Vinicius Werneck Salazar

Mestre pelo Programa de Engenharia de Sistemas e Computação (COPPE/UFRJ). Bacharel em Ciências Biológicas pela UFSC com período sanduíche na University of Queensland (Austrália) pelo programa Ciência sem Fronteiras (CNPq). Instrutor certificado de programação e análise de dados na organização internacional The Carpentries. Já atuou como professor de programação e boas práticas de computação científica, tendo desenvolvido o CursoCCB - Curso de Computação Científica para Biólogos, que teve duas edições bem-sucedidas na UFSC. É instrutor de mergulho autônomo PADI, com experiência em mergulho científico, ensino de programação, bioinformática, genômica e microbiologia marinha. Possui mais de dois anos de efetiva experiência em atividades de pesquisa, desenvolvimento e inovação em biotecnologia marinha, incluindo estudos de óleo.

Informações coletadas do Lattes em 13/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação

2019 - 2021

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: BioProv: uma biblioteca para dados de proveniência em workflows de genômica comparativa,Ano de Obtenção: 2021
Marta Lima de Queirós Mattoso.Coorientador: Fabiano Lopes Thompson. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em Ciências Biológicas

2012 - 2018

Universidade Federal de Santa Catarina
Título: Ensino de Programação para Biólogos: Retornando os conhecimentos de um estudo empírico em oceanografia física
Orientador: Arnaldo D'Amaral Pereira Granja Russo
com Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Ensino Médio (2º grau)

2009 - 2011

Colégio Itacorubi

Formação complementar

2019 - 2019

Metagenômica e bioinformática de vírus. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

Ecologia Microbiana Marinha e Metagenômica. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.

2015 - 2015

Marine Ecology. (Carga horária: 108h). , The University of Queensland, UQ, Austrália.

2014 - 2015

Immunology, Parasitology & Marine Venoms. (Carga horária: 108h). , The University of Queensland, UQ, Austrália.

2014 - 2015

Tropical Marine Ecosystems. (Carga horária: 108h). , The University of Queensland, UQ, Austrália.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Participação em eventos

X-Meeting. Knowledge management in genomics - The role of data provenance. 2019. (Congresso).

IV SciPy Latin America. 2016. (Congresso).

VII Congresso Brasileiro de Oceanografia. Microbial community structure of a subtropical coastal lagoon (Lagoa da Conceição - Florianópolis/SC). 2016. (Congresso).

XII Python Brasil. 2016. (Congresso).

XIV Semana de Ensino, Pesquisa e Extensão - UFSC. Estande do projeto MAArE - Monitoramento Ambiental do Arvoredo e Entorno. 2015. (Feira).

Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia - CAEB. 2013. (Congresso).

Produções bibliográficas

  • SALAZAR, VINÍCIUS W. ; TSCHOEKE, DIOGO A. ; SWINGS, JEAN ; COSENZA, CARLOS A. ; MATTOSO, MARTA ; THOMPSON, CRISTIANE C. ; THOMPSON, FABIANO L. . A new genomic taxonomy system for the Synechococcus collective. Environmental Microbiology , v. 22, p. 4557-4570, 2020.

  • TSCHOEKE, DIOGO ; SALAZAR, VINICIUS W. ; VIDAL, LIVIA ; CAMPEÃO, MARIANA ; SWINGS, JEAN ; THOMPSON, FABIANO ; THOMPSON, CRISTIANE . Unlocking the Genomic Taxonomy of the Prochlorococcus Collective. MICROBIAL ECOLOGY , v. online, p. 1-13, 2020.

  • SCHUBERT, N. ; SALAZAR, V.W. ; RICH, W.A. ; VIVANCO BERCOVICH, M. ; ALMEIDA SAÁ, A.C. ; FADIGAS, S.D. ; SILVA, J. ; HORTA, P.A. . Rhodolith primary and carbonate production in a changing ocean: The interplay of warming and nutrients. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT , v. 676, p. 455-468, 2019.

  • SALAZAR, V.W. . Por que programar?. Pizza de Dados, https://pizzadedados.com/, 24 abr. 2019.

  • SALAZAR, V. W. . What is responsability in science?. Vini Salazar's blog.

  • SALAZAR, V.W. ; OCANA, K. ; THOMPSON, F. L. ; MATTOSO, M. . Knowledge Management in Genomics: The Role of Data Provenance. In: X-Meeting, 2019, Campos do Jordão. X-Meeting 2019 Proceedings, 2019.

  • REICHMANN, H. B. ; FERST, L. M. ; SALAZAR, V.W. ; GIACHERO, M. . Estabelecendo um modelo de generalização comportamental com capacidades preditivas através de análise de redes. In: Encontro Anual de Etologia, 2018, Ouro Preto. Anais do XXXVI Encontro Anual de Etologia, 2018.

  • SALAZAR, V.W. ; FONTES, M. L. ; AIRES, L. R. ; FREITAS, F. ; BOZZETTO, J. G. . Microbial community structure in sediments from a subtropical coastal lagoon (Lagoa da Conceição - Florianópolis/SC). 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Neocrawler. 2018.

SALAZAR, V.W. ; COSTA, S. N. O. ; MAGALHAES, L. P. ; SILVA, J. C. . Ponto.Consciência. 2019; Tema: Uma plataforma para Iniciação Científica para Educação a Distância. (Blog).

SALAZAR, V.W. . Vini Salazar's blog. 2018; Tema: This is my personal blog and also my english writing practice safe space.. (Blog).

SALAZAR, V.W. ; RUSSO, A. A. P. G. . CursoCCB - computação científica para biólogos. 2018. .

