Eliseu Binneck

Eliseu é Engenheiro Agrônomo e Doutor em Ciência e Tecnologia de Sementes/Biotecnologia pela Universidade Federal de Pelotas (UFPel). Possui especialização em Bioinformática pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC). Trabalhou em estágio de Pós-Doutorado (2001 a 2006) na Embrapa Soja, na área de Biotecnologia Vegetal, com foco principal em Bioinformática, concentrado especialmente no desenvolvimento de ferramentas analíticas e métodos para pesquisas genômicas e transcriptômicas em soja. Desenvolveu trabalhos de consultoria em Bioinformática mediante convênio com Instituto Internacional de Cooperação para a Agricultura (IICA) e Projeto de Apoio ao Desenvolvimento de Tecnologia Agropecuária para o Brasil (Embrapa - PRODETAB). Ministrou a disciplina de Bioinformática como professor colaborador no programa de pós-graduação em Biotecnologia Agrícola da UFPel de 2003 a 2008. Tem experiência principalmente em montagem e anotação de genomas, genômica comparativa, transcriptômica funcional e regulação da expressão gênica, estudos de diversidade e função de comunidades microbianas (metabolômica) e mapeamento de variantes genéticas relacionadas a fenótipos de interesse. Desde 2006 é pesquisador da Embrapa Soja no Núcleo de Biotecnologia. Dedica-se prioritariamente à área de genômica aplicada a plantas e fungos, tendo gerado vários genomas de referência. Conduz investigações genômicas em acessos de germoplasma de soja com objetivo de caracterizar regiões genômicas e polimorfismos aplicáveis ao melhoramento genético visando maior produtividade. Em colaboração com colegas da Embrapa Trigo, desenvolve pesquisas para identificar novas fontes de resistência genética à brusone do trigo, doença que limita a produção de trigo no clima tropical do Brasil Central, principal fronteira de expansão da triticultura no país.

Informações coletadas do Lattes em 26/01/2026

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciência e Tecnologia de Sementes/Biotecnologia

1998 - 2001

Universidade Federal de Pelotas
Título: Identificação de cultivares e análise da pureza genética por métodos baseados em PCR e eletroforese de proteínas
Orientador: Jorge Luiz Nedel
Coorientador: Odir Antonio Dellagostin. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências AgráriasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética.

Mestrado em Ciência e Tecnologia de Sementes

1996 - 1998

Universidade Federal de Pelotas
Título: Peletização e aplicação de molibdênio em sementes de trevo branco (Trifolium repens L.)
, Ano de Obtenção: 1998.Antonio Carlos Souza Albuquerque Barros.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Especialização em Bioinformática

2002 - 2002

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Candidate genes for the late onset Alzheimer disease in the human chromosome 10
Orientador: Ana Tereza Vasconcelos e Anamaria Camargo
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Graduação em Agronomia

1991 - 1995

Universidade Federal de Pelotas
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante em Agropecuária

1988 - 1990

Centro de Educacao Profissional Vidal Ramos

Pós-doutorado

2001 - 2006

Pós-Doutorado. , Centro Nacional de Pesquisa de Soja, CNPSO, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Agrárias, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Formação complementar

2008 - 2008

Aprendizagem nas Organizações - Mentoria. (Carga horária: 25h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2007 - 2007

Gestão do Conhecimento. (Carga horária: 80h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2007 - 2007

Trabalho em Equipe. (Carga horária: 25h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2007 - 2007

Genética Quantitativa Frente aos Avanços da Biotec. (Carga horária: 40h). , Embrapa Soja, CNPSO, Brasil.

2006 - 2006

Bioinformática Estrutural. (Carga horária: 24h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2006 - 2006

Treinamento Introdutório de Pesquisadores. (Carga horária: 20h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2005 - 2005

Programação no Sistema Estatístico R. (Carga horária: 40h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2005 - 2005

Genomics in Plant Breeding -- CBAB. (Carga horária: 96h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.

2005 - 2005

Plant Gene Expression -- ICGEB. (Carga horária: 80h). , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, CENARGEN, Brasil.

2004 - 2004

Knowledge Discovery in Genomic Databases. (Carga horária: 80h). , Pan American Advanced Studies Institute, NSF PASI, Uruguai.

2004 - 2004

Workshop e Curso de Bioinformática. (Carga horária: 38h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.

2003 - 2003

Biologia Computacional -- CBAB. (Carga horária: 80h). , Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto Laboratório de Bioinformática, FMRP-USP/CBAB, Brasil.

2003 - 2003

Proteômica: Cromatografia Líquida e MALDI-TOF/MS. (Carga horária: 80h). , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, CENARGEN, Brasil.

2003 - 2003

Genotipagem com Detecção Fluorescente. (Carga horária: 40h). , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, EMBRAPA, Brasil.

2002 - 2002

Sequenciamento de DNA na Plataforma ABI Prism 3100. (Carga horária: 16h). , Applied Biosystems, ABI, Brasil.

2001 - 2001

Biossegurança e Risco Biológico - Módulo I. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

2001 - 2001

Biossegurança e Risco Biológico - Módulo II. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

2000 - 2000

Biotecnologia Vegetal. (Carga horária: 40h). , Universidade Católica de Pelotas, UCPEL, Brasil.

1999 - 1999

Bioinformática. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

1999 - 1999

Biotecnologia Aplicada ao Melhoramento. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

1998 - 1998

Biologia Molecular. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

1998 - 1998

Técnicas de Biologia Molecular I. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

1998 - 1998

Técnicas de Biologia Molecular II. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

1994 - 1994

Curso de Biotecnologia Vegetal. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genômica/Especialidade: Genômica Funcional.

Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Genética Molecular.

Participação em eventos

VII Simpósio Nacional de Biotecnologia REDBIO.Plataforma de bioinformática para estudos de estresses bióticos e abióticos em soja. 2009. (Simpósio).

II Workshop de Propriedade Intelectual.II Workshop de Propriedade Intelectual. 2005. (Seminário).

I Seminário sobre Software Livre na Embrapa.I Seminário sobre Software Livre na Embrapa. 2005. (Seminário).

2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2004. (Congresso).

III Brazilian Soybean Congress. III Brazilian Soybean Congress. 2004. (Congresso).

IV International Soybean Processing and Utilization Conference. IV International Soybean Processing and Utilization Conference. 2004. (Congresso).

Knowledge Discovery in Genomic Databases: a PASI on Data Mining Applications for Genomics and Bioinformatics.Knowledge Discovery in Genomic Databases: a PASI on Data Mining Applications for Genomics and Bioinformatics. 2004. (Encontro).

VII World Soybean Research Conference. VII World Soybean Research Conference. 2004. (Congresso).

Workshop de Bioinformática.Workshop de Bioinformática. 2004. (Outra).

Workshop e Curso de Bioinformática.Workshop e Curso de Bioinformática - Projeto Bioinformática a Serviço da Embrapa (BIEM). 2004. (Seminário).

1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICoBiCoBi. 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICoBiCoBi. 2003. (Congresso).

Introdução à Biologia Computacional.Curso Introdução à Biologia Computacional. 2003. (Outra).

IX Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal. IX Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal. 2003. (Congresso).

I Encontro Nacional de Comissões Internas de Biossegurança.Apoio à Comissão Organizadora do I Encontro Nacional de Comissões Internas de Biossegurança. 2002. (Encontro).

II Congresso Brasileiro de Soja e Mercosoja. II Congresso Brasileiro de Soja e Mercosoja. 2002. (Congresso).

Educação a Distância: ensino sem fronteiras.Educação a Distância: ensino sem fronteiras. 2001. (Oficina).

XII Congresso Brasileiro de Sementes. XII Congresso Brasileiro de Sementes. 2001. (Congresso).

VI Simpósio Brasileiro de Patologia de Sementes.VI Simpósio Brasileiro de Patologia de Sementes. 2000. (Simpósio).

