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Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ) em 1983 e o título de Doutor pela Université Paris XI (Centre d?Orsay, França) em 1989. É professora titular do Departamento de Botânica da Universidade de São Paulo desde 2007. Dois interesses principais orientam a sua atuação acadêmica-científica e são eles a compreensão de processos moleculares para diversificação biológica e a interação entre plantas e microrganismos. Estes interesses direcionaram a atuação do grupo GaTE em genômica comparativa e função biológica dos elementos de transposição. É membro da ACIESP (2015-atual), ABC (2016-atual) e CDES (2016-2018). Mais de 50 profissionais em diferentes estágios de formação científica passaram pelo GaTE e encontram-se inseridos no setor público e privado no Brasil e no exterior.
Informações coletadas do Lattes em 01/07/2022
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Microbiologie Et Genetique
1985 - 1989
Université Paris-Sud 11
Título: Analyse de lactivite de lelement transposable Activator du mais chez Arabidopsis thaliana et Daucus carota.
Orientador: Jacques Tempé
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia Vegetal.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioenergia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.
Organização de eventos
Van Sluys, Marie Anne ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro . Workshop on Biodiversity and Biobank in Brazil. 2017. (Outro).
VAN SLUYS, M.A. ; SILVA FILHO, M. C. ; CARRARI, F. ; ULLOA, R. . IPMB 2015. 2015. (Congresso).
Van Sluys, Marie Anne . UEA/NRP - Brazil workshop on plant sciences. 2012. (Outro).
Van Sluys, Marie Anne . International Workshop about the Ethanol Combustion Engines. 2012. (Outro).
SOUZA, Glaucia M ; CORTEZ, L. A. B. ; CANTARELLA, H. ; SILVA, C. ; CHAIMOVICH, H. ; Van Sluys, Marie-Anne . First Braziliain Bioenergy Science and Technology Conference - BBEST. 2011. (Congresso).
VAN SLUYS, M A ; MACHADO, M. A. ; SOUZA, A. A. . International Workshop on Xylella fastidiosa. 2007. (Outro).
SCORTECCI, K. C. ; PERES, L. E. P. ; COSTA, A. P. P. ; VAN SLUYS, M A . I Simposio Brasileiro de Genetica molecular de plantas. 2007. (Congresso).
Participação em eventos
First International Conference on Genomic Impact of Eukaryotic Transposable Elements. A genomic approach to depict transcriptionalle active transposable elements in sugarcane. 2006. (Congresso).
International workshop on Xanthomonas Genome Research: current issues and future challenges. Horizontal gene transfer input in Xanthomonas genome diversification. 2005. (Congresso).
10th International congress for culture collections: innovative roles of biological resource centers. Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. 2004. (Congresso).
TEGERM: analysis and exploitation of germplasm using trasnposable element molecular marker.TEGERM meeting. 2004. (Outra).
Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. Keystone Symposia on Transposition and other Genome rearrangements. 2003. (Congresso).
A história do projeto Genoma.Seminários de Biologia Funcional e Molecular. 2002. (Seminário).
Is TH11 protein from Arabidopsis a bifunctional protein?.Simpósio Brasil-Coréia: da Pesquisa à Biotecnologia. 2001. (Simpósio).
Georgia Genetics Symposium I: transposable elements and evolution. Retrolyc: a Tnt1-like retrotransposon isolated from L peruvianum genome. 1999. (Congresso).
Da geração espontânea à Evolução Molecular.Simpósio do Ano Pasteur. 1995. (Simpósio).
Participação em bancas
OLIVA, G.; OLIVEIRA, Mariana Cabral de; MASZZAFERA, P.; BOLZAND, V.;Van Sluys, M. A.. Código Glicomico. 2017.
