Francisco Prosdocimi

Francisco é professor associado e pesquisador do Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis (IBqM), da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) e presidente regional da Sociedade Brasileira de Genética (Regional Leste).Trabalha principalmente na área de Genômica vegetal e animal, além de ter produzido trabalhos de destaque em biologia Teórica ao propor conceitos como o FUCA (First Universal Common Ancestor) e a Simbiose Química, que consiste em uma visão marguliana sobre a origem da vida. Publicou os livros "O que é a ciência? A ciência sob um exame de consciência" (2020) e "A emergência dos sistemas biológicos" (2019). É idealizador e responsável pelo projeto institucional de extensão CIÊNCIA INCRÍVEL, que almeja divulgar o conhecimento científico utilizando métodos baseados no teatro, na música e em atividades lúdicas. Ministra disciplinas regulares na graduação e na pós-graduação em Química Biológica (CAPES nível 7) nas áreas de (i) Bioinformática, (ii) História e filosofia da ciência, (iii) Ciência, arte e educação, (iv) Psicodélicos, (v) Ambientalismo, (vi) Big Data, (vii) Genômica comparativa e evolutiva. Fundou o laboratório de Genômica, Bioinformática e Biodiversidade na UFRJ em 2011 e publicou trabalhos de destaque principalmente com genomas de aves. Seus projetos visam documentar a biodiversidade brasileira em nível molecular ao estudar genomas de plantas, aves, peixes e outros organismos. Realiza estudos multidisciplinares que tentam unir a genômica, o estudo do metabolismo vegetal e animal, o estudo da biodiversidade brasileira e a biomedicina. Francisco participa de grupos nacionais e internacionais de excelência em pesquisa científica, tendo publicado em periódicos importantes como: Nature, Science, PNAS, Nucleic Acids Research, Genome Research e outros. Doutor em bioinformática e mestre em genética pela UFMG, Francisco tem importantes e consistentes experiências internacionais de pesquisa, tendo trabalhado no Sanger Center (Cambridge, UK), Institut de Genetique et Biologie Moleculaire (Strasbourg, França), Cold Spring Harbor Laboratory (New York, US), Duke University (Durham, US), Université de Bourdeaux (Bordeaux, França), Universitat Wurzburg (Wurzburg, Alemanha), Botanischer Garten (Berlim, Alemanha), Universidade Autónoma Nacional do México (UNAM, Cidade do México) e Università del Piemonte Orientale (Vercelli, Itália). Francisco mantém colaborações estáveis com diversos grupos nacionais e internacionais para a análise comparativa, descritiva e evolutiva de genomas. Em um dos mais importantes, Francisco e seus colegas estão desvendando os genomas das plantas sagradas usadas na preparação da ayahuasca, bebida enteógena de importância médica e cultural.

Informações coletadas do Lattes em 31/10/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2003 - 2006

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Racionalizando a utilização do algoritmo PHRED para análise de seqüências de DNA
, Ano de obtenção: 2006. José Miguel Ortega. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: PHRED; Base-calling; Filosofia da ciência; Crítica à ciência acadêmica; Dogmatismo na ciência; Análise de genomas e transcriptomas. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Mestrado em Genética

2002 - 2003

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Análise dos genes mais expressos e do status atual do transcriptoma de 'Schistosoma mansoni' utilizando ferramentas de bioinformática, Ano de Obtenção: 2003
Glória Regina Franco.Palavras-chave: Schistosoma mansoni; bioinformática; análise de transcritos; anotação manual.Grande área: Ciências Biológicas

Especialização em Especialização Em Bioinformática

2002 - 2002

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Identificação e análise de novos transcritos relacionados à doença de Alzheimer no cromossomo 10 humano
Orientador: Ana Tereza Vasconcelos, Anamaria Camargo, Helena Brentani

Aperfeiçoamento em Doutorado Sanduíche

2005 - 2006

Wellcome Trust Sanger Institute
Título: Análise do genoma (DNA) do verme Schistosoma mansoni. Ano de finalização: 2006
Orientador: Matthew Berriman
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em Bacharelado Em Genética

1998 - 2001

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Análises Bioinformáticas de transcritos de Schistosoma mansoni
Orientador: Glória Regina Franco
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante

1994 - 1996

Centro Federal de Educação Tecnológica de Minas Gerais

Pós-doutorado

2019

Pós-Doutorado. , Universidad Nacional Autónoma de Mexico, UNAM, México. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução.

2008 - 2009

Pós-Doutorado. , Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, IGBMC, França. , Bolsista do(a): Agence Nationale Recherche, ANR, França. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Bioinformática.

2006 - 2007

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Formação complementar

2023 - 2023

Freud Fundamental: As Ideias e as Obras. (Carga horária: 2h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2023 - 2023

A Arte de Sonhar: História, Ciência e Futuro dos Sonhos. (Carga horária: 2h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2023 - 2023

Psicanálise e Mitologia: Uma Introdução. (Carga horária: 2h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2023 - 2023

Sonhar: Por Que e Para Quê?. (Carga horária: 2h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2023 - 2023

Curso de Formação de Alquimista Terapeuta, Módulo 4. (Carga horária: 90h). , Escola de Alquimia Contemporânea, EDALC, Brasil.

2023 - 2023

Curso de Formação de Alquimista Terapeuta, Módulo 3. (Carga horária: 90h). , Escola de Alquimia Contemporânea, EDALC, Brasil.

2022 - 2022

Curso de Formação de Alquimista Terapeuta, Módulo 2. (Carga horária: 90h). , Escola de Alquimia Contemporânea, EDALC, Brasil.

