Jeroniza Nunes Marchaukoski

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• DA SILVA FILHO, ANTONIO CAMILO ; MARCHAUKOSKI, Jeroniza Nunes ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; DE JESUS SOARES MACHADO, DIOGO ; FADEL-PICHETH, CYNTIA MARIA TELLES ; PICHETH, GERALDO . Prediction and Analysis in silico of Genomic Islands in Aeromonas hydrophila. Frontiers in Microbiology , v. 12, p. 1-16, 2021.

• DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; VOYCEIK, RICARDO ; SANTOS DE MATTOS, LETÍCIA GRAZIELA COSTA ; KULIK, MARIANE GONÇALVES ; CAMARGO, JOSUÉ OLIVEIRA ; REPULA DE OLIVEIRA, ARYEL MARLUS ; DE LIMA NICHIO, BRUNO THIAGO ; MARCHAUKOSKI, Jeroniza Nunes ; DA SILVA FILHO, ANTONIO CAMILO ; GUIZELINI, DIEVAL ; ORTEGA, J. MIGUEL ; PEDROSA, FABIO O. ; RAITTZ, ROBERTO TADEU . SWeeP: representing large biological sequences datasets in compact vectors. Scientific Reports , v. 10, p. 91, 2020.

• DE LIMA NICHIO, BRUNO THIAGO ; DE OLIVEIRA, ARYEL MARLUS REPULA ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; SANTOS, LETICIA GRAZIELA COSTA ; LEJAMBRE, ALEXANDRE QUADROS ; VIALLE, RICARDO ASSUNÇÃO ; DA ROCHA COIMBRA, NILSON ANTÔNIO ; GUIZELINI, DIEVAL ; MARCHAUKOSKI, Jeroniza Nunes ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FABIO ; RAITTZ, ROBERTO TADEU . RAFTS3G: an efficient and versatile clustering software to analyses in large protein datasets. BMC BIOINFORMATICS , v. 20, p. 1-7, 2019.

• NICHIO, B. T. L. ; MARLUS, A. ; PIERRI, C. R. ; SANTOS, L. G. C. ; LEJAMBRE, A. Q. ; VIALLE, R. ; COIMBRA, N. ; GUIZELINI, D. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. . RAFTS3 G: an efficient and versatile clustering software to analyses in large protein datasets. BMC BIOINFORMATICS , v. 20, p. 10.1186/s128594, 2019.

• DA SILVA FILHO, ANTONIO CAMILO ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; GUIZELINI, DIEVAL ; DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO ; AUGUSTO, DIÔNATA WILLIAN ; DOS SANTOS-WEISS, IZABELLA CASTILHOS RIBEIRO ; MARCHAUKOSKI, Jeroniza Nunes . Comparative Analysis of Genomic Island Prediction Tools. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 1-20, 2018.

• NICHIO, BRUNO T. L. ; MARCHAUKOSKI, Jeroniza Nunes ; RAITTZ, ROBERTO TADEU . New Tools in Orthology Analysis: A Brief Review of Promising Perspectives. Frontiers in Genetics , v. 8, p. fgene.2017.0016, 2017.

• OTEMAIER, K. R. ; STEFFENS, M. B. R. ; RAITTZ, R. T. ; BRAWERMAM, A. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . Biosom: gene synonym analysis by self-organizing map. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 14, p. 1461-1468, 2015.

• GUIZELINI, DIEVAL ; SAIZAKI, PAULA M. ; COIMBRA, NILSON A. R. ; WEISS, VINICIUS A. ; FAORO, HELISSON ; SFEIR, MICHELLE Z. T. ; BAURA, VALTER A. ; MONTEIRO, ROSE A. ; CHUBATSU, LEDA S. ; SOUZA, EMANUEL M. ; CRUZ, LEONARDO M. ; PEDROSA, FABIO O. ; RAITTZ, ROBERTO T. ; MARCHAUKOSKI, JERONIZA N. ; STEFFENS, MARIA B. R. . Complete Genome Sequence of Herbaspirillum hiltneri N3 (DSM 17495), Isolated from Surface-Sterilized Wheat Roots. Genome Announcements , v. 3, p. e01288-15, 2015.

• RODRIGUES, B.N. ; STEFFENS, M.B.R. ; RAITTZ, R.T. ; SANTOS-WEISS, I.C.R. ; MARCHAUKOSKI, J.N. . Quantitative assessment of protein function prediction programs. Genetics and Molecular Research , v. 14, p. 17555-17566, 2015.

