Willian Klassen de Oliveira

Formado em Biotecnologia (Bacharelado) pela PUCPR(2012-2015), Mestre em Bioinformática pela UFPR(04/2016-02/2018) e Doutor pelo programa de pós graduação em Biociências e Biotecnologia no Instituto Carlos Chagas - Fiocruz / PR. Possui experiência em projetos envolvendo microbiomas, genômica comparativa e RNA-seq.

Informações coletadas do Lattes em 29/12/2023

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biociências e Biotecnologia

2018 - 2022

Fiocruz - Instituto Carlos Chagas
Título: Investigação de mecanismos adaptativos e resistência a antimicrobianos de microrganismos isolados de pacientes com sepses
Helisson Faoro. Coorientador: Luis Gustavo Morello. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Bioinformática; bactérias oportunistas; Antimicrobianos; Resistência.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia. Setores de atividade: Atividades de atenção à saúde humana.

Mestrado em Bioinformática

2016 - 2018

Universidade Federal do Paraná
Título: Montagem e anotação genômica de bactérias oportunistas do gênero Herbaspirillum, isoladas de pacientes imunocomprometidos e comparação com genomas de bactérias ambientais, Ano de Obtenção: 2018
Helisson Faoro.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Herbaspirillum; Bioinformática; bactérias oportunistas; Fibrose cística.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Graduação em Biotecnologia

2012 - 2015

Pontifícia Universidade Católica do Paraná
Bolsista do(a): Programa Universidade para todos, PROUNI, Brasil.

Ensino Médio (2º grau)

2008 - 2011

Colégio estadual do Parana

Formação complementar

2014 - 2014

Introdução à Linguagem Perl para Bioinformática. (Carga horária: 8h). , Pontifícia Universidade Católica do Paraná, PUC/PR, Brasil.

2013 - 2013

Virologia - Diagnóstico de Flavivírus. (Carga horária: 64h). , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2012 - 2012

Extensão universitária em Fundamentos, Ferramentas e Técnicas de Biologia Mo. (Carga horária: 16h). , Pontifícia Universidade Católica do Paraná, PUC/PR, Brasil.

2012 - 2012

Extensão universitária em Fundamentos, Ferramentas e Técnicas de Biologia Mo. (Carga horária: 16h). , Pontifícia Universidade Católica do Paraná, PUC/PR, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente.

Alemão

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Microbiologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: ..

Organização de eventos

OLIVEIRA, W. K. ; BERTUOL, F. P. . I Fórum de Ética e Cidadania da PUCPR. 2014. (Outro).

Participação em eventos

1 Simpósio Araucária em Biologia Celular e Molecular.Montagem, anotação e comparação genômica de bactérias oportunistas do gênero Herbaspirillum isoladas de pacientes com fibrose cística. 2017. (Simpósio).

VI Jornada Acadêmica do Instituto Carlos Chagas - Fiocruz.Montagem e anotação genômica de bactérias oportunistas do gênero Herbaspirillum isoladas de pacientes imunocomprometidos e comparação com genomas de bactérias ambientais. 2017. (Seminário).

XXIII Seminário de Iniciação científica da PUCPR.Ação antimicrobiana de compostos naturais contra lactobacillus sp em frango após digestão in vitro. 2015. (Seminário).

I Fórum de Ética e Cidadania da PUCPR. 2014. (Encontro).

IV Semana Acadêmica de Biotecnologia da PUCPR. 2013. (Outra).

Reunião Anual de Iniciação Científica 2013.Análise da interação e recontituição do complexo formado pelas proteínas humanas SUMO-2 (Smallubiquitin-likemodifier2) e NIP7. 2013. (Outra).

Simpósio Temático em Biociências e Biotecnologia. 2013. (Simpósio).

XXI Seminário de Iniciação Científica da Pontifícia Universidade Católica do Paraná (SEMIC).Selection and use of bioinformatics tools for the identification of regulatory regions of gene expression in Herbaspirillum. 2013. (Seminário).

III Semana Acadêmica de Biotecnologia da PUCPR. 2012. (Simpósio).

Patógenos Desafiadores & Tópicos e Técnicas Experimentais Avançadas. 2012. (Simpósio).

Planeta PUC - Feira de Cursos e Profissões da PUCPR. Curso de Biotecnologia. 2012. (Feira).

