Elias Chaibub Neto

Possui graduação em Engenharia Agronômica pela Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" da Universidade de São Paulo (1998), mestrado em Probabilidade e Estatística pelo Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo (2003) e doutorado em estatística pela Universidade de Wisconsin - Madison, USA (2010). Atua principalmente nos seguintes temas: estatística Bayesiana, modelos gráficos probabilísticos e inferência causal em genética estatística.

Informações coletadas do Lattes em 26/11/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Estatística

2004 - 2010

University of Wisconsin - Madison
Título: Causal inference methods in statistical genetics
Orientador: Brian S. Yandell
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Palavras-chave: genética de sistemas; modelos gráficos probabilisticos causais; inferencia bayesiana; MCMC; teste de hipoteses; selecao de modelos. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.

Mestrado em Estatística

2001 - 2003

Instituto de Matemática e Estatística
Márcia D'Elia Branco.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Palavras-chave: informação de Kullback- Lieber; priori de referência; regressão binária; calibração linear; regressao binomial; calibracao binomial. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística / Especialidade: Inferência Bayesiana.

Graduação interrompida em 2000 em Estatística

1999 - interrompida

Instituto de Matemática e Estatística
Ano de interrupção: 2000

Graduação em Engenharia Agronômica

1994 - 1998

Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"
Orientador: Akihiko Ando
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

Formação complementar

2008 - 2008

Short Course in Systems Genetics. (Carga horária: 43h). , The Jackson Laboratory.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística/Especialidade: Inferência Bayesiana.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Modelos gráficos probabilísticos.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística/Especialidade: Inferência Paramétrica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.

Participação em eventos

Reuniões científicas CPE/ InCe - IEP - Albert Einstein.Inferência Causal em Genética de Sistemas. 2010. (Seminário).

The 2008 International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Inferring causal phenotype networks from segregating populations. 2008. (Congresso).

Seminário em métodos Bayesianos.Prioris de referência de Berger e Bernardo. 2002. (Seminário).

Produções bibliográficas

Chaibub Neto E. ; Keller, M. P. ; Attie, A. D. ; Yandell, B. S. . Causal graphical models in systems genetics: a unified framework for joint inference of causal network and genetic architecture for correlated phenotypes. The Annals of Applied Statistics , v. 4, p. 320-339, 2010.
Harris, M. A. ; Peck, R. F. ; Colton, S. ; Chaibub Neto E. ; Kallio, J. . A combination of hand-held models and computer imaging programs helps students answer oral questions about molecular structure and function: a controlled investigation of student learning. CBE-LIFE SCI EDUC , v. 8, p. 29-43, 2009.
ZHAO, E. Keller, M. P. Rabaglia, M. B. Oler, O. T. Stapleton, D. S. Schueler, K. L. Chaibub Neto E. Moon, J. Y. Wang, P. Wang, I. Lum, P. Y. Ivanoska, I. Cleary, M. Greenawalt, D. Tsang, J. Choi, Y. Kleinhanz, R. Shang, J. Zhou, Y. P. Howard, A. D. Zhang, B. B. Kendziorski, C. Thornberry, N. A. Yandell, B. S. Schadt, E. E. , et al. Attie, A. D. ; Obesity and genetics regulate microRNAs in islets, liver, and adipose of diabetic mice. Mammalian Genome , v. 20, p. 476-485, 2009.
Chaibub Neto E. ; Ferrara, C. T. ; Attie, A. D. ; Yandell, B. S. . Inferring causal phenotype networks from segregating populations. Genetics (Austin) , v. 179, p. 1089-1100, 2008.
Ferrara, C. T. ; Wang, P. ; Chaibub Neto E. ; Stevens, R. D. ; Bain, J. E. ; Wenner, B. R. ; Ilkeyeva, O. R. ; Keller, M. P. ; Blasiole, D. A. ; Kendziorski, C. ; Yandell, B. S. ; Newgard, C. B. ; Attie, A. D. . Genetic networks of liver metabolism revealed by integration of metabolic and transcriptional profiling. PLOS Genetics , v. 4, p. e1000034, 2008.
Keller, M. P. ; Choi, Y. ; Wang, P. ; Davies, D. B. ; Rabaglia, M. B. ; Oler, O. T. ; Stapleton, D. S. ; Argmann, C. ; Schueler, K. L. ; Edwards, S. ; Steinberg, H. A. ; Chaibub Neto E. ; Kleinhanz, R. ; Turner, S. ; Hellerstein, M. K. ; Schadt, E. E. ; Yandell, B. S. ; Kendziorski, C. ; Attie, A. D. . A gene expression network model of type 2 diabetes links cell cycle regulation in islets with diabetes susceptibility. Genome Research , v. 18, p. 706-716, 2008.
Chaibub , E. N. ; Branco, M. D. . Reference analysis for the p-dimesional calibration problem. Brazilian Journal of Probability and Statistics , v. 21, p. 121-139, 2007.
Doksum, K. A. ; Ozeki, A. ; Kim, J. ; Chaibub Neto E. . Thinking outside the box: statistical inference based on Kullback-Leibler empirical projections. Statistics & Probability Letters , v. 77, p. 1201-1213, 2007.
Chaibub , E. N. ; Ando, A. ; Silva, E. F. ; Morishima, H. ; Akimoto, M. ; Martins, P. S. . Collecting wild relatives of rice in Paraguay and Northeastern Argentina. Plant Genetic Resources Newsletter , short communication, v. 118, p. 51-52, 1999.
Chaibub , E. N. ; Branco, M. D. . Um estudo comparativo de prioris no problema de calibração linear. In: I Congresso Bayesiano da América Latina, 2002, Ubatuba. I Congresso Bayesiano da América Latina, 2002. p. 56.
Chaibub Neto E. ; Yandell, B. S. . Inferring causal phenotype networks from segregating populations. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Chaibub Neto E. . Prioris de referência de Berger e Bernardo. 2002. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Chaibub Neto E. ; Yandell, B. S. ; Moon, J. Y. . QTLnet R package (em desenvolvimento). 2010.