• DE SOUZA, V. ; PIRO, V. C. ; FAORO, H. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; CHICORA, V. K. ; GUIZELINI, D. ; WEISS, V. ; VIALLE, R. A. ; MONTEIRO, R. A. ; STEFFENS, M. B. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; CRUZ, L. M. ; CHUBATSU, L. S. ; RAITTZ, R. T. . Draft Genome Sequence of Herbaspirillum huttiense subsp. putei IAM 15032, a Strain Isolated from Well Water. Genome Announcements , v. 1, p. e00252-12-e00252-12, 2013.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDRINI, H. ; FIGUEIREDO, B. C. . Um ambiente de ensino e pesquisa para a área médica. SCPI, 2004.

• MARCHAUKOSKI, J. N. . A health care information system to Neonatology support. IEEE, 2002.

• Prado A. L. ; VOLANSKI W. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. ; RAITTZ, R. T. . Um Estudo Comparativo da Aplicação de Redes Neurais Artificiais na Liberação dos Exames de Perfil Lipídico e Glicemia em Jejum. In: 10th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2011, Fortaleza. 10th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2011.

• GUIZELINI, D. ; PEDROSA, F. O. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; RAITTZ, R. T. ; ALVES, G. M. . GENEBINGO: IDENTIFICAÇÃO DE GENES UTILIZANDO REDE NEURAL ARTIFICIAL. In: 10th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2011, Fortaleza. 10th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2011.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDRINI, H. ; FIGUEIREDO, B. C. . Uma Plataforma de Ensino e Pesquisa para a Área Médica. In: X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2006, Florianópolis. X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. São Paulo: Sociedade Brasileira de Informática em Saúde, 2006. p. 1-1676.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; A. Milanez Junior ; C.F. Geronasso ; PEDRINI, H. ; FIGUEIREDO, B. C. . Sistema de Áudio-Conferência para Educação a Distância na Área Médica. In: X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2006, Florianópolis. X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. São Paulo: Sociedade Brasileira de Informática em Saúde, 2006. p. 1-1676.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDRINI, H. ; FIGUEIREDO, B. C. . UM AMBIENTE DE ENSINO E PESQUISA PARA A ÁREA MÉDICA. In: IV Simpósio Catarinense de Processamento Digital de Imagens (IV SCPDI), 2004, Florianópolis. Anais do IV SCPDI. Florianópolis: UFSC, 2004. p. 1-106.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; SILVA, L. ; SUNYE, M. S. ; BELON, O. R. P. . Architecture for the construction of medical image databases, Proceedings of SPIE Medical Imaging 2003: PACS and Integrated Medical Information Systems: Design and Evaluation. In: SPIE Medical Imaging 2003: PACS and Integrated Medical Information Systems: Design and Evaluation, 2003, San Diego. Proceedings of SPIE Medical Imaging 2003: PACS and Integrated Medical Information Systems: Design and Evaluation. San Diego: SPIE Press, 2003. v. 5033. p. 130-138.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; SUNYE, M. S. ; BELON, O. R. P. ; SILVA, L. ; CAT, M. M. N. ; GORGA, C. N. . A Health Care Information System for Neonatology Support. In: 15th International Conference on Systems Computer Based - CBMS 2002, 2002, Maribor. 15th International Conference on Systems Computer Based - CBMS 2002, 2002. p. 29-34.

• Prado A. L. ; VOLANSKI W. ; TAPETY, D. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . Sistema para Liberação de Resultados com Aprendizagem. In: 38 Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínic, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 60-60.

• VOLANSKI W. ; Prado A. L. ; TAPETY, D. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . Novo Paradigma Laboratorial: Redes Neuronais como Segunda Opinião. In: 38 Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 66-66.

• VOLANSKI W. ; Prado A. L. ; TAPETY, D. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . Interação Homem-Máquina: Sistema de Interface Gráfica para Urinálise. In: Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 57-57.

• TAPETY, D. ; VOLANSKI W. ; Prado A. L. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . SAEDIG: Sistema Computacional Aplicado para o Cadastro e Acompanhamento de Gestantes Diabéticas. In: 38 Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 59-59.