2021 - 2022

Curso de Formação de Alquimista Terapeuta, Módulo 1. (Carga horária: 90h). , Escola de Alquimia Contemporânea, EDALC, Brasil.

2021 - 2021

Jung e a Alquimia. (Carga horária: 5h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2021 - 2021

Ciência Psicodélica: A Fronteira dos Transtornos Psíquicos. (Carga horária: 2h). , Casa Do Saber, CASA DO SABER, Brasil.

2019 - 2021

Level ONE Yoga Instructor. (Carga horária: 220h). , Kundalini Research Institute, KRI, Estados Unidos.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Italiano

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Pouco, Lê Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Grande área: Ciências Humanas / Área: Educação.

Grande área: Ciências Humanas / Área: Filosofia / Subárea: Epistemologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Origem da vida.

Grande área: Ciências Humanas / Área: História / Subárea: História e filosofia da ciência.

Organização de eventos

CAMPOS, J. M. S. ; SANTOS, Fabrício Rodrigues dos ; FARIAS, S. T. ; FRANCO, G. R. ; PROSDOCIMI, FRANCISCO . Darwin Day (UFJF). 2024. (Congresso).

RUSSO, C. A. M. ; Prosdocimi, F. . Darwin Day, UFRJ. 2019. (Congresso).

Prosdocimi, F. ; VIEIRA, T. ; MIGNACO, J. A. ; POLYCARPO, C. ; ALMEIDA, M. ; SALMON, D. ; ALMEIDA, F. C. . A incrível ciência de Leopoldo de Meis, Ano 1. 2019. (Exposição).

VASCONCELOS, S. ; SORENSON, M. ; MASUDA, H. ; Prosdocimi, F. . 4th World Conference on Research Integrity. 2015. (Congresso).

VASCONCELOS, S. ; SORENSON, M. ; PROSDOCIMI, Francisco . II Brispe -- Second Brazilian meeting on Research Integrity, Science and Publication Ethics. 2012. (Congresso).

Participação em eventos

Darwin Day.Teleologia e nomenclatura gênica: uma nova (velha) propost. 2018. (Simpósio).

Congresso Nacional de Genética. Da síntese moderna até a síntese evolutiva estendida e além.... 2016. (Congresso).

Congresso Nacional de Genética. Genomics and phylogenomics of animal and plant models. 2016. (Congresso).

XVI Congreso Latinoamericano de Genética. The concept of the Last Universal Common Ancestor (LUCA) in modern Biology. 2016. (Congresso).

II ISEB.The origin of genes. 2014. (Simpósio).

toxi-latin 2014. Genomics and ecotoxicology. 2014. (Congresso).

58a SBG. O genoma do papagaio "Amazona aestiva". 2012. (Congresso).

VII X-meeting. The influence of bad gene predictions to evolutionary analysis: a case study on the evolutionary fate of paralogs. 2011. (Congresso).

XIX Plant and Animal Genome Conference. Systems biology of spider webs. 2011. (Congresso).

VI X-meeting. MOLECULAR, BEHAVIORAL AND ANATOMICAL SOPHISTICATION IN SPIDER WEBS: INSIGHTS FROM SPINNING GLAND RNA-SEQ EXPERIMENTS IN PRIMITIVE AND MODERN SPIDERS. 2010. (Congresso).

XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Next-generation sequencing analysis of two spider transcriptomes. 2010. (Congresso).

55 Congresso Nacional de Genética. Impaired fertility in humans: an evolutionary explanation. 2009. (Congresso).

12th Evolutionary Biology Meeting in Marseilles. Framework for a Comparative Data Analysis Ontology (C-DAO). 2008. (Congresso).

Data Integration in Life Sciences. CDAO: an evolutionary framework for comparative data analysis. 2008. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics. Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2005. (Congresso).

XXXIV Reunião Anual da SBBq. XXXIV Reunião Anual da SBBq. 2005. (Congresso).

. II International Congress on Bioinformatics and Computational Biology (ICoBiCoBi). 2004. (Congresso).

50 Congresso Nacional de Genética. 50 Congresso Nacional de Genética. 2004. (Congresso).

II ENAPEBI. II ENAPEBI. 2004. (Congresso).

XXXIII Reunião Anual da SBBq. XXXIII Reunião Anual da SBBq. 2004. (Congresso).

. 49 Congresso Nacional de Genética. 2003. (Congresso).

. I International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICoBiCoBi. 2003. (Congresso).

. XXXII Reunião Anual da SBBq. 2003. (Congresso).

Work on Bioinformatics. Work on Bioinformatics -- WOB. 2003. (Congresso).

. XXXI Reunião Anual da SBBq. 2002. (Congresso).

. VIII Symposium International on Schistosomiasis. 2001. (Congresso).

. XXX Reunião Anual da SBBq. 2001. (Congresso).

.X Semana de Iniciação Científica da UFMG. 2001. (Simpósio).

.IX Semana de Iniciação Científica da UFMG. 2000. (Simpósio).

. 45 Congresso Nacional de Genética. 1999. (Congresso).

.VIII Semana de Iniciação Científica da UFMG. 1999. (Simpósio).

