Rafaela Salgado Ferreira
É farmacêutica (UFMG) e doutora em Química e Química Biológica (University of California San Francisco, EUA). Realizou pós-doutorado na Universidade de São Paulo (2010) e atuou como pesquisadora visitante no Centre de Biochimie Structurale (Montpellier, França) em 2018. Desde 2011 é filiada ao Departamento de Bioquímica e Imunologia da UFMG e coordenadora do Laboratório de Modelagem Molecular e Planejamento Fármacos, no qual emprega técnicas computacionais e experimentais para desenvolvimento de novos ligantes para alvos terapêuticos. Trabalha na área de desenvolvimento racional de fármacos, com expertise nas áreas de triagem virtual de bases de dados, docking molecular, modelagem comparativa e biologia estrutural. Atualmente é chefe do Departamento de Bioquímica e Imunologia do ICB/UFMG e tesoureira da Divisão de Química Medicinal da Sociedade Brasileira de Química (gestão 2024-2026). É membro afiliada do Center for Discovery and Innovation in Parasitic Diseases (CDIPD) da University of California San Diego, EUA. Nos últimos anos, teve seu trabalho reconhecido através dos prêmios LOréal-UNESCO-ABC Para Mulheres na Ciência 2017, Categoria Química", LOréal-UNESCO For Women in Science International Rising Talent 2018, "Prêmio SBQ-ACS Mulheres Brasileiras na Química 2021, Categoria Líder Emergente", e "Prêmio Early Career Researcher Award 2022", pela Divisão de Química Medicinal da SBQ e Comissão Organizadora do 10th BrazMedChem. É Bolsista de Produtividade em Pesquisa pelo CNPq (nível 2, Comitê de Biofísica).
Informações coletadas do Lattes em 25/07/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Química e Química Biológica
2005 - 2010
University Of California San Francisco
Título: Combining virtual and high-throughput screening in the discovery of new cruzain inhibitors
Orientador: Brian K. Shoichet & James H. McKerrow
Bolsista do(a): University of California San Francisco, UCSF, Estados Unidos. Palavras-chave: planejamento de farmacos; docking; biologia estrutural.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.
Pós-doutorado
2017 - 2018
Pós-Doutorado. , Centre de Biochimie Structurale, CBS, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2011 - 2011
Pós-Doutorado. , Instituto de Física de São Carlos - Universidade de São Paulo, IFSC/USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2010 - 2011
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem molecular.
Formação complementar
2021 -
Programa de Formação de Formadores PED Brasil. (Carga horária: 200h). , Instituto Canoa, INSTITUTO CANOA, Brasil.
2018 - 2018
9th Edition of the WIPO-KIPO-KAIST-KIPA Advanced International Certificate. (Carga horária: 35h). , World Intellectual Property Organization, WIPO, Suiça.
2018 - 2018
Intellectual Property and the Life Sciences. (Carga horária: 12h). , World Intellectual Property Organization, WIPO, Suiça.
2018 - 2018
Transition to Entrepreneurial Mindset Programme. (Carga horária: 30h). , Centre Europeen D'Education Permanente, CEDEP, França.
2016 - 2016
RapiData 2016 at SLAC - Data Collection and Structure Solving. (Carga horária: 40h). , Stanford Linear Accelerator Center, SLAC*, Estados Unidos.
2013 - 2013
Conducting Molecular Dynamics Simulations (AMBER). (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.
2011 - 2011
Solvation continuum models. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.
2011 - 2011
Concepts and Techniques in Molecular Modeling. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Lê Bem.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem molecular/Especialidade: Docking.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Purificação de proteínas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Atômica e Molecular/Especialidade: Cristalografia de proteínas.
Organização de eventos
FERREIRA, R. S. ; VIEIRA, R. P. ; MALTAROLLO, V. G. ; BRAGA, S. F. P. . IV Workshop de Jovens Pesquisadores em Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. 2022. (Congresso).
LISBOA, S. L. ; OLIVEIRA, B. L. ; SAMPAIO, Y. ; SCHREIBER, L. A. ; COSTA, C. S. ; FERNANDES, R. M. ; VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R. S. . VI Curso de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2022. (Outro).
SCOTT, A. L. ; FERREIRA, R. S. ; TROSSINI, GUSTAVO H. G. . II Workshop of Molecular Modeling in Drug Design and Discovery. 2022. (Outro).
SILVA, B. M. ; FERREIRA, R. S. ; MACHADO, J. L. P. ; ESPINOZA, E. R. A. ; GERVASIO, J. H. D. B. ; OLIVEIRA, B. L. ; ALMEIDA, J. P. P. ; PEREIRA, M. G. ; PEZZOPANE, R. R. ; MENDES, J. P. R. ; SCHREIBER, L. A. ; FERNANDES, R. M. ; BASTOS, M. R. ; VILELA, L. F. F. . I Workshop Teórico/Prático do IdeaReal: a bioinformática na detecção de variantes do vírus SARS-CoV-2 e no desenvolvimento de fármacos para tratamento da COVID-19. 2021. (Outro).
FERREIRA, R.S. . III Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2017. (Outro).
FRANCO, G. R. ; AZEVEDO, V. A. C. ; BLEICHER, L. ; VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R.S. . X-meeting 2016. 2016. (Congresso).
VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R.S. . II Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2016. (Outro).
VILELA, L. F. F. ; Ferreira, R. S. ; DUARTE, C. G. ; GONCALVES, C. A. X. ; BATISTA, R. P. ; MIRANDA, M. ; CHAME, D. ; MENDES, T. ; RIBEIRO, L. . I Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2015. (Outro).
FERREIRA, R. S. ; VILELA, L. F. F. ; ORTEGA, J. M. ; AZEVEDO, V. A. C. . Curso CBAB: Bioinformática Estrutural e Análises do Proteoma. 2013. (Outro).
BLUNDELL, T. ; GROOM, C. ; SUSSMAN, J. ; SPADON, P. ; IRWIN, J. J. ; SANSEVERINO, L. R. ; FERREIRA, R. S. ; GRASSI, G. ; GULLO, F. ; GUERRI, A. ; MOTEMIGLIO, L. ; MORANDI, F. ; POZZI, C. ; TURK, M. . 40th Course, International School of Crystallography. From molecules to medicine: Integrating crystallography in drug discovery. 2008. (Congresso).
Participação em eventos
International Conference of the LOEWE Center DRUID 2024. Revisiting an old target: Cruzipain subtypes and implications to the discovery of treatments for Chagas disease. 2024. (Congresso).
XI Curso Internacional de Biologia Molecular de Tripanossomatídeos: do genoma à busca de novas drogas.Bioinformática: do gene ao design de proteínas e medicamentos (UFMG). 2024. (Outra).
XI Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos,.Planejamento de fármacos para tratamento de doenças negligenciadas.. 2024. (Outra).
American Chemical Society Meeting - Fall 2023. From genomics to molecular modeling: Discovery and characterization of four Trypanosoma cruzi cruzipain subtypes and potential implications for Chagas disease drug discovery. 2023. (Congresso).
VII Curso de Verão em Bioinformática - UFMG.Docking e planejamento de fármacos. 2023. (Outra).
V Simpósio Nacional em Ciências Farmacêuticas (V SINCIFAR).Mesa redonda 2 - Desenvolvimento de fármacos: sucessos recentes, lições aprendidas e direções futuras. 2023. (Simpósio).
XIV Encontro Nacional de Professores de Química Farmacêutica e Medicinal. 2023. (Encontro).
X-meeting 2023. From genomics to molecular modeling: discovery and structural characterization of four Trypanosoma cruzi cruzipains subtypes. 2023. (Congresso).
XXIX Escola de Verão em Química Medicinal..A cruzaína como alvo para a doença de Chagas: descoberta de inibidores e caracterização de subtipos de cruzaína. 2023. (Simpósio).
10th BrazMedChem. Cruzipains as a target for Chagas disease: inhibitor discovery and characterization of subtypes. 2022. (Congresso).
10ª Feira Brasileira de Colégios de Aplicação e Escolas Técnicas. Do sonho à realidade: como se tornar um cientista?. 2022. (Feira).
34° ERSBQMG.Mesa Redonda - Mulheres na Ciência.. 2022. (Outra).
II Workshop of Molecular Modeling in Drug Design and Discovery.From target validation to inhibitor discovery and optimization: Molecular modeling in drug discovery targeting cruzain. 2022. (Simpósio).
IV Workshop de Jovens Pesquisadores em Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos.Biological assays and target validation in medicinal chemistry. 2022. (Simpósio).
VI Curso de Engenharia de Máquinas Biológicas.Projetos e Negócios em Biologia Sintética. 2022. (Simpósio).
VI Curso de Verão em Bioinformática da UFMG.Bioinformática estrutural no planejamento de fármacos. 2022. (Simpósio).
ISCB-Latin America, SoIBio and BioNetMx Virtual Symposium.Women in STEM panel. 2020. (Simpósio).
Gordon Research Conference on Proteolytic Enzymes and Their Inhibitors. Discovery and Characterization of Parasitic Cysteine Protease Inhibitors from ?Open Access Malaria Box?. 2018. (Congresso).
World Science Day for Peace and Development - UNESCO.The Human right to science and the rights of scientific researchers: accessibility and equality of opportunities. 2018. (Outra).
XLIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biofísica. RATIONAL DRUG DESIGN TOWARDS NEW TREATMENTS FOR NEGLECTED AND EMERGING DISEASES. 2018. (Congresso).
Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference. Discovery, Characterization and Computer-Aided Optimization of New Classes of Cruzain and Rhodesain Inhibitors Among Malaria Box Compounds. 2017. (Congresso).
II WORKSHOP BIOTECNOLOGIA EM PRODUTOS FARMACÊUTICOS: DESENVOLVIMENTO, PRODUÇÃO E REGULAMENTAÇÃO.Triagem Virtual no Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. 2016. (Simpósio).
44a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. NOVEL THIOPHENOL-THIOSEMICARBAZONES DERIVATIVES AS CRUZAIN INHIBITORS. 2015. (Congresso).
I Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas.Introdução a Biologia Molecular. 2015. (Oficina).
III WORKSHOP EM MÉTODOS COMPUTACIONAIS APLICADOS ÀS CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS - PROF. SUELY LINS GALDINO.Triagem virtual: uma abordagem racional para descoberta de moléculas bioativas. 2015. (Simpósio).
International Genetically Engeneered Machine (iGEM) Competition 2015 - Giant Jamboree. Leishmania: from pathogens to drug delivery systems. 2015. (Olimpíada).
I Workshop de Jovens Pesquisadores em Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos.Descoberta e Otimização de Inibidores das Enzimas Cruzaína e Rodesaína. 2015. (Simpósio).
X European Workshop in Drug Design. Discovery and Characterization of Cruzain and Rhodesain Small Molecule Inhibitors Through Experimental Screening. 2015. (Congresso).
1st Symposium on Current Topics in Molecular Biophysics.Analysis of the interaction between Coq10 protein and Q6 coenzyme through comparative modelling and docking studies. 2014. (Simpósio).
7th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. Molecular simplification as strategy for designing of potential inhibitors of the cysteine protease cruzain. 2014. (Congresso).
Brazilian Symposium on Chemistry and Physiology of Proteases and their Inhibitors.Discovery of Cruzain and Rhodesain Small Molecule Inhibitors Through Experimental Screening. 2014. (Simpósio).
International Genetically Engineered Machines - iGEM - Giant Jamborree 2014. ColonYeast. 2014. (Olimpíada).
Proteolytic Enzymes and Their Inhibitors - Gordon Research Conference. Synthesis, Biological Evaluation and Structure-Activity Relationships of Potent Noncovalent and Nonpeptidic Cruzain Inhibitors as Anti-Trypanosoma cruzi Agents. 2014. (Congresso).
SIMCIFAR 2014.Cruzaína e rodesaína: alvos moleculares para o desenvolvimento de antitripanossomatídeos. 2014. (Simpósio).
VII Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biologicos. Triagem Virtual em Larga Escala. 2014. (Congresso).
36a Reunião Anual da SBQ. Planejamento, síntese e avaliação biológica de novos inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. 2013. (Congresso).
Workshop on Proteases in Medical Parasitology.Overview of Protease Assays. 2013. (Outra).
XLII Reunião Anual da SBBq. Discovery and Structure-Activity Relationships for a Series of Thiosemicarbazones as Potent Cruzain and Rhodesain Inhibitors. 2013. (Congresso).
44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Basic Concepts on Rational Planning of Drugs. 2012. (Congresso).
44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Examples of drug development from rational planning. 2012. (Congresso).
44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Strategies of rational planning of drugs. 2012. (Congresso).
6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. 2012. (Congresso).
Farmácia e Cosméticos - Avanços Biotecnológicos na Farmacologia e Cosmetodologia.Planejamento Racional de Fármacos. 2012. (Outra).