• VOLANSKI W. ; Prado A. L. ; RAITTZ, R. T. ; TAPETY, D. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . Efeito do Estresse na Validação de Resultado de Urinálise. In: 38 Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 214-214.

• VOLANSKI W. ; TAPETY, D. ; RAITTZ, R. T. ; Prado A. L. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PICHETT, G. . SAD: Software Inteligente com Aprendizagem Baseada em Exemplo para Sistema de Apoio à Decisão. In: Congresso Brasileiro de Análises Clínicas. 11 Congresso Brasileiro de Citologia Clínica, 2011, Rio de Janeiro. Sociedade Brasileira de Análises Clínicas, 2011. p. 58-58.

• MORENO, L.F. ; WILLEMANN, G. M. ; STEFFENS, M. B. R. ; KADOWAKI, M. A. S. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . sRNATool: A Tool applied for predicting noncoding RNAs in Herbaspirillum seropedicae SmR1. In: First International Workshop on Bioinformatics, 2010, 2010, CURITIBA - PR. First International Workshop on Bioinformatics, 2010, 2010.

• GUIZELINI, D. ; PEDROSA, F. O. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; RAITTZ, R. T. . BioQuery Builder: A query designer for biological databases. In: X-Meeting 2012, 2012, Campinas - SP. X-Meeting 2012, 2012. v. 1. p. 1.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. ; ALVES, J. H. . EVINCI - Estudos preliminares da aplicação das técnicas e Banco de Dado e Mineração de Dados Genômicos em Repositórios de Dados Biológicos Públicos. In: EVINCI 2012, 2012, CURITIBA - PR. EVINCI 2012. CURITIBA: UFPR, 2012. v. 1. p. 1.

• RODRIGUES, B. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . Similarity and dissimilarity between predict protein function systems: a quantitative assessment. In: X-Meeting 2012, 2012, Campinas - SP. X-Meeting 2012, 2012. v. 1. p. 1.

• GUIZELINI, D. ; PEDROSA, F. O. ; TIBAES, J. H. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; SOUZA, E. M. ; RAITTZ, R. T. . jContigSort: a new computer application for contigs ordering. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio), 2011, 2011, Florianópolis. th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio), 2011 Abstract book, 2011.

• TIBAES, J. H. ; RAITTZ, R. T. ; VIALLE, R. ; GUIZELINI, D. ; SOUZA, E. M. ; STEFFENS, M. B. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. . A NEW COMPUTATIONAL TOOL TO IDENTIFY ANNOTATION DIVERGENCE IN BACTERIAL GENOME SEQUENCES. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio), 2011, Florianópolis. 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio) Abstract book, 2011.

• SILVEIRA, L. ; GUIZELINI, D. ; PEDROSA, F. O. ; RAITTZ, R. T. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; TIEPPO, E. ; SOUZA, E. M. . jTrim: a new computer application for DNA sequence trimming. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio), 2011, Florianópolis. 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compuational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmerican Society for Bioinformatics (SolBio) Abstract book, 2011.

• OTEMAIER, K. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. ; STEFFENS, M. B. R. . ARTIFICIAL INTELLIGENCE APPLIED TO THE STANDARDIZATION OF THE NOMENCLATURE OF GENES. In: X-meeting 2011 - 7th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011, Florianóplos. X-meeting 2011 - 7th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011 - 7th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011, Florianóplos. X-meeting 2011 - 7th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and ComputationAbstract book, 2011.

• MORENO, L.F. ; GOMES, R. A. C. ; STEFFENS, M. B. R. ; WILLEMANN, G. M. ; KADOWAKI, M. A. S. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . EVINCI - ESTUDO DE ESTRUTURAS SECUNDÁRIAS DE SMALL-RNA PRESENTES NA BACTÉRIA HERBASPIRILLUM SEROPEDICAE SmR1. In: EVINCI 2011, 2011, CURITIBA - PR. EVINCI 2011. CURITIBA: UFPR, 2011. v. 1. p. 1.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; STEFFENS, M. B. R. ; Willemann, G M ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. ; RAITTZ, R. T. ; MORENO, L.F. . PREDICTION OF SMALL RNAS IN Herbaspirillum seropedicae THROUGH COMPUTATIONAL APPROACH. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz do Iguaçu. Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010.