XI Jornada de Biologia da PUC. XI Jornada de Biologia da PUC-MG. 1997. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Victoria Regina Borges Tavares Melo

FERREIRA, F. R. M.; VERGARA, M.; CAMACHO, J.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. FUNÇÕES MENTAIS E A MONTAGEM NO CINEMA DA PRIMEIRA METADE DO SÉCULO XX: O LUGAR DA PSICOLOGIA NAS TEORIAS CINEMATOGRÁFICAS DE MUNSTERBERG E EISENSTEIN. 2024. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Eloy da Silva Seabra Junior

MESQUITA, R. D.; CARDOSO, M. F. M. C.; Oliveira, P. L.;Prosdocimi, F.. A predição gênica no genoma de Triatoma infestans Klug, 1935. 2019. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Flávia Ariany Belato Costa

SCHRAGO, C. G.; JUNQUEIRA, A. C. M.;Prosdocimi, F.. Diversidade e evolução de hemoglobinas extracelulares em Metazoa. 2019. Dissertação (Mestrado em Programa de Pos-Graduação em Genética) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Gabriel Alves Vieira

Prosdocimi, F.; JUNQUEIRA, A. C. M.; POLYCARPO, C.; OLIVEIRA, M.. FILOGENÔMICA MITOCONDRIAL SEM CUSTOS: UMA PROVA DE CONCEITO COM FORMIGAS DA SUBFAMÍLIA PSEUDOMYRMECINAE (HYMENOPTERA : FORMICIDAE). 2019. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Roberto Abrantes Firme

XAVIER, G. A.; TORNAGHI, A. J. C.; MAIA, C. O.; PROSDOCIMI, Francisco. Ciências na escola bloco a bloco: uso de gamificação no aprendizado utilizando o ambiente virtual de minecraft. 2019. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Filipe Romero Rebello Moreira

PROSDOCIMI, F; JUNQUEIRA, A. C. M.; CARVALHO, A. B.; SCHRAGO, C. G.. Quantificação de sinal em conjuntos de dados filogenômicos. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pos-Graduação em Genética) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Jefferson Yuri Lopes Gomes

PROSDOCIMI, Francisco; KURTENBACH, E.; PAVAO, M.; MASUDA, H.. O USO DE ANIMAÇÕES E RECURSOS AUDIOVISUAIS NA EDUCAÇÃO: ORIGEM E DESENVOLVIMENTO DA VIDA NO PLANETA TERRA. 2017. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Rosany Teresa de Andrade Fernandes

MAIA, C. O.; PROSDOCIMI, Francisco; PIRES, E. U.; SANTOS, R. E.. Observação de concepções prévias utilizando desenhos como identificadores: uma pesquisa de base qualitativa.. 2017. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Gabriel Eduardo de Matos Rodrigues

PROSDOCIMI, FRANCISCO; FORTUNATO, R.; ARAUJO, H.; MARTINS, R. A. P.. Estudo das funções de SMC1a durante o desenvolvimento da retina. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências Morfológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Carlos Renato de Oliveria Daumas Filho

FONSECA, R. N.; PEREIRA, A. F.;Prosdocimi, F.. Proteínas Tirosina fosfatases (PTPS) no genoma do mosquito Aedes aegypti: identificação, caracterização e análise funcional. 2016. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Helkin Giovani Forero Ballesteros

PROSDOCIMI, Francisco; OLIVARES, F. L.; FERNANDES, L. D. R. S.; HEMERLY, A. S.. Caracterização de parede celular de cana-de-açucar (Saccharum spp.) em genótipos contrastantes quando à fixação biológica de nitrogênio. 2014. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Paloma Freitas Araújo

PROSDOCIMI, Francisco; OLIVEIRA, Guilherme Correia; Galdino, CB. Identificação de potenciais marcadores microssatélites em "Tropidurus torquatus" (Reptilia: Squamata): uma abordagem para sequenciamento com tecnologia por chips semicondutores. 2013. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais.

Aluno: Josemar Moreira Campos Barbosa

FACAS, E. P.; SANTOS, A. C. F.;PROSDOCIMI, F; LANNES, D. R. C.. Realidade docente no ambiente escolar: identidade social, práxis e resistência. 2024. Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Marcelo do Nascimento Costa

REHEN, S.; RAMOS, R. N.; PORCIUNCULA, L.; JUNQUEIRA, M.;Prosdocimi, F.. Efeitos do LSD sobre a Neuroplasticidade: Análise Molecular e Celular em Neuroesferas e Organoides Cerebrais Humanos. 2024. Tese (Doutorado em Ciências Médicas) - Instituto D'Or de Pesquisa e Ensino.

Aluno: Miryam Palacios Pérez

VALENZUELA, M. J.;PROSDOCIMI, FRANCISCO; DALMAU, D. I. P.; RIVERA, A. M.; RIOS, R. M. G.. Evolución del proteoma con base en la evolución del código genético, e incorporación evolutiva de moléculas de RNA. 2021 - Universidad Autónoma de la Ciudad de México.

Aluno: Gabriel Zamudio Solórzano

JOSE, M. V.; SIERRA, L. A. M.; RIOS, R. M. G.; VIDAL, P. E. M.;Prosdocimi, F.. Modelo probabilístico de evolución de proteínas aunado a la evolución de los códigos del tRNA.. 2021 - Universidad Nacional Autónoma de Mexico.

