Larissa Lopes Silva Scholte

Pós-doutorado

Formação complementar

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Organização de eventos

Participação em eventos

Orientou

Produções bibliográficas

• SANTOS, ALEXANDRE BUENO ; COSTA, PATRÍCIA SILVA ; DO CARMO, ANDERSON OLIVEIRA ; DA ROCHA FERNANDES, GABRIEL ; Scholte, Larissa Lopes Silva ; RUIZ, JERONIMO ; KALAPOTHAKIS, EVANGUEDES ; CHARTONE-SOUZA, EDMAR ; NASCIMENTO, ANDRÉA MARIA AMARAL . Insights into the Genome Sequence of Chromobacterium amazonense Isolated from a Tropical Freshwater Lake. International Journal of Genomics , v. 2018, p. 1-10, 2018.

• SCHOLTE, LARISSA L. S. ; PASCOAL-XAVIER, MARCELO A. ; NAHUM, LAILA A. . Helminths and Cancers From the Evolutionary Perspective. FRONTIERS IN MEDICINE , v. 5, p. 90, 2018.

• PAIVA, MAGNA C. ; REIS, MARIANA P. ; COSTA, PATRÍCIA S. ; DIAS, MARCELA F. ; BLEICHER, LUCAS ; SCHOLTE, LARISSA L.S. ; NARDI, REGINA M.D. ; NASCIMENTO, ANDRÉA M.A. . Identification of new bacteria harboring qnrS and aac(6-)-Ib/cr and mutations possibly involved in fluoroquinolone resistance in raw sewage and activated sludge samples from a full-scale WWTP. Water Research (Oxford) , v. 110, p. 27-37, 2017.

• SCHOLTE, LARISSA L.S. ; MOURÃO, MARINA M. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; MELESINA, JELENA ; ROBAA, DINA ; VOLPINI, ANGELA C. ; SIPPL, WOLFGANG ; PIERCE, RAYMOND J. ; Oliveira, Guilherme ; NAHUM, LAILA A. . Evolutionary relationships among protein lysine deacetylases of parasites causing neglected diseases. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 53, p. 175-188, 2017.

