Rodrigo Proto de Siqueira

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• Proto-Siqueira, R ; LANES, SILVANIA ; BORTOLINI, JOANA F ; ZOUAIN-FIGUEIREDO, GLAUCIA ; BARROS-NASCIMENTO, EDGARD ; MARINATO, ANDRÉ F . Remote Onco-Hematology Laboratory Using Reflex Testing for Increased Accessibility and Reduced Costs in a Developing Country: A Proof of Concept. Journal Of Applied Laboratory Medicine , v. 22, p. 1-3, 2023.

• GIOVANETTI, MARTA SLAVOV, SVETOSLAV NANEV FONSECA, VAGNER WILKINSON, EDUAN TEGALLY, HOURIIYAH PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER VIALA, VINCENT LOUIS SAN, EMMANUEL JAMES RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA SANTOS, ELAINE VIEIRA ABURJAILE, FLAVIA XAVIER, JOILSON FRITSCH, HEGGER ADELINO, TALITA EMILE RIBEIRO PEREIRA, FELICIDADE LEAL, ARABELA IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO DE CARVALHO PEREIRA, GLAUCO VAZQUEZ, CYNTHIA SANABRIA, GLADYS MERCEDES ESTIGARRIBIA OLIVEIRA, ELAINE CRISTINA DE DEMARCHI, LUIZ CRODA, JULIO DOS SANTOS BEZERRA, RAFAEL PAOLA OLIVEIRA DE LIMA, LOYZE , et al. MARTINS, ANTONIO JORGE RENATA DOS SANTOS BARROS, CLAUDIA MARQUEZE, ELAINE CRISTINA DE SOUZA TODAO BERNARDINO, JARDELINA MORETTI, DEBORA BOTEQUIO BRASSALOTI, RICARDO AUGUSTO DE LELLO ROCHA CAMPOS CASSANO, RAQUEL MARIANI, PILAR DRUMMOND SAMPAIO CORRÊA KITAJIMA, JOÃO PAULO SANTOS, BIBIANA Proto-Siqueira, R CANTARELLI, VLADEMIR VICENTE TOSTA, STEPHANE NARDY, VANESSA BRANDÃO REBOREDO DE OLIVEIRA DA SILVA, LUCIANA GÓMEZ, MARCELA KELLY ASTETE LIMA, JAQUELINE GOMES RIBEIRO, ADRIANA APARECIDA GUIMARÃES, NATÁLIA ROCHA WATANABE, LUIZ TAKAO BARBOSA DA SILVA, LUANA DA SILVA FERREIRA, RAQUEL DA PENHA, MARA PATRICIA F. ORTEGA, MARÍA JOSÉ DE LA FUENTE, ANDREA GÓMEZ VILLALBA, SHIRLEY TORALES, JUAN GAMARRA, MARÍA LIZ AQUINO, CAROLINA FIGUEREDO, GLORIA PATRICIA MARTÍNEZ FAVA, WELLINGTON SANTOS MOTTA-CASTRO, ANA RITA C. VENTURINI, JAMES DO VALE LEONE DE OLIVEIRA, SANDRA MARIA GONÇALVES, CRHISTINNE CAVALHEIRO MAYMONE DO CARMO DEBUR ROSSA, MARIA BECKER, GUILHERME NARDI GIACOMINI, MAYRA PRESIBELLA MARQUES, NELSON QUALLIO RIEDIGER, IRINA NASTASSJA RABONI, SONIA MATTOSO, GABRIELA CATANEO, ALLAN D. ZANLUCA, CAMILA DUARTE DOS SANTOS, CLAUDIA N. ASSATO, PATRICIA AKEMI ALLAN DA SILVA DA COSTA, FELIPE POLETI, MIRELE DAIANA LESBON, JESSIKA CRISTINA CHAGAS MATTOS, ELISANGELA CHICARONI BANHO, CECILIA ARTICO SACCHETTO, LÍVIA MORAES, MARÍLIA MAZZI GROTTO, REJANE MARIA TOMMASINI SOUZA-NETO, JAYME A. NOGUEIRA, MAURÍCIO LACERDA FUKUMASU, HEIDGE COUTINHO, LUIZ LEHMANN CALADO, RODRIGO TOCANTINS NETO, RAUL MACHADO BISPO DE FILIPPIS, ANA MARIA VENANCIO DA CUNHA, RIVALDO FREITAS, CARLA PETERKA, CASSIO ROBERTO LEONEL DE FÁTIMA RANGEL FERNANDES, CÁSSIA NAVEGANTES, WILDO DO CARMO SAID, RODRIGO FABIANO CAMPELO DE A E MELO, CARLOS F. ALMIRON, MARIA LOURENÇO, JOSÉ DE OLIVEIRA, TULIO HOLMES, EDWARD C. HADDAD, RICARDO SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO ELIAS, MARIA CAROLINA KASHIMA, SIMONE JUNIOR DE ALCANTARA, LUIZ CARLOS COVAS, Dimas Tadeu ; Genomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil. Nature Microbiology , v. 7, p. 1490-1500, 2022.