Aluno: Marcela Uliano-Silva

DE FREITAS REBELO, MAURO; BISCH, P. M.; URMENYI, T. P.; DAVILA, A.; PROSDOCIMI, Francisco. Sequenciamento, montagem e anotação dos genomas mitocondrial e nuclear do mexilhão invasor Limnoperna fortunei. 2017. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Victor Corrêa Seixas

CARVALHO, A. B.; SOLE-CAVA, A. M.; LOBO-HAJDU, G.; PROSDOCIMI, Francisco; SILVA, E. P.. Evolução do genoma mitocondrial em Annelida. 2017. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Lucas Ferreira da Silva

VERJOVSKI-ALMEIDA, S.;Prosdocimi, F.; NAKAYA, H. T. I.; FUJITA, A.; CARDOSO, A. B.. LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Elisa Maria Costa e Silva de Paiva

MERMUDES, J. R.; ZILBERBERG, C.; ZANOL, J.; CARVALHO, A. B.;Prosdocimi, F.. Diversidade e Evolução de proteínas transportadoras de oxigênio em Metazoa. 2017. Tese (Doutorado em BIODIVERSIDADE E BIOLOGIA EVOLUTIVA) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Henrique Vieira Figueiró

PROSDOCIMI, FRANCISCO; SCHRAGO, C. G.; FAGUNDES, N. J. R.; BAPTISTA, P. C.; EIZIRIK, E.. Análises genomicas da onça-pintada (Panthera onca): caracterização do genoma compelto e investigação de regiões sob seleção através de comparações interespecíficas e populacionais. 2016. Tese (Doutorado em Ecologia e Evolução da Biodiversidade) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

Aluno: Piero Angeli Ruschi

JENNINGS, W. B.;PROSDOCIMI, FRANCISCO; AMARAL, F. S. R.; WEKSLER, M.; PASSOS, P. G. H.. Moleculary Phylogeny and Evolution of the Amazilia versicolor species complex (Aves:Apodiformes:Trochilidae). 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Tetsu Sakamoto

ORTEGA, J. M.PROSDOCIMI, FRANCISCO; CASTRO, M.; BLEICHER, L.; GOES NETO, A.. Ferramentas para análise filogenética e de distribuição taxonômica de genes ortólogos. 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Diego Trindade de Souza

MATIOLI, S. R.; SETUBAL, J. C.; ALVES, J. M. P.; BRIONES, M. R. S.; PROSDOCIMI, Francisco. Origem de genes recentes, uma abordagem com PSSMs deterioradas e arquiteturas de domínio proteico. 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Climbiê Ferreira Hall

BARROS, F.; PANSARIN, E. R.; CORDEIRO, I.; SMIDT, E. C.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Sistemática filogenética, citogenética e taxonomia de Zygopetalinae (Orchidaceae) com ênfase em Koellensteinia. 2015. Tese (Doutorado em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente) - Instituto de Botânica.

Aluno: FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE ZANON BARROSO

NOGUEIRA, FTS; SILVA, M. F.;PROSDOCIMI, FRANCISCO; FERREIRA, P. C. G.. Regulação da interação de gramíneas com o meio ambiente: o papel dos pequenos RNAs. 2014. Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Thais Louise Gurjão de Carvalho

HEMERLY, A. S.; SILVA, M. F.; OLIVARES, F.;Francisco Prosdocimi,. Caracterização dos mecanismos envolvidos na promoção do crescimento radicular de cana-de-acúcar por bactérias diazotróficas. 2012. Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Carla dos Anjos de Souza

Prosdocimi, F.; GRATTAPAGLIA, D.; COELHO, A. S. G.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; PEREIRA, R. W.. Padrões de diversidade mitocondrial e nuclear em raças de suínos naturalizadas do Brasil.. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.

Aluno: Elisa Maria Costa e Silva

SCHRAGO, C. G.; ZANOL, J.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Diversity, conservation and gene genealogy of annelid hemerythrins. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em BIODIVERSIDADE E BIOLOGIA EVOLUTIVA) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Mariana Fonseca Rossi

PROSDOCIMI, FRANCISCO; SCHRAGO, C. G.; SOARES, C. A. G.; CORREA, R. L.. Diversidade molecular da microbiota ruminal com potencial biotecnológico e classificação evolutiva das hidrolases glicosídicas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Christiane Coelho Santos

SILVA NETO, M. A. C.; PINTO, A. L.;PROSDOCIMI, FRANCISCO; VASCONCELOS, S.. CONSENSOS E CONTROVÉRSIAS SOBRE A APROPRIAÇÃO DA ?GREY LITERATURE? EM DOCUMENTOS CIENTÍFICOS. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Lívia Vargas

FERREIRA, M. A.; SIMOES, J.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Transcriptome profile analysis of sugarcane responses during drought tolerance conferred by diazotrophic bacteria Gluconacetobacter diazotrophicus. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia Vegetal e Bioprocessos) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Lucas Araujo Freitas

RUSSO, C. A. M.; GIANNINI, A. L. M.; PROSDOCIMI, Francisco. Evolução Molecular adaptativa em duas escalas de tempo. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Bárbara de Oliveira Aguiar

SCHRAGO, C. E. G.; RUSSO, C. A. M.;Francisco Prosdocimi,. Avaliação do desempenho de diferentes métodos de sumarização do filoma. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Mariana Carnavale Bottino

VALENTE, A. P.; MONTEIRO, R. Q.; PROSDOCIMI, Francisco. Neurobiologia da agressividade. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

CARVALHO, P. C.; BISCH, P. M.; SCHNEIDER, H.; PASCUTTI, P.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Pesquisador em Bioinformática. 2015. Instituto Nacional de Câncer.

SILVEIRA, C. H.; LIMA, L. H. F.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Professor Adjunto de Bioinformática. 2014. Universidade Federal de Itajubá.

