Jader Maikol Caldonazzo Garbelini
Possui doutorado em Ciência da Computação pela Universidade Federal do Paraná (UFPR), mestrado em Bioinformática pela Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR) e graduação em Sistemas de Informação pelo Centro Universitário Filadélfia. Possui experiência como professor nos cursos de Ciência da Computação na Universidade Estadual do Paraná e Universidade Tecnológica Federal do Paraná. No momento, trabalha como tutor em cursos de pós-graduação na Cogna Educação, nas áreas de Inteligência Computacional, Inteligência Artificial, Machine Learning. Atua como pesquisador nas área de Bioinformática e Biologia Computacional, em particular no estudo de motifs biológicos.
Informações coletadas do Lattes em 20/07/2024
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Informática
2020 - 2024
Universidade Federal do Paraná
Título: APRENDIZADO NÃO SUPERVISIONADO EM GENÔMICA FUNCIONAL: CONSTRUINDO MODELOS PROBABILÍSTICOS ATRAVÉS DA EXPLORAÇÃO DO ESPAÇO DE K-MERS EMPREGANDO OTIMIZAÇÃO DETERMINÍSTICA PARA DESCOBERTA DE MOTIFS BIOLÓGICOS EM LARGA ESCALA
Aurora Trinidad Ramirez Pozo. Coorientador: Danilo Sipoli Sanches. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Mestrado em Bioinformática
2015 - 2017
Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Título: Abordagem baseada em algoritmos meméticos para descoberta de motivos biológicos, Ano de Obtenção: 2017
Danilo Sipoli Sanches.Coorientador: André Yoshiaki Kashiwabara. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: motivos; algoritmos evolutivos; algoritmos memeticos; heurísticas; sítios de ligação dos fatores de transcrição.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
Especialização em andamento em MBA em Ciência de Dados
2024 - Atual
Inst. de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo
Orientador: Francisco Louzada Neto
Graduação em Sistemas de Informação
2010 - 2014
Centro Universitário Filadélfia
Título: Uso de cloud computing como ferramenra de produtividade nas empresas
Orientador: Moisés Fernando Lima
Formação complementar
2023 - 2023
Bayesian Statistics: Mixture Models. (Carga horária: 21h). , University of California, UCSC, Estados Unidos.
2023 - 2023
Mathematics for Machine Learning: Linear Algebra. (Carga horária: 18h). , Imperial College London, ICL, Grã-Bretanha.
2023 - 2023
University of California San Diego. (Carga horária: 15h). , UNIVERSITY CALIFORNIA SAN DIEGO, UCSD, Estados Unidos.
2022 - 2022
Bayesian Statistics: Techniques and Models. (Carga horária: 30h). , University of California, UCSC, Estados Unidos.
2021 - 2021
Bayesian Statistics: From Concept to Data Analysis. (Carga horária: 20h). , University of California, UCSC, Estados Unidos.
2019 - 2019
Java Servlet: autenticação, autorização e o padrão MVC. (Carga horária: 14h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Java e JSF 2 - II: Componentes ricos com Primefaces. (Carga horária: 12h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Java e JSF 2 - III: Integração com CDI. , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Improving Deep Neural Networks: Hyperparameter Tuning and Regularization. (Carga horária: 25h). , DeepLearning.AI, DLAI, Estados Unidos.
2019 - 2019
Java e JSF I: Sua aplicação web com JSF2. (Carga horária: 20h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
JAX-WS: domine a criação de webservices SOAP. (Carga horária: 16h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Structuring Machine Learning Projects. (Carga horária: 2019h). , DeepLearning.AI, DLAI, Estados Unidos.
2019 - 2019
EJB: O poder da Java EE. (Carga horária: 15h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Neural Networks and Deep Learning. (Carga horária: 25h). , DeepLearning.AI, DLAI, Estados Unidos.
2019 - 2019
Java e JSTL: Tags para facilitar o desenvolvimento JSP. (Carga horária: 6h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2019 - 2019
Java Servlet: programação web Java. (Carga horária: 10h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2017 - 2017
JAX-RS e Jersey: domine a criação de webservices REST. (Carga horária: 12h). , Alura Ensino Online, AL, Brasil.
2014 - 2014
Furukawa Certifield Professional. (Carga horária: 40h). , Softsell, SS, Brasil.
2010 - 2010
Introdução à lógica de programação. (Carga horária: 8h). , Centro Universitário Filadélfia, UNIFIL, Brasil.
2004 - 2004
Academia local Cisco - módulo II. (Carga horária: 64h). , Platin, PLATIN, Brasil.