Keystone Symposia - Drug discovery for protozoan parasites. 2012. (Congresso).
Sao Paulo School of Advanced Science: Advanced Topics in Computational Biology/ Agrochemical and Drug Design. Molecular docking with Autodock Vina. 2012. (Congresso).
VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2012. (Outra).
XLI Reunião Anual da SBBq. Discovery of low micromolar noncompetitive inhibitors of the enzyme rhodesain. 2012. (Congresso).
34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Planejamento de fármacos baseado na estrutura do receptor de inibidores não-covalentes de enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. 2011. (Congresso).
Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference. 2011. (Congresso).
I Escola Brasileira de Modelagem Molecular (EBMM 2011). 2011. (Outra).
X-meeting. Structure-based optimization of noncovalent cruzain inhibitors. 2011. (Congresso).
XVII Escola de Verão em Química Farmacêutica e Medicinal. 2011. (Outra).
5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. Development of a structure-based virtual screening strategy for new inhibitors for Trypanosoma brucei aldolase. 2010. (Congresso).
The 239th ACS National Meeting. 2010. (Congresso).
XIV Workshop da Pós-Graduação do Instituto de Física de São Carlos.XIV Workshop da Pós-Graduação do Instituto de Física de São Carlos. 2010. (Outra).
XXXI Simpósio Acadêmico de Estudos Farmacêuticos.Curso de Modelagem Molecular. 2010. (Simpósio).
Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference. Successes and failures in using virtual screening to predict the results of a high- throughput screen against cruzain. 2009. (Congresso).
I Simpósio de Planejamento e Desenvolvimento de Novos Fármacos para Doenças Negligenciadas. 2009. (Simpósio).
Keystone Symposia - Drug Discovery for Protozoan Parasites. Sucesses and failures in using virtual screening to predict the results of a high-throughput screening against cruzain. 2009. (Congresso).
XIII International Congress of Protistology. 2009. (Congresso).
4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. A study on cruzain: can virtual screening predict the results of a high-throughput screening?. 2008. (Congresso).
International school of crystallography 40th course - From molecules to medicine: integrating crystallography in drug discovery. Parallel DOCK and high-throughput screening against cruzain. 2008. (Congresso).
Keystone Symposia - Drug Discovery for Protozoan Parasites. Docking based discovery of noncovalent cruzain inhibitors. 2007. (Congresso).
28a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Síntese e avaliação de arilfuranos como inibidores da tripanotiona redutase. 2005. (Congresso).
XIII Jornada de Iniciação Científica.Síntese de potenciais inibidores da tripanotiona redutase para tratamento da doença de Chagas. 2005. (Outra).
Projeto Social Farmácia Consciente.Projeto Social Farmácia Consciente. 2004. (Outra).
XXV Simpósio Anual de Estudos Farmacêuticos.Aplicação de técnicas moleculares no laboratório clínico. 2004. (Simpósio).
XI Semana de Iniciação Científica da UFMG.Avaliação da atividade caseinolítica da papaína, dos látex de Carica candamarcensis e Carica papaya. 2002. (Outra).
52a Reunião Anual da SBPC. Estudo in vitro da ação do tiabendazol sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 2000. (Congresso).
8a SBPC Jovem. Efeitos fisiológicos da radiação. 2000. (Congresso).
II Encontro Mineiro de Educação Matemática.A História dos Números. 2000. (Encontro).
II Reunião Anual da UFMG Jovem.Exposição interativa - Efeitos fisiológicos da radiação. 2000. (Outra).
IX Semana de Iniciação Científica da UFMG.A história dos números. 2000. (Outra).
XV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental. Estudo in vitro da ação do tiabendazol sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 2000. (Congresso).
ECO-BH.Divulgação científica sobre saúde e meio ambiente. 1999. (Oficina).
VIII Semana de Iniciação Científica da UFMG.Estudo in vitro da ação do tiabendazol sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 1999. (Outra).
Participação em bancas
Ferreira, R. S.; SANTOS, V. C.; LOURENCO, E. M. G.; SANTOS, L. H.; BLEICHER, L.. Investigação do potencial impacto de substituições em subtipos de cruzipaínas nas interações com inibidores. 2025. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BLEICHER, L.;FERREIRA, R. S.; WEBER, K. C.; ROCHA, W. R.. CARACTERIZAÇÃO COMPUTACIONAL DO MECANISMO DE REAÇÃO DAS HIUASES E SUA EVOLUÇÃO EM VERTEBRADOS. 2024. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
DE OLIVEIRA, RENATA BARBOSA; MALTAROLLO, VINÍCIUS G; MACHADO, R. R.; COELHO, M. M.;FERREIRA, R. S.; PADUA, R. M.. PLANEJAMENTO, SÍNTESE E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE ANTINOCICEPTIVA E TOXICIDADE AGUDA DE ARILFURANOS POTENCIAIS INIBIDORES DA ENZIMA FAAH. 2024. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MAGALHAES, M. T. Q.; FRANCO, G. R.; PINHEIRO, A. S.; ABURJAILE, F. F.;FERREIRA, R. S.. Avaliação dos produtos de expressão das regiões gênicas envolvidas na degradação do ácido úrico. 2024. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; SANTOS, L. H.; BRAGA, M. N. M.; VIEIRA, R. P.; GUIMARAES, A. C. R.. Caracterização estrutural de subtipos de cruzipaína por modelagem molecular. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; SANTOS, M. S.; REZENDE JR, C. O.. OTIMIZAÇÃO DE UMA CLASSE DE BENZENOSSULFONAMIDAS COMO AGENTES ANTI-TRYPANOSOMATIDAE: PLANEJAMENTO, SÍNTESE E AVALIAÇÃO BIOLÓGICA CONTRA O TRYPANOSOMA CRUZI E LEISHMANIA INFANTUM. 2023. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Uberlândia.
MALTAROLLO, V. G.; COSTA, D. M. A.; GERTRUDES, J. C.;Ferreira, R. S.. INTEGRAÇÃO DE ALGORITMOS DE APRENDIZADO DE MÁQUINA AO DOCKING MOLECULAR PARA PLANEJAMENTO E REALIZAÇÃO DE ENSAIOS IN VITRO DE INIBIDORES DA ENZIMA ENOIL-ACP-REDUTASE NAD(P)HDEPENDENTE (FABI) DE STAPHYLOCOCCUS AUREUS E DE ESCHERICHIA COLI. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R.S.; BLEICHER, L.; MALTAROLLO, V. G.. Triagem virtual para prospecção de inibidores contra a protease NS2B-NS3 de Zika vírus. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MINARDI, R. C. M.; SABINO, A. P.; BLEICHER, L.; OLIVEIRA, M. G. A.;FERREIRA, R.S.. Identificação de novos peptídeos inibidores de TMPRSS2: uma abordagem computacional para prospecção de um tratamento antiviral. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MACHADO, C. R.;Ferreira, R. S.; BARTHOLOMEU, D. C.. ESTUDO DO PAPEL DOS GENES RNASEH1 E RNASEH2A NAS VIAS DE RESPOSTA AOS DANOS NO DNA E SINALIZAÇÃO DE MORTE EM TRYPANOSOMA CRUZI. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
DARDENNE, L. E.;Ferreira, R. S.; BARRETO, A.. Desenvolvimento de funções de pontuação para predição de afinidade proteína-ligante utilizando Redes Neurais Profundas. 2022. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica.
Ferreira, R. S.; BLEICHER, LUCAS; BRESSAN, G. C.. Priorização de proteínas quinases de Trypanosoma cruzi como potenciais alvos terapêuticos para o desenvolvimento de inibidores covalentes. 2022. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
DA SILVA JUNIOR, E. N.;Ferreira, R. S.; FATIMA, A.; JARDIM, G. A. M.. A simbiótica relação entre para-quinonas e beta-lapachonas para a identificação de compostos bioativos: síntese e potencial atividade contra o vírus SARS-CoV-2. 2022. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Minas Gerais.
SANCHEZ, E. F.;Ferreira, R. S.; BORGES, M. H.. Análise do potencial biotecnológico das proteínas isoladas de venenos de serpentes pelo Serviço de Bioquímica de Proteínas de Venenos Animais da Fundação Ezequiel Dias. 2022. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Fundação Ezequiel Dias.
FERREIRA, R. S.; SANCHEZ, E. F.; VILELA, L. F. F.; HORTA, M. F.. Propriedades moleculares e bioquímicas da lectina tipo C presente no veneno de Bothrops neuwiedi. 2021. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
TORRES, P. H. M.; PASCUTTI, P. G.;FERREIRA, R. S.; DARDENNE, L. E.; BISCH, P. M.. DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE DOCAGEM MOLECULAR E TRIAGEM VIRTUAL E APLICAÇÃO NA BUSCA DE AGENTES TERAPÊUTICOS CONTRA O VÍRUS ZIKA. 2021. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.
ANDRADE, S. F.; ROESLER, R.; GNOATTO, S. C. B.; PILGER, D. A.;FERREIRA, R.S.. PLANEJAMENTO, SÍNTESE E AVALIAÇÃO BIOLÓGICA DE COMPOSTOS OBTIDOS POR HIBRIDAÇÃO MOLECULAR CONTRA LINHAGENS TUMORAIS DE CÂNCER PEDIÁTRICO. 2021. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.
NAGEM, R. A. P.; COSTA, M. A. F.;FERREIRA, R. S.; VIEIRA, R. P.. Estudo de interação da proteína Pb27 de Paracoccidioides brasiliensis com um ligante nucleotídico e de sua aplicação em um biossensor. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
TEIXEIRA, S. M. R.; FERNANDES, A. P.;FERREIRA, R. S.. Trypanosoma cruzi inositol phosphorylceramide synthase as a potential drug target for Chagas disesase. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; FERREIRA, J. M. S.; KROON, E. G.; MOTA, B. E. F.; MALTAROLLO, VINÍCIUS G.. Triagem virtual e biológica de substâncias com potencial atividade antiviral contra três flavivírus: dengue virus, yellow fever virus e Zika virus. 2020. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Microbiologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BLEICHER, L.;FERREIRA, R. S.; NAGEM, R. A. P.; PIMENTA, A. M. C.. Investigação de um sítio de regulação alostérica da protease NS2B-NS3 do vírus da Zika com potencial para ligação a moléculas bioativas. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
PIRES, D. E. V.;FERREIRA, R. S.; IZIDORO, S. C.. Entendendo os mecanismos moleculares de mutações que causam esclerose lateral amiotrófica. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; BLEICHER, L.; MAGALHAES, M. T. Q.; TAHARA, E. B.. Ataíde. Análise de resíduos conservados e correlacionados de cisteíno proteases. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R.S.; DORNELLES, M. M.; AMBROSIO, P. E.. Metodologia para desenvolvimento de modelos reprodutíveis para predição de propriedades ADMET utilizando algoritmos de aprendizado de máquina. 2017. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional em Ciência e Tecnologia) - Universidade Estadual de Santa Cruz.
LIMA, L. F.;FERREIRA, R.S.CAFFARENA, E. R.. Estudos de modelagem molecular dos mecanismos de afinidade realtiva para quatro galantamínicos com potentcial anti-Alzheimer. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
PACHECO, A. B. F.; VERMELHO, A. B.;Ferreira, R. S.. Predição funcional de proteínas moduladas por estresse em Deinococcus radiodurans. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.
BIZARRO, C. V.;CAFFARENA, E. R.Ferreira, R. S.. Determinação de energia livre de ligação por métodos in silico para ligantes de InhA de Mycobacterium Tuberculosis. 2016. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Farmacêutica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.
COSTA, M. C. N.; NATSUI, A. P. Y.;Ferreira, R. S.. Desenvolvimento de uma plataforma modelo para a busca de ligantes com potencial leishmanicida baseado na inibição seletiva da enzima diidroorotato desidrogenase. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas - FCFRP) - Universidade de São Paulo.
REGASINI, L. O.;Ferreira, R. S.; SOUZA, F. P.. Síntese de aminochalconas e análogos arílicos como agentes antivirais, antifúngicos e inibidores de mieloperoxidase. 2015. Dissertação (Mestrado em Quimica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MINARDI, R. C. M.; SILVEIRA, S. A.;FERREIRA, R. S.. nAPOLI: uma ferramenta web para análise de interações proteína-ligante. 2015. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
ALMEIDA, S.AZEVEDO, V. A. C.Ferreira, R. S.; SORIANI, F. M.. Caracterização e análise das vias de redução de nitrato em Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.
NAGEM, R. A. P.;FERREIRA, R. S.; MACHADO, C. R.. Produção de enzimas recombinantes da via de degradação do naftaleno para caracterização estrutural. 2013. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; YAMAGISH, M. E. B.; WEBER, G.. Otimização de periodicidades fracas em genomas utilizando transformadas de Fourier e algoritmos genéticos. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto.
