Thaís Ribeiro Santiago

Pós-doutorado

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Orientou

Produções bibliográficas

• FURTADO, LEILA LOURENÇO ; REGO-MACHADO, CAMILA DE MORAES ; PEIXOTO, GUSTAVO HENRIQUE SILVA ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO . Polyphasic identification of surgacane root-knot nematodes from ten municipalities in São Paulo State, Brazil. Tropical Plant Pathology , v. 1, p. 1, 2023.

• TOUZDJIAN PINHEIRO KOHLRAUSCH TÁVORA, FABIANO ; DE ASSIS DOS SANTOS DINIZ, FRANCISCO ; DE MORAES RÊGO-MACHADO, CAMILA ; CHAGAS FREITAS, NATÁLIA ; BARBOSA MONTEIRO ARRAES, FABRÍCIO ; CHUMBINHO DE ANDRADE, EDUARDO ; FURTADO, LEILA LOURENÇO ; OSIRO, KAREN OFUJI ; LIMA DE SOUSA, NATÁLIA ; CARDOSO, THIAGO BÉRGAMO ; MÁRCIA MERTZ HENNING, LILIANE ; ABRÃO DE OLIVEIRA MOLINARI, PATRÍCIA ; FEINGOLD, SÉRGIO ENRIQUE ; HUNTER, WAYNE B. ; FÁTIMA GROSSI DE SÁ, MARIA ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; LIMA NEPOMUCENO, ALEXANDRE ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; CORREA MOLINARI, HUGO BRUNO . CRISPR/Cas- and Topical RNAi-Based Technologies for Crop Management and Improvement: Reviewing the Risk Assessment and Challenges Towards a More Sustainable Agriculture. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 10, p. 1-20, 2022.

• DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; BASSO, MARCOS FERNANDO ; DE OLIVEIRA, NELSON GERALDO ; DA SILVA, JOSÉ CLEYDSON FERREIRA ; DE OLIVEIRA GARCIA, BRUNO ; CUNHA, BÁRBARA ANDRADE DIAS BRITO ; CARDOSO, THIAGO BERGAMO ; NEPOMUCENO, ALEXANDRE LIMA ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; DE SOUZA, WAGNER RODRIGO ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . MicroRNAs expression profiles in early responses to different levels of water deficit in Setaria viridis. PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY OF PLANTS , v. 1, p. 1607-1624, 2022.

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• RIBEIRO, ANA PAULA ; VINECKY, FELIPE ; DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; DAS CHAGAS NOQUELI CASARI, RAPHAEL AUGUSTO ; HELL, ALINE FORGATTI ; DA CUNHA, BÁRBARA ANDRADE DIAS BRITO ; MARTINS, POLYANA KELLY ; DA CRUZ CENTENO, DANILO ; DE OLIVEIRA MOLINARI, PATRICIA ABRÃO ; DE ALMEIDA CANÇADO, GERALDO MAGELA ; MAGALHÃES, JURANDIR VIEIRA DE ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; DE SOUZA, WAGNER RODRIGO ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . Enhanced aluminum tolerance in sugarcane: evaluation of SbMATE overexpression and genome-wide identification of ALMTs in Saccharum spp.. BMC PLANT BIOLOGY , v. 21, p. 1-15, 2021.

• BASSO, MARCOS FERNANDO ; DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; SANTIAGO, THAIS RIBEIRO ; DE SOUZA, WAGNER RODRIGO ; GARCIA, BRUNO DE OLIVEIRA ; DA CUNHA, BÁRBARA DIAS BRITO ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . Efficient genome editing and gene knockout in Setaria viridis with CRISPR/Cas9 directed gene editing by the non-homologous end-joining pathway. Plant Biotechnology , v. 1, p. 1-12, 2021.

• FURTADO, LEILA LOURENÇO ; REGO-MACHADO, CAMILA DE MORAES ; MARIN-RAMIREZ, GUSTAVO ; FREITAS, NATÁLIA CHAGAS ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO . CRISPR/CAS: do sistema imune de procariotos ao controle de doenças de plantas. REVISAO ANUAL DE PATOLOGIA DE PLANTAS , v. 27, p. 7-31, 2021.

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• DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; DE SOUZA, WAGNER RODRIGO ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; SAMPAIO, BRUNO LEITE ; RIBEIRO, ANA PAULA ; COTTA, MICHELLE GUITTON ; DA CUNHA, BÁRBARA ANDRADE DIAS BRITO ; MARRACCINI, PIERRE ROGER RENÉ ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . Identification and characterization of core abscisic acid (ABA) signaling components and their gene expression profile in response to abiotic stresses in Setaria viridis. Scientific Reports , v. 9, p. 4028, 2019.

• SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; BONATTO, CÍNTHIA CAETANO ; ROSSATO, MAURÍCIO ; LOPES, CLÁUDIO AFONSO PINHO ; LOPES, CARLOS ALBERTO ; MIZUBUTI, EDUARDO SEITI GOMIDE ; SILVA, LUCIANO PAULINO . Green synthesis of silver nanoparticles using tomato leaves extract and their entrapment in chitosan nanoparticles to control bacterial wilt. JOURNAL OF THE SCIENCE OF FOOD AND AGRICULTURE , v. 1, p. 1-19, 2019.

• SOUZA, WAGNER RODRIGO ; OLIVEIRA, NELSON GERALDO ; VINECKY, FELIPE ; RIBEIRO, ANA PAULA ; BASSO, MARCOS FERNANDO ; CASARI, RAPHAEL AUGUSTO DAS CHAGAS NOQUELI ; CUNHA, BÁRBARA ANDRADE DIAS BRITO ; DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; MARTINS, POLYANA KELLY ; AUCIQUE'PEREZ, CARLOS EDUARDO ; JÚNIOR, SÍLVIO CARLOS CRISTOFOLETTI ; NEPOMUCENO, ALEXANDRE LIMA ; SOUSA, CARLOS ANTÔNIO FERREIRA ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; NAKASHIMA, KAZUO ; YAMAGUCHI'SHINOZAKI, KAZUKO ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . Field evaluation of overexpressing sugarcane for drought tolerance. JOURNAL OF AGRONOMY AND CROP SCIENCE , v. 01, p. jac.12341, 2019.

• DE SOUZA, WAGNER RODRIGO ; PACHECO, THÁLYTA FRAGA ; DUARTE, KAROLINE ESTEFANI ; SAMPAIO, BRUNO LEITE ; DE OLIVEIRA MOLINARI, PATRÍCIA ABRÃO ; MARTINS, POLYANA KELLY ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; FORMIGHIERI, EDUARDO FERNANDES ; VINECKY, FELIPE ; RIBEIRO, ANA PAULA ; DA CUNHA, BÁRBARA ANDRADE DIAS BRITO ; KOBAYASHI, ADILSON KENJI ; MITCHELL, ROWAN ANDREW CRAIG ; DE SOUSA RODRIGUES GAMBETTA, DASCIANA ; MOLINARI, HUGO BRUNO CORREA . Silencing of a BAHD acyltransferase in sugarcane increases biomass digestibility. Biotechnology for Biofuels , v. 12, p. 111, 2019.

• ROLIM, LUCAS ; SANTIAGO, THAÍS RIBEIRO ; DOS REIS JUNIOR, FÁBIO BUENO ; DE CARVALHO MENDES, IEDA ; DO VALE, HELSON MARIO MARTINS ; HUNGRIA, MARIANGELA ; SILVA, LUCIANO PAULINO . Identification of soybean Bradyrhizobium strains used in commercial inoculants in Brazil by MALDI-TOF mass spectrometry. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 1, p. 23, 2019.

• SANTIAGO, THAÍS R. ; PEREIRA, VALQUIRIA M. ; DE SOUZA, WAGNER R. ; STEINDORFF, ANDREI S. ; CUNHA, BÁRBARA A. D. B. ; GASPAR, MARÍLIA ; FÁVARO, LÉIA C. L. ; FORMIGHIERI, EDUARDO F. ; KOBAYASHI, ADILSON K. ; C. MOLINARI, HUGO B. . Genome-wide identification, characterization and expression profile analysis of expansins gene family in sugarcane (Saccharum spp.). PLoS One , v. 13, p. e0191081, 2018.

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• NAKAYAMA, THIAGO J. ; RODRIGUES, FABIANA A. ; NEUMAIER, NORMAN ; MARCOLINO-GOMES, JULIANA ; MOLINARI, HUGO B. C. ; SANTIAGO, THAÍS R. ; FORMIGHIERI, EDUARDO F. ; BASSO, MARCOS F. ; FARIAS, JOSÉ R. B. ; EMYGDIO, BEATRIZ M. ; DE OLIVEIRA, ANA C. B. ; CAMPOS, ÂNGELA D. ; BORÉM, ALUÍZIO ; HARMON, FRANK G. ; MERTZ-HENNING, LILIANE M. ; NEPOMUCENO, ALEXANDRE L. . Insights into soybean transcriptome reconfiguration under hypoxic stress: Functional, regulatory, structural, and compositional characterization. PLoS One , v. 12, p. e0187920, 2017.

