Kaleb Pretto Gatto

Pós-doutorado

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Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Evolução molecular de DNAs repetitivos e assinaturas adaptativas nos genomas nuclear e mitocondrial de anfíbios anuros, Descrição: Com o advento do sequenciamento de nova geração houve um grande crescimento na disponibilidade de dados genômicos em diversos ramos da árvore da vida. Entre anfíbios anuros, o crescimento no volume e qualidade dos dados genômicos tem sido enorme. Porém, algumas questões evolutivas ainda permanecem em aberto, mesmo com essa abundância de dados. Anfíbios anuros estão entre o grupo de tetrápodes com o maior número de espécies que apresentam genomas poliploides. Dessa forma, um dos objetivos da presente proposta (subprojeto I) se dá em caracterizar sequências de DNAs repetitivos e testar a hipótese da existência de variantes subgenoma/cromossomo específicas para as espécies de anuros poliploides Xenopus borealis e X. laevis, as quais há a disponibilidade de dados genômicos em bancos de dados. Por outro lado, diferentes espécies de anuros possuem diferentes adaptações morfofisiológicas relacionadas aos seus hábitos de vida (aquático, terrestre, arborícola e fossorial). Sendo assim, o segundo objetivo da presente proposta (subprojeto II) se dá em testar a ocorrência de convergência e/ou paralelismo em nível molecular entre espécies com diferentes hábitos de vida. Tais eventos de convergência seriam estudados para: (a) genes relacionados ao processo de osmorregulação e (b) genes mitocondriais codificadores de proteínas. Com base nos resultados a serem obtidos, se almeja obter um maior entendimento da evolução de sequências de DNA repetitivos em genomas poliploides. Ademais, os resultados a serem obtidos também podem auxiliar em um melhor entendimento das estratégias adaptativas entre espécies de anuros com diferentes modos de vida.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Kaleb Pretto Gatto - Coordenador / Daniel Pacheco Bruschi - Integrante / Luciana Bolsoni Lourenço - Integrante / Ariadne Fares Sabbag - Integrante.

• 2021 - Atual

  O papel dos cromossomos sexuais na divergência de anuros do complexo de espécies Physalaemus cuvieri ? Physalaemus ephippifer: explorando as barreiras reprodutivas em uma zona de contato entre linhagens divergentes, Descrição: As zonas de contato entre linhagens divergentes favorecem a investigação de barreiras reprodutivas e assim contribuem para o estudo de processos de especiação. Em anuros, os cromossomos sexuais são muito diversos entre distintos grupos, o que levanta o possível papel desses cromossomos no isolamento reprodutivo pós-zigótico e, consequentemente, na especiação. Em zonas de contato em que os híbridos apresentam menor valor adaptativo, a seleção natural intensifica o isolamento reprodutivo, favorecendo o estabelecimento de barreiras reprodutivas pré-zigóticas. Na presente proposta, analisaremos o possível papel dos cromossomos sexuais na evolução do complexo de espécies Physalaemus cuvieri ? Physalaemus ephippifer, focando na zona de contato entre duas linhagens divergentes (L1 de ?P. cuvieri? e P. ephippifer), portadoras de distintos cromossomos sexuais. Avaliaremos a hipótese de que diferenças relacionadas aos cromossomos sexuais tenham promovido barreira reprodutiva pós-zigótica e, consequentemente, estimulado a seleção sexual na zona de contato entre as linhagens. Para tanto, i) ampliaremos a área previamente amostrada a fim de definir a extensão da zona de contato entre as linhagens; ii) caracterizaremos a estrutura genética e os cromossomos sexuais ao longo de todo o transecto em estudo; e iii) investigaremos se houve deslocamento de caracteres reprodutivos (morfológicos e/ou acústicos) na zona de contato. Para a análise da estrutura genética, utilizaremos sequências de DNA mitocondrial e marcadores obtidos de bibliotecas de 3RAD. Para a análise citogenética, mapearemos alguns marcadores cromossômicos que já se mostraram informativos para esse grupo, como o DNAsat PcP190 e a sonda produzida a partir da microdissecção do cromossomo Z de P. ephippifer. Utilizaremos também as bibliotecas 3RAD para a prospecção de sequências repetitivas e de sequências ligadas ao sexo com o objetivo de melhor caracterizar e comparar os sistemas de cromossomos sexuais encontrados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Kaleb Pretto Gatto - Integrante / Luciana Bolsoni Lourenço - Coordenador / Gilda Vasconcellos de Andrade - Integrante / Todd Pierson - Integrante / Juan Martin Ferro - Integrante / Lucas Henrique Bonfim de Souza - Integrante / Fábio Perin de Sá - Integrante / Célio Fernando Baptista Haddad - Integrante / Joana de Moura Gama - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2021