ALVES, R. B.;FERREIRA, R. S.; SILVA, T. H. A.;OLIVEIRA, R. B.. Síntese de inibidores potenciais da tripationa redutase: base para o desenvolvimento de novos fármacos para tratamento da doença de Chagas e leishmaniose. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
CARVALHO, D. T.;FERREIRA, R. S.ALVES, R. J.. Planejamento racional por modelagem molecular, síntese e caracterização de glicosídeos com potencial atividade inibitória da acetilcolinesterase. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MURTA, S. M. F.; ARAUJO, M. S. S.; BARTHOLOMEU, D. C.; GRISARD, E. C.;Ferreira, R. S.. Integrando dados de transcriptômica em redes de interação para prospecção de novos alvos e fármacos para a quimioterapia da doença de Chagas. 2025. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular, Genética e Bioinformática) - Instituto René Rachou.
GUIMARAES, A. C. R.;FERREIRA, R. S.; LAMEIRA, JERÔNIMO. Prospecção de Inibidoresda Enoil-ACP Redutase de Plasmodium falciparum a Partir de Abordagens in silico e in vitro. 2024. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
ANDRADE, C. H.;FERREIRA, R. S.; AGUIAR, A. C. C.; SILVA, J. H. M.; CAMPOS, H. S.. Abordagem orientada por alvos e triagens in silico e in vitro para identificar novos candidatos antimaláricos com foco em Plasmodium vivax. 2024. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical) - Universidade Federal de Goiás.
ANDRICOPULO, A. D.FERREIRA, R. S.; TROSSINI, G. H. G.; MORAES, J.; MAGALHAES, L. G.. Investigação de moduladores da tubulina com propriedades anticâncer. 2024. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada - Instituto de Física de São Carlos/USP/SÃO CA) - Universidade de São Paulo.
SILVA, C. H. T. P.;FERREIRA, R.S.; CLOSOSKI, G. C.; COSTA, L. T.. Planejamento computacional e avaliação biológica de inibidores alostéricos de glicogênio sintase cinase 3-β com interesse na doença de Alzheimer. 2023. Tese (Doutorado em Doutorado em Química) - Universidade de São Paulo.
LAMEIRA, JERÔNIMO; PASCUTTI, PEDRO GERALDO;FERREIRA, R. S.; GARRIGA, F. J. L.; SILVA, J. R. A.. Modelagem molecular de inibidores covalentes reversíveis de cisteíno proteases. 2023. Tese (Doutorado em Química) - Universidade de São Paulo.
LIMA, L. M.; TINOCO, L. W.;FERREIRA, R. S.; REGASINI, L. O.; CERECETTO, H.. Estudos para a descoberta de novos inibidores duais Pan-PI3K/mTOR. 2023. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Farmacologia e Química Medicinal)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.
MAGALHAES, M. T. Q.; BEMQUERER, M. P.; VERLY, R. M.; SILVA, A. H. M.;FERREIRA, R. S.. Lunatinas: um estudo da relação estrutura-função de peptídeos bioativos multifuncionais. 2023. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.; ANDRADE, C. H.; MAGALHAES, M. T. Q.; TORRES, P. H. M.; MALTAROLLO, V. G.. Prospecção de Inibidores Ortostéricos da Protease NS2B-NS3 do Vírus Zika como potenciais candidatos a Fármacos. 2022. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
PIRES, D. E. V.; BLEICHER, L.;Ferreira, R. S.; MONTE NETO, R. L.; VELOSO, W. N. P.. "In silico discovery of GPCR ligands using graph based signatures and auxiliary features. 2022. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MACEDO, A. M.;Ferreira, R. S.; SANTOS, B. F.; MUNFORD, D.; TORRES, B. B.; MORTIMER, E. F.. Aplicação da Teoria dos Códigos de Legitimação na análise de discurso de professor de disciplinas de química e bioquímica para estudantes de graduação. 2022. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R.S.; PASCUTTI, P. G.; MINARDI, R. C. M.; MAGALHAES, M. T. Q.; SILVA, M. L.. PyAutoFEP: uma ferramenta de automação para cálculos de FEP para o programa GROMACS integrando técnicas de amostragem estendida. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; MACHADO, C. R.; TROSSINI, G. H. G.; GUIMARAES, A. C. R.; MOURAO, M. M.. Developing cruzipain inhibitors: rational development of a new class of inhibitors and identification of cruzipain subtypes. 2021. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
LAGE, C. A. S.; BISCH, P. M.; PASCUTTI, P. G.;FERREIRA, R. S.; GALHARDO, R. S.; SILVA, R.. CARACTERIZAÇÃO DO PERFIL DE EXPRESSÃO DE GENES COM FUNÇÕES PREDITAS IN SÍLICO NO METABOLISMO DE DEINOCOCCUS RADIODURANS. 2021. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.
MINARDI, R. C. M.; LIMA, L. F.;CAFFARENA, E. R.; OLIVEIRA, M. F.;FERREIRA, R. S.. Modelagem molecular aliada ao aprendizado de máquina na busca por assinaturas de resistência a herbicidas em Acetolactato sintases (ALSs). 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.CAFFARENA, E. R.; LIMA, L. F.; MAGALHAES, M. T. Q.. Avaliação da Seletividade de Inibição de Cisteíno Proteases por Chagasina Através de Estudos de Dinâmica Molecular de Complexos Proteicos. 2020. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MAGALHAES, M. T. Q.; SANTOS, L. H.; SANTOS, D. A.;FERREIRA, R. S.. Domínio HIRAN: variações estruturais e suas implicações na interação com ssDNA. 2020. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MINARDI, R. C. M.;FERREIRA, R. S.; MARTINS, J. P. A.; BLEICHER, L.; Guido, Rafael VC; LIMA, L. H. F.. Prioritizing promising compounds in virtual screening campaigns. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
GUIMARAES, A. C. R.;FERREIRA, R.S.; ESCOBAR, P. C.. Estudo de Metaloproteases de Leishmanina (Viannia) braziliensis pertencentes ao cromossomo 10 da família M8. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
ANDRICOPULO, A. D.; NASCIMENTO, A. S.; CILLI, E. M.;Ferreira, R. S.; CRUZ, F. C.. Planejamento de inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi candidatos a fármacos contra a doença de Chagas. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada - Instituto de Física de São Carlos/USP/SÃO CA) - Universidade de São Paulo.
PIMENTA, A.; BLOCH JUNIOR, C.; RAMOS, C. H. I.;Ferreira, R. S.; SILVA, A. M.. Estudo da atividade inibitória e da interação molecular das lunatinas e análogos sobre a proteína tirosina fosfatase de Yersinia sp (YopH). 2016. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MOREIRA, D. R. M.; MOREIRA, C. P. S.; CORREA, C. M.;ALVES, R. J.FERREIRA, R. S.OLIVEIRA, R. B.. Planejamento, síntese e avaliação da atividade tripanocida de potenciais inibidores de cisteíno-proteases. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
CASTILHO, M. S.;FERREIRA, R. S.; BORGES, V. M.; PITA, S. S. R.; BENEVIDES, R. G.. Produção recombinante de enzimas da via biossintética de esteróis de Leishmania brasiliensis. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia) - Universidade Estadual de Feira de Santana.
PAPPA, G. L.; MINARDI, R. C. M.; SILVEIRA, C. H.; DARDENNE, L. E.; BLEICHER, L.;Ferreira, R. S.. Algoritmos genéticos para identificação de sítios ativos em enzimas. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
AZEVEDO, V. A. C.Ferreira, R. S.; ARNI, R. K.;LEMKE, NEY; ORTEGA, M. L.; MOLINA, F.. Validação de um método para predição de redes de interação proteína-proteína e sua aplicação em Corynebacterium pseudotuberculosis para identificar proteínas essenciais. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.; SANCHEZ, E. F.;CAFFARENA, E. R.; NASCIMENTO, A. S.; BLEICHER, L.; LIMA, L. F.. Identificação de inibidores das metaloproteases de veneno de serpente atroxilisina-I e leucurolisina-a através de triagem virtual, dinâmica molecular e avaliação experimental. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
GOMES, D. A.; GOES, A. M.; MELO, A. B.; SERAKIDES, R.; CASTRO JUNIOR, C.;FERREIRA, R. S.. O papel do Ca+ intracelular nos processos de diferenciação e progressão do ciclo celular em células tronco mesenquimais derivadas de tecido adiposo. 2014. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
ANDRICOPULO, A. D.; NASCIMENTO, A. S.; LIMA, M. E. F.;FERREIRA, R. S.; COMINETTI, M. R.. Triagem biológica, identificação e planejamento de novos candidatos a agentes anticâncer a partir de produtos naturais e compostos sintéticos. 2014. Tese (Doutorado em Física Aplicada - opção Física Biomolecular) - Instituto de Física de São Carlos - Universidade de São Paulo.
AZEVEDO, V. A. C.FERREIRA, R. S.; KRISHNASWAMY, R.; RAMOS, R. J.; SANTORO, M. M.; SORIANI, F. M.; BLEICHER, L.. Modelome Derived Intra-Species Broad Spectrum Drug and Vaccine Targets Identification in the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis. 2013. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.
GOES NETO, A.;AZEVEDO, V. A. C.FERREIRA, R. S.; DUARTE, A. A.; SANTOS JUNIOR, M. C.. Sintase da quitina de Moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora: caracterização, clonagem, expressão heteróloga e triagem virtual e teste in vitro de inibidores. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual de Feira de Santana.
FERREIRA, R. S.LEITE, A. C. L.Hernandes, Marcelo Zaldini. Síntese a avaliação da atividade antichagásica de novas hidrazonas. 2012. Tese (Doutorado em Inovação Terapêutica) - Universidade Federal de Pernambuco.
Ferreira, R. S.; NAGEM, R. A. P.; LEITE, J. R. S. A.. ESTUDO DA INTERAÇÃO PEPTÍDEO- LIPOPOLISSACARÍDEO EM SALMONELLA ENTERICA: INTEGRANDO A BIOFÍSICA MOLECULAR NO DESENHO RACIONAL DE PEPTÍDEOS BIOATIVOS. 2025. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; MAGALHAES, M. T. Q.; AVILA, R. A. M.. Desenvolvimento de uma nova estratégia para o tratamento do acidente escorpiônico. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R.S.; SIMOES, R. T.; CRUZ, J. S.. Estudo in vitro da atividade do peptídeo LyeTx I-bPEG, em linhagem celular de câncer de mama triplonegativo (MDA-MB 231) e na modulação do antígeno leucocitário humano (HLAG). 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FRANCO, G. R.;FERREIRA, R. S.; BLEICHER, L.. RNApedia: Uma base de dados de interações proteína-RNA. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
ANDRADE, C. H.; Mottin, Melina; NEVES, B. J.;FERREIRA, R. S.. Descoberta de inibidores da protease principal (3CLpro) de SARS-CoV-2: integração de estratégias computacionais e avaliação experimental. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical) - Universidade Federal de Goiás.
FERREIRA, R. S.; TRINDADE, S. C.; PACHECO, L. G. C.. Genômica subtrativa e imunoinformática aplicadas à prevenção e tratamento das infecções causadas por Streptococcus equi em equinos. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; ANDRADE, C. H.; DEMARQUE, D. P.. Rational Investigation of Designed OGT Inhibitors Targeted Therapy in Leukemic Cancer cells by Using Cannabinoids Databases. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Fármaco e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.
Ferreira, R. S.; BLEICHER, L.; NAGEM, R. A. P.. DESENVOLVIMENTO DE TECNOLOGIA PARA PLANEJAMENTO DE PROTEÍNAS PARA USO EM DIETA ?SINGLE-CELL PROTEIN?. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.; SIMOES, R. T.; ROCHA, M. N.. "Estudo da atividade do peptídeo LyeTxI bPEG, derivado da peçonha da aranha Lycosa erythrognatha, isolado e combinado com carboplatina, em linhagem celular de câncer de mama triplo-negativo (MDA-MB 231) e em modelo in vivo, em camundongo. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.; BLEICHER, L.; MAGALHAES, M. T. Q.. PLANEJAMENTO E SÍNTESE DE DERIVADOS ARILFURANOS COMO POTENCIAIS INIBIDORES DA PROTEASE MPRO CODIFICADA PELO GENOMA DO VÍRUS SARS-CoV-2. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MUNIZ, J. R. C.;Ferreira, R. S.; CILLI, E. M.. Descoberta de novos ligantes bioativos com propriedades anticâncer. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
LIMA, L. H. F.; GUIMARAES, L. G. L.;Ferreira, R. S.. Estudos experimentais e computacionais da ação inseticida de óleos essenciais em Moscas Calliphoridae e identificação de seus possíveis alvos moleculares. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós Graduação Multicêntrico em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal de São João Del-Rei.
