Vanessa Simão de Almeida

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Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• BLÜMCKE, INGMAR CORAS, ROLAND BUSCH, ROBYN M. MORITA'SHERMAN, MARCIA LAL, DENNIS PRAYSON, RICHARD CENDES, FERNANDO LOPES'CENDES, ISCIA ROGERIO, FABIO ALMEIDA, VANESSA S. ROCHA, CRISTIANE S. SIM, NAM SUK LEE, JEONG HO KIM, SE HOON BAULAC, STEPHANIE BALDASSARI, SARA ADLE'BIASSETTE, HOMA WALSH, CHRISTOPHER A. BIZZOTTO, SARA DOAN, RYAN N. MORILLO, KATHERINE S. ARONICA, ELEONORA MÜHLEBNER, ANGELIKA BECKER, ALBERT CIENFUEGOS, JESUS , et al. GARBELLI, RITA GIANNINI, CATERINA HONAVAR, MRINALINI JACQUES, THOMAS S. THOM, MARIA MAHADEVAN, ANITA MIYATA, HAJIME NIEHUSMANN, PITT SARNAT, HARVEY B. SÖYLEMEZOGLU, FIGEN NAJM, IMAD ; Toward a better definition of focal cortical dysplasia: An iterative histopathological and genetic agreement trial. EPILEPSIA (COPENHAGEN. ONLINE) , v. 62, p. 1416-1428, 2021.

• DANTAS, G. P. M. ; CARDOSO, C. M. ; MILO, A. C. M. ; CASTRO, L. T. ; ALMEIDA, V.S. ; SANTOS, F. R. ; OLIVEIRA, L. R. ; CRESPO, E. ; FRERE, E. ; MILLIONES, A. ; GONZALEZ ; MORGANTE, J. S. ; VIANNA, J. A. . Demographic history of the Magellanic Penguin (Spheniscus magellanicus) on the Pacific and Atlantic coasts of South America. JOURNAL OF ORNITHOLOGY , v. 159, p. 643-655, 2018.

• AVANSINI, SIMONI H. ; TORRES, FÁBIO R. ; VIEIRA, ANDRÉ S. ; DOGINI, DANYELLA B. ; ROGERIO, FABIO ; COAN, ANA C. ; MORITA, MARCIA E. ; GUERREIRO, MARILISA M. ; YASUDA, CLARISSA L. ; SECOLIN, RODRIGO ; CARVALHO, BENILTON S. ; BORGES, MURILO G. ; ALMEIDA, VANESSA S. ; ARAÚJO, PATRÍCIA A. O. R. ; QUEIROZ, LUCIANO ; CENDES, FERNANDO ; LOPES-CENDES, ISCIA . Dysregulation of NEUROG2 plays a key role in focal cortical dysplasia. ANNALS OF NEUROLOGY , v. 83, p. 623-635, 2018.

• DANTAS, G. P. M. ; ALMEIDA, V.S. ; MARACINI, P. ; SERRA, S. D. ; CHAME, M. ; LABARTHE, N. ; KOLESNIKOVAS, C. ; SICILIANO, S. ; MATIAS, C. A. R. ; MOURA, J. F. ; E.CAMPOS, S. D. ; MADER, A. ; SERAFINI, P. P. . Evidence for northward extension of the winter range of magellanic penguins along the Brazilian coast. MARINE ORNITHOLOGY , v. 41, p. 195-197, 2013.

• BRUNO, D. C. F. ; DONATTI, A. ; MARTINS, M. ; ALMEIDA, V.S. ; GERALDIS, J. C. ; OLIVEIRA, F. S. ; DOGINI, D. B. ; LOPES-CENDES, I. . Circulating nucleic acids in the plasma and serum as potential biomarkers in neurological disorders. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (on line) , 2020.