• Basso, M. F. ; CUNHA, B.A.D.B. ; Ribeiro, A. P. ; Martins, P. K. ; SOUZA, W. R. ; OLIVEIRA, N. G. ; Nakayama, T. J. ; CASARI, R. A.C. N. ; SANTIAGO, T. R. ; VINECKY, F. ; CANÇADO, L. J. ; SOUSA, C. A. F. ; OLIVEIRA, P. A. ; SOUZA, S. A. C. D. ; CANÇADO, G. M. A. ; KOBAYASHI, A. K. ; MOLINARI, H. B. C. . Improved Genetic Transformation of Sugarcane (Saccharum spp.) Embryogenic Callus Mediated by Agrobacterium tumefaciens. Current Protocols in Stem Cell Biology , v. 2, p. 221-239, 2017.

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• SANTIAGO, T. R. ; GARCIA, F. A. O ; ROMEIRO, R. S. ; FERRAZ, H. G. M. ; SOUZA, A. N. ; FREITAS, M. A. . Controle biológico do crestamento bacteriano em dois cultivares de feijoeiro, pelo uso de procariotas residentes de filoplano.. In: XVIII Simpósio de Iniciação Científica ? SIC, 2008, Viçosa- MG. SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008. Viçosa, 2008.

• SANTIAGO, T. R. ; ROMEIRO, R. S. ; GARCIA, F. A. O ; FERRAZ, H. G. M. ; REZENDE, L. C ; FREITAS, M. A. ; SOUZA, A. N. . Rizobactérias como promotoras de crescimento em plantas de arroz. In: SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008, 2008, Viçosa. SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008, 2008.

• REZENDE, L. C ; SANTIAGO, T. R. ; ROMEIRO, R. S. ; GARCIA, F. A. O ; FERRAZ, H. G. M. ; SOUZA, A. N. ; FREITAS, M. A. . Bioensaios para avaliação da potencialidade antagonística de rizobactérias contra Bipolaris oryzae.. In: SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008, 2008, Viçosa- MG. SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008. Viçosa, 2008.

• SOUZA, A. N. ; ROMEIRO, R. S. ; FREITAS, M. A. ; FERRAZ, H. G. M. ; GARCIA, F. A. O ; SANTIAGO, T. R. . Indução de Síntese de Gliceolina em Cotilédones de Soja por Metabólitos e Extratos de Células de Duas Estirpes de Bacillus cereus, Previamente Selecionadas como Agentes de Biocontrole de Doenças do Feijoeiro. In: SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008, 2008, Viçosa- MG. SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008. Viçosa - MG, 2008.

• FREITAS, M. A. ; ROMEIRO, R. S. ; GARCIA, F. A. O ; SOUZA, A. N. ; FERRAZ, H. G. M. ; GODINHO, M. T. ; SANTIAGO, T. R. . Inibição da germinação de uredosporos de Phakopsora pachyrhizi por procariotas residente do filoplano de soja. In: SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008, 2008, Viçosa - MG. SIC/SIMPÓS/SEU/SEn-2008. Viçosa - MG, 2008.

• SANTIAGO, T. R. ; FERNANDES, M. B. ; Nogueira, Sônia Regina ; Fernandes-Carrijo,Fernanda Rausch ; BROMMONSCHENKEL, S. H. . Reação de cultivares de soja (Glycine max (L.) Merril) ao agente causal da ferrugem asiática (Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow) em casa-de-vegetação. In: XXXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador. Reação de cultivares de soja (Glycine max (L.) Merril) ao agente causal da ferrugem asiática (Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow) em casa-de-vegetação. Brasília: Fitopatologia Brasileira, 2006. v. 31. p. 313-313.

• FERNANDES, M. B. ; LEÃO,A.P ; COSTA,B.V ; SANTIAGO, T. R. ; Nogueira, Sônia Regina ; Fernandes-Carrijo,Fernanda Rausch . Efeito do armazenamento de uredósporos de Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow na germinação e viabilidade.. In: XXXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador. Efeito do armazenamento de uredósporos de Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow na germinação e viabilidade.. Brasília: Fitopatologia Brasileira, 2006. v. 31. p. 314-315.

