Rodrigo Volcan Almeida

Pós-doutorado

Formação complementar

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Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

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• ALMEIDA, R. V. ; RÖSSLE, S. C. ; ALQUÉRES, S. M. C. ; LARENTIS, A. L. ; CARDOSO, A. M. ; de Almeida, W. I. ; BISCH, P. M. ; ALVES, T. L. M. ; MARTINS, O. B. . MODELAGEM ETRUTURAL DE UMA LIPASE TERMOFÍLICA DE Pyrococcus furiosus. In: IX ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 2003, RIO DE JANEIRO. LIVRO DE RESUMOS - IX ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 2003. p. 105-105.

• LARENTIS, A. L. ; RÖSSLE, S. C. ; ALMEIDA, R. V. ; CARDOSO, A. M. ; de Almeida, W. I. ; BISCH, P. M. ; MARTINS, O. B. ; ALVES, T. L. M. . MODELAGEM ESTRUTURAL DO COMPLEXO DA CARBAZOL 1,9a DIOXIGENASE (Pseudomonas sp.) DA ROTA DE DENITROGENAÇÃO DE PETRÓLEO. In: IX ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 2003, RIO DE JANEIRO. LIVRO DE RESUMOS - IX ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 2003. p. 34-34.

• ALMEIDA, R. V. ; ALQUÉRES, S. M. C. ; RÖSSLE, S. C. ; LARENTIS, A. L. ; CARDOSO, A. M. ; de Almeida, W. I. ; MARTINS, O. B. ; BISCH, P. M. ; ALVES, T. L. M. . Engenheirando uma Lipase de Pyrococcus furiosus. In: Colóquio Anual de Engenharia Química, 2003, Rio de Janeiro. Colóquio Anual de Engenharia Química, 2003.

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• ALMEIDA, R. V. ; ALVES, T. L. M. ; MARTINS, O. B. . Cloning and Expression of a Lipase Gene from Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus furiosus in Escherichia coli. In: V Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2002, Brasília - DF. Anais do V Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2002.

• BASTOS, R. G. ; BENERI, R. L. ; ALMEIDA, R. V. ; PADILHA, M. ; QUEIROZ, M. I. . AVALIAÇÃO DO CULTIVO DA APHANOTHECE MICROSCOPICA NÄGELI NA AUSÊNCIA DE LUMINOSIDADE. In: 9o CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA -FURG/UFPEL/UCPEL, 2000, Rio Grande. ANAIS DO 9o CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA -FURG/UFPEL/UCPEL, 2000.

• ALMEIDA, R. V. ; BASTOS, R. G. ; QUEIROZ, M. I. . CARACTERIZAÇÃO DA MATÉRIA ORGÂNICA NO EFLUENTE DA PARBOILIZAÇÃO DO ARROZ. In: XIV CONGRESSO REGIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA, 1999, Santa Maria - RS. CRICTE 99, 1999.

• BASTOS, R. G. ; ALMEIDA, R. V. ; QUEIROZ, M. I. . DETERMINAÇÃO DO CRESCIMENTO DE CIANOBACTÉRIA NO EFLUENTE DA PARBOILIZAÇÃO DO ARROZ. In: XIV CONGRESSO REGIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA, 1999, Santa Maria - RS. CRICTE 99, 1999.

• ALMEIDA, R. V. ; BASTOS, R. G. ; BENERI, R. ; QUEIROZ, M. I. ; YUNES, J. S. ; BASTOS, R. G. . CARACTERIZAÇÃO EM ÁCIDOS NUCLÉICOS DA CIANOBACTÉRIA Aphanothece microscopica Nägeli, VISANDO A PRODUÇÃO DE PROTEÍNAS UNICELULARES. In: III CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA QUÍMICA EM INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1999, Belo Horizonte - MG. ANAIS DO III CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA QUÍMICA EM INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1999.

• BASTOS, R. G. ; BENERI, R. ; ALMEIDA, R. V. ; PADILHA, M. ; QUEIROZ, M. I. . CULTIVO DE CIANOBACTÉRIA NO EFLUENTE DA PARBOILIZAÇÃO DO ARROZ VISANDO A PRODUÇÃO DE PROTEÍNA UNICELULAR. In: VIII CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1999, Rio Grande. ANAIS DO VIII CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1999.

