Luiz Roberto Nunes

Luiz Roberto Nunes é graduado em Ciências Biológicas e Mestre em Parasitologia pela Universidade de São Paulo. Concluiu o doutorado em Biologia Molecular e Genética pela Virginia Commonwealth University (USA) em 1996. Atualmente, é Professor Associado na Universidade Federal do ABC. Durante 1997 e 2011, foi professor da Universidade de Mogi das Cruzes, onde desempenhou diversas funções de natureza docente e acadêmico-administrativas. Publicou mais de 40 artigos em periódicos especializados, dois capítulos de livro e mais de 80 trabalhos em anais de eventos. Possui 6 produtos tecnológicos registrados, entre patentes e software. Supervisionou dois projetos de Pós-Doutoramento; orientou 6 teses de doutorado, 10 dissertações de mestrado e vários trabalhos de iniciação científica nas áreas de Genética e Bioquímica. Recebeu 2 prêmios e/ou homenagens, incluindo a Medalha do Mérito Científico e Tecnológico do Governo do Estado de São Paulo. Atua na área de Microbiologia, com ênfase em Biologia Molecular e Genômica. Em suas atividades profissionais, interagiu com 167 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos. Em seu currículo Lattes, os termos mais freqüentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: microarray, Xylella fastidiosa, Paracoccidioides brasiliensis, Trypanosoma cruzi e genômica.

Informações coletadas do Lattes em 28/07/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Molecular Biology And Genetics

1992 - 1996

Virginia Commonwealth University
Título: Structure and Expression of the SL Genes in Trypanosomatids
Orientador: Gregory Allen Buck
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas

Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)

1989 - 1991

Universidade de São Paulo
Título: Análise Filogenéticade Tripanosomatídeos dos gêneros Herpetomonas e Phytomonas através de sondas de kDNA e rDNA, Ano de Obtenção: 1991
Maria Heloiza Trebilcock Affonso.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Ciências Biológicas

1985 - 1988

Universidade de São Paulo

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Protozoologia de Parasitos.

Organização de eventos

NUNES, L. R. ; COSTA DE OLIVEIRA, R . XIV Congresso de Iniciação Cientifica da UMC. 2011. (Congresso).

NUNES, L. R. ; COSTA DE OLIVEIRA, R . XIII Congresso de Iniciação Cientifica da UMC. 2010. (Congresso).

NUNES, L. R. ; COSTA DE OLIVEIRA, R . XII Congresso de Iniciação Científica da UMC. 2009. (Congresso).

NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . XI Congresso de Iniciação Científica da UMC. 2008. (Congresso).

NUNES, L. R. ; de Almeida, PC . X Congresso de Iniciação Científica da UMC. 2007. (Congresso).

NUNES, L. R. ; de Almeida, PC . IX Congresso de Iniciação Científica da UMC. 2006. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Valquiria Campos Alencar

NUNES, L. R.OLIVEIRA, Regina Costa deSHIDA, CLÁUDIO S.. Análise genômica comparativa entre isolados de Xylella fastidiosa associados à CLS. 2012. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Flávia Elídia Gandolfi Feitosa

NUNES, L. R.; Pizirani-Kleiner AA;OLIVEIRA, Regina Costa de. Modulação da expressão gênica da fitobactéria Xylella fastidiosa em diferentes condições de densidade celular. 2007. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Simone Dreher

NUNES, L. R.; CAIRES, Antônio Carlos Fávero; BATISTA, Alzir de Azevedo. Síntese e Aplicação de Paladociclos Contendo o Ligante 1,2-Bis (Difenilfosfosina) Etano como agentes antitumorais. 2004. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Mariana Fiscaletti

NUNES, L. R.; MALDONADO, Gabriel Padila; AZEVEDO, João Lúcio de. Importancia de la biotecnología en la agricultura: aplicación de una metodología basada en la reacción de la cadena de la polimerasa (PCR) y ensayos de viruencia para caracterizar aislamientos de Pyricularia grisea, principal patógeno del arroz. 2003. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Giane Mie Yanai

NUNES, L. R.; ALBANO, Rodolpho de Mattos; CAVALCANTI, Paulo. Análise Genômica Comparativa de Xylella fastidiosa através de hibridações em microarranjos de DNA. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia (Biociências Nucleares)) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro.

Aluno: Viviane Monteiro Góes

NUNES, L. R.ROMANHA, Álvaro José; YAMADAOGATA, Sueli. Genômica Funcional dos Genes diferencialmente representados nas formas epimastigotas do Trypanosoma cruzi (Chagas, 1909). 2002. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Débora Pereira Santana

RODRIGUES, T.;NUNES, L. R.; PAREDES-GAMERO, E. J.; MILLAZOTTO, M. P.; CUNHA, R. L. O.. Estudo dos Mecanismos de Indução de Apoptose por Paladaciclos em Células em Cultura. 2013. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Ana Claudia de Freitas Oliveira

OLIVEIRA, Regina Costa deNUNES, L. R.; ARAUJO, W. L.;PUCCIA, Rosana; ARAUJO, D. R.. Estudos do efeito de compostos fenotiazínicos no perfil transcricional e resistência múltipla a drogas em Paracoccidioides brasiliensis. 2013. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: ROSICLER LAZARO BARBOSA

NUNES, L. R.; SILVA, A. P.; Marques, MV; Benedetti, CE. Análise funcional e estrutural da proteína BigR de Xylella fastidiosa envolvida na regulação do operon Xf0768-0764. 2008. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Cintia Kawai

NUNES, L. R.; Tersariol, I; Vercesi, A; Nantes, IL. Identificação e caracterização de um novo sítio de interação de citocromo c com vesículas que mimetizam a membrana mitocondrial interna. 2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes.