ALMEIDA JUNIOR, N. F.; FERRO, J. A.;PROSDOCIMI, FRANCISCO. Professor Adjunto de Bioinformática. 2013. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Orientou

Gabriella Bartollo

NOVOS ENREDOS PARA A EDUCAÇÃO FUNDAMENTAL EM COMUNIDADES CARIOCAS: O SAMBA COMO EIXO NORTEADOR PARA O ENSINO DE BIOCIÊNCIAS; Início: 2024; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Luisa Taranto

A música como metodologia ativa de ensino-aprendizagem; Início: 2024; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; (Orientador);

Wanessa do Bomfim Machado

Teatro e Educação: História multicultural e perspectivas para a educação no século XXI; Início: 2023; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; (Orientador);

Aline da Silva

As Artes Visuais como ferramentas semióticas de avaliação do APRENDIZADO em BIOCIÊNCIAS: emponderamento científico negro; Início: 2022; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; (Orientador);

Fabiana Cabral Machado Alves de Souza

Sequenciamento, montagem e genômica comparativa de mitogenomas de aranhas; 2019; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Thaís Fontenelle Leme

Estudos genômicos de raças caninas brasileiras: a ancestralidade do fila e do fox paulistinha; 2018; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Juliana Mayra Nunes Farias

Neuroeducação em um contexto lúdico: produção e avaliação de dois jogos didáticos de Biociências para alunos do Ensino Médio; 2018; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Gabriel Alves Vieira

FILOGENÔMICA MITOCONDRIAL SEM CUSTOS: UMA PROVA DE CONCEITO COM FORMIGAS DA SUBFAMÍLIA PSEUDOMYRMECINAE (HYMENOPTERA : FORMICIDAE); 2017; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Ana Lucia Rodrigues da Costa

Uma cartilha ilustrada para a divulgação científica: a proteção do patrimônio genético nacional; 2014; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Orientador: Francisco Prosdocimi;

MARCELA ULIANO DA SILVA

Sequenciamento, montagem e anotação do transcriptoma do mexilhão invasor 'Limnoperna fortunei'; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Francisco Prosdocimi;

Igor Rodrigues da Costa

ALFIE: UM PROGRAMA PARA A BUSCA EXAUSTIVA DE LOCOS ANÔNIMOS E SUA VALIDAÇÃO EM GENOMAS DE HOMINÍDEOS; 2012; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Erivaldo Fraga da Silva

A INTELIGÊNCIA MUSICAL: ASPECTOS TRANSDISCIPLINARES ENVOLVIDOS NA COMPOSIÇÃO E APLICAÇÃO DE BIOCANÇÕES COMO INSTRUMENTO PARA O DESENVOLVIMENTO COGNITIVO, EMOCIONAL E AFETIVO DE ALUNOS DO ENSINO FUNDAMENTAL; 2024; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Juan Perez Valencia

Caracterização bioquímica de um modelo metastático de câncer de língua; 2017; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Francisco Prosdocimi;

Marcela Uliano-Silva

Sequenciamento, montagem e anotação dos genomas mitocondrial e nuclear do mexilhão invasor Limnoperna fortunei; 2017; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Francisco Prosdocimi;

Nicholas Barroso Costa Lima

GENÔMICA COMPARATIVA DE AVES OS GENOMAS DO PAPAGAIO-DE-FRONTE-AZUL E DO FUSELO; 2017; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Ana Teresa Nogueira Dumans

2016; Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Francisco Prosdocimi;

Helena Magarinos Souto

Montagem e anotação do genoma mitocondrial completo de 7 beija-flores usando dados de sequenciamento Illumina HiSeq e análises filogenômicas dos dados obtidos; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas: Modalidade Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Igor Rodrigues da Costa

Funcionalização de genes da vias de biossíntese de aminoácidos que permaneceram em metazoários; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas: Modalidade Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Lucas Kovalski Moura

Evolução da heterotrofia: estudo das vias biossintéticas de aminoácidos, lipídeos, vitaminas e nucleotídeos; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Brasília; Orientador: Francisco Prosdocimi;

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Montagem e análise de genomas organelares; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Larissa Haerolde

Jornalismo científico; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Mateus Vidal

Sequenciamento, montagem e anotação de genomas plastidiais; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Alex Shoemaker Bastos

Diferenças genômicas entre peixes Siluriformes epígeos e hipógeos; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas - Licenciatura Ou Bacharelado) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Helena Magarinos Souto

Filogenia de mitocondriomas de beijas-flores; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas: Modalidade Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Krzysztof Siemion

A grande deleção das vias bioquímicas de biosíntese de aminoácidos; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, International Federation of Medical Students Association; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Diana Claro Pessoa

Divulgação científica: o doping genético; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, International Federation of Medical Students Association; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Laryssa Santos Queiroz

Nutrigenômica evolutiva em eucariotos; 2010; Iniciação Científica - Universidade Católica de Brasília, Universidade Católica de Brasília; Orientador: Francisco Prosdocimi;

Renan Nascimento de Almeida

Montagem, anotação da mitocôndria completa de peixes do gênero Nannoperca; 2010; Iniciação Científica - Universidade Católica de Brasília, Universidade Católica de Brasília; Orientador: Francisco Prosdocimi;

