Nelson José Freitas da Silveira

Pós-doutorado

Formação complementar

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Organização de eventos

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Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• SANTOS, LEANDRO MARCOS ; DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS . Fragment-based Drug Discovery Successful Contributions to Current PharmacotherapeuticAgents Arsenal against Aggressive Cancers: A Mini-Review. Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry , v. 23, p. 1796-1810, 2023.

• MARCOS SANTOS, LEANDRO ; DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS . Current Fragment-to-lead Approaches Starting from the 7-azaindole: ThePharmacological Versatility of a Privileged Molecular Fragment. CURRENT TOPICS IN MEDICINAL CHEMISTRY , v. 23, p. 2116-2130, 2023.

• BORBA, JOÃO RICARDO BUENO DE MORAIS ; DE ARAÚJO, LEONARDO PEREIRA ; VELOSO, MARCIA PARANHO ; DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS . Applying the bioisosterism strategy to obtain lead compounds against SARS-CoV -2 cysteine proteases: An in-silico approach. Journal of Computational Chemistry (Online) , v. 45, p. 35-46, 2023.

• MARCELINO, R. C. ; PERERA, L. A. ; BORBA, J. R. B. M. ; Silveira NJF . Molecular docking study involving bioactive natural compounds against SARS-CoV-2 proteins. Natural Resources for Human Health , v. 1, p. 1-12, 2022.

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• HENRIQUE DA SILVA CAVALCANTI, MARCELLO ; BUENO ALVES, LEVY ; DUARTE, ALFREDO ; AGUIAR MENDES, ADRIANO ; MAURÍCIO SCHENEEDORF FERREIRA DA SILVA, JOSÉ ; JOSÉ FREITAS DA SILVEIRA, NELSON ; TSUYAMA ESCOTE, MARCIA ; SINDRA VIRTUOSO, LUCIANO . Immobilization of Thermomyces lanuginosus lipase via ionic adsorption on superparamagnetic iron oxide nanoparticles: Facile synthesis and improved catalytic performance. CHEMICAL ENGINEERING JOURNAL , v. 431, p. 134128, 2021.

• ZANON, C. F. ; HENRIQUE, T. ; GIROL, A. P. ; STEFANINI, A. C. B. ; CONTESSOTO, N. S. A. ; Silveira, NJF ; BEZERRA, D. P. ; SILVEIRA, E. R. ; BARBOSA-FILHO, J. M. ; CORNELIO, M. L. ; TAJARA, E. H. ; OLIANI, S. M. . Biological and physical approaches on the role of piplartine (piperlongumine) in cancer. Scientific Reports , v. 10, p. 1-14, 2020.

• Alves, R. S. ; ALVES, L. B. ; Altoé, L. S. ; SARANDY, M. M. ; FREITAS, M. B. ; da Silveira, NJF ; NOVAES, R. D. ; GONÇALVES, R. V. . Peptides from Animal Origin: A Systematic Review on Biological Sources and Effects on Skin Wounds. Oxidative Medicine and Cellular Longevity , v. 2020, p. 4352761, 2020.

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• COELHO, C. M. ; SANTOS, T. ; FREITAS, P. G. ; NUNES, J. B. ; MARQUES, M. J. ; PADOVANI, C. G. D. ; JUDICE, W. A. S. ; CAMPS, I. ; da Silveira, NJF ; CARVALHO, D. T. ; VELOSO, M. P. . Design, Synthesis, Biological Evaluation and Molecular Modeling Studies of Novel Eugenol Esters as Leishmanicidal Agents. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 29, p. 715, 2018.

• FREITAS, P. G. ; CASTILHO, T. E. ; ALMEIDA, L. ; MACIEL-REZENDE, C. M. ; COSTA, L. T. ; VIEGAS JUNIOR, C. ; MARQUES, M. J. ; SANTOS, M. H. ; da Silveira, NJF . An in silico Study of Benzophenone Derivatives as Potential Non-Competitive Inhibitors of Trypanosoma cruzi and Leishmania Amazonensis Cysteine Proteinases. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 00, p. 1-13, 2017.

• FREITAS, P. G. ; ELIAS, T. C. ; PINTO, I. A. ; COSTA, L. T. ; CARVALHO, P. V. S. D. ; Omote, D ; CAMPS, I. ; ISHIKAWA, T. ; ARCURI, Helen Andrade ; VINGA, S. ; OLIVEIRA, A. L. ; de AZEVEDO JR, W.F. ; da Silveira, NJF . Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein.. Letters in Drug Design & Discovery , v. 14, p. 1-12, 2017.