Produções bibliográficas

OLIVEIRA, WILLIAN K ; FERRARINI, MARIANA ; MORELLO, LUIS G ; FAORO, HELISSON . Resistome analysis of bloodstream infection bacterial genomes reveals a specific set of proteins involved in antibiotic resistance and drug efflux. NAR Genomics and Bioinformatics , v. 2, p. 1, 2020.
OLIVEIRA, GEOVANE R. ; OLIVEIRA, WILLIAN K. ; ANDRADE, CARLA ; MELO, ANTONIO DIEGO B. ; LUCIANO, FERNANDO B. ; MACEDO, RENATA E. F. ; COSTA, LEANDRO B. . Natural antimicrobials for control of Salmonella Enteritidis in feed and in vitro model of the chicken digestive process. JOURNAL OF ANIMAL PHYSIOLOGY AND ANIMAL NUTRITION , v. 1, p. 1-10, 2019.
FAORO, HELISSON ; OLIVEIRA, WILLIAN K. ; WEISS, VINICIUS A. ; TADRA-SFEIR, MICHELLE Z. ; CARDOSO, RODRIGO L. ; BALSANELLI, EDUARDO ; BRUSAMARELLO-SANTOS, LIZIANE C. C. ; CAMILIOS-NETO, DOUMIT ; CRUZ, LEONARDO M. ; RAITTZ, ROBERTO T. ; MARQUES, ANA C. Q. ; LIPUMA, JOHN ; FADEL-PICHETH, CYNTIA M. T. ; SOUZA, EMANUEL M. ; PEDROSA, FABIO O. . Genome comparison between clinical and environmental strains of Herbaspirillum seropedicae reveals a potential new emerging bacterium adapted to human hosts. BMC GENOMICS , v. 20, p. 630, 2019.
OLIVEIRA, W. K. ; Faoro, H. ; TADRA-SFEIR, M. Z. ; CARDOSO, R. L. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. . Genomic analysis of opportunistic bacteria from Herbaspirillum genus isolated from immunocompromised patients. In: X-Meeting, 2016, Belo Horizonte. X meeting, 2016.
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OLIVEIRA, W. K. ; OLIVEIRA, G. R. ; COSTA, L. B. ; BITTENCOURT, F. ; MACEDO, C. ; MACEDO, R. E. F. . Ação antimicrobiana de compostos naturais contra lactobacillus sp em frango após digestão in vitro. In: XXIII Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2015, Curitiba. XXIII Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2015.
OLIVEIRA, G. R. ; OLIVEIRA, W. K. ; COSTA, L. B. ; BITTENCOURT, F. ; MACEDO, C. ; MACEDO, R. E. F. . Avaliação da atividade antibacteriana in vitro dos óleos essenciais isotiocianato de alila e carvacrol e dos ácidos orgânicos capróico e propiônico sobre Salmonella enteritidis. In: XIII Encontro Regional Sul de Ciência e TEcnologia de Alimentos, 2015, Curitiba. XIII Encontro Regional Sul de Ciência e TEcnologia de Alimentos, 2015.
OLIVEIRA, G. R. ; OLIVEIRA, W. K. ; COSTA, L. B. ; BITTENCOURT, F. ; MACEDO, C. ; MACEDO, R. E. F. . Ação de compostos antimicrobianos naturais adicionados à raçao de frango sobre lactobacillus plantarum durante digestão simulada in vitro. In: XIII Encontro Regional Sul de Ciência e TEcnologia de Alimentos, 2015, Curitiba. XIII Encontro Regional Sul de Ciência e TEcnologia de Alimentos, 2015.
OLIVEIRA, W. K. ; MADEIRA, H. M. F. . Selection and use of bioinformatics tools for the identification of regulatory regions of gene expression in Herbaspirillum. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013, Curitiba. XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013.
BONOTTO, D. R. ; BALDAN, A. P. ; CESARO, G. ; MAUERWERK, M. T. ; OLIVEIRA, W. K. ; SANTOS, D. C. M. ; MADEIRA, H. M. F. . Capacidade fermentativa e caracterização molecular da microbiota do trato intestinal de carpa capim. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013, Curitiba. XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013.
CANZIANI, E. F. ; ANDRADE, E. F. ; OLIVEIRA, W. K. ; CESARO, G. ; SANTOS, D. C. M. ; MAUERWERK, M. T. ; MADEIRA, H. M. F. . Identificação de bactérias do trato gastrintestinal de cupins. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013, Curitiba. XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013.
SANTOS, D. C. M. ; BONOTTO, D. R. ; OLIVEIRA, W. K. ; CESARO, G. ; MAUERWERK, M. T. ; MADEIRA, H. M. F. . Efeito da temperatura na fermentação anaeróbia por bactérias isoladas do trato digestório de carpa-capim. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013, Curitiba. XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013.
CESARO, G. ; BONOTTO, D. R. ; SANTOS, D. C. M. ; OLIVEIRA, W. K. ; MAUERWERK, M. T. ; BALDAN, A. P. ; MADEIRA, H. M. F. . Efeito de fontes de nitrogênio e de energia na fermentação anaeróbia por bactérias isoladas do trato digestório de carpa-capim. In: XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013, Curitiba. XXI Seminário de Iniciação Científica da PUCPR, 2013.
OLIVEIRA, W. K. ; OLIVEIRA, G. R. ; COSTA, L. B. ; BITTENCOURT, F. ; MACEDO, C. ; MACEDO, R. E. F. . Ação de compostos antimicrobianos naturais adicionados à raçao de frango sobre lactobacillus plantarum durante digestão simulada in vitro. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
OLIVEIRA, W. K. ; OLIVEIRA, G. R. ; COSTA, L. B. ; BITTENCOURT, F. ; MACEDO, C. ; MACEDO, R. E. F. . Composto natural anti-salmonella para aumentar a segurança alimentar no consumo de produtos de aves. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).
OLIVEIRA, W. K. ; ZANCHIN, N. I. T. . Análise da interação e recontituição do complexo formado pelas proteínas humanas SUMO-2 (Smallubiquitin-likemodifier2) e NIP7. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).
OLIVEIRA, W. K. ; MADEIRA, H. M. F. . Selection and use of bioinformatics tools for the identification of regulatory regions of gene expression in Herbaspirillum. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Projetos de pesquisa