2003 - 2003
Administração de sistemas Linux. (Carga horária: 40h). , IAPEC, IAPEC, Brasil.
2003 - 2003
Administrador de redes. (Carga horária: 70h). , People Computação, PEOPLE, Brasil.
2002 - 2002
Academia local Cisco - módulo I. (Carga horária: 64h). , Platin, PLATIN, Brasil.
2002 - 2002
Lógica de programação. (Carga horária: 30h). , Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - PR, SENAC/PR, Brasil.
2002 - 2002
Linux. (Carga horária: 40h). , Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - PR, SENAC/PR, Brasil.
2001 - 2001
Introdução à redes e Windows NT. (Carga horária: 40h). , Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - PR, SENAC/PR, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Teleinformática.
Organização de eventos
GARBELINI, J. M. C. . SEMANA DA COMPUTAÇÃO (SECOMP 2022). 2022. (Outro).
GARBELINI, J. M. C. . SEMANA DA COMPUTAÇÃO (SECOMP 2021). 2021. (Outro).
GARBELINI, J. M. C. . SEMANA DA COMPUTAÇÃO (SECOMP 2022). 2022. (Outro).
Participação em eventos
15th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms (BIOINFORMATICS 2024). SMT: A High-Performance Approach for Counting Kmers. 2024. (Congresso).
XI Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS 2022). Towards a better understanding of heuristic approaches applied to the biological motif discovery. 2022. (Congresso).
5th Brazilian Conference on Intelligent System (BRACIS).Discovery Biological Motifs Using Heuristics Approaches. 2016. (Outra).
Workshop de Bioinformática.Discovery Biological Motifs Using Heuristics Approaches. 2016. (Outra).
II Simpósio de Inovação e Propriedade Intelectual.Descoberta de Motifs Utilizando Algoritmos Evolutivos Multiobjetivo. 2015. (Simpósio).
Workshop de Bioinformática.Descoberta de Motifs Utilizando Profile HMM e Algoritmos Genéticos. 2015. (Outra).
X-meeting.Motif Discovery Using Profile HMM and Evolutionary Algorithms. 2015. (Outra).
III Simpósio Nacional de Iniciação Científica. 2013. (Simpósio).
II Simpósio Nacional de Iniciação Científica da Unifil. 2012. (Simpósio).
Palestra SAP. 2012. (Encontro).
IBM DB2 Workshop for Oracle Professinals. 2011. (Outra).
I Simpósio Nacional de Iniciação Científica da Unifil. 2011. (Simpósio).
V Semana Empresarial e Tecnológica dos Cursos de Administração, Ciências Contábeis, Ciência da Computação, Sistemas de Informação e Logística. 2011. (Encontro).
Google: Soluções para Alavancar sua Marca. 2010. (Outra).
Hacker Ético. 2010. (Encontro).
IV Semana Empresarial e Tecnológica. 2010. (Encontro).
VII SECOMP - Seminário de Computação. 2010. (Seminário).
Participação em bancas
GARBELINI, J. M. C.. Comparação entre Algoritmos para Descoberta de Motifs Biológicos em Sequências de DNA. 2022 - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. Comparação entre o Controle de Banda no BRAS VS OLT. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. Reconhecimento de Padrões em Sequências de Inserção da Família IS4. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. Uso da Mineração de Processos na Análise de Genes da Família IS5. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. RECONHECIMENTO DE PLACAS DE VEÍCULOS POR MEIO DE IMAGENS. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. COMPARATIVO ENTRE AS TECNOLOGIAS DE ACESSO PARA ISPS: PROTOCOLOS PPPOE E IPOE. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. COMPARANDO A ALOCAÇÃO DE GIBBS COM LEMATIZAÇÃO DE VERBOS EM CLASSIFICAÇÃO DE TEXTOS USANDO MODELO DE ALOCAÇÃO LATENTE DE DIRICHLET. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. UTILIZAÇÃO DA METAHEURÍSTICA GRASP PARA O PROBLEMA DO CAIXEIRO COMPRADOR. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
GARBELINI, J. M. C.. Apoiando o Ensino de Operações de Frações Matemáticas por meio de um Jogo Digital. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana.