MODOLO, L. V.; MAGALHAES, M. T. Q.;FERREIRA, R. S.. Estudos in vitro e in silico de resíduos cataliticamente ativos de NahK de Pseudomonas putidas G7. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FRANCO, G. R.; FREITAS, L. M.;FERREIRA, R. S.. Diferenças genéticas humanas afetam como os SARS-CoV-2 se ligam às nossas células. / Pangenoma e core-genes da provável família Pithoviridae, composta por vírus gigantes. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
SANTOS, L. H.;FERREIRA, R. S.. Metodologias in silico aplicadas a descoberta de fármacos: busca de novos alvos moleculares e substâncias químicas para doenças causadas por tripanossomatídeos. 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
FERREIRA, R. S.; MAGALHAES, M. T. Q.; ALEXANDRE, S. S.. Modeling nucleic acids -A mesoscopic approach. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
NAGEM, R. A. P.; MENDES, T. A. O.;FERREIRA, R. S.. Caracterização funcional e estrutural de proteínas anticongelantes putativas da levedura Metschnikowia australis. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MONTANARI, C. A.; NASCIMENTO JUNIOR, A. M.;FERREIRA, R. S.. Modelagem molecular de inibidores covalentes reversíveis de cisteíno proteases. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Química) - Universidade de São Paulo.
FERREIRA, R. S.; VILELA, L. F. F.; PAPPA, G. L.. In silico design of GPCR ligands: from lead discovery to pharmacokinetics optimization. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
CRUZ, J. S.; MAGALHAES, P. P.;FERREIRA, R.S.. Atividade antimicrobiana, em ambiente planctônico e de biofilme, dos peptídeos sintéticos derivados de LyeTx1, da peçonha da aranha Lycosa Erythrognatha. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R.S.; CARDOSO, V. N.; TAHARA, E. B.. Estratégias moleculares para caracterização e diferenciação de células-tronco derivadas de tecido adiposo e fibroblastos dérmicos humanos. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BLEICHER, L.; SANTOS, M. A.;FERREIRA, R.S.. Uma estratégia de triagem virtual mista baseada em alvo e ligante: um estudo de caso com a ricina. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
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FARIA, A. A. P.; ALMEIDA, A. C. L.;FERREIRA, R. S.. Modelo matemático para coevolução de patógenos e epidemias e implementação computacional. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BRESSAN, G. C.; COSTA, M. D. L.; OLIVEIRA, L. L.; SANTOS, A. A.;Ferreira, R. S.. Caracterização bioquímica das cinases reguladoras de splicing hsSRPK2 e PfSRPK1 no contexto do desenho racional de inibidores com potencial terapêutico. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquimica Agricola) - Universidade Federal de Viçosa.
BLEICHER, L.;FERREIRA, R. S.; ORTEGA, J. M.. Utilização de parâmetros bioquímicos e modelos estatísticos para determinação de epitopos. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BLEICHER, L.; PAPPA, G. L.;Ferreira, R. S.. Busca por padrôes posicionais de átomos com cargas parciais semelhantes em núcleos hidorfóbicos de estrutturas globulares de mesma família proteica. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; SANTORO, M. M.; VIELA NETO, O. P.. Algoritmos Genéticos para Previsão de Função de Enzimas por Similaridade de Sítio Ativo. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
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FERREIRA, R. S.; VILELA, L. F. F.; BLEICHER, L.. Análise de PadrÕes de Interação na Superfície de Contato entre Inibidores Protéicos e Serino Proteases. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
SANTORO, M. M.; NAGEM, R. A. P.;FERREIRA, R. S.; BLEICHER, L.. Estudo comparativo de par6ametros de estrutura secundária em proteomas de organismos com genoma completo. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; VAGO, A. R.; SANTOS, E. T.. Associação de SNPs com a cor da pele em brasileiros. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; Russo, R. C.; TEIXEIRA, S. M. R.. Trypanosoma cruzi expressando NY-ESO-1 induz imunidade antitumoral associada com a geração de linfócitos T CD8+ gzmB+ de memória. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; SANTOS, M. A.; BLEICHER, L.. O papel da evolução na formação das estruturas secundárias de proteínas e o relacionamento ancestral entre arranjos das mesmas. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BORGES, K. B. G.;FERREIRA, R.S.. Avaliação do efeito do extrato etanólico do fungo Trichoderma stromaticum sobre células tumorais. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.; BARBOSA, E. S.;OLIVEIRA, R. B.; COSTA, M. A. F.. PREDIÇÕES FARMACOCINÉTICAS E AVALIAÇÃO DA POTÊNCIA DE UMA SÉRIE DE DERIVADOS DE BENZENOSSULFONILPIPERAZINA CONTRA A ENZIMA CRUZAÍNA DO TRYPANOSOMA CRUZI. 2025. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
BLEICHER, L.;Ferreira, R. S.; MINARDI, R. C. M.. APLICAÇÕES DA INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL NA PESQUISA DESENVOLVIMENTO DE NOVOS MEDICAMENTOS. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
COSTA, D. M. A.;Ferreira, R. S.; SILVA, M. R. E.; DIOGO, M. A.. EXPRESSÃO E PURIFICAÇÃO DA PROTEÍNA PL pro DE SARS-COV-2 PRODUZIDA EM CÉLULAS DE ESCHERICHIA COLI VISANDO O PLANEJAMENTO DE NOVAS MOLÉCULAS CANDIDATAS A FÁRMACO. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
Ferreira, R. S.OLIVEIRA, R. B.; SERAFIM, M. S. M.. Caracterização bioquímica de potenciais inibidores da protease NS2B- NS3 de Zika vírus. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
COSTA, D. M. A.; MALTAROLLO, V. G.;FERREIRA, R. S.; SERAFIM, M. S. M.. CONSTRUÇÃO DE MODELO FARMACOFÓRICO PARA INIBIDORES DA ENZIMA MPRO DO SARS-COV-2. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MARTINS, J. P. A.; MIRANDA, A. S.;FERREIRA, R. S.. Estudos QSAR de inibidores de DENV-2 NS2B/NS3 Protease. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal de Minas Gerais.
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OLIVEIRA, R. B.; MALTAROLLO, VINÍCIUS G.;FERREIRA, R.S.. Construção e validação de modelos de similaridade química para inibidores da FabI de Staphylococcus aureus com aplicação em triagem virtual. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais.
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FERREIRA, R. S.; BLEICHER, L.. Papel de resíduos conservados e correlacionados na estrutura e função das serina proteases. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais.
MONTANARI, C. A.; ROCHA, GERD B.; NASCIMENTO, A. S.; SANTANNA, C. M. R.;Ferreira, R. S.. Banca de concurso para tecnologista - Perfil: Planejamento de fármacos. 2024. Laboratório Nacional de Computação Científica.
Oliveira, Renata B. de; SANTANNA, C. M. R.; ROMEIRO, N. C.;Ferreira, R. S.; RAMALHO, T. C.. Professor Adjunto A, Departamento de Produtos Farmacêuticos. Área de conhecimento: Química Farmacêutica. 2015. Universidade Federal de Minas Gerais.
CAFFARENA, E.;FERREIRA, R. S.; PANEPUCCI, R. A.. Pesquisador da Fiocruz - Perfil SSP1619 - Biologia Estrutural e Bioimageamento. 2014. Fundação Oswaldo Cruz.
FERREIRA, R. S.; Guido, Rafael VC; MURAKAMI, M.. Pesquisador da Fiocruz - Perfil HP1487 - Biologia Estrutural. 2014. Centro de Pesquisas René Rachou /Fundação Oswaldo Cruz.
FRANCO, L. H.; HORTA, M. F.;FERREIRA, R. S.. Banca de seleção de mestrado e doutorado - PPG em Bioquímica e Imunologia da UFMG. 2023. Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.. Revisora de resumos submetidos ao 10th BrazMedChem. 2022. Sociedade Brasileira de Química.
FERREIRA, R. S.. consultor(a) externo(a) do processo de avaliação de projetos de pesquisa da UFAL. 2022. Universidade Federal de Alagoas.
FERREIRA, R. S.. Consultora externa do processo de avaliação de projetos de pesquisa da UFAL. 2022. Universidade Federal de Alagoas.
FERREIRA, R. S.; POLETINI, M. O.. Comissão avaliadora do 24º Encontro de Extensão da UFMG. 2021. Universidade Federal de Minas Gerais.
FRANCO, G. R.;FERREIRA, R. S.; MINARDI, R. C. M.; CARVALHO, D. S.. Processo Seletivo de 1a entrada/2020 para o curso de doutorado do PPG em Bioinformática. 2020. Universidade Federal de Minas Gerais.
FRANCO, G. R.; GOES NETO, A.; MINARDI, R. C. M.; ORTEGA, J. M.; BEM, L. E. V.; MAGALHAES, M. T. Q.; BLEICHER, L.;Ferreira, Rafaela S.. Wokshop de Avaliação Discente do Programa de pós-graduação em Bioinformática. 2020. Universidade Federal de Minas Gerais.
ORTEGA, J. M.; VILELA, L. F. F.;FERREIRA, R. S.. Banca Examinadora do Simpósio do Mestrado. 2020. Universidade Federal de Minas Gerais.
FRANCO, G. R.;FERREIRA, R. S.; SANTOS, L. H.; BLEICHER, L.; SANTOS, M. A.. Banca do processo seletivo de doutorado 4a entrada do PPG em Bioinformática UFMG. 2019. Universidade Federal de Minas Gerais.
AGUIAR, E. R. G. R.;Ferreira, R. S.; MINARDI, R. C. M.;AZEVEDO, V. A. C.. Banca de seleção para doutorado - Programa de Pós Graduação em Bioinformática. 2016. Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.; ORTEGA, J. M.; SANTOS, M. A.;AZEVEDO, V. A. C.. Banca de seleção de doutorado - Programa de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG. 2014. Universidade Federal de Minas Gerais.
AZEVEDO, V. A. C.; ORTEGA, J. M.;FERREIRA, R. S.. Banca de seleção de doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática - UFMG. 2014. Universidade Federal de Minas Gerais.
FERREIRA, R. S.. XVI Semana da Graduação da UFMG. 2012. Universidade Federal de Minas Gerais.
