioquímicos e de sinalização celular em fungos filamentosos para a caracterização dos mecanismos moleculares envolvidos na regulação da síntese de bioprodutos de interesse biotecnológico. Os resultados obtidos através da caracterização funcional desses fungos permitirá compreender o envolvimento de diferentes vias de sinalização na regulação da expressão de genes relacionados à produção de compostos bioativos em fungos filamentosos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Roberto do Nascimento Silva - Integrante., Número de produções C, T & A: 2

• 2019 - Atual

  Caracterização da via de sinalização dependente de cálcio na regulação da expressão de celulases pelo fungo Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina), Descrição: Resíduos orgânicos provenientes de plantas, denominados de biomassa lignocelulósica, podem ser reaproveitados para a fabricação de biocombustíveis de segunda geração. Para isto é necessária a desconstrução deste material em moléculas mais simples. Enzimas produzidas pelo fungo Trichoderma reesei, como as celulases, possuem esta capacidade, entretanto o processo de obtenção ainda precisa ser otimizado para se tornar viável economicamente. Assim, este projeto tem como objetivo contribuir para o entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos na regulação da expressão dos genes de T. reesei que atuam na desconstrução da biomassa lignocelulósica. Para isto, propomos a caracterização funcional de 5 transportadores de cálcio, envolvidos na via de sinalização dependente de cálcio, que foram identificados previamente pelo grupo durante o cultivo de T. reesei na presença de celulose, soforose e bagaço de cana-de-açúcar. A caracterização será realizada através da construção de linhagens mutantes para cada gene e então a determinação dos efeitos provocados. Os resultados obtidos a partir deste trabalho permitirão a elaboração de um modelo relacionando o papel da via de sinalização dependente de cálcio na regulação da expressão de celulases por T. reesei, possibilitando a identificação de novos alvos para a otimização do processo de degradação de biomassa lignocelulósica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Roberto do Nascimento Silva - Coordenador / Letícia Harumi Oshiquiri - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2017 - 2019

  Identificação e caracterização de vesículas extracelulares produzidas por Trichoderma reesei, Descrição: O Trichoderma reesei é um fungo saprófito envolvido na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Esse fungo apresenta a capacidade de formar e secretar celulases, sendo o fungo industrial mais importante na produção dessas enzimas para produção de bioetanol. A degradação dos componentes da parede lignocelulósica é um processo complexo que requer uma série de proteínas regulatórias para torná-lo mais eficiente e poupar gastos energéticos desnecessários. Este projeto tem como principal objetivo contribuir para o entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no processo de desconstrução da biomassa vegetal por T. reesei através da caracterização de transportadores de cálcio relacionados com a via de sinalização intracelular dependente de cálcio, os quais são diferencialmente expressos mediante indução por celulose, soforose e bagaço de cana de açúcar. Inicialmente, 9 genes de transportadores de cálcio envolvidos com sinalização intracelular dependente de cálcio, anteriormente identificados pelo nosso grupo através de análises in silico de dados de RNA-Seq, foram selecionados de acordo com o nível de expressão gênica em QM4914 durante o cultivo em celulose e soforose e, QM6a em bagaço de cana. Nosso estudo será focado em genômica funcional para caracterização destes transportadores de cálcio de T. reesei e o seu papel na regulação da transcrição e secreção de celulases através de: 1) Construção de linhagens mutantes para cada gene, 2) Determinação da atividade celulolítica e expressão gênica de celulases e genes de vias de sinalização nos mutantes obtidos, 3) Caracterização fenotípica das linhagens mutantes para transportadores de cálcio, 4) Ensaio de tolerância para cálcio dos mutantes submetidos a diferentes concentrações de cálcio, 5) Dosagem de cálcio intracelular, 6) Construção de linhagens retransformantes para os genes alvos, 7) Determinação da localização intracelular dos transportadores de cálcio através de microscopia de fluorescência, 8) Purificação e caracterização das vesículas secretadas de T. reesei na indução por celulose, soforose e bagaço de cana de açúcar e 9) Análise proteômica do conteúdo proteico das vesículas extracelulares de T. reesei. Os resultados obtidos através da caracterização funcional desses transportadores permitirão a construção de um modelo relacionando o seu papel na via de sinalização dependente de cálcio, bem como compreender o envolvimento da via de sinalização de cálcio na secreção e regulação da expressão de genes de celulases pelo fungo T. reesei.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Roberto do Nascimento Silva - Integrante.