Orientou
Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans; Início: 2021; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Biociências (USP), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
ESTUDO DA COLONIZAÇÃO DE DIFERENTES VARIANTES DE XANTHOMONAS ALBILINEANS EM SACCHARUM SPP; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Arquitetura molecular do Locus Xa21 em resposta à infecção por Xanthomonas em cana de açúcar; Início: 2019; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Metabolismo de sacarose e a interação planta microrganismos; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências; (Orientador);
INVESTIGANDO OS ASPECTOS BIOLÓGICOS DE THI1 EM PLANTAS; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências; (Orientador);
Aplicando ME sobre genomas de Xanthomonas albilineans em busca de alvos; ; Início: 2016; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Início: 2018; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;
Início: 2017; Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;
Análise do impacto de genes presentes em elementos genéticos móveis do genoma de Xanthomonas albilineans em seus perfis patogênicos; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biomédicas) - Instituto de Ciência Biomédicas (USP); (Orientador);
Estudos fisiológicos comparativos in vitro de isolados de Xanthomonas albilineas com diferentes graus de agressividade da doença ?escaldadura da folha? de cana-de-açúcar; Início: 2018 - Instituto de Biociências; (Orientador);
Biotecnologia bacteriana: construção de vetores de expressão e edição genômica; Início: 2021; Orientação de outra natureza; Instituto de Biociências (USP); (Orientador);
Plataforma GEMAC de alvos, anotação e integração de resultados; ; Início: 2018; Orientação de outra natureza; Instituto de Biociências; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);
Uso do ?Polimorfismo baseado na inserção de Retrotransposon? (RBIP) mais o PCR quantitativo na verificação de associação entre genes de resistência e Elementos Transponíveis; 2015; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Caracterização genômica dos genes s6pp de Saccharum spp; vinculados na produção de sacarose; ; 2015; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Desenvolvimento de Método de Identificação de Promotores de Cana-de-Açúcar: Análise comparativa de clonagem dirigida e clonagem aleatória; 2012; Dissertação (Mestrado em Programa Interunidades Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Perfil transcricional do retrotransposon Retrolyc 1 em mutantes de tomate Micro-Tom e em suspensão celular de fumo; ; 2008; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudo da inativação por RNAi de retrotransposons da família Tnt1; 2007; 0 f; Dissertação (Mestrado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Interferência na expressão do gene thi1 de Arabidopsis thaliana e seus efeitos biológicos; 2003; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Detecção in vivo da atividade promotora do elemento de transposição Ac em Arabidopsis thaliana através da utilização do gene reporter GFP; 2001; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Farias; Caracterização genômica e investigação da região promotora do gene thi1 de Arabidopsis thaliana; 2001; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Seleção Genética Negativa Em Raízes Transformadas de Tomate Com O Gene da Timidina Quinase Viral Hsvtk; ; 1997; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Seleção Genética Negativa Em Raízes Transformadas de Tomate (Lycopersicon Esculentum) Com O Gene da Enzima da Citosina Desaminase; 1996; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Scortecci; Contribuição Ao Estudo da Regulação da Atividade do Elemento de Transposição Ac do Milho Em Arabidopsis Thaliana (L; ) Heynh (Cruciferae); 1993; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
PROSPECÇÃO in silico DE PEQUENOS RNAs NA RELAÇÃO DE FUNGOS FITOPATOGÊNICOS E SEUS HOSPEDEIROS; 2019; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências,; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
INFLUÊNCIA DE ELEMENTOS MÓVEIS EM LINHAGENS DE XANTHOMONAS ORYZAE; 2013; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudos de elementos de transposição em plantas: elementos tipo hAT em cana de açucar; 2012; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Homólogos a At-thi1 em cana de açúcar: estudo molecular e funcional; ; 2012; Tese (Doutorado em INTERNACIONAL BIOLOGIA) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Impacto dos elementos transponíveis nos genomas de estirpes brasileiras de Bradyrhizobium; 2012; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações; ; 2011; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Marie-Anne Van Sluys;
Discriminação de fenótipos Tnt1-U3 específicos em linhagens de Nicotiana RNAi; 2010; Tese (Doutorado em Internacional Biologia Vegetal) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
RETROTRANSPOSONS DAS FAMILIAS OPIE, HOPSCOTCH E MAGGY: DESVENDANDO AS INTERACOES COM O GENOMA DA CANA-DE-ACUCAR; 2009; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Análise do perfil genômico e de expressão gênica de microorganismos em diferentes áreas afetadas por BTEX na cidade de Cubatão, SP; 2009; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Genômica comparativa de enzimas de degradação da parede celular vegetal em Xanthomonas, Xylella e Stenotrophomonas; 2008; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Caracterização da diversidade de famílias de elementos transponíveis expressos em cana-de-açúcar (Saccharum spp); 2007; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Diversidade de retrotransposons similares a Retrolyc1 em Solanum; 2007; Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Genes parálogos AtXPB1 e AtXPB2: estudo da duplicação e expressão em Arabidopsis thaliana; ; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Varani; Análise comparativa de integrases de 4 linhagens de Xylella fastidiosa; 2004; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências,; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Análise da expressão do retrotransposon Retrolyc1 em Lycopersicon esculentum e Lycopersicon peruvianum; 2004; Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
