Rafael Keith Ono

Pós-doutorado

Formação complementar

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Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Produções bibliográficas

• MARCHESI, JORGE AUGUSTO PETROLI ; ONO, RAFAEL KEITH ; CANTÃO, MAURÍCIO EGÍDIO ; IBELLI, ADRIANA MÉRCIA GUARATINI ; PEIXOTO, JANE DE OLIVEIRA ; MOREIRA, GABRIEL COSTA MONTEIRO ; GODOY, THAÍS FERNANDA ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; MUNARI, DANÍSIO PRADO ; LEDUR, MÔNICA CORRÊA . Exploring the genetic architecture of feed efficiency traits in chickens. Scientific Reports , v. 11, p. 4622, 2021.

• SILVESTRE VASCONCELOS, TARCISIO ; THOMAZ, MARIA CRISTINA ; CASTELINI, FABRICIO ROGÉRIO ; VERSUTI ARANTES ALVARENGA, PATRÍCIA ; ALVES DE OLIVEIRA, JAQUELINE ; FERREIRA RAMOS, GÉSSICA ; KEITH ONO, RAFAEL ; MILANI, NATÁLIA CRISTINA ; DOS SANTOS RUIZ, URBANO . Evaluation of pineapple byproduct at increasing levels in heavy finishing pigs feeding. ANIMAL FEED SCIENCE AND TECHNOLOGY , v. 269, p. 114664, 2020.

• CAVANI, LIGIA ; SILVA, RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA ; CARREÑO, LUIS ORLANDO DUITAMA ; ONO, RAFAEL KEITH ; BERTIPAGLIA, TÁSSIA SOUZA ; FARAH, MICHEL MARQUES ; MILLEN, DANILO DOMINGUES ; FONSECA, RICARDO DA . Genetic diversity of Brazilian Brahman cattle by pedigree analysis. PESQUISA AGROPECUÁRIA BRASILEIRA (ONLINE) , v. 53, p. 74-79, 2018.

• DOMINGUES, M. S. ; ANDRIGHETTO, C. ; LUPATINI, G. C. ; MATEUS, G. P. ; ARANHA, A. S. ; ONO, R. K. ; SHIGUEMATSU, M. M. S. ; GIACOMINI, P. V. ; SEKIYA, B. M. S. . Growth and yield of corn forage intercropped with marandu grass in an agrosilvopastoral system with eucalyptus. SEMINA. CIÊNCIAS AGRÁRIAS (ONLINE) , v. 38, p. 3669, 2017.

• CAVANI, L. ; GARCIA, D. A. ; CARRENO, L. O. D. ; ONO, R. K. ; PIRES, M. P. ; FARAH, M. M. ; VENTURA, H. T. ; MILLEN, D. D. ; FONSECA, R. . Estimates of genetic parameters for reproductive traits in Brahman cattle breed. Journal of Animal Science , v. 93, p. 3287, 2015.

• PIRES, M. P. ; FARAH, M. M. ; CARRENO, L. O. D. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; ONO, R. K. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; FONSECA, R. . Estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento em ovinos da raça Suffolk no Brasil. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia (Online) , v. 67, p. 1119-1124, 2015.

• BARBIERI, A. ; ONO, R.K. ; CURSINO, L. L. ; FARAH, M. M. ; PIRES, M. P. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; PIRES, A. V. ; CAVANI, L. ; CARRENO, L. O. D. ; Fonseca, Ricardo . Genetic parameters for body weight in meat quail. Poultry Science (Print) , v. 94, p. 169-171, 2015.

• PEREIRA, MURILLO CEOLA STEFANO ; RIGUEIRO, ANDRÉ LUIZ NAGATANI ; ONO, RAFAEL KEITH ; RIGOBELO, EVERLON CID . Avaliação dos padrões de resistência a antimicrobianos de cepas de Escherichia coli portadoras e não portadoras dos genes stx1, stx2 e eae. Revista Acadêmica: Ciências Agrárias e Ambientais (PUCPR. Impresso) , v. 12, p. 270, 2014.

• DUITAMA, L.O. ; FARAH, M.M. ; UTSUNOMIYA, A.T.H. ; ONO, R.K. ; PIRES, M.P. ; FONSECA, R. . Uso de modelos lineares mistos na avaliação genética de escores visuais: estudo de simulação. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia , v. 66, p. 1139-1146, 2014.