• SOARES, L. F. S. ; TIEPPO, E. ; STEIN, L. ; Gehlen M A C ; PICHETT, G. ; HASS, I. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . Análise Eletroforética em Géis Unidimensionais: Nova Abordagem Focada em Inteligência Artificial e Estudo Comparativo de Soluções. In: VI Workshop de Visão Computacional, 2010, Presidente Prudente. . In: VI Workshop de Visão Computacional, 2010, Presidente Prudente. VI Workshop de Visão Computacional. Presidente Prudente: Workshop de Visão Computacional, 2010. v. 1. p. 49-49.

• Gehlen M A C ; RIGO, L. U. ; PEDROSA, F. O. ; TIEPPO, E. ; GUIZELINI, D. ; STEIN, L. ; CARDOSO, R. ; CRUZ, L. M. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . Development of a Comprehensive nif Gene Database. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010, Búzios. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010.

• TIEPPO, E. ; TIBAES, J. H. ; Gehlen M A C ; GUIZELINI, D. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; OLIVEIRA, L. F. ; SOUZA, E. M. . Effect of Coverage Depth on de novo Bacterial Genome Assembly Using Short Read. In: X-meeting 2010 - 6th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. In: X-meeting 2010 - 6th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.

• GUIZELINI, D. ; Gehlen M A C ; TIEPPO, E. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . File Fingerprinting: A New Methodology for Reduces Time and Complexity Updating and Synchronization of Local Database with the NCBI Genbank. In: . X-meeting 2010 - 6th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. . In: X-meeting 2010 - 6th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.

• CARDOSO, R. ; RAITTZ, R. T. ; TIEPPO, E. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. ; MONTEIRO, R. A. ; FAORO, H. ; WASEN, R. ; BAURA, V. ; CRUZ, L. M. . Herbaspirillum Rubrisubalbicans Genome Sequencing.. In: 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010.

• TIEPPO, E. ; OLIVEIRA, L. F. ; CARDOSO, R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; FARINELLI, L. ; LEMOS, E. G. M. ; SOUZA, J. A. M. ; SOUZA, E. M. . Genome Draft of Bradyrhizobium Elkanii. In: 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010.

• Gehlen M A C ; RIGO, L. U. ; CRUZ, L. M. ; TIEPPO, E. ; OLIVEIRA, L. F. ; SOUZA, E. M. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; GUIZELINI, D. ; RAITTZ, R. T. . A New Biological Data Mining Strategy Based on Blast Results using Artificial Neural Networks and Biopython. In: 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010.

• GUIZELINI, D. ; PEDROSA, F. O. ; STEFFENS, M. B. R. ; Gehlen M A C ; TIEPPO, E. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . File Fingerprinting: A New Methodology for Reduces Time, Complexity Updating and Synchronization of Local Database with the NCBI Genbank. In: 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010, Curitiba. 1st International Workshop in Bioinformatics, 2010.

• MORENO, L.F. ; WILLEMANN, G. M. ; STEFFENS, M. B. R. ; KADOWAKI, M. A. S. ; MARCHAUKOSKI, J. N. . EVINCI - ESTUDO IN SILICO COMPARATIVO DE ESTRUTURAS PRIMÁRIA E SECUNDÁRIA DE RNAs CURTOS DA BACTÉRIA Herbaspirillum seropedicae. In: EVINCI, 2010, CURITIBA - PR. EVINCI 2010. CURITIBA: UFPR, 2010. v. 1. p. 1.

• Gehlen M A C ; STEIN, L. ; TIEPPO, E. ; HASS, I. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; RAITTZ, R. T. . AUTOMAÇÃO DO PROCESSO DE INTERPRETAÇÃO DE GÉIS DE ELETROFORESE IN SILICO UTILIZANDO ALGORITMOS GENÉTICOS E OUTRAS TÉCNICAS DE INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL.. In: EVINCI - Encontro de Iniciação Científica da UFPR, 2008, CURITIBA. 16 EVINCI - Encontro de Iniciação Científica da UFPR. CURITIBA: Gráfica da UFPR, 2008. v. 1. p. 237-237.

• MARCHAUKOSKI, J. N. ; SUNYE, M. S. . Princípios para a Construção de Banco de Dados de Imagens Médicas. In: XXX Congresso Brasileiro de Radiologia, 2001, Curitiba. XXX Congresso Brasileiro de Radiologia. São Paulo: Radiologia Brasileira, 2001. v. 34. p. 59-59.