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• Toledo, Sílvia Regina Caminada ; ZAGO, Marco Antonio ; Oliveira, Indhira Dias ; Proto-Siqueira, Rodrigo ; Okamoto, Oswaldo K. ; Severino, Patricia ; Vêncio, Ricardo Z. N. ; Gamba, Francine Tesser ; Silva, Wilson A. ; Moreira-Filho, Carlos A. ; Torre, Cristiane A. Dalla ; Alves, Maria Tereza Seixas ; Garcia-Filho, Reynaldo J. ; Simpson, Andrew J. G. ; Petrilli, Antonio Sergio . Insights on PRAME and osteosarcoma by means of gene expression profiling. Journal of Orthopaedic Science (Print) , v. 16, p. 458-466, 2011.

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• Neder L ; MARIE, Suely K Negahashi ; CARLOTTI JR, Carlos Gilberto ; GABBAI, Alberto Alain ; ROSEMBERG, Sergio ; MALHEIROS, Suzana Mf ; SHINJO, Sueli Mieko Oba ; UNO, M. ; AGUIAR, Paulo Henrique ; MIURA, Flavio ; CHAMMAS, Roger ; COLLI, Benedicto Oscar ; MA, Zago ; SILVA JR, Wilson Araujo da . Galectin-3 as an Immunohistochemical Tool to Distinguish PilocyticAstrocytomas from Diffuse Astrocytomas, and Glioblastomas fromAnaplastic Oligodendrogliomas. Brain Pathology , v. 14, n.4, p. 399-405, 2004.

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• SILVA JR, Wilson Araujo da ; COVAS, Dimas Tadeu ; PANEPUCCI, Rodrigo ; SIUFI, Jorge ; ZANETTE, Dalila ; SANTOS, Anemari ; ZAGO, Marco Antonio . The profile of gene expression in humam marrow mesenchimal stem cell.. Stem Cells (Dayton, Ohio) , Stem Cells, v. 21, p. 661-669, 2003.

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• Terapia Celular - realidade nacional. Revista t\anto, Pelotas, 10 dez. 2012.

• Células tronco: caracteristicas e fontes de obtenção. Revista Tanto, 10 nov. 2012.

• Conforme a busca, conforme a crença: o peregrino de Compostela. Revista Tanto, Pelotas, 15 dez. 2011.

• Destino Certo - Fernando de Noronha. Revista Tanto, Pelotas, 10 jul. 2011.

• Natal Catalão. Revista Tanto, Pelotas, 15 dez. 2010.

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• PANEPUCCI, Rodrigo A ; JORGE, Siufi ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; Neder L ; ORELANA, Maristela ; ROCHA, Vandersson ; COVAS, Dimas Tadeu ; MA, Zago . THE COMPARISON OF GENE EXPRESSION OF UMBILICAL CORD VEIN AND BONE MARROW DERIVED MESENCHYMAL STEM CELLS. In: 9th Congress of the European Hematology Association, 2004, Genebra. The Haematology Journal, 2004.

• VASCONCELOS, Yuri ; P, Oppezzo ; VUILLIER, Françoise ; KIMURA, Eliza Yuriko Sugano ; LF, Franco ; MA, Zago ; M, Yamamoto ; G, Dighiero ; F, Davi . Novos marcadores surrogate para genes VH na LLC. In: Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia 2003, 2003, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia (Impresso), 2003. v. 25. p. 111-111.

• AG, Araújo ; SJ, Ismael ; RP, Falcão ; CA, Souza ; MA, Zago . Prame: Antígeno tumoral expresso em neoplasias linfóides.. In: Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia 2003, 2003, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia (Impresso), 2003. v. 25. p. 53-53.