SALAZAR, V. W. ; RUSSO, A. A. P. G. . CursoCCB - Curso de Computação Científica para Biólogos. 2018. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Material didático).

Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Taxonomia genômica de picocianobactérias, Descrição: Análises em larga escala de genoma completo de picocianobactérias do gênero Prochlorococcus e Synechococcus para determinação taxonômica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Vinícius Werneck Salazar - Integrante / Fabiano Lopes Thompson - Coordenador.

  • 2017 - Atual

    Variação espacial e temporal na coluna d'água estuário da Lagoa de Santo Antônio (Laguna - SC), Descrição: O complexo lagunar centro-sul catarinense (CLSC) é um sistema estuarino de vital importância para o Estado de Santa Catarina. O principal componente do CLSC, comumente chamado de ?laguna?, é composto pelas Lagoas do Mirim, do Imaruí e de Santo Antônio; essa última destaca-se por conectar a ?laguna? ao oceano adjacente através de um estreito canal, e por abrigar a foz do Rio Tubarão. Por ser um elemento de alta importância socioeconômica, a Lagoa de Santo Antônio requer efetivo gerenciamento ambiental, que deve ser feito de planejado com uma estratégia compreensiva e multidisciplinar; embora estudos prévios tenham descrito amplamente aspectos geomorfológicos, sedimentológicos e arqueológicos desse ecossistema, ainda existem lacunas principalmente em relação à características oceanográficas do estuário, que podem influenciar os fenômenos biológicos, e, por consequência, os serviços ecossistêmicos. Foi realizado o primeiro estudo sazonal e espacial da composição da coluna d?água da Lagoa de Santo Antônio, amostrando profundidade, condutividade, temperatura e clorofila a na água em vinte diferentes estações amostrais. Quatro saídas embarcadas foram realizadas, respectivamente nos meses de janeiro, maio, julho e outubro de 2017, buscando uma representação da variação sazonal, com lançamento de um instrumento perfilador CTD e coleta de água de superfície (para análise de clorofila a) em cada estação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Vinícius Werneck Salazar - Integrante / Arnaldo Amaral Pereira Granja Russo - Coordenador.

  • 2016 - 2018

    O efeito das mudanças climáticas sobre os mecanismos de concentração de carbono em macroalgas marinhas, Descrição: Muitos ecossistemas bentônicos marinhos estão atualmente ameaçados pelas pressões globais (como a acidificação e o aquecimento dos oceanos). Entre estes, os ecossistemas formados pelos rodolitos, que, no Brasil, são de grande importância ecológica e econômica. Portanto, é vital ter uma melhor compreensão da sua fisiologia, assim como diferenças entre espécies que podem resultar em diferenças em suas tolerâncias e respostas às variações ambientais ocasionadas pelas mudanças climáticas, e que por sua vez irão determinar a composição e distribuição da população. Por isso, o presente trabalho estudou, detalhadamente e em uma primeira abordagem, os mecanismos fisiológicos chave e possíveis diferenças que se relacionam com as respostas das espécies de rodolitos mais dominantes no banco de rodolitos mais meridional do Brasil, localizado na Reserva Biológica Marinha do Arvoredo. Os resultados mostram que existem diferenças específicas para cada espécie entre os rodolitos, e que definem os seus aportes na produtividade e produção do carbonato de cálcio no banco de rodolitos. Também, os ensaios com inibidores de vias metabólicas (relacionadas ao metabolismo do bicarbonato) mostram que as espécies diferem no que trata da importância da relação entre fotossíntese e calcificação, assim como no papel de certos mecanismos de concentração do carbono. Isso indica que suas respostas às mudanças ambientais podem ser potencialmente diferentes, o que implicaria em efeitos na comunidade do banco de rodólitos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Vinícius Werneck Salazar - Coordenador / Nadine Schubert - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

  • 2015 - 2017

    Determinação de diversidade filogenética em zonas mortas com ênfase na identificação de bactérias produtoras de hidrogênio, Descrição: Projeto de pesquisa envolvendo análise do gene 16S de amostras ambientais de sedimento da Lagoa da Conceição, visando investigação da comunidade microbiana local e bioprospecção de cepas produtoras de biohidrogênio.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Vinícius Werneck Salazar - Integrante / Maria Luiza Schmitz Fontes - Coordenador / Luan Renato Aires - Integrante / Fernando de Freitas - Integrante / Juana Gerevini Bozzetto - Integrante / Regina Vasconcellos Antonio - Integrante.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Federal do Rio de Janeiro. , AC Ilha do Fundão, Cidade Universitária, 21941972 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (48) 39383545

Experiência profissional

2019 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2017 - Atual

Universidade do Estado de Santa Catarina

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2016 - 2018

Universidade Federal de Santa Catarina

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de iniciação científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Bolsista CNPq de Iniciação Científica no Laboratório de Ficologia (LAFIC - BOT - CCB - UFSC), sob orientação da Dra. Nadine Schubert. Projeto: O efeito das mudanças climáticas sobre os mecanismos de concentração de carbono em macroalgas marinhas.

2012 - 2013

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de iniciação científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Bolsista CAPES pelo Programa Jovens Talentos da Ciência. Trabalhou no Laboratório de Genética do Comportamento (BEG - UFSC) sob supervisão do prof. Geison Souza Izídio.

2018 - 2019

Neoprospecta Pesquisa e Consultoria

Vínculo: MEI, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Bioinformata na empresa Neoprospecta Microbiome Technologies. Análise microbiológica através de genes marcadores (16S e ITS). Desenvolvimento de software bioinformático utilizando Python.