V Workshop sobre Marketing em Sementes e Mudas. V Workshop sobre Marketing em Sementes e Mudas. 2000. (Congresso).

XVII Seminário Panamericano de Semillas - Rueda de Negocios y Foro Mundial sobre Biotecnología y Marketing de Semillas.XVII Seminário Panamericano de Semillas - Rueda de Negocios y Foro Mundial sobre Biotecnología y Marketing de Semillas. 2000. (Seminário).

XI Congresso Brasileiro de Sementes. XI Congresso Brasileiro de Sementes. 1999. (Congresso).

I Congresso de Pós-Graduação em Ciências Agrárias da UFPel. I Congresso de Pós-Graduação em Ciências Agrárias da UFPel. 1997. (Congresso).

X Congresso Brasileiro de Sementes. X Congresso Brasileiro de Sementes. 1997. (Congresso).

XV Seminário Panamericano de Semillas e III Workshop sobre Marketing de Sementes e Mudas.XV Seminário Panamericano de Semillas e III Workshop sobre Marketing de Sementes e Mudas. 1996. (Seminário).

I Congresso de Engenheiros Agrônomos do Mercosul e XI Encontro Estadual de Engenheiros Agrônomos. I Congresso de Engenheiros Agrônomos do Mercosul e XI Encontro Estadual de Engenheiros Agrônomos. 1995. (Congresso).

1° Seminário Internacional Sobre Sementes, Mudas e Inoculantes do Mercosul e 1ª Mostra de Produtos e Processos do Setor.1° Seminário Internacional Sobre Sementes, Mudas e Inoculantes do Mercosul e 1ª Mostra de Produtos e Processos do Setor. 1993. (Seminário).

Integração Regional Pró Mercosul.Integração Regional Pró Mercosul. 1993. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Iris Lamberti Ziober

SHIMOKOMAKI, M.; Fungaro, M H P;BINNECK, E.. Carnes PSE (pale, soft, exudative) de frangos: Análise molecular do gene codificador da proteína receptora de rianodina tipo 1. 2008.

Orientou

Juliana C Molina

Clonagem, sequenciamento, anotação e agrupamento de genes expressos em raízes de soja durante o déficit hídrico; 2004; 0 f; Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento) - Universidade Estadual de Londrina, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eliseu Binneck;

Geri Eduardo Meneghello

Análise in silico de proteínas relacionadas a sementes e identificação de microssatélites; 2007; 0 f; Tese (Doutorado em Ciência e Tecnologia de Sementes) - Universidade Federal de Pelotas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Eliseu Binneck;

Gabriel Olle Dalmazo

Integração e visualização de dados do genoma da soja utilizando Gbrowse - GMOD; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Engenharia Agronômica) - Universidade Federal de Pelotas, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Orientador: Eliseu Binneck;

Adelina Michels

Gene Ontology; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Agronomia) - Universidade Federal de Santa Catarina; Orientador: Eliseu Binneck;

Gabriel Olle Dalmazo

Integração e visualização de dados do genoma da soja utilizando Gbrowse - GMOD; 2008; Iniciação Científica - Embrapa Soja, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Orientador: Eliseu Binneck;

Luiz Gustavo Andrade dos Santos

Aprimoramento Tecnológico para Redução de Perdas por Seca na Cultura da Soja em Sistemas Agrícolas Sustentáveis; 2008; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Londrina, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Orientador: Eliseu Binneck;

André Ricardo Gonçalves

Desenvolvimento e implementação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, análise, mineração, e visualização de dados de seqüências biológicas relacionadas ao genoma da soja; 2008; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Londrina; Orientador: Eliseu Binneck;

Marcelo Iwata

VSQual; 2008; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Londrina, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Orientador: Eliseu Binneck;

Jack Hou

Phylogenetic analysis of some strains of Fusarium genus causing disease in soybean in Brazil; 2007; Iniciação Científica - Ankeny High School, The World Food Prize; Orientador: Eliseu Binneck;

Produções bibliográficas

  • VIANA, JÉSSICA BARBARA VIEIRA ; FERREIRA-NETO, JOSÉ RIBAMAR COSTA ; BINNECK, Eliseu ; OLIVEIRA SILVA, ROBERTA LANE DE ; COSTA, ANTÔNIO FÉLIX DA ; BENKO-ISEPPON, ANA MARIA . Exploring Epigenetic Modifiers in Cowpea: Genomic and Transcriptomic Insights into Histone Methyltransferases and Histone Demethylases. Stresses , v. 5, p. 13, 2025.

  • DA SILVA, EDUARDO ALVES ; MACIEL, JOAO LEODATO NUNES ; PIZOLOTTO, CARLOS AUGUSTO ; CONSOLI, LUCIANO ; BINNECK, Eliseu ; TORRES, GISELE ABIGAIL MONTAN ; BONATO, ANA LIDIA VARIANI ; FERNANDES, JOSE MAURICIO CUNHA ; BOLLER, WALTER . Unravelling the Severity Landscape of Brazilian Magnaporthe oryzae Triticum on Wheat Cultivars With and Without 2N V S Translocation. PLANT PATHOLOGY , v. 74, p. 1-13, 2025.

  • DE SOUZA, TAMIRES DOROTEO ; DE GODOY, SARA MATAROLI ; FELICIANO, DANIELE C. ; BINNECK, Eliseu ; RANGEL, DRAUZIO E.N. ; SOSA-GÓMEZ, DANIEL R. . Genetic diversity of the entomopathogenic fungus Metarhizium rileyi based on de novo microsatellite markers. JOURNAL OF INVERTEBRATE PATHOLOGY , v. 204, p. 108081, 2024.

  • FERREIRA-NETO, JOSÉ RIBAMAR COSTA ; SILVA, MANASSÉS DANIEL DA ; BINNECK, Eliseu ; VILANOVA, ELAYNE CRISTINA RAMOS ; MELO, ANA LUÍZA TRAJANO MANGUEIRA DE ; SILVA, JÉSSICA BARBOZA DA ; DE MELO, NATONIEL FRANKLIN ; PANDOLFI, VALESCA ; BENKO-ISEPPON, ANA MARIA . From Genes to Stress Response: Genomic and Transcriptomic Data Suggest the Significance of the Inositol and Raffinose Family Oligosaccharide Pathways in Stylosanthes scabra, Adaptation to the Caatinga Environment. PLANTS , v. 13, p. 1749, 2024.

  • SANTOS-SILVA, CARLOS ANDRÉ DOS ; FERREIRA-NETO, JOSÉ RIBAMAR COSTA ; AMADOR, VINÍCIUS COSTA ; BEZERRA-NETO, JOÃO PACÍFICO ; VILELA, LÍVIA MARIA BATISTA ; BINNECK, Eliseu ; RÊGO, MIRELI DE SANTANA ; DA SILVA, MANASSÉS DANIEL ; MANGUEIRA DE MELO, ANA LUIZA TRAJANO ; DA SILVA, RAHISA HELENA ; BENKO-ISEPPON, ANA MARIA . From Gene to Transcript and Peptide: A Deep Overview on Non-Specific Lipid Transfer Proteins (nsLTPs). ANTIBIOTICS-BASEL , v. 12, p. 939, 2023.

  • NEIVA, MARIANA M. ; DE GODOY, SARA M. ; FELICIANO, DANIELE C. ; MARQUES SILVA, JOÃO F. ; BINNECK, Eliseu ; DA ROSA, RENATA ; MURÚA, MARÍA G. ; SPECHT, ALEXANDRE ; SOSA'GÓMEZ, DANIEL R. . Development of microsatellite markers and genetic diversity of the velvetbean caterpillar Anticarsia gemmatalis (Lepidoptera: Erebidae). Austral Entomology , v. 62, p. 345-359, 2023.