• ALMEIDA, R.V. . Debatendo a noção de Desenvolvimento Sustentável como Ideologia: aspectos teóricos. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Aula Inaugural do Curso de Biotecnologia (UFRJ-Xerém). 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . A experiência do Laboratório de Microbiologia Molecular e Proteínas (LaMMP-IQ-UFRJ) na produção de proteínas de interesse famacêutico. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Pokémons e como as cobras perderam as pernas: o que a ciência tem a ver com tudo isso?. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• ALMEIDA, R. V. . Perspectivas Futuras da Educação e da Ciência no Brasil. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Da teoria da evolução ao Pokémons: como gerar organismos geneticamente modificados. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• ALMEIDA, R. V. . Engenharia metabólica da produção de 1,3-propanodiol. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . OGMs para a produção de enzimas e produtos da indústria petroquímica: a experiência do LaMMP-IQ-UFRJ. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Obstáculos ao desenvolvimento da ciência: a contribuição de Gaston Bachelard e a experiência da disciplina Lógica e Filosofia das Ciências do IQ/UFRJ. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Construindo Catalisadores sob Encomenda: Engenharia de Proteínas Aplicada à Lipases. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Engenharia de Proteínas Aplicada à Lipases. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . TECNOLOGIA ENZIMÁTICA NO BRASIL: PESQUISA VERSUS BALANÇA COMERCIAL. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, R. V. . Uma esterase estranha de um bicho estranho: características e aplicações biotecnológicas.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2018 - Atual

  Química como Ideologia, Descrição: Segundo Lewontin (2001) ?a ciência é uma instituição social a respeito da qual existe uma grande dose de equívocos, mesmo entre aqueles que dela fazem parte. Achamos que a ciência é uma instituição, um conjunto de métodos [...]. Achamos que a ciência é objetiva. A ciência nos trouxe todo um conjunto de boas coisas. Ela aumentou tremendamente a produção de alimentos. Ela aumentou nossa expectativa de vida [...]. Contudo, ?Ao mesmo tempo, a ciência, como outras atividades produtivas, tais como o Estado, a família e o esporte, é uma instituição social completamente integrada e influenciada pela estrutura de todas as nossas demais instituições sociais. [...] Afinal, os cientistas não começam a vida como cientistas, mas como seres sociais imersos numa família, num Estado, numa estrutura produtiva, e eles enxergam a natureza através de lentes que foram moldadas pelas suas experiências sociais. [...] Trata-se de um duplo processo ? por um lado, da influência social e do controle daquilo que os cientistas fazem e dizem, e por outro lado, do uso daquilo que os cientistas fazem e dizem para sustentar ainda mais as instituições da sociedade ? é isso que imaginamos quando falamos da ciência como ideologia.? (LEWONTIN,2001, p.7-8). Concordando com esta análise do biólogo Richard Lewontin o presente projeto tem como objetivo investigar como a Química, em suas mais diferentes repercussões, tem sido uma ideologia. Com referenciais no marxismo temos estudado inicialmente a noção de ?sustentabilidade? no ensino de química, bem como a química dos anticoncepcionais e o controle do corpo da mulher. Ainda são interesses à crítica ao modo de produção de alimentos baseado no agronegócio, sustentado em grande parte pela química dos agrotóxicos e fertilizantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (2) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / Amanda Ramos de Mattos Thomé - Integrante / Henrique de Miranda dos Santos - Integrante.

• 2014 - Atual

  PROSPECT-BIO - Rede multidisciplinar em prospecção computacional e caracterização estrutural de proteínas com potencial biotecnológico: biodiesel, biocidas e câncer, Descrição: Este projeto visa a criação de uma rede de pesquisa em prospecção computacional e proteômica, bem como na caracterização estrutural de proteínas com potencial biotecnológico para a produção do biodiesel, biocidas e também, alvos moleculares associados ao câncer de medula óssea. A atuação conjunta e multidisciplinar deste grupo de pesquisa emergente prevê a integração da área básica com a área aplicada podendo levar a elucidação de mecanismos biológicos e biotecnológicos. Além da consolidação de grupos emergentes associados utilizaremos como base os métodos de bioinformática para a prospecção de proteínas permeando os projetos envolvidos como também a área de biologia estrutural contando, principalmente, com os estudos de determinação estrutural, dinâmica e interação de proteínas por Ressonância Magnética Nuclear (RMN) e simulação de dinâmica molecular (SDM), como enfoque comum às seguintes proteínas alvo: (1) Lipases de interesse biotecnológico; (2) Biocidas ? peptídeos antimicrobianos e (3) Receptores da via de Hedgehog (Proteína BOC) em leucemia mielóide crônica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / FÁBIO CÉSAR SOUSA NOGUEIRA - Integrante / CRISTIANE DINIS ANO BOM - Integrante / Rafael Dias Mesquita - Integrante / Francisco Gomes Neto - Integrante / Luciana Pizzati - Integrante.