• Henrique T ; Silveira NJF ; CUNHA-VOLPATO, A. ; MATARUCO, M. ; STEFANINI, A. C. ; FARES, A. ; ANDRADE, J. ; MASSON, C. ; LOPEZ, R. ; NUNES, F. ; KOWALSKI, L. ; SEVERINO, P. ; TAJARA, E. . HNdb: an integrated database of gene and protein information on head and neck squamous cell carcinoma. DATABASE-OXFORD , v. 2016, p. baw026-11, 2016.

• DRUMOND, BETANIA PAIVA ; DA SILVA FAGUNDES, LUIZ GUSTAVO ; ROCHA, RAISSA PRADO ; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE ; ARAKI, CARLOS SHIGUERU ; COLOMBO, TATIANA ELISA ; NOGUEIRA, MAURICIO LACERDA ; ELIAS, T. C. ; da Silveira, NJF ; MALAQUIAS, LUIZ COSME COTTA ; COELHO, LUIZ FELIPE LEOMIL . Phylogenetic analysis of Dengue virus 1 isolated from South Minas Gerais, Brazil. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 47, p. 251-258, 2016.

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• FREITAS, P. G. ; BARBOSA, A. F. ; SARAIVA, L. A. ; CAMPS, I. ; da SILVEIRA, NJ F ; VELOSO, M. P. ; SANTOS, M. H. ; SCHNEEDORF, J. M. . Mangiferin Binding to Serum Albumin is non-saturable and induces conformational changes at high concentrations. Journal of Luminescence , v. 132, p. 3027-3034, 2012.

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• PACETTI, G. A. ; KAWAGUCHI, L. Y. A. ; PARENTE, M. ; AIMBIRE, F. ; da SILVEIRA, NJ F ; ALBERTINI, R. . Análise do Controle Autonômico de Controladores de Tráfego Aéreo por meio da Variabilidade Cardíaca. ConScientiae Saúde (Impresso) , v. 10, p. 201-209, 2011.

• SANTOS, JEAN DOUGLAS MOURA DOS ; OLIVEIRA, MARCO ANTONIO DE ; SILVEIRA, NELSON JOSé FREITAS DA ; CARVALHO, SéRGIO DE SOUZA ; OLIVEIRA, ADENO GONçALVES . Confiabilidade inter e intraexaminadores nas mensuraÃ?§Ã?µes angulares por fotogrametria digital e goniometria. Fisioterapia em Movimento (PUCPR. Impresso) , v. 24, p. 389-400, 2011.

• Arcuri, Helen A ; Zafalon, Geraldo FD ; Marucci, Evandro A ; Bonalumi, Carlos E ; da Silveira, NJF ; Machado, Jose M ; de Azevedo, Walter F ; Palma, Mario S . SKPDB: a structural database of shikimate pathway enzymes. BMC Bioinformatics , v. 11, p. 12, 2010.

• Rodrigues-Lisoni, Flavia C ; Peitl, Paulo ; Vidotto, Alessandra ; Polachini, Giovana M ; Maniglia, Jose V ; Carmona-Raphe, Juliana ; Cunha, Bianca R ; Henrique, Tiago ; Souza, Caique F ; Teixeira, Rodrigo AP ; Fukuyama, Erica E ; Michaluart, Pedro ; de Carvalho, Marcos B ; Oliani, Sonia M ; GENCAPO, Project (Head and Neck Genome Project (GENCAPO)) ; Tajara, Eloiza H . Genomics and proteomics approaches to the study of cancer-stroma interactions. BMC Medical Genomics , v. 3, p. 14, 2010.

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• ALVES, V. A. F. ; NONOGAKI, S. ; CURY, PM ; WUNSCH-FILHO, V. ; CARVALHO, M. B. ; MICHALUART JR, P ; MOYSES, R. A. ; CURIONI, O. A. ; FIGUEIREDO, D. L. ; SCAPULATEMPO-NETO, C. ; Polachini GM ; SOUZA, R. S. ; OLIANI, S. M. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; NOBREGA, F. G. ; GENCAPO, Project (Head and Neck Genome Project (GENCAPO)) ; TAJARA, E. H. ; ZAGO, M. A. . Annexin A1 subcellular expression in laryngeal squamous cell carcinoma.. Histopathology (Oxford. Print) , v. 56, p. 715-722, 2008.