• ARAUJO NETO, F. R. ; HERRERA, L. G. G. ; ONO, R.K. ; QUEIROZ, S. A. . Características de Crescimento em Bovinos de Corte. In: Sandra Aidar de Queiroz. (Org.). Introdução ao Melhoramento Genético de Bovinos de Corte. 1ed.Guaíba - RS: Agrolivros, 2012, v. 1, p. 55-62.

• ONO, R. K. ; IBELLI, A. M. G. ; CANTAO, M. E. ; PEIXOTO, J. O. ; SOLLERO, B. P. ; SUREK, D. ; MOREIRA, G. C. M. ; GODOY, T. F. ; COUTINHO, L. L. ; LEDUR, M. C. . Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. In: 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018, Auckland - NZ. Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018.

• FERNANDES, L. T. ; ONO, R. K. ; IBELLI, A. M. G. ; LAGOS, E. B. ; MORES, M. A. Z. ; CANTAO, M. E. ; LORENZETTI, W. R. ; PEIXOTO, J. O. ; PEDROSA, V. B. ; LEDUR, M. C. . Novel putative candidate genes associated with umbilical hernia in pigs. In: 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018, Auckland - NZ. Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018.

• MARCHESI, J. A. P. ; ONO, R. K. ; IBELLI, A. M. G. ; BUZANSKAS, M. E. ; CANTAO, M. E. ; PEIXOTO, J. O. ; MUNARI, D. P. ; COUTINHO, L. L. ; LEDUR, M. C. . Estudo de associação global do genoma revela novos genes e regiões genômicas associadas à conversão alimentar em frangos de corte. In: XII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2017, Ribeirão Preto - SP. Anais do XII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2017.

• ONO, R. K. ; PALUDO, E. ; IBELLI, A. M. G. ; PEIXOTO, J. O. ; PETRY, B. ; PANDOLFI, J. R. C. ; LOPES, L. ; JAENISCH, F. R. F. ; LEDUR, M. C. . Fatores relacionados à variação na expressão gênica no fêmur de frangos de corte. In: XII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2017, Ribeirão Preto - SP. Anais do XII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2017.

• CARMO, K. B. ; IBELLI, A. M. G. ; SAVOLDI, I. R. ; ONO, R. K. ; PEIXOTO, J. O. ; LEDUR, M. C. . Associação de um snp no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. In: 11 Jornada de Iniciação Científica, 2017, Concórdia - SC. Anais da 11 Jornada de Iniciação Científica, 2017.

• ONO, R. K. ; MENEZES, T. J. ; CAVANI, L. ; TINO, C. R. S. ; FERRAZ, J. B. S. ; FONSECA, R. . Curva de crescimento de ovelhas da raça Santa Inês. In: XI Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2015, Santa Maria - RS. Anais do XI Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2015.

• DOMINGUES, M. S. ; ANDRIGHETTO, C. ; LUPATINI, G. C. ; ARANHA, A. S. ; MATEUS, G. P. ; ONO, R.K. ; GIACOMINI, P. V. ; SHIGUEMATSU, M. M. S. . Avaliação no desenvolvimento do milho e capim-marandu em sistema agrossilvipastoril com eucalipto. In: XXIV CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 2014, Vitória - ES. anais do XXIV CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 2014.

• ALLI, N. D. ; FABRE, P. T. ; CACERE, G. ; MAESTA, S. A. ; PEREIRA, F. T. V. ; CARVALHO, W. L. ; FARIAS, M. A. ; ONO, R.K. . Avaliação das características craniais e cerebrais de cordeiros lanados e deslanados pelo método de atordoamento por dado cativo penetrante. In: III Congresso Brasileiro de Bioética e Bem-estar Animal, 2014, Curitiba - PR. Anais do III Congresso Brasileiro de Bioética e Bem-estar Animal, 2014.

• CAVANI, L. ; SILVA, R. M. O. ; ONO, R.K. ; FARAH, M. M. ; CARRENO, L. O. D. ; FONSECA, R. . Assessment of Genetic Variability Using Pedigree Analysis of the Brahman Breed in Brazil. In: 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 2014, Vancouver - BC. Proceedings of 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 2014.