• SOUZA, V. ; PIRO, V. C. ; FAORO, H. ; TANDRA-SFEIR, Michelle Z. ; CHICORA, V. K. ; GUIZELINI, D. ; WEISS, V. A. ; VIALLE, R. ; MONTEIRO, R. A. ; STEFFENS, M. B. R. ; MARCHAUKOSKI, J. N. ; PEDROSA, F. O. ; CRUZ, L. M. ; CHUBATSU, L. S. ; RAITTZ, R. T. . Herbaspirillum huttiense subsp. putei IAM 15032, whole genome shotgun sequencing project GenBank: ANJR00000000.1 2012 (Depósito de Sequencias Genomicas) 2012 (Depósito de Sequencias Genomicas).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  PROJETOS DE INOVAÇÃO EM ASSISTÊNCIA À SAÚDE - PIAS, Descrição: Este projeto visa pesquisar tecnologias de inovação aplicadas à promoção saúde e qualidade de vida humana, integrando as tecnologias da Bioinformática, Computação Afetiva e Biomedicina. Assim, o presente estudo procura minimizar a carência na área da saúde por inovações metodológicas que apliquem tecnologias de ponta, como Inteligência Artificial e Internet das Coisas, com bom custo benefício. Como resultado desta pesquisa novas concepções serão construídas: bases de conhecimento, técnicas de pré-diagnóstico e pós-diagnóstico e ferramentas de aplicação. Além da produção científica, este projeto viabiliza a formação de massa crítica e cientistas nestas novas áreas de pesquisa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Coordenador / Dieval Guizelini - Integrante / Luiz Antônio Pereira Neves - Integrante / Alessandro Brawermam - Integrante / RAITTZ, ROBERTO TADEU - Integrante / ELSA SANTOS LIMA - Integrante / GUSTAVO SCHWANKA - Integrante / Caroline Mazetto Mendes - Integrante / Eduardo Juliano Alberti - Integrante / Camila Pereira Perico - Integrante.

• 2019 - Atual

  Inteligência Artificial aplicada à Bioinformática da fixação biológica do nitrogênio, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Roberto Tadeu Raittz em 25/06/2020., Descrição: Tendo em vista que o volume de dados de sequencias genéticas depositadas nos bancos de dados públicos cresce exponencialmente (DOOLITTLE, 1990), é fato que existe a necessidade de desenvolvimento de ferramentas e algoritmos de Bioinformática que atendam às demandas das pesquisas científicas atuais. O grupo de pesquisa de IA aplicada à Bioinformática, da UFPR, dispõe de potencial computacional e parcerias científicas importantes que favorecem execução de empreendimentos colaborativos. Mediante esta afirmação, este projeto propõe o desenvolvimento de estratégias computacionais de mineração de dados (Data mining) conjuntamente com estratégias de mineração de textos (text mining) para obter um novo potencial para melhoria da capacidade de análise de informações de textos científicos, genômica e proteômica referentes à fixação biológica do nitrogênio.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Coordenador / Fábio de Oliveira Pedrosa - Integrante / GUIZELINI, DIEVAL - Integrante / FAORO, HELISSON - Integrante / SOUZA, EMANUEL M. - Integrante / DE PIERRI, CAMILLA REGINATTO - Integrante / DE LIMA NICHIO, BRUNO THIAGO - Integrante / DE OLIVEIRA, ARYEL MARLUS REPULA - Integrante / Diogo Machado de Jesus - Integrante.

• 2013 - 2022

  Biologia Computacional - Rede de Cooperação Acadêmica para o Estudo e Desenvolvimento de Ferramentas para a Genômica Estrutural e Funcional, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Berenice Reynaud Steffens em 17/03/2014., Descrição: Objetivo Geral: Fortalecer e ampliar o intercâmbio acadêmico entre os programas interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e da USP (5), o de Genética e Biologia Molecular da UFPA (CAPES 5) e o de Bioinformática da UFPR (CAPES 3). Áreas Temáticas do Projeto: a) Desenvolvimento de algoritmos para mineração, análise funcional e visualização de sistemas biológicos; análise e interpretação de dados gerados pelas tecnologias de alto desempenho nas áreas de genômica, transcriptômica, proteômica, metagênomica e metabolômica; B) Modelagem e simulação de sistemas e redes biológicas (redes de interações proteína-proteína,redes metabólicas, redes de fatores de transcrição, redes de sinalização e afins); C)Desenvolvimento de tecnologias WEB para armazenamento e processamento de informações biológicas D) Desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais e matemáticos para modelagem molecular e simulação de estruturas de proteínas; E) Estudos de evolução molecular, filogenômica e comparação de genomas em larga escala; F) Desenvolvimento e aplicação de métodos e sistemas computacionais e matemáticos para caracterização de sequências nucleotídicas e protéicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (30) Doutorado: (30) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Integrante / LEONARDO MAGALHAES CRUZ - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Integrante / Fábio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Maria Berenice Reynaud Steffens - Coordenador / Alexandre Gori de Castilho - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1