• 2017 - Atual

  Caracterização da via de sinalização dependente de cálcio na regulação da expressão e secreção de celulases pelo fungo Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina), Descrição: O Trichoderma reesei é um fungo saprófito envolvido na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Esse fungo apresenta a capacidade de formar e secretar celulases, sendo o fungo industrial mais importante na produção dessas enzimas para produção de bioetanol. A degradação dos componentes da parede lignocelulósica é um processo complexo que requer uma série de proteínas regulatórias para torná-lo mais eficiente e poupar gastos energéticos desnecessários. Este projeto tem como principal objetivo contribuir para o entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no processo de desconstrução da biomassa vegetal por T. reesei através da caracterização de transportadores de cálcio relacionados com a via de sinalização intracelular dependente de cálcio, os quais são diferencialmente expressos mediante indução por celulose, soforose e bagaço de cana de açúcar. Inicialmente, 9 genes de transportadores de cálcio envolvidos com sinalização intracelular dependente de cálcio, anteriormente identificados pelo nosso grupo através de análises in silico de dados de RNA-Seq, foram selecionados de acordo com o nível de expressão gênica em QM4914 durante o cultivo em celulose e soforose e, QM6a em bagaço de cana. Nosso estudo será focado em genômica funcional para caracterização destes transportadores de cálcio de T. reesei e o seu papel na regulação da transcrição e secreção de celulases através de: 1) Construção de linhagens mutantes para cada gene, 2) Determinação da atividade celulolítica e expressão gênica de celulases e genes de vias de sinalização nos mutantes obtidos, 3) Caracterização fenotípica das linhagens mutantes para transportadores de cálcio, 4) Ensaio de tolerância para cálcio dos mutantes submetidos a diferentes concentrações de cálcio, 5) Dosagem de cálcio intracelular, 6) Construção de linhagens retransformantes para os genes alvos, 7) Determinação da localização intracelular dos transportadores de cálcio através de microscopia de fluorescência, 8) Purificação e caracterização das vesículas secretadas de T. reesei na indução por celulose, soforose e bagaço de cana de açúcar e 9) Análise proteômica do conteúdo proteico das vesículas extracelulares de T. reesei. Os resultados obtidos através da caracterização funcional desses transportadores permitirão a construção de um modelo relacionando o seu papel na via de sinalização dependente de cálcio, bem como compreender o envolvimento da via de sinalização de cálcio na secreção e regulação da expressão de genes de celulases pelo fungo T. reesei.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Roberto do Nascimento Silva - Integrante.

• 2016 - 2018

  Caracterização funcional da xiloglucanase (CEL74A) de Trichoderma reesei na degradação de bagaço de cana-de-açúcar, Descrição: No presente trabalho foi realizado a construção de uma linhagem mutante para o gene cel74a (codificando para uma xiloglucanase) e a caracterização funcional de CEL74A na regulação gênica de holocelulases durante o cultivo em bagaço de cana-de-açúcar. Os nossos resultados mostraram que deleção de cel74a possivelmente pode estar envolvida no sinergismo da regulação da expressão de holocelulases durante o cultivo em bagaço de cana-de-açúcar. A partir da análise do perfil de expressão gênica, foi possível observar a redução na expressão de todos os genes de celulases testados (cel7a, cel7b e cel6a) embora não tenha afetado a atividade enzimática, ao passo que as hemicelulases (xyn1 e xyn2) apresentaram aumento tanto na expressão quanto na atividade enzimática. Na linhagem Δcel74a, foi observado redução na liberação de glicose, xilose e galactose após a hidrólise de xiloglucano. Além disso, a atividade de CEL74A foi modulada na presença de cálcio e pode ser necessária para a atuação mais eficiente de outras enzimas envolvidas na degradação de xiloglucano. Desta forma, em T. reesei, CEL74A apresenta um papel importante tanto na regulação de genes holocelulolíticos quanto para a degradação eficiente de bagaço de cana-de-açúcar, contribuindo para a elucidação de mecanismos pelos quais este fungo utiliza para a utilização do bagaço de cana-de-açúcar como fonte de carbono.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Roberto do Nascimento Silva - Coordenador / LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN BORGES - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2013 - 2017