SURE e Garapa: caracterização molecular e distribuição de dois retrotransposons com LTR em cana-de-açúcar; 2004; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Morgante; Organização genômica e estudos da função do gene araXPB em Arabidopsis thaliana; 2003; 150 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Aspectos funcionais do gene thi1 em plantas selvagens e mutantes de Arabidopsis thaliana (Brassicaceae); 2003; Tese (Doutorado em Pos Graduação em Botânica) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estrutura do genoma de Leifsonia xuli pv cynodontis e impacto de elementos IS; 2002; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudos de complementação de mutantes de Arabidopsis thaliana com o gene thi1; 2001; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Diversidade da Região U3 do retrotransposon Retrolyc1 em quatro espécies do gênero Lycopersicon spp; ; 2000; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Caracterização de linhagens brasileiras de Agrobecterium tumefaciens; ; 1999; 0 f; Tese (Doutorado em Energia Nuclear na Agricultura) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Costa; Caracterização de sequências homólogas ao retrotransposon Tnt1 em Lycopersicon peruvianum; 1999; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudo da Atividade do Elemento Transposição Ac do Milho Em Sistemas Heterólogos; 1997; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
2018; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2016; Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Marie-Anne Van Sluys;
2014; Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Marie-Anne Van Sluys;
2014; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2013; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2013; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2013; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2011; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
Metcalfe; 2009; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2009; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2008; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
Estudo da duplicação gënica AtXPB1 e AtXPB2 de Arabidopsis thaliana; 2007; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2004; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2003; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2003; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
2001; Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;
Obtencao de 04 linhagens de Xanthonomas albilineans expressando cada uma uma proteina fluorescente; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de Pelotas; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Caracterização da relação entre o retrotransposon tnt1 e o ciclo celular de Nicotiana tabacum; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Identificação e mapeamento das proteínas de repetição do pentatricopeptídeo em cultivares modernas de cana-de-açúcar; 2015; Iniciação Científica - Intituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudo da atividade transcricional de três diferentes cópias de retrotransposons da linhagem evolutiva DEL em cana-de-açúcar; ; 2012; Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
ANÁLISE DA REGIÃO PROMOTORA DO ELEMENTO RETROSOL; 2008; Iniciação Científica - Intituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Análise do padrão de inserção dos transposons IS em 9 genomas de Xanthomonas spp; 2008; Iniciação Científica - Instituto de Biociências; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudo de interferência de RNA na expressão e atividade de Tnt1 em plantas de tabaco; 2008; Iniciação Científica - Instituto de Biociências; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Anãlise das toxinas do tipo hemaglutininas, RTX e killer/antikiller presentes em xylella fastidiosa; ; 2007; Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Inativação por RNAi de seqüências similares à transcriptase reversa do retroelemento Tnt1 em linhagem celular BY-2 de Nicotiana tabacum (Solanaceae); 2007; Iniciação Científica - Instituto de Biociências; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Atividade transcricional associada a região LTR de retrotransposons; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Fundação Santo André, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Uso de cDNA-AFLP para indentificar genes envolvidos na floração de cana de açúcar; 2006; Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Estudo da atividade transcricional de retrotransposons de cana de açúcar; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Bilógicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Regulação da expressão gênica de Retrolyc1; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Análise comparativa da expressão de Retrolyc 1B isolado do genoma de Lycopersicon; ; 2001; Iniciação Científica - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Otimização das condições de transformação in vivo de Arabidopsis thaliana; ; 2000; Iniciação Científica - Instituto de Biociências; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Detecção e quantificação de long non-coding RNA e elementos de transposição em experimento piloto da interação cana e Xanthomonas albilineans; 2020; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Desenvolvimento de sistema Taqman para determinação alélica de locus RGA em cana-de-açúcar; 2018; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Treinamento em manutenção de estoques de bactérias, linhagens de plantas e estratégias moleculares de construção gênica; ; 2015; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Tratamento Bioinformático em Larga Escala de Sequências de Cana de Açúcar e busca de padrões em elementos de transposição; ; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Tratamento Bioinformático em Larga Escala de Sequências de Cana de Açúcar e busca de padrões em elementos de transposição; ; 2013; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Treinamento em manutenção de estoques de bactérias, linhagens de plantas e estratégias moleculares de construção gênica; ; 2013; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Anotação de 1000 clones BAC do genoma da cana de açúcar: banco de dados, integração e interface web; ; 2013; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Treinamento Técnico em biologia molecular de plantas com enfoque em bioenergia; 2009; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Título em português Sequenciamento de DNA com uso de novas tecnologias e análise comparativa com metodologia convecional por método de Sanger; ; 2009; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Análise comparativa das sequencias de elementos de transposição entre o milho moderno e antigo; 2005; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências; Orientador: Marie-Anne Van Sluys;
Produções bibliográficas
SOUSA'BAENA, MARIANE S ; HERNANDES-LOPES, JOSÉ ; Van Sluys, Marie-Anne . Reaching the top through a tortuous path: helical growth in climbing plants. CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY , v. 59, p. 101982, 2021.
PARTIDA, VANIA GABRIELA SEDANO ; DIAS, HENRIQUE MOURA ; CORCINO, DIANA SUSANA MARTINEZ ; Van Sluys, Marie-Anne . Sucrose-phosphate phosphatase from sugarcane reveals an ancestral tandem duplication. BMC PLANT BIOLOGY , v. 21, p. 23, 2021.
MASUDA, HANA PAULA ; NAKABASHI, MYNA ; MORGANTE, PATRICIA G ; KAJIHARA, DANIELA ; DE SETTA, NATHALIA ; MENCK, Carlos Frederico Martins ; Van Sluys, Marie-Anne . Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE , v. 754, p. 144818, 2020.