• CARRENO, L. O. D. ; FARAH, M. M. ; GARCIA, D. A. ; ONO, R.K. ; CAVANI, L. ; FONSECA, R. . Flexibility of Bayesian LASSO under different genetic structure. In: 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 2014, Vancouver - BC. Proceedings of 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 2014.

• VASCONCELOS, T. S. ; RUIZ, U. S. ; THOMAZ, M. C. ; CASTELINI, F. R. ; RODRIGUES, D. J. ; ONO, R.K. ; RAMOS, G. F. ; OLIVEIRA, J. A. . Avaliação biológica do resíduo de abacaxi para suínos em terminação. In: IV Congresso Latino Americano de Nutrição Animal, 2014, São Pedro - SP. Anais do IV Congresso Latino Americano de Nutrição Animal, 2014.

• VASCONCELOS, T. S. ; RUIZ, U. S. ; THOMAZ, M. C. ; OLIVEIRA, J. A. ; CASTELINI, F. R. ; ONO, R.K. ; ALVARENGA, P. V. A. . Características das carcaças de suínos alimentados com dietas com teores crescentes de resíduo de abacaxi. In: IV Congresso Latino Americano de Nutrição Animal, 2014, São Pedro - SP. Anais do IV Congresso Latino Americano de Nutrição Animal, 2014.

• CARRENO, L. O. D. ; ONO, R.K. ; CAVANI, L. ; FARAH, M. M. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; FONSECA, R. . Estimativas de parâmetros genéticos de características de crescimento em gado Brahman. In: C, 2013, Uberaba - MG. X Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2013.

• ONO, R.K. ; SANTOS, D. J. A. ; LUGO, N. A. H. ; RIBEIRO, T. B. ; CAETANO, S. L. ; BRUNELI, F. A. T. . Análise de sobrevivência da duração da lactação de vacas Guzerá (Bos taurus indicus). In: X Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2013, Uberaba - MG. X Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2013.

• CAVANI, L. ; SILVA, P. K. A. ; CARRENO, L. O. D. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. . Estudo da endogamia em rebanho bovino da raça Brahman. In: IX Simpósio de Ciências da Unesp - Dracena, 2013, Dracena - SP. anais do IX Simpósio de Ciências da Unesp - Dracena, 2013.

• PRANDO, L. ; ONO, R.K. ; CAETANO, S. L. ; CARDOSO, P. B. ; CROMBERG, V. U. ; QUEIROZ, S. A. . Estudo do comportamento de reintegração social em perdizes (Rhynchotus rufescens) criadas em cativeiro por meio de análise de sobrevivência. In: IX Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2012, Jõao Pessoa. IX Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2012.

• SILVA, P. K. A. ; VICARI, D. V. F. ; VERA, J. H. S. ; ONO, R.K. ; BUENDIA, N. A. ; SOUTELLO, R. V. G. . Ação da imunocastração sobre o ganho de peso e cobertura de gordura subcutânea em novilhas confinadas de diferentes grupos genéticos. In: 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012, Brasília - DF. Anais da 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012.

• PACHECO, T. M. ; ABREU, K. S. ; CARVALHO, L. C. ; FRESCHI, J. B. ; ONO, R.K. ; SOUTELLO, R. V. G. . Efeito da Castração no Desempenho de Bovinos da Raça Nelore Mantidos em Sistema de Semi-confinamento. In: 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012, Brasília - DF. Anais da 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012.

• SOUTELLO, R. V. G. ; ABREU, K. S. ; VICARI, D. V. F. ; KODEL, F. J. ; ONO, R.K. ; LUQUETTI, B. C. . Desempenho e Característica de Carcaça de Novilhos da Raça Nelore Inteiros e Castrados Mantidos em Sistema de Semi-confinamento. In: 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012, Brasília - DF. Anais da 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012.

• SILVA, P. K. A. ; VICARI, D. V. F. ; VERA, J. H. S. ; PENHA, D. S. ; ONO, R.K. ; SOUTELLO, R. V. G. . Efeito da utilização do dispositivo intra-uterino bovino (DIUB) sobre o ganho de peso e acabamento de gordura em fêmeas bovinas confinadas de diferentes grupos genéticos. In: 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012, Brasília - DF. Anais da 49ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012.