  • FERREIRA-NETO, JOSÉ RIBAMAR COSTA ; DA SILVA, MANASSÉS DANIEL ; BINNECK, Eliseu ; DE MELO, NATONIEL FRANKLIN ; DA SILVA, RAHISA HELENA ; DE MELO, ANA LUIZA TRAJANO MANGUEIRA ; PANDOLFI, VALESCA ; BUSTAMANTE, FERNANDA DE OLIVEIRA ; BRASILEIRO-VIDAL, ANA CHRISTINA ; BENKO-ISEPPON, ANA MARIA . Bridging the Gap: Combining Genomics and Transcriptomics Approaches to Understand Stylosanthes scabra, an Orphan Legume from the Brazilian Caatinga. PLANTS , v. 12, p. 3246, 2023.

  • TORRES, GISELE ABIGAIL MONTAN ; FERREIRA, JÉSSICA ROSSET ; BINNECK, Eliseu ; MACIEL, JOÃO LEODATO NUNES ; CONSOLI, LUCIANO . Blast disease and wheat production in Brazil. PESQUISA AGROPECUÁRIA BRASILEIRA (ONLINE) , v. 57, p. e02487, 2022.

  • DE LIMA CABRAL, GEORGE ANDRÉ ; BINNECK, Eliseu ; DE SOUZA, MARISLANE CARVALHO PAZ ; DA SILVA, MANASSÉS DANIEL ; COSTA FERREIRA NETO, JOSÉ RIBAMAR ; POMPELLI, MARCELO FRANCISCO ; ENDRES, LAURÍCIO ; KIDO, ÉDERSON AKIO . First Expressed TFome of Physic Nut (Jatropha curcas L.) After Salt Stimulus. Plant Molecular Biology Reporter , v. 2020, p. 1-20, 2020.

  • DE SOUZA, MARISLANE CARVALHO PAZ ; DA SILVA, MANASSÉS DANIEL ; BINNECK, E. ; DE LIMA CABRAL, GEORGE ANDRÉ ; BENKO ISEPPON, ANA MARIA ; POMPELLI, MARCELO FRANCISCO ; ENDRES, LAURÍCIO ; KIDO, E. A. . RNA-Seq transcriptome analysis of Jatropha curcas L. accessions after salt stimulus and unigene-derived microsatellite mining. INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS , v. 147, p. 112168, 2020.

  • FERREIRA-NETO, JOSÉ RIBAMAR COSTA ; DA SILVA, MANASSÉS DANIEL ; BENKO-ISEPPON, ANA MARIA ; PANDOLFI, VALESCA ; BINNECK, E. ; NEPOMUCENO, A. L. ; Abdelnoor, Ricardo Vilela ; KIDO, EDERSON AKIO . Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration. PLANT GENE , v. 1, p. 100202, 2019.

  • DE JESUS-PIRES, CAROLLINE ; FERREIRA-NETO, JOSE RIBAMAR COSTA ; PACIFICO BEZERRA-NETO, JOAO ; KIDO, E. A. ; DE OLIVEIRA SILVA, ROBERTA LANE ; Pandolfi, Valesca ; WANDERLEY-NOGUEIRA, ANA CAROLINA ; BINNECK, E. ; DA COSTA, ANTONIO FELIX ; PIO-RIBEIRO, GILVAN ; PEREIRA-ANDRADE, GENIRA ; SITTOLIN, ILZA MARIA ; FREIRE-FILHO, FRANCISCO ; Benko-Iseppon, Ana Maria . Plant Thaumatin-like Proteins: Function, Evolution and Biotechnological Applications. CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE , v. 20, p. 1-50, 2019.

  • BINNECK, Eliseu ; LASTRA, CLAUDIA CRISTINA LÓPEZ ; SOSA-GÓMEZ, DANIEL R. . Genome Sequence of Metarhizium rileyi , a Microbial Control Agent for Lepidoptera. Microbiology Resource Announcements , v. 8, p. e00897-19, 2019.

  • MERTZ-HENNING, L.M. ; NAGASHIMA, A.I. ; KRZYZANOWSKI, F.C. ; Binneck, E. ; HENNING, F.A. . Relative quantification of gene expression levels associated with lignin biosynthesis in soybean seed coat. Seed Science and Technology , v. 43, p. 445-455, 2015.

  • NASCIMENTO, LEANDRO COSTA DO ; COSTA, GUSTAVO GILSON LACERDA ; BINNECK, Eliseu ; PEREIRA, GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES ; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA . A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA project: databases and pipelines. Genetics and Molecular Biology (Impresso) , v. 35, p. 203-211, 2012.

  • WANDERLEY-NOGUEIRA, ANA C. ; BELARMINO, LUIS C. ; SOARES-CAVALCANTI, NINA DA M. ; BEZERRA-NETO, JOÃO P. ; KIDO, EDERSON A. ; PANDOLFI, VALESCA ; ABDELNOOR, RICARDO V. ; BINNECK, Eliseu ; CARAZZOLE, MARCELO F. ; BENKO-ISEPPON, ANA M. . An overall evaluation of the resistance (R) and pathogenesis-related (PR) superfamilies in soybean, as compared with Medicago and Arabidopsis. Genetics and Molecular Biology (Impresso) , v. 35, p. 260-271, 2012.

  • DROVAL, A.A. ; Binneck, E. ; MARIN, S.R.R. ; PAIÃO, F.G. ; OBA, A. ; NEPOMUCENO, A.L. ; SHIMOKOMAKI, M. . A new single nucleotide polymorphism in the ryanodine gene of chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research , v. 11, p. 821-829, 2012.

  • STOLF-MOREIRA, RENATA ; LEMOS, ELIANA G. M. ; CARARETO-ALVES, LÚCIA ; MARCONDES, JACKSON ; PEREIRA, SELMA S. ; ROLLA, AMANDA A. P. ; PEREIRA, RODRIGO M. ; NEUMAIER, NORMAN ; BINNECK, Eliseu ; ABDELNOOR, RICARDO V. ; OLIVEIRA, MARIA C. N. ; MARCELINO, FRANCISMAR C. ; FARIAS, JOSÉ R. B. ; Nepomuceno, Alexandre L. . Transcriptional Profiles of Roots of Different Soybean Genotypes Subjected to Drought Stress. Plant Molecular Biology Reporter , v. 29, p. 19-34, 2011.

Outras produções

Binneck, E. . Assessor científico da Revista Brasileira de Sementes. 2001.

Binneck, E. . Construção (e manutenção até out/2000) do site do Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes da Universidade Federal de Pelotas (UFPel). 1999.

BINNECK, E. . VSQual - sistema desenvolvido para o manuseio e verificação da qualidade dos dados de seqüências de DNA gerados por sequenciadores automatizados. 2004.

BINNECK, E. . Stand-alone BLAST pipelines. 2003.

BINNECK, E. . Phred/CrossMatch plate visual reporter. 2002.

BINNECK, E. . Phred score to base color. 2002.

BINNECK, E. . Relatório de consultoria - IICA, projeto PRODETAB 02.02.20500.06. 2004.

BINNECK, E. ; NEPOMUCENO, A L . Projeto 'Bioinformática aplicada à análise do genoma funcional de raízes de soja (BioinfoSoja)'. 2003.

BINNECK, E. . Bioinformática na Embrapa Soja. 2002.

BINNECK, E. . Relação entre a União Protetora de Obtentores Vegetais (UPOV) e a Biotecnologia. 2000.

BINNECK, E. . Seminário de Bioinformática. 2000.

BINNECK, E. . Relatório: Técnicas de Biologia Molecular I. 1998.

BINNECK, E. . Relatório: Técnicas de Biologia Molecular II. 1998.

BINNECK, E. . Embriogênese somática: aplicações na produção de sementes sintéticas e transformação de plantas. 1997.

BINNECK, E. . Viabilidade da utilização de sementes sintéticas na produção de milho híbrido simples. 1997.