• PANEPUCCI, Rodrigo A ; JORGE, Siufi ; ARAUJO, Amelia Goes ; ZANETTE, Dalila Luciola ; SANTOS, Ard ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; COVAS, Dimas Tadeu ; ZAGO, Marco Antonio . Análise serial da expressão gênica (SAGE) de células tronco mesenquimais.. In: congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia 2003, 2003, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia (Impresso), 2003. v. 25. p. 41-41.

• PANEPUCCI, Rodrigo A ; SIUFI, Jorge ; ORELANA, Maristela ; PALMA, Patricia ; ZANETTE, Dalila Luciola ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; COVAS, Dimas Tadeu ; ZAGO, Marco Antonio . Relação entre células progenitoras hematológicas com base na expressão gênica.. In: Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia 2003, 2003, São Paulo. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia (Impresso), 2003. v. 25. p. 42-42.

• FALCÃO, Roberto Passetto ; ISMAEL, Sebastião José ; ZAGO, Marco Antonio . The expression of tumor associated antigens in chronic lymphoproliferative disorders. In: VII Congress of the European Hematology Association, 2002, Florença, 2002.

• ESTALOTE, AC ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; ZAGO, Marco Antonio ; PALATINIK, Marcos . The G298A- Ala100Thr mutation on the coding sequence of the Duffy Antigen/Chemokine Receptor (DARC) gene in non-Caucasian. In: XVIII Congresso Nacional do Colégio Brasileiro de Hematologia, 2001, Fortaleza, 2001.

• ISMAEL, Sebastião José ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; ZAGO, Marco Antonio ; ARAUJO, Amelia Goes . Análise da Expressão de Genes Codificantes de Antígenos Específicos de Tumor em Células Neoplásicas da Leucemia Linfóide Crônica. In: XVIII Congresso Nacional do Colégio Brasileiro de Hematologia, 2001, Fortaleza, 2001.

• ESTALOTE, AC ; ZAGO, Marco Antonio ; PALATINIK, Marcos ; SILVA JR, Wilson Araujo da . The G298A- Ala100Thr mutation on the coding sequence of the Duffy Antigen/Chemokine Receptor (DARC) gene in non-Caucasian. In: XVIII Congresso Nacional de Genética, 2001, Aguas de Lindóia.

• CARRARA, Rita Viu ; CAMPOS, Cibele ; NAGAMURA, Leonisia ; DANIEL, Jeremias ; GODOI, Marcia ; BARBIERI, Marisa ; COVAS, Dimas Tadeu . Aplicação de métodos teóricos-práticos para abordagem da biodiversidade no ensino médio e fundamental. In: XVIII Congresso Nacional de Genética, 2001, Aguas de Lindóia, 2001.

• PERONE, Cláudia Helena ; GREGÓRIO, Zita Maria ; SOUZA, Ana Maria de . Screening das Hemoglobinopatias no Laboratório de Análises Clínicas da Faculadade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP. In: XXIV Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia Sociedade Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, 2000, Rio de Janeiro. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterpia, 2000. v. 22. p. 56-56.

• SANDES, Kyioko Abe ; SILVA JR, Wilson Araujo da ; ZAGO, Marco Antonio . Genótipo do Grupo Sanguíneo Duffy em 40 indivíduos Afro-Brasileiros. In: XVII Congresso Nacional de Genética, 2000, Aguas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology. v. 23. p. 566-566.

• LEITE, Samara . Avaliação de alguns antioxidantes na toxicidade induzida pelo Hg+2 na função renal e estresse oxidativo mitocondrial.. In: XI Congresso Brasileiro de Toxicologia, International Congress of Clinical Toxicology, 1999, Guarujá, 1999.

• Reticulocyte parameters: Why should clinical laboratories evaluate and report them?. Boletim da Sociedade Brasileira de Hematologia e Hemoterapia (Impresso) (Cessou em 1998. Cont. ISSN 1516-8483 Revista Brasileira de Hematologia e Hemo , 2013.