Orientou
; ; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; (Coorientador);
; Desenvolvimento de inibidores covalentes de cinases de Leishmania como potenciais fármacos para tratamento de leishmanioses; Início: 2024; Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);
; ; Início: 2024; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Associação de algoritmos de aprendizado de máquina e docking molecular para a otimização da triagem virtual em ultra larga-escala; Início: 2023; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);
Descoberta de inibidores da dihidrofolato redutase de Mycobacterium tuberculosis baseado na estrutura do receptor; Início: 2023; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Caracterização bioquímica da lectina tipo C de Bothrops neuwiedi; Início: 2022; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);
Planejamento de inibidores da protease principal de SARS-CoV-2; Início: 2020; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Início: 2025; Universidade Federal de Minas Gerais;
Início: 2024; Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais;
Início: 2024; Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais;
Compreensão de elementos importantes para inibição seletiva de proteassoma de organismos patogênicos; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Estudos de interações proteína-ligante de subtipos de cruzipaínas com inibidores de cruzaína; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; (Orientador);
Investigação do potencial impacto de substituições em subtipos de cruzipaínas nas interações com inibidores; 2025; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Triagem virtual para prospecção de inibidores contra a protease NS2B-NS3 de Zika vírus; 2023; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Priorização de proteínas quinases de Trypanosoma cruzi como potenciais alvos terapêuticos para o desenvolvimento de inibidores covalentes; 2022; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Caracterização estrutural de subtipos de cruzipaína por modelagem molecular; 2022; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
A simbiótica relação entre para-quinonas e beta-lapachonas para a identificação de compostos bioativos: síntese e potencial atividade contra o vírus SARS-CoV-2; 2022; Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Minas Gerais, Pró-Reitoria de Pesquisa da UFMG; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Propriedades moleculares e bioquímicas da lectina tipo C presente no veneno de Bothrops neuwiedi; 2021; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Investigação de um sítio de regulação alostérica da protease NS2B-NS3 do vírus da Zika com potencial para ligação a moléculas bioativas; 2019; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Ataíde; Análise de resíduos conservados e correlacionados de cisteíno proteases; 2019; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Síntese de inibidores de cruzaína e rodesaína; 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, ; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
PLANEJAMENTO, SÍNTESE E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE DE POTENCIAIS INIBIDORES DA CRUZAÍNA: BASE PARA O DESENVOLVIMENTO DE NOVOS FÁRMACOS TRIPANOCIDAS; 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Developing selective cruzain inhibitors through structure-based techniques; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Sïntese e estudos de modelagem molecular de uma série de inibidores das enzimas cruzaína e rodesaína; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Prospecção de Inibidores Ortostéricos da Protease NS2B-NS3 do Vírus Zika como potenciais candidatos a fármacos; 2022; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Síntese e avaliação da atividade biológica de análogos de inibidores de cruzaína; 2022; Tese (Doutorado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Developing cruzipain inhibitors: rational development of a new class of inhibitors and identification of cruzipain subtypes; 2021; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
PyAutoFEP: uma ferramenta de automação para cálculos de FEP para o programa GROMACS integrando técnicas de amostragem estendida; 2021; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Avaliação da Seletividade de Inibição de Cisteíno Proteases por Chagasina Através de Estudos de Dinâmica Molecular de Complexos Proteicos; 2020; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Prioritizing promising compounds in virtual screening campaigns; 2019; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Otimização e avaliação biológica de uma classe de inibidores competitivos das enzimas parasitárias cruzaína e rodesaina; 2018; Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Planejamento, Síntese e Avaliação da Atividade Tripanocida de Potenciais Inibidores de Cisteíno Proteases; 2016; Tese (Doutorado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Planejamento racional de compostos inibidores da transcriptase reversa HIV-1; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Identificação de inibidores das metaloproteases da classe P-I de veneno de serpente atroxlisina- I e leucurolisina-a através de triagem virtual e dinâmica molecular; 2015; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Predição computacional da rede de interação proteína-proteína para 15 cepas de Corynebacterium pseudotuberculosis; 2015; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Modelome Derived Intra-Species Broad Spectrum Drug and Vaccine Targets Identification in the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis; 2013; Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Rafaela Salgado Ferreira;
2024; Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Rafaela Salgado Ferreira;
2022; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2022; Universidade Federal de Minas Gerais, ; Rafaela Salgado Ferreira;
2022; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2021; Universidade Federal de Minas Gerais, ; Rafaela Salgado Ferreira;
2021; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2018; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2018; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2017; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
2017; Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rafaela Salgado Ferreira;
PREDIÇÕES FARMACOCINÉTICAS E AVALIAÇÃO DA POTÊNCIA DE UMA SÉRIE DE DERIVADOS DE BENZENOSSULFONILPIPERAZINA CONTRA A ENZIMA CRUZAÍNA DO TRYPANOSOMA CRUZI; 2025; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Caracterização bioquímica de potenciais inibidores da protease NS2B-NS3 de ZIKA vírus; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
CARACTERIZAÇÃO DE POTENCIAIS INIBIDORES DA PROTEASE CRUZAÍNA DO TRYPANOSOMA CRUZI; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
SCREENING THE PATHOGEN BOX TO DISCOVER NEW CRUZAIN AND RHODESAIN INHIBITORS: A COMBINED IN SILICO AND IN VITRO APPROACH; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Avaliação da atividade de produtos domésticos contra larvas de Aedes aegypti; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
PLANEJAMENTO RACIONAL DE INIBIDORES DE SRPK-1 E SRPK-2 PARA DESENVOLVIMENTO DE COMPOSTOS ANTITUMORAIS; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Vírus Zika: Protease NS2B-NS3 como alvo para a busca de inibidores antivirais; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Descoberta e caracterização bioquímica de inibidores das enzimas cruzaína e rodesaína; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Centro Universitário Newton Paiva; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Descoberta de inibidores da dihidrofolato redutase de Mycobacterium tuberculosis baseado na estrutura do receptor; 2025; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Caracterização bioquímica de potenciais inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Modelagem molecular e caracterização experimental de potenciais inibidores de NS2B/NS3 do vírus Zika; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Proposição de ligantes por estudos de modelagem molecular; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Otimização racional de inibidores de cruzaína; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Desenvolvimento racional de inibidores de cisteíno proteases para tratamento de doença de Chagas e COVID-19; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
; ; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Estudo de modelagem molecular de potenciais inibidores de NS2B/NS3 do vírus Zika; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Modelagem molecular de inibidores das quinases SRPK1 e SRPK2; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Descoberta e caracterização de inibidores de cruzaína a partir de docking e triagem experimental; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Utilização de Leishmania como vetor para tratamento de artrite reumatóide; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Avaliação de exosítios da enzima cruzaína através de técnicas computacionais e experimentais; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Estudos de relação estrutura atividade e modelagem molecular de inibidores da enzima rodesaína de Trypanosoma brucei; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Expressão, purificação e cristalografia da enzima rodesaína de T; brucei; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Análise da interação entre a proteína Coq10 e a coenzima Q6 através de estudos de docagem molecular e dinâmica molecular; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
; ; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Expressão da enzima rodesaína de T; brucei e avaliação de potenciais inibidores; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
; ; 2013; Iniciação Científica - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Modelagem molecular de potenciais inibidores da enzima tripanotiona redutase; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Plataforma IdeaReal de Desenvolvimento de Proposta de Educação; Divulgação Científica e bionegócios; 2023; Orientação de outra natureza; (Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Pró-Reitoria de Pesquisa da UFMG; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Caracterização de inibidores da protease NS2B/Ns3 do vírus Zika - IC Júnior; 2023; Orientação de outra natureza; (COLTEC) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Estágio - Curso técnico em Química; 2023; Orientação de outra natureza; (COLTEC) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Estágio de graduação; 2023; Orientação de outra natureza; (Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Seleção de potenciais inibidores da enzima tripanotiona redutase por triagem virtual; 2011; Orientação de outra natureza; (COLTEC) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Rafaela Salgado Ferreira;
Produções bibliográficas
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FERREIRA, R. S. . Planejamento de fármacos para tratamento de doenças negligenciadas.. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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RIBEIRO, B. M. R. M. ; DIAS, MARCIO VINICIUS BERTACINE ; FERREIRA, R. S. . Desenvolvimento e Validação de Protocolo de Docking para a Dihidrofolato Redutase de M. tuberculosis quanto às interações intermoleculares. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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VILAR, L. C. ; COSTA, M. G. S. ; Ferreira, R. S. . Identificação e Caracterização de Sítios Alostéricos e Crípticos e Descoberta de Potenciais Inibidores Seletivos para SRPK2. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOURENCO, E. M. G. ; RICCI, M. ; MACHADO, FABIANA S. ; Ferreira, R. S. . Busca de Alvos Antiparasitários do Fármaco Zileuton por Triagem Virtual Invertida Baseada em Ligante. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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PASSOS, A. M. V. L. ; DINIZ, L. A. ; LOURENCO, E. M. G. ; Ferreira, R. S. . Estudos de Interações Proteína-Ligante de Subtipos de Cruzipaínas com Inibidores de Cruzaína. 2024. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Ferreira, Rafaela S. . A cruzaína como alvo para a doença de Chagas: descoberta de inibidores e caracterização de subtipos de cruzaína. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Da medicina a moda: Aplicações da Biotecnologia no Cotidiano. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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CAMPOS, A. C. B. ; SANTOS, L. H. ; SANTOS, V. C. ; Ferreira, R. S. . STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF THE FOUR TRYPANOSOMA CRUZI CRUZIPAINS SUBTYPES AIDED BY COMPUTATIONAL TECHNIQUES. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Ferreira, R. S. . From genomics to molecular modeling: discovery and structural characterization of four Trypanosoma cruzi cruzipains subtypes. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Ferreira, R. S. . Docking e planejamento de fármacos. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, Rafaela S. . Bioinformática estrutural na descoberta de fármacos e caracterização de alvos terapêuticos. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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MOREIRA, T. V. ; MARTINS, L. C. ; DINIZ, LUCAS ABREU ; BERNARDES, TALITA CRISTINA DINIZ ; OLIVEIRA, R. B. ; FERREIRA, R. S. . Triagem da Pathogen Box para descoberta e caracterização de novos inibidores para cruzaína e TbrCatL?. 2023. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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LOURENCO, J. A. ; FERREIRA, R. S. . Validação de protocolo de docking molecular para triagem virtual de possíveis inibidores da SRPK-2. 2023. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R. S. . Aplicação de cálculos de variação de energia livre baseados em dinâmicas moleculares na descoberta de fármacos. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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GINI, A. L. R. ; DINIZ, L. A. ; CUNHA, P. S. T. ; LOPES, J. R. ; PROKOPCZYK, I. M. ; SANTOS, J. L. ; Ferreira, R. S. ; SCARIM, C. B. . Novos derivados de hidrazonas como inibidores de cruzaína para o tratamento da doença de Chagas. 2023. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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DINIZ, L. A. ; MOREIRA, T. V. ; MARTINS, L. C. ; BERNARDES, T. C. D. ; OLIVEIRA, R. B. ; Ferreira, R. S. . DISCOVERY AND CHARACTERIZATION OF PROMISING CRUZAIN INHIBITORS THROUGH PATHOGEN BOX SCREENING. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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DINIZ, L. A. ; MARTINS, L. C. ; BERNARDES, T. C. D. ; MOREIRA, T. V. ; OLIVEIRA, R. B. ; Ferreira, R. S. . DESCOBERTA E CARACTERIZAÇÃO DE INIBIDORES DA CRUZAÍNA POR TRIAGEM EXPERIMENTAL DA BIBLIOTECA PATHOGEN BOX. 2023. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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RIBEIRO, B. M. R. M. ; SANTOS, L. H. ; FERREIRA, R.S. . Development of a docking protocol against NS2B-NS3 pro ZIKA VIRUS. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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RIBEIRO, B. M. R. M. ; DIAS, R. ; REZENDE JR, C. O. ; Ferreira, R. S. . Biochemical Characterization of potential Zika virus NS2B-NS3pro inhibitors. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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BARRETO, LUIZA V. ; MARTINS, L. C. ; SOUZA, M. L. ; FERREIRA, R.S. . DESIGNING SARS-COV-2 VIRUS MAJOR PROTEASE (MPRO) ALLOSTERIC INHIBITORS AS POTENTIAL TREATMENTS FOR COVID-19. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Ferreira, R. S. . Abordagens de planejamento racional de fármacos para doenças negligenciadas e emergentes. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Cruzipains as a target for Chagas disease: inhibitor discovery and characterization of subtypes. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Biological assays and target validation in medicinal chemistry. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Bioinformática estrutural no planejamento de fármacos. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Projetos e Negócios em Biologia Sintética. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Do sonho à realidade: como se tornar um cientista?. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . From target validation to inhibitor discovery and optimization: Molecular modeling in drug discovery targeting cruzain. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Planejamento de Fármacos Baseado em Estrutura. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Bioinformática e Modelagem Computacional de Fármacos. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R.S. . De doença de Chagas a COVID-19: planejamento de inibidores de proteases para desenvolvimento de fármacos. 2021. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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Ferreira, R. S. . Rational development of protease inhibitors for the treatment of neglected and emerging diseases. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Rational design of Mpro inhibitors to treat COVID-19. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SANTOS, V. C. ; Kolb, Peter ; Ferreira, R. S. . Discovery and optimization of cruzain inhibitors using docking and virtual screening. 2020. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FASSIO, A. V. ; SANTOS, L. H. ; SILVEIRA, S. A. ; FERREIRA, R. S. ; MINARDI, R. C. M. . nAPOLI: a graph-based strategy to detect and visualize conserved protein-ligand interactions in large-scale. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. . Inibidores de cisteíno proteases para o tratamento de tripanossomíases. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Planejamento racional de inibidores de proteases para tratamento de doenças negligenciadas. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Inibidores de proteases para tratamento de doenças negligenciadas. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, R. S. . Rational design of cysteine protease inhibitors to develop drugs for neglected diseases. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R.S. . Discovery, Characterization and Computer-Aided Optimization of New Classes of Cruzain and Rhodesain Inhibitors Among Malaria Box Compounds. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. . Planejamento racional de fármacos para doenças negligenciadas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, R. S. . Triagem Virtual no Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R.S. ; BLEICHER, L. ; MINARDI, R. C. M. ; SILVA, M. L. . Novel computational methods for protein characterization. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R.S. . Application of Informatics Approaches in Drug Design. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R.S. ; VILELA, L. F. F. . Desenvolvimento de Projetos em Biologia Sintética: Estimulando a independência, criatividade e o empreendedorismo em alunos de graduação. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R. S. . Descoberta e Otimização de Inibidores das Enzimas Cruzaína e Rodesaína. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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Ferreira, R. S. . Rational Drug Design for Neglected Diseases. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, R. S. . Triagem virtual: uma abordagem racional para descoberta de moléculas bioativas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, R. S. . Contribution of universities - Rational development of cruzain and rhodesain inhibitors. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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Ferreira, R. S. . Protein crystallography as an important basis for structure-based drug design: applications to neglected diseases. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R. S. . Desenvolvimento Racional de Inibidores de Cisteino-Proteases Parasitárias para Tratamento de Doenças Negligenciadas. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. . Triagem Virtual. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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FERREIRA, R. S. ; DESSOY, M. A. ; PAULI, I. ; SOUZA, M. L. ; KROGH, R. ; SALES, ANA I. L. ; Oliva, Glaucius ; DIAS, L. C. ; ANDRICOPULO, A. D. . Synthesis, Biological Evaluation and Structure-Activity Relationships of Potent Noncovalent and Nonpeptidic Cruzain Inhibitors as Anti-Trypanosoma cruzi Agents. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. . Triagem Virtual em Larga Escala. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Ferreira, R. S. . Discovery of Cruzain and Rhodesain Small Molecule Inhibitors Through Experimental Screening. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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POVOA, F. D. ; BLEICHER, L. ; FERREIRA JUNIOR, J. R. S. ; FERREIRA, R. S. . Analysis of the interaction between Coq10 protein and Q6 coenzyme through comparative modelling and docking studies. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R. S. . Bases teóricas e aplicações de docking. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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FERREIRA, R. S. ; REBELLO, K. . Overview of Protease Assays. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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VILLELA, F. S. ; BRAGA, S. F. P. ; FONSECA, N. C. ; CAFFREY, C. ; OLIVEIRA, R. B. ; FERREIRA, R. S. . Discovery of low micromolar noncompetitive inhibitors of the enzyme rhodesain. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; FERREIRA, L. L. G. ; ANDRICOPULO, A. D. . Development of a structure-based virtual screening strategy for new inhibitors for Trypanosoma brucei aldolase. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; Simeonov, A. ; Jadhav, A. ; Irwin, John J ; AUSTIN, C.P. ; MCKERROW, JH ; Shoichet, B. K. . Successes and failures in using virtual screening to predict the results of a high- throughput screen against cruzain. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; Simeonov, A. ; Jadhav, A. ; Irwin, John J ; AUSTIN, C.P. ; INGLESE, J. ; MCKERROW, JH . Successes and failures in using virtual screening to predict the results of a high- throughput screen against cruzain. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; Simeonov, A. ; Irwin, John J ; Jadhav, A. ; AUSTIN, C.P. ; INGLESE, J. ; MCKERROW, JH ; Shoichet, B. K. . Parallel DOCK and high-throughput screening against cruzain. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; Simeonov, A. ; Jadhav, A. ; Irwin, John J ; AUSTIN, C.P. ; INGLESE, J. ; MCKERROW, JH ; Shoichet, B. K. . A study on cruzain: Can virtual screening predict the results of high-throughput screening?. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; GRAVES, A. P. ; Shoichet, B. K. ; MCKERROW, JH . Docking based discovery of noncovalent cruzain inhibitors. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; OLIVEIRA, R. B. ; ZANI, C. L. ; SILVA, T. H. A. . Estudos de superposição molecular de acetamidofenilfuranos com a tripanotiona redutase. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; ZANI, C. L. ; SILVA, T. H. A. ; OLIVEIRA, R. B. . Síntese de potenciais inibidores da tripanotiona redutase para tratamento da doença de Chagas. 2005. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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FERREIRA, R. S. ; MASSARA, C. L. . Estudo in vitro da ação do tiabendazol sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 2000. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; MASSARA, C. L. . Estudo in vitro da ação do tiabendazol sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 2000. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. S. ; MASSARA, C. L. ; DINIZ, M. C. P. . Estudo in vitro da ação do tiabendazole sobre a viabilidade dos ovos de Ascaris lumbricoides. 1999. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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FERREIRA, R. S. ; EIDAM, O. ; SHOICHET, B. K. . Cruzain in complex with a non-covalent ligand 2010 (Depósito de estrutura protéica no banco de dados Protein Data Bank).