• 2011 - 2016

  Bioinformática aplicada à proteômica e à genômica estrutural e funcional PROCAD UFPR UFMG, Descrição: OBJETIVO GERAL: Desenvolvimento de ferramentas e metodologias computacionais aplicados à genômica estrutural e funcional, montagem e análise de dados de genomas, e aplicação no sequenciamento e anotação de genomas bacterianos. Para a execução deste projeto os parceiros dos dois Programas da área de genômica estrutural e funcional identificarão metodologias e softwares de Bioinformática já disponíveis e/ou a serem implementados e/ou aperfeiçoados. Os parceiros também atuarão na construção de uma Base de Dados e Conhecimento na área de genômica estrutural e funcional, além de participarem da análise de dados genômicos e na geração de novos conhecimentos na área. Os recursos e conhecimentos desenvolvidos serão compartilhados pelos grupos envolvidos. As ferramentas desenvolvidas serão testadas em dois genomas bacterianos a serem sequenciados por membros do Programa de Bioinformática da UFPR.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (20) Doutorado: (20) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / Roberto Tadeu Raittz - Integrante / LEONARDO MAGALHAES CRUZ - Integrante / Emanuel Maltempi de Souza - Coordenador / Fábio de Oliveira Pedrosa - Integrante / Maria Berenice Reynaud Steffens - Integrante / Geraldo Pichett - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 10

• 2011 - Atual

  Banco de Dados e Mineração de Dados em Bioinformática, Descrição: Modelagem de dados biológicos complexos definindo arquiteturas de banco de dados para o gerenciamento de grandes volumes de informação e estratégias de mineração de dados objetivando contribuir com a geração de novos conhecimentos no campo das Ciências Biológicas e suas várias áreas de aplicação como a saúde, o meio ambiente, o agronegócio, entres outras. Considerando as aplicações na área de tecnologia da saúde, existe um campo vasto de pesquisa, explorando as características fisiológicas, cognitivas e emocionais que produzem dados biológicos que representam padrões de doenças do ser humano. Desta forma, é possível estender a modelagem de dados biológicos desta pesquisa em aplicações de tecnologias para a saúde. Neste contexto, o uso da computação afetiva e outras aplicações voltadas à saúde com recursos tecnológicos, fazem parte do escopo desta, na geração de modelagem de dados biológicos também para minerar possíveis padrões de doenças.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (5) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Coordenador / Roberto Tadeu Raittz - Integrante / Dieval Guizelini - Integrante / Luiz Antônio Pereira Neves - Integrante / Cyntia Picheth - Integrante / Alessandro Brawermam - Integrante / ELSA SANTOS LIMA - Integrante / Juliana Helena Tibães - Integrante / Alexander Robert Kutzke - Integrante / GUSTAVO SCHWANKA - Integrante / Antonio Camilo - Integrante., Número de produções C, T & A: 21 / Número de orientações: 3

• 2009 - 2019

  Banco de Dados em Bionformática, Descrição: Modelagem de dados biológicos. Construção de bases de conhecimentos e recuperação dados biológicos. Construção de Sistema de Banco de Dados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Coordenador., Número de produções C, T & A: 11

• 2009 - 2011

  Sistema de Classificação de Bactérias por Redes Neuro-Fuzzy com Base em Características Extraídas das Seqüências de Genes de 16s rRNA utilizando SIBILA (Servidor de Redes Neurais), Descrição: Análise de seqüências de Genes de 16s rRNA para obtenção de características que possibilitem o treinamento de redes neurais. Treinamento de redes neurais para classificação filogenética de seqüências desconhecidas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2008 - 2019

  Telemedicina, Descrição: Projeto de áudio e vídeo conferência para área médica. Objetivo do projeto é desenvolver metodologia, software e aplicá-los a segunda opinião médica, integrando regiões do interior do Paraná e regiões no Mercosul aos especialistas do Hospital Pequeno Príncipe.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / Bonald Cavacante Figueiredo - Coordenador / LUCIANO ROSI MENGARELLI - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13

Projetos de desenvolvimento

• 2008 - 2010

  Software para comunicação em tempo real via internet e serviços de especialistas para comunicação a distância, Projeto certificado pela empresa MENGARELLI INFORMATICA LTDA - ME em 30/08/2017., Descrição: http://www.seti.pr.gov.br/arquivos/File/Chamada%20de%20projetos%20ETE%202008.pdf Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina, Rede de Professores, Rede Empresarial. Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina; Rede de Professores; Rede Empresarial. Este projeto propõe o uso comercial (excluindo venda de licença) do programa de computador (áudio-conferência em tempo real pela internet), cuja primeira versão foi concluída em 2006 (tese de doutorado) e a segunda em 2008 com apoio principal do Instituto de Pesquisa Pelé Pequeno Príncipe (IPPP). A busca de interação entre grupos de ensino, consultoria e assistência entre profissionais geograficamente distantes é crescente em todas as áreas, principalmente na Medicina. A possibilidade de envio de dados, sinais e imagens, bem como o monitoramento remoto em tempo real, permite que a informação circule rapidamente entre centros de referência e serviços distantes desprovidos de tecnologias modernas ou profissionais especializados. Um dos objetivos para uso deste programa (e de futuras versões) é manter uma rede de telemedicina (apenas de médico para médicos) para aproximar especialistas do Brasil com médicos generalistas localizados em áreas remotas e pobres do Brasil, Paraguai e outras localidades com baixo IDH. Clínicas, faculdades e outras entidades localizadas no interior, bem como empresas que atuam nas diversas áreas do comércio que desejam usar apenas salas personalizadas para uso exclusivo delas poderão participar. O que se espera da introdução desta tecnologia no mercado é a geração de serviços de qualidade de baixo custo para profissionais especializados, soluções rápidas para os receptores da informação veiculada por meio das salas virtuais, estágios para alunos da graduação e emprego para recém-formados. Com a colaboração do Centro de Genética Molecular e Pesquisa do Câncer em Crianças (CEGEMPAC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR), o IPPP estabeleceu uma rede de comunicação em tempo real pela internet. Esta tentativa (2006-2007) aconteceu ao nível da pesquisa e da assistência filantrópica, e muitas transmissões foram realizadas usando a primeira versão do sistema entre Curitiba e Instituições dos Departamentos (Estados) de Alto Paraná e Canindeyú do Paraguai. Esta rede disponibilizou áudio-conferência (som e imagem), mas não ganhou proporções maiores, nem mesmo pode continuar prestando os serviços nos alvos pretendidos (como começou) por não ter sido um projeto auto-sustentável.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / LUCIANO ROSI MENGARELLI - Integrante / Humberto C IBANEZ - Integrante / Bonald C. Figueiredo - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Outra.

