Sandro José de Souza

Possui graduação em Biologia pela Universidade Federal do Paraná (1989) e doutorado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1993). De 1995 a 1998, foi Pew Latin American Fellow na Universidade de Harvard. Foi um dos pioneiros da genômica e da Bioinformática no Brasil. Foi membro associado do Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer de 1999 a 2012. Atualmente é Professor Titular do Instituto do Cérebro da UFRN. Eleito pelo Fórum Econômico Mundial como um ?Young Global Leader? em 2009. Foi Tinker Visiting Professor na Universidade de Chicago em 2011.

Informações coletadas do Lattes em 15/09/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioquímica

1990 - 1993

Universidade de São Paulo
Título: Interaçoes macromoleculares na matriz extracelular: uma abordagem bioquímica e filogenética
, Ano de obtenção: 1993. Ricardo Renzo Brentani. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: colagenase; colágeno; fibronectina; matriz extracelular; peptídeo.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Outro.

Graduação em Ciências Biológicas

1986 - 1989

Universidade Federal do Paraná

Pós-doutorado

1995 - 1998

Pós-Doutorado. , Harvard University, HARVARD, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Organização de eventos

DE SOUZA, S.J. ; Stransky, Beatriz . Biologia Sistêmica do Câncer: Uma abordagem integrada. 2014. (Congresso).

DE SOUZA, S.J. ; Stransky, Beatriz ; de Souza, G.A. . Proteômica & Espectrometria de Massa Rumo a Análise de Sistemas Biológicos. 2013. (Outro).

DE SOUZA, S.J. ; Stransky, Beatriz ; Reboucas, N. . Biologia Molecular Aplicada à Pesquisa. 2012. (Outro).

DE SOUZA, S.J. ; Stransky, Beatriz ; Ohno-Machado, L . A Bioinformática no século 21. 2012. (Outro).

LONG, Manyuan ; BROSIUS, J. ; de Souza SJ . Tasting the Art of Science - A symposium to honor Wally Gilbert. 2005. (Congresso).

de Souza SJ ; SAMAIA, H. B. ; José Miguél Ortega ; BARRERA, Junior . International Conference On Bionformatics and Molecular Biology ICOBICOBI. 2004. (Congresso).

CHAMMAS, Roger ; VILLAVERDE, D. ; de Souza SJ . SIMEC 2000- Simpósio Internacional sobre Matriz Extracelular. 2000. (Congresso).

Participação em eventos

1 St International Workshop on Bioinformatics.Cancer Genomics in the era of US$ 0.00000001 per nucleotide. 2010. (Outra).

56º Congresso Brasileiro de Genética. Transcriptomas e a Compreensão Contemporânea dos Genes. 2010. (Congresso).

56º Congresso Brasileiro de Genética. 2010. (Congresso).

I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética.Deciphering the human surfaceome. 2010. (Outra).

SB-Meeting 2010 - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting. The Role of Exon Shuffling in the Evolutionof PPI Networks. 2010. (Congresso).

XIV Congresso de Educação Saber 2010. O debate Darwinismo X Criacionismo no Brasil. 2010. (Congresso).

XVIII Seminário de Iniciação Científica da PUCPR - PIBIC.Avaliador do Comitê Externo do CNPq dos trabalhos apresentados pelo alunos do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica (PIBIC). 2010. (Seminário).

XXVIII Workshop Temático do CAT/cepid.Re-sequencing of tumor genomes: a systems biology perspective. 2010. (Outra).

17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology & 8th European Conference on Computational Biology. 2009. (Congresso).

IV Simpósio Temático "Fronteiras das Ciências Fisiológicas".The New(est) Genomics Revolution. 2009. (Simpósio).

IV Simpósio Temático do Departamento de Fisiologia e Biofísica "Fronteiras das Ciências Fisiológicas".The new(est) genomics revolution. 2009. (Simpósio).

Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática. 2009. (Simpósio).

Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática.Genome Evolution and Biological Networks. 2009. (Simpósio).

V Course of the Latin American School of Human and Medical Genetics.Bioinformatic tools in genetics and genomics. 2009. (Simpósio).

V Curso de Verão em Bioinformática.Análise de Expressão Gênica. 2009. (Outra).

4th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Ultra-high throughput sequencing of the transcriptome of a breast cancer cell line.. 2008. (Congresso).

4th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology". 2008. (Congresso).

54º Congresso Brasileiro de Genética. 2008. (Congresso).

IX Encontro de Pesquisa do Instituto de Ciências Biológicas - IV Encontro anual de pesquisa em Bioquímica e Imunologia - Comemoração aos 40 anos do ICB e do Programa de Pós-Graduação em Bioquímica e Imunologia na UFMG.Going deeper... A nova revolução da genômica. 2008. (Encontro).

IX Simpósio Nacional de Biologia Molecular Aplicada à Medicina. 2008. (Simpósio).

IX Simpósio Nacional de Biologia Molecular Aplicada à Medicina."Analises Computacionais Aplicadas à Medicina: Uma Busca por Alvos Terapêuticos na Superfície de Células Tumorais". 2008. (Simpósio).

Rede Brasileira de Pesquisa sobre o Câncer.Rede Brasileira de Pesquisa sobre o Câncer. 2008. (Seminário).

3rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Aomputational Biology.. 2007. (Congresso).

53º Congresso Brasileiro de Genética. 2007. (Congresso).

53º Congresso Brasileiro de Genética.O surfaceoma humano: uma busca em larga-escala por alvos terapêuticos na superfície celular de células tumorais. 2007. (Simpósio).

6th International Congress of Pharmaceutical Sciences, CIFARP. Splicing Variants in Cancer: Therapeutical Opportunities. 2007. (Congresso).

6th International Congress of Pharmaceutica Sciences - CIFARP 2007. 2007. (Congresso).

Alellyx Applied Genomics.Sobre a complexidade do genoma humano: pares sense/antisense. 2007. (Seminário).

III Course of the Latin American School of Human and Medical Genetics.A completar. 2007. (Outra).