FALCAO, P. K. ; MARTINS, N. F. ; MARTINS, A. ; CAETANO, A. ; BINNECK, Eliseu . Curso Noções e Aplicações de Bioinformática. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

BINNECK, E. . Minicurso de Bioinformática, II Semena de Biologia, FFALM. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

BINNECK, E. . Bioinformática Aplicada à Análise Genômica, I Curso de Extensão em Biossegurança e Biotecnologia. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

BINNECK, E. . Curso de Bioinformática. 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático - Pós-Graduação).

BINNECK, E. . Curso de Bioinformática. 2003. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático - Pós-Graduação).

BINNECK, Eliseu . Curso Noções e Aplicações de Bioinformática. 2008 (Curso) .

Projetos de pesquisa

  • 2025 - Atual

    Desenvolvimento de estratégias e ferramentas para a exploração da diversidade genética da soja visando seu uso em programas de melhoramento (DIVERSOJA) - Embrapa 10.23.03.045.00.00, Descrição: A capacidade competitiva da soja brasileira em âmbito internacional foi conquistada com um intenso uso de tecnologia pelos produtores brasileiros, culminando com a liderança mundial na produção dessa oleaginosa. No entanto, essa liderança está ameaçada pelo risco de não mantermos no futuro os ganhos genéticos obtidos no passado. Isso se deve principalmente pelo uso de um limitado número de ancestrais, que foram usados em cruzamentos e seleção pelos programas de melhoramento, formando assim um germoplasma com um pool genético bastante estreito, e que pode não ser suficiente para enfrentar os futuros desafios da sojicultura. Assim, é essencial que o Brasil busque alternativas para que esse problema não venha a se concretizar. Embora o aumento de rendimento seja um objetivo buscado por todos os desenvolvedores, não existe ainda um protocolo otimizado para simultaneamente incrementar a diversidade genética e o potencial produtivo em soja. Com o objetivo de desenvolver e validar este protocolo, serão desenvolvidas estratégias baseadas no uso de ferramentas de genética, genômica e metabolômica para identificar materiais exóticos que contenham alelos que sejam importantes para o desenvolvimento de germoplasma com alto potencial produtivo. Para atingir o objetivo proposto, serão avaliados os dados genotípicos de cerca de 15.406 acessos exóticos e 400 cultivares de soja brasileiros. Com base na diversidade genética existente entre eles, serão selecionados acessos mais divergentes em relação ao pool de variedades brasileiras. Parte desses acessos será utilizado prontamente para cruzamentos com cultivares elite e parte deles serão caracterizados fenotipicamente a campo e quanto ao seu perfil metabólico, para um melhor conhecimento de seus potenciais produtivos e posteriormente utilizados para uma nova etapa de cruzamentos. Espera-se desenvolver germoplasma de soja com um potencial produtivo superior aos praticados atualmente, e dessa forma, enfrentar os desafios futuros da produção de soja no Brasil com maior segurança e competitividade. Código do projeto: 10.23.03.045.00.00. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Carlos Alberto Arrabal Arias - Integrante / Ricardo Vilela Abdelnoor - Integrante / Marcelo Fernandes de Oliveira - Coordenador / Clara Beatriz Hoffmann Campo - Integrante / Francismar Correa Marcelino Guimaraes - Integrante / Jose Ubirajara Vieira Moreira - Integrante / Monica Juliani Zavaglia Pereira - Integrante / Odilon Lemos de Mello Filho - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2025 - Atual

    +MICRO: Diversificação de Microrganismos para o Controle de Doenças e Aumento da Resiliência em Soja e Feijoeiro no Centro-Sul - Embrapa 10.23.03.033.00.00, Descrição: As coleções de microrganismos da Embrapa desempenham um papel crucial no avanço da pesquisa agrícola. No entanto, há uma escassez de diversidade nessas coleções. Esse cenário é semelhante ao observado na indústria, onde a maioria (97) dos fungicidas microbiológicos comerciais pertencem a apenas dois gêneros (Bacillus spp. e Trichoderma spp.). Essa falta de diversidade limita o desenvolvimento de soluções inovadoras para os desafios agrícolas. Diversas culturas importantes, como o feijão e a soja, enfrentam doenças como o mofo-branco e as podridões causadas por Macrophomina phaseolina. Essas doenças causam perdas significativas na produtividade, exigindo esforços contínuos para o controle. As perdas apenas com essas duas doenças são expressivas e chegam a picos de 70 na lavoura de soja e 60 em feijão. O manejo tradicional dessas doenças inclui o controle químico preventivo e o controle biológico com microrganismos como Trichoderma spp. e Bacillus spp. No entanto, essa estratégia tem se mostrado insuficiente, como evidenciado por epidemias recentes. O projeto +MICRO tem como objetivo aumentar a diversidade de linhagens de microrganismos disponíveis para o desenvolvimento de soluções inovadoras para o controle de doenças do feijão e da soja na região Centro-Sul. O projeto se baseia em dois pilares: reconhecimento da rizosfera como um ambiente estratégico para a prospecção de microrganismos benéficos às plantas; e o potencial dos consórcios sintéticos para conferir uma proteção mais robusta e benefícios mais abrangentes para as plantas. Com base nisso propõe-se o desenvolvimento de dois bancos de dados, um de solos e outro de microrganismos, além de um agente de controle biológico composto por um consórcio sintético de microrganismos voltado para as culturas de soja e de feijão. Dessa forma, o +MICRO visa enriquecer a diversidade de microrganismos disponíveis na Embrapa, contribuir para o desenvolvimento de soluções inovadoras no controle de doenças e para fortalecer a resiliência do feijoeiro e da soja. Para encarar um desafio tão complexo, o projeto reúne uma equipe multidisciplinar composta por pesquisadores da Embrapa, três universidades (UFLA, UFG e UFCA), uma associação (AS-PTA Agricultura Familiar e Agroecologia, Rio de Janeiro-RJ) e uma empresa privada (Pudica Alimentos Orgânicos, Hidrolândia-GO). Essa equipe trabalhará em conjunto para alcançar os objetivos do projeto e contribuir para suprimir doenças e fortalecer a resiliência de feijoeiro e soja na região Centro-Sul do Brasil. Código do projeto: 10.23.03.033.00.00. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Claudine Dinali Santos Seixas - Integrante / Adriane Wendland Ferreira - Integrante / Andre Emilio Jantara - Integrante / Flavio Henrique Vasconcedos de Medeiros - Integrante / Gesimaria Ribeiro Costa Coelho - Integrante / Guilherme Juliao Zocolo - Integrante / Luana Alves Rodrigues - Integrante / Marco Antonio Nogueira - Integrante / Marta Cristina Corsi de Filippi - Integrante / Mauricio Conrado Meyer - Integrante / Murilo Lobo Junior - Integrante / Paulo Marcal Fernandes - Integrante / Raquel Neves de Mello - Coordenador / Tatiana Maris Ferraresi - Integrante / Valacia Lemes da Silva Lobo - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2025 - Atual

    Sensibilidade de Pyricularia oryzae Triticum do Brasil a fungicidas carboxamidas, estrobilurinas e triazóis e oportunidades de otimização do manejo químico da brusone do trigo - Embrapa 20.23.03.014.00.00, Descrição: O monitoramento da sensibilidade do fungo Pyricularia oryzae Triticum (Pot) aos principais fungicidas utilizados para controlar a brusone do trigo é fundamental para a correta determinação das limitações associadas ao controle químico dessa doença. Esse tipo de avaliação deve ser realizado com periodicidade ao longo dos ciclos de cultivo para que seja capaz de captar variações na sensibilidade de fungos fitopatogênicos, especialmente a fungicidas de uso intenso e com alto e médio risco de geração de resistência. Neste projeto, a sensibilidade de Pot no Brasil será avaliada em relação a três grupos químicos de fungicidas: carboxamida (Inibidores da Succinato Desidrogenase; SDHI), estrobilurina (Inibidores de Quinona Oxidase; QoI) e triazol (Inibidores da Desmetilação de Esteróis; DMI). Assim, o objetivo geral do projeto é monitorar a sensibilidade de Pyricularia oryzae Triticum do Brasil a fungicidas dos grupos químicos carboxamida, estrobilurina e triazol, correlacionar possíveis resistências com mutações do patógeno e atualizar indicações relativas ao controle químico da brusone do trigo. Código do projeto: 20.23.03.014.00.00. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Ana Lidia Variani Bonato - Integrante / Angelo Aparecido Barbosa Sussel - Integrante / Joseani Mesquita Antunes - Integrante / Joao Leodato Nunes Maciel - Coordenador / Daniel Augusto Shurt - Integrante / Emerson Medeiros Del Ponte - Integrante / Luzz Kezzy de Morais - Integrante / Rita de Cassia Santos Goussain - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2022 - Atual