• ALVARES, A. M ; MICHALUART JR, P ; Severino P ; OKAMOTO, O. K. ; NUNES, F. D. ; MOREIRA FILHO, C. A. ; TAJARA, E. H. ; GENCAPO, Project (Head and Neck Genome Project (GENCAPO)) . Global gene expression profiling of oral cavity cancers suggests molecular heterogeneity within anatomic subsites.. BMC Research Notes , v. 1, p. 113, 2008.

• Cantalino, J.L.R. ; Oliveira, L.V.F. ; Salgado, A.S.I. ; da SILVEIRA, NJ F ; Costa, M.C. . Análise da variabilidade da frequência cardíaca após mobilização miofascial da região craniana.. Terapia Manual , v. 6, p. 25-27, 2008.

• LAZARO, J. C. ; LIMA, C. J. ; MOREIRA, L. M. ; SILVEIRA JR., L. ; da SILVEIRA, NJ F ; VILLAVERDE, A. B. ; PACHECO, M. T. T. . Analysis of the alteration in the optical configuration of Raman spectrometer: Optimization of signal-to-noise ratio (SNR) in a specific wavelength range of clinical interest. Spectroscopy (Ottawa) , v. 22, p. 467-474, 2008.

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• MANHANI, Karisa Karla ; ARCURI, Helen Andrade ; da Silveira, NJF ; HUCHOA, H. B. ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; CANDURI, Fernanda . Molecular Models of Protein Kinase 6 from Plasmodium falciparum. Journal of Molecular Modeling (Online) , Alemanha, v. 12, n.1, p. 42-48, 2005.

• ARCURI, Helen Andrade ; CANDURI, Fernanda ; PEREIRA, José Henrique ; da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luiz Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; SANTOS, Diógenes Santiago ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Molecular models of shikimate pathway enzymes of Xylella fastidiosa. Biochemical and Biophysical Research Communications , USA, v. 320, p. 979-991, 2004.

• da Silveira, NJF ; HUCHOA, H. B. ; CANDURI, Fernanda ; PEREIRA, José Henrique ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; BASSO, Luiz Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; SANTOS, Diógenes Santiago ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Structural Bioinformatics Study of PNP from Schistosoma mansoni. Biochemical and Biophysical Research Communications , USA, v. 322, p. 100-104, 2004.

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• PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, Fernanda ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; da Silveira, NJF ; BASSO, Luiz Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Structural bioinformatics study of EPSP synthase from Mycobacterium tuberculosis. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , USA, v. 312, p. 608-614, 2003.

• AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; CANDURI, Fernanda ; da Silveira, NJF . Structural basis for inhibition of cyclin-dependent kinase 9 by flavopiridol. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , USA, v. 293, n.1, p. 566-571, 2002.

• AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; GASPAR, Renato Tadeu ; CANDURI, Fernanda ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF . Molecular model of cyclin-dependent kinase 5 complexed with roscovitine. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , USA, v. 297, p. 1154-1158, 2002.

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• AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, Fernanda ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; da Silveira, NJF ; BASSO, Luiz Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; SANTOS, Diógenes Santiago . Structural bioinformatics study of EPSP synthase from Mycobacterium tuberculosis. In: II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICOBICOBI), 2004, Angra dos Reis. Livro de resumos, 2004.

• ARCURI, Helen Andrade ; CANDURI, Fernanda ; PEREIRA, José Henrique ; da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luiz Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; SANTOS, Diógenes Santiago ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Structural bioinformatics applied of study for shikimate pathway enzymes of Xylella fastidiosa. In: 1st Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis. Livro de resumos, 2004.

• da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; CANDURI, Fernanda ; UCHÔA, Hugo Brandão ; JORGE, Guilherme Eberhart ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Structural bioinformatics applied to the study of protein targets from Mycobacterium tuberculosis. In: 1st Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis. Livro de resumos, 2004.

• DIAS, Marcio Vinicius Bertacine ; CANDURI, Fernanda ; da Silveira, NJF ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luiz Augusto ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; SANTOS, Diógenes Santiago . Molecular models of tryptophan synthase from Mycobacterium tuberculosis complexed with inhibitors. In: 1st Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis. Livro de resumos, 2004.

• PERES, Patrícia ; LOMBARDI, Fábio R ; CANDURI, Fernanda ; da Silveira, NJF ; RODRIGUEZ, Gustavo Orlando Bonilla ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Molecular model of cathodic hemoglobin from catfish Hoplosternum littorale. In: SBBq, 2003, Caxanbú. Livro de resumos, 2003.