SANCHES, D. S.;GARBELINI, J. M. C.; DA SILVAROCHA, JOSIMAR. Algoritmo Evolutivo Híbrido Baseado Em Clusterização Aplicado Ao Problema De Roteamento De Veículos. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
SANCHES, D. S.;GARBELINI, J. M. C.; SAMPAIO, L. D. H.. Algoritmos Genéticos Híbridos Aplicados A Problemas De Sequenciamento. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia da Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
Orientou
Gestão E Governança De Tecnologia Da Informação; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Gestão E Governança De Tecnologia Da Informação) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Análise Das Teses E Dissertações Sobre Robótica Educacional No Âmbito Do Sistema De Ensino Brasileiro; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Robótica Educacional) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Análise De Vulnerabilidades E Ameaças Em Redes De Computadores; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Redes De Computadores) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Compliance Em Lgpd Para Pequenas E Médias Empresas; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Data Protection Officer - Dpo) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Análise De Sentimentos: Exploração De Técnicas De Análise De Dados Para Avaliar O Sentimento Em Postagens Em Redes Sociais; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Análise De Dados) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Aplicações De Inteligência Artificial Na Saúde; 2024; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Inteligência Artificial E Machine Learning) - Cogna Educação; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Gestão da informação nas casas legislativas em âmbito municipal - softwares para controle no processo legislativo; 2019; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em MBA em Gestão de Tecnologia da Informação) - Universidade Norte do Paraná; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
A LIDERANÇA FRENTE À INOVAÇÃO NA UTILIZAÇÃO DO MODELO SCRUM; 2019; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em MBA em Gestão de Tecnologia da Informação) - Universidade Norte do Paraná; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
DIFICULDADES DE SEGURANÇA E O USO DE APLICATIVOS BANCÁRIOS; 2019; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Gestão em Tecnologia da Informação) - Universidade Norte do Paraná; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Comparação entre Algoritmos para Descoberta de Motifs Biológicos em Sequências de DNA; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Comparação entre o Controle de Banda no BRAS VS OLT; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
COMPARATIVO ENTRE AS TECNOLOGIAS DE ACESSO PARA ISPS: PROTOCOLOS PPPOE E IPOE; na UNESPAR; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Vantagens e Desvantagens na Utilização do Protocolo MPLS em Provedores ISPS; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Aplicação de Boas Práticas Operacionais no Gerenciamento de Roteamento BGP DE SISTEMAS AUTÔNOMOS; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - UNESPAR - Campus Apucarana; Orientador: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini;
Produções bibliográficas
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GARBELINI, JADER M. CALDONAZZO ; SANCHES, DANILO S. ; POZO, AURORA T. RAMIREZ . biomapp::chip: large-scale motif analysis. BMC BIOINFORMATICS , v. 25, p. 128, 2024.
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MORAES, DEYVID HERIC ; SANCHES, DANILO SIPOLI ; DA SILVAROCHA, JOSIMAR ; GARBELINI, JADER MAIKOL CALDONAZZO ; CASTOLDI, MARCELO FAVORETTO . A novel multi-objective evolutionary algorithm based on subpopulations for the bi-objective traveling salesman problem. SOFT COMPUTING , v. 23, p. 1-12, 2018.
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CALDONAZZO GARBELINI, JADER M. ; KASHIWABARA, ANDRÉ Y. ; SANCHES, DANILO S. . Sequence motif finder using memetic algorithm. BMC BIOINFORMATICS , v. 19, p. 19:4-19:4, 2018.
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GARBELINI, J. M. C. ; SANCHES, DANILO S. ; POZO, AURORA TRINIDAD RAMIREZ . Towards a Better Understanding of Heuristic Approaches Applied to the Biological Motif Discovery. In: João Marcos Travassos Romano; Leonardo Tomazeli Duarte. (Org.). Brazilian Conference on Intelligent Systems. 1ed.Switzerland: Springer Nature, 2022, v. , p. 180-194.
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GARBELINI, JADER ; SANCHES, DANILO ; KASHIWABARA, ANDRÉ ; POZO, AURORA . SMT: A High-Performance Approach for Counting Kmers. In: 15th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, 2024, Rome. Proceedings of the 17th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, 2024. p. 545-552.
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GARBELINI, JADER M. CALDONAZZO ; SANCHES, DANILO SIPOLI ; POZO, AURORA TRINIDAD RAMIREZ . Expectation Maximization based algorithm applied to DNA sequence motif finder. In: 2022 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2022, Padua. 2022 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2022. p. 1-8.
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GARBELINI, JADER C. ; KASHIWABARA, ANDRÉ Y. ; SANCHES, DANILO S. . Discovery Motifs by Evolutionary Computation. In: the 2016, 2016, Denver. Proceedings of the 2016 on Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion - GECCO '16 Companion. p. 1463.