  Análise citogenética e filogenética do complexo Physalaemus cuvieri - P. ephippifer (Anura, Leptodactylidae), Descrição: Grande variação genética e citogenética ocorre dentre populações relacionadas filogeneticamente aos táxons Physalaemus cuvieri e Physalaemus ephippifer. Análises de delimitação de espécies baseadas em sequências de DNA sugerem a presença de ao menos quatro espécies nesse grupo, que ficou conhecido como complexo P. cuvieri - P. ephippifer. Embora sequências mitocondriais tenham mostrado pouca divergência genética entre P. ephippifer e a Linhagem 1 de "P. cuvieri", assinaturas mitocondriais são encontradas para cada uma dessas duas linhagens. Características citogenéticas também diferenciam esses dois grupos, sendo encontrado evidente heteromorfismo sexual cromossômico exclusivamente em P. ephippifer. A presença de haplótipos mitocondriais de P. ephippifer e da Linhagem 1 de "P. cuvieri" dentre indivíduos provenientes de São Pedro da Água Branca-MA, sítio localizado entre a área de ocorrência de P. ephippifer e a da Linhagem 1 de "P. cuvieri", levantou a hipótese de contato secundário entre as referidas linhagens. No entanto, o reduzido tamanho da amostra estudada não permitiu o teste dessa hipótese. Os dados citogenéticos referentes a indivíduos dessa localidade também são escassos, estando restritos a poucos indivíduos, todos machos. Dessa forma, o estudo genético e citogenético de espécimes da região de São Pedro da Água Branca torna-se de grande relevância tanto para a melhor compreensão da diversidade contida no complexo P. cuvieri - P. ephippifer quanto para a investigação do possível papel das diferenças citogenéticas na dinâmica evolutiva desse grupo. Nesse contexto, no presente estudo pretendemos analisar espécimes provenientes de São Pedro da Água Branca e de áreas próximas, a fim de testar a hipótese de introgressão entre P. ephippifer e a Linhagem 1 de "P. cuvieri", bem como avaliar as diferenças cariotípicas encontradas nesse grupo. Para tanto, marcadores RAD-seq e sequências mitocondriais referentes ao fragmento H1 (que inclui os genes ribossomais 12S e 16S, e o gene para RNAt-val) serão obtidos para espécimes dessa região e também para indivíduos de P. ephippifer e da Linhagem 1 de "P. cuvieri". Análises da diversidade genética e inferências filogenéticas serão realizadas com base nos dois conjuntos de sequências. O teste de introgressão ABBA/BABA será realizado com base nos marcadores RAD-seq. Preparações cromossômicas serão obtidas de espécimes provenientes da região de São Pedro da Água Branca e os cariótipos desses indivíduos serão comparados aos de P. ephippifer e da Linhagem 1 de "P. cuvieri". Os dados citogenéticos e as inferências derivadas da análise de sequências nucleotídicas serão analisados de forma integrada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Kaleb Pretto Gatto - Integrante / LOURENÇO, LUCIANA BOLSONI - Coordenador / Karin Regina Seger - Integrante / Gilda Vasconcellos de Andrade - Integrante / William Pinheiro da Costa - Integrante / Renata de Oliveira Tenório - Integrante / Benjamin Minault Fitzpatrick - Integrante / Todd Pierson - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2017