Sforça, Danilo Augusto ; VAUTRIN, SONIA ; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO ; MANCINI, MELINA CRISTINA ; ROMERO-DA CRUZ, MARÍA VICTORIA ; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA ; CONTE, MÔNICA ; BELLEC, ARNAUD ; DAHMER, NAIR ; FOURMENT, JOELLE ; RODDE, NATHALIE ; SLUYS MAV. ; VICENTINI, RENATO ; GARCIA, ANTÔNIO AUGUSTO FRANCO ; FORNI-MARTINS, ELIANA REGINA ; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO ; HOFFMANN, HERMANN PAULO ; PINTO, Luciana Rossini ; LANDELL, MARCOS GUIMARÃES DE ANDRADE ; VINCENTZ, MICHEL ; BERGES, HELENE ; SOUZA, A. P. . Gene Duplication in the Sugarcane Genome: A Case Study of Allele Interactions and Evolutionary Patterns in Two Genic Regions. Frontiers in Plant Science , v. 10, p. 1-15, 2019.
BARROS-CARVALHO, GESIELE ALMEIDA ; HUNGRIA, MARIANGELA ; LOPES, FABRÍCIO MARTINS ; VANSLUYS, MARIE-ANNE . Brazilian-adapted soybean Bradyrhizobium strains uncover IS elements with potential impact on biological nitrogen fixation. FEMS Microbiology Letters , v. 366, p. fnz046, 2019.
TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S . The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY , v. 70, p. 497-506, 2019.
SOUZA, GLAUCIA MENDES VANSLUYS, MARIE-ANNE LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI LEE, HAYAN MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES HOTTA, CARLOS TAKESHI GAIARSA, JONAS WEISSMANN DINIZ, AUGUSTO LIMA OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS FERREIRA, SÁVIO DE SIQUEIRA NISHIYAMA, MILTON YUTAKA TEN-CATEN, FELIPE RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO ANDRADE, PABLO DE MORAIS DESOUZA, ROBSON FRANCISCO NICASTRO, GIANLUCCA GONÇALVES PANDYA, RAVI KIM, CHANGSOO GUO, HUI DURHAM, ALAN MITCHELL CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO ZHANG, JISEN ZHANG, XINGTAN ZHANG, QING MING, RAY , et al. Schatz, Michael C DAVIDSON, BOB PATERSON, ANDREW H HECKERMAN, DAVID ; Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GigaScience , v. 8, p. 1, 2019.
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SLUYS MAV. ; ARAÚJO, P. G. ; TEMPE, J. . Caracterização da Região U3 de Sequências Homólogas Ao Retrotransposon Tnt1 Em Difierentes Espécies de Lycopersicon. In: 42 Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu MG. v. 19. p. 325-325.
SLUYS MAV. ; PACHECO, F. T. H. ; SILVA, D. M. ; R NETO, J. ; TEMPE, J. . Caracterização de Isolados Selvagens de Agrobacterium Tumefaciens Provenientes de Diferentes Espécies Vegetais. In: 42 Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu MG. v. 19. p. 345-345.
SLUYS MAV. ; HASHIMOTO, R. Y. ; MENCK, C. F. M. ; TEMPE, J. . Transfer Of The Cytosine Deaminase Gene To A Wild Variety Of Lycopersicon Esculentum And Its Expression Analysis. In: XXIV Reunião Anual da SBBq, 1995. Livro de Resumos. Caxambu, MG. p. 55-55.
SLUYS MAV. ; SCORTECCI, K. C. ; TEMPE, J. . Ac Transposable Element Reactivation From T-Dna After 5-Azacytidine Treatment. In: Segundo encontro Latinoamericano de Biotecnologia Vegetal REDBIO95, 1995. Livro de resumos. Puerto Iguazu, Argentina. p. D17.
SLUYS MAV. ; SCORTECCI, K. C. ; TEMPE, J. . Reactivation Of The Nopaline Synthase Gene Expression In Transgenic Arabidopsis Thaliana.. In: XXIII Congresso Nacional de Bioquímica e Biologia Molecular, 1994. Livro de Resumos. Caxambu, MG. p. 45.
SLUYS MAV. ; SCORTECCI, K. C. ; GRANDBASTIEN, M. A. ; TEMPE, J. . Caracterização de Um Retrotransposon Semelhante A Tnt1 No Genoma de Lycopersicon. In: 40 Congresso Nacional de Genética, 1994. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 17. p. 201-201.
SLUYS MAV. . Transformation Of A Wild Variety Of Lycopersicon Esculentum With A. Rhizogenes.. In: XXII REUNIAO ANUAL DA SBBQ, 1993. CAXAMBU - MG. p. 0-0.
SLUYS MAV. . Treatment Of Wild And Transgenic Seeds Of A. Thaliana With The Demethylating Agent: 5 Azacitydine.. In: XXI REUNIAO ANUAL DA SBBQ, 1992. CAXAMBU, MG. p. 0-0.
SLUYS MAV. . What Is Happening To Transposable Element Ac In Arabidopsis Thaliana?. In: VI PAN AMERICAN BIOCHEMISTRY CONGRESS, 1990. SAO PAULO, SP. p. 0-0.
SLUYS MAV. . E. Coli Xtha Mutant Is Not Hipersensitive To Ascorbic Acid-Copper Sulfate Treatment: A H2o2 Mediated Reaction. In: IV PAN AMERICAN BIOCHEMISTRY CONGRESS, 1984. BUENOS AIRES, ARGENTINA. p. 0-0.