Programa de Doutorado em Bioinformática.O Surfaceoma humano: uma busca em larga-escala por alvos terapêuticos na superfície celular de células tumorais.. 2007. (Seminário).

52º Congresso Brasileiro de Genética. A molécula de RNA vs Era pós-genômica - Tema: "O verdadeiro Mundo de RNA: Explorando o transcriptoma humano". 2006. (Congresso).

52º Congresso Brasileiro de Genética. 2006. (Congresso).

Ciclo de Palestras da Pós-Graduação em Ciências Biológicas da UNIVAP.O papel dos introns na origem e evolução de novos genes. 2006. (Seminário).

Global Dialogues on Emerging Science and Technology (GDEST) Conference on Bioinformatics. A completar. 2006. (Congresso).

II Latinamerican School of Human and Medical Genetics. II Latinamerican School of Human and Medical Genetics. 2006. (Congresso).

ISMB / X-Meeting 2006. 2006. (Congresso).

Seminários Gerais do Departamento de Bioquímica do Programa de Pós Graduação do Instituto de Química da USP.Sobre a complexidade do transcriptoma humano. 2006. (Seminário).

V São Paulo Research Conference - Teoria da Evolução: Principios e Impacto. O papel do embaralhamento antigo e moderno dos exons na montagem de proteínas antigas. 2006. (Congresso).

V São Paulo Research Conference - Teoria da Evolução: Principios e Impacto. 2006. (Congresso).

XIII Congresso da Sociedade Brasileira de Biologia Celular - IX Simpósio Brasileiro de Matriz Extracelular - III International Symposium on Extracellular Matrix.From Bioinformatics to Functional Genomics. 2006. (Simpósio).

XXXV Reunião da SBBq. XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2006. (Congresso).

1st International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Search for novel imprinted genes using SAGE and MPSS allele-specific tags. 2005. (Congresso).

51º Congresso Brasileiro de Genética. 2005. (Congresso).

51º Congresso Brasileiro de Genética - Simpósio "Bioinformática como ferramenta na exploração de sistemas biológicos complexos". SNPs, SAGE e ESTs: Integração de dados na exploração do transcriptoma humano. 2005. (Congresso).

Conhecimento Genômico, Aplicações Clínicas e Implicações Éticas.A Genômica na Prática Clínica - "Integrando Genoma, Transcriptoma e Proteoma sob uma ótica da biologia sistêmica: relevância clínica.". 2005. (Simpósio).

Evolução Molecular.Seminário sobre Evolução Molecular. 2005. (Seminário).

Seminários de Biologia Funcional e Molecular do Programa de Pós-Graduação em Biologia Funcional e Molecular do Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas.Caracterização de variantes de splicing diferencialmente expressos em tumor. 2005. (Seminário).

Symposium to Celebrate the Scientific Explorations of Walter Gilbert.Symposium to Celebrate the Scientific Explorations of Walter Gilbert. 2005. (Simpósio).

56ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - SBPC.Informática na Fronteira da Ciência. 2004. (Simpósio).

56º Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência. 2004. (Outra).

II ENAPEBI - Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia. II Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia.. 2004. (Congresso).

III International Symposium on Extracellular Matrix - VIII Simpósio Brasileiro sobre Matriz Extracelular SIMEC.A completar. 2004. (Simpósio).

III Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research.On the biological significance of Alternative Splicing: a bioinformatics approach. 2004. (Outra).

Instituto de Estudos Avançados da Universidade de São Paulo em São Carlos.Splicing alternativo: reflexões sobre o seu significado biológico. 2004. (Outra).

Programa da disciplina de Bioinformática na FioCruz.Programa da disciplina de Bioinformática na FioCruz. 2004. (Seminário).

SBBQ. XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.. 2004. (Congresso).

Seminários do Departamento de Bioquímica e Imunologia da Universidade Federal de Minas Gerais.Variabilidade no transcriptoma humano causada por splicing alternativo: uma análise in silico de retenção de introns. 2004. (Seminário).

Tópicos Avançados em Fisiologia e Biofísica do Programa de Pós-Graduação de Fisiologia Humana do ICB/USP.O significado biológico de splicing alternativo. 2004. (Outra).

XIX Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE. Use of bioinformatics to decipher the complexity of the human transcriptome. 2004. (Congresso).

1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology - ICOBICOBI. A direct association between Alternative Splicing and Tumorigenesis as evaluated by SAGE. 2003. (Congresso).

Curso Introdução à Biologia Computacional.Análise do Transcriptoma Humano. 2003. (Outra).

II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research..Exploring the tumor transcriptome through computational biology tools. 2003. (Outra).

SAGE Congress. 2003. (Congresso).

Semana Científica sobre o Câncer e a Genômica.A Bioinformática aplicada à Genômica. 2003. (Seminário).

Semana Científica sobre o Câncer e a Genômica.Impacto da Genômica no Câncer. 2003. (Seminário).

48º Congresso Nacional de Genética. Origem dos introns: antiga ou recente?. 2002. (Congresso).

54ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência.Aspectos Moleculares nas Doenças Autoimunes. 2002. (Outra).

Curso Análise de Transcriptomas..Curso: Análise de Transcriptomas.. 2002. (Outra).

Curso SAGE e Splicing.Curso: SAGE e Splicing. 2002. (Outra).

Human Full-Length cDNA Annotation Invitational. 2002. (Outra).

Mini Symposium on "Bioinformatics and Gene Evolution".Mini Symposium on Bioinformatics and Gene Evolution. 2002. (Simpósio).

VII Brazilian Symposium on Extracellular Matrix / II International Symposium on Extracellular Matrix.A completar. 2002. (Simpósio).

XXXI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. A completar. 2002. (Congresso).

4ª Semana Temática de Biologia.Andamento do projeto Genoma Câncer no Brasil. 2001. (Seminário).

53ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência SBPC.O papel da Bioinformática na Biologia atual. 2001. (Outra).

Brazilian International Genomic Conference. Brazilian International Genomic Conference. 2001. (Congresso).

Centers for Bioinformatcs & Computational Biology and Genome Technology Seminar Series.A completar. 2001. (Seminário).