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FERREIRA, R. S. ; MCKERROW, J. H. ; SHOICHET, B. K. . Crystal structure of cruzain covalently bound to a purine nitrile 2009 (Depósito de estrutura protéica no banco de dados Protein Data Bank).
Outras produções
MORAIS, S. ; FIGUEIREDO, B. ; ASSIS, N. ; ALVARENGA, D. ; MAGALHAES, M. ; FERREIRA, R. S. ; VIEIRA, ANGÉLICA T. ; MENEZES, G. ; OLIVEIRA, SERGIO C. . Grupo da UFMG descobre ação anti-inflamatória em proteína do 'Schistosoma'. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R.S. . Saiba quem são os mineiros do ano 2017. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Atrás da grande descoberta. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Mineira vence prêmio que estimula presença de mulheres na ciência. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R.S. . Pesquisadora brasileira ganha prêmio internacional com pesquisa sobre Zika e Doença de Chagas. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Podcast'A indústria farmacêutica foca nas populações mais ricas', denuncia brasileira premiada pela Unesco. 2018. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
FERREIRA, R. S. . Brasileira ganha prêmio internacional que incentiva mulheres cientistas. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Industria farmacéutica elude países pobres, dice científica brasileña. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . A cientista brasileira premiada por pesquisar doenças negligenciadas pela indústria farmacêutica. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Mineira ganha prêmio internacional por pesquisa sobre zika e Chagas. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Ouro de Minas: Rafaela Ferreira. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . ?Precisamos de mais apoio?, diz cientista premiada pela Unesco sobre pesquisas brasileiras. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Brasileira ganha prêmio internacional por pesquisa sobre zika e Chagas. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R.S. . Equipe da UFMG busca verba para participar de competição de máquinas nos EUA. 2017. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Pesquisadoras da UFMG vencem prêmio para mulheres na ciência. 2017. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Prêmio ?Para Mulheres na Ciência 2017? reconhece o trabalho de sete pesquisadoras brasileiras. 2017. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . ?Leishmania? modificada por grupo da UFMG é alternativa para tratamento de doenças inflamatórias; pesquisa participa de competição nos EUA. 2015. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. . Jovens pesquisadores da UFMG conquistam prêmio internacional. 2015. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R.S. . UFMG conquista prêmio internacional de ciência e educação. 2015. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA, R. S. ; BORGES, W. S. . Busca e identificação de candidatos a fármacos a partir de produtos naturais e sintéticos. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Ferreira, R. S. . Aplicação das técnicas de docking molecular e triagem virtual de bases de dados para planejamento racional de fármacos. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
FERREIRA, R. S. . Docking Molecular e Planejamento Racional de Fármacos. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2023 - 2024
Estudo da expressão de subtipos de cruzipaínas do Trypanosoma cruzi e de sua afinidade por inibidores, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / renata b. de oliveira - Integrante / Santuza Maria Ribeiro Teixeira - Integrante / viviane correa santos - Integrante / MACHADO, FABIANA S. - Integrante / Ana Paula C. A. Lima - Integrante / BERNARDES, TALITA CRISTINA DINIZ - Integrante / Marcella Nunes de Melo Braga - Integrante / Rayane Aparecida Nonato Rabelo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2
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2022 - 2024
Caracterização de perfil de substratos e da importância biológica de subtipos de cruzipaínas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Jair Siqueira-Neto - Integrante / viviane correa santos - Integrante / O'Donoghue, Anthony J. - Integrante / Ana Paula C. A. Lima - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
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2022 - Atual
DESENVOLVIMENTO DE NOVOS AGENTES ANTIPARASITÁRIOS PARA TRATAMENTO DAS LEISHMANIOSES E DOENÇA DE CHAGAS, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Silvane Murta - Integrante / Renata Barbosa Oliveira - Integrante / celso O Rezende Jr - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
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2021 - Atual
Desenvolvimento de fármacos baseado na estrutura: produção e caracterização da estrutura tridimensional de potenciais alvos moleculares em complexo com candidatos a fármacos contra a covid-19 e contra bactérias multirresistentes, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / renata b. de oliveira - Integrante / Ronaldo A P Nagem - Integrante / Débora Maria Abrantes Costa - Coordenador / Vinícius Gonçalves Maltarollo - Integrante / Augusto Cesar Ribeiro da Silva - Integrante / Eduardo Melos Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
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2020 - 2022
Aplicação de cálculos de variação de energia livre baseados em dinâmicas moleculares na descoberta de fármacos, Descrição: O objetivo principal do presente projeto é propor novos inibidores competitivos para os principais alvos de doenças negligenciadas como a Doença de Chagas (Cruzaína), Zika (NS3), e Doença do Sono (Rodesaína), utilizando abordagens in silico de bioinformática estrutural e biologia computacional. Com essas abordagens estimativas de afinidade de dezenas de moléculas no âmbito de uma campanha de otimização de um ou um pequeno grupo de protótipos serão obtidas. As seguintes etapas serão realizadas: (i) quantificar o processo de ligação de pequenos sistemas de um receptor biológico e uma pequena molécula orgânica, perfazendo um total da ordem de 50.000 partículas, para dezenas de moléculas selecionadas através da técnica de adaptative biasing force; (ii) propor modificações estruturais nos compostos com similaridade aos compostos líderes mais promissores, criando possíveis análogos otimizados da série; (iii) Avaliar a diferença de afinidade entre os compostos gerados a partir de cálculo de perturbação de energia livre, de forma a priorizar entre os análogos para avaliação experimental.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Lucianna Helene dos Santos - Integrante.
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2017 - 2018
Desenvolvimento racional de inibidores de proteases para tratamento de doenças negligenciadas, Descrição: Neste projeto visamos a obtenção de compostos para tratamento das doenças de Chagas e Zika, enfermidades negligenciadas para as quais há urgente necessidade de desenvolvimento de novas terapias. Para tanto, propõe-se estratégias baseada em alvos moleculares essenciais para os agentes etiológicos: as proteases cruzaína, de Trypanosoma cruzi, e NS2B-NS3 do vírus Zika (NS2B-NS3ZV). Desta forma, o objetivo geral da proposta é a otimização de inibidores enzimáticos quanto a sua potência contra a enzimas e atividade em modelos celulares, através de uma abordagem moderna de química medicinal e computacional, o planejamento racional de fármacos baseado na estrutura das proteínas-alvo. Serão empregados como pontos de partida inibidores de cruzaína recentemente descobertos em nosso grupo de pesquisa e inibidores de NS2B-NS3ZV ou de outras proteases homólogas de outros flavivírus, já descritas na literatura. No caso da enzima cruzaína, os inibidores competitivos Amb7 (IC50 = 3 µM) e Amb12 (IC50 = 27 µM) foram selecionados para otimização e desenvolvimento de potenciais candidatos a fármacos. A partir da avaliação de construídas bibliotecas virtuais de análogos destes compostos, empregando a técnica de docking molecular e estruturas cristalográficas da proteína, serão selecionados compostos para síntese e posterior avaliação em ensaios bioquímicos contra a enzima. Com o objetivo de priorizar inibidores seletivos, possivelmente mais seguros para eventual aplicação na clínica, será determinada a potência contra dos compostos também contra as catepsinas humanas L e B. Finalmente, será determinada da potência dos inibidores de cruzaína contra o parasito T. cruzi. O desenvolvimento de inibidores da enzima NS2B-NS3ZV também será realizado de forma racional, empregando a estrutura cristalográfica recentemente determinada para um complexo desta proteína com um inibidor. Para planejamento dos novos inibidores serão também consideradas informações sobre outros já descritos, e de centenas inibidores de enzimas homólogas dos vírus dengue e West Nile. A partir de docking molecular destes compostos e de outros análogos comercialmente disponíveis, serão selecionados os compostos para posterior avaliação contra a enzima. Os inibidores identificados serão também avaliados em neurônios infectados pelo Zika vírus. A partir da abordagem proposta espera-se determinar a relação estrutura-atividade para os compostos Amb7 e Amb12 e obter análogos potentes contra a cruzaína (IC50 idealmente submicromolar) e atividade contra o parasito T. cruzi. Há perspectiva de continuidade do trabalho através de avaliação da atividade em modelos animais de doença de Chagas, além de determinação de outras características relevantes para o desenvolvimento de fármacos, como perfil farmacocinético. A identificação de inibidores de NS2B-NS3ZV capazes de inibir replicação viral contribuirá para validação deste alvo, além de fornecer pontos de partida para futuros esforços de otimização. Assim, moléculas descobertas e caracterizadas no decorrer deste projeto poderão ser otimizadas para emprego na clínica contra duas doenças relevantes no atual contexto brasileiro e mundial.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador., Financiador(es): LOreal Brasil Comercial de Cosmeticos - Auxílio financeiro.