• Células-tronco e terapia celular. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Zago, M. A. ; FALCÃO, Roberto Passetto . Halofuginone Induces Post-Transcriptional Down-Regulation of Cyclin D1, Cell Cycle Arrest and Apoptosis In Mantle Cell Lymphoma Cells through Activation of Integrated Stress Response Pathways. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RIZZATTI, Edgar Gill ; De Lourdes Chauffaille, Maria . MECANISMOS CITOTÓXICOS DO ANTIFÚNGICO HALOFUGINONA NO LINFOMA DE CÉLULAS DO MANTO. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• MAEKAWA, Y. ; NAGLER, A. ; RIZZATTI, Edgar Gill . MECANISMOS CITOTÓXICOS DO ANTIFÚNGICO HALOFUGINONA NO LINFOMA DE CÉLULAS DO MANTO. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• MIYASHIRO, K. ; PERINI, A. P. ; GRANATO, C. . Detecção do vírus Influenza A H1N1 por PCR em tempo-real: desenvolvimento, validação e prevalência. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• MIYASHIRO, K. ; SAMPAIO, J. ; DUTRA, A. P. . Validação da detecção de enterovírus no líquido cefalorraquidiano por RT-PCR em tempo real. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• GRUENBART, D. ; STIEPCICH, M. . Detecção e genotipagem do papilomavirus humano pela técnica de microarray. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• BELMONTE, M. ; ALBERTO, F. L. . Validação da metodologia Cobas TaqMan para a quantificação de carga viral de HIV. 2008. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2009 - 2010

  Detecção de bactérias e fungos no sangue pela técnica de PCR em tempo-real: Septifast, Descrição: Projeto, execução e validação do sistema de detecção por PCR em tempo-real de fungos e bactérias no sangue (Septifast - Roche). Cultura de fungos e bactérias (ATCC) para o preparo de curvas padrões, em sangue, de microorganismos e validaçào do sistema de extração e detecção.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2009 - Atual

  Mecanismos moleculares de ação antitumoral da halofuginona no linfoma de células do manto, Descrição: Neste projeto, propomos a hipótese de que a halofuginona, para exercer seu efeito citotóxico no LCM, causa perturbações na via de sinalização TGFβ. Para investigar essa hipótese, utilizaremos um amplo painel de linhagens celulares derivadas do LCM e identificaremos aquelas com maior sensibilidade e resistência à halofuginona. Nessas linhagens, caracterizaremos as alterações no ciclo celular e indução de apoptose causadas pela halofuginona, bem como sua interação com inibidores das vias TGFβ, AKT e WNT, e com concentrações suprafisiológicas de TGFβ recombinante. Resultados preliminares sugerem que a citoxicidade é independente da inibição da via do TGFbeta e que há uma resposta integrada ao stress celular.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / Edgar Gill Rizzatti - Coordenador / Valdemir Carvalho - Integrante., Financiador(es): Fleury Medicina e Saúde - Auxílio financeiro / Universidade de São Paulo - Cooperação / Universidade Federal de São Paulo - Cooperação / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2008 - 2008

  Caracterização de alterações genéticas na leucemia promielocítica aguda, Descrição: Caracterização de novas alterações cromossômicas e mutações no gene FLT3 em pacientes portadores da leucemia promielocítica aguda.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / De Lourdes Chauffaille, Maria - Coordenador / Borri, Daniela - Integrante / Moreira, Eloisa S. - Integrante / Fernando Lopes Alberto - Integrante., Financiador(es): Fleury Medicina e Saúde - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2007 - 2007

  Análise da expressão global de proteínas em células neoplásicas da LLC por array de anticorpos monoclonais, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2006 - 2007

  Caracterização molecular dos genes IgVH em pacientes portadores de LLC, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2006 - 2007

  Análise da expressão da proteína TOSO em array de tecidos, Descrição: Validação dos achados identificados pela técnica de SAGe descrevendo a expressào aberrante do gene TOSO em células da LLC por array de tecidos seguido de detecção imuno-histoquímica. A quantificação da expressão da proteína TOSO foi realizada em células primárias de pacientes com LLC por citometria de fluxo quantitativa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marco Antonio Zago - Integrante / Rodrigo A Panepucci - Integrante / John Gribben - Integrante / Clear, A. - Integrante / Morris, K. - Integrante / Owen, C. - Integrante., Financiador(es): Queen Mary University of London - Bolsa / Cancer Research UK - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2004 - 2006

  Expressão gênica em carcinomas de cabeça e pescoço, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / Marco Antonio Zago - Integrante / Luciano Neder - Integrante / David LA Figueiredo - Integrante / Rui CM Mamede - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2003 - 2006