Chaibub Neto E. ; Yandell, B. S. . qtlhot R package (em desenvolvimento). 2010.

Chaibub Neto E. ; Yandell, B. S. . QTLcmst R package (em desenvolvimento). 2010.

Chaibub Neto E. ; Yandell, B. S. . QDG R package. 2008.

Chaibub Neto E. ; Keller, M. P. ; Broman, A. T. ; Attie, A. D. ; Yandell, B. S. . Causal model selection tests in system genetics. University of Wisconsin - Madison Tecnical report number 1157. 2010.

Chaibub Neto E. ; Keller, M. P. ; Broman, A. F. ; Attie, A. D. ; Jansen, R. C. ; Broman, K. W. ; Yandell, B. S. . Quantile-based permutation thresholds for QTL hotspots (submetido para Genetics). 2010.

Chaibub Neto E. ; Keller, M. P. ; Attie, A. D. ; Yandell, B. S. . Causal graphical models in systems genetics: a unified framework for joint inference of causal network and genetic architecture for correlated phenotypes. (TR 1146, Department of Statistics, University of Wisconsin - Madison). 2008.

Chaibub , E. N. ; Branco, M. D. . Reference Bayesian analysis of the linear calibration problem.. 2003.

Histórico profissional

Experiência profissional

2004 - 2010

University of Wisconsin - Madison

Vínculo: Aluno de doutorado, Enquadramento Funcional: livre, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Desenvolvimento de software e metodologia estatística para a análise de dados genéticos e genômicos no laboratório do Prof. Dr. Alan D Attie do Departamento de Bioquímica e participação em projetos de pesquisa sobre a base genética de fenótipos complexos como obesidade e diabetes tipo 2.

Atividades

Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa

1999 - 2000

Instituto de Matemática e Estatística Universidade de São Paulo

Vínculo: Aluno de graduação, Enquadramento Funcional: livre, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Estatística, .,Linhas de pesquisa
Ensino, Bacharelado em Estatística, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Auxiliar de Ensino - Estatística Básica, Auxiliar de Ensino - Inferência Estatística

1994 - 1998

Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"

Vínculo: Aluno de graduação, Enquadramento Funcional: livre, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

Estágios , Departamento de Genética, .,Estágio realizado, Laboratório de Genética Ecológica (Profs. Paulo Martins Sodero e Akihiko Ando).