Rodrigo Siqueira de Souza

I'm a licensed biologist from University of Brazil (Federal University of Rio de Janeiro--UFRJ), M.Sc in Neuroscience by the Biomedical Sciences Institute of University of Brazil (ICB/UFRJ) and doing my Ph.D in Cybernetics at University of Reading. Experienced in Computational Neuroscience, Evolution of the Brain, Bioinformatics (Molecular Docking and Rational Drug Design), Astrobiology and Paleontology (most three-Dimentional Modeling usages and vertebrates paleontology). My current research is about cultured neuronal networks linked to a robot body, we will train it to learn some motor skills. The main objective being to make a disruption in the neuronal culture in order to simulate a stroke to finally treat it with stem cells and see in detail how the treatment enables the robot regain its previous capabilities. This research is being conducted at the Brain Embodiment Lab at the University of Reading under the mentoring of Prof. Slawomir Nasuto and Dr. Evangelos Delivopoulos. It is being funded by the National Counsel of Technological and Scientific Development of the Brazilian with a scholarship as part of the Science Without Borders program.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Cybernetics

2014 - Atual

University of Reading
Título: An Animat as a model of stem cell therapy on neuronal networks damaged by stroke.,
Orientador: Dr. Slawomir Nasuto
Coorientador: Dr. Evangelos Delivopoulos. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Animat; Brain-machine interfaces; Cultured Neuronal Networks; MEA; Stroke.Grande área: Ciências da SaúdeGrande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Cybernetics.

Mestrado em Ciências Morfológicas - Neurociência

2011 - 2013

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Quantitative analysis of cellular composition rules of the brains of the Artidactyla order.,Ano de Obtenção: 2013
Suzana Herculano-Houzel.Coorientador: Bruno Mota. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Neurobiologia Computacional; Evolução; Neuroanatomia; Cetartiodatcyla.

Mestrado interrompido em 2010 em Modelagem Computacional

2010 - Interrompido

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: N/A,Orientador: Laurent Emmanuel Dardenne
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Ano de interrupção: 2010Palavras-chave: Rational Drug Design; Molecular Docking; Computational Biology; Bioinformatics.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Ciências Biológicas (Licenciatura)

2005 - 2009

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Ensino Médio (2º grau)

2002 - 2004

Sistema Elite de Ensino

Ensino Fundamental (1º grau)

1998 - 2001

Colégio Pentágono

Ensino Fundamental (1º grau)

1994 - 1998

Centro Educacional Mallet

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Formação complementar

2016 - 2016

Effective CVs How to impress both employers within and outside. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2016 - 2016

Working with the media. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2016 - 2016

How to get published. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2015 - 2015

Academic writing skills for non-native speakers. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2015 - 2015

Quality assurance in research. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2015 - 2015

? Career Journey: from PhD to Research and Enterprise Development. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2014 - 2015

Introduction to the Russian Language. (Carga horária: 300h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2014 - 2014

Introduction to MATLAB. (Carga horária: 6h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2014 - 2014

Ethical considerations in preclinical biomedical research. (Carga horária: 4h). , University of Reading, UR, Inglaterra.

2012 - 2012

Introduction to Astrobiology. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2011 - 2011

Neurogeriatrics. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuroanatomy. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuroimaging. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Research Methodology and Ethics. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Statistics applied to Clinical Research. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuropsychopharmacology. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuroeconomy. (Carga horária: 15h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuropsychology. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Neuropsychiatry. (Carga horária: 30h). , Instituto D'Or, ID'OR, Brasil.

2011 - 2011

Advanced Introduction to Artificial Intelligence. (Carga horária: 40h). , Udacity, UDA, Estados Unidos.

2010 - 2010

Elements of Programming. (Carga horária: 16h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

Molecular Biology. (Carga horária: 60h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

Differential and Integral Calculus. , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Shell Script Programming. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Trophic networks dynamics. (Carga horária: 23h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

XML for Bioinformatics. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Knowledge Representation Systems. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

1997 - 1998

DOS , Windows, Word, Excel, Internet, etc.. , A.S.P Training Group, A.S.P, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Japonês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

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Participação em eventos

CSN School on Neurotechniques.An animat as a model for stem cell repair in neuronal networks damaged by stroke. 2015. (Oficina).

Latin American School of Computational Neuroscience (LASCON IV).Do natural stimuli drive the development of topographic maps?. 2012. (Outra).

Jornada de Pós-Graduação (ICB-UFRJ).Esculpindo o Cérebro: um modelo baseado na ontogenia do sistema nervoso.. 2011. (Simpósio).

Frontiers in Neuroscience Symposium. 2010. (Simpósio).

Programa de Verão em Modelagem Computacional do LNCC. 2009. (Oficina).

Encontro Nacional dos Estudantes de Biologia. 2006. (Encontro).

III Jornada Fluminense de Paleontologia. 2006. (Seminário).

Ciclo de Palestras do Dia da Árvore. 2005. (Encontro).

XVII Jornada de Embriologia(registro E-024 na UFRJ - sr5).XVII Jornada de Embriologia. 2005. (Seminário).