  Caracterização da expressão da protéina PRAME em células da LLC, Descrição: Produção de um anticorpo monoclonal específico contra a proteína PRAME e caracterização, a nível protéico, de sua expressão em células neoplásicas da leucemia linfocítica crônica por citometria de fluxo, western blot e microscopia confocal.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Roberto Passetto Falcão - Integrante / Marco Antonio Zago - Integrante / Rego EM - Integrante / Filonenko V - Integrante / Ivan Gout - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2002 - 2004

  Caracterização molecular e protéica de astrocitomas, Descrição: Análises comparativas in silico de diferentes bibliotecas de SAGE oriundas da bibliografia revelaram possíveis marcadores moleculares de estratificação prognóstica em astrocitomas. O trabalho realizado demonstra que é possível a estratificação de astrocitomas por PCR em tempo-real quantitativo de alguns genes específicos e que a marcação com galectina-3 de cortes histológicos por imunoitoquímica pode auxiliar da diferenciação desses tumores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / Wilson Araujo da Silva Jr - Integrante / Zago MA - Integrante / Suely Nagahashi Marie - Coordenador / Sueli Mieko Oba Shinjo - Integrante / Luciano Neder - Integrante., Número de produções C, T & A: 2

• 2002 - 2004

  Expressão gênica em linfoma de células do manto, Descrição: Identificação de novas redes gênicas envolvidas na patogênese do linfoma de células do manto por microarray. Trabalho inovador em descrever alterações na via do TGFbeta em células tumorais do LCM.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / Roberto Passetto Falcão - Integrante / Marco Antonio Zago - Integrante / Rodrigo Panepucci - Integrante / Aglair Garcia - Integrante / Edgar Gill Rizzatti - Coordenador / Osvaldo Keith Okamoto - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2001 - 2004

  Caracterização de células tronco mesenquimais, Descrição: Análise global da expressão genica em células tronco mesenquimais isoladas da veia do cordão umbilical e de medula óssea.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Integrante / Marco Antonio Zago - Coordenador / Wilson Araujo da Silva Jr - Integrante / Dimas Tadeu Covas - Integrante / Rodrigo Panepucci - Integrante / Jorge Siufi - Integrante / Maristela Orelana - Integrante., Número de produções C, T & A: 5

• 2000 - 2004

  Análise global da expressão gênica (SAGE) na LLC, Descrição: Análise global da expressão gênica (SAGE) de células primárias de pacientes com LLC classificados pelo sequenciamento da região VDJ (IgG). Os resultados demonstraram diferenças em diferentes redes gênicas envolvidas com apoptose, ciclo celular e proliferação e possibilitaram a primeira descrição de expressão aberrante do gene TOSO, relacionado com a via extrínseca da apoptose.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marco Antonio Zago - Integrante / Rodrigo Panepucci - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

• 2000 - 2004

  Análise da expressão de genes específicos de tumor em doenças linfoproliferativas crônicas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marco Antonio Zago - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2000 - 2000

  Genotipagem populacional do grupo sanguíneo Duffy, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marco Antonio Zago - Integrante / Angela Cristina Estalote - Integrante / Wilson Araujo da Silva Jr - Integrante / Marcos Palatinik - Integrante.

Projetos de desenvolvimento

• 2013 - Atual

  Detecção de SNP no gene da IL28, Descrição: Desenvolvimento e validação da metodologia de PCR em tempo-real para detecção do SNP 12979860 C/T no gene da IL28 em pacientes com infecção pelo HCV para apoio de escolha de protocolo de tratamento.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marion De Marco - Integrante., Financiador(es): Laboratório Antonello - Outra.

• 2010 - 2010

  Pesquisa das mutações C677T e A1298C do gene da MTHFR por PCR em tempo-real, Descrição: Planejamento, execução, validação (normas internacionais de desenvolvimento de novas metodologias CLSI) e implementação da metologia de pcr em tempo-real para a identificação das mutações C677T e A1298C no gene da MTHFR. Definição dos critérios de aceitação dos resultados, controle de qualidade, interface e liberação de resultados.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2009 - 2011