RODY, HUGO V. S. ; CAMARGO, LUIS E. A. ; CRESTE, SILVANA ; Van Sluys, Marie-Anne ; RIESEBERG, LOREN H. ; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B. . Arabidopsis-Based Dual-Layered Biological Network Analysis Elucidates Fully Modulated Pathways Related to Sugarcane Resistance on Biotrophic Pathogen Infection. Frontiers in Plant Science , 2021.
Van Sluys, Marie Anne . W954-Virus-like Attachment Sites as Structural Landmarks of Plants Retrotransposons. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Van Sluys, M. A. . Aplicações do genoma em Biotecnologia. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
VAN SLUYS, M.-A. ; Van Sluys, Marie Anne . Transposable elements between two karma; evolutionary and cell biology viewpoints. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Van Sluys, Marie Anne ; MALUF, D. Q. ; JESUS, Erika Maria de ; HERNANDES, J. ; SCHIAVO-MUCHE, A. P. . Tnt1 retrotransposon and ethylene mediates tobacco defense responses. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Van Sluys, Marie Anne . Funding Agency Panel Sao Paulo Research Foundation FAPESP. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Van Sluys, M. A. . O olhar de McClintock sobre o vivo. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Van Sluys, M. A. ; CRUZ, C. H. B. . Science and Technology in the State of Sao Paulo. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Van Sluys, M. A. ; CRUZ, C. H. B. . FAPESP e o financiamento à pesquisa no Estado de São Paulo. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Van Sluys, Marie Anne . Sugarcane genome and BIOEN initiative. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Van Sluys, Marie Anne . Energy security: BIOEN Research Program and the Sugarcane genome. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Van Sluys, Marie Anne . Sugarcane genome sequence. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
SLUYS, M. A. ; Van Sluys, Marie Anne . The Role of Science in Coping with the Grand Challenges Facing Humanity. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Van Sluys, Marie Anne . Sugarcane Genomics. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A . Transposable elements in sugarcane. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A . Plant genomics in Brazil. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; ROSSI, M. ; SACCARO, Nilo ; JESUS, Erika Maria de ; DOMINGUES, Douglas Silva ; COSTA, Ana Paula Pimentel . A genomic approach to depict transcriptionally active transposable elements in sugarcane. 2006. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VILTORELLO, C. B. M. ; LIMA, W. ; VARANI, A. M. ; SOUZA, R. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; MENCK, C. F. M. ; VAN SLUYS, M A . Plant pathogens comparative genomics: genetic móbile elements as sources of gene diversity. 2006. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; LIMA, W. ; MENCK, C. F. M. ; BOGDANOVE, A. ; LEACH, J. E. . Comparative genomic analysis among Xanthomonadales. 2006. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A . Horizontal gene transfer input in Xanthomonas genome diversification. 2005. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; OLIVEIRA, M. C. ; ZERILLO, Marcelo ; VARANI, A. M. ; VITORELLO, C. B. M. . Genetic mobile elements induced mutations and their impact genome evolution. 2005. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
ROSSI, M. ; ARAÚJO, P. G. ; JESUS, Erika Maria de ; VARANI, A. M. ; VAN SLUYS, M A . Comparative analysis of sugarcane expressed transposable elements. 2004. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; VITORELLO, C. B. M. . Mobile genetic elements contribution to the differentiation of closely related Xanthomonas genomes. 2004. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A . Xylella fastidiosa and comparative analysis to whole genome sequences of other phytopathogenic bacteria. 2003. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; COSTA, A. P. P. ; ARAÚJO, P. G. ; CASACUCERTA, J. M. ; GRANDBASTIEN, M. A. . Retrolyc: a Tnt1-like retrotransposon isolated from Lycopersicon peruvianum genome. 1999. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
VAN SLUYS, M A ; FEDOROFF, N. V. ; TEMPE, J. . Transposition of the maize Activator element in Arabidopsis thaliana and Daucus carota. 1987. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
HERNANDES, J. ; MALUF, D. Q. ; JESUS, Erika Maria de ; Lopes FR ; PARMIGIANI, R. B. ; KAROLSKI, Bruno ; DIAS, H. M. ; JACOBS, T. B. ; CAMARGO, A. A. ; KITAJIMA, J.P. ; Van Sluys, M. A. . Evidence-based gene expression modulation correlates with transposable element knock-down 2020 (Divulgação Científica).
SECKENDORF, M. V. ; Zerillo, Marcelo M ; BONADIO, D. ; VANSLUYS, M A . Projeto GEMACana. Sao Paulo 2020 (Divulgação Científica).
Outras produções
SLUYS MAV. ; ROSSI, M. ; ARAÚJO, P. G. . Retroprom: método de obtenção e uso. 2004.
VANSLUYS, M A ; SOUZA, G. . O Genoma da Cana de açucar. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
Van Sluys M.A. ; Margarido, Gabriel R. A. . Um quebra-cabeça genômico. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
Van Sluys, Marie Anne . De Bacteria e Louco todo mundo tem um pouco. 2016.