• MANHANI, Karisa Karla ; CANDURI, Fernanda ; da Silveira, NJF ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Molecular model of cyclin-dependent kinase 4 complexed with Roscovitine. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• CANDURI, Fernanda ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF . Structural bioinformatics study of CDK1 complexed with Flavopiridol and Roscovitine. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• ESTEVES, Luciana Carvalho ; CANDURI, Fernanda ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Structural bioinformatics study of Cyclin-dependent kinase isolated from Plasmodium falciparum complexed with Roscovitine. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• UCHÔA, Hugo Brandão ; JORGE, Guilherme Eberhart ; da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Automatization and parallelization in the molecular modeling process of tertiary structures of proteins. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; UCHÔA, Hugo Brandão ; JORGE, Guilherme Eberhart ; CANDURI, Fernanda ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Bioinformatics study of cyclin-dependent kinase 5 complexed with Roscovitine. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• ARCURI, Helen Andrade ; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, Fernanda ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Molecular model of shikimate kinase isolated from Xylella fastidiosa. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• JORGE, Guilherme Eberhart ; da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; UCHÔA, Hugo Brandão ; CANDURI, Fernanda ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Prot gif a web tool to generate macromolecular graphics for publication and teaching. In: SBBq, 2003, Caxambú. Livro de resumos, 2003.

• CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF ; UCHÔA, Hugo Brandão ; CANDURI, Fernanda ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Parallelization of a docking program in a Beowulf cluster. In: Workshop on Molecular Modeling in Biophysics, 2002, Rio de Janeiro. Livro de resumos, 2002.

• GASPAR, Renato Tadeu ; CANDURI, Fernanda ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; da Silveira, NJF ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Analysis of inhibition of cyclin-dependent kinase 1 by roscovitine and flavopiridol. In: Workshop on Molecular Modeling in Biophysics, 2002, Rio de Janeiro. Livro de resumos, 2002.

• da Silveira, NJF ; CAMERA JUNIOR, João Carlos ; CANDURI, Fernanda ; AZEVEDO JUNIOR, Walter Filgueira de . Comparative modelling: problems and solutions using modeller. In: Workshop on Molecular Modeling in Biophysics, 2002, Rio de Janeiro. Livro de resumos, 2002.

• Silveira NJF . Interação de Dados Biológicos por Meio Computacional. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• da Silveira, NJF . Bioinformática Estrutural. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• Saraiva, LA ; Rodrigues IC ; Veloso, MP ; da Silveira, NJF . BIOINFORMATICS APPROACH OF CYCLIN-DEPENDENT KINASES 1 AND 3 COMPLEXED WITH INHIBITORS. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, R. A. ; de Assis, GF ; da Silveira, NJF . Prediction of segmentes in proteins using LMProt algoritm. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Matsui QYP ; Mota, AJ ; Back-Brito GN ; Pereira, DB ; da Silveira, NJF ; Mittmann J . Sexagem e sequenciamento parcial do gene CHD-1/Z de Mimus Saturninus Taxidermizado. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Saraiva, LA ; da Silveira, NJF ; Rodrigues IC ; Silva, JMSF ; Santos, PG ; Veloso, MP . Docking Molecular de xantomonas naturais farmacologicamente ativas com HSA, principal proteína humana de transporte sanguíneo. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CARVALHO, P. V. S. D. ; da Silveira, NJF ; Omote, D ; Gouvêa, CMCP . Approach applied in the computational Discovery of new phytochemical present in medicinal plants, with Terapeutic Potential in Head and Neck Cancer. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Saraiva, LA ; da Silveira, NJF ; Rodrigues IC ; Silva, JMSF ; Santos, PG ; Santos, MH ; Veloso, MP . Molecular docking of natural pharmacologically active xanthones with human serum albumin and bovine serum albumin, main protein transporters in plasma. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Saraiva, LA ; Veloso, MP ; Rodrigues IC ; da Silveira, NJF . Structural Bioinformatics approach of cyclin-dependent kinases 1 and 3 complexed with inhibitors. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Saraiva, LA ; Veloso, MP ; Rodrigues IC ; da Silveira, NJF . Computational approach to new anticancer drug developments using bioinformatics to structural analysis of molecular markers in HNSCC. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• da Silveira, NJF . Métodos Computacionail Aplicados em Bioinformática. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - 2022