  Novos marcadores moleculares em onco-hematologia, Descrição: Desde a nova classificação de neoplasias onco-hematológicas instituída pela Organização Mundial da Saúde em 2001, as doenças hematológicas são classificadas de acordo com os achados moleculares e citogenéticos, além das características citomorfológicas e imunofenotípicas. Com o avanço das técnicas de identificação de mutações e caracterização de perfis de expressão gênica associados ao câncer, foram descritos novos marcadores moleculares que podem auxiliar no diagnóstico, avaliação de prognóstico e monitoramento de resposta ao tratamento (investigação de doença residual). Em Hematologia, esses marcadores moleculares têm impacto direto principalmente no diagnóstico das doenças mieloproliferativas crônicas policitemia vera (PV), mielofibrose primária (PMF)1 e trombocitemia essencial (TE)2 e das leucemias mieloides agudas com cariótipo normal. Na investigação das doenças mieloproliferativas crônicas, destacam-se a pesquisa quantitativa da mutação V617F no exon 14 do gene JAK2, as mutações no exon 12 do mesmo gene,3 e a detecção das mutações no códon 515 do gene MPL4-6, sendo este último especialmente relevante na investigação dos casos negativos para a mutação V617F do JAK2. Atualmente, os principais fatores independentes preditivos de prognóstico para os casos de leucemias mieloides agudas com cariótipo normal são as mutações nos genes FLT3, NPM17 e CEBPA8. Relevância A utilização de testes moleculares na identificação das mutações descritas acima é requisito fundamental para a correta classificação das neoplasias hematológicas, assim como para a determinação de prognóstico e escolha do protocolo terapêutico adequado. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2009 - 2009

  Pesquisa de bandas oligoclonais no líquido cefalorraquidiano (LCR) por isoeletrofocalização (IEF), Descrição: Validação, conforme normas da CLSI, do teste de identificação de bandas oligoclonais no LCR por isoeletrofocalização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2008 - 2010

  Genotipagem de HPV por microarray, Descrição: Validação e implantação da metodologia de identificação e genotipagem de HPV por microarray. Definição do sistema de interfaceamento e liberação de resultados do primeiro teste de microarray implantado no Grupo Fleury. Definição da melhor estratégia de extração de ácidos nucleicos e caracterização de eficiência de amplificação do PCR.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2008 - 2009

  Desenvolvimento de um método in house de genotipagem do vírus HIV-1 e determinação das mutações de resistência a anti-retrovirais, Descrição: Devido à alta mutagenicidade do vírus HIV-1 e a presença de co-infecções por diferentes subtipos virais, é importante que se determine qual o genótipo do vírus infectante para a escolha de um tratamento anti-retroviral adequado e específico para o paciente. A metodologia comercialmente disponível para o seqüenciamento da região da protease e da transcriptase reversa é cara e não apresenta uma eficiência na amplificação de alguns subtipos do HIV. - Determinar a sensibilidade e a reprodutibilidade de um método de extração de HIV RNA plasmático desenvolvido no laboratório; - Determinar a sensibilidade do método de extração semi-automatizado pelo BioRobot 9604 (Quigen) pela utilização do QIAamp Viral RNA Mini kit (Quiagen); - Padronizar a reação de RT-PCR com primers específicos para a região pol (genes da protease e da transcriptase reversa) do HIV e determinar a sensibilidade do método. - Padronizar a reação de seqüenciamento de nucleotídeos com 8 diferentes primers e definir algoritmos automáticos para a detecção de mutações e de populações mistas; - Desenvolver, junto com uma empresa prestadora de serviços de bioinformática, um software de análise e edição da seqüência consenso originada do seqüenciamento in house da região da polimerase do HIV. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 1999 - 1999

  Screening das hemoglobinopatias no laboratórios de análises clínicas da FCFRP, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2013 - Atual

  Detecção de SNP no gene da IL28, Descrição: Desenvolvimento e validação da metodologia de PCR em tempo-real para detecção do SNP 12979860 C/T no gene da IL28 em pacientes com infecção pelo HCV para apoio de escolha de protocolo de tratamento.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

• 2010 - 2010

  Pesquisa das mutações C677T e A1298C do gene da MTHFR por PCR em tempo-real, Descrição: Planejamento, execução, validação (normas internacionais de desenvolvimento de novas metodologias CLSI) e implementação da metologia de pcr em tempo-real para a identificação das mutações C677T e A1298C no gene da MTHFR. Definição dos critérios de aceitação dos resultados, controle de qualidade, interface e liberação de resultados.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2009 - 2011