• 2013 - Atual

  Lipases para a Produção de Biodiesel utilizando Matérias-primas de Baixo Valor Agregado: Prospecção por Bioinformática, Whole Cell Biocatalysis e Caracterização Estrutural, Descrição: Este projeto propõe alternativas para a utilização de resíduos e coprodutos da indústria de processamento de óleo de palma e do óleo de macaúba para a produção de biodiesel utilizando-se as lipases. Estas enzimas estão disponíveis comercialmente, mas ainda apresentam um alto valor de mercado, em especial para a obtenção de insumos de baixo valor agregado e alto volume de venda como o biodiesel. Assim espera-se que lipases recombinantes obtidas com tecnologia nacional produzida por fermentação a partir de resíduos da cadeia da palma (POME e glicerina bruta) e do óleo de macaúba possam ser empregadas como biocatalisadores na obtenção de biodiesel a partir de matéria-prima também residual como a borra ácida. Deste modo, fecha-se um ciclo ambientalmente correto, sustentável e com elevada aplicabilidade potencial inovador na indústria de biocombustíveis. O projeto envolverá a ação integrada de diferentes expertises nas áreas de bioinformática, biologia molecular, engenharia bioquímica e biologia estrutural, envolvendo diferentes grupos de pesquisa em uma rede de característica multidisciplinar. A parte inicial do projeto envolverá a prospecção de novas lipases utilizando-se ferramentas de bioinformática e bancos de dados de sequencias públicos; selecionas as lipases por bioinformática os genes serão clonados, expressos em Pichia pastoris utilizando-se a abordagem de whole-cell biocatalysis e caracterizados bioquimicamente quanto a capacidade de catalisarem reações de transesterificação e esterificação utilizando-se as matérias-primas de baixo valor agregado e etanol e metanol como álcoois; as melhores enzimas serão produzidas em biorreatores e utilizadas nas reações de biodiesel variando-se as condições e buscando-se otimizar os rendimentos; como vai ser tratar de novas enzimas, todo um trabalho de caracterização estrutural envolvendo espectrometria de fluorescência, dicroísmo circular, RMN e simulação de dinâmica molecular será realizado em paralelo com o objetivo de entender as características estruturais destas novas enzimas e propor mutações sítio-dirigidas para a otimização das suas eficiências catalíticas; os melhores mutantes serão novamente produzidos em whole-cell e utilizados para a produção de biodiesel.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Integrante / CRISTIANE DINIS ANO BOM - Integrante / Denise Maria Guimarães Freire - Coordenador / Rafael Dias Mesquita - Integrante / Francisco Gomes Neto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2015