Aluno: Gustavo Henrique Esteves

NUNES, L. R.; VERJOVSKIALMEIDA, Sérgio; Neves, EJ; Garcia, NL; Cesar Júnior, RM. Métodos estatísticos para a análise de dados de cDNA microarray em um ambiente computacional integrado. 2007. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Sibele Inácio Meireles

NUNES, L. R.; REIS, Luiz Fernando Lima; CAMARGO, Anamaria. Desenvolvimento de um método de diagnóstico molecular para o câncer gástrico baseado na análise do perfil de expressão gênica através da metodologia de cDNA array. 2003. Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Beatriz Simonsen Stolf

NUNES, L. R.; REIS, Luiz Fernando Lima; SOGAYAR, Mari Cleide; KIMURA, Edna; VERJOVSKIALMEIDA, Sérgio. Identificação de marcadores moleculares para o câncer de tireóide por cDNA microarrays. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

NUNES, L. R.; LOPES, José. Avaliação de Condições de Oferta de Cursos de Biologia. 2000. Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.

NUNES, L. R.. Banca de Seleção de candidatos para o programa de Doutorado em Bioinformática da USP. 2004. Universidade de São Paulo.

NUNES, L. R.. Banca de seleção para candidatos ao programa de Doutorado em Bioinformática da USP. 2003. Universidade de São Paulo.

Orientou

Domingos Pereira Pazo Filho

Desenvolvimento de uma estratégia diagnóstica do tipo ?point of care? para a detecção quantitativa de infecção pelo citomegalovírus humano (HCMV); Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC; (Orientador);

HIGOR BARRETO CAMPOS

Desenvolvimento de um equipamento integrado parta a detecção quantitativa de microrganismos deteriorantes de cerveja em ambiente industrial; Início: 2024; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

René Aduan Júnior

Desenvolvimento de um sistema de Point of Care Testing (PoCT) para a detecção e quantificação de microrganismos deteriorantes de cerveja em ambiente industrial; 2023; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Vinícius Manganaro Farnézio

Construção de uma linhagem geneticamente modificada de Zymomonas mobilis com vistas à produção de álcoois de cadeia longa; 2021; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Renata Ozelami Vilas Boas

Análise Transcriptômica Global de Zymomonas mobilis (ZM4) na presença do Auto Indutor de Quorum Sensing (QS) Tipo 2 (AI-2); 2019; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Fabiano Bezerra Menegidio

Perfil transcricional de Vitis vinifera apresentando sintomas da doença de Pierce; 2016; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Flávio Francisco da Silva

Montagem e análise genômica: estudo de casos de isolados de Xylella fastidiosa oriundos de Taiwan; 2016; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Débora Liliane de Souza Reno

ANÁLISE DOS EFEITOS DA TELURANA RF-28 SOBRE O CRESCIMENTO E A EXPRESSÃO GÊNICA GLOBAL EM Paracoccidioides brasiliensis; 2015; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Carla Tavares

Perfil Transcricional de Xylella fastidiosa em resposta ao estresse oxidativo induzido por Paraquat; 2007; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Fundação de Amparo ao Ensino e à Pesquisa; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Maristela Boaceff Ciraulo

Análise genômica funcional da bactéria fitopatogênica Xylella fastidiosa cultivada em 3G10R, um meio baseado na composição química do xilema; 2006; 87 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Secretaria Estadual da Educação; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Daniela Batista Leite

Análise da transição Micélio-Levedura do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis através de hibridação em microarranjos de DNA; 2005; 74 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Nair Hideko Muto

Análise do Processo de diferenciação celular do Trypanosoma cruzi através de hibridação em microarranjos de DNA: comparação de resultados obtidos com diferentes frações de RNA do parasita; ; 2002; 59 f; Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Fundação Oswaldo Cruz, ; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Juliana de Fátima Santos Silva

CARACTERIZAÇÃO DO MECANISMO DE QUORUM SENSING (QS) EM Zymomonas mobilis EM RESPOSTA AO AUTO-INDUTOR DO TIPO 2 (AI-2); 2022; Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

David Aciole Barbosa

ANÁLISE DA COMPOSIÇÃO E DA INFLUÊNCIA EXERCIDA PELA MICROBIOTA INTESTINAL FÚNGICA DE CAMUNDONGOS DURANTE O DESENVOLVIMENTO DE CAQUEXIA INDUZIDA POR TRANSPLANTE DE CÉLULAS DE CÂNCER PULMONAR (LLC); 2022; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Fabiano Bezerra Menegidio

Reprodutibilidade e replicabilidade em análises de bioinformática utilizando contêineres Docker; 2020; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Valquiria Campos Alencar

Caracterização funcional e evolutiva do gene UDP-xilose sintase em Xylella fastidiosa, envolvido na síntese de Lipopolissacarídeos (LPS); 2016; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Daiene Souza Santos

Análise in planta da expressão de genes potencialmente envolvidos com o processo infeccioso da Xylella fastidiosa; 2013; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, ; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Marcus Vinícius de Oliveira

Análise do perfil transcricional de Paracoccidioides brasiliensis em resposta a stress oxidativo; 2009; 0 f; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Fundação de Amparo ao Ensino e à Pesquisa; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Valquiria Campos Alencar

2017; Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Luiz Roberto Nunes;

Daniela Leite Jabes

2015; Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Luiz Roberto Nunes;

Juliana de Fátima Santos Silva

Clonagem, expressão e purificação da enzima recombinante 4-Hidroxifenil Piruvato Dioxigenase (4-HPPD) de Paracoccidioides brasiliensis; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Renata Ozelami Vilas Boas

ANÁLISE DA AÇÃO DA TIORIDAZINA SOBRE A VIA CWI (CELL WALL INTEGRITY SIGNALLING PATHWAY) NA PAREDE CELULAR DE LEVEDURAS DE Paracoccidioides brasiliensis; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Nayara Ribeiro Magalhães

Efeito de novas drogas sobre o crescimento e a expressão gênica de Xylella fastidiosa; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

David Aciole Barbosa

Análise de efeitos da Telurana RF-07 sobre a expressão gênica de Paracoccidioides brasiliensis; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Daiene Souza Santos