  Novos marcadores moleculares em onco-hematologia, Descrição: Desde a nova classificação de neoplasias onco-hematológicas instituída pela Organização Mundial da Saúde em 2001, as doenças hematológicas são classificadas de acordo com os achados moleculares e citogenéticos, além das características citomorfológicas e imunofenotípicas. Com o avanço das técnicas de identificação de mutações e caracterização de perfis de expressão gênica associados ao câncer, foram descritos novos marcadores moleculares que podem auxiliar no diagnóstico, avaliação de prognóstico e monitoramento de resposta ao tratamento (investigação de doença residual). Em Hematologia, esses marcadores moleculares têm impacto direto principalmente no diagnóstico das doenças mieloproliferativas crônicas ? policitemia vera (PV), mielofibrose primária (PMF)1 e trombocitemia essencial (TE)2 ? e das leucemias mieloides agudas com cariótipo normal. Na investigação das doenças mieloproliferativas crônicas, destacam-se a pesquisa quantitativa da mutação V617F no exon 14 do gene JAK2, as mutações no exon 12 do mesmo gene,3 e a detecção das mutações no códon 515 do gene MPL4-6, sendo este último especialmente relevante na investigação dos casos negativos para a mutação V617F do JAK2. Atualmente, os principais fatores independentes preditivos de prognóstico para os casos de leucemias mieloides agudas com cariótipo normal são as mutações nos genes FLT3, NPM17 e CEBPA8. Relevância A utilização de testes moleculares na identificação das mutações descritas acima é requisito fundamental para a correta classificação das neoplasias hematológicas, assim como para a determinação de prognóstico e escolha do protocolo terapêutico adequado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2009 - 2009

  Pesquisa de bandas oligoclonais no líquido cefalorraquidiano (LCR) por isoeletrofocalização (IEF), Descrição: Validação, conforme normas da CLSI, do teste de identificação de bandas oligoclonais no LCR por isoeletrofocalização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2008 - 2010

  Genotipagem de HPV por microarray, Descrição: Validação e implantação da metodologia de identificação e genotipagem de HPV por microarray. Definição do sistema de interfaceamento e liberação de resultados do primeiro teste de microarray implantado no Grupo Fleury. Definição da melhor estratégia de extração de ácidos nucleicos e caracterização de eficiência de amplificação do PCR.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2008 - 2009

  Desenvolvimento de um método in house de genotipagem do vírus HIV-1 e determinação das mutações de resistência a anti-retrovirais, Descrição: Devido à alta mutagenicidade do vírus HIV-1 e a presença de co-infecções por diferentes subtipos virais, é importante que se determine qual o genótipo do vírus infectante para a escolha de um tratamento anti-retroviral adequado e específico para o paciente. A metodologia comercialmente disponível para o seqüenciamento da região da protease e da transcriptase reversa é cara e não apresenta uma eficiência na amplificação de alguns subtipos do HIV. - Determinar a sensibilidade e a reprodutibilidade de um método de extração de HIV RNA plasmático desenvolvido no laboratório; - Determinar a sensibilidade do método de extração semi-automatizado pelo BioRobot 9604 (Quigen) pela utilização do QIAamp Viral RNA Mini kit (Quiagen); - Padronizar a reação de RT-PCR com primers específicos para a região pol (genes da protease e da transcriptase reversa) do HIV e determinar a sensibilidade do método. - Padronizar a reação de seqüenciamento de nucleotídeos com 8 diferentes primers e definir algoritmos automáticos para a detecção de mutações e de populações mistas; - Desenvolver, junto com uma empresa prestadora de serviços de bioinformática, um software de análise e edição da seqüência consenso originada do seqüenciamento in house da região da polimerase do HIV.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 1999 - 1999

  Screening das hemoglobinopatias no laboratórios de análises clínicas da FCFRP, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

• 2021 - Atual

  Diagnóstico Molecular em Onco-Hematologia, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Andre Fiorin Marinato - Integrante.

• 2019 - 2019

  Sars-Cov-2, Descrição: Desenvolvimento do teste de PCR para o Sars-Cov-2. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Vlademir Vicente Cantarelli - Integrante.

• 2013 - Atual

  Detecção de SNP no gene da IL28, Descrição: Desenvolvimento e validação da metodologia de PCR em tempo-real para detecção do SNP 12979860 C/T no gene da IL28 em pacientes com infecção pelo HCV para apoio de escolha de protocolo de tratamento.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador / Marion De Marco - Integrante., Financiador(es): Laboratório Antonello - Outra.

