Manolo Fernandez Perez

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

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Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• Perez, Manolo F. ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; ROMEIRO'BRITO, MONIQUE ; FRANCO, FERNANDO F. ; Taylor, Nigel P. ; Zappi, Daniela C. ; Moraes, Evandro M. . Coalescent-based species delimitation meets deep learning: Insights from a highly fragmented cactus system. Molecular Ecology Resources , v. 22, p. 1016-1028, 2022.

• SOUZA, FERNANDO H. S. DE ; SASSI, FRANCISCO DE M. C. ; FERREIRA, PEDRO H. N. ; BERTOLLO, LUIZ A. C. ; EZAZ, TARIQ ; LIEHR, THOMAS ; Perez, Manolo F. ; CIOFFI, MARCELO B. . Integrating Cytogenetics and Population Genomics: Allopatry and Neo-Sex Chromosomes May Have Shaped the Genetic Divergence in the Erythrinus erythrinus Species Complex (Teleostei, Characiformes). BIOLOGY , v. 11, p. 315, 2022.

• KIRSCHNER, PHILIPP ; Perez, Manolo F. ; SANMARTÍN, ISABEL ; MARQUER, LAURENT ; SCHLICK-STEINER, BIRGIT C. ; ALVAREZ, NADIR ; ARTHOFER, WOLFGANG ; FRAJMAN, BO'O ; GAMISCH, ALEXANDER ; HILPOLD, ANDREAS ; PAUN, OVIDIU ; TRUCCHI, EMILIANO ; ZÁVESKÁ, ELI?KA ; STEINER, FLORIAN M. ; SCHÖNSWETTER, PETER . Congruent evolutionary responses of European steppe biota to late Quaternary climate change. Nature Communications , v. 13, p. 1921, 2022.

• SASSI, F. M. C. ; PEREZ, M. F. ; SILVA, M. A. ; KAVALCO, K. F. ; PASA, R. . Can geometric morphometrics work for species clusterization on the armored catfish Hypostomus Lacépède, 1803 (Siluriformes Loricariidae)?. Biodiversity Journal , v. 12, p. 147-153, 2021.

• FEGIES, ANA CLÁUDIA ; CARMIGNOTTO, ANA PAULA ; PEREZ, MANOLO FERNANDEZ ; GUILARDI, MARIANA DIAS ; LESSINGER, ANA CLÁUDIA . Molecular Phylogeny of Cryptonanus (Didelphidae: Thylamyini): Evidence for a recent and complex diversification in South American open biomes. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 162, p. 107213, 2021.

• SEMBER, ALEXANDR ; NGUYEN, PETR ; Perez, Manolo F. ; ALTMANOVÁ, MARIE ; RÁB, PETR ; CIOFFI, MARCELO DE BELLO . Multiple sex chromosomes in teleost fishes from a cytogenetic perspective: state of the art and future challenges. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES , v. 376, p. 20200098, 2021.

• DE M. C. SASSI, FRANCISCO ; Perez, Manolo F. ; OLIVEIRA, VANESSA CRISTINA S. ; DEON, GEIZE A. ; DE SOUZA, FERNANDO H. S. ; FERREIRA, PEDRO H. N. ; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL A. ; HATANAKA, TERUMI ; LIEHR, THOMAS ; BERTOLLO, LUIZ A. C. ; DE B. CIOFFI, MARCELO . High Genetic Diversity despite Conserved Karyotype Organization in the Giant Trahiras from Genus Hoplias (Characiformes, Erythrinidae). Genes , v. 12, p. 252, 2021.

• OLIVEIRA, E. ; PEREZ, M. F. ; BERTOLLO, LUIZ ANTONIO CARLOS ; GESTICH, C. ; RAB, P. ; SOUZA, F. ; VIANA, P. ; FELDBERG, E. ; OLIVEIRA, E. ; CIOFFI, MARCELO DE BELLO . Historical demography and climate driven distributional changes in a widespread Neotropical freshwater species with high economic importance. ECOGRAPHY , p. 1291-1304, 2020.

• OLIVEIRA, EZEQUIEL A. DE ; SASSI, FRANCISCO DE M. C. ; Perez, Manolo F. ; BERTOLLO, LUIZ A. C. ; RÁB, PETR ; EZAZ, TARIQ ; HATANAKA, TERUMI ; VIANA, PATRIK F. ; FELDBERG, ELIANA ; OLIVEIRA, EDIVALDO H. C. DE ; CIOFFI, MARCELO DE B. . Comparative cytogenetic survey of the giant bonytongue Arapaima fish (Osteoglossiformes: Arapaimidae), across different Amazonian and Tocantins/Araguaia River basins. Neotropical Ichthyology , v. 18, p. e200055, 2020.

• CIOFFI ; RÁB ; EZAZ ; BERTOLLO ; LAVOUÉ ; OLIVEIRA ; SEMBER ; MOLINA ; SOUZA ; MAJTÁNOVÁ ; LIEHR ; AL-RIKABI ; YANO ; VIANA ; FELDBERG ; UNMACK ; HATANAKA ; TANOMTONG ; PEREZ . Deciphering the Evolutionary History of Arowana Fishes (Teleostei, Osteoglossiformes, Osteoglossidae): Insight from Comparative Cytogenomics. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 20, p. 4296, 2019.

• SOUZA, ALLYSON SANTOS DE ; DIAS JÚNIOR, EURICO AZEVEDO ; PEREZ, MANOLO FERNANDEZ ; CIOFFI, MARCELO DE BELLO ; BERTOLLO, LUIZ ANTONIO CARLOS ; GARCIA-MACHADO, ERIK ; VALLINOTO, MARCELO NAZARENO SOUZA ; PEDRO MANOEL, GALETTI ; MOLINA, WAGNER FRANCO . Phylogeography and Historical Demography of Two Sympatric Atlantic Snappers: Lutjanus analis and L. jocu. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE , v. 6, p. 545, 2019.

• SOUZA ; PEREZ ; BERTOLLO ; OLIVEIRA ; LAVOUÉ ; GESTICH ; RÁB ; EZAZ ; LIEHR ; VIANA ; FELDBERG ; CIOFFI . Interspecific Genetic Differences and Historical Demography in South American Arowanas (Osteoglossiformes, Osteoglossidae, Osteoglossum). Genes , v. 10, p. 693, 2019.

• KHAN, GULZAR ; RIBEIRO, PAULIANNY M. ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; Perez, Manolo F. ; FRANCO, FERNANDO F. ; Moraes, Evandro M. . Weak population structure and no genetic erosion in Pilosocereus aureispinus: A microendemic and threatened cactus species from eastern Brazil. PLoS One , v. 13, p. e0195475, 2018.

• Perez, Manolo F. ; FRANCO, FERNANDO F. ; BOMBONATO, JULIANA R. ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; KHAN, GULZAR ; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE ; FEGIES, ANA C. ; RIBEIRO, PAULIANNY M. ; SILVA, GISLAINE A. R. ; Moraes, Evandro M. ; BURRIDGE, CHRIS . Assessing population structure in the face of isolation by distance: Are we neglecting the problem?. DIVERSITY AND DISTRIBUTIONS , v. 24, p. 1883-1889, 2018.

• KHAN, GULZAR ; GODOY, MARIANA O. ; FRANCO, FERNANDO F. ; Perez, Manolo F. ; Taylor, Nigel P. ; Zappi, Daniela C. ; Machado, Marlon C. ; Moraes, Evandro M. . Extreme population subdivision or cryptic speciation in the cactus Pilosocereus jauruensis ? A taxonomic challenge posed by a naturally fragmented system. SYSTEMATICS AND BIODIVERSITY , v. 1, p. 1-12, 2017.

• MIÑO, CAROLINA I. ; AVELAR, LUIZA H. DA SILVA ; DA SILVA, FAGNER M. ; Perez, Manolo F. ; MENEZES, LUIZA F. ; DEL LAMA, SILVIA N. . Genetic differentiation and historical demography of wood stork populations in Brazilian wetlands: Implications for the conservation of the species and associated ecosystems. AQUATIC CONSERVATION-MARINE AND FRESHWATER ECOSYSTEMS , v. 1, p. 1-12, 2017.

• FRANCO, FERNANDO FARIA ; JOJIMA, CECÍLIA LEIKO ; PEREZ, MANOLO FERNANDEZ ; ZAPPI, DANIELA CRISTINA ; TAYLOR, NIGEL ; MORAES, EVANDRO MARSOLA . The xeric side of the Brazilian Atlantic Forest: The forces shaping phylogeographic structure of cacti. Ecology and Evolution , v. 1, p. 1-7, 2017.

• Perez, Manolo F. ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; Moraes, Evandro M. ; CARSTENS, BRYAN C. . Model-based analysis supports interglacial refugia over long-dispersal events in the diversification of two South American cactus species. HEREDITY , p. 550-557, 2016.

• PERES, E. A. ; SOBRAL-SOUZA, T. ; PEREZ, M. F. ; BONATELLI, I. A. ; SILVA, D. P. ; SILVA, M. J. ; SOLFERINI, V. N. . Pleistocene Niche Stability and Lineage Diversification in the Subtropical Spider Araneus omnicolor (Araneidae). Plos One , v. 10, p. e0121543, 2015.

• GARRICK, R. C. ; BONATELLI, I. A. ; HYSENI, C. ; MORALES-GARCIA, A. E. ; PELLETIER, T. A. ; PEREZ, M. F. ; RICE, E. ; SATLER, J. D. ; SYMULA, R. E. ; THOME, M. T. C. ; CARSTENS, B. C. . The evolution of phylogeographic datasets. MOLECULAR ECOLOGY , v. 24, p. 1164-1171, 2015.

• PEREZ, M. F. ; CARSTENS, B. C. ; RODRIGUES, G. L. ; MORAES, E. M. . Anonymous nuclear markers data supporting species tree phylogeny and divergence time estimates in a cactus species complex in South America. Data in Brief , v. 6, p. 1-1, 2015.

• Perez, Manolo F. ; CARSTENS, BRYAN C. ; RODRIGUES, GUSTAVO L. ; Moraes, Evandro M. . Anonymous nuclear markers reveal taxonomic incongruence and long-term disjunction in a cactus species complex with continental-island distribution in South America. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 95, p. 11-19, 2015.

• BONATELLI, ISABEL A. S. ; Perez, Manolo F. ; PETERSON, A. TOWNSEND ; Taylor, Nigel P. ; Zappi, Daniela C. ; Machado, Marlon C. ; KOCH, INGRID ; PIRES, ADRIANA H. C. ; Moraes, Evandro M. . Interglacial microrefugia and diversification of a cactus species complex: phylogeography and paleodistributional reconstructions for Pilosocereus aurisetus and allies. MOLECULAR ECOLOGY , v. 23, p. 3044-3063, 2014.

• Moraes, Evandro M. ; Machado, Marlon C. ; Zappi, Daniela C. ; Perez, Manolo F. ; Téo, Mariana F. ; Taylor, Nigel P. . Cross-species amplification of microsatellites reveals incongruence in the molecular variation and taxonomic limits of the Pilosocereus aurisetus group (Cactaceae). Genetica ('s-Gravenhage) , v. 140, p. 277-285, 2012.

• PEREZ, M. F. ; Teo, M. F. ; Zappi, D. C. ; Taylor, N. P. ; MORAES, E. M. . Isolation, characterization, and cross-species amplification of polymorphic microsatellite markers for Pilosocereus machrisii (Cactaceae). American Journal of Botany , v. 98, p. e204-e206, 2011.

• Perez, M. F. ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; Franco, F. F. ; FEGIES, A. ; MORAES, E. M. . Structure by distance: poor population structure detection by unnacounted IBD can hinder conservation strategies. In: Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016, Santiago. Annals of the Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016.

• KHAN, G. ; PEREZ, M. F. ; ORTIZ, M. G. ; Moraes, Evandro M. . Extreme population subdivision or cryptic speciation in the cactus Pilosocereus jauruensis? A taxonomic challenge posed by a naturally fragmented system. In: Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016, Santiago. Analls of the Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016.

• Moraes, Evandro M. ; Perez, M. F. . Diversification drivers of a cactus species complex restricted to rocky savanna patches within the Cerrado landscape.. In: Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016, Santiago. Annals of the Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016.

• Moraes, Evandro M. ; Perez, M. F. . Diversification drivers of a cactus species complex restricted to rocky savanna patches within the Cerrado landscape.. In: Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016, Santiago. Annals of the Fifth Meeting for Neotropical Biogeography, 2016.

• PEREZ, M. F. ; MORAES, E. M. ; CARSTENS, B. C. . Next-Generation multiloci phylogegraphic structure in the Pilosocereus aurisetus (Cactaceae) species complex. In: 60º Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá. Anais do 60º Congresso Brasileiro de Genética, 2014.

• PEREZ, M. F. ; MORAES, E. M. . Microsatellite population structure in Pilosocereus machrisii (Cactaceae): a cactus species with natural patchy distribution in eastern tropical south america. In: 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia. Anais do 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011.

• TÉO, M. F. ; PEREZ, M. F. ; MORAES, E. M. . Cross-species amolification of Pilosocereus machrisii microsatellites within the Pilosocereus aurisetus group (Cactaceae)). In: 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia. Anais do 57º Congresso Brasileiro de Genética, 2011.

• PEREZ, M. F. ; MORAES, E. M. . Isolamento de Marcadores Microssatélites em Pilosocereus machrisii (Cactaceae). In: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. Anais do 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

• PEREZ, MANOLO FERNANDEZ . Assessing complex diversification processes in the Neotropics using deep learning demographic modeling. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• PEREZ, M. F. . Biogeography and evolution of bony-tongue fishes. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• PEREZ, M. F. ; BONATELLI, I. A. . Aprendendo sobre o Passado: O que os cactos de hoje nos contam sobre as mudanças climáticas históricas. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• TÉO, M. F. ; PEREZ, M. F. ; MORAES, E. M. . Análise da transferabilidade de marcadores de DNA microssatélite de Pilosocereus machrisii para as espécies do grupo Pilosocereus aurisetus. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• AMARAL, D. T. ; BONATELLI, I. A. ; PEREZ, M. F. ; DAVANÇO, P. V. ; LAGANARO, N. M. ; PEREIRA, G. H. S. ; RISSOLI, R. Z. ; OLIVATTO, L. M. . Degradação Ambiental, pequenas populações e estresse fisiológico em répteis. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2022 - Atual

  INCT - Biodiversidade e uso sustentável de Peixes Neotropicais, Descrição: O Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia da Biodiversidade e Uso Sustentável de Peixes Neotropicais é uma rede integrativa e colaborativa de diferentes grupos de pesquisa, empresas e outras organizações sociais, atuando em questões relevantes e interagindo com setores da sociedade, ampliando assim a fronteira do conhecimento e oferecendo soluções sistêmicas para a área. Esta proposta conta com 134 pesquisadores envolvendo docentes, bolsistas e técnicos de 27 universidades e institutos brasileiros e 22 instituições do exterior, com contribuição marcante para as diversas áreas do conhecimento relacionadas ao tema central desta proposta. Diversos eixos temáticos (ET) compõem esse instituto onde serão utilizadas abordagens integrativas para o avanço científico, caracterização e conservação da biodiversidade ictiológica Neotropical continental e marinha e o seu uso sustentável. Somados aos avanços científicos, os resultados servirão para embasar o estabelecimento de políticas públicas voltadas à conservação das espécies e desenvolvimento de novos produtos e tecnologias na aquicultura. Ademais, a presente proposta está completamente alinhada à Agenda 2030 da Organização das Nações Unidas (ONU) para acelerar os avanços em direção aos Objetivos do Desenvolvimento Sustentável (ODS). A formação de recursos humanos será também priorizada, possibilitando o treinamento de massa crítica de qualidade para a pesquisa e fomentando o ensino voltado à proteção e uso sustentável da biodiversidade. Além de agregar de forma articulada grupos de excelência em diversas áreas de conhecimento e estratégicas para um desenvolvimento sustentável, o instituto visa também incorporar outros agentes sociais, possibilitando assim uma interação com a sociedade pelo trabalho colaborativo com instituições não acadêmicas e escolas da educação básica. Tais ações permitirão difundir o conhecimento, além de fomentar o ensino e experiências que favoreçam a proteção da nossa biodiversidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / CIOFFI, MARCELO B. - Coordenador.

• 2021 - Atual

  Uma abordagem integrativa para a análise de processos dispersivos, adaptativos e evolutivos entre espécies relacionadas com distribuição intercontinental. A família Osteoglossidae (Teleostei, Osteoglossiformes) como modelo investigativo. Parte IV., Descrição: O presente projeto dará continuidade à temática de investigação da história evolutiva, a qual vem sendo abordada em nossos projetos anteriores aprovados pela FAPESP. Neste sentido, serão enfocadas problemáticas que ainda necessitam ser mais bem compreendidas, abrangendo questões biogeográficas e de dispersão de espécies entre diferentes continentes, as rotas de colonização utilizadas, bem como as consequências evolutivas decorrentes do isolamento geográfico e adaptação aos novos ambientes colonizados. A ordem Osteoglossiformes constitui um excelente material de estudo, visto que este grupo primitivo de teleósteos, embora restrito a ambientes de água doce, se encontra atualmente disperso em diferentes continentes. Representantes de uma de suasa famílias, os Osteoglossidae, serão particularmente investigados, considerando sua pertinência para os objetivos propostos. Conhecidos popularmente como aruanãs, os osteoglossídeos constituem um dos grupos mais emblemáticos de Osteoglossiformes, hoje distribuídos em diferentes países do Velho e do Novo Mundo. Destacam-se pela sua beleza e exuberância do padrão de coloração, o que resulta em cifras altíssimas por seus espécimes no comércio aquariofilista. Na América do Sul, particularmente na região amazônica, ocorrem duas espécies endêmicas, o aruanã prata (Osteoglossum bicirrhossum) e o aruanã preto (Osteoglossum ferrerai), enquanto na Ásia ocorrem linhagens distintas de Scleropages formosus, diferenciadas pela diversidade do padrão de coloraçãoido. Assim sendo, este grupo oferece uma oportunidade ímpar para investigações de genes que podem estar sendo submetidos à um processo de rápida evolução e seleção natural, como aqueles associados ao padrão de cor, permitindo colonizações bem-sucedidas em novos ambientes e o entendimento de como o genoma pode favorecer respostas adaptativas. Paralelamente, a reconstrução biogeográfica da diversificação desta família, com testes de hipóteses que potencialmente explicam a estreita relação filogenética de espécies distribuídas em diferentes continentes, possibilitará o entendimento do processo dispersivo ocorrido neste grupo. O efeito da deriva continental será avaliado e comparado com outras hipóteses que explicam os padrões de diversificação atualmente observados. Finalmente, análises citogenéticas acopladas à modelos de delimitação de espécies serão realizadas em 05 variantes de cor de Scleropages formosus (o aruanã asiático), buscando subsídios robustos, em nível cromossômico e genômico, que possam permitir investigar se destas variantes constituem espécies distintas, uma questão que ainda permanece em aberto nesse grupo. Serão utilizadas abordagens integrativas da citogenética molecular, biogeografia, genômica e transcriptômica, propiciando um embasamento mais robusto às propostas presentadas. Integrando este projeto encontra-se uma equipe composta por 09 grupos de pesquisa nacionais e internacionais, somando esforços para a sua viabilização, permitindo assim que os objetivos propostos sejam de fato atingidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / Marcelo Bello Cioffi - Coordenador / BERTOLLO, LUIZ ANTONIO CARLOS - Integrante / Fernando Souza - Integrante / OLIVEIRA, VANESSA CRISTINA S. - Integrante / LIEHR, THOMAS - Integrante / Francisco de Menezes Cavalcante Sassi - Integrante / Tariq Ezaz - Integrante / Ricardo Utsonomia - Integrante / A Tanomtong - Integrante / Renata LR Moraes - Integrante / Gustavo Akira Toma - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2018 - Atual

  Diversidade genética, biogeografia e evolução de peixes da ordem osteoglossiformes (Teleostei, osteoglossomorpha), Descrição: A ordem Osteoglossiformes representa uma das mais antigas linhagens de Teleósteos que, juntamente com sua ampla distribuição geográfica, torna este grupo um objeto importante para estudos sistemáticos, biogeográficos e evolutivos. Atualmente, espécies viventes dessa ordem são encontradas em diversos rios e lagos da América do Sul, África, Ásia e Austrália. Tal distribuição pode ter contribuído para a diversidade presente neste grupo, possivelmente devido à necessidade das espécies de se adaptarem aos diferentes ambientes onde ocorrem. Das 06 famílias atualmente descritas, 03 delas apresentam uma distribuição restrita ao continente Africano (Pantodontidae, Mormiridae e Gymnarchidae), enquanto que as outras 03 (Arapaimidae, Notopteridae e Osteoglossidae), se encontram distribuídas em distintos continentes. Considerando sua origem muito antiga (~ 227 milhões de anos), esse padrão atual de distribuição poderia ser decorrente de eventos vicariantes ocorridos após a divisão da Gondwana, ainda que o registro fóssil e estudos recentes que incorporam a datação molecular não suportem totalmente essa teoria. Dados citogenéticos e genômicos, além de escassos, são restritos a poucas espécies. Essa falta de dados está associada, entre outros fatores, à sua ampla distribuição, com grupos endêmicos de diferentes continentes, dificultando um estudo integrativo que permite uma visão globalizada de seu processo evolutivo. Assim, o presente projeto busca avaliar a variabilidade genética presente na ordem Osteoglossiformes pelo emprego do sequenciamento de nova geração de regiões associadas a Elementos Ultra Conservados (EUCs) e de marcadores DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing). Esses marcadores serão utilizados em uma ampla amostragem de representantes de todas as famílias da ordem Osteoglossiformes e serão utilizados para inferir se a diversificação de espécies próximas, atualmente presentes em continentes diferentes, se deram antes ou após a fragmentação dos mesmos por meio de dispersões marinhas de ancestrais atualmente extintos. Também serão realizadas análises de delimitação de espécies para as variantes de cor de Scleropages formosus (aruanã asiático), as quais podem corresponder a possíveis espécies distintas. Além disso, a história filogeográfica da espécie Arapaima gigas (pirarucu) será estudada com maior detalhe, a partir do desenvolvimento de modelos evolutivos que serão testados com metodologias recentes de análise filogeográfica. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de pesquisadores de todos os 05 continentes, somando esforços para a investigação que está sendo proposta e garantindo assim a sua exequibilidade.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / Marcelo Bello Cioffi - Integrante.

• 2017 - Atual

  Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica na ordem osteoglossiformes (Teleostei: osteoglossomorpha). Parte II, Descrição: A ordem Osteoglossiformes possui pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um modelo ímpar para a integração de estudos cromossômicos e biogeográficos. Entretanto, os dados cromossômicos em Osteoglossiformes são ainda escassos e restritos a poucas espécies. O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2014/23172-4), enfocando a biogeografia e a evolução cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Especificamente em relação às famílias Arapaimidae e Notopteridae, nossos resultados anteriores destacaram uma grande variação cromossômica intrafamiliar, dando abertura para investigações genômicas e populacionais avançadas, aprofundando assim o conhecimento de suas inter-relações evolutivas. Assim sendo, em continuidade ao projeto inicial, objetivamos agora estudos inéditos na família Gymnarchidae e adicionais nas famílias Notopteridae e Arapaimidae. Para tanto, serão utilizadas abordagens de Citogenética Classica (coloração convencional e bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA, hibridização genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP) com sondas obtidas a partir de procedimentos de microdissecção cromossômica. Adicionalmente, será dado um passo significativo para a prospecção da variabilidade genética presente nas famílias investigadas pelo emprego do sequenciamento de nova geração DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), altamente informativo e ainda inédito entre os peixes. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de pesquisadores de 05 países distintos, onde todos os 05 continentes encontram-se representados, somando esforços para a investigação que está sendo proposta e garantindo assim a sua exequibilidade. Os dados a serem obtidos constituirão uma base sólida para a continuidade dos estudos com as demais famílias de Osteoglossiformes, a fim de viabilizar uma ampla abordagem cromossômica nesta ordem, sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade. O modelo investigativo propiciado por este grupo, associado à sua ampla distribuição geográfica e à sua posição basal na filogenia dos peixes, fazem dele um importante objeto para estudos sistemáticos e evolutivos, possibilitando dimensionar o impacto da fragmentação dos continentes na sua história evolutiva, evidenciada ao nível de sua constituição cromossômica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / Marcelo Bello Cioffi - Coordenador / Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / Orlando Moreira Filho - Integrante / Eliana Feldberg - Integrante / Terumi Hatanaka - Integrante.

• 2015 - 2017

  Filogenia de Pilosocereus (Cactaceae) e delimitação de espécies no grupo Pilosocereus aurisetus baseado em modelos de coalescência e dados multiloco, Descrição: O recente desenvolvimento de novos métodos probabilísticos baseados no modelo coalescente de multiespécies tem possibilitado o teste de hipóteses sobre a delimitação de espécies mesmo em grupos que se originaram recentemente, com tênue distinção morfológica entre as linhagens e complexa variação geográfica entre populações. Entre os gêneros de Cactaceae mais diversos no Brasil, Pilosocereus abriga 41 espécies reconhecidas e é subdividido em cinco grupos taxonômicos informais com base em agrupamentos morfológicos e geográficos. Entre esses grupos, P. aurisetus abriga oito espécies restritas aos enclaves de campos rupestres no centro e leste do Brasil que mostram uma intrincada história filogeográfica com diversificação recente, presença de linhagens crípticas e uma taxonomia de difícil tratamento formal. A partir de uma base de dados obtidos por sequenciamento massivo de segmentos associados a sítios de restrição (Rad-Seq) em uma amostra inter e intraespecífica no grupo P. aurisetus, nós desenvolvemos e validamos in silico e in vitro uma série de locos nucleares anônimos e de microssatélites úteis para estudos filogenéticos e filogeográficos no gênero Pilosocereus. Na presente proposta nós utilizaremos esses marcadores para: 1) investigar as relações filogenéticas e a composição de espécies nos grupos taxonômicos informais do gênero Pilosocereus; 2) utilizar uma abordagem coalescente de delimitação de espécie para investigar a diversidade taxonômica na linhagem filogenética relacionada com o grupo P. aurisetus. Os resultados desse estudo serão utilizados para fazer recomendações explícitas para tratamentos taxonômicos formais que certamente serão necessários para alcançar um arranjo taxonômico que reflita acuradamente a diversidade do grupo de espécies estudado.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / Zappi, D. C. - Integrante / Evandro Marsola de Moraes - Coordenador / BONATELLI, ISABEL A. S. - Integrante.

• 2013 - 2017

  FILOGEOGRAFIA DE NOVA GERAÇÃO DO GRUPO DE CACTÁCEAS PILOSOCEREUS AURISETUS: TESTE DE HIPÓTESES E DESENVOLVIMENTO DE MARCADORES NUCLEARES, Descrição: A contribuição dos ciclos paleoclimáticos do Quaternário e dos eventos geomorfológicos do Neogeno na diversificação de espécies Neotropicais tem sido um tema recorrentemente debatido na literatura. Tais eventos podem ter moldado o padrão atual de distribuição disjunta dos enclaves xéricos no Domínio Cerrado, de forma que essas manchas de vegetação podem ser relictos de uma distribuição mais ampla no passado. Entretanto, estudos com táxons associados a essas áreas são extremamente escassos, dificultando a compreensão da história de diversificação nesses locais. Em parte essa escassez se deve a pouca disponibilidade de marcadores moleculares com sinal filogenético adequado para espécies vegetais relacionadas e com divergência recente. As Cactaceae pertencentes ao grupo PILOSOCEREUS AURISETUS apresentam distribuição associada a esses enclaves no nordeste, centro-oeste e sudeste do Brasil. O histórico taxonômico desse grupo é extremamente instável, refletindo a complexidade da variação morfológica nas espécies. No presente projeto serão isolados marcadores nucleares anônimos para o grupo P. AURISETUS a partir de dados genômicos de Sequenciamento de Nova Geração. Esses marcadores nucleares serão utilizados sobre uma amostragem extensiva de todo o espectro de variação taxonômica e morfológica das espécies do grupo. Os dados genômicos também serão utilizados diretamente para testar algumas hipóteses levantadas em estudos anteriores sobre a história de diversificação dessas espécies.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / Evandro Marsola de Moraes - Coordenador / Bryan C. Carstens - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2010 - 2012

  Estudo da estrutura genética da espécie de cactácea colunar Pilosocereus machrisii utilizando DNA microssatélite., Descrição: Estudos de estrutura genética em espécies com populações disjuntas e restritas são importantes, pois esse padrão de distribuição pode diminuir a diversidade genética dentro das populações e aumentar a diferenciação genética entre elas. A partir da utilização de metodologias atuais empregando análises bayesianas e de máxima verossimilhança é possível realizar inferências sobre a contribuição relativa de fatores atuais e históricos que moldaram a atual estrutura genética de uma espécie. No presente projeto pretende-se realizar um estudo sobre a diversidade genética e estrutura populacional da espécie de cactácea Pilosocereus machrisii. Essa espécie possui distribuição naturalmente fragmentada na região leste do Brasil, com suas populações restritas aos enclaves de vegetação seca no domínio Cerrado. A partir dos resultados obtidos serão realizadas inferências sobre a história demográfica dessas populações, verificando sinais sobre alterações históricas em sua distribuição e no nível de conexão entre elas. Os resultados deste estudo contribuirão para o andamento de um projeto mais amplo que possui como objetivos principais investigar a história evolutiva e a estrutura filogeográfica de um grupo de espécies filogeneticamente relacionadas à P. machrisii utilizando DNA microssatélite nuclear e sequências nucleotídicas do genoma do cloroplasto.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / E. M. Moraes - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2008 - 2009

  Isolamento de Locos de DNA Microssatélite nas Quatro Espécies de Cactaceae Relacionadas à Pilosocereus aurisetus, Descrição: O grupo de espécies de cactáceas relacionadas à Pilosocereus aurisetus é formado por quatro espécies de cactos colunares (P. aurisetus, P. machrisii, P. vilaboensis e P. aureispinus) cuja distinção taxonômica é definida com base em características morfológicas. A distribuição geográfica das quatro espécies é fragmentada, ocorrendo em áreas de afloramento rochoso com vegetação de campos rupestres nas regiões nordeste, sudeste e centro-oeste do Brasil. No presente projeto foi realizado o isolamento de locos de DNA microssatélite a partir da construção de uma biblioteca genômica parcial enriquecida. Os resultados deste estudo contribuirão para o andamento de um projeto mais amplo denominado ?Estudo filogeográfico do grupo de espécies relacionadas à P. aurisetus (cactaceae) utilizando DNA microssatélite nuclear e sequências nucleotídicas do genoma do cloroplasto?.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manolo Fernandez Perez - Integrante / E. M. Moraes - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Prêmios