Análise in planta da expressão de genes potencialmente envolvidos com o processo infeccioso da Xylella fastidiosa; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Fabiana Barros Rodrigues

Análise comparativa entre dois isolados de Xylella fastidiosa associados à CVC; Início: 2005; Iniciação científica; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Daniela Batista Leite

Resposta a stress oxidativo em Xylella fastidiosa: identificação e caracterização dos genes ativados por OxyR; 2000; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Cláudia renata Muniz

Estudo da degradação de goma xantana por microorganismos endofíticos isolados de plantas cítricas; 2000; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Maroá Schaaf Zotelli

Genômica Comparativa de isolados de Xylella fastidiosa; 2000; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Adriana Ribeiro de Oliveira

Análise de variabilidade genética no gênero Capsicum através de RAPD; 1999; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Roberto Nunes;

Produções bibliográficas

BATISTA DA SILVA, IURI ; BARBOSA, D. A. ; KAVALCO, KARINE FREHNER ; NUNES, L. R. ; PASA, RUBENS ; MENEGIDIO, FABIANO B. . Discovery of putative long non-coding RNAs expressed in the eyes of Astyanax mexicanus (Actinopterygii: Characidae). Scientific Reports , v. 13, p. 1, 2023.
ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ARAÚJO, BRUNO C. ; BRANCO, GIOVANA SOUZA ; SIMEONE, ALEXANDRE S. ; HILSDORF, ALEXANDRE W. S. ; JABES, DANIELA L. ; Nunes, Luiz R. ; MOREIRA, RENATA G. ; MENEGIDIO, FABIANO B. . Transcriptomic Profiling and Microsatellite Identification in Cobia (Rachycentron canadum), Using High-Throughput RNA Sequencing. MARINE BIOTECHNOLOGY , v. 24, p. 255-262, 2022.
ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; SILVA, JULIANA DE FÁTIMA DOS SANTOS ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; FARNÉZIO, VINÍCIUS MANGANARO ; DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ALMEIDA, ALEX TRAMONTIN ; DE SOUZA, EMANUEL MALTEMPI ; MÜLLER-SANTOS, MARCELO ; JABES, DANIELA L. ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; RODRIGUES, Tiago ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; WALMSLEY, ADRIAN R. ; NUNES, L. R. . The Quorum Sensing Auto-Inducer 2 (AI-2) Stimulates Nitrogen Fixation and Favors Ethanol Production over Biomass Accumulation in Zymomonas mobilis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 22, p. 5628, 2021.
DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; SANTOS, KALTINAITIS B. N. H. ; HUMBERTO, ANA CAROLINA ; ALENCAR, VALQUÍRIA C. ; SILVA, JULIANA F. S. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; BATISTA JR, MIGUEL L. ; Nunes, Luiz R. ; JABES, DANIELA L. . Analysis of mouse faecal dysbiosis, during the development of cachexia, induced by transplantation with Lewis lung carcinoma cells. MICROBIOLOGY-SGM , v. 167, p. 001088, 2021.
ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ARAÚJO, BRUNO C. ; BRANCO, GIOVANA SOUZA ; SIMEONE, ALEXANDRE S. ; HILSDORF, ALEXANDRE W. S. ; JABES, DANIELA L. ; NUNES, L. R. ; MOREIRA, RENATA G. ; MENEGIDIO, F. B. . Transcriptomic Profiling and Microsatellite Identification in Cobia (Rachycentron canadum), Using High-Throughput RNA Sequencing. MARINE BIOTECHNOLOGY , v. X, p. X, 2021.
MUÑOZ, JULIÁN E. ; ROSSI, DIEGO C. P. ; JABES, DANIELA L. ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; CUNHA, FERNANDA F. M. ; Nunes, Luiz R. ; ARRUDA, DENISE C. ; PELLESCHI TABORDA, CARLOS . In Vitro and In Vivo Inhibitory Activity of Limonene against Different Isolates of Candida spp.. JOURNAL OF FUNGI , v. 6, p. 183, 2020.
JABES, DANIELA L. ; DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; SANTOS, KALTINAITIS B. N. H. ; CARVALHO, LUCAS M. ; HUMBERTO, ANA CAROLINA ; ALENCAR, VALQUÍRIA C. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; BATISTA, MIGUEL L. ; MENEGIDIO, F. B. ; NUNES, L. R. . Fungal Dysbiosis Correlates with the Development of Tumor-Induced Cachexia in Mice. JOURNAL OF FUNGI , v. 6, p. 364, 2020.
MENEGIDIO, FABIANO B ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ALENCAR, VALQUÍRIA C ; VILAS BOAS, RENATA O ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; JABES, DANIELA L ; NUNES, L. R. . Transcriptomic profiling identifies novel transcripts, isomorphs, and noncoding RNAs in Paracoccidioides brasiliensis. MEDICAL MYCOLOGY , v. 59, p. 197-200, 2020.
ACIOLE BARBOSA, DAVID ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; GONÇALVES, RAFAEL S. ; SILVA, JULIANA DE FÁTIMA SANTOS ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; FAUSTINO DE MARIA, YARA NATÉRCIA LIMA ; JABES, DANIELA LEITE ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; Nunes, Luiz R. . ParaDB: A manually curated database containing genomic annotation for the human pathogenic fungi Paracoccidioides spp.. PLoS Neglected Tropical Diseases , v. 13, p. e0007576, 2019.
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ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; JABES, DANIELA LEITE ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; SASSAKI, GUILHERME LANZI ; DE SOUZA, LUCAS RODRIGO ; PUZER, LUCIANO ; MENEGHETTI, MARIA CECÍLIA ZORÉL ; LIMA, MARCELO ANDRADE ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; NUNES, L. R. . Functional and Evolutionary Characterization of a UDP-Xylose Synthase Gene from the Plant Pathogen Xylella fastidiosa , Involved in the Synthesis of Bacterial Lipopolysaccharide. BIOCHEMISTRY , v. 56, p. 779-792, 2017.
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NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; YANAI, Giane Mie ; LEITE, Daniela Batista ; SILVA, Vivian Shmidt da ; TACON, Naiara Scaglia ; BATISTA, W L ; CARVALHO, KC ; NÓBREGA, Marina P ; NÓBREGA, Francisco G ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho ; PUCCIA, Rosana ; MARQUES, Everaldo Reis ; SAVOLDI, M ; GOLDMAN, Maria Helena ; GOLDMAN, Gustavo Henrique . Microarray analysis of the micelium to yeast transition in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. In: 49 Congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. Meeting Abstract Book, 2003. v. 1. p. 1-1.