Disciplina Oncologia de Cabeça e Pescoço do Curso de Pós-Graduação em Ciências da Fundação Antonio Prudente.Bioinformática. 2001. (Outra).

II Escola de Verão Métodos Computacionais em Biologia.A draft of the human transcriptome. 2001. (Outra).

Atualização do Curso de Ciências Moleculares.Palestra: "Biologia Computacional". 2000. (Seminário).

Programa de Pós-Graduação em Biologia Buco-Dental da Faculdade de Odontologia de Piracicaba.Projeto Genoma Humano do Câncer. 2000. (Seminário).

VII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde e II Simpósio Internacional de Sistemas de Informação Hospitalar. Bioinformática. 2000. (Congresso).

10º Congresso Médico do Piauí - 1º Congresso de Enfermagem do Piauí. Biologia Molecular. 1999. (Congresso).

10º Congresso Médico do Piauí - 1º Congresso de Enfermagem do Piauí. 1999. (Congresso).

BioSemana 99. O Projeto Genoma do Câncer Humano: Estratégia e Desafios. 1999. (Congresso).

II Semana Temática da Biologia USP.O gene Egoísta. 1999. (Outra).

XIII Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FeSBE. Towards a resolution of the introns-carly/introns-late debate. 1998. (Congresso).

3º Simpósio Brasileiro Sobre Matriz Extracelular - SIMEC 94.Extracellular matrix resorption in the gingiva of the rat incisor. 1994. (Simpósio).

Curso de Biologia das Metástases.Biologia Celular da Invasão e Metástases. 1994. (Outra).

Curso de Biologia das Metástases.Enzimas envolvidas no processo de invasão e metástases. 1994. (Outra).

I Simpósio Internacional de Pesquisa e Tratamento Multidisciplinar do Câncer de Cabeça e Pescoço.Invasão Tumoral e Metástases. 1994. (Simpósio).

IX Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental - FESBE. Bases Moleculares da reatividade anti auto-antígenos protéicos no curso "Auto Imunidade". 1994. (Congresso).

Reencontro Internacional sobre estrutura e função de âncoras GPI. 1994. (Encontro).

Simpósio de Biologia Molecular e Oncologia Gastroenterológica.Aspectos Celulares da Progressão Tumoral. 1994. (Simpósio).

XXIII Reunião Anual da SBBq. 1994. (Congresso).

Basic and Applied Cancer Research International Symposium on HPV - Ludwig Institute for Cancer Research 10th Anniversary. 1993. (Simpósio).

Curso Receptores de Membranas em Cabeça e Pescoço promovido pelo Serviço de Cirurgia de Cabeça e Pescoço do Hospital Heliópolis.Integrinas e o mecanismo de metástases. 1993. (Outra).

Curso Receptores de Membranas em Cabeça e Pescoço promovido pelo Serviço de Cirurgia de Cabeça e Pescoço do Hospital Heliópolis.Proteases e o mecanismo de invasão. 1993. (Outra).

II Simpósio Antonio Prudente. 1993. (Simpósio).

XVIII Congresso Brasileiro de Imunologia.Hidropaticidade complementar e determinação de interações entre receptores-ligantes, enzimas-substratos e antígenos-anticorpos. 1993. (Encontro).

XXII Reunião Anual da SBBq. 1993. (Congresso).

Curso de Pós-Gradução em Biologia e Patologia Buco-Dental da Faculdade de Odontologia de Piracicaba.Interação Colágeno-Colagenase. 1992. (Seminário).

Simpósio Médico Internacional Roche "Citoquinas e Fatores de Crescimento". 1992. (Simpósio).

1º Simpósio Brasileiro sobre Matriz Extracelular. 1990. (Simpósio).

International Symposium on Human Papillomavirus. 1990. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Lulu Wu

DE SOUZA, SANDRO JOSÉBARRERA, Junior; Reis MS. Um método para modificar vias de sinalização molecular por meio de análise de banco de dados de interatomas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Diego Gomes Teixeira

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; Jerônimo SMB; Lima, JPMS; SHAW, Jeffrey Jon. Diversidade genômica de isolados com origem clínica distinta de Leishmania infantum do Estado do Rio Grande do Norte. 2015. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Natália Bezerra Mota

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; Copelli, M; Diniz, LFM. Análise de grafos aplicada a relatos de sonho: ferramenta diagnóstica objetiva e diferencial para psicose esquizofrênica e bipolar. 2013. Dissertação (Mestrado em NEUROCIÊNCIAS) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Mayra Toledo Mendes de Castro

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; camargo, b;DIAS NETO, EmmanuelCARRARO, Dirce Maria. Validação de alterações somáticas e de novo em tumores de wilms esporádicos identificadas por sequenciamento de exomas. 2013. Dissertação (Mestrado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Rogério Furquim Mauad

de Souza SJ; SHAW, Jeffrey Jon; MARTINS, Maurício Rodrigues; BRIONES, Marcelo da Silva. IDaTE: Uma ferramenta para estimar tempos de divergências com um teste de razão de máxima verossimilhança para relógio molecular.. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Leonardo de Oliveira Martins

de Souza SJ. Simulação da evolução molecular do HIV-1: análise de estimadores de diversidade genética.. 2002 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gerdine Ferreira de Oliveira Sanson

de Souza SJ. Modelo Probabilísticos de substituição de nucleotídeos aplicados à evolução in vitro do Gene rRNA 18s e ao estudo da diversidade genética de Trypanosoma cruzi.. 2002. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Robson Francisco de Souza

ZANOTTO, Paolo Marinho de Andrade; VENTURA, Armando Morais;de Souza SJ. Heterogeneidade em Flaviviridae: segmentação e processos evolutivos. 2000. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ivan Tadeu Rebustini