  Repositioning and combination of drugs for the treatment of SARS-CoV-2 infection: Predictive in silico modeling and validation of antiviral activity in vitro., Descrição: This project aims to combine computational tools applied to drug repositioning and in vitro studies to identify drugs with activity against SARS-CoV-2. Initially, the SARS-CoV-2 molecular targets that offer the greatest potential to be affected by the molecules/drugs of interest and trigger antiviral effects will be selected. Part of these targets has already been selected, considering the relevance proven in previous in vitro studies. Innovative molecular targets for SARS-CoV-2 will be determined from integrative transcriptome analysis. After selecting the targets of interest, the interaction and affinity between each target with the drugs in clinical use deposited in our database will be investigated, as well as promising molecules of natural origin already commercialized. The cytotoxicity of drugs/molecules and their combinations will be investigated in vitro in different cell types. The drugs/molecules and their combinations with greater potential for in silico interaction and less cytotoxicity in vitro will be investigated in relation to their activity against SARS-CoV-2.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Marcos José Marques - Integrante / Luiz Cosme Malaquias - Integrante / Rômulo Dias Novaes - Coordenador / Jônatas Satos Abrahão - Integrante / Lívia Figueiredo Diniz - Integrante / Pedro Luiz Rolalém - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal de Alfenas - Auxílio financeiro.

• 2020 - 2022

  Evaluation of the immunogenicity of epitopes rationally selected by reverse vaccination of structural proteins of SARS-CoV-2 and associated with BCG vaccine as a carrier and inducer of trained innate immunity., Descrição: Em função do potencial dessa associação gerar uma resposta imune, o coordenador da pesquisa aponta que os resultados terão impacto direto na qualidade de vida da população. ?Os resultados produzidos neste projeto poderão ter um grande impacto na saúde pública devido a possibilidade de identificar uma porção do vírus capaz de gerar uma resposta imune contra esse microrganismo e conseguir treinar a resposta imune do paciente ao ponto de melhorar a resposta inicial e evitar o desenvolvimento da doença?, argumenta, afirmando que será possível também, em colaboração com o Instituto Adolfo Lutz, auxiliar no diagnóstico da infecção pelo novo coronavírus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Leonardo Augusto do Almeida - Coordenador., Financiador(es): Universidade Federal de Alfenas - Auxílio financeiro.

• 2017 - Atual

  Caracterização de adesinas em leveduras patogênicas como estratégia para prevenção de infecções causadas por biofilmes., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Ana Carolina Barbosa Padovan - Coordenador., Financiador(es): Universidade Federal de Alfenas - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2012

  Análise de expressão gênica por bioinformática, utilizando dados de ESTs do projeto genoma câncer (hcgp)., Descrição: Diversas pesquisas começaram a ser feitas a partir disto, tendo algumas, resultados animadores a respeito de marcadores molecular do câncer. A bioinformática está tornando-se assim, uma importante arma no diagnóstico e prevenção do câncer. Torna-se cada vez mais necessários estudos na área de sequenciamento genético, o primeiro passo, que foi o sequenciamento, foi dado, falta-se agora aprofundarmos cada vez mais na infinidade de informações que estes dados podem nos oferecer. A bioinformática oferece mecanismos rápidos e seguros para análise dos dados, programas como mysql, que é um sistema de gerenciamento de banco de dados, e Perl, que manipula textos e emite relatórios, podem ser utilizados sem muita dificuldade no processo de estudos das sequências. A estatística, com o teste exato de Fisher dá a fundamentação matemática para a comprovação de resultados. Enfim, pesquisas que possam resultar em alguma comprovação de marcadores são de suma importância para o conhecimento científico por si só, e por possíveis benefícios futuros que podem causar.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Lincoln Leandro Fonseca - Integrante.

• 2008 - 2010

  Abordagem computacional na identificação de marcadores tumorais e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos, Descrição: A criação de uma base de dados de tumores de cabeça e pescoço, obtidos de resultados de SAGE (Serial Analysis of Gene Expression), microarranjos e proteômica, deve auxiliar de forma muito eficiente a identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em ambas as técnicas. Os novos marcadores selecionados por ferramentas desenvolvidas no presente projeto, possibilitarão a identificação de novos alvos terapêuticos a serem utilizados contra bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Os resultados, divulgados publicamente, permitirão a seleção, pelo usuário, de genes com expressão baixa ou elevada em tumores e revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos e drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer. Os marcadores selecionados serão validados pela técnica de PCR em tempo real e os resultados têm potencial para identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2005 - 2007