  Caracterização da via de sinalização dependente de MAPK na regulação da expressão de celulases pelo fungo Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina), Descrição: O fungo filamentoso Trichoderma reesei é um saprófito envolvido na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Esse fungo apresenta a capacidade de formar e secretar celulases, sendo o mais importante produtor dessas enzimas para produção de bioetanol em escala industrial. A regulação da expressão de celulases é controlada a nível transcricional e de maneira dependente da fonte de carbono. No entanto, as vias de sinalização e os mecanismos envolvidos na regulação da expressão dessas enzimas em T. reesei ainda são pouco conhecidos. Neste trabalho, nós demonstramos através de caracterização funcional e análise transcricional por RNA-Seq as principais alterações na expressão gênica que ocorrem em mutantes funcionais para dois genes da via de sinalização dependente de MAPK, Δtmk1 e Δtmk2. Os resultados obtidos permitiram identificar que as proteínas TMK1 e TMK2, em T. reesei, regulam processos independentes e às vezes podem regular um mesmo processo, no entanto, através de mecanismos de ação diferentes que permitem a modulação da expressão gênica nesse organismo. Em relação a linhagem Δtmk2, foi demonstrado que o crescimento em bagaço de cana de açúcar e glicose, regula negativamente e positivamente, respectivamente, a transcrição de genes de celulase, diminui a expressão genes envolvidos com remodelamento da cromatina, além de alterar o perfil de expressão de genes envolvidos no metabolismo de carboidratos, aminoácidos, lipídios, metabólitos secundários e genes de sinalização celular tais como GPCR, fosfolipase A, B e D. Por outro lado, a deleção da MAPK TMK1 promove alterações mais discretas no perfil transcricional da linhagem Δtmk1, e as principais mudanças estão relacionadas com a diminuição na expressão dos principais genes de celulases e xilanases, repressão da a expressão de transportadores pertencentes à família MFS, transportadores de aminoácidos e íons como Ca2+ e Mg2+. Os nossos resultados revelaram que a via de sinalização das MAPKs em T. reesei regula muitos eventos importantes que permitem ao fungo promover o reconhecimento, o transporte e o metabolismo de diferentes fontes de carbono durante o processo de degradação da parede celular de plantas. Sendo assim, o agrupamento desses dados permitirá a construção de um modelo global dos eventos que ocorrem durante degradação da lignocelulose em T. reesei, o que irá possibilitar a construção de linhagens mais eficientes na degradação de biomassa vegetal.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Roberto do Nascimento Silva - Coordenador.