• ALMEIDA, V.S. ; AVANSINI, S. H. ; BORGES, M. ; TORRES, F. R. ; ROGERIO, F. ; CARVALHO, B. S. ; TEDESCHI, H. ; GHIZONI, E. ; YASUDA, C. L. ; CENDES, F. ; LOPES-CENDES, I. T. . Searching for somatic mutations in focal cortical dysplasia using next generation sequencing. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• ALMEIDA, V.S. ; AVANSINI, S. H. ; TORRES, F. R. ; ROGERIO, F. ; CARVALHO, B. S. ; CANTO, A. M. ; GHIZONI, E. ; TEDESCHI, H. ; YASUDA, C. L. ; CENDES, F. ; LOPES-CENDES, I. T. . MOSAICISMO SOMÁTICO NAS DISPLASIAS CORTICAIS FOCAIS. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• S. R. Rogatto ; ALMEIDA, V.S. ; H. Kuasne . INTEGRATIVE GENE AND MIRNAS EXPRESSION ANALYSIS IN HPV NEGATIVE ORAL LEUKOPLAKIAS. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DANTAS, G. P. M. ; ALMEIDA, V.S. ; CARDOSO, C. M. ; MILO, A. C. M. ; MORGANTE, J. S. . Variabilidade genética de gaivotões (Larus Dominicanus) atraves de SNPs na Costa Brasileira. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  IDENTIFICAÇÃO DE MUTAÇÕES ASSOCIADAS ÀS DISPLASIAS CORTICAIS FOCAIS UTILIZANDO ABORDAGENS GENÔMICAS, Descrição: As epilepsias constituem um dos grupos de doenças neurológicas graves mais frequentes, afetando de 1,5 -2% da população mundial. Diversos tipos de malformações do desenvolvimento cortical (MDC) podem causar epilepsia e estão frequentemente associados à ocorrência de crises refratárias, incluindo a Displasia Cortical Focal (DCF). Esta se caracteriza por alterações citoarquiteturais observadas em outras MDC, como na Esclerose Tuberosa (ET) e na Hemimegaencefalia (HME). Recentemente, foi demonstrada a relação entre ET, HME e mutações em mosaicismo. A identificação de mutações em estado de mosaicismo somático pode contribuir para o entendimento de doenças complexas, no entanto estas alterações não são detectadas pelo sequenciamento de Sanger. Sendo assim, a possibilidade de detectá-las pelas técnicas de sequenciamento de nova geração (NGS) representa uma nova perspectiva para a utilização desta tecnologia. Portanto, o principal objetivo deste projeto é investigar se mutações em estado de mosaicismo somático podem estar presentes nas DCF. Para tal, utilizaremos como estratégia o Deep Sequencing por NGS. Será sequenciado o DNA genômico de tecidos cerebrais provenientes de cirurgia ressectiva de pacientes com DCF e do sangue periférico desses mesmos pacientes, para aferir se o mosaicismo que por ventura for encontrado é restrito ao Sistema Nervoso Central. A captura das regiões de interesse a serem sequenciadas será realizada com o kit Nextera Custom Enrichment Kit (Illumina) e as reações de NGS serão realizadas em um Hiseq2500. Utilizaremos a estratégia do sequenciamento completo do exoma humano (WES). Além disso, como o WES não é a técnica de escolha para identificar alterações estruturais utilizaremos microarrays de citogenética molecular (CytoScanHD) para identificar a presença de variações no número de cópias (CNVs) nessas mesmas amostras. Esperamos com este projeto contribuir para o melhor entendimento da etiologia genética das DCFs e identificar os mecanismos moleculares possivelmente envolvidos nas DCFs e nos mecanismos de desenvolvimento do córtex cerebral.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vanessa Simão de Almeida - Integrante / Fabio Rossi Torres - Integrante / Iscia Teresinha Lopes-Cendes - Coordenador.

• 2015 - 2016

  Investigation of Copy Number Variations in Patients with Malformations of Cerebral Cortex and Epilepsy Syndromes, Descrição: Copy Number Variations (CNVs) are the most frequent class of genomic structural variant in humans and are associated with neurologic diseases. In order to investigate the role of CNVs in Malformations of Cerebral Cortex (MCC) and Epilepsy Syndromes as well as in healthy individuals, a genomic screening using a high resolution SNP-array platform (CytoScan HD, Affymetrix Genotyping Console) will be performed in a cohort of 608 patients and 200 control samples.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vanessa Simão de Almeida - Integrante / Fabio Rossi Torres - Integrante / Iscia Teresinha Lopes-Cendes - Coordenador.

