LUÍS RICARDO RIBEIRO DA SILVA

Formação complementar

Áreas de atuação

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas, Descrição: Ostariophysi é uma das maiores superordens de peixes, formada quase exclusivamente por espécies de água-doce, com cerca de 95 famílias, cerca de 1.500 gêneros e 11.000 espécies, contendo assim, aproximadamente, 30 das espécies de peixes conhecidas no mundo e quase 70 das espécies de água doce. Os Ostariophysi estão presentes em todo o mundo, exceto na Antártica, de onde são conhecidos apenas fósseis. Apesar da grande riqueza de espécies e, portanto, sua grande importância científica e econômica, existem ainda muitos problemas na identificação de espécies e no entendimento das relações entre os grupos internos da superordem (e consequentemente na sua classificação), assim como dúvidas nos seus processos de diversificação e biogeografia histórica, que precisam ser abordados com metodologias modernas e resolutivas. Para abordar a questão da identificação molecular de todos exemplares analisados estamos propondo o sequenciamento completo de seus DNAs mitocondriais, o que vai permitir a criação de um grande banco de dados, que poderá ser utilizado futuramente em muitos projetos de DNA barcode (identificação molecular), projetos com objetivos ecológicos (DNA ambiental), de regulação e controle de espécies (DNA forense) e também para elaboração de filogenias mitocondriais. Para abordar as questões sobre as relações entre os grupos (filogenias) e sobre seus processos de diversificação (macroevolução) e biogeografia histórica serão utilizados os marcadores chamados elementos ultraconservados (ultraconserved elements - UCEs). O uso dessa classe de marcadores moleculares genômicos em estudos de filogenia, macroevolução e biogeografia histórica tem crescido bastante nos últimos anos, inclusive com vários trabalhos publicados por nosso grupo de pesquisa, confirmando as vantagens de seu uso em tal tipo de estudo. Para a realização desse projeto está sendo montada uma grande rede de colaboradores do Brasil e do exterior, todos com grande experiência no estudo de peixes, o que permitirá não só a realização a contento do presente projeto, mas também a realização de inúmeros projetos futuros.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Integrante / Claudio Oliveira - Coordenador.

• 2020 - Atual

  Aspectos funcionais e evolutivos dos cromossomos supranumerários em peixes baseados no modelo Astyanax (TELEOSTEI, CARACIFORMES), revelados por análise genômica e estrutural, Descrição: Cromossomos B são elementos estruturais enigmáticos do genoma de alguns organismos. Curiosamente, esses cromossomos não se recombinam com os cromossomos do complemento A e assim, seguiram um caminho diferente durante a evolução, carregando principalmente informações genéticas redundantes já presentes nos cromossomos do complemento padrão. Em populações de peixes do gênero Astyanax são encontrados diversos tipos de cromossomos B com relação ao tamanho e morfologia, sendo a variante metacêntrica a mais recorrente em diversas espécies. Devido à sua semelhança morfológica e o compartilhamento de sequências de DNA repetitivo, foi proposto que esta variante teria uma origem comum nas espécies portadoras neste grupo. No entanto, as conclusões obtidas a partir da análise de sequências de DNA repetitivo são frágeis, uma vez que este tipo de sequência possui uma rápida evolução e uma alta taxa de dispersão nos cromossomos. Em relação aos efeitos dos cromossomos B em Astyanax, foi demonstrado que estes elementos estão associados a uma maior expressão do gene dmrt1 em gônadas masculinas em maturação. Apesar da existência de diversos estudos citogenéticos e estruturais já realizados sobre cromossomos B em Astyanax, pouco se sabe a respeito da atividade funcional de alguns genes presentes e identificados nestes elementos, geralmente envolvidos no controle do ciclo celular, bem como sobre sua taxa de transmissão para a prole, que poderiam dar indicações sobre sua função e papel representado no estágio evolutivo das populações. Com o intuito de testar a hipótese de origem comum dos cromossomos B em Astyanax, será investigada em algumas espécies desse gênero a presença de genes codificadores de proteínas nesses elementos. Adicionalmente, será investigada a expressão dos genes encontrados em indivíduos portadores (+B) e não portadores (0B) e a possível expressão destes genes a partir de sequências presentes exclusivamente no cromossomo B, para verificar padrões de atividade neste tipo de cromossomo. Será verificado se a possível expressão desses genes se traduz em proteínas funcionais, sendo também realizadas análises para identificar diferenças no perfil global proteico em indivíduos +B e 0B. E a análise da taxa de transmissão deste cromossomo em uma população de A. paranae escolhida como modelo, possibilitará identificar mecanismos celulares que atuam nos processos que garantem sua manutenção nas populações. Neste sentido, considera-se que a utilização de metodologia genética molecular de última geração servindo de base para estudos genômicos e funcionais se constitua numa ferramenta adequada para desvendar aspectos da origem, presença, estrutura, manutenção, funcionamento, herança e evolução destes elementos em Astyanax e, por conseguinte, nos peixes e outros organismos, certamente representando um grande avanço nas pesquisas nesta área. Por outro lado, informações sobre a origem e manutenção destes elementos poderia proporcionar conhecimento sobre o desenvolvimento de processos celulares anômalos resultantes de descontrole do ciclo celular.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (3) . , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Integrante / Claudio Oliveira - Integrante / Fausto Foresti - Coordenador / Diogo Teruo Hashimoto - Integrante / Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade Silva - Integrante / Fábio Porto-Foresti - Integrante / Ricardo Utsunomia - Integrante / Caio Augusto Gomes Goes - Integrante / Cristiano Neves do Nascimento - Integrante / Mateus Rossetto Vidal - Integrante / Silvana de Melo - Integrante.