    Expansão da área de trigo na região tropical do Brasil Central - TED Embrapa 20.23.10.006.00.00, Descrição: O trigo, ao lado dos fertilizantes, constitui-se numa das principais pautas de importação do setor agrícola brasileiro, onerando a balança comercial do País. O balanço de oferta e demanda de trigo para 2022, estima uma produção de 10,5 milhões de toneladas para um consumo de 12,3 milhões de toneladas. Este projeto tem como objetivos gerar conhecimentos e transferir tecnologias para o complexo agroindustrial do trigo que contribuam para o aumento da área e da competitividade da cultura no Brasil Central, nos estados de São Paulo, Goiás, Minas Gerais, Distrito Federal, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso e Bahia, por meio de ações capazes de proporcionar maior adesão de produtores ao cultivo do cereal. Com atenção especial ao Bioma Cerrado, o projeto vai permitir o acompanhamento das diversas políticas públicas ou privadas direcionadas ao setor tritícola nacional. Um dos focos é o apoio à operacionalização do crédito e seguro rural na triticultura, envolvendo riscos de delimitação de áreas com aptidão potencial para produção do cereal, como suporte à política de crédito e securidade rural no Brasil por meio do ZARC. O projeto propõe também ações de transferência de tecnologia em aproximação à cadeia produtiva do cereal no ambiente tropical para, de forma imediata e ao longo da execução, mobilizar, capacitar e apoiar agentes da assistência técnica e produtores na promoção do cultivo, no intercâmbio de conhecimentos e na prospecção de demandas sobre a cultura. Concomitantemente, propõe ainda enfrentar desafios científicos e tecnológicos para a expansão sustentada da área de cultivo. O principal deles relacionado com o fungo Magnaporthe oryzae, agente causal da brusone, doença limitante para produção de trigo na região tropical do Brasil Central. As ações do projeto deverão priorizar a busca de fontes de resistência à essa doença. Código do projeto: 20.23.10.006.00.00. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Adão S Acosta - Integrante / Gisele Abigail Montan Torres - Integrante / Luciano Consoli - Integrante / Ana Lidia Variani Bonato - Integrante / Angelo Aparecido Barbosa Sussel - Integrante / Joseani Mesquita Antunes - Integrante / Julio Cesar Albrecht - Integrante / Alaerto Luiz Marcolan - Coordenador / Alvaro Augusto Dossa - Integrante / Andre Mateus Prando - Integrante / Andre Rodrigo Farias - Integrante / Bruno Souza Lemos - Integrante / Carlos Eduardo da Silva Moraes - Integrante / Claudio Lazzarotto - Integrante / Gilberto Rocca da Cunha - Integrante / Hilton Luis Ferraz da Silveira - Integrante / Joao Leodato Nunes Maciel - Integrante / Joaquim Soares Sobrinho - Integrante / Job Lucio Gomes Vieira - Integrante / Jorge Henrique Chagas - Integrante / Lincoln Moreira Rocha Loures - Integrante / Marcos Rafae Petek - Integrante / Milena Yumi Ramos - Integrante / Moacir Pedroso Junior - Integrante / Oswaldo Vasconcellos Vieira - Integrante / Rafael Mingoti - Integrante / Ricardo Lima de Castro - Integrante / Roberta Dalla Porta Grundling - Integrante / Vanoli Fronza - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2019 - 2022

    Controle genético e aspectos epidemiológicos da brusone do trigo (BRUSGENE) - Embrapa 12.16.04.009.00.00, Descrição: A brusone é um dos principais limitantes à cultura do trigo no Brasil, país onde a doença foi relatada pela primeira vez e cujos surtos epidêmicos são frequentes. Além de impedir a expansão da cultura do trigo no Cerrado brasileiro, esta doença causa enormes danos em importantes regiões tritícolas do país, como o norte do Paraná e sul de São Paulo. O seu controle baseado na resistência genética não tem atingido a eficiência desejada, pois, até o momento, as cultivares de trigo disponibilizadas para os produtores brasileiros não têm apresentado resistência a essa doença em níveis satisfatórios. A identificação tanto de marcadores moleculares associados a esse fenótipo, bem como, de genótipos de trigo que possam ser utilizados como fontes de resistência, são subsídios importantes para o desenvolvimento de cultivares de trigo resistentes à brusone. Por outro lado, não se tem a exata dimensão da importância que plantas daninhas, além de sementes e restos culturais de plantas de trigo, representam como agentes de sobrevivência e fonte de inóculo dos agentes causais da brusone, o patotipo do trigo de Pyricularia oryzae, e uma nova espécie de fungo, P. graminis-tritici. Os objetivos este projeto são caracterizar, molecular e fenotipicamente, a resistência à brusone em genótipos de trigo e dimensionar o grau de importância que plantas do gênero Urochloa, de grãos, de sementes e de palha de trigo como fontes de inóculo para doença no Brasil. Genótipos de trigo do programa de melhoramento de trigo da Embrapa Trigo e de coleções internacionais serão avaliados quanto à reação à brusone da espiga em ambientes de campo. Esta caracterização fenotípica será associada com dois tipos de avaliação molecular: a presença do segmento 2NS/2AS de Aegilops ventricosa, cuja associação com resistência à brusone já foi demonstrada. A expectativa é de que os resultados obtidos na proposta contribuam efetivamente para o desenvolvimento de cultivares resistentes à brusone, uma demanda que é altamente prioritária para triticultura nacional. Além disso, as informações obtidas deverão contribuir para o esclarecimento do papel que fontes de inóculo como hospedeiros alternativos, sementes e resíduos culturais de trigo representam para doença no Brasil, condição que poderá repercutir na mudança ou em novas indicações de manejo da doença no país. Código do projeto: 12.16.04.009.00.00. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Gisele Abigail Montan Torres - Integrante / Luciano Consoli - Integrante / Ana Lidia Variani Bonato - Integrante / Angelo Aparecido Barbosa Sussel - Integrante / Joseani Mesquita Antunes - Integrante / Maurício Antonio de Oliveira Coelho - Integrante / Claudine Dinali Santos Seixas - Integrante / Joao Leodato Nunes Maciel - Coordenador / Vanoli Fronza - Integrante / Adriano Augusto de Paiva Custodio - Integrante / Marcelo Gravina de Moraes - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2016 - 2018

    Mecanismos de resistência de Chrysodeixis includens a toxina Cry1Ac e estudos de resistência cruzada (Cry1Ac), Descrição: As áreas das culturas Bt nos sistemas agrícolas experimentaram uma rápida expansão. No Brasil, a área com soja que expressa a proteína Cry1Ac em 2013 foi de 2,26 milhões de hectares, na safra 2013/14 foi de 5,2 milhões de hectares e a safra 2014/15, estima-se que essa área atingiu 6,3 milhões de ha, representando 20 do total semeado com soja. Na temporada 2015/16 foi estimado que esta área atingiu 45 da área de soja e em 2016/17 foi estimada em 55 da área. A disponibilidade desta proteína em grandes áreas permite a pressão de seleção exercida sobre pragas alvo, favorecendo o surgimento de populações resistentes. Portanto, a detecção inicial da frequência de alelos de resistência é fundamental para a definição e estabelecimento de estratégias em programas de gerenciamento de resistência de insetos (MRI) (Gould et al 1997, Andow Alstad, 1998). Este projeto visa a determinação da frequência de alelos de resistência em populações de C. includens e a seleção de indivíduos resistentes com a finalidade de determinar os mecanismos de resistência assim com a possível ocorrência de resistência cruzada a outras toxinas. A resistência será determinada por meio de bioensiaos comparativos com populações suscetíveis, estudos das microvilosidades e estudos de transcriptômica. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Daniel Ricardo Sosa-Gomez - Coordenador / Ivani de Oliveira Negrão Lopes - Integrante / Renata da Rosa - Integrante.