MOURA, M. ; Van Sluys, Marie Anne . DNA móvel. 2012. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SLUYS MAV. ; HOFTE, H. . A Erva Daninha Que Sintetiza Todo O Mundo Vegetal. 1997 (entrevista).
SLUYS MAV. . Sugarcane transposable elements depicted from its transcriptome. 2004 (simposio) .
SLUYS MAV. . Comparative analyses of Xylella fastidiosa genomes. 2003 (Conferência) .
SLUYS MAV. . Xylella fastidiosa genome. 2001 (simposio) .
SLUYS MAV. . Repeated motifs in the U3 region of Retrolyc1 LTR in different Lycopersicon species. 2000 (simposio) .
SLUYS MAV. . Expression And Genome Organisation Of The Thi1 Gene Of Arabidopsis. 1998 (apresentação do trabalho em uma Gordon Conference) .
SLUYS MAV. . Regulation Of The Ac Transposable Element Promoter In Tobacco Plants. 1998 (trabalho apresentado em uma Gordon Research Conference) .
2018 - Atual
GEMACANA: Contribuição de genes, genomas e elementos de transposição na interação entre plantas e microorganismos: estudo de caso em cana de açúcar., Descrição: A interação planta-microorganismos representa um dos processos de fundamental relevância para o funcionamento de ecossistemas naturais, bem como agrícolas. A compreensão de seus componentes e dos processos que controlam essa interação biológica tem potencial de melhorar a produtividade das culturas e monitorar a qualidade ambiental. Este projeto pretende contribuir na elucidação deste sistema complexo através da utilização de ferramentas moleculares e de bioinformática dos genomas para descobrir os principais genes que controlam e / ou medeiam a interação de cana de açúcar com três patógenos (Leifsonia xyli subsp xyli;. Xanthomonas albilineans; Sporisorium scitamineum) e uma bactéria fixadora de nitrogênio (Gluconacetobacter) considerada promotora de crescimento para a cana. Esses organismos têm uma interação biotrófica/hemibiotrófica com cana de açúcar e os aspectos moleculares sob estas condições são geralmente menos compreendidas. O nosso objetivo é comparar e contrastar respostas moleculares através das interações individuais tanto de cana de açúcar quanto dos microrganismos envolvidos. Especificamente, (i) analisaremos padrões de expressão de um conjunto de genes previamente identificados análogos a genes de resistência (RGA), espécies reativas de oxigênio (ROS), metabolismo de carboidratos, síntese de hormônios e seu controle, elementos de transposição, e uma família de genes relacionados com a edição de genes em organelas e conhecido por ter membros que estão envolvidos na regulação das defesas de plantas via Na-siRNA (pentatricopeptide) bem como de genes envolvidos em respostas metabólicas específicas dos microrganismos; (ii) avaliar e comparar entre espécies de microrganismos os padrões de expressão de genes microbianos com um foco particular em moléculas secretadas entre os quais esperamos encontrar moléculas efetoras; (iii) avaliar e comparar as mudanças nos padrões de expressão durante duas infecções mistas, e (iv) avaliar e comparar as mudanças no microbioma do hospedeiro, como resultado da interação com os micróbios mencionados. Como um produto de extensão, esperamos fornecer informações moleculares sobre a biologia da cana ao interagir com vários micróbios almejando o desenvolvimento de um kit de diagnóstico para monitorar canaviais e construir um banco de dados "phytobiome" de cana que seja abrangente e que poderia ser usado em estudos comparativos com outras Poaceae.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (9) . , Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / Luis Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Claudia Barros Monteiro-Vitorello - Integrante / Silvana Creste - Integrante / Marcelo Zerillo - Integrante / Paula Turrini - Integrante / Juliane Ishida - Integrante / Tatiane Correa - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2009 - Atual
Genômica de cana de açúcar: elemetos de transposição contribuintes para diversidade gênica, genética e genômica, Descrição: Este projeto está integrado ao programa BioEn-FAPESP. A cana de açúcar é uma das fontes mais importantes para a produção de biocombustíveis no Brasil. Também ocupa posição de destaque no agronegócio do Estado de São Paulo. A produção de biocombustíveis a partir de cana de açúcar é dependente de sacarose como matéria prima. Espera-se que a indústria sucro alcooleira brasileira ganhe em competividade desde que haja um aumento de produtividade (biomassa) garantindo a preservação do meio ambiente evitando-se o uso de novas terras. Aumento de produção de biomassa pode ser atingido através do uso de técnicas que permitam o monitoramento e modulação do metabolismo de sacarose em condições adequadas e restritivas de crescimento da planta, como por exemplo condições de pouca disponibilidade de água. O uso potencial do bagaço como fonte de biomassa é dependente da disponibilização do carbono fixado nos polímeros que constituem a parede celular. O presente projeto tem como objetivo gerar um sequenciamento parcial de duas cultivares de cana de açúcar (R570 e SP80-3280) de modo a subsidiar o desenvolvimento de ferramentes moleculares que poderão auxiliar na compreensão deste genoma híbrido e poliplóide. A descoberta de genes e a identificação das regiões regulatórias envolvidas no metabolismo de sacarose e partição dos esqueletos de carbono na planta são algumas das áres na pesquisa básica que serão beneficiadas pelo presente estudo. Programas de melhoramento também poderão ser beneficiados tendo a cesso a informações moleculares com potencial ao desenvolvimento de marcadores moleculares. Os cultivares modernos de cana de açúcar são híbridos de Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum. Seu genoma monoplóide é estimado em aproximadamente 1Gb comparável em escala aos genomas do milho e do ser humano. Utilizar-se-á uma abordagem combinada de seqüências geradas por pirosequenciamento e pelo método clássico de Sanger de 1000 clones de BAC. Uma coleção de ESTs geradas pelo projeto. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (7) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1997 - Atual