• 2017 - 2017

  Mapeamento de experiência socioambientais do Estado da Bahia, Descrição: No Estado da Bahia existe uma riqueza de conhecimentos, bem como de projetos e ações voltadas às questões socioambientais desenvolvidos por diferentes sujeitos e grupos sociais que, em sua maior parte, não são conhecidos. Nesse sentido, o Mapeamento de Experiências Socioambientais dos Territórios de Identidade tem por objetivo principal identificar, reunir, divulgar, integrar e sistematizar informações de ações e experiências socioambientais voltadas à sustentabilidade existentes no Estado num banco de dados. É um movimento inicial de conhecer o que se faz, quem faz e onde ocorrem as experiências sociais com vistas à sustentabilidade ambiental para, a partir daí, estabelecer as ações políticas que garantam a articulação, o empoderamento e sua divulgação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Coordenador / Marina Faraulo - Integrante / Vinicius mascarenhas - Integrante / Iulle pacheco - Integrante / Claudia Coelho - Integrante.

• 2017 - Atual

  COMPORTAMENTO SINÁPTICO E STATUS TRANSCRICIONAL DO TRIVALENTE X1X2Y EM PEIXES GYMNOTIFORMES: INFERÊNCIAS SOBRE OS MECANISMOS DE INATIVAÇÃO MEIÓTICA DOS CROMOSSOMOS SEXUAIS., Descrição: Durante as fases iniciais da prófase I, as células sofrem uma diminuição significativa na sua atividade transcricional, relacionada com os estados asinápticos dos cromossomos homólogos. Este fenômeno é conhecido como Silenciamento Meiótico da Cromatina não Sinpatada (MSUC), e descreve a cascata de eventos de remodelação da cromatina, tendente a limitar a expressão gênica durante o início da meiose. O surgimento dos cromossomos sexuais heteromórficos (ZW e XY), coloca em conflito os mecanismos de controle da meiose, já que estes cromossomos, na maioria dos casos, possuem apenas um pequena porção homóloga, deixando uma grande extensão de cromatina não sinaptada, podendo reconhecer nestes organismos, um tipo especial de MSUC, denominada Inativação Meiótica dos Cromossomos Sexuais (MSCI), a qual surge como um mecanismo complementar da MSUC, garantindo o normal avanço das células pela prófase I. Embora os pares sexuais ZW e XY sejam os mais estudados, dentro dos vertebrados, os peixes surgem como um excelente modelo de estudo por possuir sistemas alternativos de determinação cromossômica do sexo, desde sistemas hemizigoticos até sistemas múltiplos. Estes últimos, são característicos de uma ordem endêmica de peixes da região Neotropical, os Gymnotiformes, oferecendo assim um modelo alternativo para o estudo da MSCI por se tratarem de cromossomos sexuais surgidos por fusão céntrica, onde os processos de degeneração e diferenciação dos cromossomos sexuais XY e ZW não seriam tão evidentes. No presente projeto pretende-se utilizar a imuno-localização de marcadores específicos da prófase I, com o objetivo de avaliar o comportamento sináptico e o estado transcricional dos cromossomos sexuais de Eigenmannia sp2, Gymnotus pantanal e Brachyhypopomus pinnicaudatus, espécies que compartilham o sistema de cromossomos sexuais múltiplos X1X1X2X2/X1X2Y, como um primeiro passo para compreender os processos de inativação meiótica dos cromossomos sexuais (MSCI) em peixes... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Integrante / Cristian Andrés Araya - Coordenador / Fausto Foresti - Integrante.