  UMA ABORDAGEM COMPUTACIONA PARA A IDENTIFICAÇÃO DE ALVOS TERAPÊUTICOS COM BASE NOS DADOS DE TRANSCRIPTOMAS E PROTEOMAS DE TECIDOS TUMORAIS, Descrição: O presente projeto tem como objetivo criar um banco de dados local com resultados de SAGE, microarranjos e proteômica e desenvolver algoritmos para realizar meta-analises em dados de expressão, selecionando marcdores em câncer de cabeça e pescoço para serem utilizados em diagnósticos mais rápidos e alvos terapêuticos mais específicos para tratamento com drogas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara da Silva - Integrante / Wilson Araújo da Silva Jr. - Integrante / Alessandra Vidotto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

Projetos de desenvolvimento

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como lead compounds ), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal approach , quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como lead compounds ), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal approach , quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

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  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

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  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

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  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

• 2010 - 2011

  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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  Fitofármacos presentes em Euphorbia tirucalli Lineu (Aveloz), com Potencial para novas Terapias em Câncer de Cabeça e Pescoço., Descrição: O planejamento racional baseado em estrutura e no mecanismo de ação de um fármaco é a estratégia mais eficiente e menos dispendiosa para o desenvolvimento de novos fármacos, capaz de contribuir em todos os estágios do processo, desde a descoberta de protótipos (também conhecidos como ?lead compounds?), sua otimização (com respeito à afinidade ao receptor, especificidade, toxicidade e biodisponibilidade), até a elaboração de compostos candidatos a testes clínicos. Essa metodologia é baseada no bloqueio ou estimulação da atividade biológica de biomacromoléculas, tais como proteínas ou ácidos nucléicos (DNA ou RNA), associadas a diferentes processos patológicos. A informação estrutural do bioreceptor permite a descoberta e síntese de compostos com complementaridade estérica, hidrofóbica e eletrostática ao seu sítio de ligação, os quais podem vir a se tornar fármacos e serem introduzidos na terapêutica medicamentosa. Essa abordagem, em sua essência, caracteriza o planejamento racional de fármacos baseado em estrutura. O que torna ainda mais atrativo tal ?approach?, quando utilizado com proteínas, é o conhecimento de que 78% dos fármacos atuais têm como alvo esse tipo de biomacromolécula (MARSHALL, 2004). O surgimento de novos conhecimentos em bioinformática, genética e biologia molecular de câncer tem resultado na identificação cada vez maior de moléculas alvos potenciais para o descobrimento e desenvolvimento de novas drogas anticâncerigenas. Atualmente, cientistas estão focados no descobrimento e na elucidação estrutural de potenciais inibidores de proteínas expressas em células cancerígenas que possuem um papel chave no desenvolvimento do tumor. Criando dessa forma uma nova classe de medicamentos que poderá beneficiar milhares de pessoas afetadas por essa doença. Interações proteína-ligante são críticas na transmissão de sinais que guiam a célula a executar respostas biológicas, e quando estas não desempenham sua função normal podem enviar sinais errados e desen. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Paulo Vinícius Sanches Daltro de Carvalho - Integrante / Daniel Omote - Integrante.

• 2010 - Atual

  Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores gênicos em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos., Descrição: A identificação de marcadores tumorais obtidos do cruzamento de genes diferencialmente expressos em técnicas como SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) e Microarray possibilitarão o avanço em estudos de desenho racional de drogas tomando tais genes como alvos para desenho de novas drogas contra o câncer. Os marcadores moleculares selecionados serão estudados em complexo com bases de dados de ligantes disponíveis publicamente. Estes marcadores serão estudados utilizando programas de bioinformática estrutural para predição e análise de suas conformações 3D em complexo com ligantes selecionados por screening virtual. Com esta metodologia de identificação de marcadores e predição de estruturas 3D, será possível identificar, no âmbito estrutural, com maior precisão e utilizando as mais recentes e aceitas tecnologias de modelagem e interação com drogas em larga escala, novos alvos terapêuticos, drogas mais específicas para tratamento de pacientes com câncer e identificar subtipos tumorais e sua correlação com diferentes parâmetros, como comportamento clínico e sensibilidade a diferentes terapias. Os resultados também poderão revelar padrões metabólicos e de sinalização importantes para o desenho de alvos terapêuticos. Tais dados por se tratarem de uma análise em larga escala, serão disponibilizados em uma base de dados disponível a pesquisadores interessados na identificação de compostos líderes complexados com marcadores da tumorigênese.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Nelson José Freitas da Silveira - Coordenador / Eloiza Helena Tajara - Integrante / Roosevelt Alves da Silva - Integrante / Ihosvany Camps Rodriguez - Integrante.

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