  • 2012 - 2016

    Estratégias integradas de caracterização da resistência de trigo à brusone (WheatBGIn2) - Embrapa 02.11.08.004.00.00, Descrição: O primeiro relato mundial de ocorrência de brusone de trigo em condições de campo foi feito no Brasil, no norte do Paraná, em meados da década de 80. Atualmente, esta doença está presente em todas as regiões tritícolas do Brasil e em países como Bolívia, Paraguai e Argentina. Embora o fungo possa infectar todos os órgãos aéreos da planta, incluindo folhas, colmos e espigas, a infecção da espiga do trigo é a forma mais destrutiva de ocorrência da doença. A maioria das cultivares de trigo analisadas, até meados dos anos 2000, quanto à reação à infecção por P. oryzae mostrou alta suscetibilidade das espigas à brusone. Baseada na exploração de recursos genéticos com a fenotipagem a campo, a proposta de pesquisa interdisciplinar sobre a resistência genética de trigo a P. oryzae consolidou-se com a condução dos três primeiros viveiros de brusone de trigo no país (ensaios denominados de hot spots), em Dourados-MS, Londrina-PR e Planaltina-DF. Neste projeto, é proposto o monitoramento do microclima de cada um dos viveiros, de modo a se analisar o efeito de variáveis climáticas sobre a ocorrência e a severidade da doença, dependendo do local avaliado. Esta rede de fenotipagem a campo, estabelecida em cinco locais de regiões tritícolas do país (MS, PR, DF, MG e RS), com monitoramento de condições climáticas permitirá: 1) a identificação de genótipos de trigo portadores de genes de resistência e que poderão ser, no contexto dos demais planos de ação, utilizados pelo programa de melhoramento genético, e finamente fenotipados para fins de estudos sobre genética da resistência; 2) a definição de estratégias de controle, químico e cultural, adaptadas aos diferentes padrões de resposta da planta; 3) a caracterização da influência de condições climáticas sobre a incidência de brusone em trigo; 4) a definição dos efeitos da doença sobre parâmetros agronômicos e de qualidade tecnológica de trigo. As fontes de resistência identificadas neste trabalho serão caracterizadas do ponto de vista genotípico, transcricional e traducional com o intuito de se realizar a caracterização da resistência genética de trigo a P. oryzae. Serão conduzidos estudos de genética de associação e de mapeamento de locos de resistência quantitativa (QRL). Subsequentemente, a partir dos genes-candidatos e dos QRLs identificados serão gerados marcadores moleculares com o intuito de se implementar nova estratégia de seleção de linhagens de trigo com melhores níveis de resistência à brusone. Código do projeto: 02.11.08.004.00.00. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Antônio Nhani Júnior - Integrante / Manoel Carlos Bassoi - Integrante / Márcia Soares Chaves - Integrante / Pedro Luiz Scheeren - Integrante / Gisele Abigail Montan Torres - Coordenador / Marcio Nicolau - Integrante / Sandra Scagliusi - Integrante / Luciano Consoli - Integrante / Herbert Gonzales - Integrante / Claudine Seixas - Integrante / Augusto Goulart - Integrante / Cristobal Uauy - Integrante / Adeliano Cargnin - Integrante / Alexei de Campos Dianese - Integrante / Ana Lidia Variani Bonato - Integrante / Angelo Aparecido Barbosa Sussel - Integrante / Augusto Cesar Pereira Goulart - Integrante / Antonio Joaquim Braga Pereira Braz - Integrante / Cesar Luis Girardi - Integrante / Edina Regina Moresco - Integrante / Eduardo Caierao - Integrante / Flavio Martins Santana - Integrante / Jose Mauricio Cunha Fernandes - Integrante / Jose Pereira da Silva Junior - Integrante / Joseani Mesquita Antunes - Integrante / Julio Cesar Albrecht - Integrante / José Antônio Martinelli - Integrante / Martha Zavariz de Miranda - Integrante / Maurício Antonio de Oliveira Coelho - Integrante.

  • 2008 - 2012

    Rede da Embrapa para Estudo do Genoma da Soja - Embrapa 02.07.06.010.00.00, Descrição: O projeto visa complementar ações de pesquisa, bem como de recursos, formando uma Rede da Embrapa para Estudos do Genoma da Soja (REGESOJA), que irá contribuir de modo efetivo para potencializar a participação do Brasil no contexto internacional de pesquisa genômica em soja. Devido a ampla gama de ferramentas biotecnológicas para acesso a informação gênica, bem como os diferentes tipos de estresses que acometem a soja , novas alternativas para complementar o projeto Genosoja podem ser facilmente vislumbradas. Neste sentido, o presente projeto visa propor novas estratégias e ferramentas experimentais para contribuir e ampliar os resultados a serem obtidos pelo Consórcio Nacional para Estudo do Genoma da Soja, focando em tipos de estresses e ferramentas biotecnológicas não previstas no Genosoja e que visam complementar os resultados obtidos neste Consórcio. O projeto REGESOJA propõe o estudo do genoma da soja sob diferentes níveis, desde sua organização em nível estrutural, buscando identificar e sequenciar regiões genômicas importantes, contribuindo assim com a construção do mapa físico de Glycine max, até a identificação em nível transcricional e protéico de genes envolvidos nas respostas a diferentes estresses bióticos e abióticos que acometem a cultura. A REGESOJA focará em estratégias pontuais, claramente definidas, buscando utilizar dados gerados pelo GENOSOJA e pelo Consórcio Internacional. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Alexandre Lima Nepomuceno - Integrante / R V Abdelnoor - Coordenador / Marcelino, FC - Integrante / Everaldo Gonçalves de Barros - Integrante / Maria de Fátima Grossi de Sá - Integrante / Maria Helena Bodanese-Zannetini - Integrante / Mariangela Hungria - Integrante / Juliana Dantas Almeida - Integrante / Maria C. Baracat-Pereira - Integrante / Luciano G. Fietto - Integrante / Eduardo Romano - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / Leila M G Barros - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Luciane Maria P. Passaglia - Integrante / Marcia Maria Auxiliadora Naschenveng P. Margis - Integrante / Maria Fatima Grossi de Sa - Integrante / Mauro Carneiro - Integrante / Maria Cristina Bacarat Pereira - Integrante / Rodrigo da Rocha Fragoso - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2008 - 2012