• 2016 - Atual

  Organização genômica ictiofauna do semi-árido baiano utilizando marcadores cito moleculares, Descrição: A caatinga representa um dos biomas menos conhecidos da região semi-árida caracterizada por um elevado grau de endemismo, particularmente entre certos grupos animais, entre eles, os peixes (ictiofauna). A maior parte da biodiversidade aí encontrada permanece no anonimato e sob constante ameaça, seja pela degradação ambiental ou pela introdução de espécies exóticas. As técnicas de citogenética clássica têm caracterizado a composição cariotípica de muitos grupos animais ao longo das últimas décadas, conferindo um importante subsídio para os estudos de diversidade e taxonomia (citotaxonomia) a partir da identificação de espécies crípticas, complexos de espécies e polimorfismos. Esse projeto tem por objetivo fornecer uma caracterização cariotípica refinada a partir da aplicação da técnica de hibridação fluorescente in situ (FISH) no material citogenético de representantes da ictiofauna, usando diferentes sondas, fornecendo subsídios para análises mais refinadas das características cromossômicas da fauna regional. Assim, espécies de interesse ecológico e/ou econômico da região do semi-árido poderão ser amplamente estudadas através de uma técnica atual, direta, rápida, de alta resolução e bastante eficaz para a detecção e mapeamento de regiões específicas de DNA e identificação de segmentos cromossômicos imperceptíveis pelas técnicas de bandamento convencionais. Tais dados serão úteis para o conhecimento da riqueza faunística regional e do panorama da biodiversidade animal do semi-árido.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Integrante / Débora Diniz - Coordenador / Claudio Oliveira - Integrante / Caroline Garcia - Integrante / Débora Diniz Bezerra - Integrante.

• 2016 - Atual

  Sistema Urubu: Rede Social de Conservação da Biodiversidade, Descrição: Descrição: Todos os anos 475 milhões de vertebrados selvagens são atropelados em estradas e rodovias brasileiras. Essa é a estimativa do Centro Brasileiro de Estudos em Ecologia de Estradas (CBEE), resultando no maior impacto direto à biodiversidade do nosso país. Neste número não estão incluídos os impactos indiretos (fragmentação, perda de habitat, afugentamento, animais machucados que morrem depois, entre tantos outros). Desde 2010 o CBEE busca atuar na redução deste impacto e temos obtidos excelentes resultados. O grande problema é que Brasil pretende investir em ampliação da sua rede viária nos próximos anos, além de incentivar a comercialização de milhares de veículos diariamente. Além da implantação de mais rodovias e ferrovias, o governo busca mudanças na legislação de licenciamento ambiental, tornando o processo mais ágil e menos restritivo. Neste sentido a presente proposta visa a continuidade das suas ações em diferentes segmentos, através do Programa Sistema Urubu (PSU). O PSU terá foco no desenvolvimento de ações estabelecidas em 19 Planos de Ação Nacionais (PANs) e, sobretudo nas ações do Plano Estratégico para Conservação da Fauna Afetada por Infraestrutura Viária (PE Estradas). O PSU permitirá a gestão do PE Estradas e a execução de algumas ações prioritárias, que por sua vez deverão gerar uma base de sustentabilidade de longo prazo ao PE, considerando que o mesmo deverá ter continuidade após os cinco anos deste planejamento inicial. Atuaremos em todas as regiões e biomas do Brasil, tanto com ações diretas de formação e capacitação, quanto na captação de novos parceiros na comunidade em geral e na sociedadeorganizada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luis Ricardo Ribeiro da Silva - Coordenador / Alex Bager - Integrante.

Prêmios