  Evolução Dirigida para Otimizar a Estabilidade à Temperatura da Lipase Pf2001 de Pyrococcus furiosus, Descrição: Existem principalmente três formas de se contornar o problema da estabilidade dos biocatalisadores, a saber: isolando enzimas de organismos extremofílicos que naturalmente são mais resistentes às condições rigorosas de uma condição industrial; a imobilização de enzimas em suportes insolúveis que protegem a estrutura terciária de condições desnaturantes; e por último, a engenharia de proteínas, que engloba o conjunto de técnicas moleculares utilizadas para promover mutações e produzir biocatalisadores otimizados e resistentes a estas condições. O presente projeto visa obter uma lipase altamente termoestável capaz de ser utilizada sob condições rigorosas presentes em alguns processos industriais conciliando as três alternativas metodológicas citadas: uso de extremoenzimas, imobilização e principalmente, a evolução dirigida. Sendo o principal objetivo deste projeto a construção de uma biblioteca de mutantes através da técnica de error prone PCR e simultaneous saturation mutagenesis (evolução dirigida) com a finalidade de se obter ao menos um mutante com elevada estabilidade à temperatura, proporcionando a produção de um biocatalisador com grande potencial de aplicação biotecnológica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / Marcelo Victor Holanda Moura - Integrante / RAFAEL ALVES DE ANDRADE - Integrante / CRISTIANE DINIS ANO BOM - Integrante / GABRIELA COELHO BRÊDA - Integrante / Letícia Dobler - Integrante / Juliana Meneguete - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  Produção de PDO(1,3 Propanodiol) a partir da glicerina por rota biotecnológica: Avaliação de biocatalisadores e otimização de processos por engenharia metabólica., Descrição: O projeto trata da produção 1,3 propanodiol a partir da glicerina por rota biotecnológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / Denise Maria Guimarães Freire - Integrante / Bianca Cruz Neves - Integrante / Maria Alice Zarur Coelho - Integrante., Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  Obstáculos Epistemológicos no Ensino de Ciências, Descrição: O presente projeto tem como objetivo central estudar a ação dos mais diferentes obstáculos epistemológicos, resgatando a contribuição do epistemólogo francês Gaston Bachelard, no ensino de ciências. Temos dado atenção especial a influência da teleologia, do vitalismo e antropomorfismo no ensno de Química, Bioquímica e Biologia. Além disso, o referencial teórico tem sido usado em crítica ao ensino de "Funções Inorgânicas", bem como suporte de materiais didáticos audio-descritos para o ensino de química para cegos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / Ariane Leites Larentis - Integrante / LÚCIO AYRES CALDAS - Integrante / MANUEL GUSTAVO LEITÃO RIBEIRO - Integrante / Marcelo Hawrylak Herbst - Integrante / FABIANE P MARTINS - Integrante / CRISTIANA DE BACELOS PASSINATO - Integrante.

• 2007 - 2010

  Produção da Esterase (Pf2001) de Pyrococcus furiosus por Fermentação no Estado Sólido, Descrição: Com este projeto pretende-se obter cepas bacterianas modificadas geneticamente capazes de produzir a esterase de Pyrococcus furiosus por Fermentação no Estado Sólido, de forma constitutiva (sem a necessidade de indutores químicos) e estável (com o mínimo possível de pressão seletiva), utilizando rejeitos agroindustriais como meio de cultivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Coordenador / Denise Maria Guimarães Freire - Integrante / Bianca Cruz Neves - Integrante / Talitha Cruz Cardoso - Integrante / Carolina Vasconcelos Barreto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Universidade Federal do Rio de Janeiro - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

• 2007 - Atual

  Desenvolvimento de biocatalisadores com tecnologia nacional visando a obtenção de bioprodutos de interesse da indústria do petróleo: Produção e imobilização de lipases., Descrição: O projeto propõe a produção e imobilização de lipases, utilizando tecnologia nacional.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Integrante / Denise Maria Guimarães Freire - Coordenador / Melissa Estrada Gutarra - Integrante / Fernando Araripe Torres - Integrante., Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro.

• 2007 - Atual

  Síntese de Fármacos e Intermediários Utilizando Lipases e Esterases, Descrição: Lipases e esterases são enzimas extensamente utilizadas em síntese orgânica. Este projeto tem como objetivo estudar a síntese enanciosseletiva de fármacos e intermediários utilizando estas enzimas como catalisadores.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Integrante / Denise Maria Guimarães Freire - Coordenador / Aline G. Cunha - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2006 - 2015

  Imobilização da Esterase (Pf2001) de Pyrococcus furiosus em suportes com diferentes graus de hidrofobicidade, Descrição: Este projeto tem como objetivo principal o estudo da imobilização da esterase (Pf2001) de Pyrococcus furiosus em suportes com diferentes graus de hidrofobicidade, visando a determinação de parâmetros da cinética e das isotermas de adsorção, hiperativação e também a purificação da enzima. Com isto espera-se estar contribuindo para o desenvolvimento de um biocatalisador mais robusto para síntese orgânica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rodrigo Volcan Almeida - Integrante / Denise Maria Guimarães Freire - Coordenador / Roberta Vieira Branco - Integrante., Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios