Edoardo Estevam de Oliveira Lobl

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Organização de eventos

Participação em eventos

Comissão julgadora das bancas

Foi orientado por

Produções bibliográficas

• LOBL, E. E. O. ; SALVARANI, M. ; CARROCINI, G. C. S. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . A rede social e a linguagem visual como mecanismo de propagação da Bioética. In: V Encontro Sobre Ciências, Popularização da Ciência e Alfabetização Cienífica, 2013, São José do Rio Preto. Anais do V Encontro Sobre Ciências, Popularização da Ciência e Alfabetização Cienífica, 2013. p. 92-94.

• VALENCIO, L. F. S. ; BARBERINO, W. M. ; FIALHO, T. A. S. ; SALVARANI, M. ; LOBL, E. E. O. ; GRACIANI, R. D. ; ROSAN, D. B. A. ; CARROCINI, G. C. S. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . Ensino da Bioética para as Ciências Biológicas: a Contribuição de uma Liga Acadêmica. In: IV Encontro de Bioética, 2013, São Paulo. Caderno de Resumo do IV Encontro de Bioética, 2013. p. 17-20.

• LOBL, E. E. O. ; OLIVEIRA, T. Y. K. ; VIEIRA, C. ; CARARETO, C. M. A. . Annotation of transposable elements on Drosophila mojavensis and its sister-species D. arizonae. In: X Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila, 2017, Ouro Preto. Anais do X Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila, 2017. p. 63-63.

• VALENCIO, L. F. S. ; LOBL, E. E. O. ; CARROCINI, G. C. S. ; EVORA, G. B. ; MORENO, J. G. ; SILVA, M. P. ; TAMBONES, I. L. ; FERREIRA, G. S. V. ; SALVARANI, M. ; GRACIANI, R. D. ; FIALHO, T. A. S. ; WEGMANN, R. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . GRUPO DE ESTUDOS E DISCUSSÕES EM BIOÉTICA - GEDBIOÉTICA. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VALENCIO, L. F. S. ; BARBERINO, W. M. ; FIALHO, T. A. S. ; SALVARANI, M. ; LOBL, E. E. O. ; GRACIANI, R. D. ; ROSAN, D. B. A. ; CARROCINI, G. C. S. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . Ensino de Bioética para as Ciências Biológicas: a Contribuição de uma Liga Acadêmica. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• LOBL, E. E. O. ; SALVARANI, M. ; CARROCINI, G. C. S. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . A REDE SOCIAL E A LINGUAGEM VISUAL COMO MECANISMO DE PROPAGAÇÃO DA BIOÉTICA. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• BARBERINO, W. M. ; OLIVEIRA, R. G. ; GUIMARAES, F. D. ; SILVA, P. A. M. ; AMARAL, F. S. R. ; VALENCIO, L. F. S. ; FIALHO, T. A. S. ; SALVARANI, M. ; LOBL, E. E. O. ; GRACIANI, R. D. ; ROSAN, D. B. A. ; CARROCINI, G. C. S. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . O USO DE ANIMAIS NO ENSINO E PESQUISA. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VALENCIO, L. F. S. ; SALVARANI, M. ; LOBL, E. E. O. ; BARBERINO, W. M. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . GRUPO DE ESTUDOS E DISCUSSÕES EM BIOÉTICA NA UNIVERSIDADE: EXPERIÊNCIA DE IMPLEMENTAÇÃO. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VALENCIO, L. F. S. ; SALVARANI, M. ; BARBERINO, W. M. ; LOBL, E. E. O. ; BONINI-DOMINGOS, C. R. . GRUPO DE EXTENSÃO EM BIOÉTICA: IMPORTÂNCIA NA FORMAÇÃO ACADÊMICA. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2017 - 2019

  Anotação e caracterização de elementos de transposição no genoma de Drosophila mojavensis e de sua espécie irmã D. arizonae, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Claudia Marcia Aparecida Carareto em 07/12/2017., Descrição: Elementos de transposição (TEs) são sequências de DNA repetitivas capazes de se moverem a partir de um local para outro no genoma e a capacidade replicativa dessas sequências é a essência de seu sucesso evolutivo. O presente estudo buscou compreender a diversidade dos TEs e sua classificação hierárquica em genomas sequenciados para este estudo e públicos, de Drosophila mojavensis (genoma público-r1.04 e genomas das linhagens 22 e 01) e da espécie irmã D. arizonae (genoma público-pub e da linhagem 17). Foi utilizado o pipeline TEdenovo presente no suíte de aplicativos REPET para a identificação dos TEs e o software Repeatmasker para a anotação dos mesmos. As sequências identificadas foram classificadas até em nível de família por meio de análises filogenéticas, como também foi estimado o grau de divergência das cópias anotadas por meio da análise de landscape. O conteúdo de TEs variou entre os genomas (D. mojavensis r1.04: 16,6%, 22: 5,5% e 01: 7,5%; D. arizonae pub: 5,4% e 17: 6,4%). Em todos os genomas analisados, as superfamílias Gypsy, BEL, Jockey e R1 são as mais representativas dentre os elementos de Classe I, enquanto que dentre os elementos de Classe II destacam-se as superfamílias hAT, Mariner/Tc1, P e Helitrons. Em D. mojavensis r1.04, 13% dos TEs encontram-se em regiões gênicas ou próximos a genes, dos quais 11,6% correspondem a elementos Gypsy, dentre os TEs de Classe I, e 17,4% a elementos hAT, dentre os elementos de Classe II, concordante com a distribuição genômica. Utilizando o genoma de D. navojoa como grupo externo, demonstrou-se que a divergência do conjunto de TEs é congruente com a divergência entre as espécies. Este estudo enfatiza que a anotação de TEs é um processo bastante afetado pelas metodologias utilizadas, desde o sequenciamento e montagem dos genomas, até as próprias ferramentas e banco de dados utilizados no processo de anotação. Independente dessas limitações, a caracterização da composição de TEs de um genoma é etapa essencial para entendimento dos possíveis papéis que desempenham na evolução das espécies que os abrigam.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Edoardo Estevam de Oliveira Lobl - Integrante / Claudia Marcia Aparecida Carareto - Coordenador / Thiago Yukio Kikuchi Oliveira - Integrante / Cristina Vieira - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2016 - 2017

  Anotação e Caracterização In-Silico de Elementos de Transposição no Genoma de Drosophila mojavensis, Descrição: Durante os primeiros projetos de sequenciamento do genoma, a análise computacional esforçava-se em identificar os elementos de transposição (TEs) e subsequente filtragem ou mascaramento com o objetivo de facilitar a anotação dos genes nos genomas sequenciados. No entanto, o interesse pela sua categorização e classificação cresceu apenas à medida que se foi descobrindo sua abundância e diversidade em novos genomas disponíveis e os esforços iniciais de identificação dos TEs transformaram-se em sua categorização ampla e sistemática em todo o genoma. Drosophila mojavensis (subespécie wrigleyi) é a única espécie do grupo repleta do subgênero Drosophila que teve o genoma sequenciado pelo Drosophila 12 Genomes Consortium. Nessa publicação de genoma, assim como nas demais, foi feita uma anotação geral dos elementos de transposição em nível de ordens, mostrando que 8,92% do genoma de D. mojavensis é composto por TEs. Contudo, como apontado na própria publicação, o principal desafio para os estudos genômicos de Drosophila continua sendo a análise abrangente da evolução estrutural e relações entre famílias de elementos de transposição. Assim, o presente projeto teve por objetivo neste trabalho predizer, classificar hierarquicamente e anotar os TEs no genoma de D.mojavensis em nível de superfamília. Além disso, contextualizou-se os TEs preditos de acordo com a proximidade de regiões gênicas, a qual pode apresentar indícios de sua possível função reguladora. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Edoardo Estevam de Oliveira Lobl - Integrante / Claudia Marcia Aparecida Carareto - Coordenador / Thiago Yukio Kikuchi Oliveira - Integrante., Financiador(es): Pró-Reitoria de Extensão Universitária - UNESP - Bolsa.

• 2016 - Atual

  Dinâmica e Evolutiva Funcional dos Elementos de Transposição Dentro e Entre Espécies, Descrição: Este projeto irá estudar a dinâmica funcional e evolutiva dos elementos de transposição (TEs) dentro e entre espécies de drosofilídeos focando dois objetivos principais. O primeiro objetivo, que será explorado em dois subprojetos, visa investigar o impacto do estresse genômico decorrente da hibridação na ativação dos TEs, e se essa ativação pode ser associada ao isolamento reprodutivo pós-zigótico. Para isso serão investigadas duas espécies irmãs (D. mojavensis e D. arizonae) que divergiram recentemente e seus híbridos. No subprojeto ?Anotação e caracterização de elementos de transposição nos genomas de Drosophila mojavensis e D.arizonae?, os TEs das duas espécies serão preditos, anotados e classificados hierarquicamente, e contextualizados de acordo com a proximidade de regiões gênicas, de modo a analisar sua potencial ação na regulação gênica. No subprojeto ?A expressão de elementos de transposição pode ser associada ao isolamento pós-zigótico entre Drosophila mojavensis e D. arizonae??, quatro subespécies de D. mojavensis serão intercruzadas com a espécie D. arizonae a fim analisar parâmetros da história de vida e de esterilidade híbrida, bem como realizar análises de expressão de TEs e de genes específicos (candidatos à especiação) em tecidos germinativos. A segunda questão, que se refere à ocorrência de transferência horizontal (HT) de TEs, será abordada no subprojeto ?Transferência horizontal de elementos de transposição sem-LTRs entre Drosophila e Zaprionus?. Utilizando dois retrotransposons sem LTRs, não são propensos a HTs, será testada a hipótese de que espécies do subgênero Zaprionus e do subgrupo melanogaster de Drosophila, que divergiram concomitantemente na África Tropical, passaram por um período permissivo de transferências horizontais de TEs, o que teria facilitado a troca de desse tipo de retrotransposon.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Edoardo Estevam de Oliveira Lobl - Coordenador / Claudia Marcia Aparecida Carareto - Integrante / Thiago Yukio Kikuchi Oliveira - Integrante / Cristina Vieira - Integrante / Maryanna Cristiano Simão - Integrante / Annabelle Haudry - Integrante / Cecília Ártico Banho - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Agence Nationale de la Recherche - Auxílio financeiro.