Análise comparativa de genomas Bacterianos, Descrição: O grupo participou ativamente do sequenciamento e análise dos genomas bacterianos financiados pelo Programa Genoma ONSA/FAPESP. Neste contexto analisamos os elementos de transposição (TE) e ilhas genômicas associadas aos TEs, bacteriófagos e plasmídeos. O grupo tem especial interesse na compreensão da diversificação dos elementos e do impacto destes sobre a estabilidade e diferenciação dos genomas de organismos filogenéticamente próximos. Estudos de genômica comparativa entre diferentes linhagens patogênicas e não patogênicas são o foco central.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / C B Monteiro Vitorello - Integrante / Mariana Cabral de Oliveira - Integrante / Alessandro Varani - Integrante / Ana Tereza Vasconcelos - Integrante / Marcelo Zerillo - Integrante / Luis Eduardo Aranha Camargo - Integrante / Jonas Weissmann Gaiarsa - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / United States Department of Agriculture - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 21
1995 - Atual
Reparo de DNA em plantas, Descrição: Este projeto visa estudar diferentes aspectos de reparo de DNA e suas principais consequências para a célula: morte e mutagênese. Em células de mamíferos em cultura estamos desenvolvendo sistemas de vetores virais para o controle da expressão de genes de reparo de DNA. Estamos dedicando especial atenção à expressão do gene da fotoliase de marsupial em células humanas. Com estes estudos, conseguimos demonstrar que o sinal necessário para iniciar o estímulo de apoptose por UV em células humanas pode ser fotorreativado, o que indica a participação da lesão CPD (dímeros de pirimidina) e permite realizar uma série de investigações da sequência de eventos que levam a morte celular. Vetores ponte de replicação epissomal estão também sendo empregados em estudos de mutagênese, possibilitando a determinação da "assinatura" molecular de mutagênese de agentes como o oxigênio singlete e ozônio. Estamos também envolvidos em caracterizar genes envolvidos em reparo de DNA de plantas. Além de termos sido pioneiros na identificação de alguns desses genes em Arabidopsis (genes araXPB1 e arathi1), o início de busca em banco de dados do Projeto Genoma SUCEST, permitiu a identificação de vários genes de cana-de-açúcar, potencialmente homólogos aos genes humanos. A completa caracterização destes está em andamento. A equipe indicada está associada ao laboratório da Dra. MA Van Sluys, há outros integrantes no laboratório do Dr. Menck e Dr. Silva-Filho.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Integrante / D. Ribeiro - Integrante / Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Myna Nakabashi - Integrante / Marcio C Silva Filho - Integrante / Marisa Moura Momoli - Integrante / F. S. Papini Terzi - Integrante / Leonardo Paiva Farias - Integrante / Priscila Mayumi Kashiwabara - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 31
1989 - Atual
Elementos de transposição e seu impacto no genoma (GaTE), Descrição: Elementos de transposição são seqüências genéticas móveis responsáveis em parte por gerar variabilidade genética. Variabilidade esta gerada como conseqüência de capacidade intrínseca de mudar de lugar nos genomas em que se encontram associados. Este projeto pretende analisar o impacto destes elementos em genomas de plantas e em bactérias. A abordagem experimental será diversificada uma vez que elementos distintos e com conhecimento inerente heterogêneo são a base deste projeto. Em plantas, daremos continuidade aos trabalhos iniciados pelo grupo quando do isolamento e caracterização do retrotransposon Retrolyc1 e o estudo estará centrado no controle da expressão do elemento em nível transcricional. Ainda no contexto de Solanaceae, iniciaremos uma busca por retroelementos em plantas silvestres e cultivadas de Solanum dando ênfase ao estudo do polimorfismo de inserção associado à ploidia e domesticação das espécies selecionadas. A partir do projeto SUCEST foram identificadas 21 famílias de elementos de transposição presentes e expressos no genoma de cana de açúcar. Pretendemos aprofundar os estudos em quatro destas famílias sendo elas a família dos transposons do tipo Mu e hAT, assim como dos retroelementos Tnt1 e Hopscotch. De um lado, será avaliada a atividade de transposição destes elementos e também a contribuição dos progenitores em elementos de transposição na constituição do genoma híbrido de cana de açúcar. A função integrase é uma atividade protéica associada ao corte da cadeia fosfodiéster da molécula de DNA e é comum as transposases, recombinases e integrases, sendo que o que as diferencia é o modo em que o corte é efetivamente gerado na molécula. O estudos das integrases presentes nos genomas bacterianos tem como objetivo a identificação das famílias e das regiões associadas de quatro linhagens de Xylella fastidiosa. Nosso objetivo central é a compreensão da diversificação dos elementos e do impacto destes sobre a estabilidade e diferenciação dos genomas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Marie-Anne Van Sluys - Coordenador / Maria Magdalena Rossi - Integrante / Ana Paula Pimentel Costa - Integrante / Regina Yuri Hashimoto Miura - Integrante / Erika Maria de Jesus - Integrante / Alessandro Varani - Integrante / Douglas Silva Domingues - Integrante / Maria Elisa Manetti - Integrante / Bruno Karolski - Integrante / Nilo Saccaro - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 73
Prêmios
2016
Membro Titular da ABC, Academia Brasileira de Ciências.