• DEMARCHI, C. ; PIRES, M. P. ; FONSECA, R. ; CARRENO, L. O. D. ; ONO, R.K. ; VERNIZ, V. . Efeito de Produtor e época de nascimento nas características de desempenho ponderal em ovinos. In: VII Encontro de Zootecnia e VI Simpósio de Ciências da Unesp Dracena, 2010, Dracena. Anais do VII Encontro de Zootecnia e VI Simpósio de Ciências da Unesp Dracena, 2010.

• PIRES, M. P. ; DEMARCHI, C. ; ONO, R.K. ; WATANABE, D. H. M. ; FONSECA, R. . Tendência Genéticas dos Animais Participantes da Prova de Ganho de Peso do Núcleo de Ovinos de Junqueirópolis. In: VII Encontro de Zootecnia e VI Simpósio de Ciências da Unesp Dracena, 2010, Dracena. Anais do VII Encontro de Zootecnia e VI Simpósio de Ciências da Unesp Dracena, 2010.

• FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; LOPES, P. S. ; QUEIROZ, A. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; FARAH, M. M. ; CARRENO, L. O. D. ; WATANABE, D. H. M. ; GUIMARAES, S. E. F. ; BRACCINI NETO, J. ; TORRES, R. A. ; EUCLYDES, R. F. . LZ5 - a free software for data simulation. In: 32nd. Conference of the International Society for Animal Genetics, 2010, Edimburgo. Proceedings of the 32nd Conference of the International Society for Animal Genetics, 2010.

• FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; LOPES, P. S. ; GUIMARAES, S. E. F. ; BRACCINI NETO, J. ; VERNIZ, V. ; WATANABE, D. H. M. ; EUCLYDES, R. F. ; TORRES, R. A. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; CARRENO, L. O. D. ; FARAH, M. M. . On simulation single nucleotide polimorphism (SNP) data. In: 32nd. Conference of the International Society for Animal Genetics, 2010, Edimburgo. Proceedings of the 32nd Conference of the International Society for Animal Genetics, 2010.

• CARRENO, L. O. D. ; FARAH, M. M. ; HERRERA, L. G. G. ; FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; ONO, R.K. . Estimativas de parâmetros genéticos e correlações de características reprodutivas em gado Brahman sob ambiente tropical.. In: VII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2010, Maringá. Anais do VII Simpósio Brasileiro de Melhoramento Animal, 2010.

• FONSECA, R. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; QUEIROZ, A. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. . Desenvolvimento e Implementação de um Algoritmo para Geração de Qtls e Marcadores Moleculares. In: 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007, Jaboticabal - SP. Anais da 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007.

• QUEIROZ, A. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. . Construção de uma Interface de Comandos para um Software de Simulação de Dados em Melhoramento Genético Animal. In: 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007, Jaboticabal - SP. Anais da 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007.

• PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; QUEIROZ, A. ; FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. . Simulação de Características Correlacionadas. In: 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007, Jaboticabal - SP. Anais da 44a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2007.

• ONO, R.K. ; FONSECA, R. ; PIRES, M. P. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; PIRES, A. V. . Simulating a Genome with Markers. In: 8 Wolrd Congress on Genetics Apllied to Livestock Production, 2006, Belo Horizonte - MG. Simulating a Genome with Markers, 2006.

• FONSECA, R. ; ONO, R.K. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; PIRES, M. P. ; PIRES, A. V. . On Simulating Overlapping and Non-overlapping Generations. In: 8 Wolrd Congress on Genetics Apllied to Livestock Production, 2006, Belo Horizonte - MG. On Simulating Overlapping and Non-overlapping Generations, 2006.

• UTSUNOMIYA, A. T. H. ; VAZ, R. I. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. . Desenvolvimento de um software-livre para simulação em melhoramento genético animal. In: Zootec - 2005 - Produção animal e responsabilidade, 2005, Campo Grande - MS. Anais da Zootec - 2005, 2005.

• VAZ, R. I. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. . Desenvolvimento e implementação de um algoritmo para simulação da gametogênese e zigotogênese. In: 42a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005, 2005, Goiânia - GO. Anais da 42a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005, 2005.