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2016 - 2020
Otimização de inibidores de cisteíno proteases para desenvolvimento de candidatos a fármacos para a Doença de Chagas e doença do sono, Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono africana são doenças tropicais negligenciadas, para as quais há necessidade urgente de fármacos com maior eficácia e menor toxicidade. Para tanto, uma estratégia promissora é a identificação de inibidores de proteínas essenciais para o parasito. Neste contexto, as cisteíno-proteases são alvos validados, dado sua importância biológica em diversos processos durante o ciclo de vida parasitário. A enzima cruzaína, principal cisteíno-protease do Trypanosoma cruzi, está entre os alvos terapêuticos mais estudados para a doença de Chagas. Similarmente, a enzima rodesaína, do parasito Trypanosoma brucei, constitui um alvo validado para a doença do sono, sendo essencial para o parasito e importante para a penetração da barreira hematoencefálica. Além de importância biológica destas proteínas, a determinação de estruturas cristalográficas destas em complexo com inibidores forneceu bases para estratégias modernas de planejamento racional de novas moléculas. Finalmente, devido a alta similaridade entre as enzimas cruzaína e rodesaína, comumente inibidores são capazes de inibir ambas, permitindo uma estratégia altamente atrativa de planejamento de fármacos simultaneamente efetivos contra duas doenças. Recentemente avaliamos o conjunto de 400 compostos Malaria box, disponibilizado pela organização Medicines for Malaria Venture, contra as enzimas cruzaína e rodesaína. Dentre os compostos avaliados, 74 causaram pelo menos 50% de inibição de pelo menos uma das enzimas, sendo identificados 52 inibidores de cruzaína e 55 de rodesaína, entre os quais 38 são inibidores de ambas proteínas. Observou-se também que a maioria destas moléculas apresentou atividade inibitória apenas caso fosse pré-incubadasm com a enzima, como é característico de inibidores que se ligam covalentemente a proteínas. No entanto, foram identificados ainda 19 inibidores capazes de inibir estas enzimas mesmo na ausência de incubação, como esperado para inibidores competitivos reversíveis. A partir destes resultados foram selecionadas 15 moléculas para caracterização detalhada, incluindo determinação de sua potência contra cada enzima e o modo de inibição enzimático. Os ensaios confirmatórios incluíram confirmação da atividade inibitória a 10 µM, determinação de IC50, determinação de mecanismo de inibição e ensaios para verificação de agregação, com avaliação da atividade inibitória em diversas concentrações do detergente Triton X-100 e após pré-incubação com albumina bovina. Desta forma foram validados dois inibidores competitivos de cruzaína, Amb7 e Amb12, que foram selecionados como pontos de partida para otimização e desenvolvimento de potenciais candidatos a fármacos. O presente projeto se direciona a este objetivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
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2014 - 2017
DETERMINAÇÃO DA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DA CISTEÍNO-PROTEASE CPB DE LEISHMANIA BRAZILIENSIS E DESENVOLVIMENTO DE INIBIDORES ENZIMÁTICOS COMO CANDIDATOS A FÁRMACOS PARA TRATAMENTO DE LEISHMANIOSE, Descrição: A leishmaniose é uma doença negligenciada endêmica principalmente nas Américas, na Ásia e na África. No período de 2007 a 2012 foram reportados cerca de 300.000 casos de leismaniose visceral e 1 milhão de casos da forma cutânea da doença. O tratamento atual é baseado em antimoniais pentavalentes, como o estibogluconato de sódio (Pentostan) e o antimoniato de N-metil glucamina (Glucantime), e a segunda escolha de tratamento são os fármacos pentamidina e a anfotericina B que, além de serem tóxicas, são de difícil administração. Outros compostos vêm sendo estudados quanto à sua atividade leishmanicida, porém ainda não se tem um fármaco que apresente um bom índice terapêutico e uma baixa toxicidade. Assim, a procura de novos compostos com maior eficácia contra as Leishmania spp e de baixa toxicidade para as células de mamífero, é necessária. Tendo em vista a necessidade de novos medicamentos para a leishmaniose, propõe-se neste projeto o desenvolvimento de inibidores de cisteíno protease B (CPB) de Leishmania (Viannia) braziliensis. As cisteíno proteases parasitárias são importantes para diversas funções essenciais no ciclo de vida dos parasitos, como nutrição, evasão da resposta imune do hospedeiro, infecção de células e diferenciação dos parasitos. Dezenas de cisteíno proteases foram identificadas em leishmania, sendo a CPB a protease mais estudada. As proteases CPA e CPB são essenciais para autofagia e para diferenciação para amastigotas, e mutantes que não expressam estas enzimas são caracterizados por perda de virulência e redução da infecção em macrófagos e em camundongos. CPB é uma protease do Clan A, família C1 e do tipo semelhante a catepsina L, assim como as enzimas cruzaína e rodesaína, de T. cruzi e T. brucei. Diversas isoformas desta enzima estão presentes em Leishmania (19 isoformas em L. mexicana e 8 em L. major), organizadas em tandem. A expressão desta proteína está relacionada a imunomodulação, envolvendo síntese de IL-4, desenvolvimento da resposta Th2 e inibição de resposta Th1. CPB está envolvida ainda na degradação do fator de transcrição NF-κB, suprimindo a expressão de IL-12. Inibidores de CPB vem sendo propostos através de avaliação de produtos naturais e de triagem experimental em larga escala (high-throughput screening - HTS), empregando biblioteca de compostos de alta diversidade química. Estudos recentes nesta área fornecem importantes informações sobre a enzima CPB como alvo terapêutico. Em primeiro lugar, esta é uma proteína que apresenta alta drogabilidade, ou seja, há alto potencial de modulação por pequenas moléculas com características de fármacos. Além disso, a possibilidade de desenvolvimento de inibidores seletivos para enzimas parasitárias é importante para evitar toxicidade de medicamentos que atuem por inibição de CPB. Finalmente, este estudo ilustra o potencial de descoberta de inibidores de CPB a partir da avaliação de inibidores de enzimas homólogas. Associado a importância biológica da CPB, estas informações motivam a proposta de caracterização estrutural e de desenvolvimento de inibidores desta enzima, proposta neste projeto. Para tanto, propõe-se o emprego de técnicas de biologia estrutural, triagem de inibidores de cisteíno-proteases e parasitologia. Através do emprego da técnica de cristalografia, pretende-se determinar a estrutura tridimensional desta enzima, permitindo a futura aplicação de técnicas de planejamento racional de fármacos, como docking molecular e dinâmica molecular. A triagem experimental de inibidores de cisteíno-proteases, por enzimologia, e a subsequente avaliação da atividade anti-parasitária dos compostos, permitirão a descoberta e caracterização de compostos que posteriormente podem ser otimizados para o desenvolvimento de fármacos para tratamento de leishmaniose.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (5) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / renata b. de oliveira - Integrante / ana cristina lima leite - Integrante / Ronaldo A P Nagem - Integrante / carlos roberto alves - Integrante / Saulo Fernandes de Andrade - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2014 - 2016
Descoberta E Planejamento Racional De Inibidores De Cisteíno- E Metaloproteases: Potenciais Candidatos A Fármacos Para Doenças Negligenciadas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Oliveira, Renata B. de - Integrante / lucas bleicher - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Ronaldo A P Nagem - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.
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2014 - 2015
Competição Internacional de Sistemas Biológicos Modificados ( iGEM) Desenvolvimento de uma bactéria detectora de múltiplos marcadores prognósticos de Doenças Cardiovasculares, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Coordenador / Clara Guerra Duarte - Integrante / Carlos Alberto Xavier Gonçalves - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
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2013 - 2020
Rede de Cooperação Acadêmica para o Estudo e Desenvolvimento de Ferramentas para a Genômica Estrutural e Funcional, Descrição: A UFMG e a USP têm tradicionalmente apoiado iniciativas inovadoras, incentivando áreas de vanguarda na pesquisa e promovendo a excelência em seus programas de Pós-graduação. Como parte desta política, entre os anos de 2002 e 2003, em resposta ao edital BIOMICRO induzido pela CAPES, ambas as Universidades criaram Programas de Doutorado em Bioinformática. Na UFMG, a iniciativa congregou os Departamentos de Bioquímica e Imunologia (DBI) e de Ciência da Computação (DCC) juntamente com cinco outros Departamentos pertencentes aos Institutos de Ciências Biológicas e de Ciências Exatas e Escola de Engenharia. O programa da UFMG está sediado no Instituto de Ciências Biológicas, que concentra o maior número de professores do curso. Na USP a iniciativa congregou 6 escolas: Instituto de Matemática e Estatística, Instituto de Química, Instituto de Biociências, Instituto de Ciências Biomédicas, Faculdade de Medicina Veterinária, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, e Instituto de Física de São Carlos. O programa da USP está sediado no Instituto de Matemática e Estatística. Até poucos anos atrás estes eram os dois únicos programas do gênero existentes no País. A relação entre os dois programas foi sempre de grande parceria e várias ações conjuntas foram tomadas sem um vínculo oficial. Por outro lado, entre o Programa de Bioinformática da UFMG e o programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular da UFPA existe uma parceria oficial desde 2008, com a aprovação do projeto Procad entre os Professores Vasco Azevedo e Artur Silva. Deste projeto já resultaram muitos benefícios com o compartilhamento de competências, tecnologias e infra-estruturas. Hoje o Professor Vasco Azevedo e Artur Silva são professores permanentes nos dois programas. Da iniciativa PROCAD UFMG UFPA formaram-se, em três turmas induzidas em bioinformática, 30 mestres e 10 doutores, sendo que 5 destes egressos atualmente são professores concursados na UFPA e atuam no ensino de graduação e pós-graduação em bioinformática para os cursos de Ciências Biológicas, Biotecnologia e Biomedicina. Nesta parceria houve um marco que deve ser destacado que foi o fato de sermos o maior depositário de genomas completos juntos ao NCBI na América Latina, através da Rede Paraense de Genômica e Proteômica. Graças ao apoio recebido através da CAPES Procad a UFPA estará submetendo a CAPES proposta de criação de um curso de Bioinformática em nível de pós-graduação, vinculado ao futuro Instituto de Biotecnologia. Esta proposta congregará professores dos Institutos de Ciências Biológicas, Exatas e da Saúde e será o primeiro programa desta natureza na Amazônia. Na UFPR, os primeiros passos relacionados à Bioinformática iniciaram no ano 2005 com a colaboração entre o Núcleo de Fixação de Nitrogênio (NFN) do Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular (Setor de Ciências Biológicas) e o curso de Tecnologia em Sistemas de Informação (TSI - Setor de Educação Profissional e Tecnológica - SEPT). O NFN coordena, desde 2008, o INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio e dispõe de infra-estrutura de ponta para geração de dados biológicos nas áreas de genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica. Os projetos desenvolvidos pelo PPG em Bioinformática da UFPR permitiram a aquisição de expertise na aplicação de técnicas de Inteligência Artificial (IA) para montagem, fechamento e anotação de genomas de procariotos. Desde então, técnicas para validação de montagens de genomas, de reconhecimento de padrões em biologia molecular tem sido aplicada com sucesso. Em 2012, os Programas de Bioinformática da UFMG e UFPR, liderados pelos docentes José Miguel Ortega (UFMG) e Emanuel Maltempi de Souza (UFPR), iniciaram uma parceria de trabalho fomentada pelo projeto Procad nas áreas de Genômica, Proteômica e Sistemas de Bioinformação (tecnologia Web Service). O projeto já viabilizou compartilhamento. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / lucas bleicher - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Miguel L Ortega - Integrante / Alan Mitchell Durham - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Maria Berenice Reynaud Steffens - Integrante.
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2013 - 2017
Rational development of cysteine and metalloprotease inhibitors as leads for neglected diseases drug development, Descrição: Despite the high prevalence of neglected diseases, there is very low investment from pharmaceutical companies in this field, and the need for new treatments is urgent. Therefore, there is interest in the discovery of inhibitors of proteins which are essential for the development of such diseases. In this project we propose to develop new inhibitors for key enzymes involved in Chagas disease, African sleeping sickness and in the toxic effects of snake venom bites. In all cases the currently available therapies are inadequate, presenting efficacy and toxicity problems. The targets chosen in this work are the cysteine proteases cruzain and rhodesain, targets for Chagas disease and African sleeping sickness, respectively, and the metalloproteases atroxlysin-I and leucurolysin-a, important toxins from snake venoms. These proteins have been chosen based on their validation as molecular targets and on the availability of structural information, which will be extremely helpful to allow rational drug design strategies. We propose to employ several computational techniques in the discovery and development of protease inhibitors, making the process more rational, efficient and cheaper than solely experimental approaches. Initially, to discover new classes of inhibitors, we will apply virtual screening of large compound databases. Then, the optimization of the compounds discovered will be guided by molecular dynamics simulations and free energy calculations. All hypothesis provided by computational experiments will be experimentally validated, with determination of the potency and mechanism of action of all inhibitors. The most promising compounds will also be co-crystalized with the respective enzymes, providing a solid basis for further rational development of more potent inhibitors. In the case of cruzain and rhodesain inhibitors, compounds will also be evaluated against the relevant parasites.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / klaus liedl - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
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2013 - 2014
Estudos de relação estrutura-atividade e modelagem molecular de uma série de tiosemicarbazonas contra as enzimas parasitárias rodesaína e cruzaína, Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono são classificadas como doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os poucos fármacos disponíveis para o seu tratamento apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. As cisteíno-proteases destacam-se entre os alvos identificados para diversas doenças parasitárias por desempenhar diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a otimização de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi e rodesaína de Trypanosoma brucei. A partir de um inibidor da rodesaína previamente identificado pelo nosso grupo, foi sintetizada uma série de análogos, que também foram avaliados contra esta enzima. Neste projeto propõe-se a avaliação destes compostos contra a cruzaína, em ensaios bioquímicos e por modelagem molecular. Estes estudos permitirão a identificação de novos inibidores de cruzaína, determinação de diferenças de relação estrutura-atividade (REA) para essas enzimas e estabelecimento das bases moleculares para as diferenças observadas. Os inibidores identificados serão também avaliados contra os parasitos T. cruzi e T. brucei, permitindo que sejam identificados compostos-líder para o desenvolvimento de novos fármacos. Valor concedido: R$ 7.000. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador.