Hugo Aguirre Armelin;HO, P. L.; de Souza, S. J.. Expressão de Fatores Peptídicos de Crescimento em Linhagens Cultivadas de Células Y-1 de Tecido Adrenocortical de Mamíferos. 1999. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Rita Silvério de Magalhães Machado

de Souza, Sandro J; dos Santos, MA; José Miguél Ortega; Couto, BRGM; Starling, CE. Prediction of drug targets in human pathogens. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Debmalya Barh

de Souza, Sandro J; Azevedo, VAC; Soares, SC; Arni, RK. Bioinformatics strategies for identification of cancer biomarkers and targets in pathogens associated with cancer. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Katia de Paiva Lopes

de Souza, Sandro J; José Miguél Ortega; Franco, G; Lobo, FP; Fernandes, GR. Ancestralidade e co-regulação de genes codificadores de proteínas humanas. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: PAULO RICARDO PORFÍRIO DO NASCIMENTO

de Souza, Sandro J; Jerônimo SMB; dos Santos EA; Brodskin CI; Pasquali MA. Perfil transcricional e alterações histopatológicas na leishmaniose visceral canina. 2016. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Moara Machado

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; Santos, EMT; Magalhães, WCS; Struchiner, CJ; de Souza, RP; Pena, SDJ. Diversidade genômica e seleção natural em populações humanas. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Fabiano Cordeiro Moreira

DE SOUZA, S.J.RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA; Ramos, R.T.J.; SCHNEIDER, I.; ASSUMPCAO, P.; SANTOS, S.. Análise in Silico da Expressão Diferencial de microRNAs no Câncer Gástrico. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Thayse Azevedo da Silva

DE SOUZA, S.J.; Agnez, L; Neto, V.F.A.; Valinotto, A.C.. Análise do efeito de polimorfismos não-sinônimos em genes de reparo de DNA da via BER na resposta inflamatória da Meningite. 2013. Tese (Doutorado em Renorbio) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Joana Cristina Medeiros Tavares

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; Medeiros, S.R.B.; Cornelio, DA; Lenz, G; José Miguél Ortega. Transcriptoma diferencial entre células-tronco mesenquimais humanas jovens e senescentes. 2013. Tese (Doutorado em Renorbio) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Gabriel da Rocha Fernandes

DE SOUZA, S.J.; José Miguél Ortega; Franco, G; Cantão, M.. Integração de bases de dados de genes homólogos e aplicação em análises de sequencias.. 2011. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Yuri José de Camargo Barros Moreira

ALMEIDA, S. V.; de Souza, S. J.; Forti, F. L.; DIAS NETO, E.;CARRARO, Dirce M. Identificação de perfis de expressão de RNAs codificadores e não codificadores de proteína como preditores de recorrência de câncer de próstata. 2010. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Leonardo Barbosa Koerich

de Souza SJ. Baixa conservação do conteúdo gênico do cromossomo Y em 12 espécies de Drosophila. 2009. Tese (Doutorado em Genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: David Corrêa Martins Junior

DE SOUZA, S.J.BARRERA, Junior; Junior, R.M.C.; Hugo Aguirre Armelin. Seleção de características e predição intrinsecamente multivariada em identificação de redes de regulação gênica. 2009. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Cristina Rodrigues Rangel

FOLGUEIRA, M. A. A. K; de Souza, S. J.; REIS, Eduardo M R; ABRANTES, E. F.. Identificação de Marcadores Moleculares em Câncer de mama Através da Técnica de Microarray Utilizando uma Plataforma de Exons Tumor-Associados. 2008. Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Renata Carmona e Ferreira

de Souza SJBRENTANI, Helena Paula. Análise da adaptação dos códons como uma ferramenta para predizer a abundância de uma proteína e sua correlação com o ruído na expressão gênica.. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Maurício de Alvarenga Mudado

DE SOUZA, S.J.; José Miguél Ortega; Franco, G;GRUBER, Arthur. Uso da Base de Dados Secundária KOG como Ferramenta para Caracterização de Expressão Gênica e Mineração de Dados em Projetos Transcriptoma. 2007. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: theri Leica Degaki

SOGAYAR, Mari Cleide; Luiz Roberto Giorgetti de Britto;de Souza SJSHINJO, Sueli M Oba; Suely Lopes Gomes. Genoma funcional e análise in silico na caracterização e no isolamento de genes envolvidos em gliomas humanos. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Marcos Damião da Silva

de Souza SJ. ?Polimorfismo de colon 72 do gene supressor tumoral tp53 e do codon 1367 da helicase de Werner, associados a morbidades em populações de idosos de São Paulo.. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas Genética) - Faculdade de Medicina de Botucatu.

Aluno: Fernando Alexis Gonzales Zubiate

NOBREGA, F. G.VALENTINI, S. R.; ALMEIDA, S. V.; OLIVEIRA, Carla Columbano de; de Souza, S. J.. Caracterização da função da proteína Nop17p de Saccharomyces cerevisiae. 2005. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Marcos Castanheiras Alegria

de Souza SJ; FARAH, Shaker Chuck; OLIVEIRA, Carla Columbano de;GUEIROS FILHO, Frederico José; SLUYS, Marie Anne Van; BALDINI, Regina Lúcia; BERTOLINI, Maria Célia; MARQUES, Marilis Do Valle. Identificação de Interações Proteína-Proteína envolvendo os produtos dos Loci hrp, vir e rpf de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2004 - Instituto de Química da Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Bandeira Paiva

de Souza SJ. Filogenias moleculares de sequências genômicas: aplicação na análise de receptores acoplados à proteína-G.. 2004 - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Tharin Maria Blumeschein de Almeida

DORRY, H. F. A. E.; ALMEIDA, S. V.; de Souza, S. J.; MENCK, C. F. M.; REINACH, F. C.. Estudo da Ligação de Cátions Divalentes em Sítios Ef-Hand Utilizando a Cadeia Leve Regulatória de Miosina de Músculo Liso. 2000. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Luiz Paulo Moura Andrioli

ALVES, M. J. M.; SILVA, Aline M da; de Souza, S. J.;PEREIRA, G. G.; OLIVEIRA, Carla Columbano de. Clonagem e Caracterização da Serina/treonina Fosfatase Tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: ACARIZIA EDUARDO DA SILVA