• COSTA,B.V ; LEÃO,A.P ; SANTIAGO, T. R. ; FERNANDES, M. B. ; Fernandes-Carrijo,Fernanda Rausch ; Nogueira, Sônia Regina ; BROMMONSCHENKEL, S. H. . Efeito in vitro em diferentes temperturas na germinação de uredósporos de Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow.. In: XXXIX Congresso Brsileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador. Efeito in vitro em diferentes temperturas na germinação de uredósporos de Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow.. Brasília: Fitopatologia Brasileira, 2006. v. 31. p. 313-313.

• Fernandes-Carrijo,Fernanda Rausch ; Nogueira, Sônia Regina ; SANTIAGO, T. R. ; CARNEIRO, ; BROMMONSCHENKEL, S. H. . Reação de genótipos de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) ao agente causal da ferrugem da soja (Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow). In: XXXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador. Reação de genótipos de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) ao agente causal da ferrugem da soja (Phakopsora pachyrhizi Sydow & P. Sydow). Brasília: Fitopatologia Brasileira, 2006. v. 31. p. 348-348.

• SANTIAGO, T.R. . Setaria viris como planta modelo para estudos de genômica funcional de plantas C4. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTIAGO, T.R. . Crispr-Cas9: Do sistema imune de procariotos à edição de genomas. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SANTIAGO, THAIS R. . Um panorama atualizado do complexo Ralstonia solanacearum. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTIAGO, THAIS R. . Diversidade e variabilidade de Ralstonia no Brasil. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SANTIAGO, THAIS R. ; Mizubuti, E. S. G. ; Lopes, C. A. . Genetic characterization of Ralstonia causing bacterial wilt in Brazil. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTIAGO, THAIS R. . Genetic characterization of Ralstonia causing bacterial wilt in Brazil. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTIAGO, T. R. ; GARCIA, F. A. O ; FERRAZ, H. G. M. ; FREITAS, M. A. ; SOUZA, A. N. ; GODINHO, M. T. ; SOUSA, L. O. ; ROMEIRO, R. S. . Antagonismo direto detectado em rizobactérias isoladas de rizosfera de arroz contra Bipolaris oryzae. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SANTIAGO, T. R. ; GARCIA, F. A. O ; FERRAZ, H. G. M. ; FREITAS, M. A. ; SOUZA, A. N. ; GODINHO, M. T. ; SOUSA, L. O. ; HILST, P. C. ; OLIVEIRA, G. L. ; DIAS, D. C. F. S. ; ROMEIRO, R. S. . Seleção Massal de rizobactérias autóctones em arroz para promoção de crescimento. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Utilização da ferramenta CRISPR/Cas9 para edição gênica de tomate (Solanum lycopersicum) visando a resistência múltipla a doenças rumo a um manejo mais sustentável, Descrição: Recentemente, esforços têm focado no desenvolvimento da Bioeconomia, área que reúne todos os setores produtivos que utilizam recursos biológicos de maneira racional e sustentável. Esse mercado destina-se a oferecer soluções coerentes, eficazes e concretas para os grandes desafios sociais, como as mudanças climáticas, substituição de recursos fósseis, segurança alimentar e saúde da população. Essa atividade econômica é dependente de pesquisa em biociências e visa transformar o conhecimento e novas tecnologias em inovação para indústria e sociedade. Neste contexto, a presente proposta visa apresentar soluções tecnológicas para o controle e manejo sustentável de importantes fitopatógenos que afetam a cultura do tomate (Solanum lycopersicum), de grande relevância para o DF, contribuindo assim para a Bioeconomia da região. Pretende-se desenvolver estratégias inovadoras utilizando a tecnologia de edição gênica CRISPR/Cas9 para o controle de importantes doenças que afetam o tomateiro incluindo a mancha bacteriana (com foco na espécie Xanthomonas euvesicatoria pv. perforans), begomovirose (ToCMoV, ToRSV e outros begomovirus), mofo-cinzento (Botrytis cinerea) e oídio (Oidium neolycopersici e Oidiopsis haplophylli). Para a prospecção de genes potencialmente envolvidos na suscetibilidade do tomate aos diferentes patógenos, exploraremos os dados transcriptômicos disponíveis nos bancos de dados públicos, por exemplo NCBI, Sol Genomics Network e Phytozome para a realização de uma meta-análise de dados transcriptômicos das diferentes interações (tomateiro-begomovirus, -Oidium neolycopersici / Oidiopsis haplophylli, -X. euvesicatoria pv. perforans e -Botrytis cinerea). Com base em perfis de expressão diferencial in silico, bem como em achados relevantes da literatura, 20-30 genes candidatos específicos e comumente identificados nas diferentes interações serão selecionados e sua expressão será avaliada por RT-qPCR. Após a validação da expressão dos genes candidatos, RNAs guia (gRNAs) serão desenhados in silico e os vetores CRISPR/Cas9 (simples e/ou multiplexado, i.e. contendo um ou mais gRNAs) serão clonados para a posterior transformação e edição gênica de plantas de tomate. Espera-se com esta proposta obter plantas de tomate resistentes a múltiplos patógenos de importância econômica. A equipe desta proposta conta com a expertise de vários pesquisadores em diferentes áreas do conhecimento incluindo Biologia Molecular, Bioinformática, Fitopatologia, Cultura de Tecidos e Edição gênica. Contamos com a colaboração do Dr. Manuel Cordones da Universidade de Murcia, Espanha que vem trabalhando com edição gênica em tomate. Os vetores multiplex a serem utilizados neste estudo serão gentilmente fornecidos pelo Dr. Christophe Perin e Anne Cécile Mounier do Cirad, França com quem temos colaborado no tema de edição gênica. Espera-se com este projeto gerar plantas de tomate editadas com resistência múltipla a fitopatógenos, levando à diminuição das perdas de produtividade da cultura e redução na aplicação de agrotóxicos na lavoura. Trata-se do desenvolvimento de um produto com baixo impacto ao meio ambiente, estando assim totalmente alinhado às premissas da Bioeconomia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Integrante / ROSSATO, MAURICIO - Integrante / Leonardo Silva Boiteux - Integrante / Marisa Álvares da Silva Velloso Ferreira - Integrante / Alice Maria Quezado Duval - Integrante / Maria Fátima Grossi de Sá - Integrante / Luiz Eduardo Bassay Blum - Integrante / Angela Mehta dos Reis - Coordenador / Cristiano Castro Lacorte - Integrante / Simone da Graca Ribeiro - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Distrito Federal - Auxílio financeiro.

