Caio Bulgarelli

Bacharel em Sistemas de Informação pela Universidade Estácio de Sá (2007) e Mestre em Ciências pelo programa de Pós-Graduação em Biotecnologia do Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia em parceria com a Universidade Federal do Rio de Janeiro (2016). Atualmente é aluno de Doutorado do programa de Pós-Graduação em Biotecnologia do Inmetro. Atua como pesquisador/desenvolvedor no Inmetro.

Informações coletadas do Lattes em 03/12/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Mestrado em Pós-Graduação em Biotecnologia

2014 - 2016

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia
Título: Desenvolvimento de Software para Screening de Compostos de Interesse em Alvos Moleculares: Aplicação em Doenças Negligenciadas,Ano de Obtenção: 2017
Manuela Leal da Silva.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Screening; Doenças Negligenciadas; Ancoramento Molecular; Docking Molecular.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Sistemas de Informação

2003 - 2007

Universidade Estácio de Sá

Formação complementar

2015 - 2015

Reconstrução, Modelagem e Análise de Redes Metabólicas. (Carga horária: 15h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Segundo Curso de Verão da Pós-graduação em Biofísica. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2015 - 2015

Introdução à Biologia Molecular. (Carga horária: 15h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Processamento Paralelo. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Aprendizagem de Máquina e Reconhecimento de Padrões. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Predição de Estruturas de Proteínas. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Métodos de Docking Receptor-Ligante (DockThor). (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Workshop Met Comp Aplic às Ciências Farmacêuticas. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2014 - 2014

Toxicologia in sílico. (Carga horária: 3h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2014 - 2014

Desenho de Proteínas e Docking Molecular. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Sistemas de Informação.

Participação em eventos

23th Congress of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology. Software Development for Compound Screening on Molecular Targets of Neglected Tropical Diseases. 2015. (Congresso).

Orientou

Caio Felipe de Araujo Ribas Cheohen

Predição Funcional: Sequência vs; Estrutura; Início: 2017; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Ana Larissa Gama Martins Alves

ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Validação Da Eficácia Dos Metódos Automatizados Para Anotação Estrutural Em Larga Escala; Início: 2016; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; (Orientador);

Produções bibliográficas

BULGARELLI, C. ; da Silva, M. L. . ASADrug: A Platform to Accelerate Rational Drug Design. In: XLII Congresso da Sociedade Brasileira de Biofísica, 2017, Santos-SP. Anais do XLII Congresso da Sociedade Brasileira de Biofísica, 2017.
BULGARELLI, C. ; da Silva, M. L. . Web Server and Parameter Definition for Compound Screening on Molecular Targets of Neglected Tropical Disieases. In: XL Annual Meeting of the Sociedade brasileira de Biofísica, 2015, Rio de Janeiro. Annals of XL Annual Meeting of the Sociedade brasileira de Biofísica, 2015.
BULGARELLI, C. ; ALVES, A. L. G. M. ; BISCH, P. M. ; da Silva, M. L. . ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Automação do Sistema Computacional para Anotação de Proteínas em Larga Escala. In: 1º Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofisica, 2015, Natal. Anais do 1º Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofisica, 2015.
BULGARELLI, C. ; da Silva, M. L. . Software Development for Compound Screening on Molecular Targets of Neglected Tropical Diseases. In: 23th Congress of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology, 2015, Foz do Iguaçu. Annals of 23th Congress of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology, 2015.

Projetos de pesquisa

2015 - Atual

ASADock, Descrição: Software que realiza screening de compostos químicos a fim de identificar quais compostos tem maior probabilidade de interação com uma proteína de interesso do usuário.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Caio Bulgarelli - Integrante / Manuela Leal da Silva - Coordenador., Número de produções C, T & A: 3
2013 - Atual

ASAProt, Descrição: Software que realiza predição funcional de proteínas utilizando informações da sequência de aminoácidos e da estrutura tridimensional da proteína. O software processa dados em larga escala e é capaz de analisar genomas e meta-genomas inteiros.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Caio Bulgarelli - Integrante / Manuela Leal da Silva - Coordenador., Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 2

Histórico profissional

Endereço profissional

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Inmetro em Xerém. , Avenida Nossa Senhora das Graças, Vila Nossa Senhora das Graças, 25250020 - Duque de Caxias, RJ - Brasil, Telefone: (021) 21453070

Experiência profissional

2013 - Atual

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor, Carga horária: 40

Outras informações:
Desenvolvimento de softwares na área de biologia computacional para automação de workflow que realiza anotação estrutural de proteínas com acesso através da internet.

2009 - 2013

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor, Carga horária: 40

Outras informações:
Pesquisa e desenvolvimento de software e hardware de controle de um microscópio de força atômica (AFM) de alta velocidade para a utilização em nano-metrologia e caracterização de amostras biológicas.

Atividades

12/2013
Pesquisa e desenvolvimento , Inmetro em Xerém, .,Linhas de pesquisa
06/2016 - 06/2016
Ensino,,Disciplinas ministradas, Biologia Computacional
06/2009 - 12/2013
Pesquisa e desenvolvimento , Inmetro em Xerém, .,Linhas de pesquisa

2006 - 2008

Centro de Inovação Microsoft

Vínculo: Funcionário Terceirizado, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor, Carga horária: 40

Outras informações:
Durante esse período participei do desenvolvimento de sistemas diversos, utilizando as linguagens C# e VB.NET, combinadas as tecnologia ASP.NET, ADO.NET, WPF(Windows Presentation Foundation), SQL, entre outras. Alguns dos projetos que participei incluem o desenvolvimento de um sistema para o TRF (Tribunal Regional Federal), plug-ins para o Microsoft Office 2007, sites de divulgação e uma pesquisa de viabilidade com desenvolvimento de jogos para o console Microsoft XBOX 360 utilizando a tecnologia XNA. Atuei como instrutor em diversos treinamentos sobre a utilização da tecnologia .NET, participei como instrutor em diversas fases do Programa de Formação .NET atualmente chamado de Student to Business (http://proform.msdnbrasil.tempsite.ws/), também ministrei treinamentos internos e POCs (Microsoft Proof of Concept), que são treinamentos voltados para as necessidades das empresas contratantes.

2008 - 2008

Qualidade em sistemas de Informação

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor, Carga horária: 40

Outras informações:
Durante esse período trabalhei no desenvolvimento do sistema de pedágio utilizando .Net 3.5, ADO.NET, ASP.NET com a linguagem C# e banco de dados SQL Server 2005.

2016 - 2016

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 8

Outras informações:
Aulas de Biologia Computacional Aplicada para os cursos de Biotecnologia e Nanotecnologia.

2010 - 2010

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 8

Outras informações:
Aulas de programação e imagens digitais.

2012 - 2016

Kyouiku Método de Ensino Individualizado

Vínculo: Auxiliar, Enquadramento Funcional: Professor auxiliar, Carga horária: 16

Outras informações:
No cargo de professor auxiliar eu ensinava Inglês, Português, Matemática e Japonês. Os alunos eram de todas as idades. Também realizava atividades extras relacionadas às tarefas como forma de incentivar os alunos a estudar.