DE SOUZA, S.J.; DALMOLIN, R. S.; Lajus, T.B.P. O papel da proteína de ligação ao RNA Musashi-1 na radioresistência e sobrevivência de células de glioblastoma.. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: André Zelanis Palitot Pereira

de Souza, S. J.. Proteômica e transcriptômica aplicadas ao estudo da variabilidade do veneno de Bothrops jararaca. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Maria Fernanda Pereira de Araújo Demonte Forni

de Souza, S. J.. Bases Moleculares do Efeito do Estesse Oxidativo na Potencionalidade e Senescência de Células Tronco da Pele. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Juliano Rodrigo Guerreiro

de Souza, S. J.. Identificação dos alvos moleculares e celulares dos peptídeos potenciadores da bradicinina. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Giulliana Tessarin e Almeida

de Souza, S. J.. Efeitos do pareamento no perfil de expressão gênica do parasita Schistosoma mansoni. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Renata Carmona e Ferreira

de Souza SJ; José Daniel Lopes. "Análise da adaptação dos codons como ferramenta para predizer a abundância de uma proteína e sua correlação com o ruído na expressão gênica".. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: theri Leica Degaki

de Souza, S. J.. Genoma funcional e análise in silico na caracterização e no isolamento de genes envolvidos em gliomas humanos. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Eric D'Alessandro Bonaccorsi

DORRY, H. F. A. E.; de Souza, S. J.. Regulação da expressão gênica por oxigênio em microrganismos eucariotos: análises de ESTs e microarrays de cDNA de Trichoderma reesei. 2002. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica) - Instituto de Química - USP.

Aluno: Daniel Miranda de Brito

Rego TG; Batista LV; Farias ST; Coutinho VRHM; de Souza, S. J.. Uma nov abordagem para a identificação de ilhas genômicas em bactérias com base no método de agrupamento mean shift. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em INFORMÁTICA) - Universidade Federal da Paraíba.

Aluno: VANDECLECIO LIRA DA SILVA

DE SOUZA, S.J.; Costa, M.R.; Lima, JPMS. Análise evolutiva dos elementos que controlam o padrão de expressão dos genes humanos. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: JÉSSICA ALVES DE MEDEIROS ARAÚJO

DE SOUZA, S.J.; Costa, M.R.; Medeiros, S.R.B.. REPROGRAMAÇÃO DE CÉLULAS-TRONCO MESENQUIMAIS EM NEURÔNIOS UTILIZANDO GENES PRÓ-NEURAIS. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em NEUROCIÊNCIAS) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Daniel Gomes de Almeida Filho

DE SOUZA, S.J.; Ribeiro, S.T.G; Tort, A.. Uma investigação das sequências de fase Hebbianas descritas como grafos de assembleias neuronais. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em NEUROCIÊNCIAS) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Natália Bezerra Mota

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ; Ribeiro, S.T.G; Queiroz, CMT; Copelli, M. Análise de grafos aplicada a relatos de sonho: ferramenta diagnóstica objetiva e diferencial para psicose esquizofrênica e bipolar. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em NEUROCIÊNCIAS) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

de Souza, Sandro J. Comissão Avaliadora da Promoção para classe E - Professor Titular. 2015. Universidade Federal de Minas Gerais.

de Souza, S. J.. Professor Adjunto 1. 2010. Universidade Federal de Minas Gerais.

de Souza, S. J.. Professor Adjunto 1. 2010. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

de Souza, S. J.. Professor Doutor, Referência MS-3, em Regime de Dedicação Integral à Docência e à Pesquisa (R.D.I.D.P.), Departamento de Genética - Área de Bioinformática. 2003. Universidade de São Paulo, campus Ribeirão Preto.

SAKHARKAR, M.; Kocher J-P;de Souza, Sandro J. Review Comittee for Bachelor in Bioinformatics Program - University of Malaya. 2016. University of Malaya.

de Souza, Sandro J. Comissão de avaliação de propostas do programa CAPES PRINT. 2018. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

Aith F; Sa MFG;de Souza, Sandro J. Comissão de Análise e Julgamento do Prêmio Capes/Interfarma de Inovação e Pesquisa na edição 2016. 2016. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

de Souza SJ. Vaga destinada ao cargo de Tecnologista Pleno 3 na área de Desenvolvimento e Suporte em Bioinformática. 2002. Laboratório Nacional de Computação Científica.

Orientou

Pedro Victor

Uso de modelos de IA na análise e interpretação de riscos poligênicos; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

Rodrigo Lima Andrade

Uso de modelos de IA na análise e interpretação de dados de metagenômica de solo; ; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

ANA CAROLINA MIRANDA FERNANDES COÊLHO

Desenvolvimento de uma abordagem para detecção de neoantígenos a partir do sequenciamento de amostras tumorais; 2019; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Thiago Dantas Soares

BIO-DIA: Ferramenta web para integração de dados e algoritmos; ; 2019; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Coorientador: Sandro José de Souza;

Laise Cavalcanti Florentino

Desenvolvimento de uma abordagem de integração de dados genômicos e farmacêuticos; 2018; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Sandro José de Souza;

Paulo Roberto Branco Lins

Desenvolvimento de uma abordagem quantitativa para o estudo de recorrências de módulos topológicos em redes biológicas; 2018; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Coorientador: Sandro José de Souza;

Viviane Brito Nogueira

CajaDB: um knowledgebase para dados de sagui; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciencias da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas; Coorientador: Sandro José de Souza;

VANDECLECIO LIRA DA SILVA

Análise evolutiva de sítios de ligação a fatores de transcrição; 2016; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Andre Faustino da Fonseca

Integração de dados genômicos oriundos de câncer em redes de interação proteína-proteína; ; 2016; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Andre Mauricio Ribeiro-dos-Santos

Análise genômica do efeito de INDELS em sítios de ligação a fatoresa de transcrição; ; 2014; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Julio Cesar Nunes

Analise correlacional entre a expressao dos fatores de splicing e a ocorrencia de splicing alternativo em tecidos humanos e de camundongos; ; 2008; Dissertação (Mestrado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Gustavo Starvaggi França

Mapeamento dos eventos de EXON-SHUFFLING em Eucariotos; ; 2007; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Caetano Giminez Carezato