2016 - Atual

Montagem e anotação genômica de bactérias oportunistas do gênero Herbaspirillum, isoladas de pacientes imunocomprometidos e comparação com genomas de bactérias ambientais., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Willian Klassen de Oliveira - Coordenador / Helisson Faoro - Integrante.
2015 - 2016

Utilização do ORFeoma de T. cruzi para caracterização funcional de proteínas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Willian Klassen de Oliveira - Coordenador / Christian Macagnan Probst - Integrante.
2014 - 2015

AÇÃO ANTIMICROBIANA DE COMPOSTOS NATURAIS CONTRA LACTOBACILLUS SP EM FRANGO APÓS DIGESTÃO IN VITRO, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Willian Klassen de Oliveira - Integrante / Renata Ernlund Freitas de Macedo - Coordenador.
2013 - 2014

ANÁLISE DA INTERAÇÃO E RECONSTITUIÇÃO DO COMPLEXO FORMADO PELAS PROTEÍNAS HUMANAS SUMO-2 (SMALL UBIQUITIN-LIKE MODIFIER2) E NIP7., Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Willian Klassen de Oliveira - Integrante / Nilson Ivo Tonin Zanchin - Coordenador.
2012 - 2013

Seleção e utilização de ferramentas de bioinformática para identificação de regiões reguladoras da expressão gênica de Herbaspirillum, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Willian Klassen de Oliveira - Integrante / Humberto Maciel da França Madeira - Coordenador.

Prêmios

2017

Menção Honrosa - 1 colocado na VI Jornada Acadêmica do ICC/Fiocruz, Instituto Carlos Chagas - Fiocruz/PR.

2016

Prêmio Marcelino Champagnat de melhor desempenho acadêmico da turma de Biotecnologia, PUCPR.

2015

1 Lugar - Missão Saúde 2015, Pontifícia Universidade Católica do Paraná / University of the Incarnate Word.

2014

1 lugar - Missão Saúde 2014, Pontifícia Universidade Católica do Paraná (PUCPR).

Histórico profissional

Experiência profissional

2015 - 2016

Fiocruz - Instituto Carlos Chagas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 30

2013 - 2014

Fiocruz - Instituto Carlos Chagas

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação científica, Carga horária: 20

2014 - 2015

Pontifícia Universidade Católica do Paraná

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

2012 - 2013

Pontifícia Universidade Católica do Paraná

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

2016 - Atual

Universidade Federal do Paraná

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.