• 2010 - 2010

  Pesquisa das mutações C677T e A1298C do gene da MTHFR por PCR em tempo-real, Descrição: Planejamento, execução, validação (normas internacionais de desenvolvimento de novas metodologias CLSI) e implementação da metologia de pcr em tempo-real para a identificação das mutações C677T e A1298C no gene da MTHFR. Definição dos critérios de aceitação dos resultados, controle de qualidade, interface e liberação de resultados.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2009 - 2011

  Novos marcadores moleculares em onco-hematologia, Descrição: Desde a nova classificação de neoplasias onco-hematológicas instituída pela Organização Mundial da Saúde em 2001, as doenças hematológicas são classificadas de acordo com os achados moleculares e citogenéticos, além das características citomorfológicas e imunofenotípicas. Com o avanço das técnicas de identificação de mutações e caracterização de perfis de expressão gênica associados ao câncer, foram descritos novos marcadores moleculares que podem auxiliar no diagnóstico, avaliação de prognóstico e monitoramento de resposta ao tratamento (investigação de doença residual). Em Hematologia, esses marcadores moleculares têm impacto direto principalmente no diagnóstico das doenças mieloproliferativas crônicas ? policitemia vera (PV), mielofibrose primária (PMF)1 e trombocitemia essencial (TE)2 ? e das leucemias mieloides agudas com cariótipo normal. Na investigação das doenças mieloproliferativas crônicas, destacam-se a pesquisa quantitativa da mutação V617F no exon 14 do gene JAK2, as mutações no exon 12 do mesmo gene,3 e a detecção das mutações no códon 515 do gene MPL4-6, sendo este último especialmente relevante na investigação dos casos negativos para a mutação V617F do JAK2. Atualmente, os principais fatores independentes preditivos de prognóstico para os casos de leucemias mieloides agudas com cariótipo normal são as mutações nos genes FLT3, NPM17 e CEBPA8. Relevância A utilização de testes moleculares na identificação das mutações descritas acima é requisito fundamental para a correta classificação das neoplasias hematológicas, assim como para a determinação de prognóstico e escolha do protocolo terapêutico adequado.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2009 - 2009

  Pesquisa de bandas oligoclonais no líquido cefalorraquidiano (LCR) por isoeletrofocalização (IEF), Descrição: Validação, conforme normas da CLSI, do teste de identificação de bandas oligoclonais no LCR por isoeletrofocalização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2008 - 2010

  Genotipagem de HPV por microarray, Descrição: Validação e implantação da metodologia de identificação e genotipagem de HPV por microarray. Definição do sistema de interfaceamento e liberação de resultados do primeiro teste de microarray implantado no Grupo Fleury. Definição da melhor estratégia de extração de ácidos nucleicos e caracterização de eficiência de amplificação do PCR.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 2008 - 2009

  Desenvolvimento de um método in house de genotipagem do vírus HIV-1 e determinação das mutações de resistência a anti-retrovirais, Descrição: Devido à alta mutagenicidade do vírus HIV-1 e a presença de co-infecções por diferentes subtipos virais, é importante que se determine qual o genótipo do vírus infectante para a escolha de um tratamento anti-retroviral adequado e específico para o paciente. A metodologia comercialmente disponível para o seqüenciamento da região da protease e da transcriptase reversa é cara e não apresenta uma eficiência na amplificação de alguns subtipos do HIV. - Determinar a sensibilidade e a reprodutibilidade de um método de extração de HIV RNA plasmático desenvolvido no laboratório; - Determinar a sensibilidade do método de extração semi-automatizado pelo BioRobot 9604 (Quigen) pela utilização do QIAamp Viral RNA Mini kit (Quiagen); - Padronizar a reação de RT-PCR com primers específicos para a região pol (genes da protease e da transcriptase reversa) do HIV e determinar a sensibilidade do método. - Padronizar a reação de seqüenciamento de nucleotídeos com 8 diferentes primers e definir algoritmos automáticos para a detecção de mutações e de populações mistas; - Desenvolver, junto com uma empresa prestadora de serviços de bioinformática, um software de análise e edição da seqüência consenso originada do seqüenciamento in house da região da polimerase do HIV.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

• 1999 - 1999

  Screening das hemoglobinopatias no laboratórios de análises clínicas da FCFRP, Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Rodrigo Proto de Siqueira - Coordenador.

Prêmios