    GENOSOJA: Consórcio Nacional para Estudos do Genoma da Soja - CNPq Processo 552735/2007-8, Descrição: O projeto GENOSOJA propõe o estudo do genoma da soja sob diferentes níveis, desde sua organização em nível estrutural, buscando identificar e sequenciar regiões genômicas importantes, contribuindo assim com a construção do mapa físico de Glycine max, até a identificação em nível transcricional e protéico de genes envolvidos nas respostas a diferentes estresses bióticos e abióticos que acometem a cultura. Ainda, o projeto busca estudar não somente se um gene é expresso ou não, mas também determinar os níveis em que é expresso, as interações com outros genes, sua localização física e seus produtos. A obtenção destas informações, com foco em plantas de soja submetidas aos principais estresses que acometem a cultura no Brasil, permitirá a identificação de genes e de rotas metabólicas importantes, crucias para o desenvolvimento e estudo de plantas tolerantes a situações de desafio. O projeto está estruturado em seis Projetos Componentes (PC), visando abordar diferentes aspectos do genoma da soja. No PC1 serão executadas as atividades de gestão do projeto. No PC2 (Genômica Estrutural), estão incluídas atividades de pesquisa relacionadas com estudos do genoma físico e estrutural, onde o sequenciamento de regiões ricas em genes de um cultivar nacional será priorizado. Estudos de sintenia e requenciamento de algumas regiões em diferentes genótipos também serão conduzidos neste PC, o que permitirá identificar polirmofismos em nível de uma base (SNPs). No PC3 (Transcriptoma), serão utilizadas várias estratégias para acessar a informação dos genes diferencialmente expressos sob diferentes estresses bióticos (Ferrugem Asiática e nematóides) e abióticos (seca e fixação de nitrogênio). Os mesmos experimentos para obtenção de material biológico no PC3 serão utilizados para obtenção de material biológico nos estudos de Proteoma no PC4. Esta estreita relação garantirá uma complementaridade e redução da variabilidade experimental, permitindo uma melhor eficiência da utilização destes dois grandes grupos de dados na caracterização do genoma funcional da soja. Os resultados destes PCs (PC3/PC4) serão discutidos e repassados ao PC relacionado à comprovação da função biológica in vivo (PC5). Em conexão ao PC2, as seqüências dos genes identificados como diferencialmente expressos serão utilizadas como sondas moleculares para mapeamento físico das regiões genômicas onde estes genes se encontram, assim como, na identificação de regiões reguladoras (promotores, enhancers, cis-elements, etc) que controlam a expressão dos mesmos, e obtenção de marcadores genéticos funcionais. O PC6 (Bioinformática) será a principal ferramenta integradora de todo o projeto GENOSOJA, onde bancos de dados e a disponibilização de programas de análise permitirão um estudo profundo do genoma de genótipos brasileiros de soja submetidos a diferentes desafios ambientais. Os trabalhos desenvolvidos no GENOSOJA se associarão ao esforço mundial de estudo do genoma completo da soja através da participação do projeto no International Soybean Genome Consortium (ISGC). A participação do Brasil, de forma ativa, em tal consórcio é altamente estratégica, pelo fato de sermos o segundo maior produtor dessa cultura e termos conhecimento e base instalada de pesquisa capaz de contribuir para tal esforço. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Nepomuceno, A L - Integrante / Francismar Corrêa Marcelino-Guimarães - Integrante / Everaldo Gonçalves de Barros - Integrante / Maurílio Alves Moreira - Integrante / Ivan Schuster - Integrante / Maria de Fátima Grossi de Sá - Integrante / Maria Helena Bodanese-Zannetini - Integrante / Mariangela Hungria - Integrante / Sérgio Hermínio Brommonschenkel - Integrante / Juliana Dantas Almeida - Integrante / Marcelo E Loureiro - Integrante / Maria C. Baracat-Pereira - Integrante / Luciano G. Fietto - Integrante / Eduardo Romano - Integrante / Gonçalo A. G. Pereira - Integrante / Ana Maria Benko-Iseppon - Integrante / Rogerio Margis - Integrante / Márcia Margis-Pinheiro - Integrante / Ederson A. Kido - Integrante / Marcelo F. Carazzole - Integrante / Ricardo Vilela Abdelnoor - Coordenador / Marcio Alves Ferreira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2007 - 2010

    PIBA: Pesquisa e Inovação em Bioinformática para o Agronegócio - Embrapa 02.06.06.008.00.00, Descrição: O projeto procura viabilizar soluções de bioinformática para o desenvolvimento da biotecnologia ligada ao tema Agropecuária. O sofisticado embasamento técnico e a natureza genérica da biotecnologia moderna estão possibilitando o desenvolvimento de imensa gama de produtos e processos. A Bioinformática é um dos pilares da biotecnologia moderna, responsável pelo desenvolvimento e a aplicação de ferramentas da tecnologia da informação para permitir a organização, gestão, análise e interpretação de dados em suporte ao tratamento de questões biológicas relevantes. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / Antônio Nhani Júnior - Integrante / P R K Falcão - Coordenador / Michel Eduardo Beleza Yamagishi - Integrante / Fabio Danilo Vieira - Integrante / Claudia Teixeira Guimarães - Integrante / Marcelos Gonçalves Narciso - Integrante / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Natalia Florencio Martins - Integrante / Marcos Mota do Carmo Costa - Integrante / Marcia Soares Vidal - Integrante / Katia Regina dos Santos Teixeira - Integrante / Aurea Valadares Folgueras Flatschar - Integrante / Roberto Willians Noda - Integrante / Claudio Brondani - Integrante / Edgard Henrique dos Santos - Integrante / Eduardo Fernandes Formighieri - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / Georgios Joannis Pappas Junior - Integrante / Jean Luiz Simoes de Araujo - Integrante / Jose Edson Fontes Figueiredo - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

  • 2004 - 2007

    BIEM: Bioinforma#769;tica a Servic#807;o da Embrapa - Embrapa 02.03.01.12, Descrição: O projeto foi desenvolvido para o estabelecimento de uma base tecnolo#769;gica de bioinforma#769;tica e biologia computacional caracterizada na estrutura da REDE de Bioinforma#769;tica para a Embrapa e seus usua#769;rios garantindo a gerac#807;a#771;o de produtos e melhoria de processos que envolvem o avanc#807;o das pesquisas na a#769;rea de biologia molecular. Código do projeto: 02.03.1.12.00. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eliseu Binneck - Integrante / K R S Teixeira - Integrante / C T Guimarães - Integrante / A L Mancini - Integrante / A F Mota - Integrante / A R de Freitas - Integrante / A L Campos - Integrante / A A C Purcino - Integrante / D P Munari - Integrante / Goran Neshich - Integrante / H N de Oliveira - Integrante / J L S de Araújo - Integrante / K R E de Jesus - Integrante / L C A Regitano - Integrante / L V M Rigden - Integrante / L L Coutinho - Integrante / M C S Oliveira - Integrante / M A Machado - Integrante / M M Costa - Integrante / M V G B da Silva - Integrante / M L Martinez - Integrante / M M Guimarães - Integrante / M M de Alencar - Integrante / M E B Yamagishi - Integrante / N F Martins - Integrante / N P Carneiro - Integrante / P R K Falcão - Coordenador / R Togawa - Integrante / R H Higa - Integrante / R F da Silva - Integrante / R S Verneque - Integrante / W Arbex - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.

Prêmios

2006

Aprovado no concurso público para Pesquisador A em Bioinformática, Embrapa.

1995

Menção Honrosa - Prêmio de excelência acadêmica. Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel - FAEM, Universidade Federal de Pelotas.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Soja. , Rodovia Carlos João Strass, s/nº Acesso Orlando Amaral, Distrito de Warta, 86085981 - Londrina, PR - Brasil - Caixa-postal: 4006, Telefone: (43) 33716223, URL da Homepage:

Experiência profissional

2006 - Atual

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador A, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Pesquisador Cientista Doutor, Nível A, na área de Biologia Avançada / subárea Bioinformática, sediado na Embrapa Soja (Centro Nacional de Pesquisa de Soja, CNPSO) em Londrina-PR.