• ADEMA, COEN M. HILLIER, LADEANA W. JONES, CATHERINE S. LOKER, ERIC S. KNIGHT, MATTY MINX, PATRICK Oliveira, Guilherme RAGHAVAN, NITHYA SHEDLOCK, ANDREW DO AMARAL, LAURENCE RODRIGUES ARICAN-GOKTAS, HALIME D. ASSIS, JULIANA G. BABA, ELIO HIDEO BARON, OLGA L. BAYNE, CHRISTOPHER J. BICKHAM-WRIGHT, UTIBE BIGGAR, KYLE K. BLOUIN, MICHAEL BONNING, BRYONY C. BOTKA, CHRIS BRIDGER, JOANNA M. BUCKLEY, KATHERINE M. BUDDENBORG, SARAH K. LIMA CALDEIRA, ROBERTA CARLETON, JULIA , et al. CARVALHO, OMAR S. CASTILLO, MARIA G. CHALMERS, IAIN W. CHRISTENSENS, MIKKEL CLIFTON, SANDRA COSSEAU, CELINE COUSTAU, CHRISTINE CRIPPS, RICHARD M. CUESTA-ASTROZ, YESID CUMMINS, SCOTT F. DI STEPHANO, LEON DINGUIRARD, NATHALIE DUVAL, DAVID EMRICH, SCOTT FESCHOTTE, CÉDRIC FEYEREISEN, RENE FITZGERALD, PETER FRONICK, CATRINA FULTON, LUCINDA GALINIER, RICHARD GAVA, SANDRA G. GEUSZ, MICHAEL GEYER, KATHRIN K. GIRALDO-CALDERÓN, GLORIA I. DE SOUZA GOMES, MATHEUS GORDY, MICHELLE A. GOURBAL, BENJAMIN GRUNAU, CHRISTOPH HANINGTON, PATRICK C. HOFFMANN, KARL F. HUGHES, DANIEL HUMPHRIES, JUDITH JACKSON, DANIEL J. JANNOTTI-PASSOS, LIANA K. DE JESUS JEREMIAS, WANDER JOBLING, SUSAN KAMEL, BISHOY KAPUSTA, AURÉLIE KAUR, SATWANT KOENE, JORIS M. KOHN, ANDREA B. LAWSON, DAN LAWTON, SCOTT P LIANG, DI LIMPANONT, YANIN LIU, SIJUN LOCKYER, ANNE E. LOVATO, TYANNA L. LUDOLF, FERNANDA MAGRINI, VINCE MCMANUS, DONALD P. MEDINA, MONICA MISRA, MILIND MITTA, GUILLAUME MKOJI, GERALD M. MONTAGUE, MICHAEL J. MONTELONGO, CESAR MOROZ, LEONID L. MUNOZ-TORRES, MONICA C. NIAZI, UMAR NOBLE, LESLIE R. OLIVEIRA, FRANCISLON S. PAIS, FABIANO S. PAPENFUSS, ANTHONY T. PEACE, ROB PENA, JANETH J. PILA, EMMANUEL A. QUELAIS, TITOUAN RANEY, BRIAN J. RAST, JONATHAN P. ROLLINSON, DAVID ROSSE, IZINARA C. ROTGANS, BRONWYN ROUTLEDGE, EDWIN J. RYAN, KATHRYN M. SCHOLTE, LARISSA L. S. STOREY, KENNETH B. SWAIN, MARTIN TENNESSEN, JACOB A. TOMLINSON, CHAD TRUJILLO, DAMIAN L. VOLPI, EMANUELA V. WALKER, ANTHONY J. WANG, TIANFANG WANNAPORN, ITTIPRASERT WARREN, WESLEY C. WU, XIAO-JUN YOSHINO, TIMOTHY P. YUSUF, MOHAMMED ZHANG, SI-MING ZHAO, MIN WILSON, RICHARD K. ; Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail. Nature Communications , v. 8, p. 15451, 2017.

• SUHADOLNIK, MARIA L. S. ; SALGADO, ANA P. C. ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; BLEICHER, LUCAS ; COSTA, PATRÍCIA S. ; REIS, MARIANA P. ; DIAS, MARCELA F. ; ÁVILA, MARCELO P. ; BARBOSA, FRANCISCO A. R. ; CHARTONE-SOUZA, EDMAR ; NASCIMENTO, ANDRÉA M. A. . Novel arsenic-transforming bacteria and the diversity of their arsenic-related genes and enzymes arising from arsenic-polluted freshwater sediment. Scientific Reports , v. 7, p. 11231, 2017.

• PALEVICH, NIKOLA ; BRITTON, COLLETTE ; KAMENETZKY, LAURA ; MITREVA, MAKEDONKA ; DE MORAES MOURÃO, MARINA ; BENNURU, SASISEKHAR ; QUACK, THOMAS ; Scholte, Larissa Lopes Silva ; TYAGI, RAHUL ; SLATKO, BARTON E. . Tackling Hypotheticals in Helminth Genomes. TRENDS IN PARASITOLOGY , v. xx, p. 1-4, 2017.

• MAGALHÃES, DIOGO M. ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; SILVA, NICHOLAS V. ; OLIVEIRA, GUILHERME C. ; ZIPFEL, CYRIL ; TAKITA, MARCO A. ; DE SOUZA, ALESSANDRA A. . LRR-RLK family from two Citrus species: genome-wide identification and evolutionary aspects. BMC Genomics , v. 17, p. 623, 2016.

• Scholte, LLS . Hanseníase, verminoses e tracoma têm cura: a experiência de uma campanha integrada. Boletim Epidemiológico , v. 47, p. 1-10, 2016.

• Marcelino, J M R ; Fiorillo, KS ; Scholte, LLS ; Scholte, R G C. . Situação epidemiológica da filariose linfática no Brasil. Boletim Epidemiológico , v. 47, p. 1-5, 2016.