• RUIZ, U. S. ; VASCONCELOS, T. S. ; THOMAZ, M. C. ; ALMEIDA, V. V. ; CASTELINI, F. R. ; RODRIGUES, D. J. ; ONO, R.K. ; RAMOS, G. F. ; OLIVEIRA, J. A. . Evaluation of pineapple byproduct in finishing pigs feeding. In: ADSA-ASAS Midwest Meeting, 2014, Des Moines, IA. Proceedings of ADSA-ASAS Midwest Meeting, 2014.

• SANTIAGO, G. G. ; SIQUEIRA, F. ; CARDOSO, F. F. ; SOUZA JUNIOR, M. D. ; ONO, R.K. ; TORRES JUNIOR, R. A. A. . Desequilíbrio de ligação com SNP chip em média densidade em bovinos da raça Canchim. In: V Simpósio Internacional e IX Encontro de Genética e Melhoramento Animal, 2014, Viçosa - MG. Anais do V Simpósio Internacional e IX Encontro de Genética e Melhoramento Animal, 2014.

• CAVANI, L. ; SILVA, R. M. O. ; ONO, R.K. ; FARAH, M. M. ; CARRENO, L. O. D. ; FONSECA, R. . Estimations of genetic parameters for maternal ability and reproductive characteristics in dams of Santa Inês sheep. In: Joint ISNH/ISRP International Conference 2014, 2014, Canberra - ACT. Proceedings of Joint ISNH/ISRP International Conference 2014, 2014.

• CAVANI, L. ; SILVA, R. M. O. ; ONO, R.K. ; FARAH, M. M. ; CARRENO, L. O. D. ; FONSECA, R. . Pedigree analysis using the probability of gene origin of Brahman breed in Brazil. In: Joint ISNH/ISRP International Conference 2014, 2014, Canberra - ACT. Proceedings of Joint ISNH/ISRP International Conference 2014, 2014.

• LUPATINI, G. C. ; BERTOLDI, G. P. ; SILVA FILHO, W. I. ; GOMES, V. C. ; ANDRIGHETTO, C. ; MATEUS, G. P. ; DOMINGUES, M. S. ; ONO, R.K. . Study of the use of methods of fasting in weighing supplemented beef cattle on pasture. In: 50ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2013, Campinas - SP. 50ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2013.

• MENEZES, T. J. ; SILVA, P. K. A. ; CAVANI, L. ; ONO, R.K. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; ALESSIO, F. N. ; FONSECA, R. ; MEMBRIVE, C. M. B. . Study of environmental effects for reproductive traits of Brahman females. In: 50ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2013, Campinas - SP. 50ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2013.

• FABRE, P. T. ; LOPES, A. M. ; CRISTOVAM, R. R. B. ; FONSECA, R. ; ONO, R. K. ; MEMBRIVE, C. M. B. . Características produtivas e reprodutivas em rebanhos bovinos leiteiros na região de Dracena/SP e municípios vizinhos. In: VII Congresso de Extensão Universitária da UNESP, 2013, Águas de Lindóia - SP. Anais do VII Congresso de Extensão Universitária da UNESP, 2013.

• WATANABE, D. H. M. ; FONSECA, R. ; MAESTA, S. A. ; SILVA, P. K. A. ; PIRES, M. P. ; KAWAKAMI, P. S. F. ; BARBIERI, A. ; ONO, R. K. . Implementação de provas de ganho de peso em um confinamento coletivo de ovinos. In: VI Congresso de Extensão Universitária da UNESP, 2011, Águas de Lindóia - SP. Anais do VI Congresso de Extensão Universitária da UNESP, 2011.

• FONSECA, R. ; VERNIZ, V. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; QUEIROZ, A. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; FARAH, M. M. ; PIRES, A. V. . LZ5 - A Flexible Data Simulation Program for Animal Breeding Area. In: 9th. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2010, Leipzig. Proceeding of the 9th. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2010.

• FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; QUEIROZ, A. . Implementação de algoritmos para simulação da inversa da matriz de parentesco. In: 45º Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008, Lavras - MG. Anais da 45º Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.

• PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; QUEIROZ, A. ; FONSECA, R. . Comparação de dois métodos de implementação do índice de seleção para características múltiplas. In: V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciência da Unesp de Dracena, 2008, Dracena - SP. Anais do V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciências da Unesp de Dracena, 2008.

• VERNIZ, V. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; QUEIROZ, A. ; FONSECA, R. . LZ5 ? Módulos para simulação de dados e avaliação genética animal A IMAL. In: V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciência da Unesp de Dracena, 2008, Dracena - SP. Anais do V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciências da Unesp de Dracena, 2008.

• PICCOLO, N. I. P. ; BORGES, P. M. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. ; MAESTA, S. A. ; ARRIGONI, M. B. . Proposta de desenvolvimento de um sistema de comunicação para viabilizar um programa de melhoramento genético de ovinos. In: V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciência da Unesp de Dracena, 2008, Dracena - SP. Anais do V Encontro de Zootecnia e IV Simpósio de Ciências da Unesp de Dracena, 2008.

• FONSECA, R. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; QUEIROZ, A. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. . Phenotypic and Molecular Data Simulation Software for Animal Breeding. In: The 3rd. International Conference of Quantitative Genetics, 2007, Hangzhou. Proceedings of the 3rd. International Conference of Quantitative Genetics, 2007. p. 34-34.

• PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; VAZ, R. I. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; FONSECA, R. . Desenvolvimento de um algoritmo para a simulação dos cromossomos de indivíduos de uma população-base. In: 51o. Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindoya - SP. Anais do 51o. Congresso Brasileiro de Genética, 2005, 2005.

• ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; VAZ, R. I. ; FONSECA, R. . Desenvolvimento de um algoritmo para simulação de valores fenotípicos. In: 51o. Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindoya - SP. Anais do 51o. Congresso Brasileiro de Genética, 2005, 2005.

• ONO, R. K. ; PIRES, M. P. . Heterogeneidade de variância para produção de leite aos 305 dias e idade ao primeiro parto. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• CARRENO, L. O. D. ; PIRES, M. P. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; ONO, R.K. ; UTSUNOMIYA, A. T. H. ; FONSECA, R. . Uso de escores visuais no melhoramento animal 2012 (Revisão Bibliográfica).

• MENEZES, T. J. ; SANTOS, A. R. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; ONO, R.K. ; LONGUINE, R. ; OLIVEIRA, J. A. ; TARGANSKI, D. M. ; FONSECA, R. . Herdabilidade para Eficiência Reprodutiva em Avaliação de Fêmeas Brahman 2012 (Revisão Bibliográfica).

• SILVA, P. K. A. ; CAVANI, L. ; PACHECO, T. M. ; SANTANA, A. T. ; LUZ, P. A. C. ; ONO, R.K. ; PIRES, M. P. ; FONSECA, R. . Parâmetros genéticos para características de habilidade materna em ovinos 2012 (Revisão Bibliográfica).

• SIQUEIRA, W. S. ; DOMINGUES, M. S. ; CURSINO, L. L. ; MANHANI, B. B. ; ONO, R.K. ; CARRENO, L. O. D. ; OLIVEIRA FILHO, D. C. ; VERA, J. H. S. . Avaliação Visual como ferramenta na seleção e produção de bovinos de corte no Brasil 2012 (Revisão Bibliográfica).

• BARBIERI, A. ; KAWAKAMI, P. S. F. ; BERTIPAGLIA, T. S. ; PIRES, M. P. ; ONO, R.K. ; FONSECA, R. . Importância de Estimativas de Parâmetros Genéticos para Características de Crescimento em Codornas de Corte 2011 (Revisão Bibliográfica).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2015 - 2016