Análise de classificadores de seqüências projetados por aprendizado computacional supervisionado e não supervisionado; ; 2004; Dissertação (Mestrado em Bioinformatica) - Ime- Universidade de Sao Paulo, ; Coorientador: Sandro José de Souza;

Fabio Passetti

Análise de splicing alternativo no transcriptoma humano; 2000; 0 f; Dissertação - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Diego Marques Coelho

Perfil transcricional de neurônios induzidos; 2021; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Sandro José de Souza;

VANDECLECIO LIRA DA SILVA

Bioinformática aplicada para identificação de genes de câncer/testículo e sua associação com prognóstico em uma análise pan-câncer; ; 2019; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Andre Mauricio Ribeiro-dos-Santos

Sequenciamento genômico de ameríndios: análise populacional e evolutiva; ; 2018; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

André Luis Fonseca Faustino

Abordagens sistêmicas para análise da manutenção da integridade genômica: uma perspectiva evolutiva e clínica; 2018; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Guilherme Fernandes de Araújo

Desenvolvimento de uma plataforma para a simulação de cenários evolutivos em populações biológicas; 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Sandro José de Souza;

JOSIVAN RIBEIRO JUSTINO

Caracterização de genes com expressão bi-modal em dados de RNA-Seq; 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Sandro José de Souza;

Jose Eduardo Kroll

Explorando a Complexidade do Transcriptoma Humano: Eventos de Splicing Alternativo; 2013; Tese (Doutorado em Doutorado) - Ime- Universidade de Sao Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Suzana Andreoli Marques Ezquina

Estudo da poliadenilação alternativa:efeito dos polimorfismos nos elementos em cis de RNA e transcritos antisenso; 2012; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Rodrigo Fernandes Ramalho

Estudo do Efeito da Seleção Natural em Ativadores de Splicing Exônico (eses) de Populações Humanas Através de Análise de Frequência; 2012; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Sandro José de Souza;

Daniel Onofre Vidal

Identificação em larga escala de transcritos antisenso e genes com expressão alélica diferencial utilizando bancos de dados de SAGE e MPSS; 2009; Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Sandro José de Souza;

Jorge Estefano Santana de Souza

Estudo em larga escala de ocorrência de SNPs em elementos reguladores de Splicing e sua possível relação com doenças hunanas; ; 2008; 0 f; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Pedro Alexandre Favoretto Galante

A Large scale gene expression analysis of the human and mouse brain; ; 2008; 0 f; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Sandro José de Souza;

Noboru Jo Sakabe

Estudo computacional de elementos reguladores de splicing alternativo em larga escala e identificação de novos elementos candidatos; ; 2007; 0 f; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Elza Helena Andrade Barbosa Durhan

Mapeamento do uso alternativo dos sitios de splicing 5'e 3'emproteinas - estudo de caso por métodos teórico s e experimentais; 2007; 0 f; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Robson Francisco de Souza

Identificação de novas proteínas componentes do septo de divisão celular usando genômica comparativa; ; 2007; 0 f; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Sandro José de Souza;

Maria Dulcetti Vibranovski

Comparação da estrutura terciária de proteínas: Implicações na evolução dos genes e origens dos domínios proteicos; ; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Raphael Bessa Parmigiani

Caracterização de um novo antígeno tumoral: CTSP-1; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Sandro José de Souza;

Elisa Napolitano e Ferreira

Identificação de variantes de splicing sob influência da alta expressão do oncogene ERBB2 em câncer de mama; 2005; Tese (Doutorado em Doutorado) - Instituto de Biociências - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Sandro José de Souza;

Natanja Sara Kirschbaum Salger

Desenvolvimento de um sistema em larga escala para o estudo computacional de formas de Splicing alternativo diferencialmente expressos em tumores e sua validação experimental; ; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Maarten Rudolph Leerkes

Desenvolvimento de uma abordagem in silico para a identificacao de genes diferencialmente expressos em tumores; ; 2004; 0 f; Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sandro José de Souza;

Meena Kishore Sakharkar

A large-scale analysis of intron sliding in eukaryotic genomes; ; 2002; 0 f; Tese - National University of Singapore, ; Orientador: Sandro José de Souza;

Gilderlanio Santana de Araújo

2018; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Sandro José de Souza;

Jose Eduardo Kroll

2014; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Sandro José de Souza;

Marbella Maria Bernardes da Fonseca

2014; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Sandro José de Souza;

Julia Pinheiro Chagas da Cunha

Estudo funcional de variantes de Splicing com expressão diferencial em tecidos tumorais baseados em mutações em sitios enhancers e silenciadores de Splicing encontrados em bancos de dados de tumores; ; 2007; Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Sandro José de Souza;

Douglas Vasconcelos Cancherini

Estrutura e evolução das redes de interação entre as proteínas; ; 2007; Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Sandro José de Souza;

Silvia Maria Kuva

1999; Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Sandro José de Souza;

Adriana Brunstein

1999; Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Sandro José de Souza;

Graziela Miê Peres Lopes

Análise de fatores de Splicing em câncer; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Sandro José de Souza;

Isabella Tanus Job e Meire

Análise de dados genômicos na identificação de biomarcadores para cãncer presentes no surfaceoma humano; ; 2014; Iniciação Científica - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Sandro José de Souza;

André Luis Fonseca Faustino

Integração de dados em genômica do câncer; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Sandro José de Souza;

VANDECLECIO LIRA DA SILVA

Evolução de TFBS em humanos; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade do Estado do Rio Grande do Norte; Orientador: Sandro José de Souza;

Thayna Emilia da Silva

Análise de dados genômicos na identificação de biomarcadores para cãncer presentes no surfaceoma humano; ; 2012; Iniciação Científica - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Sandro José de Souza;

Cleber Rodrigues de Freitas

Desenvolvimento de estratégias computacionais para análise de dados genômicos; 2014; Orientação de outra natureza - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Sandro José de Souza;