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Comissão julgadora das bancas

Carolina Moreira Voloch

Voloch, Carolina M.. Analise Quantitativa das regras de composição celular de encéfalos de Artiodáctilos. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Morfológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Carolina Moreira Voloch

Menezes, J. R. L.;Voloch, C. M.. Análise Quantotativa das regras de composição celular de encéfalos de Artiodáctilos. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Morfológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Olavo Bohrer Amaral

AMARAL, O B; MENEZES, J; VOLOCH, C. Análise quantitativa das regras de composição celular de encéfalos de Artiodáctilos. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Morfológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

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Foi orientado por

Suzana Carvalho Herculano Houzel

Regras celulares de alometria do encéfalo de artiodáctilos; 2013; Dissertação (Mestrado em Programa de Ciências Morfológicas (PCM)- Universidade Federal do Rio de Jan) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Suzana Carvalho Herculano Houzel;

Lílian Paglarelli Bergqvist

Vinculada ao projeto UFRJ ?Paleobiologia dos Vertebrados Fósseis Sul-americanos?; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Lílian Paglarelli Bergqvist;

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Produções bibliográficas

  • Kazu, RODRIGO S. ; MALDONADO, JOSé ; MOTA, BRUNO ; MANGER, PAUL R. ; HERCULANO-HOUZEL, SUZANA . Cellular scaling rules for the brain of Artiodactyla include a highly folded cortex with few neurons. Frontiers in Neuroanatomy , v. 8, p. 128, 2014.

  • Kazu, R.S ; Dardon, Ulisses ; Abranches, Carla Terezinha ; Bergqvist, Lílian . Modelagem 3D e suas aplicações na pesquisa paleontológica. Gaea (São Leopoldo. Online) , v. 6, p. 76-89, 2010.

  • Mello, G.P ; DIAS, W. S. ; LEPINE, J. ; Lorenzo-Oliveira, D. ; Kazu, R.S . Mass extinctions, galactic orbits in the solar neighborhood and the Sun: a connection?. 2013. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • MOTA, B. ; Kazu, R.S ; NEVES, K. ; HERCULANO-HOUZEL, S. . Algebraic tests for a model for emergent order in neuronal network through selective neuronal and synaptic death. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

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Outras produções

Kazu, R.S . The Science Cookbook. 2012; Tema: Scientific Propagation. (Blog).

Kazu, R.S . Tutoring at Zoology IV course. 2007. (Tutoring).

Guilherme Lopes ; Kazu, R.S ; Ricardo Oliveira ; André Hoffman ; Bruno Clarkson ; Diogo Tinoco ; Vinícius Ramalho . Show com a banda Abzurah. 2007. Interpretação.

Kazu, R.S ; Ricardo Oliveira ; Guilherme Lopes ; Vinícius Ramalho ; Bruno Clarkson ; Diogo Tinoco ; André Hoffman . Show com a banda Abzurah.. 2007. Interpretação.

André Hoffman ; Bruno Clarkson ; Kazu, R.S ; Diogo Tinoco ; Guilherme Lopes ; Ricardo Oliveira ; Vinícius Ramalho . Show com a banda Abzurah. 2006. Interpretação.

Kazu, R.S ; Thiago Domingues ; Sergio Cleto ; Rodrigo Furman ; Maíra Mattos ; Guilherme Rosa . Show com a banda Akai Tsuki. 2006. Interpretação.

Kazu, R.S ; Sergio Cleto ; Thiago Domingues ; Guilherme Rosa ; Maíra Mattos ; Pedro Rosa . Show com a banda Akai Tsuki. 2006. Interpretação.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • University of Reading, School of Systems Engineering. , Brain Embodiement Laboratory, Shinfield Park, RG66AX - Reading, - Inglaterra, Telefone: (44) 7768386007, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2016 - Atual

    University of Reading

    Vínculo: Formal labor contract, Enquadramento Funcional: Warden assistant for Childs Hall, Carga horária: 15

  • 2016 - Atual

    University of Reading

    Vínculo: Formal labor contract, Enquadramento Funcional: Tutor in the Programming module, Carga horária: 4

  • 2014 - Atual

    Brain Embodiment Laboratory

    Vínculo: Scholarship, Enquadramento Funcional: PhD researcher, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Title of the thesis: An animat as a model for stem cell repair in neural networks damaged by stroke. Doctorate in Cybernetics fully funded by CNPq as part of the Science Without Border program.

  • 2010 - 2013

    Comparative Neuroanatomy Lab

    Vínculo: Graduate Student Internship, Enquadramento Funcional: Master of Science Student, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Dissertation Title: Quantitative analysis of cellular composition rules in the brains of the order Artiodactyla. Advisor: Suzana Herculano-Houzel. Sponsored by: Coordination of Improvement for Higher Education Personnel (CAPES).

  • 2010 - 2010

    Laboratório Nacional de Computação Científica

    Vínculo: Graduate Student Internship, Enquadramento Funcional: Master of Science Student, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Master's Research with Rational Drug Design and Molecular Docking of Proteins using the Autodock software. Sponsored by: Coordination of Improvement for Higher Education Personnel (CAPES).

  • 2009 - 2010

    Laboratório Nacional de Computação Científica

    Vínculo: Internship, Enquadramento Funcional: Undergraduate student research, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Undergraduate student voluntary internship at the Group of Molecular Modeling of Biological Systems at LNCC.

  • 2008 - 2008

    Colégio de Aplicação da UFRJ

    Vínculo: Undergraduate internship, Enquadramento Funcional: Assistant Professor, Carga horária: 7, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Internship at the Application School of UFRJ, teaching and preparing classes, helping students among other activities.

  • 2008 - 2009

    Laboratório de Macrofósseis (UFRJ)

    Vínculo: Undergraduate Student, Enquadramento Funcional: Research on Three Dimensional Modeling, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Undergraduate Student working on applications of Three Dimensional Modeling on the paleontological research. Advised by professor Lilian Bergqvist and sponsored by CNPq.