2006 - 2006

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Consultor, Carga horária: 40

Outras informações:
Consultor em Bioinformática mediante convênio com Instituto Internacional de Cooperação para a Agricultura (IICA) e Projeto de Apoio ao Desenvolvimento de Tecnologia Agropecuária para o Brasil (Embrapa - PRODETAB). Objetivos da Consultoria: (1) identificar genes envolvidos nos mecanismos de resistência/suscetibilidade de linhagens e cultivares resistentes/suscetíveis à ferrugem asiática da soja;(2) organizar e coordenar o plano de trabalho 9 do projeto SouthNomics (WP9 SouthNomics data bank - South America Genomic Data Bank); (3) realizar análise de marcadores SSR e AFLP para a construção do mapa genético visando à prospecção gênica em duas populações segregantes de trigo para resistência à ferrugem da folha e à tolerância à germinação pré-colheita. Número do Contrato: 106330. Projetos vinculados: FINEP 01.04.0979-00 - Plataforma tecnológica para o manejo integrado da ferrugem asiática da soja; MP3 03.04.340.00.02.00 - Caracterização e mapeamento molecular de trigo associado à resistência à ferrugem da folha e à tolerância à germinação pré-colheita; SouthNomics - A South American platform for Biotic and Abiotic Stress in Crops: Asian Soybean Rust.

2006 - 2006

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Consultor, Carga horária: 40

Outras informações:
Consultor em Bioinformática mediante convênio com Instituto Internacional de Cooperação para a Agricultura (IICA) e Projeto de Apoio ao Desenvolvimento de Tecnologia Agropecuária para o Brasil (Embrapa - PRODETAB). Objetivo da Consultoria: Oferecer suporte de bioinformática aos esforços da Embrapa Soja para identificar genes diretamente envolvidos nos mecanismos de resistência/suscetibilidade de linhagens e cultivares resistentes/suscetíveis à ferrugem asiática da soja. Objetivos específicos: (1) auxiliar na determinação de estratégias mais eficientes para geração de cultivares de soja tolerantes à ferrugem; (2) estabelecer associações filogenéticas mediante análises moleculares utilizando DNA de isolados de ferrugem asiática do Brasil e de outros países do mercosul; (3) Prospecção computacional de novos marcadores moleculares como SNPs (single nucleotide polymorphisms) para auxílio de mapeamento de QTLs e melhoramento assistido. Número do Contrato: 106082. Projeto vinculado: FINEP 01.04.0979-00 - Plataforma tecnológica para o manejo integrado da ferrugem asiática da soja.

2005 - 2006

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Visitante, Carga horária: 40

Outras informações:
Plano de ação: análise de expressão de genes candidatos envolvidos na resistência da soja à ferrugem asiática. CNPq Processo 380630/2005-2 Projeto FINEP/CT-AGRO: Plataforma tecnológica para o manejo integrado da ferrugem asiática da soja.

2004 - 2004

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Consultor, Carga horária: 40

Outras informações:
Consultor em Bioinformática mediante convênio com Instituto Internacional de Cooperação para a Agricultura (IICA) e Projeto de Apoio ao Desenvolvimento de Tecnologia Agropecuária para o Brasil (Embrapa - PRODETAB). Objetivo da Consultoria: Suprir as demandas de serviço especializado em bioinformática na Embrapa Soja, dando suporte, principalmente, na análise e interpretação das informações obtidas a partir dos estudos de expressão gênica em raízes sob condições de estresse, como as situações de déficit hídrico e parasitismo por nematóides. Número do Contrato: 189/04. Projeto vinculado: PRODETAB 02.02.20500.06 - Desenvolvimento de cultivares de soja adaptadas às várias regiões ecológicas e aos vários sistemas de produção.

2001 - 2003

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador de Pós-Doutorado, Carga horária: 40

Outras informações:
Bolsista do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq Processo 350619/2001-8).

Atividades

  • 02/2014

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro Nacional de Pesquisa de Soja.Cargo ou função, Membro do Comitê Local de Publicações.

  • 03/2013

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro Nacional de Pesquisa de Soja.Cargo ou função, Líder de equipe: Biometria, Bioinformática e Socioeconomia.

  • 12/2001

    Pesquisa e desenvolvimento, Centro Nacional de Pesquisa de Soja.Linhas de pesquisa

2006 - Atual

Embrapa soja

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador A, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2006

Embrapa soja

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Visitante, Carga horária: 40

Outras informações:
Plano de ação: análise de expressão de genes candidatos envolvidos na resistência da soja à ferrugem asiática. CNPq Processo 380630/2005-2 Projeto FINEP/CT-AGRO: Plataforma tecnológica para o manejo integrado da ferrugem asiática da soja.

2001 - 2003

Embrapa soja

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador de Pós-Doutorado, Carga horária: 40

Outras informações:
Bolsista do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq Processo 350619/2001-8).

2008 - 2008

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 30

Outras informações:
Colaboração na disciplina de Bioinformática no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Agrícola no período de 03 a 07 de março de 2008, ministrando um total de 30 horas aula.

2006 - 2006

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Outras informações:
Ministrou a disciplina de Bioinformática no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Agrícola, no período de 11 a 15 de dezembro de 2006, totalizando 45 horas-aula

2005 - 2005

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Outras informações:
Ministrou a disciplina de Bioinformática no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Agrícola no período de 05 a 09 de dezembro de 2005, totalizando 40 horas-aula

2004 - 2004

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Outras informações:
Ministrou a disciplina de Bioinformática no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Agrícola no período de 12 a 16 de abril de 2004, totalizando 40 horas-aula.

2004 - 2004

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Outras informações:
Ministrou 40 horas-aula na disciplina Tópicos Especiais, do Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, no período de 22 a 26 de novembro de 2004. Tema abordado: Introdução à Bioinformática.

2003 - 2003

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Outras informações:
Ministrou a disciplina de Bioinformática no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Agrícola no período de 10 a 14 de março de 2003, totalizando 40 horas-aula.

1996 - 2001

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de pós-graduação, Carga horária: 40

1993 - 1995

Universidade Federal de Pelotas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante - Iniciação Científica

Atividades

  • 01/2005

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática

  • 11/2004 - 11/2004

    Ensino, Ciência e Tecnologia de Sementes, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Tópicos Especiais - Introdução à Bioinformática

  • 04/2004 - 04/2004

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática

  • 03/2003 - 03/2003

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática

  • 03/1998 - 11/2001

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel.Cargo ou função, Consultoria de estatística experimental e multivariada.

  • 03/1998 - 08/2000

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia.Cargo ou função, Representante discente (doutorado) do Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes - eleito pelos colegas.

  • 06/1996 - 08/1997

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia.Cargo ou função, Representante discente (mestrado) do Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes.

2001 - 2001

Universidade da Região da Campanha

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Consultor, Carga horária: 12

Outras informações:
Ministrou o curso de extensão "Métodos estatísticos - planejamento e análise de experimentos com a utilização de computadores", no período de 1 de maio a 31 de agosto de 2001, num total de 60 horas-aula (40 teoria e 60 prática), incluindo a capacitação para utilização do software Statistica. Objetivo: capacitação de profissionais para a condução de experimentos utilizando-se de metodologias estatísticas adequadas, envolvendo as etapas de planejamento experimental, confecção do modelo estatístico para descrição dos dados coletados e a análise crítica dos resultados.

Atividades

  • 05/2001 - 08/2001

    Treinamentos ministrados , Instituto Biotecnológico de Reprodução Vegetal.Treinamentos ministrados, Métodos estatísticos - planejamento e análise de experimentos com a utilização de computadores

2002 - 2002

Universidade Estadual de Londrina

Vínculo: Professor colaborador, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 3

Outras informações:
Colaborou em disciplinas curriculares do curso de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular, ministrando as aulas de bioinformática.

2002 - 2002

Universidade Estadual de Londrina

Vínculo: Professor colaborador, Enquadramento Funcional: Professor

Outras informações:
Colaborou em disciplinas curriculares do curso de Pós-graduação em Ciências de Alimentos, ministrando as aulas de bioinformática.

Atividades

  • 01/2002

    Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Biologia Molecular

  • 01/2002

    Ensino, Ciência de Alimentos, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Biologia Molecular Aplicada a Alimentos

Propriedade Intelectual

Patentes (1)

Tipo Título Data depósito
INVENTOR e DEPOSITANTE Sistema de eletroforese com refrigeração por circulação de água 03/11/2000