• 2023 - Atual

  Controle do nematoide das lesões via mecanismos de RNA interferente: desenvolvimento de ferramentas de biotecnologia e metodologia de screening na busca de moléculas-alvo, Descrição: Os nematoides das lesões, em especial Pratylenchus brachyurus e P. zeae, estão, atualmente, entre os principais problemas fitossanitários da agricultura brasileira por possuírem ampla gama de hospedeiros (fator que dificulta a rotação de culturas) de alta relevância econômica (p.ex. soja, cana-de-açúcar e milho), por causarem danos irreversíveis, reduzirem substancialmente a produtividade e pelo fato de as medidas de controle tradicionalmente estudadas não serem efetivas e sustentáveis. Esse projeto foi concebido para gerar informação e produtos para a proteção da cultura da soja e cana-de-açúcar contra o nematoide das lesões radiculares via mecanismo de RNA interferente. O projeto tem como foco a geração de plantas transgênicas com resistência a P. brachyurus e P. zeae e o desenvolvimento de estratégias de screening disruptivas com objetivo de descobrir novas moléculas-alvo que interfiram negativamente no ciclo de vida do nematoide. Plantas transformadas de soja e cana-de-açúcar, contendo sequências genômicas das duas espécies de Pratylenchus, serão avaliadas quanto à resistência contra os fitonematoides. Busca-se uma resistência duradoura, eficiente e, se possível, mais ampla ao nematoide da lesão radicular. As sequências dos fitonematoides escolhidas têm alta identidade com sequências de vários desses fitonematoides que infectam as culturas alvo do trabalho no Distrito Federal e restante do país. Cana-de-açúcar e soja transgênicas foram produzidas e encontram-se em fase de teste. A predição de moléculas-alvo ocorrerá por meio do: (i) Desenvolvimento de uma plataforma de triagem de alto desempenho para a identificação de moléculas de dupla fita de RNA (dsRNA) capazes de controlar e mitigar os efeitos nefastos causados por P. zeae e P. brachyurus; e a (ii) Predição computacional das interações proteína-proteína (nematoide-hospedeiro) para um melhor entendimento das relações complexas entre elas e a busca de proteínas com papel central na interação de importantes processos biológicos. Além disso, o projeto terá especial relevo para a elucidação de questões básicas como a montagem e a anotação do genoma de fitonematoides economicamente importantes que são alvo do projeto e a disponibilização de uma solução inteligente, inovadora e automatizada para a identificação e a contagem de isolados de P. brachyurus e P. zeae vivos, mortos e com alterações morfológicas. Com o desenvolvimento desse projeto, o contato com a cadeia produtiva será intensificada, ocorrerá a geração de um banco de moléculas-alvo que deverá fazer parte do arsenal de estratégias de programas de melhoramentos e viabilizará o desenvolvimento de novas ferramentas de controle de nematoides fitopatogênicos baseadas em silenciamento gênico. Tais medidas viabilizarão a continuidade de uso das áreas, de modo a otimizar os recursos naturais e evitar abertura de novas áreas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Coordenador / Eduardo Seiti Gomide Mizubuti - Integrante / Leila Lourenço Furtado - Integrante / Francisco de Assis dos Santos Diniz - Integrante / Alexandre Lima Nepomuceno - Integrante / Thalisson Rosa de Araújo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Distrito Federal - Auxílio financeiro.