• 2012 - 2013

  LESÕES PRECURSORAS DO CÂNCER ORAL E DA OROFARINGE, Descrição: O comportamento biológico das lesões orais e de orofaringe e o seu potencial para sofrerem transformação maligna é pouco conhecido. Há um número muito limitado de estudos que buscam a identificação de marcadores moleculares de avaliação de risco de progressão tumoral. Neste estudo foram selecionadas amostras de lesões orais não malignas, analisadas para a expressão gênica global e amostras pareadas de leucoplasias e tecido normal contralateral para a expressão global de microRNAs. Em adição, foram realizadas meta-análises utilizando dados da literatura para selecionar candidatos para serem confirmados por RT-qPCR. Foram feitas análise de agrupamento hierárquico não supervisionado dos casos de lesões, análise supervisionada dos casos de leucoplasias, e comparações destes casos quanto ao hábito tabagista e etilista. Obtivemos 13 miRNAs com expressão diminuída nas leucoplasias. Seis deles foram selecionados (FDR <0,08) para a análise in silico (TargetScan) sendo identificados 1.688 genes alvos candidatos para serem regulados por esses miRNAs. A análise integrada entre a expressão de transcritos e miRNAs revelou 131 genes com expressão aumentada regulados pelos seis miRNAs com expressão diminuída (hsa-miR-191, hsa-miR-940, hsa-miR-1228, hsa-miR-1234, hsa-miR-1238 e hsa-miR-4313). A meta-análise mostrou concordância com 71 genes e dois miRNAs diferencialmente expressos. Três miRNAs (hsa-miR-191, hsa-miR-1228 e o hsa-miR-4313) e sete genes (CARD8, CASP10, ZNF784, MADCAM1, MADD, TERT e SOX4) foram selecionados para confirmação dos achados. Foi observado aumento significativo da expressão dos transcritos MADD (p = 0,042) e ZNF784 (p = 0,009) confirmando os resultados obtidos na análise de expressão global dos transcritos, e todos os miRNAs foram confirmados com diminuição significativa de expressão. Os demais genes avaliados não apresentaram resultados significativos embora a maioria mantivesse o sentido esperado da expressão quando comparados com o tecido normal contralateral. Neste estudo, foram detectados potenciais marcadores moleculares em leucoplasias, porém devido ao número limitado de casos, alguns transcritos não foram confirmados, o que reforça a continuidade destas análises.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Vanessa Simão de Almeida - Integrante / Silvia Regina Rogatto - Coordenador / Hellen Kuasne - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2009 - 2011

  Pingüins de Magalhães como um modelo em estudos de genética da conservação: Variabilidade genética, filogeografia e mudanças climáticas., Descrição: Resumo O Pingüim de Magalhães é uma espécie do gênero Sphenicus, que apresenta distribuição reprodutiva desde a Ilha de Chiloé no Chile, até a Costa Central da província de Rio Negro na Argentina, incluindo as Ilhas Malvinas. Nos meses de inverno eles migram para o norte do Oceano Atlântico pegando carona na Corrente das Malvinas, chegando até a costa Brasileira. Nos últimos anos estão chegando até a costa dos estados da Bahia, Alagoa e Pernambuco. Há poucos estudos genéticos desses pinguins, se tornando essencial aumentar o conhecimento visando compreender a diversidade genética e a taxa de migração dos indivíduos. Para isso, este trabalho analisou 200 sequências do gene citocromo b e Dloop do DNA mitocondrial de Pinguins de Magalhães de colônias da Argentina, do Chile e de pinguins que chegaram ao Brasil. Foram feitas análises nos programas DNAsp, Arlequin e NetWork, e foi encontrado uma grande diversidade haplotípica e nucleotídica, não apresentando diferenciação populacional entre as colônias estudadas. Os pinguins que chegam ao Brasil são provenientes das colônias Argentinas, porém não foi possível identificar uma colônia fonte. Os testes de neutralidade mostraram que essas populações se encontram em expansão. Apesar dessa espécie não ser considerada como ameaçada a extinção, 28 das 63 colônias dos Pinguins de Magalhães estão incluídas em áreas protegidas e pouco sabemos sobre a dinâmica de migração e conectividade dessas colônias.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vanessa Simão de Almeida - Integrante / Dra. GISELE PIRES DE MENDONÇA DANTAS - Integrante / Dr. JOÃO STENGHEL MORGANTE - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Prêmios