2015
Membro Titular da ACIESP, ACIESP.
2005
Menção Honrosa pelo projeto de IC desenvolvido por Nilo Saccaro-Junior, 13 SICUSP.
2000
Medalha de Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.
2000
Professora homenageada do Departamento, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.
2000
Prêmio Mulher do Ano juntamente com Elizabeth Martins, Ana Claudia Rasera, Anamaria A. Camargo, Claudia Monterio-Vitorello, Marilis Marques Valle e Mariana C de Oliveira, Revista Cláudia.
1997
Menção honrosa pelo projeto de Iniciação Científica desenvolvido por L. P. Farias, 5 SICUSP.
1997
Professora Homenageada do Departamento de Botänica, Pelos Formandos em Ciëncias Biológicas.
1995
Patronesse da Turma de Formandos em Ciências Biológicas, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.
1994
Professora homenageada do Departamento, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.
1993
Professora homenageada do Departamento, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.
1992
Professora homenageada do Departamento de Botânica, Pelos Formandos em Ciências Biológicas.
Histórico profissional
Endereço profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica. , rua do matão, 277, Cidade Universitaria, 05508090 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30917759, Fax: (11) 30917724, URL da Homepage:
Experiência profissional
2007 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professora Titular, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Aprovada em concurso realizado em 9 e 10 de novembro de 2006. Resultado do concurso publicado no DOE em 8 de janeiro de 2007.
2002 - 2007
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professora Associada, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
1989 - 2002
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professora Doutora, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
Ensino, Ciências Moleculares, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, CCM221
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Comissão Coordenadora do Curso de Ciências Moleculares como Representante do Instituto.
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Linhas de pesquisa
Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Responsável pelo Laboratório de Biologia Molecular de Plantas.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Membro da Comissão Interna de Pós Graduação, área de Botânica.
Ensino, Ciências Biológicas (Botânica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, BIB5702 - Introns e Elementos transponíveis, BIB 5709 - Genômica, BIB5764 - Genética Molecular Vegetal, BIB5786 - Interação Ambiente-Desenvolvimento Vegetal: variações hormonais e da expressão gênica
Ensino, Ciências Bilógicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BIB131 - Fisiologia Vegetal, BIB135 - Relações hídricas e metabólicas em plantas, BIB525 - Biologia Molecular de Plantas
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Presidente da Comissao de Pesquisa do IBUSP a partir de 02/2006.
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, IBI5022 - Biologia Molecular
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Vice coordenadora de Pós Graduação em Botânica.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Representante do Instituto junto a Comissão Interunidades em Biotecnologia.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Membro Represante dos Docentes Doutores.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Membro do Grupo de Estudo sobre Plantas Transgênicas da Universidade de São Paulo-PRP.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Vice-Coordenadora de Pós-Graduação no Programa de Botânica.
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Cargo ou função, Membro da Comissão Setorial de Biotecnologia da Secretaria de Ciência e Tecnologia do Estado de São Paulo.
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Linhas de pesquisa
Ensino, Ciências Bilógicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisiologia dos Hormônios Vegetais
1990 - 1990
Centre National de la Recherche ScientifiqueVínculo: Pesquisador visitante, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40
Outras informações:
Bolsista BID/USP
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento, Institut Des Sciences Végétales, Gif Sur Yvette.,Linhas de pesquisa
1984 - 1984
Universidade do Estado do Rio de JaneiroVínculo: Bolsista de Aperfeiçoamento Ci, Enquadramento Funcional: Bolsista de Aperfeiçoamento Científico do CNP, Carga horária: 40
Outras informações:
Bolsista de Aperfeiçoamento Científico do CNPq.
Atividades
Pesquisa e desenvolvimento, Universidade do Estado do Rio de Janeiro.,Linhas de pesquisa
Patentes (2)
| Tipo | Título | Data depósito |
|---|---|---|
| INVENTOR | Retroprom, método de obtenção de retroprom e uso de retroprom | 27/10/2004 |
| INVENTOR | Protéinas de superfície de leptospira | 28/02/2003 |
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