• 2022 - Atual

  Estratégias disruptivas para o controle do nematoide das lesões nas culturas de soja, cana-de-açúcar e milho, Descrição: Os nematoides das lesões, em especial Pratylenchus brachyurus e P. zeae, estão, atualmente, entre os principais problemas fitossanitários da agricultura brasileira por possuírem ampla gama de hospedeiros (fator que dificulta a rotação de culturas) de alta relevância econômica (p. ex. soja, cana-de-açúcar e milho, apenas para citar as culturas-foco deste projeto); por causarem danos irreversíveis e reduzirem substancialmente a produtividade; e pelo fato de as medidas de controle tradicionalmente estudadas não serem efetivas e sustentáveis. Este projeto foi idealizado para delinear estratégias disruptivas de controle do nematoide das lesões em três culturas de grande importância econômica. Estratégias de base biológica, química-verde e física serão desenvolvidas: 1. Desenvolvimento de plantas transgênicas de cana-de-açúcar expressando RNAs de dupla fita homólogos a dois genes de parasitismo de P. zeae visando ao controle do nematoide por meio de RNA de interferência. 2. Síntese verde de nanopartículas (NP) de cobre com efeito nematicida a P. brachyurus e P. zeae em soja. 3. Desenvolvimento de um tratamento baseado em radiação de baixa frequência (RBF) que é espécie-específica e sítio-direcionado, aplicado por satélite, capaz de reduzir a atividade de P. brachyurus em milho. O projeto contribuirá para a elucidação de questões básicas como a identificação e distribuição das espécies dos fitonematoides, assim como com a disponibilização de soluções inteligentes e inovadoras para reduzir as perdas de produtividade de culturas de alto valor econômico: uma variedade resistente, uma nanopartícula protetora e um tratamento por RBF capaz de reduzir as populações do patógeno. As medidas viabilizarão a continuidade de uso das áreas atualmente utilizadas para as culturas em tela, de modo a otimizar os recursos naturais e evitar abertura de novas áreas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Coordenador / Eduardo Seiti Gomide Mizubuti - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Integrante / Francisco de Assis dos Santos Diniz - Integrante / Ricardo Gomes Tomaz - Integrante / Paulo Vieira - Integrante / Pablo Castillo - Integrante.

• 2021 - Atual

  Programa de pesquisa no manejo do nematoide da galha (Meloidogyne spp.) e nematoide das lesões radiculares (Pratylenchus spp.) empregando a tecnologia de RNA interferente, transgenia e nanotecnologia, Descrição: O Brasil e o maior produtor de cana-de-acucar, segundo maior produtor de soja e terceiro maior produtor de milho do mundo. A produção brasileira poderia ser maior se não fossem as perdas causadas por fitonematoides. As perdas causadas por nematoides de planta podem chegar à ordem de 50% da produção, quando nenhuma forma de controle for implementada nos campos de cultivo. Dentre os diversos gêneros que acometem a cultura da soja, milho e cana-de-açúcar, o nematoide das lesões radiculares (Pratylenchus spp.) e o nematoide das galhas (Meloidogyne spp.) são os maiores causadores de perda. O controle desses fitoparasitas é complexo, limitado ao uso de cultivares resistentes, ainda pouco disponíveis aos agricultores, e aplicação de nematicidas. No entanto, são poucas as fontes de resistência e a aplicação de nematicidas nem sempre é eficiente, além de os produtos registrados apresentarem alta toxicidade ao homem e ao meio ambiente. Portanto, atualmente, não há medidas de controle eficientes e sustentáveis para esses organismos de grande importância econômica na agricultura, o que preocupa os produtores devido à presença desses nematoides nas principais áreas de cultivo do Brasil. Por isso, métodos inovadores para o controle sustentável precisam ser desenvolvidos para garantir o sistema de produção agrícola. Para resolver esse problema, criou-se informalmente um programa de pesquisa formado por pesquisadores de diferentes instituições do Distrito Federal e a Universidade Federal de Viçosa, com conhecimento e formação multidisciplinar na temática de Biotecnologia, com intuito de desenvolver novas ferramentas para o manejo do nematoide da galha e nematoide das lesões radiculares. Contando com a expertise desse grupo, o objetivo desse projeto será empregar a tecnologia de RNA interferente, uso da engenharia genética e nanoformulações na tentativa de conferir resistência a planta e reduzir a população dos nematoides no campo ao longo dos anos. Essas ferramentas oferecerão novas opções para o controle de fitonematoides, com alta chance na melhoria da eficiência de controle e menor risco para o meio ambiente. Esta proposta está dividida em três subprojetos: (I) Cana-de-açúcar geneticamente modificada para resistência ao herbicida glifosato e ao nematoide da galha (Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica); (II) Uso de dsRNA via aplicação tópica para o controle de Pratylenchus spp. na cultura do milho e; (III) Nanotecnologia aplicada ao controle de Pratylenchus spp. e Meloidogyne spp. na cultura da soja.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Coordenador / Eduardo Seiti Gomide Mizubuti - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Integrante / FRANCISCO DE ASSIS DOS SANTOS DINIZ - Integrante / Leila Lourenço Furtado - Integrante / Camila de Moraes Regô-Machado - Integrante / Jadir Borges Pinheiro - Integrante.