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Prosdocimi, F. ; SOUZA, S. J. ; PENA, S. D. J. . Tentativa de descoberta de novos genes no cromossomo Y humano através da bioinformática. In: X SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 2001, Belo Horizonte. Anais da X SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 2001.
Prosdocimi, F. ; FARIACAMPOS, A. C. ; PEIXOTO, F. C. ; ORTEGA, J. M. ; FRANCO, G. R. . Clustering, annotation and classification of Schistosoma mansoni sequences. In: VIII SYMPOSIUM INTERNATIONAL ON SCHISTOSOMIASIS, 2001, Recife. Proceedings of VIII SYMPOSIUM INTERNATIONAL ON SCHISTOSOMIASIS, 2001.
Prosdocimi, F. ; ZUCCONI, É. ; ANDRADE, R. ; GODINHO, A. ; GODINHO, H. ; KALAPOTHAKIS, E. . Isolamento e caracterização de marcadores de microsatélites em Prochilodus scrofa. In: IX SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 2000, Belo Horizonte. Anais da IX SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 2000.
Prosdocimi, F. ; NEVES, A. L. G. ; KALAPOTHAKIS, E. . Comparações entre técnicas de purificação de DNA plasmidial. In: VIII SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 1999, Belo Horizonte. Anais da VIII SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFMG, 1999.
Prosdocimi, F. ; BOMJARDIM, M. B. . Programa didático sobre síntese de proteínas e genética molecular. In: XXXXV CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 1999, Gramado. Anais do XXXXV CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 1999.
PROSDOCIMI, Francisco . Sequenciamento, montagem, (predição gênica) e genômica comparativa no papagaio Amazona aestiva. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
Prosdocimi, F. . Impaired fertility in humans: an evolutionary explanation. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
QUADROS, L. ; Prosdocimi, F. ; FERNANDES, G. ; ORTEGA, J. M. . Human proteins are codified with codons that balance the resistance to non-synonymous mutations with the prevention of STOP codons. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Prosdocimi, F. ; Chisham, B ; Pontelli, E ; Thompson, J ; Stoltzfus, A . CDAO: the evolutionary ontology. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Aurora da Transformação. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2022. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Frevendo ciência. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Pachamama. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Os cinco erres. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Coco Azedo: o coco das fake news. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Mata Atlantica, a canção. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Algas, a canção. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . Flavivírus. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2021. (Partitura Musical/Outro).
SILVA, E. F. ; MIGNACO, J. A. ; PROSDOCIMI, F . O DNA é o cara. Rio de Janeiro: ArtecomCiencia, 2015. (Partitura Musical/Outro).
PROSDOCIMI, Francisco ; PONTAROTTI, P. . Sobre o décimo segundo encontro de biologia evolutiva em Marseilles. Springer, 2010. (Tradução/Artigo).
PROSDOCIMI, F . Panorama da prosa brasileira contemporânea, vol. 1. Blocos On Line, 2009 (Coletânea de Contos).
Prosdocimi, F. . Desnecessárias verdades pré-nupciais. Roque Gonzales, RS: Igaçaba Produções Culturais, 2006 (Coletânea de Contos).

Outras produções

COSTA, I. R. ; Prosdocimi, F. . PhyloMito: phylogenomics of mitochondria by supermatrix. 2015.

BASTOS, A. S. ; Prosdocimi, F. . mitoMaker: a pipeline for automatic assembly and annotation of animal mitochondria using raw NGS data. 2014.

PROSDOCIMI, F ; Chisham, B ; Pontelli, E ; Thompson, J ; Stoltzfus, A . CDAO: a semantic web-ontology language to represent evolutionary biology data and analysis.. 2009.

FERNANDES, G. ; BARBOSA, D. ; PROSDOCIMI, F ; PENA, I. ; Santos, LS ; COELHO JUNIOR, O. ; BARBOSA-SILVA, A. ; Melo, H. ; NATALE, D. ; Faria-Campos, A.C. ; CAMPOS, S. V. A. ; ORTEGA, J. M. . UE-COG. 2008.

Prosdocimi, F. . TGFinder: Automated software for identification of transcription factor target genes. 2004.

Prosdocimi, F. . Scripts PERL para Bioinformática. 2002.

Prosdocimi, F. ; BOMJARDIM, M. B. . Software didático sobre síntese de proteínas e genética molecular. 1999.

Lopes, RJ ; MELLO, C. V. ; SCHNEIDER, M. P. ; PROSDOCIMI, Francisco . Brasileiros vão decifrar genomas do papagaio e do sabiá-laranjeira. 2012. (Programa de rádio ou TV/Comentário).

Prosdocimi, F. . Como a ciência encara a morte. 2006. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Prosdocimi, F. . Ecology in food, health and evironment. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

COSTA, A. L. R. ; OLIVERIA, D. R. ; PROSDOCIMI, Francisco . A proteção do patrimônio Genético Nacional: estado da arte e divulgação científica. 2014. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Educação científica via internet).

PROSDOCIMI, Francisco . Introdução à Bioinformática Genômica. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

PROSDOCIMI, F . Introdução à Bioinformática Genômica. 2011. .

PROSDOCIMI, F . Bioinformática para a análise de genomas. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Prosdocimi, F. . Bioinformática para a análise de genomas. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

PROSDOCIMI, Francisco . Curso On-Line de Bioinformática. 2007. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - CursoON-LINEdebioinformática).

Prosdocimi, F. . Introdução á bioinformática. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

Prosdocimi, F. . Introdução à bioinformática. 2006. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso ON-LINE de bioinformática).

PROSDOCIMI, Francisco ; MIGNACO, J. A. ; MACHADO, W. ; FRAGA, E. . Gaia-Pachamama: uma parábola ambientalista. 2022. Teatral.

Prosdocimi, F. ; VIEIRA, T. ; PETRONILHO, E. ; ALESSANDRA, T. ; GUEDES, H. ; MIGNACO, J. A. . Que raios é a ciência?. 2019. Teatral.

POLYCARPO, C. ; MIGNACO, J. A. ; FELIX, A. ; NASCIMENTO, A. L. ; Prosdocimi, F. . Teatro de fantoches: a neta de Leopoldo. 2019. Teatral.

GALINA, A. ; Prosdocimi, F. ; VIEIRA, T. . O peso do enxofre. 2019. Teatral.