  Desenvolvimento de metodologias para análises genômicas provenientes do sequenciamento de nova geração e formação de recursos humanos para atuar em áreas estratégicas do agronegócio Brasileiro, Descrição: Os avanços das tecnologias de sequenciamento e genotipagem têm possibilitado a geração massiva de dados genômicos em curto período de tempo, ao contrário do que acontecia no passado, causando um gargalo quanto à utilização desses dados. O desenvolvimento de workflows científicos (gerenciamento de processos utilizados em experimentos científicos) que facilitem a realização das análises estatísticas necessárias para a interpretação destas informações é um entrave nessas pesquisas. Esta deficiência em analisar e interpretar dados genômicos produzidos massivamente em um curto período de tempo tem acarretado atrasos nas pesquisas e na divulgação destes resultados, já que dependem das conclusões destas análises. Em virtude desta deficiência global e visualizando o potencial de ganho científico e tecnológico para o Brasil, os objetivos desta proposta são 1) desenvolver novos métodos computacionais em bioinformática por meio de workflows para serem aplicados em análises de dados genômicos e 2) capacitar pesquisadores brasileiros para análise de grandes conjuntos de sequências de DNA e RNA envolvidas nas áreas ômicas (genômica, transcriptômica, exômica, metagenômica e metatranscriptômica) em desenvolvimento no Brasil. O workflow de análise será desenvolvido especificamente para cada ômica envolvida no projeto. Cada workflow deverá gerenciar e tratar dos dados de entrada, realizar o pré-processamento das sequências, e utilizar as ferramentas e bancos de dados mais adequados para cada fase do projeto. O controle no fluxo de sistemas deverá ser elaborado previamente para garantir a completa execução dos processos, inclusive no tratamento das exceções intrínsecas de cada estudo abordado. Sendo assim, para a elaboração do fluxo de cada workflow será necessário o domínio completo de todas as fases do projeto, que compreende desde a coleta das informações ao auxílio na interpretação dos resultados em forma de gráficos e tabelas. Assim, as metas desta proposta são desenvolver e disponibilizar ao final do projeto 5 workflows: um de genômica, um de transcriptômica, um de exômica, um de metagenômica e metatranscriptômica, e um de análise conjunta de dados de RNA-Seq e de exoma. Além disso, 3 cursos em análises de bioinformática serão oferecidos, uma obra técnica será publicada e um workshop será realizado ao final do projeto, visando a disseminação dos conhecimentos gerados. Para tal, espera-se com esta proposta possibilitar a vinda ao Brasil do pesquisador Matt Settles, Doutor em Bioinformática, que possui grande experiência em análise de dados de sequenciamento de nova geração e coordenação de centros de geração de dados (core-facilities). Esta proposta será desenvolvida por uma equipe multidisciplinar e multiinstitucional, envolvendo a parceria entre a Embrapa Suínos e Aves, Embrapa Informática Agropecuária, Embrapa Gado de Leite, Embrapa Pecuária Sudeste, ESALQ/USP, UNESP de Araçatuba e a Universidade de Idaho (EUA), visando o desenvolvimento científico e tecnológico no Brasil, além de ampliar o quadro de pesquisadores qualificados em Bioinformática. A transversalidade desta proposta, onde o pesquisador visitante atuará em vários projetos estratégicos para o país, é altamente inovadora e promoverá grande salto qualitativo nas pesquisas realizadas pelas instituições Nacionais, o que impulsionará a busca por soluções tecnológicas que garantam a competitividade das cadeias produtivas de suínos, aves e bovinos no país.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Keith Ono - Integrante / Mônica Corrêa Ledur - Coordenador / Luiz Lehmann Coutinho - Integrante / Jane de Oliveira Peixoto - Integrante / Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva - Integrante / Poliana Fernanda Giachetto - Integrante / Mauricio Egidio Cantão - Integrante / Adriana Mércia Guaratini Ibelli - Integrante / Ricardo Zanella - Integrante / Matt Settles - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2015