• 2021 - Atual

  Estruturação genética da população de Meloidogyne spp. em cana-de-açúcar no Brasil, Descrição: O Brasil é o país com a maior produção de cana-de-açúcar do mundo, sendo esse destinado principalmente para a produção de açúcar, álcool, aguardente e na alimentação animal. No entanto, fatores bióticos e abióticos dificultam a condução e aumento da produtividade dessa cultura. Dentre os problemas bióticos podemos destacar as perdas causadas por fitonematoides, que podem chegar à ordem de 20 a 30% ao ano no primeiro corte em cultivares suscetíveis. Dentre os diversos gêneros que acometem a cultura, o nematoide das lesões radiculares (P. zeae e P. brachyurus) e o nematoide das galhas (Meloidogyne spp.) são os maiores causadores de perda. Espécies de Meloidogyne são classificados como endoparasitas sedentários, com reprodução do tipo partenogênese, seja obrigatória ou facultativa. A identificação de espécies de Meloidogyne consiste em uma abordagem polifásica baseada em características morfológicas, morfométricas, observação do padrão perineal, técnicas bioquímicas e moleculares. O avanço das técnicas empregando o DNA genômico permitiu maior acurácia na diferenciação das espécies, estudo de variabilidade, conhecimento da estruturação da genética da população de fitonematoides. Informação da estrutura genética da população do patógeno pode ser útil para prever a evolução do patógeno, implementar estratégias de controle mais efetivas principalmente no que diz respeito ao desenvolvimento de cultivares resistentes, evitar surtos e estudar a epidemiologia da doença. Entretanto, a despeito dos vultosos prejuízos ocasionados pelo nematoide das galhas nas áreas de produção de cana-de-açúcar no Brasil, até o momento, nenhuma análise empregando número expressivo de isolados e ferramentas moleculares de alta resolução foi realizada para estudar a variabilidade genética das populações brasileiras de Meloidogyne. Assim, o trabalho tem por objetivo identificar espécies de Meloidogyne na cultura da cana-de-açúcar nas principais regiões produtoras da região Centro-Sul do Brasil, estudar a variabilidade genética e mecanismos evolutivos que influenciam a população. Para isso iremos identificar as espécies de Meloidogynes presentes em canaviais por meio de esterases e malato-desidrogenases, marcadores moleculares SCAR e genes housekeeping (18S-ITS-5.8S, 28S D2/D3 e CoxII-IGS). A elucidação da variabilidade genética de populações de Meloidogyne spp. será realizada usando o marcadores moleculares Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) e Genotyping by sequencing (GBS) para determinar a estruturação genética da população e mecanismo evolutivos que influenciam na variabilidade da população em campo, cidades e regiões.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Coordenador / Eduardo Seiti Gomide Mizubuti - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Integrante / FRANCISCO DE ASSIS DOS SANTOS DINIZ - Integrante / Leila Lourenço Furtado - Integrante / Camila de Moraes Regô-Machado - Integrante / Jadir Borges Pinheiro - Integrante.

• 2018 - Atual

  Perfil epigenético e seus mRNAs alvos de Setaria viridis sob condições de seca, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Integrante / Wagner Rodrigo de Souza - Integrante / Adilson Kenji Kobayashi - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Coordenador / Karoline Estefani Duarte - Integrante.