PROBST, Christian M ; KRIEGER, Marco A ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; GOLDENBERG, Samuel ; Et al. . Analysis of gene expression during T. cruzi metacyclogenesis using microarrays. In: 2003 Molecular Parasitology Meeting, 2003, Woods Hole, MA. Meeting Abstract Book, 2003. v. 1. p. 1-1.
GOLDMAN, Gustavo H ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R. ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho ; PUCCIA, Rosana ; TEKAIA, Fradj ; NÓBREGA, Marina P ; NÓBREGA, Francisco G ; GOLDMAN, Maria Helena . EST analysis of the human pathogen Paracoccidioides brasiliensis yeast phase: identification of putative homologs of Candida. In: 22nd Fungal Genetics Conference, 2003, Pacific Grove. CA. Meeting Abstract Book, 2003. v. 1. p. 1-1.
PAVONI, D ; ÁVILA, A ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; GOLDENBERG, S ; KRIEGER, Marco Aurélio ; Et al. . Evaluation using microarray technology of polysomal mobilization in gene expression regulation during the Trypanosoma cruzi metacyclogenesis. In: 2003 Molecular Parasitology Meeting, 2003, Wood´s Hole, MA. Meeting Abstract Book, 2003. v. 1. p. 1-1.
MURTA, S ; KRIEGER, Marco A ; MONTENEGRO, L R ; CAMPOS, F M F ; PROBST, Christian M ; ÁVILA, A ; MUTO, Nair H ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R. ; GOLDENBERG, S ; ROMANHA, Álvaro José . Confirmation of differential gene expression levels ofTrypanosoma cruzi populations succeptible and resistance to Benznidazole. In: XXX Anual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2003, Caxambu, MG. Revista do Instituto Brasileiro de Medicina Tropical, 2003. v. 45. p. 55-55.
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; KRIEGER, Marco Aurélio ; GOLDENBERG, Samuel ; MUTO, Nair Hideko . Analysis of the Gene Expression Program During the Cellular Differentiation of Trypanosoma cruzi (metacyclogenisis) Through Microarray Hybridization.. In: Molecular Parasitology Meeting, 2002, Wood´s Hole. Abstracts from the 2003 Molecular Parasitology Meeting, 2002. v. -. p. ---.
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; ARAUCO, Paulo Rodrigo ; LEITE, Daniela Batista . Cloning and Characterization of scXAF-1: an apoptosis-inducing factor from sugarcane that is conserved between plants and human cells. In: 48 Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Resumos do 48 Congresso Nacional de Genética, 2002. v. -. p. ----.
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; SOUZA, Alessandra Alves de ; YANAI, Giane Mie ; D.COLETTA FILHO, Helvécio ; MACHADO, Marcos Antonio ; H.MUTO, Nair ; CALDANA, Camila ; TAKITA, Marco Aurélio . Expressão de Genes e compostos extracelulares de Xylella fastidiosa crescidas em condições de biofilme. In: 48 Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Resumos do 48 Congresso Nacional de Genética, 2002. v. -. p. ---.
NUNES, L. R. ; LEITE, Daniela Batista ; SOUZA, Alessandra Alves de ; D.COLETTA FILHO, Helvécio ; YANAI, Giane Mie ; MACHADO, Marcos Antonio ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; ROSATO, Yoko B ; GONÇALVES, Edmilson R . A microarray-based genomic comparison among Xylella fastidiosa strains isolated from different plant hosts and diverse geographical distribution. In: 48 Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Resumos do 48 Congresso Nacional de Genética, 2002. v. -. p. ---.
NUNES, L. R. ; H.MUTO, Nair ; YANAI, Giane Mie ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; GOLDENBERG, Samuel ; KRIEGER, Marco Aurélio . Functional Genomic Analisys of Trypanosoma cruzi cellular differentition process (Metacyclogenesis) using microarray technology. In: 48 Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Resumos do 48 Congresso Nacional de genética. v. -. p. ---.
NUNES, L. R. ; ROMANHA, Álvaro José ; MURTA, Silvane ; MUTO, Nair H ; YANAI, Giane Mie ; KRIEGER, Marco Aurélio ; GOLDENBERG, Samuel . Functional genomic analysis of drug resistance in Trypanosoma cruzi. In: XXIX Reunião Anual de Pesquisa Básica Doença de Chagas, 2002, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina tropical de São Paulo, 2002. v. 44. p. 24-24.
SOUZA, Alessandra A de ; TAKITA, Marco A ; KURAMAEIZIOKA, Eiko ; CALDANA, Camila ; YANAI, Giane Mie ; MUTO, Nair H ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R. ; MACHADO, Marcos A . Differential expression profile of Xylella fastidiosa cells grown under aggregating and non-aggregating conditions revealed by microarray hybridization analysis. In: XV conference of the international organization of citrus virologists, 2001, Parros. Programme and Abstracts from the XV conference of the international organization of citrus virologists, 2001. v. 1. p. 166-166.
NUNES, L. R. ; YANAI, Giane Mie ; MUTO, Nair H ; MADELLA, Cláudia R ; MITNE, Melissa ; ZOTELLI, Maroá S ; LEITE, Daniela B ; SOUZA, Alessandra A de ; D.COLETTA FILHO, Helvécio ; MACHADO, Marcos A ; OLIVEIRA, Regina Costa de . Genomic comparisons among Xylella fastidiosa strains through microarray hybridization analysis. In: I Brazilian International Genomics Conference, 2001, Angra dos Reis. BIG Abstract Book, 2001. v. 1. p. 1-1.
KRIEGER, Marco A ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; GOLDENBERG, Samuel . Specific gene expression and chronological gene program during Trypanosoma cruzi cellular differentiation. In: Molecular Parasitology Meeting, 2001, Wood´s Hole, MA. Molecular Parasitology Meeting Abstract Book, 2001. v. 1. p. 237B-237B.
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; MUTO, Nair H ; YANAI, Giane M ; KRIEGER, Marco A ; GOLDENBERG, Samuel . Analysis of the metacyclogenesis process in Trypanosoma cruzi by microarray hybridization analysis. In: XVIII Annual meeting on basic research in Chagas disease, 2001, Caxambu. Meeting Abstract Book, 2001. v. 1. p. 20-20.
KRIEGER, Marco A ; MUTO, Nair Hideko ; YANAI, Giane Mie ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R. ; GOLDENBERG, Samuel . Gene expression regulation during Trypanosoma cruzi metacyclogenesis. In: XXVIII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2001. Meeting Abstract Book. v. 1. p. 28-28.
NUNES, L. R. . Specific gene expression and chronological gene programming during Trypanosoma cruzi differentiation. In: International workshop of Molecular Biology of Stress Responses, 2001, Mendoza. Meeting Abstract book, 2001. v. 1. p. 33-33.