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2012 - 2014
Planejamento Racional, Síntese e Avaliação da Atividade Tripanocida de Inibidores Potenciais da Tripanotiona Redutase: Base para o Desenvolvimento de Novos Fármacos para Tratamento da Doença de Chagas, Descrição: A busca de alvos que possam ser explorados no desenvolvimento de novos fármacos tripanocidas é de extrema importância em vista dos problemas relacionados à quimioterapia existente para o tratamento da doença de Chagas. A tripanotiona redutase (TR) é uma enzima fundamental para os tripanosomatídeos, pois mantém um ambiente redutor no interior do parasito, evitando, assim, a morte do mesmo por stress oxidativo. Além disso, a estrutura desta enzima apresenta diferenças significativas em relação à da glutationa redutase, enzima com função correspondente no homem. A diferença estrutural entre estas enzimas é importante, pois permite o planejamento de fármacos mais seletivos e, conseqüentemente, menos tóxicos. Estas características tornam a TR um alvo promissor para ser explorado e a busca de inibidores desta enzima é uma alternativa que merece ser estudada. Dando continuidade aos trabalhos de pesquisa desenvolvidos por nosso grupo na busca de novos agentes tripanocidas e inibidores da TR, objetivou-se no presente projeto, a síntese e avaliação biológica de novos inibidores potenciais da TR. A estrutura desses inibidores foi planejada utilizando-se diarilfuranos inibidores da TR como protótipos. Ensaios de inibição da enzima TR pelos compostos planejados e sintetizados nesse trabalho serão conduzidos in vitro. Em paralelo, serão realizados ensaios com enzima GR, para avaliação da seletividade dos compostos. Todos os compostos sintetizados também serão avaliados in vitro contra T. cruzi.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / renata b. de oliveira - Coordenador / thais h a silva - Integrante / Alvaro Jose Romanha - Integrante / Policarpo A. S. Júnior - Integrante / Saulo F. P. Braga - Integrante / Mario Steindel - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2012 - 2014
PLANEJAMENTO RACIONAL, SÍNTESE E AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE BIOLÓGICA DE INIBIDORES DAS ENZIMAS CRUZAÍNA E RODESAÍNA PARA DESENVOLVIMENTO DE CANDIDATOS A FÁRMACOS PARA TRATAMENTO DE TRIPANOSSOMÍASES, Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono são doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os fármacos disponíveis para o seu tratamento são escassos e apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. Dentre os alvos validados para diversas doenças parasitárias, destacam-se as cisteíno-proteases, que desempenham diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a descoberta de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi e rodesaína de Trypanosoma brucei. Para tanto propõe-se a otimização de um inibidor de cruzaína previamente descrito, através das técnicas de planejamento racional de fármacos e simplificação molecular, e o emprego de triagem experimental de bases de dados, possibilitando a descoberta de novas classes de inibidores. Os compostos desenvolvidos serão caracterizados quanto a sua potência e mecanismo de ação contra as enzimas, atividade antiparasitária, citotoxicidade e toxicidade aguda em camundongos. Deste modo, serão caracterizados quanto a diversas propriedades relevantes para o desenvolvimento de medicamento, fornecendo bases essenciais para a validação de novos candidatos a fármacos contra estas doenças.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Oliveira, Renata B. de - Integrante / ronaldo alves pinto nagem - Integrante / Filipe Silva Villela - Integrante / Saulo Fehelberg Pinho Braga - Integrante / Conor Caffrey - Integrante / Luana Faria da Cruz - Integrante / Pollyanne Lacerda Coelho - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2012 - 2014
Síntese e Avaliação da Atividade Esquistossomicida de Nitroaromáticos: Base para o Desenvolvimento de Novos Fármacos para Tratamento da Esquistossomose, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / renata b. de oliveira - Coordenador / Conor Caffrey - Integrante / elaine maria de souza fagundes - Integrante / Marcela Silva Lopes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2012 - 2013
APLICAÇÃO DE TRIAGEM EXPERIMENTAL,TRIAGEM VIRTUAL E PLANEJAMENTO RACIONAL DE FÁRMACOS PARA TRATAMENTO DE TRIPANOSSOMÍASES E ESQUISTOSSOMOSE: DESCOBERTA DE INIBIDORES DE CISTEÍNO-PROTEASES PARASITÁRIAS, Descrição: A doença de Chagas, a doença do sono e a esquistossomose são classificadas como doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os fármacos disponíveis para o seu tratamento são escassos e apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. Dentre os alvos identificados para diversas doenças parasitárias, destacam-se as cisteíno-proteases, que desempenham diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a descoberta de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi, rodesaína de Trypanosoma brucei e SmCB1 de Schistosoma mansoni. Para tanto propõe-se o emprego de triagem experimental e triagem virtual de bases de dados, seguida pela validação bioquímica dos compostos ativos. A seguir, a determinação do mecanismo de ação dos inibidores e de estruturas cristalográficas dos complexos enzima ? inibidor permite a otimização destes a partir do planejamento racional de fármacos.O presente projeto consiste em uma abordagem multidisciplinar, com o emprego de técnicas computacionais em conjunto com técnicas experimentais de bioquímica e biologia estrutural, além de incluir colaborações com grupos de parasitologia e síntese orgânica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador., Financiador(es): Universidade Federal de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Prêmios
2024
Prêmio Paulo Mascarello Bisch, por menção honrosa, ao doutorando Lucas Cecílio Vilar, XI Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos.
2024
Membro Afiliado da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciências.
2023
SBBq Poster Award, 52nd Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology (SBBq).
2022
Bolsa de Produtividade CNPq nivel PQ2 - Abordagens interdisciplinares para a caracterização de alvos terapêuticos, descoberta e otimização de inibidores de proteases como candidatos a fármacos para do, CNPq.
2022
Early Career Research Award - Medicinal Chemistry, Sociedade Brasileira de Química e 10th Brazilian Medicinal Chemistry Symposium.
2021
Prêmio "Mulheres Brasileiras na Química 2021", categoria Líder Emergente, Sociedade Brasileira de Química e American Chemical Society.
2018
Prêmio "International Rising Talents", L'Oréal-UNESCO For Women in Science.
2018
Honra ao Mérito concedida a Thales do Valle Moreira, pela apresentação do poster ?Investigação de inibidores da cruzaína e rodesaína por triagem virtual e experimental da Pathogens box?, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).
2018
Honra ao Mérito concedida a Elany Barbosa da Silva, pela apresentação do poster ?Otimização e avaliação biológica de uma classede inibidores competitivos das enzimas parasitárias cruzaína e rodesaína?, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).
2018
Honra ao Mérito concedida a Luan Carvalho Martins,pela apresentação do poster ?Investigation of the binding mode of a novel cruzain inhibitor by docking, molecular dynamics, ab initio and MM/PBSA, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).
2018
Indicação como um dos 12 ?Mineiros do Ano de 2017?, Revista Encontro.
2018
Bolsa de Produtividade CNPq nivel PQ2 - Descoberta e otimização de inibidores de proteases para desenvolvimento de candidatos a fármacos para tratamento de doenças negligenciadas - vigência 2018-2022, CNPq.
2017
Prêmio Para Mulheres na Ciência - Categoria Química, L?Oréal, Unesco e Academia Brasileira de Ciências.
2017
Prêmio de melhor poster para Raoni A. Souza, pelo trabalho ?Assessing the interactions between snake venom metalloproteinases and hydroxamate compounds inhibitors using molecular dynamics...", IV Escola brasileira de modelagem molecular.
2015
Melhor trabalho na categoria - Best Education and Public Engagement, Overgrad, na competição "International Genetically Engineered Machine (iGEM) 2015", International Genetically Engineered Machine (iGEM).
2015
Trabalho selecionado entre os cinco melhores na categoria Best Integrated Human Practices, Overgrad", competição "International Genetically Engineered Machine (iGEM) Competition 2015 - Giant Jamboree", International Genetically Engineered Machine (iGEM).
2015
Prêmio de melhor poster para Raoni A. Souza, pelo trabalho ?Molecular simulations of snake venom metalloproteinases complexed with broad-spectrum hydroxamate inhibitors?, 44a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.
2013
Prêmio de melhor poster para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Structural comparative modeling of a snake venoms metalloproteinases atroxlysin-I?, II Escola brasileira de modelagem molecular.
2013
Menção honrosa para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Identification of inhibitors of snake venom class P-I metalloproteases using molecular modeling techniques?, 9th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biolo.
2012
Global Health Travel Award - Congresso: Drug Discovery for Protozoan Parasites, Keystone Symposia.
2012
Menção honrosa para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Identification of snake venom class P-I metalloproteases inhibitors using molecular simulation and docking methodologies?, 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biolo.
2009
Poster selecionado - Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference, Gordon Research Conferences.
2009
Keystone Symposia Scholarship - Congresso: Drug Discovery for Protozoan Parasites, Keystone Symposia.
2008
CHIH Foundation Fellowship Award, School of Pharmacy, University of California San Francisco.
2005
Global Health Sciences Scholar, Global Health Program - University of California San Francisco.
2005
2o lugar de classificação, melhor rendimento semestral global dos formandos de Farmácia, Faculdade de Farmácia da UFMG.
2005
1o lugar na XIII Jornada de Iniciação Científica do Centro de Pesquisas René Rachou, Centro de Pesquisas René Rachou.
1999
Trabalho selecionado entre os melhores na VIII Semana de Iniciação Científica da UFMG, Universidade Federal de Minas Gerais.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia. , Av. Antônio Carlos, 6627, Pampulha, 31270901 - Belo Horizonte, MG - Brasil, Telefone: (31) 34093031
Experiência profissional
2011 - Atual
Universidade Federal de Minas GeraisVínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.
2001 - 2003
Universidade Federal de Minas GeraisVínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20
Atividades
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08/2017
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Ferramentas Químicas para Compreensão de Processos Biológicos
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08/2015
Ensino, Bioquímica e Imunologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bases Moleculares II- Bioquímica
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02/2014
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Projetos em Bioquímica
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03/2012
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução a Bioquímica e Biologia Molecular
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08/2011
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática Estrutural - 30 horas
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03/2013 - 12/2016
Ensino, Biomedicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia molecular - 30 horas
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08/2011 - 12/2016
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular - 30 horas
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08/2014 - 12/2015
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica de Proteínas
-
08/2012 - 12/2013
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Temas atuais em bioquímica e imunologia - 30 horas
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08/2011 - 12/2013
Ensino, Nutrição, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Nutricional - 45 h
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11/2012 - 11/2012
Ensino, Bioquímica e Imunologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bases II - Biologia molecular - modulo de proteômica
2005 - 2010
University Of California San FranciscoVínculo: Doutoranda, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.
2010 - 2011
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Bolsista de pós-doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Supervisor: Prof. Dr. Adriano Defini Andricopulo
Instituto de Física de São Carlos
Projeto: Descoberta e desenvolvimento de novos agentes quimioterápicos na terapia do câncer e de doençaa parasitárias negligenciadas
2004 - 2005
Centro de Pesquisas René Rachou /Fundação Oswaldo CruzVínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica PIBIC/CNPq, Carga horária: 20
1998 - 2001
Centro de Pesquisas René Rachou /Fundação Oswaldo CruzVínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário do Programa de Vocação Científica, Carga horária: 4
2003 - 2003
University of Texas at AustinVínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Estudante Iniciação Científica, Carga horária: 20
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Rafaela Salgado Ferreira e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
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