• 2017 - Atual

  Perfil de pequenos RNAs e de seus mRNAs alvos em ápices radiculares de Setaria viridis sob condições de estresse por alumínio (Al3+), Descrição: Duas grandes limitações para a produção agrícola mundial, particularmente nas regiões tropicais, é a toxidez por alumínio (Al3+) e o déficit hídrico. Regiões brasileiras consideradas potenciais para a expansão agrícola canavieira estão localizadas na Região Centro-Oeste, caracterizada por apresentar solos ácidos e com elevados níveis de Al3+. A sua presença causa redução do crescimento radicular, tornando-as incapazes de explorar camadas mais profundas do solo, restringindo a absorção de nutrientes, aumentando a susceptibilidade ao déficit hídrico e reduzindo a produtividade. No entanto, as plantas desenvolveram seus próprios mecanismos de defesa para adaptarem-se a estas condições adversas. Um desses mecanismos é a reprogramação da expressão de genes codificadores de miRNAs (MIR genes). Estes miRNAs são uma classe de pequenos RNAs (smRNAs) não codificantes que apresentam cerca de 22 nucleotídeos e desempenham importante papel na regulação dos mecanismos de adaptação, resistência ou tolerância a toxidez por Al3+, atuando como reguladores a nível transcricional ou pós-transcricional da expressão de diversos genes. O projeto proposto tem por objetivos (i) realizar uma análise global do acúmulo de smRNAs em ápices radiculares da planta modelo Setaria viridis sob diferentes níveis de estresse por Al3+; (ii) identificar in silico e validar in vitro a expressão de MIR genes; (iii) identificar in silico e validar in vitro RNAs mensageiros que sejam alvos dos miRNAs diferencialmente expressos; (iv) selecionar, a partir da validação, MIR genes que estejam relacionados à tolerância ao Al3+ em S. viridis e (v) caracterizar in silico a região promotora dos MIR genes selecionados, visando identificar os cis-elementos e (vi) predizer os fatores de transcrição envolvidos na ativação da transcrição dos MIR genes selecionados. Espera-se, ao fim do projeto, disponibilizar informações sobre MIR genes, assim como sobre seus reguladores e seus alvos, que possam estar associados aos mecanismos de adaptação, resistência ou tolerância ao Al3+ em S. viridis. Espera-se ainda elucidar a função desses elementos nas diferentes vias de resposta a toxidez por Al3+ e identificar seus potenciais ortólogos em gramíneas, de modo que estes genes possam ter a sua função avaliada in vivo por meio de superexpressão ou nocaute sob o controle de promotores estresse-induzido ou tecido-específico. Os resultados obtidos deverão impactar a linha de pesquisa da equipe envolvida no projeto, que envolve o entendimento da resposta a toxidez por Al3+ em S. viridis e cana-de-açúcar, bem como permitirão a identificação de genes que podem vir a ser utilizados para o melhoramento por engenharia genética destas espécies ou de outras gramíneas de interesse econômico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Integrante / Eduardo Fernandes Formighieri - Integrante / Bárbara Andrade Dias Brito da Cunha - Integrante / Ana Paula Ribeiro - Integrante / Polyana Kelly Martins - Integrante / Wagner Rodrigo de Souza - Integrante / Letícia Jungmann Cançado - Integrante / Carlos Antônio Ferreira de Sousa - Integrante / Adilson Kenji Kobayashi - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Distrito Federal - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Produção de variedades comerciais de cana-de-açúcar transgênica para aumento da biomassa e da produção de etanol 1G e 2G a partir da transferência de genes que conferem resistência ao herbicida glifosato e a insetos-praga., Descrição: O presente projeto consolida uma colaboração entre a Pangeia Biotech e Embrapa Agroenergia e resultará em inovações tecnológicas para um considerável aumento na produtividade da cultura de cana-de-açúcar. Serão produzidos eventos transgênicos comerciais apresentando resistência a herbicida e a insetos em materiais de cana-de-açúcar. Serão transformadas até três variedades de cana-de-açúcar, dentre elas a RB855156, que é um material de colheita precoce e de domínio público, correspondendo a 4% da área total cultivada (244.440 mil hectares) (fonte: Censo Varietal IAC, safra 2016/2017).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Thaís Ribeiro Santiago - Integrante / Adilson Kenji Kobayashi - Integrante / Hugo Bruno Correa Molinari - Coordenador / Leila Lourenço Furtado - Integrante.