• VALDIVIA, HUGO O. ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; Oliveira, Guilherme ; GABALDÓN, TONI ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. . The Leishmania metaphylome: a comprehensive survey of Leishmania protein phylogenetic relationships. BMC Genomics , v. 16, p. 887, 2015.

• COSTA, PATRÍCIA S. ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; REIS, MARIANA P. ; CHAVES, ANDERSON V. ; OLIVEIRA, POLLYANNA L. ; ITABAYANA, LUIZA B. ; SUHADOLNIK, MARIA LUIZA S. ; BARBOSA, FRANCISCO A. R. ; CHARTONE-SOUZA, EDMAR ; NASCIMENTO, ANDRÉA M. A. . Bacteria and Genes Involved in Arsenic Speciation in Sediment Impacted by Long-Term Gold Mining. Plos One , v. 9, p. e95655, 2014.

• GAVA, SANDRA G. ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; VOLPINI, Ã'NGELA ; DE PAULA OLIVEIRA, RIVA ; Oliveira, Guilherme . Heterologous expression in Caenorhabditis elegans as an alternative approach to functional studies in Schistosoma mansoni. Frontiers in Genetics , v. 5, p. 1-4, 2014.

• ANDRADE, LUIZA FREIRE DE ; MOURÃO, MARINA DE MORAES ; GERALDO, JULIANA ASSIS ; COELHO, FERNANDA SALES ; Silva, Larissa Lopes ; NEVES, RENATA HEISLER ; VOLPINI, ANGELA ; MACHADO-SILVA, JOSÉ ROBERTO ; ARAUJO, NEUSA ; NACIF-PIMENTA, RAFAEL ; CAFFREY, CONOR R. ; Oliveira, Guilherme . Regulation of Schistosoma mansoni Development and Reproduction by the Mitogen-Activated Protein Kinase Signaling Pathway. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 8, p. e2949, 2014.

• CUESTA-ASTROZ, YESID ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; Oliveira, Guilherme ; NAHUM, LAILA A. . Evolutionary analysis of the cystatin family in three Schistosoma species. Frontiers in Genetics , v. 5, p. 1-12, 2014.

• Silva, Larissa ; MARCET-HOUBEN, MARINA ; NAHUM, LAILA ; Zerlotini, Adhemar ; GABALDÓN, TONI ; Oliveira, Guilherme . The Schistosoma mansoni phylome: using evolutionary genomics to gain insight into a parasite s biology. BMC Genomics , v. 13, p. 617, 2012.

• Andrade, Luiza F ; Nahum, Laila A ; Avelar, Livia G.A. ; Silva, Larissa L ; Zerlotini, Adhemar ; Ruiz, Jeronimo C ; Oliveira, Guilherme . Eukaryotic Protein Kinases (ePKs) of the Helminth Parasite Schistosoma mansoni. BMC Genomics , v. 12, p. 215, 2011.

• Silva, L L ; MARCET-HOUBEN, M. ; Zerlotini, A. ; Gabaldón, T. ; Oliveira, G. ; Nahum, L.A. . Evolutionary histories of expanded peptidase families in Schistosoma mansoni. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ , v. 106, p. 864-877, 2011.

• Scholte, Ronaldo G. Carvalho ; Silva, Larissa Lopes ; Caldeira, Roberta Lima ; Oliveira, Guilherme ; Carvalho, Omar dos Santos ; Stutz, William H. ; SIMõES, MARIANA CRIVELLARI MACHADO . Inter- and intrapopulational genetic variability of Tityus serrulatus (Scorpiones, Buthidae). Acta Tropica , v. 112, p. 97-100, 2009.

• Barreto JA ; Floriano MC ; Frade MAC ; Andrade VLG ; Scholte, L. L. S. . Guia prático sobre a hanseníase. 1. ed. Brasília: Editora MS, 2017. 68p .

• Scholte, L. L. S. . Leprosy Elimination Monitoring Exercise in Brazil ? LEM-2012. 1. ed. Brasília: Ministry of Health Publishing House, 2017. 80p .