KRIEGER, Marco Aurélio ; YAMADAOGATA, Sueli ; ÁVILA, A R ; Dallagiovanna, B. ; Monteiro, V.S. ; Sotomaior V. ; Freund, A. ; Miranda, A. ; COSTA DE OLIVEIRA, R ; NUNES, L. R. ; BUCK, G. A. ; GOLDENBERG, Samuel . Differential gene expression during Trypanospma cruzi metacyclogenesis: new gene discovery and functional genomic analysis. In: XXVII Reunião Anual de Pesquisa Básica em Doenças de Chagas, 2000, Caxambu. Anais da XXVII Reunião Anual de Pesquisa Básica em Doenças de Chagas, 2000. v. 1. p. 1.
NUNES, L. R. ; LEITE, Daniela B ; MITNE, Melissa ; Pereira, B.F. ; ZOTELLI, Maroá S ; COSTA DE OLIVEIRA, R . Analysis and identification of oxidative-stress response genes (OSR) in Xylella fastidiosa. In: 46º Congresso Nacional de Genética, 2000, Águas de Lindóia. Resumo do 46º Congresso Nacional de Genética res.# GMV070. Ribeirão Preto: Ed. SBG, 2000. v. 1. p. 1-1.
YANAI, Giane M ; COSTA DE OLIVEIRA, R ; Burlamaqui, J.C. ; NUNES, L. R. . Mutations in the connexin 26 gene correlated with non-syndromic hereditary hearing loss. In: 46º Congresso nacional de Genética, 2000, Águas de Lindóia. Resumos do 46º Congresso Nacional de Genética res.# GC011. Ribeirão Preto: Ed. SBG, 2000. v. 1. p. 1-1.
YANAI, Giane M ; COSTA DE OLIVEIRA, R ; Burlamaqui, J.C. ; NUNES, L. R. . Mutations in the connexin 26 gene correlated with non-syndromic hereditary hearing loss. In: 45º Congresso Nacional de Genética, 1999, Gramado. Resumos do 45º Congresso Nacional de Genética - res. 13-033, 1999. v. 1. p. 554-554.
RIBEIRO, C.R. ; NUNES, L. R. ; AZEVEDO, João Lúcio de ; COSTA DE OLIVEIRA, R . Isolation of xanthan gum-degrating endophutic microorganisms. In: 45º Congresso Nacional de Genética, 1999, Gramado. Resumos do 45º Congresso Nacional de Genética res. #08-053, 1999. v. 1. p. 416-417.
NUNES, L. R. ; CARVALHO, M. R. ; BUCK, G. A. . Trypanosoma cruzi strains partition into two subgroups based on the structure and function of the SL RNA and rRNA gene promoters. In: VII Molecular Parasitology Meeting, 1996, Wood's Hole. Abstracts book of the VII Molecular Parasitology Meeting, 1996. v. 1. p. 1.
SERRANO, M. G. ; NUNES, L. R. ; CAMPANER, M. ; BUCK, G. A. ; CAMARGO, E. P. ; TEIXEIRA, M. G. . Phytomonas: genus identification by PCR amplification of Spliced Leader gene sequences. In: XII Reunião da Sociedade Brasileira de Protozoologia, 1996, Caxambu. Anais da XII Reunião da Sociedade Brasileira de Protozoologia, 1996. v. 1. p. 1.
CARVALHO, M. R. ; NUNES, L. R. ; HARRIS-KERR, C. ; Floeter-Winter, L.M. ; BUCK, G. A. . Functional specificity of the SL gene and rRNA promoters among several strains of Trypanosoma cruzi. In: XXII Encontro Anual de Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 1995, Caxambu. Anais do XXII Encontro Anual de Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 1995. v. 1. p. 1.
NUNES, L. R. ; BUCK, G. A. . A cis-acting element responsible for transcription of the SL RNA from Trypanosoma cruzi is recognized by a putative transcription factor present in nuclear extracts from the parasite. In: V Molecular Parasitology Meeting, 1994, Wood's Hole, MA. Abstracts book of the V Molecular Parasitology Meeting, 1994. v. 1. p. 1.
NUNES, L. R. ; METCHEVA, I. ; BUCK, G. A. . Characterization of the spliced leader genes and transcripte in five Phytomonas isolates. In: IV Molecular Parasitology Meeting, 1993, Wood's Hole, MA. Abstracts book of the IV Molecular Parasitology Meeting, 1993. v. 1. p. 1.
HARRIS-KERR, C. ; NUNES, L. R. ; SHAKARIAN, A M ; SHORT,S. ; Floeter-Winter, L.M. ; BUCK, G. A. . Characterization of the SL RNA and rRNA gene promoters in Trypanosoma cruzi. In: IV Molecular Parasitology Meeting, 1993, Wood's Hole. Abstracts book of the IV Molecular Parasitology Meeting, 1993. v. 1. p. 1-1.
SHORT,S. ; NUNES, L. R. ; HARRIS-KERR, C. ; Floeter-Winter, L.M. ; BUCK, G. A. . Expression of a heterologous gene in Trypanosoma cruzi epimastigotes using theSL-RNA and the rRNA promoters. In: III Molecular Parasitology Meeting, 1992, Wood's Hole, MA. Abstracts book of the III Molecular Parasitology Meeting, 1992. v. 1. p. 1.
NUNES, L. R. ; AFFONSO, H. T. ; TEIXEIRA, M. G. ; Floeter-Winter, L.M. ; SOARES, M.B.M. ; CAMARGO, E. P. . A kDNA probe from Herpetomonas megaseliae suggests a close phylogenetic relationship between Phytomonas and Herpetomonas. In: XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBQ), 1989, Caxambú. Anais da XVIII Reunião Anual da SBBQ, 1989. v. 1. p. 1.
MARINOTTI, O. ; NUNES, L. R. ; BIANCHI, A. G. . Glycosylation heterogeneity in Musca domestica arylphorin. In: Simpósio Internacional sobre Fisiologia, Bioquímica e Controle de Insetos, 1987, Rio de Janeiro. Anais do Simpósio Internacional sobre Fisiologia, Bioquímica e Controle de Insetos, 1987. v. 1. p. 1.
NUNES, L. R. . A molecular survey of the genomic composition among citrus-associated isolates of Xylella fastidiosa. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Analysis and identification of oxidative-stress-response genes (OSR) in Xylella fastidiosa. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Análise genômica funcional do Paracoccidioides brasiliensis. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Análise estrutural e funcional de xylella fastidiosa através da técnica de hibridação em microarranjos de DNA. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Functional and comparative genomic analysis of Xylella fastidiosa through microarray hybridization. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Specific gene expression and chronological gene program during Trypanosoma cruzi cellular differentiation (metacyclogenesis). 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. . Analysis of the metacyclogenesis process in trypanosoma cruzi through microarray hybridization analysis. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . Functional and Comparative Genomic Analysis Using Microarray Hybridization - Xylella fastidiosa as a model. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . Minicurso: A Tecnologia de Microarrays - uma abordagem Teórico-Prática. 2000. (Apresentação de Trabalho/Outra).
NUNES, L. R. . A hibridação de micro-arrays e sua utilização para estudos de genômica funcional e comparativa. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . Minicurso: A tripla hélice - histórico, fundamentos e aplicações em biotecnologia e terapia gênica. 1998. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