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GARBELINI, JADER M. CALDONAZZO ; KASHIWABARA, ANDRE YOSHIAKI ; SANCHES, DANILO SIPOLI . Discovery Biological Motifs Using Heuristics Approaches. In: 2016 5th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2016, Recife. 2016 5th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2016. p. 175.
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GARBELINI, JADER MAIKOL CALDONAZZO ; KASHIWABARA, A. Y. ; SANCHES, D. S. ; POZO, AURORA TRINIDAD RAMIREZ . SMT: A High-Performance Approach for Counting Kmers. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. . Introdução ao LaTeX. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. ; SANCHES, D. S. ; POZO, A. R. . Towards a better understanding of heuristic approaches applied to the biological motif discovery. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. . Introdução à Bioinformática. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. . De Novo Mo f Discovery. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. ; KASHIWABARA, A. Y. ; SANCHES, D. S. . Discovery Biological Motifs using Heuristics Approaches. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. ; KASHIWABARA, A. Y. ; SANCHES, D. S. . Aplicação de Abordagens Heurísticas na Descoberta de Motifs Biológicos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. ; KASHIWABARA, A. Y. ; SANCHES, D. S. . Descoberta de Motifs Utilizando Algoritmos Evolutivos Multiobjetivo. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GARBELINI, J. M. C. ; KASHIWABARA, A. Y. ; SANCHES, D. S. . Descoberta de Motifs Utilizando Algoritmos Evolutivos Multiobjetivo. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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GARBELINI, J. M. C. ; LIMA, M. F. . Uso de Cloud Computing como Ferramenta de Produtividade nas Empresas. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Outras produções
GARBELINI, J. M. C. . Sistema Onix. 2013.
Projetos de pesquisa
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2021 - Atual
Aplicação de hiper-heurísticas de seleção para a descoberta de motifs biológicos: um estudo de caso em problemas mono e multiobjetivo, Descrição: Hiper-heurísticas são abordagens de alto nível que surgiram para aumentar o grau de generalização em problemas de otimização combinatória. Isso é possível porque elas trabalham no espaço heurístico e não no espaço de soluções, diferentemente dos algoritmos clássicos que são construídos para resolver problemas específicos. Atualmente as pesquisas em hiper-heurísticas consistem em descobrir novos modelos que visam selecionar ou gerar heurísticas de baixo nível de maneira inteligente. Desta forma apresentamos neste trabalho o projeto de desenvolvimento de uma nova abordagem de hiper-heurística de seleção de aprendizado on-line. O algoritmo será testado primeiramente no problema de descoberta de motifs biológicos. Este é um importante problema da biologia que consiste na detecção de pequenos fragmentos de DNA, RNA ou aminoácidos com função celular bem definida. Duas abordagens de hiper-heurísticas serão investigadas: uma mono a outra multiobjetivo e seus resultados serão comparados com abordagens do estado da arte.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) . , Integrantes: Jader Maikol Caldonazzo Garbelini - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1
Prêmios
2016
Menção Honrosa pela apresentação do trabalho: Discovery Biological Motifs Using Heuristics Approaches, Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
2015
Menção Honrosa pela apresentação do trabalho: Motifs Discovery Using Profile HMM and Evolutionary Algorithms, Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
2013
Melhor aluno da turma de Sistema de Informação, Centro Universitário Filadélfia.
Histórico profissional
Experiência profissional
2019 - Atual
KrotonVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Tutor de pós-graduação, Carga horária: 30
2019 - 2023
UNESPAR - Campus ApucaranaVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40
Atividades
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10/2021
Conselhos, Comissões e Consultoria, Núcleo docente estruturante.,Cargo ou função, Participação no NDE do curso de ciência da computação.
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09/2019
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Segurança, Redes de computadores e sistemas distribuídos, Arquitetura e organização de computadores, Sistemas operacionais
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09/2019
Conselhos, Comissões e Consultoria, Colegiado de ciência da computação.,Cargo ou função, Membro do colegiado de ciência da computação da Universidade Estadual do Paraná.
2017 - 2018
Universidade Tecnológica Federal do ParanáVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40
Atividades
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03/2017 - 12/2018
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Algoritmos I e II, Arquitetura de software, Estrutura de dados, Gerenciamento de projeto de software, Lógica para computação, Programação orientada a objetos, Sistemas operacionais
2018 - 2019
Centro de Ensino Superior de MaringáVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor de TI no ensino superior, Carga horária: 4
2013 - 2013
Ministério Público FederalVínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20
2013 - 2016
SENAI - Departamento Regional do ParanáVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor
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