• 2008 - 2010

  Software para comunicação em tempo real via internet e serviços de especialistas para comunicação a distância, Projeto certificado pela empresa MENGARELLI INFORMATICA LTDA - ME em 30/08/2017., Descrição: http://www.seti.pr.gov.br/arquivos/File/Chamada%20de%20projetos%20ETE%202008.pdf Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina, Rede de Professores, Rede Empresarial. Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina; Rede de Professores; Rede Empresarial. Este projeto propõe o uso comercial (excluindo venda de licença) do programa de computador (áudio-conferência em tempo real pela internet), cuja primeira versão foi concluída em 2006 (tese de doutorado) e a segunda em 2008 com apoio principal do Instituto de Pesquisa Pelé Pequeno Príncipe (IPPP). A busca de interação entre grupos de ensino, consultoria e assistência entre profissionais geograficamente distantes é crescente em todas as áreas, principalmente na Medicina. A possibilidade de envio de dados, sinais e imagens, bem como o monitoramento remoto em tempo real, permite que a informação circule rapidamente entre centros de referência e serviços distantes desprovidos de tecnologias modernas ou profissionais especializados. Um dos objetivos para uso deste programa (e de futuras versões) é manter uma rede de telemedicina (apenas de médico para médicos) para aproximar especialistas do Brasil com médicos generalistas localizados em áreas remotas e pobres do Brasil, Paraguai e outras localidades com baixo IDH. Clínicas, faculdades e outras entidades localizadas no interior, bem como empresas que atuam nas diversas áreas do comércio que desejam usar apenas salas personalizadas para uso exclusivo delas poderão participar. O que se espera da introdução desta tecnologia no mercado é a geração de serviços de qualidade de baixo custo para profissionais especializados, soluções rápidas para os receptores da informação veiculada por meio das salas virtuais, estágios para alunos da graduação e emprego para recém-formados. Com a colaboração do Centro de Genética Molecular e Pesquisa do Câncer em Crianças (CEGEMPAC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR), o IPPP estabeleceu uma rede de comunicação em tempo real pela internet. Esta tentativa (2006-2007) aconteceu ao nível da pesquisa e da assistência filantrópica, e muitas transmissões foram realizadas usando a primeira versão do sistema entre Curitiba e Instituições dos Departamentos (Estados) de Alto Paraná e Canindeyú do Paraguai. Esta rede disponibilizou áudio-conferência (som e imagem), mas não ganhou proporções maiores, nem mesmo pode continuar prestando os serviços nos alvos pretendidos (como começou) por não ter sido um projeto auto-sustentável.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / LUCIANO ROSI MENGARELLI - Integrante / Humberto C IBANEZ - Integrante / Bonald C. Figueiredo - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Outra.

• 2008 - 2010

  Software para comunicação em tempo real via internet e serviços de especialistas para comunicação a distância, Projeto certificado pela empresa MENGARELLI INFORMATICA LTDA - ME em 30/08/2017., Descrição: http://www.seti.pr.gov.br/arquivos/File/Chamada%20de%20projetos%20ETE%202008.pdf Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina, Rede de Professores, Rede Empresarial. Múltiplas salas com multiusuários: Rede de Telemedicina; Rede de Professores; Rede Empresarial. Este projeto propõe o uso comercial (excluindo venda de licença) do programa de computador (áudio-conferência em tempo real pela internet), cuja primeira versão foi concluída em 2006 (tese de doutorado) e a segunda em 2008 com apoio principal do Instituto de Pesquisa Pelé Pequeno Príncipe (IPPP). A busca de interação entre grupos de ensino, consultoria e assistência entre profissionais geograficamente distantes é crescente em todas as áreas, principalmente na Medicina. A possibilidade de envio de dados, sinais e imagens, bem como o monitoramento remoto em tempo real, permite que a informação circule rapidamente entre centros de referência e serviços distantes desprovidos de tecnologias modernas ou profissionais especializados. Um dos objetivos para uso deste programa (e de futuras versões) é manter uma rede de telemedicina (apenas de médico para médicos) para aproximar especialistas do Brasil com médicos generalistas localizados em áreas remotas e pobres do Brasil, Paraguai e outras localidades com baixo IDH. Clínicas, faculdades e outras entidades localizadas no interior, bem como empresas que atuam nas diversas áreas do comércio que desejam usar apenas salas personalizadas para uso exclusivo delas poderão participar. O que se espera da introdução desta tecnologia no mercado é a geração de serviços de qualidade de baixo custo para profissionais especializados, soluções rápidas para os receptores da informação veiculada por meio das salas virtuais, estágios para alunos da graduação e emprego para recém-formados. Com a colaboração do Centro de Genética Molecular e Pesquisa do Câncer em Crianças (CEGEMPAC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR), o IPPP estabeleceu uma rede de comunicação em tempo real pela internet. Esta tentativa (2006-2007) aconteceu ao nível da pesquisa e da assistência filantrópica, e muitas transmissões foram realizadas usando a primeira versão do sistema entre Curitiba e Instituições dos Departamentos (Estados) de Alto Paraná e Canindeyú do Paraguai. Esta rede disponibilizou áudio-conferência (som e imagem), mas não ganhou proporções maiores, nem mesmo pode continuar prestando os serviços nos alvos pretendidos (como começou) por não ter sido um projeto auto-sustentável.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jeroniza Nunes Marchaukoski - Integrante / LUCIANO ROSI MENGARELLI - Integrante / Humberto C IBANEZ - Integrante / Bonald C. Figueiredo - Coordenador., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Outra.