• Freire, D ; Oliveira, O ; Morelo, E ; Almeida, E ; BRANDAO, J. G. ; Silva, L L ; LEVANTEZI, M. ; ROCHA, M. C. N. ; SOARES, R. C. F. R. ; ANDRADE, V. L. G. . Diretrizes para vigilância, atenção e eliminação da Hanseníase como problema de saúde pública: manual técnico-operacional. 1. ed. Brasília: Ministério da Saúde, 2016. v. 1. 60p .

• Ignotti, E ; Scholte, LLS ; SOARES, R. C. F. R. ; et. al . Global Leprosy Strategy 2016?2020: Accelerating towards a leprosy-free world. 1. ed. New Delhi: WHO Library Cataloguing-in-Publication data. WHO - SEARO, 2016. 33p .

• Silva, L L ; Andrade, L.F. ; Mourão, M.M. ; Nahum, Laila A ; Oliveira, Guilherme . Schistosome Phylogenomics: Connecting Molecular Diversity to Parasite Biology. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L ; Andrade, Luiza F ; Mourão, M.M. ; Nahum, Laila A ; Oliveira, Guilherme . Phylogenomics: an Evolutionary Framework Bridging Schistosome Genomics and Biology. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L ; Salzburger, W. ; MUSCHICK, M. ; MALTA, J. C. . Evolutionary History of Freshwater Cymothoids (Isopoda, Cymothoidae) from Lake Tanganyika, East Africa. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• Silva, Larissa Lopes ; MARCET-HOUBEN, M. ; Zerlotini, A. ; Gabaldón, T. ; Oliveira, G. ; Nahum, L.A. . Phylogenomic analysis of three peptidase families of Schistosoma mansoni and their homologs in other eukaryotes. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L ; MARCET-HOUBEN, M. ; Zerlotini, A. ; Gabaldón, T. ; Oliveira, G. ; Nahum, L.A. . An evolutionary overview of three S. mansoni expanded endopeptidase families. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, Larissa Lopes ; MARCET-HOUBEN, M. ; Nahum, L.A. ; Zerlotini, A. ; Gabaldón, T. ; Oliveira, G. . The Schistosoma mansoni Phylome: the reconstruction of the evolutionary histories of all proteins encoded in S. mansoni genome and their homologs in 16 other organisms. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L ; MARCET-HOUBEN, M. ; Nahum, L.A. ; Zerlotini, Adhemar ; Gabaldón, T. ; Oliveira, G. . The Schistosoma mansoni Phylome: evolutionary histories to improve functional predictions and get insights into parasite biology. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Silva, L L . Filogenia de Moluscos Sul Americanos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae) inferida a partir de sequências de parte da região 16S do rDNA do DNA Mitocondrial. 2007. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• Silva, L L . Filogenia de Moluscos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae) inferida a partir de sequências de parte da região 16S do rDNA do DNA Mitocondrial. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L . Filogenia de Moluscos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae) inferida a partir de sequências de parte da região 16S do rDNA do DNA Mitocondrial. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L . Análise das sequências nucleotídicas de parte da região 16S do rDNAmt de moluscos Sul Americanos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae).. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Silva, L L . Filogenia de Moluscos Sul Americanos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae) inferida a partir de sequências nucleotídicas de parte da região 16S do rDNA do DNA Mitocondrial. 2006. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• Silva, L L . Filogenia de Moluscos Sul Americanos do gênero Lymnaea (Basommatophora: Lymnaeidae) inferida a partir das sequências da região 16S do rDNA do DNA Mitocondrial. 2005. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2010 - 2012