• 2011 - 2013

  Schistosoma mansoni: Caracterização do Perfil de Resposta aos estresses oxidativo, térmico e químico, Descrição: O sistema ubiquitina- proteassoma é importante para manter a homeostase proteica durante o estresse celular. Inibidores do proteassoma podem interferir em processos como crescimento, progressão do ciclo celular e replicação, e os seus efeitos vem sendo caracterizados em muitos parasitos. Nosso laboratório demonstrou que MG132 reduz o número de esquistossômulos, a carga parasitária e a ovoposição em camundongos infectados com S. mansoni. Neste trabalho, são descritos os efeitos in vitro do estresse oxidativo, choque térmico e estresse químico em vermes adultos de S. mansoni. Observou-se alteração no perfil de expressão proteica durante estresse oxidativo e térmico, sendo identificadas dezoito proteínas upreguladas nestas condições. Estas proteínas estão envolvidas em muitas vias intracelulares como dobramento de proteínas, proteólise, ligação a íons cálcio, regulação de proteínas e resposta a estresse. Além disso, o estresse oxidativo gerou mudanças em vermes adultos de S. mansoni em processos como produção de ovos, motilidade, morfologia do tegumento, viabilidade e pareamento dos vermes. O estresse químico induzido com Curcumina, IBMX e MG132 aumentou a produção de ROS intracelular e alterou o perfil de expressão de enzimas antioxidantes em S. mansoni. As enzimas SmGPx1 e SmPGx2 tiveram a expressão aumentada no estresse com Curcumina e IBMX, enquanto que SmSOD e SmTGR foram induzidas no estresse com Curcumina. As enzimas do proteassoma SmHul5 e SmUbp6 tiveram a expressão modulada durante o estresse oxidativo, choque térmico e estresse químico. Em adição, a análise de expressão no ciclo de vida de S. mansoni revelou que estes genes apresentam um nível alto de expressão em esporocistos, esquistossômulos e miracídios. Estes resultados sugerem que estas proteínas acessórias do proteassoma participam da resposta ao estresse e desenvolvimento do parasito. O nível de expressão de SmHul5 e SmUbp6 foi cerca 9 e 16 vezes menor em relação ao controle no estresse químico induzido com IBMX, respectivamente, sugerindo a desmontagem do proteassoma. Por outro lado, Curcumina, MG132, estresse oxidativo e choque térmico aumentaram o nível de expressão de SmHul5 e SmUbp6. Além disso, o nível de expressão da proteína de maturação do proteassoma (SmPOMP) aumentou no estresse com Curcumina, MG132 e estresse oxidativo, sugerindo a síntese de novas populações de proteassoma. Em relação ao estresse oxidativo, nós demonstramos o aumento no nível proteico de proteassoma 20S e da subunidade alfa-3 do proteassoma sugerindo que em S. mansoni as proteínas oxidadas são degradadas pelo proteassoma 20S. Além do mais, nós observamos que vermes adultos de S. mansoni parecem utilizar mecanismos de resposta similares para diferentes estresses. Nossos resultados demonstraram que o estresse oxidativo, choque térmico e estresse químico modificam o perfil de expressão de genes relacionados ao sistema ubiquitina-proteassoma e sugerem que o proteassoma é importante para as respostas celulares ao estresse neste parasito.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Vanderlei Rodrigues - Integrante / Enyara Rezende Morais - Integrante / Lizandra Guidi Magalhães - Integrante / Alice Maria de Magalhães Ornelas - Integrante.

• 2009 - 2010

  Caracterização molecular das subunidades Beta2 e Beta7 do complexo proteolítico Proteassoma 20S de Biomphalaria glabrata, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Integrante / Mariana Drummond Costa Ignacchiti - Integrante / Leonardo Alvarez Junger - Coordenador.

• 2009 - 2010

  Caracterização molecular das subunidades Alfa2 e Alfa5 do complexo proteolítico proteassoma 20S de Biomphalaria glabrata, Descrição: Apesar de todos os avanços no conhecimento da biologia dos hospedeiros intermediários para o parasito Schistosoma mansoni, muitos aspectos da interação parasito-hospedeiro ainda estão por ser elucidados. O complexo proteolítico proteassoma 26S apresenta diversas funções em processos biológicos e a sua caracterização molecular pode contribuir para o entendimento dessa interação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Integrante / Mariana Drummond Costa Ignacchiti - Integrante.

• 2008 - 2009

  Métodos moleculares aplicados à classificação de moluscos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários do parasito Schistosoma mansoni, coletados no município de Alegre/ES, Descrição: Aluno voluntário. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Integrante / Érica Mangaravite - Coordenador / Franciele Barros de Souza - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Integrante / Leonardo Alvarez Junger - Integrante.

• 2007 - 2008

  Análise malacológica das presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistoma mansoni no distrito de Anutiba, município de Alegre, Espírito Santo e ações para minimizar o efeito desta parasitose, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Integrante / Érica Mangaravite - Integrante / Franciele Barros de Souza - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Integrante.

• 2007 - 2008

  Análise malacológica das presença de caramujos do gênero Biomphalaria, hospedeiros intermediários para o parasito Schistoma mansoni no distrito de Araraí, município de Alegre, Espírito Santo, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Integrante / Érica Mangaravite - Integrante / Franciele Barros de Souza - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Coordenador.

• 2006 - 2006

  Identificação de Caramujos do Biomphalaria, infectados ou não com Schistosoma mansoni, em municípios do sul do Estado do Espírito Santo, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Integrante / Olavo dos Santos Pereira Júnior - Coordenador / Érica Mangaravite - Integrante / Franciele Barros de Souza - Integrante / Henrique Oliveira Frank - Integrante.

Projetos de desenvolvimento

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2011 - Atual

  Perfil Proteômico de vermes adultos de Schistosoma mansoni tratados com Lactacistina e análise de expressão da enzimas Hul5 e Ubp6, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Renato Graciano de Paula - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.