PROSDOCIMI, Francisco ; MIGNACO, J. A. ; FRAGA, E. . Opereta das Inteligências Múltiplas. 2019. Teatral.

PROSDOCIMI, FRANCISCO ; SIMOES, A. C. ; FARIAS, Sávio T ; BASTOS, A. C. ; SILVA, M. ; SARZI, D. ; ALVES, G. ; SILVA, C. ; ROSA, P. A. ; Lobo, F. P. ; DUMANS, ANA TERESA NOGUEIRA ; ESTEVES, C. ; FEITOSA, N. . Contação de histórias: as organelas celulares. 2017. Teatral.

PROSDOCIMI, F ; MIGNACO, J. A. ; LANDEIRA-FERNANDEZ, A. M. ; MACHADO, W. B. ; TARANTO, L. ; NEWTON, I. ; VIOLINO, V. . Ciência incrível: Biobanda apresenta um espetáculo de música e teatro no Darwin Day (UFJF). 2024. Apresentação de Obra (para compositores).

PROSDOCIMI, FRANCISCO ; FRAGA, E. ; FERRETI, G. ; DUMARD, C. ; YURI, J. ; BARBOZA, M. ; DIAS, B. ; MARTINEZ, M. ; ALVES, V. ; HAEROLDE, L. . Oficina de Ciência e Arte. 2015. Arranjo.

Prosdocimi, F. . Crônicas soluárias. 2009.

Prosdocimi, F. ; CERQUEIRA, G. C. ; HEALY, John ; YOUNG, Nelson D. . Compilação do Programa GapCoder para ambiente Linux. 2004 (Demais trabalhos relevantes) .

Prosdocimi, F. . Chico On Line -- Evolução. 2003 (Demais trabalhos relevantes) .

Prosdocimi, F. ; LACHTERMACHER-TRIUNFOL, Marcia . O DNA vai a escola (colaboração). 2003 (Demais trabalhos relevantes) .

Prosdocimi, F. . O ceticismo e o conhecimento de cada um. 2002 (Demais trabalhos relevantes) .

Prosdocimi, F. ; CASTRO, Cibele Soares de . Síntese e Processamento do RNA. 2001 (Demais trabalhos relevantes) .

Prosdocimi, F. ; RIBEIRO, Beatriz Aquino ; CARVALHAIS, Lília Costa ; GOULART, Maíra de Figueiredo . Conservacao da Biodiversidade. 2000 (Demais trabalhos relevantes) .

Projetos de pesquisa

2021 - Atual

História da alquimia, Descrição: Estudar os principais conceitos pré-científicos da antiga prática da alquimia, os principais alquimistas da história, as principais técnicas alquímicas e como o legado da alquimia foi importante para o desenvolvimento tanto da química, quanto da bioquímica, da farmacologia, da medicina, da metalurgia e da ciência moderna em geral. Entendimento profundo dos conceitos das três substâncias, quatro elementos, pedra filosofal e elixir da longa vida e relação dos conceitos com a ciência médica contemporânea. Estudar as biografias e contribuições dos principais alquimistas do passado, as mitologias envolvidas com eles e as práticas que inventaram, tais como Hermes Trismegisto, Zósimo de Panópolis, Maria Judia, Geber, Alberto Magno, Nicolas Flamel, Paracelso, John Dee, Isaac Newton, Robert Boyle, Fulcanelli, Albert Riedel, Frater Albertus, Jean Dubuis e Lawrence Principe, dentre outros. Identificar a origem das técnicas científicas que tiveram sua base nos estudos alquímicos, tais como: a destilação, a extração de compostos de plantas e minerais, a sublimação, a combustão e calcinação, as reações químicas como a oxidação e redução, e finalmente técnicas de extração, purificação e fundição de metais. Entender como o legado alquímico nos permitiu desenvolver uma metodologia experimental avançada, uma compreensão sobre as reações químicas, o desenvolvimento de métodos de purificação de substâncias, o preparo de medicamentos, dentre outros desenvolvimentos importantes para a prática da ciência contemporânea.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador.
2017 - Atual

O genoma da ayahuasca, Descrição: A ayahuasca é um chá ou bebida enteogênica usada pelos xamãs ameríndios como remédio para curar distúrbios físicos, mentais e espirituais. O chá é feito pela decocção de dois componentes principais de origem vegetal: folhas do arbusto de porte arbóreo conhecido como chacrona (Psychotria viridis: Rubiaceae) e macerados de um cipó conhecido como mariri ou jagube (Banisteriopsis caapi: Malpighiaceae). Bioquimicamente falando, os efeitos psicoativos proporcionados pela bebida são causados pela presença de DMT nas folhas da chacrona, e pela presença de alcaloides no mariri que são capazes de inibir a ação da enzima monoamina oxidase. Esse efeito permite que o DMT continue excitando a fenda pós-sináptica dos neurônios por períodos mais longos, proporcionando efeitos nootrópicos que afetam e aumentam a cognição dos usuários. O uso medicinal da ayahuasca ainda é controverso, mas tem sido comprovado que ajuda em transtornos psiquiátricos e atualmente está sendo recomendado por pesquisadores líderes em neurobiologia para determinadas patologias. No projeto atual, colaboramos com a União do Vegetal e outras comunidades ayahuasqueiras para coletar espécimes e sequenciar os genomas de ambas as plantas. Usando uma estratégia baseada nas tecnologias da Pacific Biosciences Inc., estamos finalizando o sequenciamento do genoma completo da chacrona e do mariri usando longas leituras de sequenciamento. Atualmente, estamos analisando as vias bioquímicas para encontrar enzimas relacionadas à produção de DMT e beta-carbolinas. Os princípios éticos que norteiam esta pesquisa consistem em respeitar e reverenciar o saber indígena originário que nos trouxe essa medicina potente e ainda bastante desconhecida pela ciência.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / VARANI, ALESSANDRO M. - Integrante / LOPES, SIMONE - Integrante / BARBOSA, JOSE BEETHOVEN FIGUEIREDO - Integrante / MORAES, ANA PAULA - Integrante / MIRANDA, VITOR F.O. - Integrante., Número de produções C, T & A: 1
2015 - Atual