NUNES, L. R. . Sequencia genômica de Leptospira interrogans. 2002.

NUNES, L. R. . Sequencia genômica de Xylella fastidiosa. 2000.

NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; KRIEGER, Marco Aurélio ; GOLDENBERG, Samuel . Genômica Estrutural e Funcional. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; KRIEGER, Marco Aurélio ; GOLDENBERG, Samuel . Genômica Estrutural e Funcional. 2001. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . ATecnologia de Microarrays - Uma Abordagem Teórico-Prática. 2000. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de . A Tripla Hélice: Histórico, Fundamentos e Aplicações em Biotecnologia e Terapia Gênica. 1998. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2017 - Atual

Caracterização de elementos promotores responsivos ao auto-indutor de quorum sensing (QS) tipo 2 (AI-2) em Zymomonas mobilis, Descrição: A bactéria Gram-negativa Zymomonas mobilis apresenta diversas características que a tornam atrativa para a produção industrial de diferentes bioprodutos, incluindo o bioetanol. Por exemplo, Z. mobilis pode ser cultivada tanto em condições aeróbicas como anaeróbicas, é capaz de converter glicose a etanol com uma eficiência ainda maior do que a própria Saccharomyces cerevisiae e tolera maiores concentrações deste álcool durante o processo de fermentação. Além disso, técnicas de manipulação genética foram desenvolvidas para esta bactéria, que vem sendo modificada geneticamente e/ou adaptada para produzir diversos produtos de alto valor agregado (como levano, sorbitol, lactato, polihidroxibutirato e 2,3-butanodiol, entre outros), além de incorporar fontes alternativas de carbono às suas vias metabólicas, como as pentoses xilose e arabinose. Dessa forma, Z. mobilis vem sendo vista como um microrganismo de grande potencial para a indústria de bioconversão e um melhor entendimento acerca dos mecanismos por ela utilizados para o controle de sua expressão gênica pode auxiliar no desenvolvimento de novas linhagens geneticamente manipuladas, com elevada capacidade de produção industrial. Nesse sentido, foi demonstrado recentemente que Z. mobilis é capaz de responder ao indutor de quorum sensing (QS) do tipo 2 (denominado auto-indutor 2, ou AI-2). O AI-2 é uma das moléculas utilizadas por bactérias para controlar o processo de QS, responsável por avaliar a densidade populacional do meio e sincronizar seu comportamento em escala comunitária. A ativação da resposta QS leva à diminuição no ritmo de crescimento celular, ao mesmo tempo em que ativa a expressão de genes envolvidos com uma série de atividades alternativas. Nesse sentido, se genes de interesse industrial forem incorporados ao genoma de Z. mobilis, sob o controle de promotores responsivos a AI-2, seria possível induzir sua expressão de maneira controlada, através da adição deste sinalizador às culturas, já que Z. mobilis, embora sensível a AI-2, não é capaz de sintetizá-lo. Dessa forma, o projeto aqui proposto tem por objetivo caracterizar a resposta de Z. mobilis ao sinalizador de QS AI-2, identificando os genes/operons que têm sua expressão modulada em resposta a esta molécula, bem como os elementos cis-ativadores (promotores) e trans-ativadores (fatores de transcrição) que medeiam este processo. Estes estudos levarão ao isolamento e compreensão acerca do funcionamento dos primeiros promotores indutíveis em Z. mobilis, que poderão ser desenvolvidos (e futuramente patenteados) em uma importante ferramenta para a manipulação desta bactéria, com amplas possibilidades de aplicação na indústria de bioprocessamento, já que permitirá a expressão de transgenes nesta bactéria, sob situações controladas e otimizadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Ivarne Tersariol - Integrante / Valquíria Campos Alencar - Integrante / Fabiano Bezerra Menegidio - Integrante / COSTA DE OLIVEIRA, REGINA LÚCIA BATISTA DA - Integrante / Renata Ozelami Vilas Boas - Integrante / Juliana de Fátima Santos Silva - Integrante / Adrian Robert Walmsley - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2009 - 2012