Produções bibliográficas

COELHO, RITA DE CÁSSIA CALDERARO ; MARTINS, CARLLIANE LIMA E LINS PINTO ; PASTANA, LUCAS FAVACHO ; RODRIGUES, JULIANA CARLA GOMES ; AGUIAR, KAIO EVANDRO CARDOSO ; COHEN-PAES, AMANDA DE NAZARÉ ; GELLEN, LAURA PATRÍCIA ALBARELLO ; MORAES, FRANCISCO CEZAR AQUINO DE ; CALDERARO, MARIA CLARA LEITE ; DE ASSUNÇÃO, LETÍCIA ALMEIDA ; MONTE, NATASHA ; PEREIRA, ESDRAS EDGAR BATISTA ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; RIBEIRO-DO-SANTOS, ÂNDREA ; RODRIGUEZ BURBANO, ROMMEL MARIO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; GUERREIRO, JOÃO FARIAS ; ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL DE ; SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA DOS ; FERNANDES, MARIANNE RODRIGUES ; et.al . Molecular Profile of Variants Potentially Associated with Severe Forms of COVID-19 in Amazonian Indigenous Populations. Viruses-Basel , v. 16, p. 359, 2024.
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BARROS, MARIA CLARA ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; GOMES, DANIEL HENRIQUE F. ; PINHO, CATARINA TORRES ; SILVA, CAIO S. ; BRAGA-DA-SILVA, CÍNTIA ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; AZEVEDO-PINHEIRO, JHULLY ; QUARESMA, JUAREZ ANTÔNIO SIMÕES ; FALCÃO, LUIZ FÁBIO MAGNO ; COSTA, PATRÍCIA FAGUNDES ; SALGADO, CLÁUDIO GUEDES ; CARNEIRO, THIAGO XAVIER ; BURBANO, ROMMEL RODRIGUES ; DOS SANTOS VIEIRA, JOSÉ RICARDO ; SANTOS, SIDNEY ; SOARES-SOUZA, GIORDANO BRUNO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; et.al . Unraveling the protective genetic architecture of COVID-19 in the Brazilian Amazon. Scientific Reports , v. 14, p. 27332, 2024.
LEITÃO, LUCIANA PEREIRA COLARES ; MONTE, NATASHA ; RODRIGUES, JULIANA CARLA GOMES ; DE FREITAS, LILIAN MARQUES ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; SANTOS, SIDNEY ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; FERNANDES, MARIANNE RODRIGUES ; DOS SANTOS, NEY PEREIRA CARNEIRO . Severe toxicities in amazonian populations and the role of precision medicine in acute lymphoblastic leukemia treatment. Scientific Reports , v. 14, p. 29344, 2024.
MONTE, NATASHA ; CARLA GOMES RODRIGUES, JULIANA ; WALLACY MORIKAWA SOUZA VINAGRE, LUI ; FAVACHO PASTANA, LUCAS ; LEITE DE ALCÂNTARA, ANGÉLICA ; PEREIRA COLARES LEITÃO, LUCIANA ; MAURÍCIO RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ ; RODRIGUES FERNANDES, MARIANNE ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; FARIAS GUERREIRO, JOÃO ; PIMENTEL ASSUMPÇÃO, PAULO ; SANTOS, SIDNEY ; JOSÉ DE SOUZA, SANDRO ; PEREIRA CARNEIRO DOS SANTOS, NEY . Epidemiological-molecular profile of variants associated with type 2 diabetes mellitus in indigenous populations from the Brazilian Amazon. DIABETES RESEARCH AND CLINICAL PRACTICE , v. 199, p. 110641, 2023.
AGUIAR, KAIO EVANDRO CARDOSO ; OLIVEIRA, IZABELA DE SOUSA ; COHEN-PAES, AMANDA DE NAZARÉ ; COELHO, RITA DE CÁSSIA CALDERARO ; VINAGRE, LUI WALLACY MORIKAWA SOUZA ; RODRIGUES, JULIANA CARLA GOMES ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; GUERREIRO, JOÃO FARIAS ; ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL DE ; SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA DOS ; SANTOS, NEY PEREIRA CARNEIRO DOS ; FERNANDES, MARIANNE RODRIGUES . Molecular Profile of Variants in CDH1, TP53, PSCA, PRKAA1, and TTN Genes Related to Gastric Cancer Susceptibility in Amazonian Indigenous Populations. Journal Of Personalized Medicine , v. 13, p. 1364, 2023.
DE ASSUMPÇÃO, PAULA BARAÚNA ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL ; MOREIRA, FABIANO CORDEIRO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; VIDAL, AMANDA F. ; MAGALHÃES, LEANDRO ; KHAYAT, ANDRÉ SALIM ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; CAVALCANTE, GIOVANNA C. ; PEREIRA, ADENILSON LEÃO ; MEDEIROS, INÁCIO ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; BURBANO, ROMMEL MARIO RODRÍGUEZ ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; DOS SANTOS, SIDNEY EMANUEL BATISTA . Incidence of Hereditary Gastric Cancer May Be Much Higher than Reported. Cancers , v. 14, p. 6125, 2022.
RODRIGUES, JULIANA CARLA GOMES ; FERNANDES, MARIANNE RODRIGUES ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURÍCIO ; DE ARAÚJO, GILDERLANIO SANTANA ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; GUERREIRO, JOÃO FARIAS ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL ; SANTOS, NEY PEREIRA CARNEIRO DOS ; SANTOS, SIDNEY . Pharmacogenomic Profile of Amazonian Amerindians. Journal Of Personalized Medicine , v. 12, p. 952, 2022.
PASTANA, LUCAS FAVACHO ; SILVA, THAYS AMÂNCIO ; GELLEN, LAURA PATRÍCIA ALBARELLO ; VIEIRA, GIOVANA MIRANDA ; DE ASSUNÇÃO, LETÍCIA ALMEIDA ; LEITÃO, LUCIANA PEREIRA COLARES ; DA SILVA, NATASHA MONTE ; COELHO, RITA DE CÁSSIA CALDERARO ; DE ALCÂNTARA, ANGÉLICA LEITE ; VINAGRE, LUI WALLACY MORIKAWA SOUZA ; RODRIGUES, JULIANA CARLA GOMES ; BORGES LEAL, DIANA FEIO DA VEIGA ; FERNANDES, MARIANNE RODRIGUES ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; KROLL, JOSÉ EDUARDO ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ MAURICIO ; BURBANO, ROMMEL MARIO RODRÍGUEZ ; GUERREIRO, JOÃO FARIAS ; DE ASSUMPÇÃO, PAULO PIMENTEL ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ÂNDREA CAMPOS ; et.al . The Genomic Profile Associated with Risk of Severe Forms of COVID-19 in Amazonian Native American Populations. Journal Of Personalized Medicine , v. 12, p. 554, 2022.
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de Souza, Sandro J . Tendências e perspectivas da biologia sistêmica do câncer. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Introdução à Bioinformática. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Ferramentas de Bioinformática aplicada ao genoma humano. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Integrando e ...entregando. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . The extended fitness hypothesis. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Beyond reason and borders: teh rise of global creationism. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . uma abordagem integrada para aidentificação de genes associados a caracteres clínicos em câncer. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Effect of Single Nucleotide Variants in Alternative Splicing. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Cancer Genomics. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Genômica: do câncer ao ambiente. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . From personalized to cancer genomics. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, S.J. . The impact of genomics (NGS) and bioinformatics in life sciences. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . A (mais) nova revolução da genômica e da bioinformática. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, S.J. . The impact of genomics and bioinformatics in life sciences?..and neuroscience is not an exception.. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . The impact of next generation sequencing in biomedical science. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . On the evolution of PPI networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . Integration of omics data in cancer genomics: alternative splicing. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . The Role of Exon Shuffling in the Evolution of PPI Networks. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . Transcriptomas e a compreensão contemporânea dos genes. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . A mais nova revolução da genômica. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, S.J. . Re-sequencing of tumor genomes: a system biology perspective. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . O debate criacionismo/darwinismo no Brasil. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . A goleada de Darwin. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . O gol impedido de Deus: a faceta moderna do criacionismo. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, S.J. . Genômica e Bioinformática. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, S.J. . Personalizing Alternative Splicing. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . genoma: aspectos funcionais e evolutivos. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, S.J. . Bioinformatics and identification of therapeutic targets. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . O papel dos introns na origem e evolução dos genes. 2006. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Sobre a complexidade do transcriptoma humano. 2006. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . caracterização de variantes de splicing diferencialmente expressos em câncer. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . O significado biológico do splicing alternativo. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Conferência: Use of bioinformatcs to decipher the complexity of the human transcriptome. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Splicing alternativo: reflexões sobre o seu papel biológico. 2004. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Variabilidade do transcriptoma humano. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Impacto da genômica do câncer. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . A bioinformática aplicada à genômica. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Análise do transcriptoma humano. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Biologia Computacional. 2000. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Determinação do sítio de ligação ao colágeno da coleganse. 1992. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