Ciência, arte e educação, Descrição: Utilizar elementos das artes para divulgar conteúdos científicos. Estudar novas metodologias ativas de ensino-aprendizagem que estejam mais adaptadas aos alunos do século XXI e permitam uma atualização pedagógica. Utilizar a música, as artes cênicas, as artes visuais e outros formas de arte na divulgação de conhecimentos filosóficos, científicos, éticos e socioambientais. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / Erivaldo Fraga - Integrante / Julio Alberto Mignaco - Integrante / Wanessa Machado - Integrante / Ana Maria Landeira - Integrante / aline silva - Integrante., Número de produções C, T & A: 8 / Número de orientações: 2
2013 - Atual

Genômica e Biodiversidade, Descrição: Nesse projeto sequenciamos e anotamos genomas de animais e plantas da fauna e flora fluminense e brasileira, incluindo plantas com potencial terapêutico (fitoterápicos).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / Daniel Cardoso Carvalho - Integrante / Danilo Ribeiro de Oliveira - Integrante., Número de produções C, T & A: 6
2010 - Atual

Mitocondriômica animal, Descrição: Sequenciamento de mitocôndrias completas de espécimes brasileiros e análise comparativa e evolutiva de mitogenomas. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / Daniel Cardoso Carvalho - Integrante / Luciano Beheregaray - Integrante., Número de produções C, T & A: 4
2009 - Atual

Desenvolvimento de softwares para análises evolutivas, Descrição: Produção de ontologias para análises evolutivas em biologia e biomedicina. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / Brandon Chisham - Integrante / Enrico Pontelli - Integrante / Julie Thompson - Integrante / Arlin Stoltzfus - Integrante / Pierre Pontarotti - Integrante., Número de produções C, T & A: 13
2005 - Atual

Evolução das vias bioquímicas, Descrição: Estudos sobre a evolução de genes envolvidos nas vias de biossíntese de aminoácidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / José Miguel Ortega - Integrante / Rafael Guedes - Integrante / Lucas Kovalski Moura - Integrante., Número de produções C, T & A: 6
2002 - Atual

Genômica e Transcriptômica animal e vegetal, Descrição: Estudos sobre a qualidade de sequências genômicas; análise de genomas e transcriptomas animais. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Francisco Prosdocimi - Coordenador / José Miguel Ortega - Integrante / Daniel Cardoso Carvalho - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / ana tereza ribeiro vasconcelos - Integrante / W Bryan Jennings - Integrante., Número de produções C, T & A: 21

Prêmios

2011

Aprovado no concurso para Pesquisador Classe A, EMBRAPA.

2011

Aprovado no concurso para Professor Adjunto, Instituto de Bioquímica Médica - IBqM, UFRJ.

2009

Aprovado no concurso para Professor Adjunto, Universidade Católica de Brasília.

2008

Post-doctorat, Institute de Genètique et Biologie Moleculaire et Celulaire (IGBMC, Strasbourg).

2006

Melhor tese defendida em bioinformática, UFMG -- Reitoria de pós-graduação.

2006

Melhores contos literários, Prefeitura de Roque Gonzales-RS.

2005

Melhor trabalho apresentado no BSB, BSB -- Brazilian Symposium on Bioinformatics.

2001

Melhores trabalhos de iniciação científica, UFMG.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. , Avenida Carlos Chagas Filho 373, Bloco E, sala 022, Cidade Universitária, 21941-902 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (21) 25626759, URL da Homepage:

Experiência profissional

2011 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

07/2019
Ensino, Química Biológica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Pensamentos curriculares e ensino de ciências (PEGeD), Oficina de Ciência, Arte e Educação (MP-EGeD)
07/2019
Extensão universitária , Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Atividade de extensão realizada, A incrível ciência de Leopoldo de Meis (CIÊNCIA INCRÍVEL).
07/2018
Ensino, Ciências Biológicas: Modalidade Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Química de Macromoléculas (Módulo Ácidos Nucleicos)
01/2017
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Linhas de pesquisa
03/2015
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Linhas de pesquisa
05/2014
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Linhas de pesquisa
09/2012
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Atividade realizada, Desenvolvimento do site do IBqM.
06/2012
Serviços técnicos especializados , Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Serviço realizado, Gerenciamento e manutenção do super-computador UV-100 (Silicon Graphics).
04/2011
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis.,Linhas de pesquisa
03/2019 - 08/2019
Ensino, Ciências Biológicas - Licenciatura Ou Bacharelado, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Oficina de Ciência, Arte e Educação
04/2011 - 12/2018
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Básica
03/2013 - 03/2015
Ensino, Química Biológica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos em Bioquímica
10/2011 - 10/2014
Ensino, Química Biológica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Seminários do Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia (PBMB)
06/2011 - 12/2011
Ensino, Química Biológica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Novas Técnicas de Sequenciamento (e análises bioinformáticas)

2009 - 2011

Universidade Católica de Brasília

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40