Análise da Expressão Genica da Fitobactéria Xylella fastidiosa in planta. Processo FAPESP# 2009/50115-3 - Valor Total = R$ 225.061,23, Descrição: O projeto visa ao estudo da expressão gênica em Xf 9a5c, sob condições de cultivo in planta, através da técnica de hibridação em microarranjos de DNA. Uma vez que a quantidade de RNA que pode ser obtida de amostras oriundas do interior dos vasos xilemáticos é reduzida, este procedimento envolveria, necessariamente, a padronização de um protocolo de amplificação do RNA bacteriano, bem como alguns outros procedimentos associados ao aumento da eficiência do processo e de seu controle de qualidade. Em termos sumários, os objetivos específicos deste projeto seriam: ? Testar e padronizar diferentes protocolos visando à amplificação do RNA de Xf 9a5c crescida em meio de cultura ? Testar e padronizar a metodologia de enriquecimento do RNA mensageiro de Xf 9a5c através de técnicas que visam subtrair o rRNA da população de RNA total. ? Comparar a eficiência da amplificação com amostras enriquecidas e não enriquecidas. ? Padronizar os protocolos de marcação e hibridação com microarranjos de DNA usando aRNA obtido de amostras enriquecidas e não enriquecidas. ? Verificar a correlação existente entre hibridações realizadas com RNA amplificado e RNA não amplificado. ? Aperfeiçoar a metodologia para obtenção do maior número possível de células de Xf 9a5c a partir do xilema de plantas infectadas. ? Testar diferentes metodologias de extração de RNA destas células, de maneira a obter material com qualidade e quantidade suficientes para a reação de amplificação. ? Obter dados referentes ao padrão de expressão gênica de Xf 9a5c in planta, através de hibridação em microaranjos de DNA utilizando aRNA. ? Comparar os padrões de expressão gênica em bactérias obtidas de plantas sintomáticas e plantas não sintomáticas. ? Verificar as variações temporais no transcriptoma de Xf 9a5c desde os primeiros dias pós-infecção até o desenvolvimento da CVC nas plantas infectadas (comparando bactérias oriundas de plantas que desenvolvam a doença e de plantas que permaneçam saudáveis). ? Confirm. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / R Costa de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 11
2004 - 2007

Análise genômica comparativa de isolados de Xylella fastidiosa associados à CVC no estado de São Paulo - Proc. FAPESP # 03/07553-3 - Valor Total = R$ 239.669,35, Descrição: Estudos envolvendo a caracterização de outros isolados de Xylella fastidiosa têm centrado suas atenções em isolados norte-americanos. Este projeto teve por objetivo ampliar nosso conhecimento acerca de isolados desta bactéria que são isolados de plantas cítricas na América do Sul.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Regina Costa de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8
2003 - 2007

Caracterização molecular de genes envolvidos no processo de patogenicidade/virulência no fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis - Proc. FAPESP # 02/08711-9 - Valor Total = R$ 500.000,00, Descrição: Este Projeto Temático destina-se à análise do fungo patogênico Paracoccicioides brasiliensis, com ênfase em estudos relacionados à sua genômica estrutural e funcional. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Integrante / Regina Costa de Oliveira - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Luiz Rodolpho Travassos - Integrante / Rosana Puccia - Integrante / Francisco Gorgônio da Nóbrega - Integrante / Maria Helena de Souza Goldman - Integrante / Marina Pasetto Nóbrega - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo ao Ensino e à Pesquisa - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 16
2001 - 2003

Genômica Funcional do Processo de Diferenciação Celular em Trypanosoma cruzi - Proc. CNPq #68.0031/01-4 (PADCT III-Genoma) Valor Total R$ 800.000,00, Descrição: O projeto dedicou-se ao sequenciamento de ESTs e à construção de um biochip com vistas a estudos de genômica funcional em Trypanosoma cruzi. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Integrante / Regina Costa de Oliveira - Integrante / Marco Aurélio Krieger - Integrante / Samuel Goldenberg - Coordenador / Álvaro José Romanha - Integrante / Silvane Murta - Integrante., Financiador(es): Fundação Oswaldo Cruz - Bolsa / Fundação Oswaldo Cruz - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 16
2000 - 2005

Sequenciamento e análise de genomas de interesse agronômico e ambiental - Proc. FAPESP # 00/10166-3 - Valor Total = R$ 1.000.067,13, Descrição: Este projeto, desenvolvido em colaboração com outros laboratórios do grupo ONSA, teve por objetivo, sequenciar genomas ou ESTs de organismos de interesse agronômico ou ambiental. Foram sequenciadas duas bactérias fitopatogênicas (Xylella fastidiosa Temecula e Leifsonia xyli xyli), uma bactéria patogênica em humanos Leptospira interrogans, bem como ESTs de eucalipto, café e bovinos da raça nelore.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Integrante / Regina Costa de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3
2000 - 2002

Data-mining de cana-de açúcar - Proc. FAPESP # 00/07430-0 - Valor Total = R$ 12.600,00, Descrição: Este projeto estava associado à anotação do banco de dados de cana-de-açúcar gerado pelo projeto SUCEST. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
1999 - 2002