  Citogenética molecular comparativa em anuros do gênero Pseudis com ênfase no estudo de cromossomos sexuais, Descrição: Os gêneros Pseudis e Lysapsus juntos compreendem atualmente onze espécies de anuros distribuídas pela América do Sul, todas já cariotipadas. Dentre as características citogenéticas encontradas nesse grupo, destaca-se a ocorrência de cromossomos sexuais heteromórficos em Pseudis tocantins. Com base na morfologia cromossômica e na presença de NOR, estudos anteriores sugeriram que o par sexual de P. tocantins seja homeólogo ao cromossomo 5 de P. cardosoi e ao cromossomo 7 das demais espécies de Pseudis e Lysapsus. Descobertas recentes mostraram que os blocos heterocromáticos dos cromossomos Z e W de P. tocantins diferem não apenas em tamanho, mas também em composição. Sequências de DNA satélite da família PcP190EcoRI foram encontradas em ambos os cromossomos, mas uma sequência mapeada por FISH exclusivamente no braço longo do cromossomo W diferiu expressivamente daquela isolada do cromossomo Z. Tais resultados sugerem importante papel desse DNA satélite na diferenciação dos cromossomos sexuais em questão. Apesar dos intrigantes achados referentes a P. tocantins, nada se conhece sobre os cromossomos sexuais das outras espécies do gênero Pseudis ou do gênero Lysapsus. No presente projeto, pretendemos investigar a presença do DNA satélite PcP190EcoRI em espécies representativas dos gêneros Pseudis e Lysapsus, avaliando o possível envolvimento dessas sequências na evolução cariotípica desse grupo. Além disso, utilizaremos a técnica de hibridação genômica comparativa (CGH) na tentativa de identificar os cromossomos sexuais de P. fusca, P. minuta, P. bolbodactyla e de uma espécie representante do gênero Lysapsus. Por fim, propomos o sequenciamento dos cromossomos sexuais de P. tocantins, com o intuito de buscar sequências W-específicas, inclusive genes candidatos a determinante sexual nessa espécie. Dessa forma, com a presente proposta pretendemos proporcionar relevante avanço no estudo da origem/evolução dos cromossomos sexuais de P. tocantins.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Kaleb Pretto Gatto - Integrante / Luciana Bolsoni Lourenço - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Avaliação da atividade proliferativa celular do carcinoma epidermóide bucal por meio do método AgNOR, Descrição: O presente trabalho tem como objetivo realizar um estudo histoquímico retrospectivo a fim de analisar o potencial proliferativo celular de casos de carcinoma epidermóide da cavidade bucal (CECB). Serão utilizados neste estudo, casos da referida lesão coletados nos arquivos do Laboratório de Patologia do Hospital São Vicente de Paulo e do Serviço de Diagnóstico Histopatológico do Instituto de Ciências Biológicas da Universidade de Passo Fundo (2000 a 2006). Os dados que dizem respeito à idade, sexo e raça dos pacientes, bem como os dados de localização da enfermidade na cavidade bucal, serão obtidos dos laudos histopatológicos de cada paciente. Todos os casos terão as lâminas contendo os cortes histológicos correspondentes à biópsia incisional ou excisional revistas ao microscópio de luz na coloração hematoxilina-eosina (H.E.) para confirmação do diagnóstico. A seguir, far-se-á um estudo histoquímico das lesões por meio da impregnação tecidual por prata (AgNOR). Os dados coletados serão correlacionados e analisados estatisticamente, a fim de se realizar uma comparação entre a atividade proliferativa celular dos CECBs de pacientes de diferentes sexos, idades, raças e com distintos locais da cavidade bucal acometidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) . , Integrantes: Kaleb Pretto Gatto - Integrante / Carmen Sílvia Busin - Integrante / Soluete Oliveira da Silva - Coordenador / João Cézar Mosele - Integrante / Maurício Barancelli - Integrante / Kelvin Luviza Battiston - Integrante / João Paulo De Carli - Integrante / Dileta Cecchetti - Integrante / Daniela Silveira - Integrante.