  Análise Filogenômica do Proteoma Predito de Schistosoma mansoni, Descrição: O proteoma predito do Schistosoma mansoni (Platyhelminthes: Trematoda), um dos parasitos responsáveis pela esquistossomose, inclui mais de 11.000 proteínas, em sua maioria sem caracterização experimental (http://schistoDB.net/). Este projeto visa contribuir para a anotação funcional do proteoma deste parasito permitindo uma melhor compreensão da sua diversidade biológica. Pretendemos também investigar os processos evolutivos do parasito no nível molecular e seu impacto na biologia parasitária e terapêutica da esquistossomose. Para atingir nossos objetivos, adotaremos uma abordagem filogenômica integrando informações de sequência e estrutura protéicas e reconstrução das árvores evolutivas usando os recursos computacionais desenvolvidos pelo Phylogenomics Berkeley Group (http://phylogenomics.berkeley.edu) na Universidade de Berkeley, Estados Unidos, além de recursos disponíveis no Centro de Excelência em Bioinformática de Minas Gerais, CEBio/FIOCRUZ (http://www.cebio.org).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

• 2010 - Atual

  Filogenômica de Schistosoma mansoni: uma abordagem sistêmica, Descrição: A esquistossomose é uma das doenças infecciosas e parasitárias mais prevalentes no mundo, sendo endêmica em 77 países e territórios onde aproximadamente 240 milhões de pessoas requerem tratamento preventivo e outras 779 mil vivem em áreas de risco de infecção. Atualmente o controle desta doença depende principalmente do tratamento de pacientes infectados, utilizando praziquantel, a única droga disponível, tornando urgente a identificação e caracterização de alvos alternativos para o desenho de drogas e desenvolvimento de vacinas contra esta doença. Neste contexto, a filogenômica se torna uma plataforma de trabalho essencial permitindo a investigação de processos biológicos e evolutivos complexos, além de fornecer subsídios para a anotação funcional e desenho experimental de genes e produtos gênicos previamente desconhecidos. Em virtude do exposto, o presente projeto tem como objetivo principal contribuir para um melhor entendimento da Biologia de Sistemas de S. mansoni, utilizando métodos filogenômicos bem como análises experimentais, visando contribuir para a compreensão da Biologia de Sistemas deste parasito.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

• 2009 - 2012

  Genômica Funcional e Evolutiva de Proteína Quinases Eucarióticas de Schistosoma mansoni, Descrição: Este estudo tem como objetivo analisar as proteína quinases eucarióticas de S. mansoni (ePKs). Estas proteínas desempenham um papel central na mediação da transdução de sinal em redes complexas e são consideradas alvos para o desenvolvimento de fármacos. A identificação e classificação das ePKs de S. mansoni será realizada utilizando-se diferentes abordagens computacionais, como a construção de modelos ocultos de Markov (HMMs) e reconstrução filogenética.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

• 2004 - Atual

  Identificação de novos alvos para o combate a esquistossomose, Descrição: Apesar de conquistas no impacto da morbidade da esquistossomose no Brasil, a transmissão não foi controlada e o número de pessoas sob risco de infecção tende a crescer. O projeto apresentado tem como base a exploração do genoma do S. mansoni com o fim se encontrar novos alvos, terapêuticos e vacinas, para o combate à esquistossomose. São propostas tecnologias de ponta para se alcançar os objetivos desejados. Parte-se da premissa que o uso do dado genômico abre novas perspectivas para a identificação dos alvos desejados. Propomos a combinação de estratégias computacional e experimental. Inicialmente organizam-se os dados sobre o genoma e a pesquisa pós-genômica de modo que estas informações estejam disponíveis para uma ampla e profunda mineração de dados. Para este fim desenvolvemos o SchistoDB, um banco de dados relacional do genoma do parasito. Propomos desenvolver a versão 3 do SchistoDB. A bioinformática então é utilizada para: 1. Permitir que dados gerados sejam analisados no contexto genômico; 2. Permitir a exploração dos dados por diferentes abordagens computacionais para a busca de alvos candidatos; 3. Possibilitar a reintegração de dados gerados de modo que o feedback permita o aprimoramento dos métodos de mineração; 4. Disponibilizar o conjunto de informações para que outros pesquisadores possam acessá-los e desenvolver métodos adicionais de busca de alvos. As abordagens propostas para a identificação de novos candidatos a droga são baseadas na mineração de vias metabólicas para a identificação de pontos sensíveis e o estudo de duas famílias de proteínas, já estudadas em outras doenças, as proteínas quinase e proteínas modificadoras de histonas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Prêmios