Análise Genômica Estrutural e Funcional de Xylella fastidiosa através da técnica de hibridação em microarranjos de DNA - Proc. FAPESP # 98/16257-9 - Valor Total = R$ 507.839,82, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado profissional: (2) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Integrante / Regina Costa de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 16
1999 - 2002

Projeto Genoma de Cana-de-Açúcar - Proc. FAPESP # 99/02863-7 - Valor Total = R$ 247.156,65, Descrição: Este projeto, desenvolvido em colaboração com outros laboratórios da rede ONSA, destinava-se a sequenciar ESTs obtidos de diferentes tecidos e órgãos de cana-de-açúcar, permitindo a identificação de mais de 30 mil genes potenciais desta planta.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Regina Costa de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
1997 - 2000

Projeto Genoma de Xylella fastidiosa - Proc. FAPESP # 97/13468-6 - Valor Total = R$ 664.064,71, Descrição: Este projeto, desenvolvido em colaboração com outros laboratórios da rede ONSA, permitiu o sequenciamento genômico da bactéria fitopatogênica Xylella fastidiosa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Regina Costa de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios

2000

Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.

1996

MARY P. COLLEMAN AWARD FOR OUTSTANDING STUDENT IN MICRIBIOLOGY AND IMMUNOLOGY, Virginia Commonwealth University.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas. , Rua Santa Adélia 166, Bloco A, Torre 3, Santa Terezinha, 09210-170 - Santo Andre, SP - Brasil, URL da Homepage:

Experiência profissional

2017 - Atual

Fundação Universidade Federal do ABC

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2012 - Atual

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2013
Ensino, Biossistemas, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estágio em Docência, Estágio em Docência I, Estágio em Docência II
06/2012
Pesquisa e desenvolvimento, Centro de Ciências Naturais e Humanas.,Linhas de pesquisa
06/2012
Ensino, Ciência e Tecnologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica: Estrutura, Propriedades e Funções de Biomoléculas, Projeto Dirigido, Transformações Bioquímicas
06/2012
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular e Biotecnologia, Bioquímica: Estrutura, Propriedades e Funções de Biomoléculas, Bioquímica Funcional, Genética II (Genética Molecular), Seminários em Biologia II, Introdução à Biotecnologia
05/2014 - 06/2018
Direção e administração, Centro de Ciências Naturais e Humanas.,Cargo ou função, Vice Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Biossistemas.
04/2014 - 06/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação Universidade Federal do ABC.,Cargo ou função, Chefe da Divisão de Transferência de Tecnologia - Inova UFABC.

1997 - Atual

Universidade de Mogi das Cruzes

Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Orientador no Programa de PG em Biotecnologia, Carga horária: 8

Atividades

08/2001
Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos da Tecnologia do DNA Recombinante, Tópicos Básicos em Biotecnologia I e II
10/1997
Pesquisa e desenvolvimento, Núcleo Integrado de Biotecnologia.,Linhas de pesquisa
05/2008 - 12/2011
Direção e administração, Pró Reitoria de Pesquisa Pós Graduação e Extensão.,Cargo ou função, Pró-Reitor de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão.
11/2007 - 12/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Conselho Superior.,Cargo ou função, Membro do Conselho Superior (CONSU) da UMC.
11/2007 - 12/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão.,Cargo ou função, Membro do Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão (CEPE) da UMC.
11/2007 - 04/2008
Direção e administração, Pró-Reitoria Administrativa e Acadêmica - Campus São Paulo - Pq Villa Lobos.,Cargo ou função, Pró-Reitor Administrativo e Acadêmico.
07/2006 - 12/2007
Direção e administração, Pró Reitoria de Pesquisa Pós Graduação e Extensão.,Cargo ou função, Gestor do Setor de Pesquisa e Iniciação Científica.
02/2005 - 12/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade de Mogi das Cruzes.,Cargo ou função, Coordenador do Comitê de Ética em Pesquisa Envolvendo Seres Humanos.
06/1998 - 12/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Pró Reitoria de Pesquisa Pós Graduação e Extensão.,Cargo ou função, Membro da Comissão Interna de Biossegurança da UMC (CIBIO).
02/1997 - 11/2007
Direção e administração, Centro de Ciências Biomédicas.,Cargo ou função, Coordenador do Curso de Ciências Biológicas.
02/1997 - 11/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Ciências Biomédicas.,Cargo ou função, Presidente do Colegiado do Curso de Ciências Biológicas.
02/2001 - 12/2006
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia de Microorganismos, Introdução à Biotecnologia do DNA Recombinante, Microbiologia Aplicada, Microbiologia Básica, Princípios de Melhoramento Genético, Tópicos Avançados em Biologia Molecular e Genética
02/2004 - 01/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão.,Cargo ou função, Membro do Conselho de Ensino Pesquisa e Extensão (CEPE - UMC).
08/2004 - 02/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Conselho de Ética em Pesquisa Envolvendo Seres Humanos.,Cargo ou função, Membro do Conselho de Ética em Pesquisa Envolvendo Seres Humanos.
10/1997 - 12/2004
Serviços técnicos especializados , Comissão Permanente de Processos Seletivos.,Serviço realizado, Elaboração e Correção das Provas do Vestibular UMC.
12/2001 - 11/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Monitoramento Ambiental da Serra do Itapety - CEMASI.,Cargo ou função, Membro do Conselho Técnico Científico.

2007 - 2017

Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Avaliador Institucional, Carga horária: 0

2000 - 2002

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 0

Outras informações:
Professor colaborador credenciado junto ao programa de pós-graduação

Atividades

12/2000 - 11/2002
Ensino, Biologia Celular e Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Genômica Estrutural e Funcional

2001 - 2003

Universidade Federal do Paraná

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 0

Outras informações:
Professor colaborador credenciado junto ao programa de pós-graduação

Atividades

06/2001 - 06/2003
Ensino, Biologia Celular e Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Genômica Estrutural e Funcional