  Parâmetros genéticos para características indicadoras de eficiência reprodutiva e produtiva de ovinos da raça Santa Inês, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Ricardo da Fonseca em 24/06/2016., Descrição: As características ligadas à eficiência reprodutiva são as que apresentam maior valor econômico na maioria dos sistemas de criação de carne ovina, pois estão intimamente ligadas à disponibilidade do produto final. Estimativas confiáveis de parâmetros genéticos são essenciais para a definição de índices de seleção e para determinar a resposta correlacionada sobre as demais características presentes no índice de seleção. Este trabalho tem por objetivo estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características reprodutivas em ovinos da raça Santa Inês. Foram utilizados dados de 4.742 ovelhas pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da raça Santa Inês da Associação Sergipana de Criadores de Caprinos e Ovinos em parceria com a Universidade de São Paulo. Para o estudo serão consideradas as características: Idade ao primeiro parto (IPP), Intervalo de partos (IDP), Número de cordeiros nascidos por ovelha parida (NCN), Número de cordeiros desmamados por ovelha parida (NCD), Habilidade de criação por ovelha parida (HC) definido como a razão entre NCN e NCD, Peso total dos cordeiros ao nascer (PTCN), Peso total dos cordeiros ao desmame (PTCD), Relação de nascimento (RELN), Relação de desmama (RELD) e Peso da ovelha ao desmame dos cordeiros (PD). Os componentes de (co)variância serão estimados por meio de análises bivariadas, sob modelo animal linear para IPP e IDP e limiar (threshold) para NCN, NCD e HC, utilizando o método da amostragem de Gibbs do programa THRGIBBS1F90. Para PTCN, PTCD, RELN, RELD e PD os componentes de (co)variância serão estimados por meio de análise multicaracterística, sob modelo animal, utilizando-se o algoritmo EM-REML com o auxílio do programa Wombat.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Keith Ono - Integrante / Ricardo da Fonseca - Coordenador.

• 2009 - 2011

  Estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento e de carcaça em ovinos de corte, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Ricardo da Fonseca em 28/05/2014., Descrição: Esse projeto tem por objetivo estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para as características de crescimento: Peso ao nascer (PN), Peso ao desmame (PD), Ganho de peso pré-desmama (GDPRÉ) e Ganho de peso pós-desmama (GDPÓS) e de carcaça: Área de olho de lombo (AOL) e Espessura de gordura subcutânea (EGS) para uma raça materna composta. O conhecimento dos parâmetros genéticos é de vital importância para os programas de melhoramento, pois permite a predição do progresso genético, além de ser necessário para predição de valores genéticos, para combinação de características em índices de seleção e para a otimização de esquema de seleção. No entanto, são poucos os trabalhos encontrados na literatura nacional referentes aos parâmetros genéticos de ovinos e a maioria destes trabalhos utiliza dados de rebanhos experimentais e não de dados de campo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rafael Keith Ono - Integrante / Ricardo da Fonseca - Coordenador / Bruno Fernandes Sales Santos - Integrante.

• 2006 - 2008

  Desenvolvimento e Implementação de Algoritmos para Simulação de Informações Fenotípicas Moleculares, Descrição: Os simuladores têm sido freqüentemente utilizados em melhoramento animal com as finalidades de minimizar os custos com a montagem/manutenção de experimentos (os quais normalmente requerem grande número de animais e instalações especiais) e acelerar a obtenção dos resultados que em situações de campo seriam obtidos somente após alguns anos de trabalho. Por exemplo, em um progama de seleção com bovinos de corte durante cinco gerações os últimos resultados seriam obtidos por volta de quinze anos, no entanto, poderiam ser simulados em menos de uma hora. Mais recentemente, com os avanços na área de biotecnologia, tornaram-se disponíveis informações sobre marcadores moleculares e genes candidatos/identificados associados às características de importância econômica. Assim, um simulador de dados fenotípicos e moleculares seria de grande utilidade, uma vez que os pesquisadores poderiam gerar grande número de cenários com qualquer combinação de informações. Além disso, situações poderiam ser testadas para avaliação genética, tomadas de decisão dentro de programas de melhoramento poderiam ter seu risco reduzido e exemplos para ilustração de teorias em artigos científicos ou salas de aula poderiam ser facilmente criados. Para a implementação dos algoritmos para simulação dos dados serão utilizadas máquinas com o sistema operacional Linux. A linguagem de programação empregada será C++, a qual será "traduzida" pelo compilador g++. Três módulos integrantes do simulador serão trabalhados nesse projeto: Gerador de genomas, gerador de informações moleculares e gerador de populações. Todos os algoritmos desenvolvidos e a codificação desses (arquivos-fontes) serão disponibilizados para a comunidade científica gratuitamente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) . , Integrantes: Rafael Keith Ono - Integrante / Michele Porto Pires - Integrante / Ricardo da Fonseca - Coordenador / Adam Taiti Harth Utsunomiya - Integrante / Alexandre de Queiroz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 6

Prêmios