DE SOUZA, S.J. . Biotecando. 2014; Tema: Ciências da Vida. (Blog).

DE SOUZA, SANDRO JOSÉ . Aplicações do sequenciamento de nova geração. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

de Souza SJ . Curso: "Bioinformatics". 2003. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

de Souza, S. J. . Curso de Bioinformática. 1999. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

2018 - Atual

Empreendedorismo em Biotecnologia e Bioinformática, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador / Rodrigo Romao do Nascimento - Integrante.
2014 - Atual

Biologia Sistêmica do Câncer, Descrição: Rede de pesquisa, extensão e ensino financiada pela Capes. Para maiores detalhes, ver http://neuro.ufrn.br/bsc. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador / Dirce M Carraro - Integrante / Junior Barrera - Integrante / José Miguél Ortega - Integrante.
2010 - 2012

Aquisição de uma Plataforma de Alta Performance para Análises Computacionais aplicada à Medicina, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador / Emmanulae Dias neto - Integrante / Dirce M Carraro - Integrante / Paulo Sergio L de Oliveira - Integrante / Helena Paula Brentani - Integrante / Wilson A Silva JR - Integrante / Beatriz Stransky Ferreira - Integrante / Camargo, A. A. - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2009 - 2013

O splicing alternativo em câncer, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2008 - 2011

Montagem e anotação do genoma de linhagens celulares de um mesmo indivíduo, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador / Andrew Jonh G Simpson - Integrante / Wilson A Silva Junior - Integrante / Robert L Strausberg - Integrante / da Cunha, Julia - Integrante / Galante, P. A. F. - Integrante / Camargo, A. A. - Integrante / Raphael B. Parmigiani - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2007 - 2009

Splicing Alternativo: Integração de Estratégias Computacionais para a Caracterização Funcional de Variantes Identificados por Mutações em Sítios Reguladores de Splicing em Tumores de Colon, Mama e Glioblastoma, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2006 - 2009

Uso de estratégias computacionais e experimentais para o melhor entendimento de splicing alternativo, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2000 - 2003

Laboratório Associado de Bioinformática no Programa Humano do Câncer, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1999 - 2002

Programa Genoma Humano do Câncer ? Coordenador de Bioinformática, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Sandro José de Souza - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

Prêmios

2011

Tinker Visiting Professor at University of Chicago, Tinker Foundation, Inc.

2009

Young Global Leader, World Economic Forum.

2007

50 Campeões da Inovação, Info Exame.

2005

A Elite da Tecnologia, Info Exame.

1999

Innovator of the Year, Massachusetts Institute of Technology's Technology Review magazine.

1995

Pew latin American fellow, Pew Charitable Trust.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto do Cérebro. , Av. Nascimento de Castro, 2155 - 59056-450 - Natal / RN - Brazi, Morro Branco, 59056450 - Natal, RN - Brasil, Telefone: (84) 32152709, URL da Homepage:

Experiência profissional

2012 - Atual

Universidade Federal do Rio Grande do Norte

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40

2002 - 2012

Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Membro Associado, Carga horária: 40

1998 - 2001

Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Membro Assistente, Carga horária: 40

Atividades

02/2002
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer.Linhas de pesquisa
09/1998
Pesquisa e desenvolvimento, São Paulo, Laboratório de Biologia Computacional.Linhas de pesquisa